4A2SA

Structure of the engineered retro-aldolase ra95.5
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
PRYLKGWLEDVVQLSLRRPSVRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAYYSRKSPSGLDVERDPIEYAKFMERYAVGLSIKTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMSDFIVKESQIDDAYNLGADTVLLIVKILTERELESLLEYARSYGMEPLILINDENDLDIALRIGARFIGIFSMNFETGEINKENQRKLISMIPSNVVKVAKLGISERNEIEELRKLGVNAFLISSSLMRNPEKIKELIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
molecule keywords INDOLE-3-GLYCEROL PHOSPHATE SYNTHASE
publication title Evolution of a designed retro-aldolase leads to complete active site remodeling.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 93
structure length 247
sequence length 247
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2011-09-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4a2sA00
3NXFA 3BK0A 2NZLA 5DCEA 2EF9A 1F7BA 1JCXA 3IVUA 2H90A 3HG4A 4QJ1A 2HS8A 3PB0A 1N8FA 1OK6A 4TR9A 3SI9A 1W8SA 3ABSA 2Y70A 2HSAA 3TROA 4I7UA 2J24A 2QCGA 1EB3A 3FIGA 3LTSA 4GUJA 1GG0A 4O18A 2ALDA 2V2DA 3G3DA 3HBLA 2GUUA 2E5BA 3UPBA 4O0KA 3VE9A 5I3FA 4IJBA 1H7NA 3T78A 2RKXA 2FB3A 1TJPA 4A29A 1F6KA 1X8FA 5F4XA 2YX0A 3P80A 1UUMA 2E6YA 3NPWA 4N4PA 2RHGA 3UWWA 4CNOA 1Z41A 4NNBA 3QC3A 3ABQA 4JDBA 1F6PA 3LCHA 1PIIA 3GDLA 3EWUA 1NSJA 3EXSA 2WKJA 5LKYA 2NWSA 2X1RA 3MHFA 1LORA 4EVZA 1UASA 1IXOA 4QNEA 3GR8A 1OFQA 4NJIA 4ZQPA 3L66A 2LLEA 3OG3A 1B4EA 1H1YA 3KRZA 1TO3A 2CLHA 1XBXA 1G67A 4FB7A 4UTKA 2C0AA 3W7JA 1W31A 5DELA 4LWWA 5EYWA 1JR1A 3PM6A 4MY8A 1I8JA 4FNPA 3NDOA 3W1PA 3V1PA 3DFOA 4OHQA 3O63A 1X6UA 3TSMA 4ADUA 2CLMA 3TKFA 5DN1A 1GYLA 5BMXA 1KM1A 3VCRA 3CB8A 1U83A 3S1VA 3S8HA 3FOKA 4Y8FA 5AHNA 3O6YX 4GUGA 5LGXA 4QSHA 4LS2A 4QM1A 5IBXA 3TXZA 2NLIA 4JIQA 1KV8A 3NEVA 5AC7A 3P74A 2G95A 3NGJA 1CW2A 5LNVA 3ZS4A 2NWRA 5LNWA 1MSSA 2QUTA 3EWZA 4EF8A 3HPSA 1T96A 2WNQA 5BRBA 1G4SA 4NJJA 4QAIA 2YYUA 1SU5A 4QITA 2VOMA 1XI3A 1K7FA 2RDWA 2ZA1A 1VLIA 1B9BA 4HNUA 2GJLA 3CT7A 3G1FA 3PG9A 5LHFA 5HNRA 3FJ6A 3W07A 4NZFA 4K39A 4P61A 4ML9A 3GXTA 1ZJIA 1OABA 3GVGA 1LDCA 4ZQNA 1QAPA 5EKYA 1VCGA 2WPBA 3A22A 5CPMA 1ALDA 2WNNA 2QEZA 4NU7A 2C3ZA 5U7SA 4M5PA 5TBOA 1AW2A 2WOQA 2B7PA 2Y89A 2ZQ0A 4H4IA 3W7KA 3WJXA 3BLEA 1AW1A 3WJZA 3LRLA 4RV8A 1ME7A 1PVNA 1FWRA 2YW3A 1X1OA 4NNCA 4IXHA 1JQXA 2WQPA 2NX3A 3O07A 1G69A 4RZ4A 3QPZA 4RXFA 1PHWA 1EP2A 2VXNA 3NQFA 2HMCA 4PH6A 3TNOA 1DKWA 5FEWA 2NV2A 4JYEA 1SZNA 2YXGA 4S2BA 3W2MA 4GUIA 1GTEA 4MPQA 3OA3A 2J9ZA 2H8XA 4FXSA 4QISA 2X1TA 4WD0A 2ZZ7A 5D2WA 2VC6A 1KLZA 2ZRUA 1OFOA 3V75A 1H51A 1OX5A 3NA8A 1VPXA 1XBVA 4JTIA 1ZAHA 1JULA 2XN1A 1KM5A 1VYRA 5K2ZA 1FDJA 2ISVA 5FEXA 4LT9A 1GVFA 3IIOA 4RJEA 2E68A 2FDSA 3M6YA 3HQ1A 5DXXA 4DPQA 4JTJA 3RF9A 3TH6A 4TMCA 4R33A 3UZJA 3C61A 1ZCOA 3PB2A 3LLDA 2ZA3A 1TPB1 2EKCA 5I3KA 1LBFA 4ICNA 3H54A 4OV4A 1YTDA 4HSOA 3L0GA 5D30A 1LLWA 3NM1A 4WXZA 4Y96A 1K7EA 2EHHA 2JGYA 2V81A 5GVJA 4DPPA 4HNNA 1TRDA 2ZTKA 2TPSA 1G4TA 1LTDA 4O11A 1Z44A 4FNQA 1BWKA 4OWGA 4UFIA 1JUKA 1KFJA 2RDTA 1OK4A 5G1YA 2Y7GA 2C1HA 2DZTA 3DGRA 1QCWA 2DZUA 3ELFA 5HULA 4U28A 3TJXA 3LI1A 1WAUA 4Z1AA 3LCFA 1KM3A 1IGSA 4PTNA 4JTGA 4GUFA 5F2IA 4K37A 2P1FA 1DL3A 3DFQA 3B05A 3W7MA 5J5RA 1P5BA 2AQWA 3W2NA 1Q3NA 1QMLA 1SPQA 4Q4KA 2J27A 1OFRA 1UB3A 4LVDA 2R91A 1ME9A 4O1CA 3HG5A 1MEWA 4K8HA 3B04A 1LRTA 1L6YA 1J5TA 1K3UA 3BW4A 3R89A 1ONRA 1MEIA 2BLEA 1O94A 4LV9A 3IVTA 2W6RA 3W1LA 3LCGA 3T44A 1GVRA 3N3MA 4OE7A 1RZMA 1SZGA 1WOBA 1EP3A 4M6VA 4X22A 4AWTA 1MEHA 1O60A 3M5YA 3G8EA 4WY0B 2C19A 3M41A 5A5WA 1OX6A 1G4PA 4O28A 3HJZA 4YCOA 2CLFA 4GRSA 1AL7A 4DBDA 2C18A 4JICA 2ZRXA 5AYZA 3NQEA 2O7SA 3AO0A 2QDHA 2G5WA 4POCA 4C1KA 4AAJA 1EPXA 1BEUA 3TUUA 4UTWA 1H5YA 4MZ1A 3W7NA 3IGSA 3TQ0A 2QDGA 3HGJA 1J4EA 4DF2A 2FLIA 5K3VA 2C13A 4Z0JA 1SW7A 3PVFA 1L6SA 1HO4A 4C1LA 4GJ1A 4UFMA 3E12A 5AHLA 3UYCA 3NM3A 2DZXA 1H7XA 2GOUA 3JS3A 1XBYA 1ZFJA 2QCNA 3O1NA 1JCLA 1NEYA 5H91A 5CGQA 1TPEA 4LRSA 2Y6ZA 2YGYA 1TQJA 2NX9A 5IM51 3M5VA 1R46A 3W75A 5G4EA 4OV9A 2ZDRA 2VFHA 2YW4A 4XKYA 1N55A 3NL3A 1LROA 4UMCA 3P62A 3DI1A 3YPIA 3W74A 1FXPA 1JUEA 1OFPA 4WY0F 3UWYA 1AW5A 1UUOA 3L65A 3S5YA 3Q37A 4ALDA 3A24A 5C6MA 3W22A 3QM3A 4CQAA 5D38A 1H50A 4JDYA 3DFPA 3QJAA 4NXSA 1YDOA 4ADSA 3QRHA 4DO5A 4UFHA 5KZEA 2YZRA 2F84A 4OQVA 4B5NA 3S42A 3UY7A 2VEMA 5HWNA 2H3DA 2Z1BA 3GDMA 1VR6A 3HG2A 4E2DA 4JX5A 4RX0A 2V5BA 1W0MA 3E02A 4I9AA 2DP3A 4UUIA 1SZEA 4RCXA 3SSJA 1Q6RA 5AFDA 5C5YA 1YPIA 1OX4B 4LVAA 3FFSA 4TU1A 1T99A 3DKLA 3NQ6A 3STCA 3INPA 3NPVA 3G0XA 4HNVA 2ATMA 3GK0A 3VKJA 1W5PA 3OVPA 1JVNA 4UIOA 4MYAA 3KRSA 5BW6A 4KWVA 3L5AA 3TMLA 3LOTA 1LCOA 2G97A 2A6LA 2OMAA 4O4WA 4ZVJA 1QWGA 4DXVA 2CZDA 5K9XA 4UTJA 5FF3A 3KVKA 3G1AA 2QCMA 4GXMA 3NAVA 4XBKA 2JGQA 3GDTA 1LM1A 1FQ0A 1OYBA 2VFEA 3QQ0A 4QNWA 4K7VA 1RD5A 3NQMA 4MJMA 4DO6A 1PCWA 4G1KA 2C6QA 4UTUA 2QAPA 3C52A 3LXBA 5FF4A 3CC1A 4ZQRA 3G22A 3LXAA 1GVOA 2YPIA 3ZFHA 2GPTA 3HGOA 3I65A 4R34A 3LHWA 1VYPX 3TMQA 1W3IA 5CPOA 5CPLA 2ZZ3A 2A7RA 2Z0IA 1DVJA 3S5OA 1OF8A 1RQEA 3IRDA 5DY2A 2QCDB 3W88A 1DV7A 1OYCA 1LBMA 3LCWA 4BF9A 3EXRA 3GIYA 1W3NA 1GTHA 4K8EA 3S1WA 1XDLA 4WY0A 5C55A 2ZA2A 2GQAA 3EWXA 1YLVA 3CEPA 2DORA 3KX6A 4LRTA 1WBJA 1W5QA 3KVMA 1GVSA 2QUVA 3W2UA 5D2YA 1FWNA 4WOZA 3W83A 4O15A 2ZRVA 3G18A 4N9DA 3TV8A 4I7VA 3FS2A 4WQ6A 1G7UA 2HS6A 2ATSA 1FDZA 1MXSA 4YWIA 3NYZA 2OJPA 3MYOA 1VZWA 4MUZA 3RLUA 3B0UX 4RZ6A 4D2JA 5KZMA 4MY1A 1BWLA 1RVGA 2WV8A 1VCFA 1O5KA 4EOUA 3A5VA 1QFEA 3W7HA 1X1ZA 3PC0A 1NFBA 3R2GA 1X7FA 5K7JA 1I2OA 1VHNA 1THFD 3G0SA 3THQA 2OZ0A 2A2IA 1BTMA 1GZGA 1QOPA 4EWND 3LV6A 3IEBA 4N6FA 3DH7A 1RR2A 3EX2A 2J9YA 1VGAA 1JRCA 3TJLA 3GDKA 3OVRA 2AGKA 4JEQA 4LS1A 3IIVA 1GG1A 1TPVA 1W5NA 1JCNA 3CHVA 5EA9A 3HGSA 1VJIA 1GJPA 2A4AA 1SO5A 3HGRA 3MW7A 2A0NA 3U8GA 5G4WA 1HL2A 3LERA 1XCFA 1I4NA 2QCHA 3C8FA 4MOZA 1GT8A 1V7YA 3SGUA 1KM2A 5AHMA 1EX5A 3QZEA 2E6DA 3USBA 4O53A 1FY6A 4WJEA 3WJYA 4KFPA 4Y90A 2X16A 1GWJA 3ABRA 3PUDA 3IIXA 2Y7EA 1RQHA 1WQ5A 3PR2A 1OJXA 1W56A 4Y9AA 1IF2A 3VNDA 3UQNA 1TB3A 3NQ7A 2VFGA 1F74A 4O17A 5F2LA 1TTPA 5D32A 1H63A 3C2EA 4JTSA 3Q2DA 3FKRA 3NQDA 4FEZA 1FBAA 5FESA 4X9SA 3F4WA 3WK3A 4HSNA 2QJIA 5EY5A 1TPDA 3NG3A 3M7WA 3G0UA 1T0OA 1TJRA 4TIMA 1W1ZA 2Q3OA 4NJGA 4JGDA 3LCIA 3PF3A 1OX4A 1YXYA 3O6DA 2JBMA 3W85A 3MI6A 3FYPA 3PULA 4FNUA 1OFAA 1AL8A 3NPUA 1G7VA 1M7PA 1FDYA 3M43A 3PS7A 4UTIA 3VE7A 4MVAA 1M6JA 2JKEA 1Q6QA 1QOQA 3TAKA 3W2LA 1FCVA 3LRMA 4NUWA 1L6WA 5KZDA 4IWWA 1SR9A 4JYDA 4Z1BA 4HNTA 4LVBA 2ZZ1A 2TYSA 1F5ZA 1Q6OA 2DZVA 3BGGA 3SZ8A 3HO8A 3P82A 5D09A 2A1YA 5HUPA 3EEGA 1NF0A 1DORA 2DJXA 3DI0A 4ADTA 3NOEA 2YDAA 3MJYA 3VI2A 4BFAA 3M0ZA 4PA8A 1HUVA 2GVGA 1FCUA 3EX3A 4DF0A 1H1ZA 1XUZA 2B0MA 4XUGA 3B8DA 3LXCA 3BLIA 4ORIA 2JK2A 4MLJA 3T40A 2A5HA 2PRLA 1NAL1 4K7YA 4NX5A 1K8XA 1VRDA 1KV5A 5LNUA 3DZ1A 1LBLA 3DHDA 1WA3A 1TV5A 2B7OA 4JIPA 2BWGA 4AF0B 3LHVA 1A5BA 3BW2A 1Y0EA 5CPNA 2GQ9A 3UWQA 1OVDA 4NXKA 2V5LA 4O14A 2FB2A 3LTYA 3R12A 4N4QA 4PC8A 2PC4A 1QPNA 3KRUA 2GVJA 2J9XA 1I2RA 2E77A 3QW3A 3PAJA 2TSYA 2VEKA 2WSRA 1JJKA 3MP3A 1FX6A 3PBVA 2FTPA 1DQWA 5EL1A 1EIXA 5D2TA 1PE1A 3KVJA 1TRIA 3QW4B 2QAFA 4PL2A 1Q6LA 3DU0A 3TQKA 2Y88A 1LOLA 5C54A 4JTHA 3W6YA 1KTNA 3BG3A 4UMBA 5F2GA 1TQXA 2NX1A 1HTIA 4NZJA 5LHEA 1B4KA 5G2IA 2G96A 5E93A 1Q45A 3EWBX 4O1DA 2FPTA 2ZCGA 3HOJA 4ZL1A 3QMSA 2NXGA 3A21A 4RK8A 3IIZA 1SFJA 1KFBA 1R30A 5LSMA 5D33A 1OFBA 3DKJA 4H3DA 1LZOA 2OT0A 4DQWA 1VCVA 3O05A 4IMDA 3G1HA 5AYYA 1SSGA 1VH7A 2E5CA 4RXGA 3NL5A 3RLVA 1K02A 3FKKA 4CCEA 4HPJA 1W5MA 2GJNA 1TTJA 1SW3A 4FXRA 3W23A 2X1UA 1S5VA 4UFLA 1SZFA 2ISWA 4N9BA 3LCLA 4MIMA 1H7RA 1OG0A 2ZFAA 1RV8A 1P1XA 3UPWA 3TU9A 3W7LA 4IPIA 4UFKA 3C3NA 2YFOA 2R8WA 3EXTA 2QCLA 4AXKA 4WX2A 4MZYA 1M7OA 2R14A 3DFNA 5BMWA 3W1QA 1H7OA 2O7QA 5KTLA 2VELA 1K8ZA 4N9EA 5CSSA 1V5XA 2YYTA 1KFEA 3IGUA 3IIPA 3OBKA 4M6PA 1YTKA 3TC6A 2A7PA 2DJLA 5HQEA 4R53A 3W2KA 2BZNA 1SO6A 1D9EA 4IMFA 5I3IA 3O06A 4NNAA 3TXVA 3HMJG 3QH2A 3MBDA 3TDFA 4YLWA 1XM3A 2YR1A 2Z6IA 2C16A 1XXXA 5D04C 5HR6A 2QKFA 3LRKA 3RMJA 3UWUA 4CQ9A 3W1TA 2D73A 2RFGA 2Y61A 4BWLC 5K4ZA 3HB9A 4UNLA 3NO5A 4O52A 4PCFA 1I2QA 3HPXA 4GWEA 2E5DA 3S9YA 5KITA 1FWWA 4ZQOA 2J6XA 3HIJA 3AJXA 3LV5A 3C6CA 4AH7A 3L2IA 1F76A 3LB0A 2CW6A 3CM4A 3UXDA 1YXDA 1GPWA 3TFCA 1SFLA 3P84A 3MP5A 4HHPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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