4AB4A

Structure of xenobiotic reductase b from pseudomonas putida in complex with tnt
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
349
structure length
349
Chain Sequence
TTLFDPIKLGDLQLPNRIIMAPLTRCRADEGRVPNALMAEYYVQRASAGLILSEATSVSPMGVGYPDTPGIWNDEQVRGWNNVTKAVHAAGGRIFLQLWHVGRISHPSYLNGELPVAPSAIQPKGHVSLVRPLSDYPTPRALETEEINDIVEAYRSGAENAKAAGFDGVEIHGANGYLLDQFLQSSTNQRTDRYGGSLENRARLLLEVTDAAIEVWGAQRVGVHLAPRADAHDMGDADRAETFTYVARELGKRGIAFICSREREADDSIGPLIKEAFGGPYIVNERFDKASANAALASGKADAVAFGVPFIANPDLPARLAADAPLNEAHPETFYGKGPVGYIDYPRLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords XENOBIOTIC REDUCTASE B
publication title Structural Determinants of Aromatic Ring Reduction in the Xenobiotic Reductase B from Pseudomonas Putida
rcsb
total genus 135
structure length 349
sequence length 349
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ab4A00
3GDLA 3N73A 4FNQA 4CCDA 3DFPA 3P81A 4IMEA 4IJBA 1W37A 2YZRA 3LRMA 4FX8A 1TQJA 3A23A 3HPXA 5CSRA 1KTCA 1TMHA 4RZ4A 4O1CA 3NA8A 3QMTA 3G8EA 4ZL1A 3UWWA 1GVRA 2NZLA 1SFJA 3LHVA 3M6YA 4MZ8A 3W74A 1K7FA 3IV3A 1F74A 4RV8A 3M7WA 3VKJA 3LTSA 3C0JA 1FCVA 3BG5A 1VHCA 1B4KA 3C61A 1H63A 4O0ZA 2ZRVA 5CZTA 3GNNA 2ISSA 1EWEA 5A8GA 3Q58A 3TDFA 3TW6A 2JK2A 1OX5A 3TK7A 4OWGA 3S5NA 1LROA 3DFOA 3QMSA 1FCBA 1GZGA 4BFAA 2E1DA 4UFJA 4WOZA 2NXHA 3MBFA 3G3DA 1SUXA 3LOTA 2YDAA 4L4LA 3MO7A 4AEOA 1J4EA 1VR6A 4IMGA 3UQNA 2I1OA 2FFCA 1R2TA 1I2OA 1YXYA 1FWSA 1ME8A 3OA3A 2X1SA 3TC6A 3NL2A 3HG4A 4EWND 4H4IA 1OK4A 2ZYFA 4S2CA 3IGSA 4LVGA 3VNDA 4LRTA 2OMAA 1R46A 2V82A 3OVRA 1F76A 2ZZ2A 4ALDA 5CPNA 2QCDB 3STFA 4I9AA 1OFRA 2V8ZA 2DZUA 3N2MA 5F1VA 4LT9A 4Z1CA 4MZ1A 4HPJA 2A5HA 5A5WA 2AGKA 5IBXC 3PUOA 4Q33A 2GQ8A 3NQ6A 3G1VA 3T7VA 4K6AA 5C6MA 4AMAA 3M43A 4RKAA 5L9FA 2ZTJA 5GVJA 2E09A 2O7QA 2RDUA 4DPPA 5D30A 1KM6A 4ADUA 3WK1A 1B57A 2QF7A 2NX3A 3ABRA 1S5WA 1N55A 3P82A 1MSSA 2EAWA 2CZEA 2QUVA 3ANYA 2C18A 4QSHA 3W86A 3HGSA 4E2BA 2EHHA 3I7SA 4NJKA 1ADOA 2RDTA 4UR7A 1F73A 2A7RA 3KHJA 4KFPA 4UTMA 1EA0A 4UTJA 2YPIA 1ZFJA 4PODA 4DO4A 8TIMA 5AC6A 3ABOA 4WXYA 5D09A 1ALDA 3B0UX 3EWYA 3HOJA 2W79A 3NG3A 4IX0A 4S2BA 4IMDA 4K36A 4JDYA 2PRMA 4Z1DA 4NNCA 1LTDA 2JBMA 4FXSA 2CW6A 3HF3A 3NAVA 1OFOA 4K38A 2EF9A 3W72A 4BI7A 3PB0A 1YXDA 3MYOA 1TPB1 1XDMA 3SJ3A 3W7MA 2G95A 5D03A 4A29A 1KFBA 4GUGA 5AHIA 4FNPA 5EPDA 4AVFA 2Y63A 2WJZA 4PC8A 3W7LA 3B8DA 3QFEA 4UNKA 3UWVA 4K7VA 4AWTA 2DP3A 3MHGA 3UD6A 1OFQA 1K3UA 1ZCOA 4HPXA 1ICQA 3NDOA 3OIXA 4LWWA 2ISWA 3JS3A 2OZ0A 4NJGA 1Q45A 4FX6M 3L5LA 3IGXA 1EB3A 4O10A 3UZ5A 3CWOX 1KFKA 4PH6A 3TMQA 1SZFA 3GX9A 3PC0A 2YW4A 4JIQA 5C5YA 3NL5A 1SW3A 2GJNA 5G2IA 1XM3A 3NVTA 3W7EA 3KVJA 1AL8A 1K02A 1VYSX 4IXHA 3G1HA 4WJEA 3P5ZA 3PBWA 4LVAA 3C2VA 4QIUA 2BX7A 3R5EA 4QITA 4UFIA 3B4UA 3GDRA 4HNTA 2I14A 1RD5A 3W1NA 3LCIA 2X30A 4BF9A 2V30A 1H51A 3MMTA 3TSMA 1PCWA 3W7DA 2J88A 3EB2A 3NZRA 1WOBA 3N9RA 3RLVA 5HULA 1VCFA 1RPXA 1TTIA 5HINA 4CLMA 4I7WA 1QO2A 1D3HA 5BNKA 1IXNA 4HN4A 4HSNA 3LB0A 2Z6JA 1JRBA 3QSTA 1OYCA 2HTMA 2E77A 3V75A 4MIMA 3E0IA 1WYIA 3PR2A 1ZAIA 3P62A 3V1PA 1SW0A 2QCCA 4UFMA 3W7GA 1O95A 4YCOA 2NUXA 2A6LA 1S5TA 1VPXA 1JQXA 4O1DA 4JYFA 1I4NA 4UMCA 3M44A 4O50A 3S0CA 3W23A 1L6YA 3G3MA 1E51A 1LOQA 5EYWA 2A6NA 1GEQA 1DV7A 4AXKA 4DELA 3OHIA 4YMZA 5HR7A 3LGEA 4DO6A 2ATMA 2WQPA 1G4PA 3HIJA 1NVMA 3CWNA 3W2KA 3YPIA 4YCPA 1Z42A 3W7PA 1F5ZA 1XI3A 3STGA 2VFHA 4UTHA 1QAPA 3B04A 1LRTA 5F2MA 1UJPA 3NO5A 4ZZ9A 5LHEA 4A21A 3QSRA 3N2XA 5F2LA 4WQ6A 3TQ0A 1G7UA 3NPVA 1MEWA 4O17A 4JNMA 4RR4A 4WUIA 4FF7A 4MYXA 1P5BA 4RX0A 3FYOA 1IIHA 4LW7A 2XFWA 4O4VA 3INPA 5TBOA 2P10A 3L0NA 1W3NA 3LHTA 4OV9A 1EX5A 1NSJA 1OX6A 3I7RA 3PG8A 3S9YA 2YYUA 1RV8A 3LRKA 4QNWA 4UTWA 1H60A 1UCWA 5KZDA 3UPBA 1LRNA 1I2QA 3KVLA 3P61A 3QPZA 4EF8A 1B4EA 3DAQA 3VFLA 3UXAA 1FUYA 5E1QA 4ADTA 3NR0A 3DFSA 2PCQA 4O0KA 4UTTC 1PL9A 3RNDA 2E6AA 3O6CA 5FF0A 3SY5A 4E2DA 2Z2UA 1TYGA 2VEKA 3S1WA 1T99A 4PA8A 1H7XA 3B03A 1WV2A 2E6YA 2Q3RA 2A1YA 3UWUA 1YDNA 2QCLA 1X7FA 3P80A 5FF7A 2QJGA 3UWZA 1TPVA 4UFKA 3LBCA 3PULA 4AWUA 1EPXA 3CEUA 2BXVA 3EWUA 2TSYA 1PCKA 2VOMA 4IMCA 5FEWA 3HGJA 2QCDA 4I7UA 1PHQA 1TV5A 4O1BA 1JCJA 1YTKA 3FJ6A 3OVQA 2X1RA 5KSWA 1W56A 1IXQA 3GXNA 1FBAA 2Z1BA 4UFLA 3S1UA 2CLFA 1J5TA 1WBHA 1VCGA 2DU2A 1ME7A 2V9DA 4JS3A 1O4UA 4LS2A 3IGUA 3JR2A 1HFBA 3PF3A 1GYLA 5K7JA 1TV7A 1GVOA 3N9SA 4LS1A 4K37A 5D38A 3QEZA 1FWWA 1SQ7A 1TJPA 4J9JA 3W07A 4GUJA 1G4SA 1M7PA 2PRHA 3TFXA 2OX1A 2QJIA 3KRUA 3NQVA 2RH9A 2VC6A 3LI0A 5LNVA 1C8VA 3QPYA 4M7SA 3T55A 1KTNA 5AB3A 4LV4A 3ABQA 4OQVA 1VGAA 1XBVA 1IXOA 4WY0B 5FESA 3S6DA 1Q6OA 5HNRA 5HWMA 1HO1A 3GZ3A 3C52A 3QYQA 3O16A 1DL3A 4GE8A 4JTTA 5ABTA 5G1TA 1PE1A 3M1ZA 1TPC1 1AW1A 1HTIA 4KKXA 2NUWA 1W5NA 2C0AA 4M6VA 1LOSA 2JGYA 4ZQNA 3EX1A 2YGYA 2HS8A 5KINA 1KV8A 2J9ZA 1I2RA 4PL2A 4JYEA 1VHNA 3M9YA 5DXYA 3LHZA 1FX6A 3BO9A 5AYYA 2P0OA 1G4TA 1XUZA 3R12A 3PM6A 3WFAA 3CPRA 4LRSA 1SZNA 3P5YA 1XXXA 1YTDA 4ORMA 1G6CA 3GR8A 2W6RA 1N8FA 3UNDA 3B0VC 4AF0B 3B06A 3I7QA 1LBLA 3BG3A 5D05A 3EKLA 3HGOA 2ZRYA 4IQLA 2Y62A 5G5IA 2V2HA 2GVGA 3PAJA 3W1TA 2B4GA 1OFDA 2YFNA 1YYAA 2X2GA 2JKEA 3E02A 3LDVA 5AYXA 3E49A 4WY0F 2QR6A 2V2CA 4O1AA 1H1ZA 3LXAA 5CG7A 3P74A 1YDVA 3LCWA 2ZZ6A 4ZMGA 5KTLA 1G67A 3VE7A 3DBPA 1W5PA 5D04C 1FXQA 3LRLA 2V5BA 3A22A 2GOUA 4QM1A 1JJKA 5FEPA 3VI2A 1SZEA 3FOKA 4POCA 4WD0A 1ML1A 3C2OA 4BI6A 1JVNA 2RHGA 1VCVA 3G22A 1WDWA 3GAKA 3ATZA 5AOUA 3NQ8A 4PL1A 4CNNA 2DZVA 5DN1A 4AWSA 3BARA 1J2WA 3S8HA 1OVDA 4O13A 3M5ZA 2V81A 1ICSA 2GPTA 5HUPA 3MP3A 5AHNA 3W1MA 4ML9A 3W2MA 1D3GA 4DPQA 1T8XA 4O16A 3UWQA 5DCDA 1DBTA 1VLWA 1R2RA 1UUMA 4LVFA 3O05A 3QF0A 3CB8A 1W54A 4OU1A 3NZ1A 1X1OA 3Q94A 3EWWA 2ISVA 1LDCA 3NPUA 1F6KA 3L68A 3W1PA 3TROA 4Q4KA 5U4NA 2VFDA 3W9ZA 4WX2A 3GK0A 3ABSA 3IIOA 3OEXA 3MI2A 3BLEA 3M5YA 5I3GA 1WA3A 4FIRA 3G1AA 3I65A 1QFEA 4R33A 2WNNA 3P60A 1GVFA 3D0CA 4C1LA 5LZLA 3C8FA 1I45A 2NLIA 1Q6LA 4UR8A 5DELA 3W88A 1GWJA 4K8EA 4U4MA 4NX0A 5F2GA 2R8WA 5AHFA 4XQ6A 3U6WA 2ZCGA 1QR7A 3W1AA 4MFEA 1W31A 4LV9A 1LLWA 4R53A 2FB2A 3FIGA 3TJXA 4X3ZA 1I2NA 3LLDA 4TMBA 5K4XA 4Z0SA 4HNVA 3GB6A 4N6FA 2NWRA 1EWDA 3G1YA 4DXVA 1H5YA 4DF2A 1CI1A 2CLEA 2GUUA 1VYRA 1IIGA 3E12A 3MI3A 3HG5A 5AYZA 3CTLA 4HNUA 1JULA 4TO8A 2E5CA 1L9WA 4NT0A 4CNPA 4FEZA 1O60A 2A4AA 1GVQA 2J6XA 1UUOA 1TREA 3RMJA 3WJWA 4DF0A 1EP3A 3LHYA 1Q6QA 1JUEA 2VEPA 3TJLA 3ZS4A 3NPWA 3G1XA 2H3BA 5C2XA 5D02A 2Q8ZA 3M5VA 2ZRXA 5BRBA 3MBDA 3DHFA 5D2TA 1EP2A 5TIMA 5DLCA 1XCFA 4IOTA 4DF1A 4NZFA 3QZEA 3H53A 3BVJA 1VLIA 1A53A 4M5PA 3LX9A 5CSSA 5AN7A 5I3KA 2QCHA 3O8AA 1OF6A 3A9IA 4JX6A 3HGRA 1QOPA 2PRLA 3TX9A 5LNWA 3L21A 1SPQA 4JGDA 2WOQA 5CZ0A 1OX4A 3TV8A 5J5DA 6TIMA 4RZ6A 1YDOA 3PY2A 3W2JA 3LTYA 4NUWA 1G7VA 3TE9A 1EUAA 1JCYA 4N6EA 4O28A 3DH7A 5G2WA 1KFEA 1ZALA 5EKYA 3BG9A 3A21A 5KITA 1ZHAA 3W7NA 2HMCA 2Y88A 3CU2A 3L66A 1TSIA 4WOQA 5DCEA 1AL7A 3EWXA 4N02A 4JTEA 4LY8A 3G24A 1JR1A 3QMRA 3F4WA 1FY6A 4NXKA 4MJMA 1K8YA 3HG3A 1F05A 4LTSA 2XN2A 1NEYA 5E0KA 3UY7A 1TPWA 2BLEA 4MYAA 4WY0A 4P2VA 2C1HA 3PUDA 4TIMA 2B7OA 5AC8A 4JN6A 2YXGA 1KLZA 2B7PA 3SSJA 4GUFA 2HS6A 4IPIA 4MY8A 3VE9A 4E0CA 1VC4A 4XZ9A 3UPWA 3SECA 4MY9A 1Y0EA 2QCEA 5D2WA 2YX0A 3K30A 1F2JA 3MUXA 4LU0A 4XKYB 3HBLA 1F7BA 4K7YA 3F03K 4KWVA 4FNUA 2ZZ1A 3S42A 1RR2A 1XBXA 2NX9A 5BMXA 1F6PA 4ADSA 3E9AA 2J9YA 4MPQA 1ZAHA 5F4WA 1QDSA 4O57A 2YCEA 4ZQPA 1A5CA 1AMKA 4A2SA 3THQA 3B0PA 4O53A 4M19A 4ZQRA 1TPFA 4GBUA 1LRQA 4NZJA 5CPLA 4QJ1A 4N9BA 5F4SA 3S5OA 2X16A 1TTPA 3P67A 3QW4B 4M6QA 4MKNA 2O7SA 3NQCA 5U7SA 3C2EA 4AF0A 3NOEA 3OVPA 3FS2A 1M7OA 2QEZA 3WK3A 5KZEA 2WSQA 3U8GA 3TUUA 4JTKA 2AAMA 2G96A 3BV4A 2H8XA 1U5JA 3A5FA 2V2DA 2QUTA 1SO3A 5EL1A 3AJXA 1HO4A 3G1SA 2C19A 3M47A 4ZVJA 3W2UA 4Y9AA 1DQWA 3W7KA 1UASA 1XUUA 3W1QA 4RK8A 3PB2A 5C55A 2RDWA 3LXCA 4UTLA 3LHUA 1YPFA 4C1KA 2J27A 4JTUA 2WO5A 3RFAA 4XBSA 3W2NA 3WJZA 5K3VA 2ZRWA 1JCLA 3KRSA 3W3OA 3KVMA 2DZTA 3P7YA 4EOUA 5H2ZA 3NQAA 3NL6A 4IWWA 1KLYA 3NGJA 3NPXA 1R47A 4YLWA 5EBUA 3LXBA 4CQ8A 5C54A 1DHPA 4AHOA 3C3NA 2WV8A 4B5NA 4UMAA 5DBTA 3DGRA 5LGXA 2ATSA 4KFOA 2C16A 1ZY9A 2V5LA 4K8HA 3Q37A 3R89A 3W85A 3GR7A 3R8RA 2CLMA 2H6RA 3LLFA 1KM3A 2QUUA 4UTWC 1AG1O 3WK0A 2GQAA 2VFEA 3HO8A 2Y7FA 3WJXA 1KM1A 2FTPA 4LUJA 3GKAA 3GDTA 4JTGA 5IM51 2CFFA 3SIZA 4EF9A 4UCGA 3JRKA 1CX9A 4NVTA 4RXFA 3W7JA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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