4A9UA

Crystal structure of human chk2 in complex with benzimidazole carboxamide inhibitor
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
304
structure length
287
Chain Sequence
MSVYPKALRDEYIMSKTLGSEVKLAFERKTCKKVAIKIISKDPALNVETEIEILKKLNHPCIIKIKNFFDAEDYYIVLELMEGGELFDKVVGNKRLKEATCKLYFYQMLLAVQYLHENGIIHRDLKPENVLLSSQEEDCLIKITDFGHSKILTSLMRTLCGTPTYLAPEVLVSVGTAGYNRAVDCWSLGVILFICLSGYPPFSEHRTQVSLKDQITSGKYNFIPEVWAEVSEKALDLVKKLLVVDPKARFTTEEALRHPWLQDEDMKRKFQDLLSEENESTALPQVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK2
publication title Benzimidazole Inhibitors of the Protein Kinase Chk2: Clarification of the Binding Mode by Flexible Side Chain Docking and Protein-Ligand Crystallography
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 90
structure length 287
sequence length 304
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4a9uA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4a9uA01
3DT1A 4HVSA 3U8WA 5F95A 2J0JA 1H1PA 3E7VA 4HGTA 3MYGA 3QZGA 3QBNA 1OITA 4M66A 3ZU7A 5AP5A 5LVOA 4IZYA 3IDPA 3TIYA 3ZH8A 4CG8A 4IM2A 4ZZOA 2WXVA 1IASA 3LW0A 2OH4A 3IKAA 4MBLA 3TI1A 5CS6A 4JLCA 4FZ6A 3D0EA 4DLJA 4JDKA 3R71A 3FI8A 2BROA 2OW3A 2BAKA 1RQQA 3R30A 3UIBA 2YJSA 4FKQA 3W55A 2WPAA 3GU5A 3R01A 4Q9ZA 5DT4A 5CI6A 3WYXA 5HHWA 4QMSA 2R7IA 4I0TA 1AGWA 2HZ4A 4IXPA 4R7BA 2VWWA 2E9OA 4RLKA 3LE6A 3C13A 2CLQA 2YCQA 3DOGA 3V51A 4EQMA 4FTMA 2ACXA 2XP2A 2YEXA 2PTKA 5CEIA 4O7LA 3HL7A 4FV3A 2GHLA 4O82A 2GMXA 4JRVA 5TKDA 3VJNA 4DLIA 2QLQA 3SG8A 5BPYA 2JBPA 4FG7A 4K1BA 3C9WA 1UNGA 5FDXA 4BCFA 3R21A 4I23A 5E92A 2WQNA 5D9HA 2JAMA 2VTTA 4FX3A 2CN8A 4WBBB 4YURA 3CSVA 4I6FA 2EWAA 4AT3A 4ANOA 2ONLA 3OP5A 3R04A 3JVRA 2REIA 2GFCA 4QD6A 3UG2A 4DFXE 4CFWA 5FTQA 2A27A 3I0OA 4TTHB 4Y8DA 5HESA 4ZSJA 1H24A 5LOHA 5LJJA 2QC6A 4HVIA 5HKMA 2Q0BA 3MTLA 4WSYA 2VTJA 2ITZA 1JSUA 4J53A 4O0SA 5JK3A 1GIJA 3ZC6A 3TTIA 2V0DA 4P2KA 1PXKA 1CTPE 4FOCA 3EQCA 4G9CA 4MXCA 3T3UA 4E6AA 5AA9A 5A4EA 3FPMA 3CPBA 4PF4A 1PF8A 3ZLWA 4BDJA 3MH2A 3GOPA 3R9RA 4LYNA 4P5QA 4XBUA 2JGZA 3FDNA 3ZRMA 3TV6A 3FLSA 3LQ5A 4FV0A 3OXIA 5DI1A 3OCTA 4EZ5A 4FV8A 2UZBA 3FE3A 4D0XA 2VWBA 3HRCA 1PKGA 2ZB1A 3F82A 3MB7A 3PA4A 3VS3A 4DH1A 4KIKA 4IZ5A 4RJ3A 3P7CA 5GJFA 4CVAA 2B53A 5KUPA 4KIOA 3MWUA 1RDQE 3UQFA 5JFWA 3V01A 4U5JA 4WHZA 5CZHA 5DG5A 4ZIMA 2XIZA 3JS2A 5TO8A 4FZ7A 3SVVA 4ITHA 2QOKA 3Q6UA 2C6OA 2R3IA 3REPA 4CEGA 1U5QA 5CAPA 3V6SA 4DGLC 1QPCA 4R5SA 5CT7A 4YHJA 5HG8A 4KSPA 5IH5A 4O38A 4OTGA 5J7BA 4V01A 4YLKA 3ZMMA 3NAXA 3WILA 3U9CA 3CD3A 4EC9A 3WIKA 1OPLA 4D55A 3R2YA 2WHBA 3P7BA 3GCPA 3ORIA 3ZTXA 4MD9E 3R1YA 2WMVA 4XH6A 3ZOSA 4CLJA 3FI2A 5F1ZA 2IG7A 4H1MA 4FZAB 4O96A 4J52A 3RVGA 4YTIA 5HU3A 1O9UA 4BDGA 2QVSE 3BGQA 1APME 3IDCA 3KEXA 3KN6A 3PG1A 1G3NA 4FYOA 4Z3VA 2NRYA 5LWMA 5EHOA 4F70A 3FKNA 5CSVA 1V0OA 2VTQA 2ESMA 3GU8A 4EZ7A 1QPEA 4KKGA 4A9UA 3O17A 4YR8A 2CN5A 4L7SA 5CXHA 4C8BA 4GK2A 3HNGA 3LVPA 4RWLA 4U45A 3PLAE 3PIYA 4QRCA 4ZSGA 5C1QB 1SNXA 4L52A 4U81A 3G0EA 3Q6WA 1YQJA 5J7HA 5M07A 3QD2B 5DT0A 4E5AX 4HGLA 4UY9A 4IJ9A 2HCKA 2QONA 2J9MA 5DR9A 4YHTA 5FXSA 4BI1A 4EOPA 2PVLA 3QYWA 5L8KA 3AC5A 4QQCA 1UWJA 4ZY4A 2HYYA 2YAKA 2I0EA 1ZRZA 3QQHA 2ITWA 1OBDA 3OBGA 4BB4A 2OXXA 4A07A 4AP7A 5C26A 4NYEA 4L42A 2I6LA 3C7QA 3I81A 3AC1A 4S33A 4ZY6A 5EW9A 4O1OA 4HPUE 3FMEA 3BLQA 2JC6A 3DXQA 4II5A 1TQMA 5LVPA 4AW2A 4QPMA 4BICA 4QNYA 3SGCA 3TZ8A 4DGNA 3ANRA 3N4VA 1MQ4A 5CQWA 5AR8A 5I9UA 2YAAA 4M84A 3S1HA 2VX0A 3ZDIA 4BN1A 1YHSA 1URWA 2XIXA 4EK3A 4WG4A 1GZNA 4FTLA 4FTJA 4HGSA 4UWBA 4YZMA 4BDAA 5J5SA 2QD9A 4CFVA 3EQHA 1IAJA 3LFDA 5A6NA 1J3HA 1U46A 2WMWA 4CQEA 2FVDA 1Z9XA 4QTDA 4Y72A 4AOTA 3CKXA 5HLPA 3PUPA 3LFBA 4NM7A 2HXLA 3D7TA 3ZZWA 5I4NA 1KV1A 1LEWA 5J1WA 4UN0C 4O7NA 2CCIA 2OG8A 3QHWA 3PJ2A 4FT3A 2VUWA 4AW1A 3QQJA 4XCUA 1U59A 4CZTA 2C3KA 3FZOA 3MY0A 5FEQA 2VX3A 4C59A 4CKRA 5CY3A 2WTJA 2CCHA 4WRSA 4ANMA 4EH5A 2JDRA 4H58A 4TYIA 4FKUA 4IC8A 3AD6A 5C9CA 3L9MA 3G15A 4EK6A 4X2GA 5A54A 4RMZA 1CSNA 3E8EA 3F7ZA 4PTGA 2PZYA 3C5UA 1OIUA 2C5OA 2BRHA 1CKPA 3EYGA 5AUXA 3IG7A 2BDWA 3D14A 3BWFA 3LCSA 4LMNA 4FTQA 4FC0A 3QQGA 2X1NA 3EKNA 3EJ1A 4F9WA 4GK4A 3BHHA 3E64A 1ZY5A 3PPZA 1Q5KA 2PVNA 4V05A 2HXQA 2IZSA 4ZSLA 2WNTA 3ZSIA 3QRJA 1O6LA 3TNIA 4AGWA 3RCDA 4R77A 1M7QA 3Q04A 2I0YA 4YBKA 4M69A 3UE4A 3ZS5A 4P5ZA 1W98A 4GT3A 5KKRB 2UZOA 4ZSEA 1W0XC 4U7ZA 4BDHA 4FSTA 4YTFA 3R9HA 4U40A 1GNGA 5GIPE 3GB2A 2F2UA 4OUCA 4XG4A 3W10A 1WMKA 3PRFA 5I3OA 4C61A 2BRBA 3II5A 4TN6A 4GU6A 4R8QA 3SW7A 1MRVA 4AQCA 2NNWB 4RT7A 3LXLA 3PZEA 1Q62A 5M53A 4H1JA 3WZJA 4BYJA 4F7LA 2VX1A 4FVRA 1R3CA 2QOQA 5E1SA 2DWBA 5IH4A 4DBXA 2CNUA 3L8VA 3MY5A 3NYOA 2XK7A 4FNYA 4RC3A 4F6UA 4HYHA 3P08A 4MX9A 2HK5A 2W9ZB 4FNZA 2IVTA 5CEKA 3HDNA 2W1DA 2V55A 1WBWA 5EHLA 3KRLA 4V0GA 4EONA 5J9YA 5EYDA 5KBQA 3BELA 5JMSA 2C47A 1LPUA 3ENMA 3OUNB 4XS2A 5A46A 4S2ZA 2ZV2A 2XEZA 2QU5A 3SG9A 2FSTX 3QUEA 2WEVA 3KGAA 4UBAA 3UNKA 2QO2A 2ITXA 3A99A 3E87A 3UOLA 4C33A 4C4EA 5IDNA 2JKKA 1V1KA 4U6RA 4ZTQA 2E9VA 5LMBA 2PVFA 3FQHA 3Q5IA 3ITZA 4K2RA 5CENA 1Q3DA 4F1TA 5HD7A 3UJGA 5AV2A 3VS2A 3GC7A 5ANKA 2G2FA 1YDRE 5EQPA 2BRNA 3PVUA 3LCTA 1PXIA 4G5PA 3UIMA 4ZJIA 4ASEA 1YI3A 3A2CA 4JQ8A 2WTVA 4EQCA 3PE2A 1PMVA 3P5KA 2Z7RA 3CQUA 4CKIA 2PUPA 2ITPA 4RVLA 4TYGA 2O5KA 3H9RA 1I44A 3VRZA 3IK3A 5AP0A 5CX9A 5AV0A 4FV4A 5L3AA 3Q2MA 2HY81 4Y83A 4E26A 4ALUA 1HCLA 3GC0A 3R2BA 1BL7A 1GZOA 1JNKA 4MD8E 5DEYA 3VUMA 4ANLA 5DN3A 4G6NA 3TZMA 5ANDA 3W2OA 1M17A 2EVAA 3AT4A 4ZS4A 4CSVA 3SX9A 5HEZA 2PZRA 4AOJA 2HW6A 4ZEGA 2P2IA 3LPBA 3OZ6A 4D2TA 1ZMVA 4DH5A 1OM1A 4QMWA 5HBHA 4J1RA 4ALWA 5H8BA 3GI3A 4NTTA 3KF7A 1YHWA 4IX5A 4K0YA 2UVYA 3LJ2A 2V62A 3MBLA 4RX9A 4XBRA 3V8SA 4A9TA 1ZYJA 3F2RA 4HYIA 2R3GA 2ZM1A 5EM7A 1H4LA 5AX9A 4IQ6A 4QYEA 4MXOA 3SOAA 4D4RA 4O7YA 4JBOA 4CFXA 4BTFA 3V5WA 4S30A 5D12A 3GFEA 4MHAA 3WF5A 5GJGA 2EU9A 1H27A 3LLAA 3POOA 5IQHA 4XV1A 5JFXA 1H0WA 1J1CA 1H1QA 5M55A 4X2NA 4C4FA 2WTIA 3EL8A 4CZYB 3CD8A 4W8EA 2AC3A 4K33A 3HKOA 5D41A 4EH2A 5GZ8A 3LLTA 3V6RA 5HGIA 4AGDA 1ZLTA 3LXNA 4FIFA 1WBPA 2RG5A 3C50A 3RTPA 4F64A 4W4VA 5EOBA 3DAKA 2QLUA 1IRKA 3CC6A 3NLBA 4BFMA 4FSUA 3DTCA 2R9SA 4YJTA 4JDHA 3C0GA 3LFQA 2VTHA 4NIFB 3UOJA 1J7UA 2R2PA 4KWPA 2CGXA 5IQFA 3LQ3A 2P33A 2C5VA 3MVHA 5L8LA 2XK4A 1Q4LA 4ITIA 5AMNA 5CU0A 3I79A 1YXSA 4PTEA 3D2KA 2UW6A 4C3FA 1QL6A 3F3TA 3GC8A 5IF1A 4PMTA 3COMA 2R3HA 4I6QA 3OWLA 4UALA 4UV0A 5CNOA 1YHVA 3B2WA 3EH9A 4X7QA 1NXKA 4MWIA 4F7SA 1P5EA 3L8SA 4OTHA 3R8VA 4FIIA 3TNWA 2J0IA 4JVGA 3QTIA 4H05A 2R3NA 1ZOEA 3MVMA 2W1GA 4NEUA 3QAME 4QMUA 3O0GA 1PXOA 3VUTA 4I20A 3R7YA 5JQ5A 2BDJA 4AN3A 1JKKA 2PE2A 5IQCA 2PPQA 1YXUA 5CU2A 1IA8A 1Q8ZA 2BZHB 1XHAA 2JIUA 2XYUA 3IS5A 4LOQA 4ZOGA 2IW9A 4EOMA 5EW3A 3Q60A 5FP5A 4CZUA 4O7RA 4Y5QA 3MI9A 4UMPA 5AIRA 5JZNA 4QP4A 2R3OA 3OEFX 4MWHA 5HLWA 2QOOA 2VO3A 3HV4A 4IVBA 4L9IA 1FINA 5FD2A 4U44A 3MS9A 4AGUA 5K5NA 1JKLA 1M52A 4AOIA 4TWOA 3VF8A 4RX5A 4BDFA 4AZFA 4HW7A 5AWMA 4O27B 3ZLSA 2QO7A 3ZM9A 3I1AA 5KMIA 5DT3A 2XB7A 3U55A 4NL0A 4NWMA 4AG8A 1B39A 3PWDA 1YDTE 3EB0A 3TJDA 2ETMA 4M0ZA 2C6TA 3ZO1A 4A7CA 4ACDA 4DT8A 5HORA 3LCOA 2G2IA 2HZIA 5CXZA 3Q9WA 3OROA 4G3DA 4F6SA 5J9LA 3PE1A 5A4LA 4FVPA 3UG1A 3C0IA 4G3GA 4I6HA 5C8MA 3ELJA 1GIIA 4F6WA 5E8ZA 3HV3A 2ZV9A 3RK9A 4HJOA 4FTAA 4QMVA 5ANGA 5EQYA 2YM7A 4PY1A 5FTGA 4W4YA 5GZ9A 1YOMA 4M12A 4XOYA 4RPVA 5I0BA 4AW5A 4YUQA 3G90X 2A0CX 5E4HA 4W4XA 1GJOA 4JX3A 3CTJA 3QWJA 3FLQA 5K9IA 3A7JA 4G34A 2E9UA 3OOMA 3C1XA 5HI2A 4L45A 4USEA 4IWPA 4F1MA 5KZIA 4FGRA 2YHVA 3NCZA 5I9ZA 5AV4A 1OECA 2BRGA 5IMXA 3U9NA 4TZRA 4AFEA 2XNGA 3FEGA 3NPCA 3ZONA 5FDPA 2IZUA 4RFYA 1H00A 1WBSA 3HMMA 4O1PA 5FBOA 5C03A 1S9IA 2YWPA 4I93A 4E7WA 1YWRA 4NM3A 5HVJA 3L9PA 2QKRA 4KD1A 5LVLA 1VZOA 3ID6C 3K54A 2J0LA 1AQ1A 3LFEA 4BBFA 5IUHA 5L2TA 3PSBA 5C4KA 4NFMA 3C5IA 5M4IA 5CAUA 3CS9A 3LIJA 5HCXA 3AT3A 2QG5A 3NNWA 1Q8WA 4TXCA 5HU9A 3IGOA 2XK3A 4E3CA 2XJ0A 2YIRA 3NX8A 3FMJA 4WA9A 1BMKA 3OCSA 2DS1A 3KFAA 4I0RA 2F7EE 3FI4A 3LOKA 3N9XA 4B4LA 4FGBA 3KRRA 1O6KA 2O63A 3CEKA 3COKA 5CU4A 5BMSA 4D2VA 3KXNA 2Y0AA 3DU8A 4DEAA 3OY1A 4IHPA 4UX9A 2H8HA 2VWIA 3ORKA 4MXZA 3F6XA 2X8IA 3LFAA 3FZPA 4B7TA 3UTOA 2QO9A 4TYHB 3QA0A 1GAGA 4AN9A 3PZHA 5DIAA 3PVGA 4HCVA 1OPJA 3G9LX 2VWXA 1REKA 2NRUA 4IVDA 3WI6A 5L2IA 4O7WA 3QU0A 1JOWB 4BCQA 2GFSA 3WZKA 3G9NA 1SVHA 4PWNA 1OGUA 3E3PA 3H9FA 4YSMA 4D1SA 5AUWA 3R7VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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