4A9KA

Bromodomain of human crebbp with n-(4-hydroxyphenyl)acetamide
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
KIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
molecule keywords CREB-BINDING PROTEIN
publication title Fragment-Based Discovery of Bromodomain Inhibitors Part 1: Inhibitor Binding Modes and Implications for Lead Discovery.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 115
sequence length 115
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2011-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4a9kA00
4QEWA 3LQHA 2DVRA 4MR4A 5HCLA 5FE0A 5F5ZA 4NRBA 5FE8A 4TT6A 4UITA 4LR6A 2L5EA 3JVKA 4N4IA 5E3GA 5IG6A 4Z1QA 2F6NA 5DLZA 4NR4A 4YY4A 3UW9A 4BW2A 5A5OA 5ACYA 4BW1A 5D24A 5ENIA 3S91A 3P1EA 5A5PA 5I29A 4UYDA 5ENFA 4MEOA 3S92A 5AMFA 5CRZA 4KV4A 3NXBA 5FE7A 4YBTA 5EI4A 4A9OA 4LYSA 3IU6A 3MB4A 4UIVA 4QZSA 4QUUA 4BJXA 5LJ0A 4MENA 4HXLA 5HRWA 4N3WA 4OGJA 2RFJA 3Q2EA 4UYFA 4E96A 5C8GA 5CP5A 5I80A 1JSPB 4NS5A 5E9MA 5C89A 2GRCA 4Z6HA 5IGMA 3LQIA 4QSVA 4NYXA 5E9VA 4Z6IA 4QSXA 5TB6A 4NUCA 5F25A 4N4GA 5ENGA 5E9LA 3DAIA 5ENEA 5C4QA 4QY4A 5CQTA 4UYGA 5KHMA 4YYGA 5I7YA 5I88A 5I89A 5CFWA 4O77A 3JVMA 5DX4A 5I7XA 4UYEA 2I8NA 3AADA 2YW5A 5D3LA 3JVJA 5CTLA 5KTXA 2DKWA 5CQ4A 3SVHA 5LKTA 3LJWA 3D7CA 3U5MA 5EU1A 4CUSA 5ENJA 5A83A 4TYLA 5EPRA 5K29A 4ALHA 4A9MA 3P1FA 4LYIA 4WIVA 3AQAA 3U5OA 3ONIA 4J1PA 2D82A 4TZ8A 5CUGA 5FG5A 5CY9A 3UV5A 5A82A 4A9EA 5E74A 4KCXA 5AMEA 5FBXA 4CLBA 4HXNA 4TS8A 2YEKA 5L99A 4YYHA 4J0SA 5DW1A 4GPJA 2OO1A 5F3AA 5J0DA 5FFYA 2R10A 4MEQA 5CZGA 3SVGA 4YYNA 3RCWA 4A9JA 4YADA 4NRAA 5D3NA 5FG6A 4O7FA 4QUTA 5CUBA 5CUAA 4LZRA 5F1HA 4TU4A 4YH4A 3O37A 4HXOA 4QC3A 5COIA 3P1DA 4CUPA 3UVYA 4NXJA 4ZC9A 5LJ1A 5FH6A 4QSUA 4O78A 5E9IA 4YAXA 3MULA 5DY7A 5FH7A 5AD3A 4IORA 5CPEA 2F6JA 4QSRA 5FDZA 4YYIA 4MR3A 5FG4A 4NUDA 5CQ3A 4C66A 4LRGA 4HXRA 2L85A 4OUFA 5ENHA 4XUBA 4YATA 4PTBA 3G0LA 2OSSA 4YYMA 4CFKA 2RNYA 5TCMA 4MEPA 5A5SA 3DWYA 5LVQA 5CU8A 4YYJA 4YYKA 5HQ5A 5D3SA 2E3KA 5HLSA 5E73A 4NR8A 4NQMA 3UVXA 4QR4A 4J3IA 4NRCA 4TU6A 5EWCA 2YELA 4XY9A 5F63A 5CQ6A 5FH8A 4C67A 2N9GA 5L96A 5CUCA 4QSWA 4CUUA 4YYDA 4A9FA 4DONA 3QZTA 4KV1A 4A9KA 1ZS5A 5ETBA 2G4AA 2DVSA 5E0RA 5E9YA 5A81A 4ZQLA 4QSTA 4N4FA 5HELA 4O72A 4HXKA 5DFDA 1N72A 5HEMA 4HBWA 4Z1SA 5F60A 5C7NA 5FFVA 5H1UA 4Q0NA 5EWHA 5LVRA 5DKDA 4O74A 4RVRA 4BW3A 5DYAA 5CS8A 3TLPA 3UVDA 5D3JA 5EP7A 4XY8A 4O7AA 4TZ2A 5LJ2A 5DFCA 5BT3A 3LQJA 4IR5A 5IIDA 5CQ7A 5FE6A 4YY6A 4QNSA 5FE9A 5KO4A 5EQ1A 3P5OA 4FLPA 4TT2A 2DVQA 4CUQA 5DKHA 4A9NA 2RNWA 5D26A 2H60A 4CL9A 4HXSA 3U5LA 2RS9B 4PS5A 5E3DA 4NR9A 5HJCA 5JWMA 4YH3A 5CUDA 2DATA 5CQ8A 4ALGA 3UV4A 2YQDA 5H1TA 5HENA 4O7BA 5DYUA 3GG3A 4YABA 4O71A 2NXBA 3G0JA 4UYFB 5JI8A 2RI7A 5HRXA 4BW4A 5FE5A 5I40A 5C85A 3I3JA 5FFWA 5EM3A 3O35A 5II1A 2D9EA 2WP1A 5LKUA 3QZSA 5EA1A 5IGLA 4NYWA 3FKMX 5L8UA 3MUKA 5HFRA 5DYXA 3O33A 5F61A 1E6IA 1WUGA 4Q0OA 5FB1A 2R0YA 5IGKA 5EPSA 4NQNA 3Q2FA 5DBMA 5A5NA 5CQ5A 4IOOA 5G4RA 3U5PA 5FE3A 5CQAA 3QZVA 3U5KA 5HQ6A 4HXMA 2YDWA 5II2A 3MQMA 5HM0A 4QSQA 5LKZA 5A5RA 4YC9A 5F62A 4AKNA 5EPBA 2E7NA 3ZYUA 4UIYA 4XYAA 5I1QA 5DFBA 5L98A 2KTBB 4LZ2A 2YYNA 5L97A 5BT5A 4Z93A 4WHWA 5CRMA 4A9LA 2WP2A 5HQ7A 2RNXA 4XUAA 5DYCA 4PCIA 3O34A 3SVFA 4LDFA 4F3IA 4Y03A 5ENCA 4O75A 4BHWA 4PKLA 5C87A 4IOQA 5I83A 4QSSA 4UIZA 5HFQA 4UIWA 4UIXA 5EISA 4YBSA 3LXJA 4IR3A 5F2PA 4TT4A 5KTUA 5IGNA 4TQNA 5KTWA 5A7CA 4NR5A 4A9HA 2LSPB 4NR6A 4QYDA 4QR5A 4LYWA 4TTEA 4LC2A 5H1VA 3K2JA 5EGUA 5HRVA 5D3RA 5D25A 5BT4A 4A9IA 1JM4B 5A5QA 5L8TA 4PY6A 2RO1A 3HMFA 5ENBA 1X0JA 5EK9A 5DKCA 5F1LA 4HXPA 4HBYA 4QEVA 5EICA 4NYVA 4LZSA 2DVVA 5F36A 1WUMA 5IBNA 4WHUA 2OUOA 2DWWA 5ETDA 4QEUA 4CURA 4MR5A 4YBMA 2L84A 4HBVA 5CUEA 4PCEA 3JVLA 4IR6A 4O76A 4X2IA 5DLXA 2YEMA 4UIUA 5FE2A 4CFLA 5LUUA 5D3PA 4CUTA 2FSAA 2I7KA 5EWWA 5H85A 5FB0A 3HMHA 5EV9A 2E7OA 3U5NA 3MB3A 5D3TA 4UYHA 5CGPA 5G4SA 4YK0A 4J0RA 2R0VA 3UV2A 4O7CA 4O7EA 5D7XA 4N4HA 4QR3A 4QYLA 3HMEA 3O36A 4MR6A 4QBMA 5D3HA 3U5JA 5EVAA 4IR4A 5EWDA 2R0SA 5FE1A 4HBXA 4NR7A 5A85A 3IU5A 5AD2A 1EQFA 4OGIA 5KU3A 5DW2A 4ZW1A 3MXFA 4QSPA 2MJVB 3P1CA 5E7DA 4QB3A 5LKXA 4O70A 5EWVA 4QC1A 5FE4A 5E9KA 3UVWA 4NUEA 5I86A 1F68A 5D0CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QEWA 3LQHA 2DVRA 4MR4A 5HCLA 5FE0A 5F5ZA 4NRBA 5FE8A 4TT6A 4UITA 4LR6A 2L5EA 3JVKA 4N4IA 5E3GA 5IG6A 4Z1QA 2F6NA 5DLZA 4NR4A 4YY4A 3UW9A 4BW2A 5A5OA 5ACYA 4BW1A 5D24A 5ENIA 3S91A 3P1EA 5A5PA 5I29A 4UYDA 5ENFA 4MEOA 3S92A 5AMFA 5CRZA 4KV4A 3NXBA 5FE7A 4YBTA 5EI4A 4A9OA 4LYSA 3IU6A 3MB4A 4UIVA 4QZSA 4QUUA 4BJXA 5LJ0A 4MENA 4HXLA 5HRWA 4N3WA 4OGJA 2RFJA 3Q2EA 4UYFA 4E96A 5C8GA 5CP5A 4AKHA 5I80A 1JSPB 4NS5A 5E9MA 5C89A 2GRCA 4Z6HA 5IGMA 3LQIA 4QSVA 4NYXA 5E9VA 4Z6IA 4QSXA 5TB6A 4NUCA 5F25A 4N4GA 5ENGA 5E9LA 3DAIA 5ENEA 5C4QA 4QY4A 5CQTA 4UYGA 5KHMA 4YYGA 5I7YA 5I88A 5I89A 5CFWA 4O77A 3JVMA 5DX4A 5I7XA 4UYEA 2I8NA 3AADA 2YW5A 5D3LA 3JVJA 5CTLA 5KTXA 2DKWA 5CQ4A 3SVHA 5LKTA 3LJWA 3D7CA 3U5MA 5EU1A 4CUSA 5ENJA 5A83A 4TYLA 5EPRA 5K29A 4ALHA 4A9MA 3P1FA 4LYIA 4WIVA 3AQAA 3U5OA 3ONIA 4J1PA 2D82A 4TZ8A 5CUGA 5FG5A 5CY9A 3UV5A 5A82A 4A9EA 5E74A 4KCXA 5AMEA 5FBXA 4CLBA 4HXNA 4TS8A 2YEKA 5L99A 4YYHA 4J0SA 5DW1A 4GPJA 2OO1A 5F3AA 5J0DA 5FFYA 2R10A 4MEQA 5CZGA 3SVGA 4YYNA 3RCWA 4A9JA 4YADA 4NRAA 5D3NA 5FG6A 4O7FA 4QUTA 5CUBA 5CUAA 4LZRA 5F1HA 4TU4A 4YH4A 3O37A 4HXOA 4QC3A 5COIA 3P1DA 4CUPA 3UVYA 4NXJA 4ZC9A 5LJ1A 5FH6A 4QSUA 4O78A 5E9IA 4YAXA 3MULA 5DY7A 5FH7A 5AD3A 4IORA 5CPEA 2F6JA 4QSRA 5FDZA 4YYIA 4MR3A 5FG4A 4NUDA 5CQ3A 4C66A 4LRGA 4HXRA 2L85A 4OUFA 5ENHA 4XUBA 4YATA 4PTBA 3G0LA 2OSSA 4YYMA 4CFKA 2RNYA 5TCMA 4MEPA 5A5SA 3DWYA 5LVQA 5CU8A 4YYJA 4YYKA 5HQ5A 5D3SA 2E3KA 5HLSA 5E73A 4NR8A 4NQMA 3UVXA 4QR4A 3VKGA 4J3IA 4NRCA 4TU6A 5EWCA 2YELA 4XY9A 5F63A 5CQ6A 5FH8A 4C67A 2N9GA 5L96A 5CUCA 4QSWA 4CUUA 4YYDA 4A9FA 4DONA 3QZTA 4KV1A 4A9KA 1ZS5A 5ETBA 2G4AA 2DVSA 5E0RA 5E9YA 5A81A 4ZQLA 4QSTA 4N4FA 5HELA 4O72A 4HXKA 5DFDA 1N72A 5HEMA 4HBWA 4Z1SA 5F60A 5C7NA 5FFVA 5H1UA 4Q0NA 5EWHA 5LVRA 5DKDA 4O74A 4RVRA 4BW3A 5DYAA 5CS8A 3TLPA 3UVDA 5D3JA 5EP7A 4XY8A 4O7AA 4TZ2A 5LJ2A 5DFCA 5BT3A 3LQJA 4IR5A 5IIDA 5CQ7A 5FE6A 4YY6A 4QNSA 5FE9A 5KO4A 5EQ1A 3P5OA 4FLPA 4TT2A 2DVQA 4CUQA 5DKHA 4A9NA 2RNWA 5D26A 2H60A 4CL9A 4HXSA 3U5LA 2RS9B 4PS5A 5E3DA 4NR9A 5HJCA 5JWMA 4YH3A 5CUDA 2DATA 5CQ8A 4ALGA 3UV4A 2YQDA 5H1TA 5HENA 4O7BA 5DYUA 3GG3A 4YABA 4O71A 2NXBA 3G0JA 4UYFB 5JI8A 2RI7A 5HRXA 4BW4A 5FE5A 5I40A 5C85A 3I3JA 5FFWA 5EM3A 3O35A 5II1A 2D9EA 2WP1A 5LKUA 3QZSA 5EA1A 5IGLA 4NYWA 3FKMX 5L8UA 3MUKA 5HFRA 5DYXA 3O33A 4AKGA 5F61A 1E6IA 1WUGA 4Q0OA 5FB1A 2R0YA 5IGKA 5EPSA 4NQNA 3Q2FA 5DBMA 5A5NA 5CQ5A 4IOOA 5G4RA 3U5PA 5FE3A 3ERRA 5CQAA 3QZVA 3U5KA 5HQ6A 4HXMA 2YDWA 5II2A 3MQMA 5HM0A 4QSQA 5LKZA 5A5RA 4YC9A 5F62A 4AKNA 5EPBA 2E7NA 3ZYUA 4UIYA 4XYAA 5I1QA 5DFBA 4AKIA 5L98A 2KTBB 4LZ2A 2YYNA 5L97A 5BT5A 4Z93A 4WHWA 5CRMA 4A9LA 2WP2A 5HQ7A 2RNXA 4XUAA 5DYCA 4PCIA 3O34A 3SVFA 4LDFA 4F3IA 4Y03A 5ENCA 4AI6A 4O75A 4BHWA 4PKLA 5C87A 3VKHA 4IOQA 5I83A 4QSSA 4UIZA 5HFQA 4UIWA 4UIXA 5EISA 4YBSA 3LXJA 4IR3A 5F2PA 4TT4A 5KTUA 5IGNA 4TQNA 5KTWA 5A7CA 4NR5A 4A9HA 2LSPB 4NR6A 4QYDA 4QR5A 4LYWA 4TTEA 4LC2A 5H1VA 3K2JA 5EGUA 5HRVA 3D1DA 5D3RA 5D25A 5BT4A 4A9IA 1JM4B 5A5QA 5L8TA 4PY6A 2RO1A 3D1BA 3HMFA 5ENBA 1X0JA 5EK9A 2EJNA 5DKCA 5F1LA 4HXPA 4HBYA 4QEVA 5EICA 4NYVA 4LZSA 2DVVA 5F36A 1WUMA 5IBNA 4WHUA 2OUOA 2DWWA 5ETDA 4QEUA 4CURA 4MR5A 4YBMA 2L84A 4HBVA 5CUEA 4PCEA 3JVLA 4IR6A 4O76A 4X2IA 1PUOA 5DLXA 2YEMA 4UIUA 1ZKRA 5FE2A 4CFLA 5LUUA 5D3PA 4CUTA 2FSAA 2I7KA 5EWWA 5H85A 5FB0A 3HMHA 5EV9A 2E7OA 3U5NA 3MB3A 5D3TA 4UYHA 5CGPA 5G4SA 4YK0A 4J0RA 2R0VA 3UV2A 4O7CA 4O7EA 5D7XA 4N4HA 4QR3A 4QYLA 3HMEA 3O36A 4MR6A 4QBMA 5D3HA 3U5JA 5EVAA 4IR4A 5EWDA 2R0SA 5FE1A 4HBXA 4NR7A 5A85A 3IU5A 5AD2A 1EQFA 4OGIA 5KU3A 5DW2A 4ZW1A 3MXFA 4QSPA 2MJVB 3P1CA 5E7DA 4QB3A 5LKXA 4O70A 5EWVA 4QC1A 5FE4A 5E9KA 3UVWA 4NUEA 5I86A 1F68A 5D0CA
chains in the Genus database with same CATH topology
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