4A7YA

Active site metal depleted aldos-2-ulose dehydratase
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
886
structure length
880
Chain Sequence
QPAALPLFQPQLVQGGRPDGYWVEAFPFRSDSSKCPNIIGYGLGTYDMKSDIQMLVNPYATTNNQSSSWTPVPLAKLDFPVAMHYADITKNGFNDVIITDQYGSSMDDIWAYGGRVSWLENPGELRDNWTMRTIGHSPGMHRLKAGHFTRTDRVQVVAVPIVVASSDLTTPADVIIFTAPDDPRSEQLWQRDVVGTRHLVHEVAIVPAAETDGEMRFDQIILAGRDGVDCLWYDGARWQRHLVGTGLPEERGDPYWGAGSAAVGRVGDDYAGYICSAEAFHGNTVSVYTKPAGSPTGIVRAEWTRHVLDVFGPLNGKHTGSIHQVVCADIDGDGEDEFLVAMMGADPPDFQRTGVWCYKLVDRTNMKFSKTKVSSVSAGRIATANFHSQGSEVDIATISYSVPGYFESPNPSINVFLSTGILAERLDEEVMLRVVRAGSTRFKTEMEFLDVAGKKLTLVVLPPFARLDVERNVSGVKVMAGTVCWADENGKHERVPATRPFGCESMIVSADYLESGEEGAILVLYKPSSTSGRPPFRSMDELVAHNLFPAYVPDSVRAMKFPWVRCADRPWAHGRFKDLDFFNLIGFHVNFADDSAAVLAHVQLWTAGIGVSAGFHNHVEASFCEIHACIANGTGRGGMRWATVPDANFNPDSPNLEDTELIVVPDMHEHGPLWRTRPDGHPLLRMNDTIDYPWHAWLAGAGNPSPQAFDVWVAFEFPGFETFSTPPPPRVLEPGRYAIRFGDPHQTASLALQKNDATDGTPVLALLDLDGGPSPQAWNISHVPGTDMYEIAHAKTGSLVCARWPPVKNQRVAGTHSPAAMGLTSRWAVTKNTKGQITFRLPEAPDHGPLFLSVSAIDAIPVIVQGDSIELSAWSLVPAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Lyase
molecule keywords ALDOS-2-ULOSE DEHYDRATASE
publication title Crystal Structure of Bifunctional Aldos-2-Ulose Dehydratase/Isomerase from Phanerochaete Chrysosporium with the Reaction Intermediate Ascopyrone M.
pubmed doi rcsb
source organism Phanerochaete chrysosporium
total genus 196
structure length 880
sequence length 886
ec nomenclature ec 4.2.1.110: Aldos-2-ulose dehydratase.
pdb deposition date 2011-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18056 PBP3 Penicillin Binding Protein 3 Domain
A PF18637 AUDH_Cupin Aldos-2-ulose dehydratase/isomerase (AUDH) Cupin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.990 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4a7yA02
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4a7yA03
3HSMA 4GOVA 2NZ9A 1AFCA 4OWJA 3CQAA 5BXPA 2VSEA 4I96A 3K1XA 4KC3A 4I6IA 2Q9XA 1QQKA 3JUTA 1AVWB 4Q9GA 3MALA 3BAVA 3N7MA 3HALA 4EB2B 3BB2A 3BRGC 1FMMS 2IHOA 3C9ZA 4LO2C 1S0EA 4X3AA 1AF9A 4HR6C 1JT7A 2WBCA 3O49A 4WBCA 2ZQOA 1Q1UA 5EHAA 2K43A 2M49A 2D7IA 4I4UA 3BRFA 4I4YA 2QYIB 5HPZA 4R6UB 3AKHA 1ISVA 3CRIA 31BIA 1TP0A 3VSFA 1V6UA 4FVVA 5G00A 3P53A 3V0BA 4I2SA 1JLYA 3AKIA 1OQLB 3ZXGA 4GAIA 2FO1A 2KI6B 1K5VA 2NVHA 4QKRA 3OJMA 2R9KB 1ISXA 4I7IA 1JY0A 1G9AA 1R8NA 3N0KA 4QBCA 2NYYA 1TFMB 9ILBA 4I8MA 3N7KA 4I4PA 4OW4A 4FGFA 2E4MA 2P39A 3NBCA 3CA0A 1D0HA 2BEBA 1BLAA 4TLPA 4IY8A 4LO3C 3UD9A 3VT2A 3I2XA 1HCDA 2ESUA 1WD4A 1II4A 2Y9WC 3IM5A 2DS0A 1VCLA 3BAGA 2GO2A 2FFVA 5BQUA 1ISYA 3ZC9A 5BXRA 2K4AB 3UD7A 4ZFUB 1IJTA 3VWCA 3O4AA 3I29B 4AN7B 4HA2A 3VT0A 4OEGA 6I1BA 3HBWA 5DSSB 1EPWA 5I1BA 1FN0A 1WBAA 1W3AA 4G9NA 3ILAA 4IQPA 1Z2VA 4I0YA 1DZDA 2AFGA 5FNWA 4J2KA 1MD6A 1M2TB 1TIEA 1PZZA 1QQLA 3WO2A 1JTCA 1ITBA 4JPZA 4ZFYB 2DREA 3TC2A 3BADA 2NTDA 5EC5A 4LO0A 4IYBA 4I4VA 1XYFA 2K8RA 1M16A 1IRAX 5F8YA 4Z9WB 1F31A 1ONKB 2BEAA 1Z0HA 3FJHA 3RTIB 4EFQA 3AZWA 3A07A 1YYNA 4D0TA 1XHBA 1CE7B 3IIRA 1IRPA 4QBVA 1SR4A 1GGPB 1SZ6B 2KLLA 2D22A 3AKGA 4KEJA 4P0LA 4ENDA 1FV2A 2I1BA 1DQOA 4X37A 3RSJA 5BP5A 3FUOA 1A8DA 1G82A 3FUQA 3O4OA 4LO1C 3T8SA 1E0OA 3O3QA 3WINC 3R4SA 2X2SA 1WD3A 1I1BA 1XG6A 3FJEA 3A23A 3CRGA 2VXTI 3FJJA 3NBDA 1DJSB 4DENA 1FQ9A 3V0BB 3MPPG 4JP0A 4PC4A 1PWAA 2HWMA 3WO4A 3A22A 3QYDA 3AKFA 1HWOB 1ILR1 2D23A 5BOWA 4JRAA 3HN1A 3BRDA 1BFBA 1HWMB 1QXMA 2L5XA 3D7WB 4HJJA 2Q3NB 4QALA 2VXRA 2VSAA 4D0ZA 2VLCA 2LIEA 3FJCA 4QD2C 1HKNA 5FZYA 3OBTA 3O5WB 4LO2A 2Y9FA 4J2XA 5FNXA 2FFUA 3OGGA 4USOA 3OJ2A 3FJKA 3Q7YA 3P6JA 41BIA 2F2FC 3CA4A 1FMZA 1NUNA 3O4DA 1Z4SA 4LO8B 1WBCA 4EEEB 3H6RA 1V6WA 4AN6A 1DFCA 1S0CA 3CRHA 1PUUB 2KKIA 3FFZA 1EV2A 2YUGA 1Q03A 2RG9B 3BA4A 4ZLBB 4J23B 2D43A 5JMCA 4ZA3B 3RMXA 4JAWA 4IHZA 1UPSA 3N7JA 3CA1A 3NJ5A 1BLDA 3AH1A 1JQZA 2ZQNA 4EFPA 1KNMA 1S0BA 1HIBA 4L4HA 3WMVA 3VEQA 3S8KA 4LO3A 5BVPI 1BFCA 4Z8SB 2AAIB 5D63A 5F90A 4QC4A 1AVXB 3HMYA 1RY7A 4P6AA 1BARA 2F8XC 4Q9PA 2ZR1B 1TWEA 4XFTA 1S0DA 2D1ZA 4GAFA 3ZXDA 7I1BA 3PUBA 1IOBA 3VUOA 1AVAC 3LTQA 4CJMA 5DVHA 1BASA 1Q04A 1ABRB 1RZOB 1IILA 4OUJA 1DZCA 1YBIA 4OEFA 4Q91A 1G9DA 4H9WA 3KMVA 4X39A 4A7ZA 3AJ5A 1TOOA 4J2SA 3NBEA 2NP0A 4KBBA 4P0JA 3V0AA 4IZEA 4DCKC 3CU1B 3QR5A 3FGMA 3FJ8A 1FV3A 3HOMA 1T4QA 3BX1C 3ZC8A 1T9FA 4EKXB 4YOLA 4LO0C 1HWPB 4KEKA 3FJAA 3S8JA 4I1EA 4G6MA 4QO3A 4ZFWB 1JLXA 4DEPA 5D61A 4ZKTB 1YXWA 2HWAA 3SNVA 5BXSA 4LO7B 3CA6A 1NZKA 1AXMA 1MC9A 4LO1A 3AZVA 1W3FA 3BAOA 4JQ0A 3FJFA 1BA7A 1TTUA 3O4BA 4IZXA 4H04A 3H6RB 5BP5C 4GP0A 2J3PA 1FWVA 3OBRA 3POKA 4A7KA 5BXTA 4X38A 4ZBVB 3FJIA 3W9TA 3F62B 4P0KA 4A7YA 4I3NA 4QKSA 2MLLB 2Y9GA 1S0FA 2ET2A 3UJ0A 4OWLA 1L2HA 3PHZA 1HWNB 2D20A 1IHKA 1G9BA 3FJBA 3NBNA 5E24E 3WA1A 5D62A 2F2FA 1JT4A 21BIA 4F34A 1V6XA 1XZZA 4LO7C 3OGFA 3IM7A 3IAGC 2X2TA 3OJVA 5DZUA 3P6IA 3PMEA 4I4QA 5DUYA 2HZ9A 8I1BA 1AVUA 3CAHA 4ISQA 4OWKA 3BAUA 1ISZA 1DFQA 2MC2A 5F8SA 4XKIA 3A21A 1HCEA 3V0AB 2DRYA 3B9UA 4IONA 2E4MC 3PG0A 1J0SA 4KEIA 3IM6A 3Q7XA 1CVSA 3CA5A 5EG6C 1R8OA 2Y9XE 2VUAA 2WRYA 4I4OA 1V6VA 3VSZA 1BFFA 3H6QA 1DLLA 2KH2A 4I4SA 1S0GA 3R4UA 3BAQA 1N4KA 1W3GA 1YTOA 4ZOTA 2MIBA 3AJ6A 4II0A 3CA3A 2VU9A 1PC8B 2RSTA 1DIWA 3AH2A 2Z48A 4I4XA 2XOAA 5BQUC 1K5UA 1YF8B 3UJ4A 5B2HA 1ISWA 4JKQA 2P23A 1EVTA 1RG8A 4JKXB 3UD8A 3RMYA 2HW9A 1JT3A 3JRRA 1I1EA 1FGAA 2GZBA 3BA7A 3V79C 1IT0A 3H6SE 5GAQA 4EFRA 1P63A 2D7RA 4G1RA 3WO3A 1FWUA 2AXMA 3BA5A 3FJDA 2UUSA 3O44A 4ISRA 4ZGRB 1G9CA 4USPA 2FGFA 2FDBM 3VT1A 3RTJB 3UDAA 1S0LA 2BFHA 2D44A 2AQZA 5FZUA 4F83A 5JLVA 3FJ9A 3ZX7A 1RMLA 1BFGA 2NM1A 3EF2A 2QN4A 3N7LA 4L4IA 2RQ9A 4I4RA 3I2AA 4G9MA 1DQGA 4XFSA 3O4CA 2D24A 2DRZA 4QD2B 3BTAA 3Q7WA 2Z49A 3LLPA 4D8HA 1SR4C 1TWMA 1JT5A 3BAHA 5FZZA 3WINA 4IY9A 1EYLA 4GOYA 4J2YA 3E8LC 4GP3A 4I1BA 2KI4A 2ERMA 3F1RA 4G6JA 3AH4A 3WMUA 4I37A 4OEEA 4XFUA 2LIQA 1PUMB 5F8WA 2IWTB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DQ6A 4QPWA 4PF5A 1K5MC 1KEXA 3F95A 1NUKA 1E5IA 4WVWA 3TOJA 4GZ9A 2DCZA 4FFGA 5C70A 1AFCA 1HRV1 1AUYA 3KGZA 1YQ8A 2VW1A 1UF2C 1HDKA 2RM23 2G9GA 2VCAA 4JKMA 3VKMA 1NA1B 4AVTA 1TMF2 2BFUS 4GB31 3SC7X 4CZSA 5T5PA 5A1LA 4AFBA 4Q4W2 2JDMA 3S0MA 1S4CA 3S57A 4I6IA 3UGGA 4JGZB 3KMHA 4I3GA 2VUDA 4M01A 1BJQA 1ZBA2 4CDWC 2BVVA 5I93A 3BAVA 1RUG3 1OA3A 3BTXA 3HALA 3BB2A 3NSTA 4GWNA 5IW0A 4AI1A 1FMMS 4KWJA 3C9ZA 2JIGA 1AR91 3T2PA 4FPEA 2ZGLA 1UQXA 3PVOA 4HR6C 1J84A 3ZN4A 3K3OA 5IHRA 1JT7A 1NE6A 1NCQC 2ZGKA 2DTWA 2JG9C 2ZQOA 1Z7S3 1ENQA 2K43A 5LBCA 1J1TA 2EIBA 2ZMNA 3AMHA 4FOVA 4QM8A 2M49A 3OY8A 1REDA 2GC2A 5JPNB 2WT0A 2IWGB 1CPNA 1NOVA 5FXVA 4R6UB 2PFWA 2D98A 5DZEA 3CEWA 2PHTA 5FMDA 5IJRA 31BIA 2IXCA 4UFKA 1O5LA 3VV1A 5KHHA 5LB6A 4FVVA 1V6UA 1CAUA 1NY71 1V9U3 2PHRA 2XHKA 4QHZA 4COZA 2ZABA 4DXRA 1JYXA 1PMIA 1OQLB 1JS9A 2ZMKA 4PI0A 4QQLA 1B35B 4ET7A 1G7YA 1V6NA 2R9KB 5JAXA 4B4QA 2XVKA 2ARCA 3NV1A 1MEC1 2VNGA 1SACA 3I8TA 1GR3A 3I2KA 3FLTA 2NYYA 4FP3A 5EP9A 2E53A 3PLQA 4CCCA 3F2ZA 4TYSA 5FYUA 3N7KA 3POYA 4IEZA 1QOTA 2VD7A 4JKLA 5J36A 5BV6A 4OW4A 2E4MA 1SDWA 1OFSA 3CL1A 2R49A 2WSUA 4JZRA 3SEEA 3ASIA 3VBHA 4QWNA 4ASKA 4QKNA 3M1HA 4UFMA 5CG9A 3KT4A 5JXIA 3UD9A 1HQWA 1HCDA 5JR7B 3PVNA 3GBFA 1MS5A 4FCAA 1JZ5A 3ZFGB 4LK7A 2OW4A 3I2JA 5J1XA 3K4AA 5G04L 5L7OA 2DS0A 4KU7A 5A7NA 3T1LA 3BAGA 3BTZA 5FPUA 1KJRA 2H6BA 2K4AB 4LO8A 1IJTA 3VD4A 5G05L 4ZONA 2PAKA 4Q4V3 5IK4A 1NZCA 3ST7A 4IGQA 4DS0A 1QEXA 2G9ZA 3ZYIB 1GBGA 6I1BA 2BV4A 1X7NA 2PELA 4ZXEA 1WBFA 2WNVC 4EN8B 3HBWA 3N9NA 4BU2A 1Z2VA 3NRUA 1C57A 1JU3A 4B7EA 1CONA 2AFGA 5KXEA 4OUMA 1YFXA 3KT7A 5FNWA 1MVQA 1QJU1 5F2WA 5LA9A 5FQ0B 1DQ0A 2PXJA 3AMMA 3NJYA 1KDMA 2ETEA 4U2AA 4Y20A 2BRTA 1QQLA 3ILRA 1QJEA 2PQSA 3JB4C 4LE3A 1S2BA 5E8AA 5GKAC 3CIHA 4Y1ZA 2GMMA 1Y7BA 2DVFA 2N7GA 5EC5A 4COVA 3RZGA 1DDLA 1HRV3 5EJ1B 3QCWA 5ANQA 3QH6A 1KGYA 4XJ8A 5FY1A 5FK8A 4CEWC 1M16A 2K8RA 4Z9WB 2E7TA 4RA0A 1F31A 2X29A 4XFHA 5F2SA 3VD5A 1XRUA 2FDJA 3FHQA 5A7OA 3BTYA 2RE9A 1JYIA 5A80A 3WCRA 2QBXA 2DU1A 3OPWA 1PMJX 5KHJA 4XXAA 4EFQA 5F8YA 4YW7A 3AXDA 3A7QA 1FOD1 3JD73 3IIRA 3VBRA 4QBVA 2WC2A 4QGNA 3GBWA 3LEKA 5J98B 4KWLA 1GGPB 1WLCA 1FWVA 4GH4C 3AKGA 2CDOA 2C5DA 1FV2A 3KQ4B 1CJPA 1ALYA 2H0VA 2VQAA 4ZZ8A 1N1VA 5KC5A 1NLRA 3FUOA 4LO1C 3O4OA 4TLFA 4XEZA 5I0UA 1E0OA 3TEYA 4XQWA 3O3QA 4UY4A 3R4SA 2X2SA 3OY8B 4Q1RA 4HN1A 3A23A 1SZBA 3VKLA 1GICA 2VM9A 4LIVA 2NN8A 1D4M2 4KG0A 3J26N 3TN93 3VL9A 3FJJA 3SH4A 1C5IA 2BOJA 4RYDA 2KM2A 1DJSB 2ZMLA 4DENA 2RJKA 1CAUB 2OX0A 4C1WA 4F7ZA 5H9QA 3CHXA 3MPPG 4BQ2A 4XHBA 4PC4A 1KS4A 1POV0 2HWMA 3A22A 4LNVA 5FMOL 1ILR1 4GB32 3J7LA 4HLTA 4CA9A 1GQGA 1PHMA 1X82A 3LD8A 3Q8CA 4NVPA 4OCTA 4BQXA 1O3RA 1F2NA 3NQHA 4BM8A 1AX2A 1RVF3 3U0ZA 3OGSA 4ASMB 1N47A 2R1DA 3WNNA 1SDDB 5F37A 1H2LA 4HONA 4AZZA 1QXMA 2RJ2A 3BYWA 5JVVA 4QB6A 5DUXA 1ENXA 2Q3NB 2R7EB 2VMIA 2VZQA 4FPGA 3ZYFA 1C1LA 3VBHB 5JR2A 3VDBA 2VMHA 4RS5A 1EP0A 4FI9A 5FZEA 1AR92 5LBBA 1AL21 2XHNA 4BPZA 1SHWB 3LPFA 3M70A 5GZCA 2XJQA 4J2XA 4TN7A 3T09A 2IVIB 1OBNA 3OGGA 3WT3A 3RJ2X 4XZPA 4AI0A 4USOA 5L7OB 4Y4YA 3D82A 3RI9A 1V6MA 2W68A 1SBEA 3LOBA 1POV1 2ZEYA 1FMZA 4EZ4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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