4A61A

Parm from plasmid r1 in complex with amppnp
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
321
structure length
309
Chain Sequence
HHLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDERDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINSIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords PLASMID SEGREGATION PROTEIN PARM
publication title A Bipolar Spindle of Antiparallel Parm Filaments Drives Bacterial Plasmid Segregation.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 92
structure length 309
sequence length 321
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4a61A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4a61A01
5AQKA 3VEZA 4BR5A 3UKRA 5AQLA 3MCPA 4FPBA 4CZIA 4Y0WA 4BR7A 1QZ6A 3MK6A 3VEYA 3LDLA 4NB4A 3B8AX 4DB3A 2HMPA 3H3NO 3QFUA 2NZTA 3VEWA 2V7YA 4L3QA 4B9QA 5EOYA 1G99A 3R6MA 3L6QA 2Q2RA 1RGIA 2A3ZA 3GG4A 3QB0A 5AQIA 1ATSA 4H5WA 3SK3A 5LJWA 1H1VA 2HOEA 2ZGZA 3FR0A 3H3OB 5FPMA 1X3NA 5AQYA 3SMPA 3TPQA 4CZLA 3TU5A 4PL8A 1DKGD 3U4LA 1NGGA 3P4IA 2A6AA 3BP8A 3GL1A 1NGAA 1KXPA 4BR2A 2V52B 3JS6A 4BRKA 4H5NA 1BA0A 4PKGA 3DXKA 4H5RA 3QMLA 2P9KB 4AM6A 3LDOA 3KZBA 4K43A 3U9DA 1QHAA 3DXMB 2AA4A 3D7EO 2W40A 1IG8A 1U6ZA 3BF3A 4FOIA 4QS7A 5ADXA 5AQMA 3GOIA 1RDWX 3F9MA 3LL3A 5AZJA 3O4WA 2E2QA 1HKBA 2GEMA 4NO7A 4A61A 4H5TA 4IJNA 2GWKA 4A2AA 1KAXA 1SAZA 3O80A 4FWRA 5AQWA 3LM2A 2P9PA 2YHYA 1Q18A 1BOTO 4FWOA 4A62A 3ZEUB 4EHUA 4BRCA 4BC4A 1GLLO 3VGLA 4ISFA 2YHXA 4BG8A 5AR0A 1JCFA 4FL9A 3VEOA 4FOEA 4B1WB 2A41A 4BR4A 5BREA 3VERA 1C0FA 3FZHA 3CIPA 3VF4A 3EN9A 4PKIA 4H0YB 5BRFA 1LCUA 3O8MA 4PL7A 4BRAA 4BRLA 2ZF5O 1ESVA 5BPMA 3IMXA 4JHDA 3SMSA 5FPNA 1NGEA 5JICA 4YDUC 5AQGA 4BRNA 5E84A 3W0LA 1YXQA 5E26A 3VGKA 4HWIA 3EKSA 4XH5A 3GE1A 2E20A 1XC3A 3LM9A 4MO5A 2VWBA 4GNIA 3VGMA 5BPLA 3HI0A 1YUWA 3QDKA 4WQ4A 4BG9A 5EY4A 3HSCA 4CBWA 3C7NB 3KVGA 2GELA 3DXKB 4FWKA 4RTFD 3FZKA 2FSNA 3EL2A 2Q0RA 3WQUA 2QWPA 2QWRA 3HBTA 3A5LC 3FGUA 3CHWA 1QQMA 3S41A 2IIRA 1XQSC 2KHOA 2YCHA 1T44A 1BA1A 2IVPA 3QFPA 5ADXH 2A5XA 4CZMA 5AZJB 2W41A 2D0OA 2GWJA 3R8EA 3WT0A 4FPAA 5I9EB 1J6ZA 1T6DA 4B1XB 3A5MC 2CH6A 1Y64A 4RWTA 2P9PB 4E1JA 1EQYA 2QWQA 3LDQA 4XH1A 4CJ7A 3CJCA 4H0XB 5AQHA 4B1ZA 4BRFA 1NBWA 5JLFA 1CZAN 4FWMA 4WQ5C 3AAQA 4ISGA 1HKCA 1TYQA 5AQSA 3EKUA 3GDQA 3SLCA 3D2FA 3U9ZA 5AFUA 1P8ZA 4K25A 4MLEA 1DGKN 2CGJA 3A8YA 1TUUA 1NGHA 3HZ6A 4MO4A 1YVNA 3C7NA 1MWKA 1C0GA 4PKHA 5TKYA 4JHDB 2IVOA 3UE5A 3FE1A 1SZ2A 4IWVA 3H45C 4EFHA 2ZGYA 3VOVA 1YAGA 5FPEA 5BRHA 3UKUA 3O1WA 3G25A 5JMVA 1OKJA 2AP1A 2HF4A 4JD2A 4CZJA 5AQQA 4BRPA 2QXLA 1GLDG 2V7ZA 3AAPA 1NGFA 3BUZB 1NGCA 4EHTA 3VENA 4B1YB 3SJHA 2I7NA 5AQZA 3H1VX 3H6EA 5BN9A 3QBWA 3CI5A 1ZBSA 2F9TA 1V4TA 5AQVA 3R9PA 1BU6O 3UB5A 3LDPA 4BQZA 3WEEB 1NGIA 3VPZA 4K41A 4M7YA 3VEXA 1HPMA 1LOTB 5AQUA 4DHYA 1BO5O 5JLHA 4B1VA 4AM7A 2PAVA 3I8BA 3KHYA 4CD3A 3CJ7A 4CZKA 3O6WA 4YDUA 1Z6RA 2QM1A 5AQJA 2ZWHA 3O1BA 1NGJA 4BC5A 5F0XA 1QQNA 5AQOA 2ASMA 1MWMA 2GTDA 2P9UA 1GLCG 4F9OA 2FSJA 1TYQB 3O5BA 4BRGA 1IJJA 5BR9A 3D2FB 2EWSA 3ID8A 2NLXA 4JN4A 1NGBA 3C0BA 4H5VA 4BVOA 1U2VA 4LC9B 5KPTA 4FWNA 4BC3A 3EO3A 1D4XA 2UYTA 2V51B 4BRHA 4EIAA 3ENOA 2P9SA 2E88A 3ZX2A 1BUPA 1GLFO 4BREA 5AQFA 4CBXA 4DCHA 1BWFO 1E4FT 2ITMA 3UKUB 1QQOA 2P9LA 3CJAA 4BR9A 2D0PA 2DPNA 3CQYA 4MLHA 1HX1A 4I6MA 5EX5A 1GLEG 3WEEA 2YJFA 3MN5A 2D4WA 3H1QA 4H03B 5AQTA 4JD2B 1GLBG 2FF6A 1NMDA 3FZLA 4WQ5A 5AQPA 5AZIA 3D2EB 2Q31A 4BC2A 1MDUB 3HTVA 2Q36A 3IDHA 3MN7A 4CZHA 1ZC6A 4XEIA 3IFRA 3EZWA 1MA9B 4IJAA 4H0PA 3QICA 2ASPA 1E4GT 5FPDA 2BTFA 5EVZA 4H0TB 3MDQA 2QWOA 4JAXA 4BRMA 4CBUA 1KAYA 3ULEA 3WUHA 1GLAG 3BEXA 5F1XA 4CD1A 2A40A 2FXUA 3AARA 1ATRA 4CI6A 1K8KB 2A42A 4FWSA 2FLOA 3CJBA 1HUXA 4HTLA 2VCPA 2QW9A 3OHRA 2E2NA 2GUPA 2P9UB 5AQRA 5BN8A 1BDGA 1NWKA 3J8AA 3U8XA 3M1FA 4M63C 5AQNA 1Z05A 3ZETA 3HM8A 2NRHA 5BRDA 3BF1A 2PBDA 2QWNA 3DJCA 3M3ZA 4H0VB 5CE3A 2QWMA 1HKGA 5KQ8A 4O8KA 3CERA 2P9NA 1U2VB 2Q0UA 5KPRA 4DQ8A 1DEJA 3VF6A 1X9JA 3IUCA 3VF2A 1QZ5A 1T6CA 1ATNA 3VETA 3RSEA 2FF3B 4J8FA 1WOQA 2P9SB 3FZMA 4WYBA 4A2BA 2OANA 1NGDA 3CJ1A 3M6GA 2E1ZA 2QWLA 4H0OA 1HJOA 4FO0A 2P9IA 3D2EA 4CZFA 1TUYA 3VESA 3A5OC 3I33A 3VEVA 1NLVA 4BRDA 5ELZA 3WQTA 2CGKA 4CZEA 4BQLA 4Z94A 2ASOA 1V4SA 3FFKB 4IXCA 2CGLA 2P9LB 4XH4A 5EXWA 1R59O 4I6MB 2YHWA 4BROA 5F2RA 3FLCO 3H46O 3WXLA 2YI1A 1RFQA 1JCGA 2CH5A 3DAWA 1S3XA 4FWLA 5AZIB 4C23A 3L0QA 1K8KA 3FZFA 3ATUA 1X3MA 3CQXA 1WUAA 4GY2B 2HF3A 4BVPA 4BRIA 2Q97A 5BPNA 4JNEA 2E8AA 3UKRB 1ZXOA 4QS9A 4QS8A 3ULEB 2E2PA 5LJVA 3L4IA 5AFUH 4K42A 4BRQA 5LY3A 3A0IX 2D1KA 3CJ9A 3AY9A 1JCEA 3A5NC 5KPZA 2FSKA 2I7PA 3GBTA 3QBXA 3MN9A 3WXJA 4EAHD 1HLUA 3ZETB 2J4RA 1SQKA 2P9KA 1XUPO 4IO8A 2H3GX 4BGAA 3MMVA 3WXKA 2P9NB 2YJEA 3DXMA 1BG3A 3DWLA 2E1YA 3MN6A 3LDNA 4M7XA 2E2OA 3WXIA 4FSVA 3W3DA 3ZX0A 3ENHA 3RSEB 1NM1A 4BGBA 1S22A 4CZGA 3CETA 4B1UB 2IVNA 5AQXA 5KQDA 2P9IB 3O08A 1GLJO 1KAZA 3ATVA 4FWQA 3ZX3A 2VYPA 4BR0A 4FWPA 2WUSA 4KBOA 4ISEA 4WQ4C 3JXUA 2F9WA 2Q1NA 5B8HA 4IZ9A 2BUPA 4O5FA 3ZEUA 4RCHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GV6A 3VEZA 4GKJK 3HT3A 3UKRA 4JK7A 2DFEA 3PIPL 1Q82O 4CZIA 4BR7A 4BACA 4M3ZA 4DTRA 3J7AP 3VN5A 3LDSA 5J2PA 5C0YA 4B9QA 5EOYA 4JLHA 4FK2A 1JLGA 3L6QA 1JL2A 4BE2A 3AVKA 2YNHA 3EEQA 1DT9A 5LJWA 4JS5A 1H1VA 2HOEA 2ZGZA 4OPHA 2NUBA 4FJIA 3DLBA 4PL8A 3U4LA 2YNIA 3P4IA 4NCBA 1KXPA 4BR2A 2V52B 4BRKA 1BA0A 4PKGA 3QMLA 4AM6A 1DTTA 1Q86O 2HSTA 3U9DA 1JLCA 2O8CB 2W40A 3BF3A 1U6ZA 4FOIA 4EP5A 4QS7A 4Z4EA 5ADXA 2IOCA 5AQMA 5AZJA 3K2PA 2E2QA 3MXJA 4DV6K 4H5TA 1S1VA 4A2AA 4NCAA 4UY8O 1WB9A 1VHXA 3O80A 5AQWA 5FRNA 1NOZA 3OYMA 3ZEUB 4DS5A 3VGLA 3DOLA 4BG8A 3QNOA 3T69A 1CZBA 1KSPA 3VEOA 1NJZA 3K57A 2BDPA 1CLQA 4BR4A 2O8BA 3E01A 3NFAA 1BQMA 4CGIA 3VERA 1C0FA 4F2RA 3CIPA 3EN9A 3PSIA 2OZSA 1Q9XA 2BH1A 5M1KA 1YT3A 1TK8A 1S1XA 5BPMA 4M42A 1S5JA 4W5OA 5E26A 4IG3A 1DTQA 3VQCA 1ILYA 3KJVA 4LFBK 4HWIA 4XH5A 2ZJRL 2E20A 1XC3A 2VWBA 3AVJA 4GNIA 4KH4A 5GAEP 5GADP 4FM2A 3HI0A 4WQ4A 1WBDA 3VQDA 5GAGP 4EZ6A 3PIOL 3ZT0A 3ZT4A 3EL2A 5J1EA 3HBTA 3FGUA 1VQNN 3S41A 1Q8IA 1BA1A 4XIUA 1F21A 5AZJB 2W41A 4WFBL 5C10A 2GWJA 3R8EA 1TKXA 2NRZA 2WC9A 1J6ZA 1T6DA 3A5MC 4IOXA 2RE2A 4DV3K 4FZXC 4CEEA 3O3FA 5AQHA 1RBRA 4DV1K 1K73O 1VQKN 5JLFA 3KTQA 4WQ5C 1ZBIA 1HKCA 2PFUA 4Q0BA 3GDQA 4KHNA 3RWUA 4YFUA 2PYLA 3HYFA 4KTQA 2O8BB 3QNNA 2IGIA 2NNWA 4CJVA 1NKCA 5BR8K 3VTHA 4K8XA 1TK0A 3ZT2A 1YVNA 1EX4A 5M1FA 3DLKA 3CCMN 1EWQA 1NG9A 3KWIA 4X65K 4CF9A 2YNGA 1D8YA 4LF5K 3UE5A 1SZ2A 1WNSA 4IWVA 1I94K 4JI1K 3MEGA 3O1WA 4IOCL 1U47A 1QQCA 4AHUA 4CZJA 5AQQA 4LSNA 3O9UA 2E4LA 3BUZB 3TSPA 4EHTA 3K5NA 1K9MO 5C2DA 2KKZA 1ZBSA 3K58A 1HNIA 4WFAL 3UB5A 5TKWA 4BQZA 2HNYA 3VPZA 4K41A 1NK5A 1LOTB 1TL3A 4CJFA 3OJSA 3J7YP 4PQUA 1WLJA 2XY8A 4E0DA 4CEOA 3CJ7A 4FK4A 4YDUA 4M3UA 1Z6RA 3CCRN 3NHGA 2ZWHA 2O4GA 3C65A 4DV7K 4F9OA 1DLOA 3E9PA 3F9KA 3MX5A 4CW7B 1IJJA 5BR9A 3AVLA 2NRRA 1IKWA 4BE1A 1U2VA 4LC9B 1WSFA 4FWNA 4BC3A 3EO3A 4KI6A 2KZMA 3NVMA 4JRQA 3AVFA 1QVFM 3C95A 5C24A 4TSXA 4KAZA 4A5BA 1W97L 1J5OA 1GLFO 2YNFA 5AQFA 4BREA 4CBXA 2P5GA 3P31A 1VRUA 4YOVA 3QIPA 3IG1A 3F73A 3NCIA 4BR9A 3SUQA 3V1QA 2OTJN 1LW2A 4H03B 1UOCA 4JKCA 1GLBG 4NXMK 3FZLA 1J9AA 2HHTA 2Q31A 4CJUA 4DMNA 2G8HA 1NK4A 3TAMA 1S72N 1B92A 1ZC6A 3SV3A 3KK7A 5KRSA 1VSHA 4IJAA 4H0PA 3QICA 4DSLA 3F2KA 5FPDA 3NGZA 5EVZA 3ZCMA 1U48A 4JAXA 2FBYA 2A40A 4Z4GA 1M1KO 4E7KA 2OZMA 1K8KB 3F5TA 1OH6A 2A42A 3I0RA 3BY5A 1XWLA 4LH4A 2VCPA 4NCGA 4NLBA 1YJNN 3OHRA 2E2NA 5AQRA 3KK3A 1NWKA 1W7AA 3NF7A 1Z05A 3ZETA 3HM8A 1YTUA 2NRHA 2OYQA 4FLTA 4H0VB 5CE3A 1X9WA 4B9TA 1HRHA 1I39A 1WBBA 1RTHA 3OYJA 4IDHA 1U2VB 2HHHK 4FYDA 5KPRA 1D5AA 2KLAA 1JLQA 1YTAA 1KD1O 2GBZA 4WYBA 2OANA 3M6GA 2E1ZA 3K5OA 3ASMA 1LWCA 1TUYA 3VESA 3VEVA 4BRDA 5ELZA 1N33K 4BQLA 4Z94A 4FVUA 3AA5X 3SAHA 2HMIA 2XHBA 5F2RA 1K6YA 1LW0A 1RFQA 2O8DA 1JCGA 3OW2M 3CG7A 3DYAA 4CHNA 3H08A 4DU1A 3L0QA 4I9QA 1EWRA 3U3GA 2Q97A 4OGCA 4CEZA 2GV9A 3VQ5A 3ZSZA 4WE1A 3CD6N 3L4IA 4OKEA 5AFUH 1SV5A 3I56N 3AO2A 4K8ZA 3RMDA 3DRPA 3VQ9A 5LY3A 2D1KA 4DWIA 3CJ9A 4N56A 3AY9A 3L2QA 3A5NC 5KPZA 3MEDA 1A5WA 1NK7A 4KHSA 4EAHD 4I7FA 3LAKA 5CHIA 3ZETB 2P9KA 4RW6A 3SQ2A 4C8LA 3K59A 2FBVA 3MMVA 4B9VA 2YJEA 3DXMA 3DWLA 2E1YA 4B3SK 3C94A 4M7XA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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