4AF0B

Crystal structure of cryptococcal inosine monophosphate dehydrogenase
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
522
structure length
395
Chain Sequence
TNPNAPPRPDSLLNPSDALKHLEEYPRGDGLSLQELMDSRKNGGLTYNDFLVLPGHINFPASDVSLQSKATKNIVLNTPFLSSPMDTVTEDRMAIALALHGGLGIIHHNCSAEEQAAMVRRVKKYENYPYASKVPESKQLYCGAAIGTRPGDKDRLKLLAEAGLDVVVLDSSQGNSVYQIEFIKWIKQTYPKIDVIAGNVVTREQAAQLIAAGADGLRIGMGSGSICITQEVMAVGRPQGTAVYAVAEFASRFGIPCIADGGIGNIGHIAKALALGASAVMMGGLLAGTTESPGEYFYHEGKRVKVYRGMGSIEAMEHTGLDNAATARYFSEADAVKVAQGVSGDVADKGSINKFVPYLFTGLQHSLQDAGIKSVSELHSCARSGSLRFELRTAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
publication title De Novo GTP Biosynthesis is Critical for Virulence of the Fungal Pathogen Cryptococcus Neoformans
pubmed doi rcsb
source organism Cryptococcus neoformans
total genus 121
structure length 395
sequence length 522
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
B PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4af0B00
3HO8A 3W7EA 2EPHA 1VYPX 1FWTA 4U4MA 5AC6A 2ZTKA 1QFEA 2A7NA 4FX8A 4FHAA 1SPQA 2EGZA 1GOXA 5HR7A 1K8ZA 2VFDA 3ANYA 3C3NA 1DQWA 1Q6OA 3MI3A 1SW0A 3PG8A 3GKAA 3DU0A 2EF9A 3LCHA 1TV5A 3PUDA 4LVBA 5KMYA 3ABOA 3M43A 2Y88A 3LGEA 2IQTA 3CEPA 4FX6M 4O11A 3S0CA 3IV3A 5CSSA 1ONRA 4E2DA 3NL2A 1JJKA 3ABRA 3MMTA 1A53A 4P61A 3UWQA 2V30A 4CCDA 2J27A 3PBWA 3L21A 3TJLA 3YPIA 2ZZ4A 1RR2A 1NSJA 5IBXA 5LKYA 2VOMA 3TAOA 4LY8A 3TC6A 1HO4A 1B4EA 2VEKA 3W1XA 3W2JA 4E0CA 4QSHA 2Z6IA 1MZHA 3EWZA 3CWOX 4MYAA 4WOQA 1SO4A 1YDNA 2HTMA 1K7EA 1TPVA 2A0NA 3VE7A 1TCDA 2RDTA 3NQ7A 4ZQMA 4DF2A 4YLWA 2HSAA 3NAVA 3GDLA 3G18A 4X3ZA 4O1BA 1TREA 3P62A 5D33A 1KTCA 1ME8A 4QQ3A 2NLIA 3W7IA 3CC1A 4GBUA 4LW7A 3RNDA 1G69A 1YDOA 3S5YA 3W22A 3NQAA 1HO1A 3G8EA 1Q6LA 3ATYA 4X9SA 3S1XA 1UUMA 1KLYA 3P61A 2NWSA 4MUZA 4O4VA 2V81A 1MEWA 5LNWA 1DV7A 1T96A 1M5WA 1TTPA 3BG9A 3LHYA 3MI6A 5HUPA 1E51A 1W1ZA 3LTPA 4N2YA 3W7NA 4DO5A 2OT0A 3LXCA 1TIMA 2VENA 3LOTA 2Q8LA 2E09A 1F6KA 4AEOA 5LHEA 1DORA 3QZEA 4B5NA 3PB0A 2Y7GA 4UXDA 3BLFA 5CG7A 2CU0A 2F7FA 1KM0A 4JN6A 3SGZA 1MEHA 1JCMP 1FXQA 1H5YA 4LRSA 4DO4A 3L0NA 3OVQA 3IGUA 3MP4A 2R8WA 1NAL1 1K8YA 3GB6A 1GTHA 3DI1A 1AG1O 3B03A 4XBKA 2GPTA 4TIMA 4TR9A 4ORIA 4NXKA 4HNTA 5F4WA 3P5YA 4K7YA 3WJWA 3DI0A 2FB3A 3W1NA 2OT1A 1KFEA 3THQA 3TDFA 4ZZ9A 3P82A 3MYOA 2QAPA 3HG3A 3MBFA 5D32A 2WSRA 5FF4A 1GTEA 2QR6A 4GUHA 4UFJA 4LVDA 2V8ZA 1W31A 3G0XA 4HNUA 3FJLA 4JDBA 4P2VA 2E5CA 3DGRA 2O7SA 3W72A 1YTKA 3O1NA 2WJZA 1Z41A 5CPNA 2X2GA 2G97A 1I2NA 2HS8A 1VJIA 4O0KA 1SZNA 4AWTA 3GDMA 3LXAA 3OVPA 4N6EA 1RV8A 5HULA 1VHNA 1EPXA 4TX9A 4MVAA 2Y7DA 4LOCA 2JBMA 5DCEA 1W56A 3QFEA 4Q33A 2FDSA 1S3HA 5F1UA 3W9ZA 1XBXA 4RZ4A 3DFOA 1VYRA 1XM3A 3NQ2A 2QCLA 3HPSA 2XN2A 2QCFA 2ZRXA 4JDYA 1Q45A 5LNVA 1XUZA 3TSMA 2JK2A 5FF7A 2QF7A 1L6SA 2NXGA 1YYAA 1S5VA 4NJJA 2Y70A 3ZR4A 3ZWSA 1KM5A 1XBYA 3EX4A 4JIPA 2WQPA 2QCHA 1SZEA 3PWAA 2A4AA 3IIXA 3LCFA 3NQVA 2E5DA 4L4MA 1RQEA 3SECA 2CZ5A 2V5BA 3QH2A 2ATSA 3N73A 2C13A 4NJIA 1JCLA 3HPZA 3PSVA 4ZQNA 1UCWA 1TV8A 2BTMA 4O18A 4A29A 2ZZ1A 3U6WA 1KFKA 1OFAA 3U8GA 2ISSA 2J24A 1QPRA 1S5TA 4LS1A 5AN7A 2W79A 1DQXA 4OQVA 4XKYB 5DCBA 3I7QA 5BW6A 5CZSA 2X1RA 2VFEA 5DELA 4AHPA 1QPOA 1CW2A 1KBIA 3QJAA 2GQ9A 3UY7A 4ZQOA 1TRIA 4K39A 3I7SA 4FX7A 4RCXA 2DZPA 3UZ5A 1O5KA 1WQ5A 1EX5A 1N8FA 5I3HA 4UFIA 3M7WA 1GVFA 2NZLA 4LC6A 2VFIA 3CB8A 2YX0A 3M1ZA 5D05A 2G96A 3NOEA 3NXFA 1PHQA 3K30A 1UASA 4MY8A 3KX6A 1JCYA 1WV2A 2FFCA 2QUUA 2X1SA 4GUGA 3MP5A 4IX2A 5EPDA 3G3DA 1OF6A 1H51A 3TNOA 3UXAA 4C1LA 4IXHA 3LCGA 4JYFA 1F2JA 4M19A 1VYSX 3TW7A 3LI0A 4FNRA 1X6UA 2YXGA 4JD4A 4PH6A 2A5HA 2QKFA 1WYIA 3OHIA 1QOQA 1LBFA 4G1KA 4EIVA 3E49A 4UTHA 3P5ZA 5L6UA 1GYNA 2YYUA 3CU2A 3W6YA 4WD0A 5DN1A 3GR7A 4UC5A 1TPEA 4CCEA 2YZRA 1OG0A 4IMEA 5CPLA 3EEGA 1W54A 3TQKA 1PCWA 1C8VA 2R14A 3QQ1A 3UPBA 1MSSA 4M7TA 2Z2UA 4UTTC 2NUWA 3W70A 2BLEA 1BKSA 1H7PA 3I7RA 3IIVA 3LV5A 2G5WA 1AL7A 5D2TA 3QSTA 3G1VA 3NQMA 1Q6RA 1UUOA 2Z1BA 1G6CA 5G4WA 3DFTA 4O57A 3ZWTA 5FEWA 1Y0EA 3LB0A 4R7JA 1VRDA 3LLFA 4Q32A 4O16A 1HG3A 3ATZA 2OCZA 1QPNA 1C9DA 1LYXA 1TTJA 1I2PA 2CLIA 2I9EA 3P60A 1M7PA 5HQEA 4JTLA 3O6CA 1LLZA 2A7RA 3MJYA 1EWDA 1KFBA 4J9JA 4TU1A 1IXQA 4HSNA 1FDJA 2FPYA 3GKFA 1B57A 3O05A 1DKWA 1O4UA 3G1DA 1KBJA 4PFMA 4ZQCA 3PR2A 3V75A 3FIGA 3VCRA 4PCFA 1KFCA 3E12A 4MJZA 4JY9A 1LOSA 1LP6A 2GQ8A 3C2RA 1AMKA 3MWAA 3MI2A 2GVJA 3QW4B 3TW6A 3C0JA 4OV9A 4FIQA 1I8JA 3HGOA 4S2BA 1P5BA 3VFLA 2V2CA 3M44A 3ZS4A 1H63A 1ML1A 2KZHA 3TCEA 3GAYA 5U4NA 1WOAA 3FS2A 3L5AA 1VHCA 3KOFA 1LOQA 4DQWA 2UV8G 4O12A 1SFJA 2A6NA 3JS3A 1TPH1 3LTYA 4IOTA 2E6YA 3W84A 1W3TA 3O15A 4FO4A 4A22A 5KSWA 1G4PA 1BWLA 4BI6A 3HGJA 4UTUA 3IVUA 2J9XA 2QEZA 5FEXA 5FF2A 1SO3A 1QDSA 3S5ZA 3W7QA 3NM3A 3OBKA 3UWVA 5EBUA 1FCVA 2ISVA 1T0OA 1MXSA 5K3VA 3O6DA 2NX9A 1Z44A 5SWUA 1Z42A 3RF9A 4O54A 2RH9A 3OVRA 4CQ8A 3THAA 2GQAA 4UCGA 3P81A 1JVNA 4OV4A 4LNYA 5G1TA 1W5OA 5C54A 3INPA 1TMHA 4Y8FA 3GLCA 4JGDA 2DZSA 2RDWA 1I2QA 1VR6A 5FESA 3DHDA 3W7CA 2Y89A 4NJHA 4LC8A 1D3HA 1PVNA 2NV1A 5A5WA 3N19B 3W2KA 3WJSA 2A2IA 4EVZA 2BZNA 5HUOA 4R33A 4QAIA 4K7VA 5EYWA 1Q6QA 1ZAIA 5BNKA 4AXKA 1FCUA 5AHNA 3O6YX 5IBXC 3BG5A 1J4EA 3C61A 3G1AA 1KM3A 2E5BA 4M6VA 3IVTA 3HMJG 4Z1AA 4WY0A 1U5JA 1UBSA 3FKKA 1TPWA 2DZTA 2ZZ7A 4GUIA 4UTMA 3PM6A 3QEZA 2A6LA 3V1PA 4AB4A 1VCVA 5C6MA 3TV8A 4ZL1A 3I6RA 5K7JA 5G5IA 2RFGA 3TSBA 4JX5A 2YR1A 3W74A 1OABA 3QMRA 4XUGA 1VH7A 1FWRA 3LCXA 1G7VA 3SFKA 3EKZA 2CZFA 2CW6A 3LERA 3W7MA 5I3FA 1GJPA 1PCKA 5G2IA 1SSDA 1O94A 1OFEA 4IJBA 5BMXA 1H62A 4CNOA 3Q37A 4WUIA 1VLWA 2I1OA 4XTDA 2Y7EA 2NUXA 1OFOA 1TPC1 2ZRYA 1R30A 2BXVA 5H91A 4O4WA 3GK0A 3WK0A 3EWXA 1GG1A 1SW3A 2H8XA 3IVSA 3ABQA 1VCGA 4AWUA 3W7HA 4BFAA 4K37A 2ABAA 2ZZ3A 4HNNA 2WV8A 1EUAA 4LVGA 3G3MA 4WX2A 2GUUA 3GXTA 1IF2A 1SQ7A 3TQ0A 1O60A 1PHWA 2BX7A 1WXJA 5DBTA 2P1FA 1LRNA 4CQAA 1FUYA 1WBJA 3N9SA 4LS0A 2AAMA 4NJGA 1OFBA 1KTNA 5D04C 1LRQA 1RQBA 2YGYA 4JTFA 4ZVJA 2PRHA 5K9CA 1LBMA 1X1ZA 2X16A 2R91A 3W7LA 3W2LA 4TO8A 3S1WA 3KRZA 3LBMA 4Z1CA 4UNKA 3P67A 1JRBA 1F6PA 4MZYA 5D2WA 4QJ1A 1YTDA 4WJEA 3QC3A 2WSQA 3B05A 3LRKA 3QSRA 2C15A 5G1YA 4RK8A 1JCXA 4WXYA 4M5PA 1TYGA 2RDUA 1JCNA 4LT9A 3W1UA 4N9BA 4JNMA 3UWWA 3TH6A 5H2ZA 1DVJA 4NUWA 3E9AA 1LORA 4NX0A 5AYZA 2DZUA 1DBTA 1H1YA 2ZDRA 4PA8A 1KLZA 4MFEA 3LHVA 4JX6A 5E1QA 2YDAA 4TMCA 3UY8A 2YYTA 1X8FA 1AK5A 1EIXA 5AYXA 3W71A 4UNLA 3I65A 1FDYA 2VEIA 4R34A 4UTKA 4PTNA 3RFAA 5MHBA 5FEZA 2DJXA 3KRSA 4FXRA 1VZWA 1WOBA 4LUIA 6ALDA 3PUEA 2H6RA 2WO5A 2ALDA 2VXNA 1EP2A 1XXXA 2C0AA 3PY2A 3R5EA 3NVTA 3TSDA 2E77A 4JY8A 4KKXA 4D2JA 3TE9A 3EXSA 2V2HA 3MHUA 2DZWA 4JYEA 5LNRA 1W5PA 5TIMA 3B0VC 1LCOA 3DFPA 1XI3A 5KTLA 1H7XA 3IRDA 1R47A 3BVJA 3UNDA 5CZ0A 2YFNA 1SO5A 4Q4KA 3W07A 4LVAA 1TJPA 3W1TA 4FNPA 3KAOA 1OX5A 2E1DA 2FPTA 1L2UA 3GZ3A 3O06A 3GNDA 1KA9F 3IIOA 3M6YA 1JQVA 1A50A 4JEQA 4N9DA 4NJKA 3LHUA 1OYCA 4LTSA 1H7OA 1TV7A 2ZYFA 1OJXA 3P8JA 2ZRUA 3NL5A 3P8IA 3P74A 1SSGA 3W1RA 3PG9A 2QUTA 2TPSA 2ZFAA 1AW1A 3QRHA 1NFBA 3EX6A 2VC6A 1P0NA 3G1YA 4DPPA 5KITA 3NQDA 3VKJA 1TTIA 2JGYA 3BLEA 1L6YA 2GOUA 3F4NA 3FKRA 5FF3A 1RPXA 2V9DA 3WK1A 5CPMA 1THFD 1VLIA 4GJ1A 5EY5A 1I45A 4CNPA 4Z1DA 2QCNA 5I3GA 1DL3A 1MO0A 1TSIA 3DENA 3LBCA 3RMJA 1R2RA 5IM51 7TIMA 1S5WA 2GJNA 4A2SA 1ME7A 1KM6A 3SR7A 4Z1BA 2AGKA 4HN4A 3VNDA 3L0KA 5DLCA 4QISA 1RQHA 3BGGA 4H6KA 2FIQA 3FYOA 2P10A 5ABTA 2OX1A 4N4QA 4AMAA 3IEBA 3M9YA 4UIOA 3W23A 1QWGA 3WFAA 2Y85A 1Q3NA 3NYZA 3WJZA 4GNJA 3MP3A 1WA3A 2B4GA 3U2OA 3G22A 3DXIA 4UMBA 4XTIA 1FWSA 3DKJA 1K7XA 3S6DA 2FLIA 1N7KA 3C4UA 3TK7A 3HG4A 3B0PA 1ZY9A 5LNUA 3UXDA 1NEYA 4LWWA 3L68A 4RV8A 5CZTA 3TKFA 1WDWA 2YFOA 5FF0A 3BO9A 4UR7A 4ICNA 1W3IA 4IXXA 2GJLA 4XKYA 5J5RA 3IIPA 4KFPA 3S5OA 4UUIA 1XUUA 2C6QA 1VC4A 1J2WA 2GVLA 1GVQA 1XCFA 4YCPA 4JYDA 5T26A 5C5YA 2X30A 2CWNA 3UYCA 4DXVA 3PULA 1QPQA 4O1DA 2EKCA 3KXQA 1YXDA 3NQGA 1FDZA 4O50A 4K6AA 4XQ6A 3NNTA 1KV5A 1SZFA 3UPWA 1L6WA 4PEKA 2NV2A 4GFSA 4K8HA 1KM4A 4H4IA 3STCA 1LBLA 4DBDA 1TRDA 1DOSA 4NNAA 1T99A 1OFPA 4GUFA 2V82A 3HPXA 2ZRWA 4HIBA 4IQLA 4JR5A 2W0UA 4ADTA 2ZA1A 2JKAA 2VKZG 3EX2A 1PV8A 2X1UA 2HMCA 2PC4A 3C6CA 4O52A 1LZOA 3VI2A 1VQTA 3JR2A 2TSYA 4S2CA 4BK9A 1BTMA 1CI1A 2GVGA 3EXTA 1KTBA 3KVKA 3M5XA 2PCQA 4JTEA 6TIMA 3B0UX 3A23A 2Z0IA 4BWLA 3DKLA 3KRUA 3PSWA 4FNQA 4MZ8A 5K4ZA 3W73A 3A21A 3W87A 3NGJA 3PB2A 3UQNA 3TA6A 2FTPA 2C16A 3R8RA 4AF0B 3CHVA 3W1MA 4LV4A 4POCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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