4A5BA

Crystal structure of the c258s/c268s variant of toxoplasma gondii nucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 (ntpdase1)
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
595
structure length
592
Chain Sequence
DADTEKRINVGKTHLQTLRNLETRCHDSLQALVVIDAGSSSTRTNVFLAKTRSCPNKGRSIDPDSIQLIREGKRFTGLRVVLEEWLDTYAGKDWESRPVDARLLFQYVPQMHEGAKKLMQLLEEDTVAILDSQLNEEQKVQVKALGIPVMLCSTAGVRDFHEWYRDALFVLLRHLINNPSPAHGYKFFTNPFWTRPITGAEEGLFAFITLNHLSRRLGEDPARSMIDEYGVKHSRNDLAGVVEVGGASAQIVFPLQEGTVLPSSVRAVNLQRERLLPERYPSADVVSVSFMQLGMASSAGLFLKELCSNDEFLQGGICSNPCLFKGFQQSCSAGEVEVRPDGSASVNEDVRKNRLKPLATYCSVHNPEISFKVTNEMQCRENSIDPTKPLAERMKIENCSIIEGTGNFDKCVSQVESILVAPKLPLPANIEAASSGFESVDQVFRFASSTAPMFITGREMLASIDTLKDHRLLRSDFSGDVEELAEAAREFCSSEVIIRTDGPVIQLPGEQKLNSLNFDLCKTMALTVSLLRHMAAGENQPSFIKWEKSIAGPDGKPLADLGWQVGVILHHVLFTEEWGRTAYEAGYSHNLE
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords NUCLEOSIDE-TRIPHOSPHATASE 2
publication title Structural Insight Into Activation Mechanism of Toxoplasma Gondii Nucleoside Triphosphate Diphosphohydrolases by Disulfide Reduction.
pubmed doi rcsb
source organism Toxoplasma gondii
total genus 196
structure length 592
sequence length 595
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.15: Nucleoside-triphosphate phosphatase.
pdb deposition date 2011-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.530 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4a5bA01
3.30.420.540 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4a5bA02
4A59A 3AGRA 4A5BA 4KH4A 4A57A 4A5AA 4KH5A 4JEPA 4KH6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IDKA 2WFBA 1KCFA 3CHWA 3OYEA 1LAVA 2OPQA 4CHYA 4BDYA 3RMBA 1HNVA 5KPTA 1C0MA 1YTAA 1EX4A 5AR0A 1JCFA 1NGAA 5BRDA 4CHQA 4DS4A 4FXDA 3O9QA 5M1NA 2GWKA 2PFUA 4IFVA 2Q36A 3DLRA 3E1YA 3FE1A 4XIUA 2GELA 3BUZB 3S9HA 4QCLA 4HUFA 4BRHA 1RBUA 4PQUA 4CHNA 2VGNA 3NFAA 3HVTA 2HBJA 1B92A 3I55N 3P5JA 1XHZA 1BDGA 2GUIA 1NK0A 3CD6N 2HVIA 4FJKA 3R8EA 5AZJA 3AAQA 1JLFA 1REVA 2QWRA 2RHKA 1U49A 4B3TK 3BF1A 4B9TA 4BRGA 3D6RA 4BDZA 3AVFA 4BRMA 5BRHA 2RN2A 4PKIA 3MN7A 2XY6A 1I39A 4H4MA 4BR7A 1C1BA 3L0QA 1HMVA 1WLJA 3QEWA 4DTUA 3K57A 3ISNC 4V19S 5JVHL 1ASWA 3D45A 3O9SA 3P39A 3ENHA 1NNEA 1MA9B 2D5RA 3QMLA 3ZLJA 3TARA 4CZJA 4LH4A 1HYZA 3VEVA 3VTHA 2KKZA 2X6SA 5KGXA 5D3GA 4OPKA 4BWJA 3LM9A 1WUAA 4BC5A 3L2VA 1NGIA 3ZT0A 3PIPL 5CZ1A 1MWMA 4CJUA 2D4WA 5GAHP 3F73A 4B8AB 1RBTA 2GV9A 3D7EO 4WQ5C 4A5AA 3V9XA 4IG3A 4M3TA 3OYCA 1X1PA 2HB5A 3M3ZA 3RSEB 1S9GA 3EYZA 4CZEA 3K5LA 4BE0A 2P9NB 1E4FT 4X65K 2KZZA 4DV2K 4I9QA 5HOOA 3K5NA 2YHBA 3AVJA 2VQEK 4DR6K 4CFAA 1BI4B 4FM1A 4CF1A 2NRTA 4CJPA 1D9FA 1JLBA 1TYQB 3VQDA 4DTMA 1L3TA 3AA3A 4CHOA 4BGBA 3U9ZA 4O8KA 4DTNA 3R3LA 4AHCA 3KK7A 4FOIA 5E26A 3CPEA 2W6KA 4CBXA 2W40A 4EHUA 1HNXK 4O5BA 3QIPA 4CFBA 4CJFA 1VQ8N 1GLEG 2F9TA 1HYSA 5AQLA 1NOYA 3ULEA 3ZT3A 4W5NA 4FYDA 5JMVA 3B8AX 2BTFA 1IBMK 2OZSA 3AVMA 3SUNA 2Q3SA 4NYNA 3I56N 4FJMA 4CZGA 4MO5A 4CGHA 2QWNA 5M1OA 5EVZA 4IO8A 3VQQA 2HHSA 4AQYK 5AJ3K 4OPJA 4JD2A 3HM9A 3ZSYA 3AVKA 2ZM6K 2VWBA 5DMRA 5ADXA 2Q0UA 4H5VA 2HHWA 4FOEA 3VEZA 3MX2A 5EY4A 3KLIA 4CEQA 5EOYA 3M6GA 3O5BA 4DR7K 2FBXA 3ZYYX 3G71N 2E4LA 5AQGA 3UKRB 4CBUA 4JRQA 5EXWA 3M8RA 1T03A 3UB5A 4BE1A 3LP2A 3ZCMA 4W5QA 4CEEA 3DJCA 2RPIA 1F21A 3T69A 4H0PA 1NK6A 2OPSA 2ATQA 3P4IA 2YHXA 4FPBA 1HQUA 5KPZA 2IDOA 2P9UA 4B9NA 3ENOA 3ASMA 1NGHA 4R79A 5C0YA 4E19A 1S22A 4IJNA 2D0CA 4IOXA 3A8YA 4AHUA 1IG8A 4FJIA 4FCYA 2NNWA 1QHTA 2O8FB 3ENBA 3RR8A 4L8RB 3E9PA 1CZBA 2Y1JA 3HI0A 3ZEUA 2VG5A 4Q0BA 4FWMA 4LD0A 1KRPA 3EKUA 2IVOA 4KI6A 3M1FA 3MXIA 3THWA 2Q97A 3W0LA 2FXUA 3AO1A 1E4GT 1NU0A 4FWRA 3VGKA 1BUPA 4BG9A 4CJTA 4CD3A 4BR5A 4JYAK 1IBKK 1C6VA 3VEOA 2A1SA 1NJYA 3V9ZA 4BRCA 4CK1A 4BGAA 4DLEA 4AHRA 1BISA 4FJ8A 5C2DA 2H3GX 3WXLA 3SNNA 5F0XA 2AJQA 1NBWA 3SQ0A 2YHYA 4YFUA 1I94K 3J7YP 2YV0X 1X9JA 1D5AA 3NVKA 2HHUA 2UYTA 1IKXA 3KLFA 5KQDA 4FM0A 1NKBA 3GE1A 3C6UA 1IKWA 4L3QA 5C25A 5CYMA 1VQKN 1Z26A 4LF7K 4JI2K 3DOLA 4MFBA 4JI6K 1N6QA 4Z94A 3HJFA 4WQ4A 3QIOA 4WFNL 1RTDA 1KQSM 1D9DA 4C8MA 3FGUA 2B6AA 4CESA 2UUBK 2EX3A 5FLXO 1VQON 5HRNA 1YT3A 3WNGA 4BRNA 3QEPA 1RCHA 2HW3A 2NRRA 4IG0A 4H5NA 2DFEA 1QQCA 1RNHA 4BREA 3TTFA 3MDQA 3KLGA 1N36K 3KD5E 1RDBA 3S3MA 1EQYA 3O08A 1NK5A 4B9LA 3NGZA 2O4GA 3RRHA 4JK7A 3VGMA 3C6HA 2G8IA 1UAXA 4E1MA 2I7NA 5LJVA 3DXMA 4M3WA 3CFOA 3ID8A 2Y1IA 3MCPA 2KHOA 1UWBA 1VK0A 4X62K 1L3VA 2X74A 4MDBA 4GV9A 1VSFA 5FPNA 4AM6A 3WNFA 2BE2A 3F9KA 2JGUA 1NGJA 1RBSA 3AA2A 4Y1DA 1VQ5N 3CJBA 3CJ1A 5E41A 2YKMA 1JCEA 3KKRA 2UXBK 2ZGZA 5KPRA 2W6LA 3CCLN 1KVBA 3QBXA 4FSVA 1S72N 1A5WA 2NLXA 5DM6L 3VEXA 2O8EB 3QFPA 4F9OA 4LSNA 4QOZB 1ZBLA 3SK3A 2VWJA 3T1AA 2YKNA 3GBTA 1RT4A 5JICA 1ILYA 3V81A 3RMDA 3R1XA 1Q9XA 5AQJA 4KHNA 5H1SQ 3VQ4A 1KD1O 1BO5O 2F7TA 2V52B 1WSFA 3VQ6A 1IV0A 1Z6RA 4I6MA 3I0SA 3I8BA 3DXKA 1S1VA 1QZ6A 1WNSA 3CYMA 1RT1A 1T6DA 2QKBA 1OH5A 4YOUA 4KHUA 1NLVA 5HROA 1VSMA 3TAFA 3HTVA 4Z4HA 4CZKA 4DCHA 2QK9A 4CW7B 2NZTA 2IVNA 3TTCA 5IWAK 3G6EN 4DG1A 1GLJO 4RTFD 3L2QA 3DM2A 1QVGM 3EEQA 3CCSN 4RWTA 4JRPA 2GTDA 4DLGA 2ETJA 2V7YA 5IT9O 1SUQA 4JI1K 5ADXH 4DFPA 2P9LB 4CEDA 3ZSXA 3OJSA 3NH0A 4N56A 4CD1A 3SJJA 3LZJA 1YTUA 4Z4GA 1HJRA 5BR9A 1EXQA 2YCHA 3TAGA 3JYTA 2WONA 3AAPA 3O1BA 4GW6A 2D0AA 3VA0A 4JKDA 1NKCA 2GX9A 1L3SA 2O8CA 4Z0UA 4O8UA 2FBYA 4RW8A 3TTDA 2GEMA 4BR0A 3KLHA 1U47A 2PBDA 4M42A 3ZT1A 2KW4A 3EE8A 2KFZA 1ATSA 2KLAA 4FW1A 1TAUA 5AQVA 5KI6A 3ZX2A 4C1NI 3DLEA 4JKEA 2Q1NA 2ASPA 3IG1A 3H3NO 3THXA 3L4IA 1RDDA 4CBWA 4CZHA 4FLVA 2J4RA 1NM1A 1T3VA 3KZBA 5HRSA 4IKFA 4DB3A 5BPLA 2QWQA 3BY5A 1U2VB 1QHAA 5M1PA 4BC4A 3WT0A 3OYKA 3H08A 3BDPA 3K9JA 3CMAN 3G4SN 3O4QA 3U3YA 2O4IA 4KH6A 4JS5A 1IKYA 3CJCA 1JLCA 1OH8A 4FO0A 2IIRA 1ASUA 3NF7A 5LJWA 3CQYA 3PIOL 2Q2RA 1JL1A 1GLBG 2YHAA 1KAZA 4FLUA 3U8XA 4EFHA 3O80A 4M63C 4CCHA 3L2UA 1VQ7N 4ILHA 2P5GA 1WB9A 3V1RA 2YNFA 3KIOA 3QESA 1DLOA 3SBTA 3MWPA 3MEGA 4EP5A 4CF2A 4PWDA 3TAQA 3V9UA 4GV6A 3OYBA 3VQEA 3CF5L 3TAPA 3TAMA 2XY7A 3C6AA 3SI6A 4CVNE 1H1VA 4FWQA 3OS0A 4I2QA 1O13A 4FLZA 3ZETB 5AQTA 3QFUA 3NCIA 3U6FA 1BQMA 4B08A 1ZBIA 4JI4K 4JEPA 2QW9A 1QZ5A 4DSEA 3OVNA 2HF3A 4RG8A 1T6CA 2RF2A 1U6ZA 4W5RA 1XQSC 4FW2A 2YX6A 4DTJA 3TI0A 4HHTA 3HVRA 4KKOA 4YOWA 4B8CA 3CCMN 4XH5A 1GLLO 2E2OA 4PUOA 4DQRA 4DSFA 3MWTA 5JS1A 4Z4FA 1S6PA 1B9DA 1WAFA 3L3UA 3IS9A 3KK3A 2NRXA 3WEEB 5DM7L 2HHQA 2E88A 4JI7K 5AQFA 3CCQN 2HNYA 1S9EA 2QWPA 3PLAA 3DLGA 1OH6A 4CF8A 1WBBA 2IOCA 3K9KA 3BF3A 3P31A 1VRTA 1WSIA 2YNIA 3MK6A 1NMNA 4M3RA 4CF0A 3T1HK 4EZ9A 2VCPA 4GMJB 4LF5K 2JLEA 5C12A 3OY9A 1KFSA 4KREA 2QTDA 3ULEB 3DAWA 3EZWA 3U9DA 1K9MO 1BA0A 4DTSA 5CY4A 3ZSQA 5KGWA 3CQXA 4AHSA 1OH7A 3DRPA 4DQSA 3RR7A 4KV8A 4JNEA 4CJVA 4CJKA 2F96A 3PV8A 5GIOA 2ZD1A 1T8EA 3SAHA 5HP1A 4F8RA 1B9FA 3CCVN 4JD2B 1NOZA 5AQRA 3AGKA 5GAEP 4JI8K 1YAGA 3A2FA 3CERA 1TL1A 4JAXA 3NMUA 3CJAA 4FZYA 2E6LA 1BL3A 1W97L 1VQMN 1ZBHA 4CJSA 2P9PB 4GV3A 3CC2N 3CJ7A 1NMDA 5CHIA 3VQ5A 4YDUA 2I5JA 1WSEA 1RT5A 4ZTJA 4OKEA 1EWRA 1RTIA 5J2MA 3SCXA 2AP1A 4GNIA 4GVMA 4OO1J 2ZGYA 4H0VB 1T44A 3KWGA 2P9UB 4DV1K 4EIAA 4JK9A 3WXIA 1S1XA 5A2QO 3CI5A 4M7YA 3HT3A 2EWSA 3L8BA 4HWIA 4FJJA 3SAGA 4KRFA 2YJFA 2P9KB 2WUSA 3HBTA 4E3SA 4JHDB 2ZJQL 2D1KA 5GAGP 2CH6A 1WAJA 4EHTA 3AGRA 3MXMA 4CHPA 4FWKA 3JAMO 2OZMA 1NKEA 2E2PA 3ZEUB 1YUWA 2RE2A 4B3OA 3TU5A 2KFNA 2HOEA 4RW9A 3LDNA 4H03B 3CCJN 5DK5A 1BCOA 3QNOA 3C0BA 4B1ZA 3BP8A 3O9RA 4ELVA 2CGJA 1SS6A 4IBNA 1EETA 4ISEA 3C7NB 4KB0A 5HBMA 4CGFA 3MECA 1S1TA 2RKIA 4Z4CA 4FLYA 3J7ZO 3PY8A 1VSEA 4YNQA 1T7PA 5C10A 4JKBA 4PA1A 1ZBFA 3KJVA 2B4JA 2YNHA 5HRRA 1NGDA 3CCRN 3L2WA 2P5OA 1X3MA 4N47A 2PZSA 1CLQA 3LDQA 1U4BA 3QDKA 4NCBA 1J5OA 2XRIA 3CFRA 4CEBA 4OGEA 5FPMA 1Q81O 4BRLA 4CJ4A 4DKWA 1VSJA 3OS1A 3GDQA 3FZHA 2HVHA 2VQFK 3LP0A 2UU9K 1QSSA 3OBWA 1JXEA 1KXPA 4Q5VA 3ULDA 1S6QA 3CCUN 1HYVA 3P83D 1XNQK 1HQEA 2EHGA 4N41A 3SV3A 3VF4A 4AHVA 3AVIA 4BRIA 4CERA 4RW7A 3VN5A 2F9WA 3KK1A 3NGYA 3CC4N 1HPMA 2O8DB 1Q8IA 1RDUA 5ELZA 3T1YK 2V51B 4BROA 4B1WB 4ISFA 5LMUK 3VOVA 3HL8A 4KHWA 3AV9A 1TK5A 1O1WA 1GOBA 4DR2K 3DYAA 3QERA 4DU1A 2NRHA 2VG7A 4CGGA 4CZFA 1LCUA 3NGIA 3UIQA 5HRPA 4AHTA 4H4OA 4WF9L 4KHQA 4IZ9A 3OYGA 1OVQA 4BRQA 1BA1A 2OANA 1NK8A 3HSTB 1ZBSA 3LANA 5K14A 1BQNA 3FZLA 4WQ4C 2O8BB 4XH4A 3OYDA 3DRSA 4OVLA 2GWJA 4E1JA 2WC9A 2QI2A 4BE2A 1W2BM 4CJ7A 4IFEA 5SWMA 1TKDA 3AVAA 3E9LA 1YJNN 3HP6A 1KAXA 1QQOA 3FFIA 1HX1A 3D2FB 3EL2A 1J6ZA 2A42A 3DRRA 3NDKA 3SQ2A 3TWHA 5AQIA 4LF9K 4E7HA 4CJEA 3OW2M 4A57A 3LDSA 2IVPA 2F4VK 3AARA 4LFCK 4QS8A 1JL2A 4DQPA 3M5RA 3HYFA 4FLTA 1TAQA 4DV3K 4CK3A 2GUPA 2ITMA 4IDHA 1V4SA 4QS7A 3HXMA 4FJHA 2VG6A 3LDOA 2A5XA 2E1YA 3O3FA 3LL3A 2IGIA 5KQ8A 2HF4A 1IKVA 3D2EB 2LSNA 3RTVA 3RMAA 3F9MA 1HPZA 4BG8A 2W42A 1EO1A 4JK8A 3BZKA 2OCEA 4ID1A 1RILA 1YITN 5AZIB 5I3UA 2P51A 4FWLA 4F4KA 4A61A 3OTOK 5AQPA 3GOIA 4DR1K 5FROA 3PO5A 1BOTO 1ESVA 3FR0A 3DMJA 3RVCA 1JJ2M 3MEDA 3UKRA 3MMVA 1ASVA 4HCBA 3PUFA 3NE6A 4E7JA 4ZHRA 2QWOA 4MLEA 1KVAA 4WFBL 1A5VA 2NRVA 1YVUA 1GOCA 4DF8A 5T7BA 2HMPA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4A59 A;  3AGR A;  4A5B A;  4KH4 A;  4A57 A;  4A5A A;  4KH5 A;  4JEP A;  4KH6 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4IDK A;  2WFB A;  1KCF A;  3CHW A;  3OYE A;  1LAV A;  2OPQ A;  4CHY A;  4BDY A;  3RMB A;  1HNV A;  5KPT A;  1C0M A;  1YTA A;  1EX4 A;  5AR0 A;  1JCF A;  1NGA A;  5BRD A;  4CHQ A;  4DS4 A;  4FXD A;  3O9Q A;  5M1N A;  2GWK A;  2PFU A;  4IFV A;  2Q36 A;  3DLR A;  3E1Y A;  3FE1 A;  4XIU A;  2GEL A;  3BUZ B;  3S9H A;  4QCL A;  4HUF A;  4BRH A;  1RBU A;  4PQU A;  4CHN A;  2VGN A;  3NFA A;  3HVT A;  2HBJ A;  1B92 A;  3I55 N;  3P5J A;  1XHZ A;  1BDG A;  2GUI A;  1NK0 A;  3CD6 N;  2HVI A;  4FJK A;  3R8E A;  5AZJ A;  3AAQ A;  1JLF A;  1REV A;  2QWR A;  2RHK A;  1U49 A;  4B3T K;  3BF1 A;  4B9T A;  4BRG A;  3D6R A;  4BDZ A;  3AVF A;  4BRM A;  5BRH A;  2RN2 A;  4PKI A;  3MN7 A;  2XY6 A;  1I39 A;  4H4M A;  4BR7 A;  1C1B A;  3L0Q A;  1HMV A;  1WLJ A;  3QEW A;  4DTU A;  3K57 A;  3ISN C;  4V19 S;  5JVH L;  1ASW A;  3D45 A;  3O9S A;  3P39 A;  3ENH A;  1NNE A;  1MA9 B;  2D5R A;  3QML A;  3ZLJ A;  3TAR A;  4CZJ A;  4LH4 A;  1HYZ A;  3VEV A;  3VTH A;  2KKZ A;  2X6S A;  5KGX A;  5D3G A;  4OPK A;  4BWJ A;  3LM9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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