The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
38
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sequence length |
79
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structure length |
79
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Chain Sequence |
GAMEQEAIQRLRDTEEMLSKKQEFLEKKIEQELTAAKKHGTKNKRAALQALKRKKRYEKQLAQIDGTLSTIEFQREALE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein transport
|
| molecule keywords |
CHARGED MULTIVESICULAR BODY PROTEIN 4B
|
| publication title |
Cc2D1A is a Regulator of Escrt-III Chmp4B.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
38
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| structure length |
79
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| sequence length |
79
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-12-08 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | ESAT-6-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3OGI B; 4ABM A; 3G80 A; 3Q4H A; 2VS0 A; 4I0X B; 1WA8 A; 3TXS A; 2KG7 B; 3FD9 A; 4LWS A; 2AZ2 A; 2VRZ A; 3ZBH A; 3FAV B; 3HR0 A; 2B9Z A; 2KG7 A; 4I0X A; 3FAV A; 2DE0 X; 3GVM A; 3GWK C; 3Q4H B; 4GZR B; 3TXQ A; 3O9O A; 1WA8 B; 4LWS B; 2AZ0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5LA6 A; 4JI1 B; 4U3F H; 2DW4 A; 4FFK A; 4EFE A; 2ZCE A; 1NTK H; 4Z1V A; 1NS1 A; 1PNL A; 1IBL O; 2QEX V; 3F5T A; 1YSC A; 3WB1 A; 3VQX A; 4WFB V; 3TK1 A; 4I9W A; 4TV8 A; 3RFR A; 5JH7 B; 5HFM A; 4WCE V; 1N8R W; 4PA7 A; 3BAB A; 2WA3 A; 4K8X A; 4WFH A; 3ZMU A; 1AIL A; 2OWO A; 1PD3 A; 5GON B; 4QE9 A; 1AI7 A; 1XUQ A; 2NLJ C; 1K3E A; 5B66 Z; 4MVU A; 4I55 A; 2ZM6 B; 2ODM A; 4DV4 B; 1YIJ V; 4K3A A; 2P06 A; 4PA4 A; 2B1G A; 4NXM O; 1GAX A; 1NTZ H; 3ABM B; 3ASN B; 1T5E A; 1M4U A; 3JCU Z; 4X1I A; 2EIJ C; 1B3Q A; 4G2K A; 1OJH A; 3G67 A; 1KUQ A; 2R9A A; 3SGI A; 1Q6H A; 4DR5 B; 1PP9 H; 1W2B U; 4DR1 O; 1TUE B; 5L3E A; 3JAT B; 3JAK A; 5LP6 C; 1OCC C; 4D7S A; 1Q90 D; 2JK5 C; 3K0G A; 3FAV A; 2H3O A; 2QGN A; 4WFG A; 1OCR B; 3K5M A; 2XT9 A; 2Z3Y A; 2ZIO A; 1U96 A; 2LGW A; 3CCR V; 1QLE C; 3W7U A; 3CCE V; 4J80 A; 3ABL B; 3OUF A; 1IX9 A; 3BA9 A; 3C90 A; 2B5U A; 3SYP A; 3P3N A; 4LF5 O; 1YJW V; 1KP2 A; 1J5E B; 3E86 A; 4KP4 A; 1G6U A; 1O9G A; 2Q7H A; 3KG2 A; 2DOS A; 5L3F A; 4LFA O; 3SDL A; 3E35 A; 2JS3 A; 3KZI Z; 4B3S B; 3H9V A; 4I50 A; 3H1I H; 5KAI Z; 2E5L O; 1UFI A; 2C2A A; 1EZV H; 3OW2 U; 3VQY A; 2JEX A; 1FPO A; 4DYL A; 2CTW A; 5TIS Z; 4LWS B; 3QNE A; 2ZNJ A; 4DR6 B; 4TUY B; 1KC8 W; 1K73 W; 1EBO A; 2FTK A; 2Q68 A; 4U7N A; 2ZIM A; 3GB7 C; 1LUV A; 3SYO A; 1YJN V; 3ZBH A; 4AIL C; 2ZXW B; 4PHZ A; 3TCU A; 2Y4U A; 2VQE B; 3JAW B; 1TA8 A; 3G6E V; 5IDJ A; 1SQB H; 4OGQ B; 4I5S A; 4CH5 A; 3B8M A; 2EIL C; 1M93 A; 1JCH A; 4MVZ A; 4JTC B; 1G8M A; 3T1H O; 4K0K O; 4ZI7 B; 1DTO A; 3EHB B; 2Q6A A; 3DTU B; 3D36 C; 3L75 H; 4DV6 O; 4YIO A; 4LF8 O; 1ENV A; 2X6B A; 1FJG B; 3H1J H; 2W6J G; 4PDR A; 1EFR G; 1S3J A; 3D8C A; 2WLL B; 3W7X A; 2NNU A; 1BMF G; 3UT5 B; 5LHI A; 3APO A; 1VF6 C; 4JI8 B; 4RO2 A; 4H33 A; 2E76 B; 3EVK A; 2Y69 B; 1OCO B; 5E1A C; 4DK0 A; 4B3M O; 2R9R B; 3IGA C; 1COW G; 1KB9 F; 5IJ9 B; 1IBM B; 5LMN O; 3H01 A; 1XNR B; 1ZWI C; 2F1M A; 5BZB A; 3J7A U; 1PKX A; 1DK1 A; 5A2Q N; 5LXT B; 3A8T A; 2DYS B; 2WLI B; 1Q3E A; 4LF9 B; 2HHH B; 1VF6 A; 2V1D A; 1N4C A; 3C3S A; 1VQO V; 4FIP C; 1KMI Z; 1BHA A; 2B9Z A; 2DYS C; 2QWP B; 2X7R B; 1I0H A; 3N2G B; 2WWW A; 4H0L B; 3SPJ A; 4X20 A; 4X62 B; 2D3O W; 3FYI B; 1XQ8 A; 3ZRX A; 2PYJ A; 1VQ4 V; 3AK3 A; 3TXS A; 4JI2 B; 2W0F C; 1Y74 B; 3ZS8 C; 1IUR A; 4E4E A; 3E8H A; 3ZHV A; 2CE4 A; 3ICX A; 1DLB A; 3BVO A; 1F4N A; 1G4Y B; 2X0L A; 5A9G A; 4LP8 A; 4ZBM A; 1JR9 A; 4GT1 A; 1YIT V; 1E79 G; 3BEH A; 4X64 B; 1BZK A; 1BCC H; 3UO3 A; 1XHZ A; 1DGS A; 5JVD A; 1AI5 A; 3ZMZ A; 5CA3 A; 1R6N A; 5B1A B; 3ZCC A; 1V55 C; 4JF3 A; 5ITZ B; 4LH6 A; 4TQF A; 4JI0 B; 3QG5 A; 4FFB A; 4GX2 A; 4JYC A; 4UB8 Z; 5H5N A; 3LDD A; 3ASO B; 2E3C A; 1K5Q A; 4PJ0 Z; 4DV3 B; 4DV7 B; 3OEH G; 5FNV A; 3UQ8 A; 3W7S A; 1V9P A; 1V54 B; 3CJH B; 3CYO A; 2RMK B; 3ASO C; 1YI2 V; 1R1B A; 4W4K A; 5DM6 V; 3UCS C; 4LCU C; 1EN4 A; 3CCU V; 4RWU A; 1OV9 A; 3L71 H; 3K79 A; 2VQF B; 1SZT A; 1OHH G; 2FL4 A; 4LNU B; 1JPX A; 2Q69 A; 4P2Z A; 4GX5 A; 3ETE A; 1A32 A; 1N32 B; 4QPJ A; 3OTO O; 4ZIB A; 2JGD A; 2ZE6 A; 1GN3 A; 1CP9 A; 5C93 A; 4ZOL B; 5CBG A; 1THZ A; 1FFX A; 3H1K H; 3JD0 A; 4YHH B; 1XNQ O; 5EBL C; 2BSK A; 4I4T B; 2OT5 A; 3X2Q C; 3E8B A; 2Z5U A; 3G80 A; 3CC7 V; 4X65 B; 5CBH A; 4DR7 B; 4EB6 B; 2Y0P A; 4XBF A; 1CEZ A; 3CE2 A; 2KB1 A; 1SQV H; 3STL C; 2IJI A; 3S3W A; 3HPL C; 1WP8 A; 3CPW U; 1K97 A; 4QIW F; 2CTR A; 1FXK B; 4YJ2 B; 1M57 C; 1VF7 A; 5LL6 Y; 3FD9 A; 3F7Y C; 5LYJ B; 3CCV V; 2ZR3 A; 2KQX A; 4WBN A; 5LGN A; 3ZHS A; 4EEQ A; 1ARO P; 4OX9 O; 2CDY A; 2DQ3 A; 5B1B C; 2OYQ A; 2KSD A; 3NR7 A; 3QO5 A; 1IDS A; 4JI7 B; 1YJ9 V; 5JCO C; 5JQG A; 2Q67 A; 2Y0I A; 3E22 A; 3L9D A; 4AQY O; 3SPG A; 1IZ3 A; 1RSO A; 5LBQ A; 4W4L A; 1MNG A; 1WPX A; 3JSL A; 4X88 A; 3E2E A; 3H1L H; 1MA1 A; 1FXH A; 3Q4H B; 3RYH A; 1ZL8 B; 4UCR A; 5EYP A; 1R3K C; 5BXZ A; 2HVK C; 5JCO A; 1S5J A; 2UXD B; 4MVM A; 1VQL V; 1KKC A; 2JIZ G; 1SER A; 3A0B Z; 3IC7 A; 4FLZ A; 3CCJ V; 4GCZ A; 3UO2 A; 4DV5 O; 4DRX B; 4HBN A; 4DV0 B; 5EC2 C; 1Y4M A; 2GUZ B; 1EM1 A; 3JAS A; 1H2S B; 5L3D A; 1NVP D; 1ORQ C; 1GN2 A; 3OM3 B; 3CSX A; 1AB3 A; 3G4S V; 4FLU A; 2DWE C; 3OUS A; 4NVP A; 4JYA B; 2IH3 C; 1H8E G; 4Q20 A; 2N74 A; 3ZRW B; 4KUM A; 2PI4 A; 3ZJZ A; 1OCZ C; 4BW9 A; 1W59 A; 4LH7 A; 2ILM A; 5B3S C; 4AI8 A; 2IU3 A; 5IY5 B; 3ABK C; 1HNZ O; 1F51 A; 4ZKI A; 1QNM A; 3JAR B; 3APQ A; 3SJQ C; 2JVD A; 1JFF B; 2VS0 A; 2QTS A; 5IYZ A; 2W0X A; 4DUY B; 1I7F A; 3OR6 C; 5LGU A; 3FB7 C; 1L8D A; 1XI1 A; 3WU2 Z; 2QR4 A; 4BAY A; 4JAV A; 3AG3 C; 5BR8 O; 4GZR B; 4PDM A; 5CA1 B; 3TXQ A; 5IYD O; 3AG1 B; 1M90 W; 3T4D A; 1XL4 A; 1W0J G; 1ROP A; 1SQX H; 5J2U A; 4J7K A; 1TUB B; 1QR8 A; 1WA8 A; 4YIP A; 3I56 V; 1B6Q A; 2PGG A; 4MVS A; 5CMU A; 4X66 O; 1Q86 W; 4HAM A; 4EKW A; 4JI6 B; 1SA0 A; 4BR6 A; 1SS3 A; 2RJZ A; 4CH3 A; 2QTO A; 2M6Y A; 4JAU A; 3RYC A; 5LA6 B; 1JA8 A; 2RCV A; 5H6Q A; 3FB6 C; 3RYF A; 1FAF A; 4BIO A; 4EFB A; 2YXL A; 3LDE A; 3ZN0 A; 1XMQ B; 4TV8 B; 5EC1 C; 1VQP V; 5H9C A; 4DV2 O; 1AI6 A; 4JGS A; 2P5O A; 3UM7 A; 2EZP A; 1O9H A; 1M1K W; 1IBK O; 4LFB B; 1ZSP A; 2KKW A; 4I55 B; 3DC6 A; 2BTQ A; 2YXH A; 3ZRS A; 1R6K A; 4TQD A; 5LGT A; 4RQF A; 5JJN B; 3EFF K; 1NI8 A; 2ZE5 A; 4RAI A; 1LNQ A; 2UUA O; 2EIK C; 4X1I B; 1H2L A; 4FPP A; 1VIB A; 3SPC A; 1RPO A; 4QNH B; 4F6E A; 5IJ0 A; 2XTA A; 1W0K G; 1P84 F; 5KMG A; 4IT5 A; 2OTJ V; 3P30 A; 1SET A; 2CK3 G; 4LFC O; 1VQN V; 4BW5 A; 1HNX B; 3K0D A; 2WLM A; 4DUZ O; 4O4H A; 3RBZ A; 3JAK B; 2F43 G; 2EIM C; 3QVN A; 2GHY A; 3L73 H; 4B3T B; 2IJH A; 2YDE A; 4GKK B; 1Z5V A; 5EIB D; 4DR2 O; 1H8H G; 2EIJ B; 3JAL A; 4XDJ A; 1K92 A; 1HW7 A; 3BPZ A; 2YIA A; 3ABU A; 5JJE B; 3QO8 A; 4O2A A; 5LP6 B; 2ITD C; 1I5Y A; 1OCC B; 4JI3 O; 2AW9 A; 3L72 H; 2QA4 V; 4KFM A; 5CN0 A; 5E79 Z; 1QLN A; 2HJF C; 4JYB A; 4O4L A; 4GKJ O; 3RN4 A; 2YIB A; 2CTP A; 1QLE B; 3E8G A; 2W6I G; 1D5N A; 1Q6I A; 1Q7Y W; 1TGO A; 3F7V C; 1Y76 B; 2PI5 A; 4JI1 O; 1AR1 B; 5LHG A; 2PTM A; 3OGC C; 4NXN B; 4CS2 A; 4D7T A; 3W7T A; 3CRQ A; 1NTM H; 1P4R A; 5CB4 B; 4UCS A; 3T4Z A; 2XAH A; 3BCC H; 3RVZ A; 4B3R B; 4UFZ A; 2AGA A; 2QWN B; 3AG4 C; 2M7W A; 2AHZ A; 3RYI B; 1JJ2 U; 3BFR A; 2ZM6 O; 3CCS V; 4DV4 O; 4HNA A; 3JD3 A; 5HFL A; 4O4I B; 3DC5 A; 3JAT A; 2YIC A; 3E89 A; 3CCL V; 2ZE8 A; 1F7Y A; 4FZ1 A; 4E2L A; 1IXB A; 4DW0 A; 1N36 B; 2FKX A; 4DR5 O; 5L3C A; 4FM0 A; 3WG7 C; 4FLT A; 2Z0A A; 4MT8 A; 4NKG B; 3JD1 A; 1WPB A; 4IGG A; 2EIL B; 1RPR A; 5KHH A; 2DE0 X; 3CB2 A; 3HKE A; 5DED A; 3LUT B; 2UXB B; 1GKF A; 4PV1 B; 3ZIA G; 1Q5O A; 4J11 A; 3CRM A; 2Q7G A; 3L70 H; 4MVO A; 4MW3 A; 4KL1 A; 3OD4 A; 4JYY A; 1AR4 A; 3RT3 C; 1BQ0 A; 2ZDI C; 1NVP B; 1M56 C; 3CCM V; 3C3T A; 4K8Z A; 2UXC B; 4GX1 A; 4LF6 B; 2CGO A; 4O4J A; 2Y48 A; 4NYK A; 1IVS A; 1NR1 A; 1GM8 A; 1J5E O; 2H8P C; 1QQC A; 2CUG A; 2YID A; 2OIE A; 4AHC A; 4MSW C; 3VOU A; 5LHH A; 1FXV A; 3CC4 V; 2Q5Z A; 2ZDI A; 4B3S O; 2A3Q A; 1Q81 W; 3ZN1 A; 2EUL A; 2H94 A; 3K58 A; 3T2M A; 2ZNI A; 2IBZ H; 1JQ0 A; 1MZF A; 4YY3 B; 4PEL A; 1RP3 B; 5BMV A; 3AG2 C; 2GBO A; 1SQQ H; 1YTF D; 4FJC C; 1ZLZ A; 2EBO A; 4KXR A; 3CXC U; 2VWJ A; 3TJT A; 1WLE A; 3JSN A; 4P9O A; 2OCC B; 2RN9 A; 2DQ0 A; 4X1Y A; 3BHP A; 1BS3 A; 4ZHQ A; 2ATK C; 1YZB A; 2YEV A; 4MW8 A; 3T1Y B; 2UUB B; 2VQE O; 3MD0 A; 1VQ9 V; 1PV0 A; 2OCC C; 2IJK A; 5JVD B; 4H37 A; 2P67 A; 4BWA A; 1SQG A; 1HR0 O; 1XL6 A; 2F66 C; 1XMO B; 1MAB G; 2KG7 B; 4CH4 A; 2WLH A; 4XDL A; 2EJR A; 4MS2 A; 5DN6 G; 3OE7 G; 4FFB B; 4QPK A; 5IT9 N; 1Q6U A; 1RFY A; 1FD9 A; 4N23 A; 4JI4 B; 3K9S A; 5FNV B; 4LF7 B; 1FJG O; 1AJQ A; 1QVF U; 3DSQ A; 2PF4 E; 2WA4 A; 4H13 B; 4DR3 B; 2YS8 A; 1G1X B; 4CS3 A; 4U3J A; 5IJ9 A; 5H2F Z; 4MTX A; 4F6R A; 3OTO B; 1FYJ A; 1V55 B; 5H6R A; 1MZE A; 3FX7 A; 3ZMV A; 2R70 A; 4JI8 O; 2DYR C; 2EX3 A; 1GM7 A; 4QGP A; 1VAR A; 3K5N A; 1TVK B; 4YJ3 A; 2G38 A; 2QSA A; 1AJP A; 3HB3 B; 2RDC A; 3GWK C; 2QM4 A; 2F93 B; 1FKA O; 1N33 B; 3MAQ A; 3CRA A; 4CBC A; 2ZR2 A; 1IBM O; 5IWA O; 5DEC A; 1XNR O; 3AG7 A; 3MHS C; 1HNW B; 3SYQ A; 1K9M W; 1UPG A; 4TOI A; 1FFX B; 3CHX A; 4LF4 B; 3HKD A; 1B04 A; 2IJJ A; 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3WB0 A; 2BE3 A; 2LJ2 A; 3OR7 C; 2F4V B; 1K7D A; 3J80 N; 4X65 O; 4JI5 B; 2Q7E A; 3RVY A; 2XOK G; 4PA9 A; 3TET A; 1QR9 A; 3CME V; 3OEE G; 2A79 B; 3DGE A; 1YXB A; 5LOV A; 5IYZ B; 4I9Q A; 1BQZ A; 2VWK A; 2FML A; 4R50 A; 1SC5 B; 1OCZ B; 3D3I A; 1XHX A; 4JAA A; 2QDO A; 3SJB C; 1SES A; 1D2D A; 3N2K A; 5B3S B; 2Q9L A; 4UVA A; 1Q8I A; 3ABK B; 4QE7 A; 1I94 B; 4P30 A; 2JDI G; 4A5U B; 1PPJ H; 2E75 B; 3JD4 A; 3O9O A; 5K1P A; 1GRJ A; 2QM7 A; 4JI7 O; 3HKB A; 1AP5 A; 3CWB H; 3EXA A; 4DV2 B; 1GM9 A; 3O65 A; 1SA0 B; 4J9Z B; 4DR4 B; 3AG3 B; 2HG5 C; 1MG1 A; 3RYC B; 2Q73 A; 3DXR A; 4B08 A; 4CH6 A; 3R65 A; 3LNM B; 1JMK C; 3RYF B; 2A9H A; 5KA5 A; 2XAJ A; 1YTF B; 1ZUQ A; 4L8J A; 5F2V O; 2NR5 A; 3FYE B; 5JJJ B; 4RQE A; 4LR3 A; 5KX5 A; 2UXD O; 4F4L A; 2MW2 B; 1IBL B; 3ML0 A; 4JAS A; 1QHT A; 1SKV A; 3IJ4 A; 2BTQ B; 1MOF A; 2ADQ B; 3SPH A; 2PYL A; 4TV9 A; 4DV0 O; 5EBM C; 1E1R G; 2XAG A; 2HR3 A; 3OT7 A; 4G28 B; 3BAA A; 3JCZ A; 4J7J A; 2V7Q G; 5IJ0 B; 4NXM B; 5KMG B; 4JYA O; 3LSS A; 4BIU A; 1F23 A; 3ZMT A; 4O4H B; 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