4AG0A

Crystal structure of fimx eal domain
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
QRGDVIAILQQALETNSFRLLFQPVISLRGDSHENYEVLLRLLNPQGQEVPPAEFLHAAKEAGLAEKIDRWVILNSIKLLAEHRAKGHQTKLFVHLSSASLQDPGLLPWLGVALKAARLPPESLVFQISEADATSYLKQAKQLTQGLATLHCQAAISQFGCSLNPFNALKHLTVQFIKIDGSFVQDLNQVENQEILKGLIAELHEQQKLSIVPFVESASVLATLWQAGATYIQGYYLQGPSQAMDYDFSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords FIMX
publication title Crystal Structure of an Eal Domain in Complex with Reaction Product 5'-Pgpg
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 83
structure length 250
sequence length 250
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.4.52: Cyclic-guanylate-specific phosphodiesterase.
pdb deposition date 2012-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00563 EAL EAL domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.450 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel EAL domain 4ag0A00
4HU4A 4Y9NA 4RNIA 2W27A 4FOKA 5MF5A 3U2EA 3GFZA 2R6OA 4AG0A 4AFYA 4RNJA 3GG1A 4Y9OA 3PFMA 3N3TA 4Y9PA 4ES4A 4HJFA 5MKGB 3GG0A 3SY8A 4Y9MA 3PJWA 4LYKA 2BASA 5MKGA 3GFYA 3S83A 4KIEA 3GFXA 3PJUA 3KZPA 3PJTA 3HV8A 3TLQA 4FOJA 4LJ3A 4HU3A 4J40A 4Y8EA 4Q6JA 4RNHA 5M1TA 4F3HA 3HV9A 3PJXA 4FOUA 4RNFA 4F48A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1AH3A 4Y9OA 1W2VA 2QCDB 2WMJA 1NP2A 2HTMA 3BOXA 2C79A 3TCSA 4LWWA 3S8HA 4EXQA 1UWIA 2A3EA 2ZRUA 2FB3A 3GIPA 3OVGA 2Y89A 3G24A 1YXCA 2QCFA 3UWEA 2NX1A 3NIYA 2QKFA 3ANUA 5C8BB 2VT0A 3P0WA 3A21A 4E4UA 4N9BA 4HU3A 3MW7A 4CD8A 1F3WA 3DXIA 5AYBA 3S2LA 3VKBA 2O4QA 3PZQA 1H7RA 3UPBA 3C0SA 4ZOBA 1ISZA 4AVOA 1F3XA 1Q66A 2P3ZA 2ABAA 5FAJA 1V6TA 4GNVA 1VFSA 3L5MA 2AQOA 5HK4A 1NY1A 4O0KA 3N12A 1MW3A 2CHRA 1ZJIA 4A29A 4FF5A 2CIPA 3M0XA 5MKGA 2PA6A 1FWIC 4S38A 2QUTA 4HD5A 3R43A 2XN2A 3R0UA 4GKLA 1H1YA 4ZB0A 3RU8X 2XM2A 1VJZA 3QOMA 4XD3A 4UR8A 1AK5A 1DWGM 1IIGA 8XIMA 4IFRA 5EMJA 1E15A 2J75A 4MAZA 1HGYA 5FF3A 2ZE3A 1R5YA 2FZNA 3MI2A 3TLLA 3NEHA 4ZENA 3UR5A 4GVFA 3RPMA 5M2FX 2L5HA 4U33A 3THUA 5I00A 1RH9A 5LZLA 4IL2A 3NQGA 3PFRA 4PB5A 1GOMA 4RV8A 4OOZA 2IPWA 3TC3A 3R8GA 4W5UA 2BY2A 4GVHA 4IMGA 2XVNA 3W7JA 2V38A 4B92A 1XYBA 3OPSA 1E9ZB 3EWXA 1N8WA 3HJZA 4W84A 3V4BA 3VZZA 3BW4A 1O6IA 4NZ4A 3N2OA 4PGLA 4ZMGA 4KIEA 3CEUA 5C9XA 1J01A 1CXEA 2HE8A 2WMHA 4LCQA 4Q7BA 4DXXA 4GZEA 3T0DA 2WSKA 4DZIA 2D69A 3P6LA 3C4UA 3CWNA 1LQAA 1NQ6A 1M68A 4D6CA 3W0KA 4Z1BA 5EBUA 2HK1A 2QIIA 1JDCA 3NQ6A 2DZAA 1TV5A 1G94A 3FHAA 1XDMA 2W91A 1R0MA 3GDBA 3N9KA 4IOTA 3GNDA 1BKSA 1S2CA 2CZDA 1P0KA 1PHWA 2GWGA 3CPGA 3B0PA 2GOKA 3ARWA 2VDIA 2ZZ2A 5M5DA 3UGRA 1H1ZA 3QEZA 4CQDA 3A5FA 1TVNA 1W9VA 1BWLA 1JRBA 4LB4A 4WJ8A 2FQIA 5LNWA 2QHAA 2F84A 4OHQA 3UG4A 2VD9A 4Z0JA 3ITXA 3OB8A 1KM2A 1S5VA 3IANA 4HPHA 1HFBA 3DENA 3WZ0E 3MI6A 4UTLA 4AHPA 1TE6A 1E0TA 1MZHA 1EJTC 3ZWTA 1PZ0A 3SCQA 3KS6A 2V3GA 3TXVA 3WD4A 3W26A 4U31A 1SFSA 3TYEA 1XYZA 3OLIA 4B2DA 5BZAA 1QBAA 4Q8OA 3PTMA 3M64A 1NIUA 1JFXA 2QCLA 1TCDA 4QCFA 2YCIX 4WY0F 1SZNA 5CLWA 4Q8PA 3B0VC 3LX9A 4GUHA 3RLVA 1DJXA 3SFWA 1W5PA 4XSLA 3MUZ1 3VNYA 4IIHA 1J12A 3VFLA 1Z69A 4GK8A 4QROA 5AOUA 2WZHA 3B4YA 1AZ1A 1GZGA 4DF1A 4LVAA 2CXGA 3OO2A 3RX3A 3ITLA 1NF0A 1NTHA 1ISXA 3ENLA 1CGWA 3KM8A 2KZHA 4BWLA 3QQ0A 1FWNA 4AD5A 4B9YA 4LOCA 2OO0A 3WNKA 1UUOA 5CJ5A 4W8BA 1CGVA 3SCWA 3HG4A 2XVKA 4B3ZA 1DTNA 1BG9A 3C2OA 1V08A 2V5JA 1TJRA 4QIUA 4JR5A 1XDJA 1JD9A 4XBSA 1OX4A 3W01A 4P61A 4B9ZA 2CWXA 3C52A 5A6TC 4K68A 4C6FA 3ITCA 2DZXA 1ONRA 4PEEA 3LHUA 4C1LA 1WYIA 1V3IA 4KKXA 2YIHA 2ZBTA 3QRHA 4E38A 1CPUA 2G8ZA 4F48A 2YL9A 2DEPA 4L61A 1XBZA 4XZBA 4RK8A 4UFLA 4IQJA 3HGOA 4HVXA 1K8CA 1GQKA 1EF2A 3PZVA 1R6WA 2BTMA 5JIWA 2BG5A 4DAIA 1N2VA 3JZEA 1VZWA 3QY6A 5C5YA 2NVCA 1S2AA 5HATA 1TELA 1YE6A 1D7FA 1UH3A 3P74A 1SW3A 4L1GA 5KSWA 5FCZA 2OYMA 3AYTA 4NJJA 3E3HA 4TVUA 1JZ4A 3AZSA 1UHVA 2FTPA 3IVSA 2GVYA 1JGMA 1EJRC 4C6IA 2GYIA 5FJUA 3DESA 3W1NA 4G6CA 1TFVA 2WNQA 4C6MA 3S6TA 3TOYA 2BGNE 2YA2A 5CC6A 1Y8BA 3MMWA 1JDFA 4Q8WA 3QHOA 1HVXA 4MFDA 1XLKA 4PH6A 1V6UA 1W3KA 2GFTA 2Q8ZA 3RG6A 4JZ5A 5IXEA 3QTPA 4FXRA 2ZX5A 4AZGA 1YDOA 4J3WA 3AIQA 1XRVA 2PGRA 2ZZ7A 4DWSD 2AQWA 3SRKA 3IIXA 4Y9NA 1KXHA 3N9SA 3W7PA 3U0HA 4H9ZA 3C61A 3VMNA 3G1FA 3MKVA 1PZ2A 1FWBC 4AXKA 3BV4A 4H4IA 1WBJA 1EEPA 3N34A 1JPHA 4GINA 3NOYA 3TYAA 3QFWA 1A5SA 2A3BA 4NJKA 2CC0A 3EWDA 2X40A 3KXQA 2FLIA 7PTDA 1W3JA 2WB5A 1GVFA 5GNXA 1J0ZA 3PG8A 4C6CA 3OLDA 3H2NA 2D73A 2VR4A 4GOAA 4FIQA 1QW8A 1Q6LA 2DZSA 4AIUA 1R3VA 3LMZA 3MDWA 3BAIA 4AMAA 2ZWZA 1XI3A 1CGYA 4I6KA 2C16A 3S9IA 4K3ZA 3D6NA 1S38A 2Y6ZA 3W1UA 3BJFA 1EUNA 1TX2A 1ELSA 2YA0A 1LZOA 1BRLA 1REQA 5EY5A 5HQMA 4TV5A 5D38A 1TZZA 4Q8UA 5I3KA 1EP3A 2GJNA 4IXHA 1XH2A 1MI3A 2A21A 2WJEA 3ZS4A 1VYRA 5G5IA 1GYLA 2PWUA 1H09A 2X7WA 4A2RA 1V6WA 3GD6A 1VJSA 1ZU8A 4GX9A 1FH8A 1VRDA 3AMLA 3CH0A 4XZNX 4ZE4A 4JX5A 4C6QA 4K7YA 2JFEX 3HTWA 1NDVA 1TRDA 3GB6A 2DZBA 1UA3A 4JFSA 4OOUA 3HQPA 1HJWA 1U5HA 3VU2A 3W00A 4HSHA 1GTHA 1HKIA 2BY1A 2E6AA 1Q6GA 2JEPA 4AWUA 1VIWA 3XISA 3SFKA 1EOMA 4GQQA 1A5UA 1YPFA 4MZ8A 4UTTA 3FXGA 2G4FA 2ZUNA 1HZYA 3C3UA 1YTDA 4W4QA 2IKHA 3V18A 3A12A 2R6OA 4AEFA 3RILA 1L9WA 1SJCA 3ARUA 1NDWA 4V33A 5CXPA 2DY3A 1WZMA 1KGUA 1SJDA 3S4TA 4BF5A 1TJ0A 1W5MA 5D37A 4MB3A 4OV4A 2PE4A 1WZLA 5D09A 1EP2A 1GVSA 4D1JA 4CD6A 1HNYA 4BY3A 4H9YA 3TSDA 1LROA 3V75A 4AX6A 2ATMA 3WUGA 3PJUA 4FI4A 2A1YA 2BWGA 4EXBA 3DECA 3WH8A 3LPPA 2ZUWA 3JS3A 5LGXA 1D3CA 1J18A 5DXXA 4UR7A 4RE3A 1IWBA 3EDEA 4NY2A 3GXFA 3UR7A 3MUAA 1Z3NA 2NWSA 2O9RA 1UOKA 2PMQA 4UOZA 5JQ9A 3H7UA 4ZGYA 2P0OA 2V0TA 1UPPA 2G4JA 3AXMA 3RAOA 1OFRA 4KPLA 3FK4A 4IUOA 1HL8A 3RCMA 3S2JA 3V35A 4HKPA 3WDPP 3MVTA 4UTWA 1PUDA 3KS5A 1R86A 2IXVA 3SCVA 5CZKA 3PJWA 2V68A 3WJYA 2JF6A 1NFGA 2HNEA 5J04A 3NVDA 3NQEA 1OWQA 3VILA 4CQAA 2YZRA 4RZ5A 4W8LA 5CC3A 4CU8A 1FH9A 1IEVA 2XFYA 5IBXA 3TNOA 4BA0A 5BCAA 5HQLA 4JTKA 4PB3A 3L4XA 3HGSA 1KRMA 1AZ2A 1QPRA 2E9MA 2EGZA 4EF8A 2VRQA 4BR1A 3TE9A 3BQ5A 1TPH1 5A69A 1GVQA 2F6UA 2GGIA 3OTRA 5LNRA 1ML1A 1OGSA 2CEQA 3LRLA 3NGJA 1UH4A 2ESCA 3K30A 4S3AA 1RXOB 1IGSA 3CZJA 2XN1A 1PKNA 3FHQA 4DAFA 4JEJA 4Z1AA 5IOBA 4LVFA 1BLIA 1NWRA 1Y5XA 3AI0A 2X1UA 1LYXA 3M7WA 3DCPA 4M3PA 3OZMA 3H2MA 4C1NA 4LS1A 2G3MA 3RX2A 1IHIA 4R5EA 5E9AA 4O12A 1JJKA 2PDUA 1UW9A 3F1QA 5CPNA 2BZNA 4R27A 4PUKA 4HCHA 2CESA 2TYSA 5I3DA 3CC1A 4JGDA 1LL4A 4MZ1A 2JQXA 3RLGA 2POTA 3MP3A 4A05A 2INFA 4HK6A 1HP5A 1MDLA 4NI3A 4PL1A 5ABEA 4XBKA 3M43A 1AJZA 2C6QA 3TYBA 5I2UA 3PM6A 4UFKA 3BLOA 5FL1A 4ATWA 3GE7A 1WOAA 5AVNA 3M9YA 3BG3A 3VDBA 2V81A 1ZBWA 3W02A 4W93A 4RXFA 3UJFA 4DJDA 3W7RA 4WK9A 4GABA 1RK5A 1GVRA 5DCDA 4NX5A 4CCZA 3O3RA 4QE4A 3NXFA 4JNYA 3LBOA 2PF8A 3LS9A 1OX5A 1NAL1 3L66A 1AW1A 1B2YA 1L2UA 2ZE0A 4MUZA 3IK4A 3IK2A 3WF0A 2OWCA 1UKOA 3BCFA 5J5RA 3TN4A 2ACUA 4PC8A 4C1KA 3GX9A 3D3AA 3TQPA 4HOZA 3IJDA 4KETA 2W0UA 1YXYA 3QMTA 5CZJA 3F4CA 3UY8A 4QSFA 5G1TA 2EG8A 5HJXA 2Q01A 2C19A 1QO2A 3S5YA 2CBJA 2XZ9A 4I9MA 3L4UA 1HF6A 4QS6A 3GAKA 3GG1A 2V5BA 1B57A 3DFSA 4N9DA 3M44A 5IDZA 1KBLA 3G0XA 2FZMA 1W54A 1DWFM 1RLDA 4REQB 1A5MC 1O5QA 3GDLA 4D8ZA 2XJ7A 2WO5A 1K6AA 3ZYZA 3UD6A 1XUUA 2V3DA 1QOQA 4GNJA 2VURA 1LOQA 3E5PA 4KCVA 4NIRA 1ZLPA 4MNMA 4YTSA 4AEEA 3NQ8A 4NASA 2J25A 4PCTA 4PULA 4N6FA 4HNVA 2G41A 2Y7EA 4F9DA 2PLMA 3BWWA 1VF8A 1WXYA 1ZPTA 3L0GA 3WBYA 3L4YA 1PZ3A 4I9TA 1CB7B 2ZWYA 2C1HA 3JR2A 4BI5A 2C18A 4M81A 3NPVA 1C9WA 4PL2A 3LHWA 3Q45A 1FKXA 3LZ3A 1KRBC 4US5D 1JCNA 5DANA 2J13A 3T40A 4P7RA 3UY7A 3WN6A 4RE2A 4IIEA 2I16A 2XUCA 3AQUA 4GY0A 2WOQA 3SCOA 2P8CA 5D30A 1JDDA 5A2BA 4A3HA 3I7RA 4Q6JA 1J79A 1F61A 3RYSA 3SJNA 4M7TA 3SCTA 3OVPA 2R1LA 1TPWA 3MCOA 1QUMA 3ITVA 3E0WA 4FK9A 2CERA 4WX2A 4A8LA 3H4WA 2OQLA 4LBUA 1FBAA 2DZVA 4RDWA 2A6NA 3NPXA 3MTWA 3DU0A 3R4IA 4O1EA 5GVJA 4ZTXA 4HN4A 3W84A 2VR5A 1DYSA 3BVJA 1XF0A 4LUSB 1QI5A 2DU2A 2VEPA 4AIEA 2VMFA 1DXFA 6TIMA 3MI3A 3LZ5A 3N13A 3A47A 1DJWA 1JYWA 2Y24A 1VP5A 3MO7A 2EPHA 1T6MA 3EWWA 3VINA 4XKYA 3WH6A 3EWYA 4GQ0A 2EKGA 2FVMA 4MZYA 4CN6A 1AODA 3F4NA 2I57A 1KBJA 1I60A 3K2GA 3SUUA 3KCOA 4JTIA 4A2SA 3GVQA 3ITYA 3RDKA 4UQAA 3R94A 4QG8A 1W9XA 3ANVA 1W1ZA 1FDZA 4IG2B 5DQPA 1V6XA 1V3JA 1K6WA 1RJQA 2CKRA 3V5CA 4CCCA 3SUWA 4TVDA 1VYPX 2EAWA 3BLLA 4Z0SA 1BXNA 4EWJA 1KGXA 1NARA 2VTFA 3GZAA 2PBGA 4N02A 3ECQA 3L4WA 1TV2A 2NT1A 4G1NA 3UCQA 2XH7A 2C14A 2Z29A 4QXIA 5FF4A 3OGSA 3CHEA 3C8FA 1EDTA 1W9BM 2DW6A 4FMVA 3UT0A 3CL8A 5AFDA 4FX7A 1WDQA 4HOXA 2E25A 1UH2A 4R53A 4DO5A 1WNOA 1BD0A 1JZ5A 4S3JA 3IUIA 5D9OA 3KBJA 1GWJA 3EPOA 1QXLA 5HAOA 2JKEA 5C9WA 3NTYA 3QYSA 1RQBA 4XG1A 5H2ZA 2VGGA 4JIQA 4ASTA 4JIPA 2VDGA 3R6IA 4E2BA 1P43A 3LPGA 1TQJA 3B05A 4MLRA 4RUBA 5A8PA 4MJZA 4D72A 4Q8MA 3OZOA 3ALFA 1VB9A 3C56A 3CYJA 3VGGA 3W2KA 5K9DA 3T1GA 4PYSA 1EEXA 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