4A7KA

Bifunctional aldos-2-ulose dehydratase
Total Genus 204
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
204
sequence length
885
structure length
879
Chain Sequence
QPAALPLFQPQLVQGGRPDGYWVEAFPFRSDSSKCPNIIGYGLGTYDMKSDIQMLVNPYATTNNQSSSWTPVPLAKLDFPVAMHYADITKNGFNDVIITDQYGSSMDDIWAYGGRVSWLENPGELRDNWTMRTIGHSPGMHRLKAGHFTRTDRVQVVAVPIVVASSDLTTPADVIIFTAPDDPRSEQLWQRDVVGTRHLVHEVAIVPAAETDGEMRFDQIILAGRDGVDCLWYDGARWQRHLVGTGLPEERGDPYWGAGSAAVGRVGDDYAGYICSAEAFHGNTVSVYTKPAGSPTGIVRAEWTRHVLDVFGPLNGKHTGSIHQVVCADIDGDGEDEFLVAMMGADPPDFQRTGVWCYKLVDRTNMKFSKTKVSSVSAGRIATANFHSQGSEVDIATISYSVPGYFESPNPSINVFLSTGILAERLDEEVMLRVVRAGSTRFKTEMEFLDVAGKKLTLVVLPPFARLDVERNVSGVKVMAGTVCWADENGKHERVPATRPFGCESMIVSADYLESGEEGAILVLYKPSSTSGRPPFRSMDELVAHNLFPAYVPDSVRAMKFPWVRCADRPWAHGRFKDLDFFNLIGFHVNFADDSAAVLAHVQLWTAGIGVSAGFHNHVEASFCEIHACIANGTGRGGMRWATVPDANFNPDSPNLEDTELIVVPDMHEHGPLWRTRPDGHPLLRMNDTIDYPWHAWLAGAGNPSPQAFDVWVAFEFPGFETFSTPPPPRVLEPGRYAIRFGDPHQTASLALQKNDATDGTPVLALLDLDGGPSPQAWNISHVPGTDMYEIAHAKTGSLVCARWPPVKNQRVAGTHSPAAMGLTSRWAVTKNTKGQITFRLPEAPDHGPLFLSVSAIDAIPVIVQGDSIELSAWSLVPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Lyase
molecule keywords ALDOS-2-ULOSE DEHYDRATASE
publication title Crystal Structure of Bifunctional Aldos-2-Ulose Dehydratase/Isomerase from Phanerochaete Chrysosporium with the Reaction Intermediate Ascopyrone M.
pubmed doi rcsb
source organism Phanerochaete chrysosporium
total genus 204
structure length 879
sequence length 885
ec nomenclature ec 4.2.1.110: Aldos-2-ulose dehydratase.
pdb deposition date 2011-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18056 PBP3 Penicillin Binding Protein 3 Domain
A PF18637 AUDH_Cupin Aldos-2-ulose dehydratase/isomerase (AUDH) Cupin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.990 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4a7kA02
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4a7kA03
4H04A 4QD2B 1RZOB 1AVAC 2P23A 3KMVA 4IZXA 4QKRA 1ISXA 1SR4A 3O4AA 2Y9WC 3P6JA 3HOMA 4HJJA 4OEEA 4I4QA 1DIWA 2GO2A 5D63A 1IJTA 2AFGA 2Y9XE 3OJMA 3V0AA 5BXRA 2FGFA 1TFMB 1MD6A 3FJ9A 3V0AB 1HWOB 3BA7A 1TWMA 3BAHA 3O4CA 3ILAA 3CQAA 1DFQA 2BEAA 4KEKA 3P6IA 1BFFA 1D0HA 1AFCA 1QXMA 3B9UA 1OQLB 5BP5A 3W9TA 3O4BA 3OBRA 4J23B 1W3FA 9ILBA 3FFZA 21BIA 4D0ZA 1G9CA 2NP0A 1II4A 4QBVA 4G6JA 4IZEA 2KI4A 1IOBA 5F8WA 1TTUA 3AKGA 2LIEA 4LO1A 3E8LC 4KBBA 1CVSA 5BOWA 1S0FA 4QD2C 1QQKA 2RG9B 2P39A 4F34A 3AKIA 4Z8SB 2ZR1B 2VXTI 5BQUC 5FNWA 2KH2A 5E24E 1Z0HA 3VT2A 1FGAA 4JAWA 1ISWA 3BX1C 3CA3A 3PG0A 4JPZA 1MC9A 4EKXB 4IQPA 4G9NA 4AN6A 1ITBA 4QO3A 1FMMS 1BFGA 1V6UA 1WBAA 4I3NA 3OGGA 1PUMB 3FJIA 4LO7C 1QQLA 5EHAA 4LO0C 1DFCA 4XFUA 1Z4SA 2ZQNA 5BP5C 5D62A 3N7MA 2M49A 3EF2A 3CA6A 4EFRA 1W3GA 2Y9FA 1R8OA 3N7KA 4AN7B 3H6RA 4I0YA 4P0LA 1IRAX 1YTOA 3H6RB 4GOVA 4P0JA 3WINA 1W3AA 3HN1A 3VT0A 2DS0A 4OW4A 2NTDA 3A21A 5BXTA 3WO2A 1BA7A 3FJDA 3HALA 2KKIA 1FMZA 2ZQOA 4USOA 3AJ5A 1JT5A 3MPPG 3BRGC 2I1BA 3CA4A 4I4OA 5G00A 2VUAA 5DSSB 1JT4A 1ISVA 4EFPA 1XZZA 1R8NA 1AVUA 1FQ9A 3BRFA 3FJEA 1SZ6B 3CAHA 2DREA 3RSJA 2E4MC 4X38A 4OEFA 3F62B 4FGFA 4ZKTB 4G9MA 1EVTA 1V6VA 1P63A 4X3AA 1WD4A 3RMYA 4LO2A 5FZZA 4I4SA 1T4QA 3S8KA 3BAOA 1FN0A 3FJFA 3UD7A 3LTQA 1NUNA 4I8MA 3IIRA 1HWNB 5F8SA 4I4UA 3RMXA 2DRYA 4XFSA 3CA5A 4EB2B 3WMVA 4OEGA 1S0LA 1F31A 2AAIB 1ONKB 2WRYA 4KEIA 4R6UB 2KLLA 2BEBA 3VSFA 1TOOA 3BA5A 4TLPA 2UUSA 5D61A 1CE7B 3MALA 4OUJA 2DRZA 1IHKA 2F2FC 2XOAA 3FUOA 4J2KA 4IY8A 3AH1A 1DQOA 3Q7XA 5GAQA 4OWJA 1G9DA 3BAVA 3VT1A 3V0BA 2FFVA 3BA4A 3I2AA 4G6MA 3VWCA 3BAQA 2D22A 2D7IA 3V0BB 2MIBA 3A22A 4JRAA 3D7WB 2LIQA 4X37A 1JT3A 1SR4C 4JKXB 3O3QA 2RSTA 4GP3A 2GZBA 1A8DA 4I96A 1XG6A 4Z9WB 1G9AA 1S0GA 3UJ0A 1IILA 3QR5A 4IHZA 1M2TB 3VEQA 2Z48A 4ZLBB 4EFQA 3WA1A 1J0SA 3FJ8A 1BASA 1K5UA 4GAIA 2Q3NB 1AVWB 3BB2A 1AF9A 4GAFA 2D43A 4LO8B 2Y9GA 1HKNA 7I1BA 3FUQA 1S0EA 1G9BA 3PHZA 3WO3A 3FGMA 4I2SA 2RQ9A 1I1BA 1VCLA 3ZC9A 2D7RA 1K5VA 1V6XA 2NYYA 3UD8A 4IY9A 3Q7YA 3P53A 2AQZA 3BTAA 3FJBA 4LO1C 4ZFYB 2QN4A 4Q91A 1ISZA 3OBTA 4ZA3B 4X39A 4ZFUB 1RG8A 3HBWA 4QALA 2FDBM 3FJCA 3O4OA 4LO3A 3ZC8A 2NZ9A 4I4PA 4I1EA 5DUYA 1HCDA 4A7KA 5JLVA 2R9KB 1G82A 1S0DA 4KEJA 3ZXDA 2HWAA 2D44A 1HIBA 3NBNA 1ILR1 4HR6C 2IWTB 1ISYA 6I1BA 4I7IA 1DZDA 1BLAA 1BARA 4L4HA 1BLDA 1Z2VA 2BFHA 4I4RA 2HZ9A 4A7ZA 1DJSB 3JRRA 3NBDA 1Q04A 5F8YA 5I1BA 4USPA 4GOYA 5FZUA 4QBCA 1L2HA 3WINC 1HWMB 3I29B 1HWPB 1IT0A 5BXSA 4GP0A 3AKHA 3CA0A 4H9WA 3WO4A 3O5WB 3IM5A 3NBCA 3ZX7A 3R4UA 4JQ0A 3RTJB 3UD9A 4Q9PA 1JT7A 2K8RA 1PUUB 3BADA 1FV2A 8I1BA 1JQZA 2ERMA 3N7JA 5FZYA 4ENDA 1E0OA 4A7YA 3CRGA 5EC5A 3N7LA 2D20A 1JTCA 1YF8B 2VU9A 4G1RA 1YYNA 1AVXB 3FJJA 4ZGRB 2L5XA 4CJMA 5BQUA 1EPWA 3AJ6A 5F90A 5BXPA 1PC8B 4P6AA 3HSMA 2J3PA 3JUTA 2FO1A 4J2XA 1PWAA 4P0KA 1RY7A 4ISQA 2ESUA 1BFCA 2NM1A 1IRPA 3HMYA 2MC2A 3IAGC 3OJ2A 4KC3A 4LO2C 1WD3A 4DCKC 1GGPB 2AXMA 4I4YA 4I37A 4EEEB 4LO0A 1Q1UA 3O49A 3R4SA 1FWVA 4LO7B 2D24A 3C9ZA 3PUBA 1RMLA 1TP0A 1XYFA 2D1ZA 1DZCA 1DLLA 3CRIA 1HCEA 4ZFWB 3WMUA 3UJ4A 4PC4A 3AH2A 3POKA 1S0CA 3O44A 1M16A 3V79C 2X2TA 3NJ5A 2K4AB 1TIEA 1I1EA 31BIA 3FJHA 4I4XA 4OWKA 5JMCA 1T9FA 2D23A 4ISRA 4Q9GA 1AXMA 1N4KA 4FVVA 4IYBA 5FNXA 2ET2A 1XHBA 1Q03A 1PZZA 3FJAA 1JLYA 3LLPA 2QYIB 1EV2A 1FWUA 3UDAA 3ZXGA 1NZKA 3AZVA 2HWMA 3O4DA 2HW9A 3SNVA 2NVHA 3A07A 1KNMA 1S0BA 3H6SE 2MLLB 4XFTA 3TC2A 2X2SA 4QKSA 2IHOA 3IM6A 4II0A 2VSAA 2E4MA 5B2HA 2VLCA 3RTIB 2Z49A 3H6QA 1DQGA 1FV3A 2F8XC 3OGFA 4I4VA 2VXRA 41BIA 1JLXA 4HA2A 4YOLA 4ZBVB 4OWLA 4DEPA 3AH4A 4J2YA 2YUGA 1JY0A 2VSEA 3CRHA 2KI6B 3FJKA 2Q9XA 2WBCA 5EG6C 4D0TA 3A23A 3S8JA 4ZOTA 1BFBA 4F83A 3K1XA 1TWEA 3F1RA 4IONA 3VSZA 4QC4A 4JP0A 1YBIA 5HPZA 3T8SA 3IM7A 3BRDA 4DENA 3QYDA 5DZUA 4L4IA 3OJVA 1V6WA 5BVPI 4J2SA 3AKFA 2K43A 3NBEA 4D8HA 3BAUA 3I2XA 4I1BA 3CU1B 1WBCA 2FFUA 1ABRB 4WBCA 4XKIA 2F2FA 4JKQA 3BAGA 4I6IA 4LO3C 3Q7WA 3PMEA 3VUOA 3N0KA 3CA1A 1YXWA 1UPSA 5DVHA 1EYLA 3AZWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FOYA 4UF0A 4BK5A 2P23A 3KMVA 1QJU3 2Y6KA 4BQ1A 2ZKLA 4IZXA 1C8NA 1W6MA 2BBAA 3AZYA 4AEMA 1FI2A 2XJTA 2H6CA 2RR11 2VOKA 3GYDA 3HPNA 2WZR1 5IVBA 3HOMA 3P6JA 5FYSA 1A6CA 1J1TA 3OY8B 4XQ4A 1OI6A 5B2GB 3KF5A 2Q1MA 4PJYA 1IJTA 3SITA 2VG9A 2CU5A 3Q8EA 4P9JA 1E5HA 4PI0A 3V0AA 2Y9XE 2WNUA 3HEIA 5L19A 1MD6A 4ASKA 1VRH2 5FPZA 3LFIA 4QB1A 3AVRA 3RZKA 3BA7A 3NNFA 2CGOA 3W5NA 1PM4A 1RUH2 4CE8A 1DFQA 4NIHA 1RUC2 2XBO2 5FUPA 5FYYA 4IEXA 1YFUA 1EUTA 4LTAA 1NQDA 1CZSA 5FZ1A 3TBDA 1JUHA 1SG3A 3LEMA 4XZPA 4YW3A 3B9UA 1OQLB 3W9TA 4YFZA 3GM8A 3KLSA 1PO22 1W3FA 4B4PA 5CFDB 4XJ8A 3VHRA 3AXDA 4XUOA 4CDXC 3T3YA 5EJZB 4QBVA 2A6YA 4WVZA 3S6PA 2J1AA 4EN9B 5J1XA 2WWSA 4IZEA 2JDUA 4HG6B 2ZX3A 1MZ5A 5F8WA 3IAPA 1C4RA 1UX6A 3MBWA 5FYCA 1H2MA 2XGXA 4KBBA 3H8RA 5GLUA 1QU0A 5K0UB 3LDKA 4PDWA 2JG8B 1VBA3 4LBQD 4AXOA 1DQ2A 3JBG2 4F34A 4QQOA 1PMHX 2VZUA 3R05A 2FD8A 5BQUC 4IV3C 4MGYE 1W0PA 3SCHA 5E24E 3FLTA 3H8UA 4ITCA 2Y64A 4AQ6A 4A42A 1V70A 2Z2SB 1ISWA 1W2AX 3WNNA 4JPZA 1OXCA 1UU6A 2HWE1 1PZ8A 1QJX3 3VBHC 1GNHA 3O5SA 4Y1ZA 5DAVA 3SCFA 4HT1T 4AGRA 3U4XA 4QO3A 3GJBA 2WBKA 1OOPA 4FP2A 1FMMS 4YGBA 1BK1A 4EWDA 2W92A 3DF0A 1VRH1 3N9MA 5KHKA 5D2AA 4I3NA 1S1AA 2P3KA 4CCDA 1EUUA 3IWZA 5A3PA 4LO7C 1RUH1 5EHAA 3F95A 4XJZA 1RUC1 2D6KA 4Q26A 3GZTB 1Z4SA 4GJYA 1JYCA 4YG3A 2JECA 1HJGA 2DUOA 4MOAA 1APNA 2ZZJA 1BVVA 3NL1A 4QPIA 3HVDA 5J96B 3I3BA 3CA6A 1PO21 3VZNA 2VVEA 1BBT3 1FAYA 1BMV2 1WMXA 4M3CA 1QNWA 4A44A 4GWIA 1IRAX 5JR7B 3RJRA 2JG8C 5LA0A 4Y3OA 1MS9A 3WINA 1IS3A 3HN1A 1W3AA 3VT0A 3U14A 5T3NA 5T55A 5IVFA 3BTXA 1OKQA 2ORXA 3BUCA 2EALA 2VCMA 1IQDC 3JUUA 3K77A 1GZWB 2GC3A 4IEWA 3JBG1 3I2KA 3H7YA 1UU4A 3N4MA 1XNDA 1BA7A 2BEOA 2BZDA 3FJDA 1FXZA 1KQRA 2V09A 2WA3A 4OHWA 4PT6A 1FMZA 2LROA 1NXD1 2Q4SA 4QHBA 2ZQOA 5C33A 4XFCA 5A3WA 3PL0A 2L9LA 4QX3A 3BRGC 2J1UA 4CEYA 3VZJA 2I1BA 2LW8A 3M2MA 3AKRA 3H50A 2MPFA 3C7HA 4C91A 3ACLA 3VBUA 1LEMA 3T0BA 4TWTA 4LKFA 5G00A 5GZDA 1VBA2 3SISA 1JT4A 1OFNA 2W0XA 4IE0A 4EFPA 5J36A 1QXPA 4JDMA 5JAXA 4Q4V2 3LGRA 3NNMA 1SMVA 1FQ9A 3MEPA 5JI7A 2VMHA 4GH4A 1WUVA 4QB6A 2D40A 1IGOA 5DG2A 1CPMA 1JZ6A 1SZ6B 3P6BA 3RZJA 3CAHA 2E6VA 2DREA 5CFCC 2P3JA 3GHNA 5GLTA 2E4MC 1QJX2 5LK5A 2QQMA 2IC1A 2VMCA 4ZKTB 3VDDC 1MZFA 1DQ6A 1JZ8A 3RQ0A 2BGCA 1BMV1 4ES9A 4X3AA 4XQDA 4U2AA 1DBNA 3O1RA 4B4RA 1KEXA 1JTZX 1WCSA 5A33B 5SV5A 3FJFA 1QNYA 1XYNA 2BP6A 2DCZA 4I8MA 4L92A 3WQ7A 1RITA 4YLZA 1F2NA 4R9AA 5JPMB 3K3OA 4FAHA 5I8TA 3RMXA 3SHRA 5DDJ2 2DRYA 2XLAA 4XIOA 1F9KA 3LEKA 2A6XA 4DXSA 5JXJA 1N1SA 4JDNA 2IVIB 3S57A 4EB2B 1HIXA 3FX3A 4CDUC 1BQPA 1F5JA 1LECA 2DVDA 4N53A 1DGRA 4OEGA 2ZGPA 1RXFA 1RHI2 4YZ4A 1VLNA 2VQUA 3HWJA 4O7XA 2WZPP 2E63A 2YGLA 3ETQA 3BVCA 2XDVA 2C0ZA 1I9RA 4JGYB 1VJ2A 4WBBA 4CUCA 2FDFA 2WN2A 1RUF2 4LBJA 5G05L 4IEYA 3NW4A 4O65A 4QX1A 2AEZA 1G6NA 4AF9A 1VBA1 2KLLA 2JDYA 2WNVC 1TOOA 2VZ1A 2YPDA 4IUGA 3BA5A 4CP9B 2VECA 2BNMA 4TLPA 3IKWA 4AI0A 4Q4V1 2Y0IA 4QHOA 5A7OA 4BZ4A 4CCJA 1ZRCA 2UUSA 4MHUA 4XW3A 3ZKYA 4ZZ5A 3KT1A 3TOJA 1NE4A 3Q7XA 1DQOA 1AYM3 3B7MA 5FYVA 5KC5A 1ZZ9A 3VBRB 4BIOA 3TEZA 1AHSA 4OWJA 4P00B 1QJX1 1SLTA 4K1ZA 4L97A 3MW4A 2EXKA 3V0BA 3I2AA 3BA4A 2VOVA 1PIV2 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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