The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
LFVALYDYQADRWTDLSFHKGEKFQILDASPPGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPV
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/de novo protein
|
| molecule keywords |
CHYMASE
|
| publication title |
Generation, Characterization and Structural Data of Chymase Binding Proteins Based on the Human Fyn Kinase SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
10
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5GJV B; 2D0N A; 4J9B A; 1NYF A; 2F2V A; 3VRY A; 5IHK A; 3I35 A; 1M30 A; 2ESW A; 2RPN A; 1SPK A; 4HVU A; 2KR3 A; 2DL5 A; 4QT7 A; 3VS3 A; 4JZ3 A; 4A63 B; 1M3B A; 2JTE A; 4F16 A; 4M4Z A; 1BU1 A; 1BB9 A; 4LUD A; 2MIO A; 2XMF A; 2O9V A; 2GBQ A; 1K76 A; 2CRE A; 1T3L A; 1CKA A; 1UTI A; 2ENM A; 4J9I A; 4RTW A; 3H0I A; 2ED1 A; 2JS0 A; 2O9S A; 2MCN A; 4CC4 B; 1U3O A; 1KFZ A; 2F2X A; 3I5S A; 1WLP B; 2J7I A; 4ORZ A; 2DL8 A; 2LJ3 A; 3M0Q A; 4FSS A; 1A0N B; 3UF4 A; 3PVQ A; 1G83 A; 1K1Z A; 4HVV A; 1U5S A; 1PHT A; 2K2M A; 2CUB A; 1QLY A; 1SHF A; 2CUD A; 4DEX A; 3EHR A; 4J9D A; 2DL3 A; 1RLQ C; 2KGT A; 2L0A A; 4AFZ C; 1WXB A; 2NUZ A; 2NWM A; 2P4R A; 1PNJ A; 2C0O A; 2FG0 A; 1ABQ A; 3VS6 A; 2LQW A; 1MV0 B; 1UGV A; 1H8K A; 1N5Z A; 4OMM A; 2LJ0 A; 1UG1 A; 2EPD A; 1W1F A; 1I0C A; 1X43 A; 1NEG A; 1JXO A; 2DVJ A; 2MOX A; 1G2B A; 1SEM A; 2EYX A; 4AFU C; 1Z9Z A; 4HCK A; 2G6F X; 2LQN A; 4LNP A; 3REA B; 3VS1 A; 4GBQ A; 2FRY A; 2QDL A; 2EYW A; 2KT1 A; 1X2K A; 2V1R A; 1NEB A; 4WCI A; 2KRO A; 1WI7 A; 2DLP A; 2FPE A; 2HSP A; 2FPF A; 1OPK A; 4F14 A; 1YWO A; 2GTO A; 1K4U S; 1WYX A; 2RQT A; 1FMK A; 1T0H A; 2LCS A; 1QWF A; 1I1J A; 3FJ5 A; 1E6G A; 1YP5 A; 2EKH A; 1QKX A; 1LCK A; 1AVZ C; 4D8K A; 2A08 A; 3EG1 A; 2LJ1 A; 2RQU A; 4EIK A; 2FO0 A; 1SRL A; 2DIL A; 1M8M A; 2KRM A; 3PVL A; 4Z88 A; 3JV3 A; 3VRZ A; 4RTU A; 1UUE A; 3H0F A; 3EHQ A; 1OV3 A; 1AZG B; 1UE9 A; 2EYY A; 1M3A A; 3M0U A; 1H92 A; 5ECA A; 3A98 A; 1JU5 C; 3THK A; 1V1C A; 5GJW B; 2AZS A; 1T0J A; 2CT3 A; 1NYG A; 2J05 A; 2GTJ A; 2GGR A; 5IXF A; 2KRN A; 1Y57 A; 4E6R A; 1QWE A; 2EVR A; 1JEG A; 1KIK A; 4JJB A; 1AEY A; 1WFW A; 1K9A A; 2RF0 A; 2KE9 A; 5IH2 A; 1GBR A; 1GL5 A; 1NLP C; 1SRM A; 3M0R A; 4RTZ A; 2KYB A; 3NMZ C; 3C0C A; 1AD5 A; 2VVK A; 2L3S A; 2CT4 A; 2AZV A; 2ROL A; 4ZNX A; 1K0X A; 1AZE A; 2O2O A; 1QCF A; 1UEC A; 2C0T A; 3SEM A; 1H3H A; 1M27 C; 5IHN A; 2EQI A; 2K79 A; 2AKL A; 2EBP A; 2K6D A; 1TUD A; 2O88 A; 2EGC A; 1K0S A; 4J9G A; 2RQR A; 4RTV A; 4D8D A; 1X69 A; 4HVW A; 2KXC A; 4IIM A; 1M3C A; 4OML A; 1GCQ C; 2D8H A; 3EGU A; 4OMO A; 2HCK A; 1GFC A; 1PWT A; 1PRL C; 2DA9 A; 1PRM C; 2RMO A; 2PTK A; 2EW3 A; 2YUP A; 2CDT A; 2LMJ A; 4X1V A; 3M0T A; 2L3P A; 2YT6 A; 2DF6 A; 1ARK A; 4JJC A; 3IQL A; 2CH4 A; 2E5K A; 3H0H A; 1ABO A; 3U23 A; 3VS0 A; 4AG2 C; 1JQQ A; 2I0N A; 2W10 A; 3TSW A; 2M0Y A; 2YUQ A; 5IXB A; 2JT4 A; 2CH4 W; 3R6N A; 5I22 A; 1WXT A; 1YWP A; 2V1Q A; 1T3S A; 2ECZ A; 1RI9 A; 1BBZ A; 2JM8 A; 3UAT A; 2LZ6 B; 1UHF A; 1ZUK A; 1W6X A; 2J6O A; 4J9F A; 4RTY A; 1ZUU A; 1PKS A; 2OI3 A; 2JMA A; 5HCK A; 1YCS B; 2EGA A; 2JMC A; 1HJD A; 4ESR A; 2A37 A; 1OEB A; 1X6B A; 2HDA A; 2LP5 A; 2YDL A; 4KRT A; 2DRM A; 2K9G A; 4HXJ A; 2D8J A; 2J06 A; 1MUZ A; 2KRS A; 3SHW A; 2SEM A; 1W70 A; 1EFN A; 2DL4 A; 2RQV A; 3GBQ A; 1UJ0 A; 1GCP A; 1E7O A; 3EG2 A; 1WA7 A; 1TUC A; 2EYZ A; 1AWJ A; 1GFD A; 1WXU A; 1ZUY A; 1U06 A; 2LNH B; 1WDX A; 2LX7 A; 2X3W D; 2FEI A; 2KNB B; 4Z8A A; 3KFV A; 4R0K A; 5IHI A; 2ABL A; 2IIM A; 2K3B A; 2D1X A; 1WX6 A; 2JS2 A; 4OMP A; 5I11 A; 2FPD A; 4AFS C; 2FRW A; 1AOJ A; 2DM1 A; 3UA7 A; 3NPF A; 1IO6 A; 2DBK A; 2YUN A; 4J9E A; 2KEA A; 4JJD A; 4LUE A; 1SHG A; 3QWX X; 2YSQ A; 3ULR B; 2DYB A; 4J9H A; 4F17 A; 2ROT A; 2KYM A; 1X27 A; 5FWB A; 1CSK A; 3I5R A; 2AK5 A; 2VKN A; 5FW9 A; 1AWX A; 1B07 A; 4Z89 A; 1GRI A; 3O5Z A; 2L2P A; 2PZ1 A; 2RN8 A; 2X3X D; 2C0I A; 4JPB W; 1Y0M A; 4RTT A; 5L23 A; 2YUO A; 1X2Q A; 2RQW A; 2SRC A; 1OOT A; 4Y92 A; 1FYN A; 4LN2 A; 1RUW A; 1UFF A; 1ZLM A; 2CSQ A; 4RTX A; 4OMN A; 3M0S A; 4K11 A; 2BTT A; 1UHC A; 3TVT A; 3RNJ A; 2BZY A; 1KSW A; 1ZX6 A; 2EGE A; 1UDL A; 1NG2 A; 1S1N A; 3QWY A; 1SSH A; 2CSI A; 3I9Q A; 3RBB B; 1ZBJ A; 2JM9 A; 4CC2 A; 2DE0 X; 2VWF A; 2JXB A; 4OMQ A; 3CQT A; 3VS7 A; 2O31 A; 1MV3 A; 2M51 A; 2BZ8 A; 1NLO C; 2L3Q A; 2B86 A; 1RLP C; 2A36 A; 1VYT A; 1YN8 A; 4CC3 A; 3ZL7 C; 2GQI A; 1WIE A; 2BZX A; 3VS4 A; 1HSQ A; 1VYU A; 3TSZ A; 1JO8 A; 5EC7 A; 2DL7 A; 2W0Z A; 3EG0 A; 1GCQ A; 4AG1 C; 4AFQ C; 3PE0 A; 1YNZ A; 3M0P A; 1CKB A; 1TG0 A; 2H8H A; 4LE9 A; 2DBM A; 3H41 A; 1AWW A; 2OJ2 A; 4IIO A; 3VS2 A; 1OPL A; 2KXD A; 3UA6 A; 4DEY A; 1HD3 A; 2DX1 A; 1VA7 A; 4CC7 A; 1AWO A; 1J3T A; 1NM7 A; 3NHN A; 3REB B; 1Z9Q A; 2DNU A; 1BK2 A; 2AKK A; 1ZSG A; 1X6G A; 2J6F A; 2DMO A; 2RNA A; 3LH5 A; 2HBW A; 1PKT A; 2OAW A; 3VS5 A; 2ED0 A; 1VYV A; 2K7A A; 2JW4 A; 2PNI A; 4GLM A; 1JXM A; 3EG3 A; 1GBQ A; 3NGP A; 2KBT A; 2DRK A; 1QKW A; 4J9C A; 2DJQ A; 2J6K A; 1KJW A; 1B3Q A; 2GNC A; 4RUG A; 2HEQ A; 1I07 A; 5FWC A; 2KT8 A; 1XOV A; 4JZ4 A; 2A28 A; 1UJY A; 1E6H A; 2F2W A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3A5Z B; 4M75 D; 4JLI A; 1VQ7 A; 4A4K A; 5IHK A; 4D6W A; 2JTF A; 3OYI A; 2QQB A; 1FXX A; 1V76 A; 2KR3 A; 2LT4 A; 5GAO p; 3M55 A; 3NTI A; 5CR2 A; 1YCY A; 4F16 A; 4L59 A; 1HYO A; 1WZO A; 2XMF A; 2O9V A; 1K76 A; 4IUP A; 3P8D A; 4J9I A; 2QGG A; 4M75 B; 1YFN A; 3I5S A; 3VUB A; 4A53 A; 4XU3 A; 1WLP B; 2LCL A; 4FCY A; 1WHG A; 3AHU A; 2ZPI B; 4M7A F; 1A0N B; 4ZTF A; 3QII A; 1PHT A; 4XTX A; 1VQ5 Q; 2QK0 A; 2R5M A; 8ATC B; 3JB9 G; 1V29 B; 3EHR A; 2VXF A; 1WXB A; 3GF5 A; 3OMC A; 4M77 C; 3VKI A; 3V7C A; 3VS6 A; 2LQW A; 4R55 A; 1UGV A; 5GAO n; 3CC4 Q; 2LJ0 A; 1UG1 A; 1NJI R; 2EPD A; 1I0C A; 2OTJ A; 1X43 A; 4DBH A; 1SF9 A; 3SWN B; 3FEO A; 3CEY A; 4PFO A; 3REA B; 4GBQ A; 2Y90 A; 2FRY A; 1I5L A; 2EYW A; 2KT1 A; 3JB9 D; 3JCM V; 4Q5W A; 1KD1 R; 2KRO A; 5CAI A; 4BI3 A; 2DLP A; 2X51 A; 2E6Z A; 2FPF A; 4RG8 A; 1OPK A; 3QUI A; 2XHC A; 4B9X A; 1Q82 C; 5IT9 E; 4L5G A; 1QWF A; 2LCS A; 1WHL A; 1VQL A; 2EKH A; 5CCA A; 2A08 A; 2DD4 A; 3SD4 A; 1FX7 A; 2QXF A; 4Z88 A; 3G4S Q; 1UUE A; 4KGX B; 3EHQ A; 4XTZ A; 2V8I A; 2QEX A; 3CBM A; 5J3B A; 1AZG B; 1UE9 A; 2DAQ A; 2DER A; 1H92 A; 1UGQ B; 1JU5 C; 1OUL A; 1OX9 A; 1Q86 U; 2RB6 A; 1NYG A; 4PJM A; 2DYI A; 4JS4 A; 4JLG A; 1JEG A; 4DBR A; 1VQ8 Q; 1WFW A; 3OSV A; 5LJ5 e; 5CIU A; 4J8O A; 3CCL Q; 2LVM A; 1NLP C; 3M0R A; 3NMZ C; 1YI2 A; 5GAN 6; 2CT4 A; 2KVQ G; 4GLK A; 4KH0 B; 3M9Q A; 1VQM Q; 1K0X A; 1AZE A; 2O2O A; 1QCF A; 3VU3 C; 1K73 U; 1M27 C; 2K79 A; 1VQ6 T; 1I81 A; 3HRT A; 4LDV A; 1M2V B; 2EGC A; 4RTV A; 4FW1 A; 3CPW P; 3S3N A; 2WAC A; 4C92 F; 3OB9 A; 3WXM B; 1M3C A; 3OBY A; 4HKE A; 4OML A; 3CCJ A; 3PMT A; 1D0Z A; 3GIB A; 4OMO A; 1JRI A; 2HQX A; 3CCM Q; 3PGG A; 1BYM A; 1GFC A; 1MND A; 1M2V A; 3DB4 A; 2DA9 A; 2LDM A; 2YUP A; 4M78 G; 1VQM T; 2K5F A; 2P0K A; 3BDU A; 2L3P A; 8AT1 B; 3ZBD A; 3FRN A; 2CZ6 B; 4VUB A; 3EH1 A; 2E5K A; 4IUR A; 1ABO A; 1VQ4 Q; 1D0Y A; 5GAM h; 3C4S A; 4BAC A; 3U23 A; 4C5G A; 5LJ3 g; 4ELY C; 2W10 A; 5FRO A; 2DIG A; 2M0Y A; 1P92 A; 2BE9 B; 5IXB A; 3HRS A; 3OS0 A; 5I22 A; 4X34 A; 4Y28 E; 3CCE A; 1MMA A; 1BI3 A; 4Y91 A; 4M78 D; 1BCO A; 3NTK A; 5KCO A; 5HCK A; 1YCS B; 2DET A; 4OP0 A; 2HDA A; 1ZHI A; 5HY6 A; 2R5A A; 2D0Q B; 4HXJ A; 2D8J A; 2J06 A; 3JCM d; 1MUZ A; 1W2B S; 1QQJ A; 2DL4 A; 4PJO G; 4MZP A; 3OYA A; 3M57 A; 5M9O A; 4M78 B; 2X4J A; 3OS2 A; 1E7O A; 2YHT A; 1NZ9 A; 3OW2 S; 5KYX A; 1PSE A; 2PUK B; 3QDR B; 1WDX A; 3CCV Q; 1TH7 A; 3OYM A; 1HK9 A; 2IVW A; 2K3B A; 5DLO A; 2DK3 A; 4B9W A; 2H3E B; 1IXD A; 2FRW A; 2AT1 B; 2DM1 A; 5GAN d; 4IKF A; 4PJO D; 1BCM A; 1SHG A; 2M0O A; 3QZ5 B; 1Q82 R; 3HTR A; 3CCQ A; 1OU8 A; 1JB0 E; 3RER A; 1PSF A; 1QVF A; 2VKN A; 5FW9 A; 1C6V X; 1AWX A; 1B07 A; 2L89 A; 2C0I A; 4JPB W; 3EGD B; 2E1H A; 3NFC A; 1Y0M A; 3MEW A; 4PJO B; 2ZPG B; 5AYF A; 2YUO A; 1X2Q A; 1SG5 A; 2HKQ B; 1WHK A; 1VQN Q; 5HK0 A; 4EDU A; 2QQ9 A; 1RUW A; 5GAN j; 5CKE A; 5GAM f; 1B7T A; 2DZC A; 4ELZ C; 4OMN A; 3GNF B; 4TVR A; 5GMK m; 1UHC A; 1ZX6 A; 2EGE A; 4PJO A; 3I56 Q; 5LJ3 d; 5CQY A; 1NG2 A; 3SDZ A; 1PG5 B; 3CMA Q; 1PD0 A; 4C0F A; 2RD1 A; 2DE0 X; 2JXB A; 3EAE A; 1BI1 A; 4OMQ A; 2QDY B; 2MPX C; 2NYS A; 1VQP Q; 2O31 A; 3WVE B; 5DLQ E; 2DXU A; 3EGX B; 2FZC B; 4A4H A; 1TS9 A; 1QVG S; 1RLP C; 1YN8 A; 4CC3 A; 1QCO A; 3ZL7 C; 1YBY A; 3GP8 A; 4CRI A; 3HFN A; 2LCC A; 5HKC A; 5EC7 A; 5LJ3 j; 3EGX A; 2LQK A; 2O01 E; 2OTL T; 1GCQ A; 2MMP A; 4AFQ C; 3PE0 A; 2ZAE A; 2BE7 D; 4C8Q B; 2DZ9 A; 1X01 A; 1TG0 A; 3E19 A; 2FL7 A; 1YI2 T; 2IG0 A; 2C06 A; 2CP3 A; 4E7L A; 4N4I A; 2YXY A; 1OPL A; 2NLU A; 2I2L A; 2HL5 C; 2L3R A; 4X9D A; 1HD3 A; 2EQU A; 5KYY A; 1J3T A; 3MHX A; 1YHQ Q; 3NHN A; 3REB B; 4HA8 A; 1KC8 U; 3SB2 A; 1ZSG A; 1X6G A; 2RNA A; 2AHJ B; 4M7D C; 1KQS S; 4A54 A; 3F70 A; 1YJN Q; 4HCZ A; 3RUX A; 1VYV A; 2JW4 A; 2PNI A; 2RJF A; 4GLM A; 1WGS A; 3FC3 A; 3CC7 Q; 1XTD A; 2DRK A; 4M7A C; 3GLX A; 2ZGW A; 2RM4 A; 2HEQ A; 3HRU A; 5FWC A; 2E12 A; 2KAF A; 1XOV A; 1UJY A; 2F2W A; 2PQW A; 2E6N A; 4KH1 B; 4J9B A; 2RH2 A; 4AT1 B; 3G6E Q; 2F2V A; 3VRY A; 3OYE A; 3I35 A; 1UEB A; 3FLG A; 4HVU A; 5LL6 S; 4JRP A; 1LNX A; 2JTE A; 1VQ5 A; 2MIO A; 1T3L A; 4XU1 A; 1QVP A; 2ED1 A; 2JS0 A; 2O9S A; 3E1S A; 4OGE A; 4J6X A; 1KFZ A; 3OYC A; 1N9R A; 3OYD A; 3M58 A; 4X9C A; 1Q86 R; 1BIB A; 1VQK Q; 3CC4 A; 3TU4 K; 2DL8 A; 1M4Z A; 3CPF A; 4NOY A; 1YJW T; 2PVO B; 3M0Q A; 4N4G A; 1YIJ Q; 4FSS A; 3JB9 J; 3PVQ A; 2DPP B; 3VJP A; 1N8R U; 3CD6 T; 4HVV A; 2JN0 A; 2K2M A; 4II1 A; 3QPH A; 4DEX A; 1ZSZ B; 4DQ2 A; 5FU7 B; 2CKK A; 2P4T A; 1YJ9 Q; 1C0M A; 2JJ9 A; 3FJP A; 1K73 R; 2NUZ A; 4C0D B; 2P4R A; 1M9S A; 1QMC A; 4QVD A; 2FG0 A; 3OYB A; 5GAM g; 2M16 A; 5GAO r; 3A1P A; 2LNV A; 3CCR Q; 1W1F A; 4JRQ A; 2CP7 A; 4BE1 A; 2MOX A; 4AFU C; 3I55 T; 3CCS Q; 2G6F X; 6AT1 B; 4LNP A; 2RHU A; 2H3J A; 4ZTJ A; 1H64 1; 1WNL A; 1VQ9 A; 1NEB A; 1BKB A; 4J6W A; 5CQX A; 1WI7 A; 3QJY A; 4C92 G; 5I21 A; 4F14 A; 4M75 G; 1YWO A; 2Y4X A; 2GTO A; 2VB6 A; 2EWN A; 1FMK A; 5LJ3 e; 2QA4 T; 1UGP B; 1M5Q 1; 4KT0 E; 1LCK A; 4CI0 C; 5I2S A; 2KMT A; 2WSF E; 1I4K 1; 3C95 A; 2RQU A; 2QI2 A; 2DO3 A; 2FO0 A; 4KGV B; 1SRL A; 2DIL A; 4E2F B; 1M8M A; 2LT1 A; 5A0D A; 3CCL A; 2VYT A; 3EG9 B; 2XU8 A; 3PVL A; 3JV3 A; 5KE3 A; 3H0F A; 4F7U A; 2EJF A; 3L2Z A; 2EYY A; 5A0L A; 3BFM A; 5ECA A; 3THK A; 4C92 D; 2LQ8 A; 5GJW B; 1RAD B; 2AZS A; 4DBQ A; 3HSB A; 2XIC A; 2CGH A; 2KRN A; 1QWE A; 2A7Y A; 1KIK A; 1AEY A; 1OI1 A; 4FT4 A; 3OYL A; 3L2W A; 4BE2 A; 5IH2 A; 1GBR A; 2EAY A; 3LX7 A; 3OW2 A; 1GL5 A; 2KYB A; 3BE3 A; 3JCM Q; 2ZCF B; 3LGF A; 4C92 B; 2AZV A; 3LWI A; 1MMN A; 1UEC A; 4LDY A; 3SEM A; 1H3H A; 3MP1 A; 4M7D F; 3X20 B; 3LWH A; 2AKL A; 2EBP A; 3G7Z A; 4A4G A; 3OQ5 A; 4M77 G; 1VQ4 A; 4C92 A; 4D8D A; 5LJ3 f; 2VV5 A; 3G1J A; 1RAE B; 1N27 A; 3VV0 A; 1TXQ A; 1N8R C; 4M75 A; 2KXC A; 1ACM B; 3CCU T; 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