4ALD | Genus

Total Genus 138

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	138
sequence length	363
structure length	363
Chain Sequence	PYQYPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASESLFVSNHAY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE
publication title	Crystal structure of human muscle aldolase complexed with fructose 1,6-bisphosphate: mechanistic implications. pubmed rcsb
total genus	138
structure length	363
sequence length	363
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	1998-07-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00274	Glycolytic	Fructose-bisphosphate aldolase class-I

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4aldA00

3QC3A 5CPLA 4FO4A 5AC8A 3NPUA 4PFMA 2E6YA 3FIGA 1Q45A 5DELA 3QF0A 4B5NA 3BG5A 2V9DA 1W5NA 1XBZA 1P1XA 4QNWA 4WXZA 3EWXA 3INPA 5FF3A 5EL1A 2Y61A 1K03A 1HG3A 4NX0A 3N9SA 1SZEA 2Q8LA 1L2UA 3QYQA 3WK0A 2ISVA 5BOOA 5BNKA 3JS3A 3W22A 2OX1A 3NYZA 4DO5A 3T44A 3G24A 5FF4A 4YCPA 3QQ0A 3WK3A 4JTIA 5IBXA 4IGHA 4K36A 1YADA 4MUZA 1WV2A 1X6UA 1GOXA 2CZEA 3W1XA 1OJXA 4BI6A 3RNDA 3THQA 4LV9A 5AC6A 4RV8A 3UXAA 1W5MA 3PBVA 3UQNA 3S42A 4UXDA 1IXOA 2QCDB 2NXGA 3IIXA 5FEZA 4ZQNA 1MZHA 3KVJA 1GJPA 4X9SA 3LV5A 2DZXA 3RF9A 2TPSA 5IM51 1TRIA 4XKYA 1RQHA 3MI3A 1I2PA 3W1QA 1IXNA 2FFCA 2ZBTA 1H7WA 1DL3A 2V82A 4MZ1A 3NQAA 3SJ3A 1UJPA 4UFIA 3DZ1A 1EWEA 3ABQA 1MSSA 1KFBA 4GUIA 1K7EA 4R53A 3PF3A 4DELA 2KZHA 4A2RA 4H4IA 1X7FA 3GVGA 2JKAA 3GXNA 4CQ9A 5IBXC 3NL2A 2YX0A 4PA8A 3M5YA 1QPRA 4ONVA 3LBMA 4UFHA 3G3MA 1LZOA 4WUIA 1GZGA 3NL5A 3LRMA 1H7RA 3C4UA 3DENA 3I7QA 3IGUA 4N9BA 2V2HA 1WXJA 5HWJA 2WV8A 1EP1A 3I68A 4OE7A 3IIZA 3EB2A 3TW6A 1LBFA 3FJ6A 4UTWA 4NQ1A 1KM5A 1H1ZA 2OMAA 2ISSA 2P0OA 4IQLA 2H3BA 4GUGA 2A7RA 4QIUA 2NXHA 1SU5A 1SW0A 1W5QA 3G0XA 1GG0A 3B06A 3QZEA 1SSDA 1L6WA 2QDHA 3LDVA 4O52A 1PS9A 1EIXA 4M6QA 1ME8A 3LHYA 4LU0A 1TIMA 3DI1A 3UWUA 1TPEA 4JY8A 1IXQA 1W3IA 2DU2A 3TA6A 4N6FA 5LNUA 1SFJA 3PVFA 5TIMA 3QMTA 3LCGA 4Z1DA 1S5VA 2QUVA 3LCXA 3GDMA 1W5PA 1D3GA 1S5TA 3O1NA 1KA9F 5TQLA 1GQNA 5L9FA 3T7VA 3EX3A 5AC7A 1WAUA 3MMTA 3STGA 4O14A 4HNVA 4DPQA 2A7PA 1TV5A 4AAJA 4JTLA 3HG4A 1G69A 3HBLA 5F2LA 5K4ZA 4WJEA 1QOPA 5K9CA 3RU6A 4MVAA 4L4MA 3P5YA 1VC4A 2RDTA 4A2SA 4UTWC 4AHOA 3LB0A 4BWLA 3P8JA 4LVAA 3OEXA 4A3UA 1I45A 3NPWA 4CLMA 3M16A 1WA3A 3T78A 4YCOA 5H2ZA 2WNZA 1EP2A 3GZ3A 1H1YA 3FKRA 4BF9A 3DKLA 3UZJA 2JK2A 4PC8A 4FIQA 3ZS4A 1D9EA 3G1XA 3QQ1A 4K7YA 5CZSA 2X30A 3W23A 2A5HA 5K9XA 3A23A 1VCGA 1QMLA 1JCNA 4IMEA 3ATZA 1WDWA 2VEPA 3HGRA 1SSGA 3L0NA 3L66A 1PE1A 3LGEA 3DFQA 3VI2A 3N19B 3GXPA 2VELA 1AMKA 1S5WA 1QPNA 3DH7A 1LLWA 3PB0A 3W1MA 1G4TA 3L21A 4BWLC 4H3DA 3W1UA 4RXGA 4LNYA 3N34A 4UTLA 3HGJA 1TPC1 1OHLA 3W7IA 4E38A 4DF1A 2YW4A 4YWIA 3TR2A 3LV6A 4O4WA 4HNUA 3W7MA 3P62A 1F2JA 4JD4A 3HG5A 3C2RA 2ZRZA 3TXVA 4O0KA 1PVNA 4LUJA 4HNNA 1BTMA 3O07A 1XC4A 3L9CA 1T0OA 2XN2A 5G2HA 3F4WA 1KM4A 1D3HA 4UCGA 3OVQA 2NXIA 2XFWA 3S5ZA 2ATSA 1C8VA 4EVZA 3P82A 4J9JA 1OFBA 1KM6A 2J88A 1UB3A 4GJ1A 1IXPA 2VFHA 2I9EA 3O06A 1GTEA 4ORMA 1FX6A 3TSDA 1P5BA 2TSYA 2H3DA 4C1LA 1ZNNA 3QMRA 1TYGA 4NNAA 3GDKA 1LRTA 2NLIA 4PL1A 5SWUA 4QJ1A 3W2LA 1VYRA 4IPIA 4UR7A 4NXSA 3UWWA 5J5DA 3KHJA 4NVTA 1L6SA 3ZWSA 2QF7A 2VEIA 3B4UA 1ME7A 3NZ1A 4LS2A 4Z0JA 1SW3A 5EMUA 1JR1A 2C1HA 3EX6A 1X1OA 1OYCA 2J24A 1LOSA 1H7XA 2ZA3A 3P80A 3UPBA 3W7HA 1AG1O 3BG9A 2G97A 4C1KA 3W6YA 4GBUA 2CLKA 3DFTA 3CPRA 5D32A 2B7PA 4CQ8A 3B0VC 1LRQA 3E49A 4M5PA 4DXVA 3MP4A 1YXCA 3M41A 1VCVA 2CFFA 3G1SA 1L9WA 4I7UA 2NX3A 5HNRA 4N9CA 3W7QA 5D05A 4EF8A 4HNTA 2V30A 4S2BA 4TR9A 2E6DA 3WJWA 4IXHA 3MYPA 4UMBA 3UZ5A 1KTBA 2ZZ7A 1J5TA 3SR7A 3EWZA 4ZQCA 1O94A 4Y90A 3O05A 1NAL1 2XN1A 2Y62A 1YYAA 3FS2A 3LI0A 1QWGA 4LUIA 4FF7A 1K3UA 2B0MA 3DFPA 4DF2A 1GVQA 3DFOA 4JTUA 3TFCA 5I3GA 1SZGA 3TKFA 5DBTA 2QCCA 2QDGA 4OV4A 4A21A 3C2EA 1PL9A 4MIMA 5A8GA 2YYUA 3G1YA 3KRUA 3NQEA 5HUOA 2FQIA 1JUBA 1TSIA 4XQ6A 1KV8A 4LS0A 4P2VA 3EEGA 4Y6GA 4TO8A 2I1OA 3PUOA 3W1AA 4BFAA 4FXSA 7TIMA 1WOAA 1TPUA 1Y0EA 1EEPA 3IIVA 2FJKA 3DHDA 3IEBA 3C8FA 3QSRA 1OYBA 3KOFA 1H7NA 1RR2A 4NJJA 3TAKA 1XBYA 3BGJA 4K39A 1J4EA 4WOZA 2HMCA 4MPQA 4IMFA 3N14A 3NQGA 3C52A 2C19A 3L0KA 3G1AA 5BMWA 4U28A 3W72A 5LHFA 4JR5A 1H62A 4M6VA 3IIOA 1G4SA 1QR7A 2YFOA 1LROA 3NQMA 2W79A 3VE7A 3A24A 3CU2A 4AF0B 1DOSA 3PR2A 3BLFA 3NL3A 1SW7A 2NUXA 4L4LA 3W1PA 5HWMA 3NQ8A 3CC1A 4WQ6A 4JDBA 3HB9A 3SFKA 2ZRXA 3U2OA 5AYYA 4YL2A 2CLIA 4WY0B 5I3JA 1L6YA 1HTIA 3CTLA 2X1RA 2QJHA 1DV7A 3C6CA 1CW2A 1I2QA 3UPWA 3W73A 1AL7A 1SZFA 1TJRA 4NU7A 3PBUA 4DEFA 4CCCA 1VS1A 3EX1A 3RFAA 1ML1A 3T40A 3F4NA 3CB8A 3GKAA 4X2RA 1ADOA 3WK2A 2EGZA 4BR1A 2V8ZA 3EWYA 2WNNA 3G1VA 2ZRUA 1KW1A 2DZWA 4NNCA 3SGZA 1YTDA 4ADTA 1NVMA 4GNJA 3TUUA 3BGGA 2P1FA 4YMZA 3OIXA 1FBAA 1BWLA 2QCLA 2VFDA 1W56A 1JRCA 3O63A 1OX4A 3QPZA 1SR9A 1AW1A 1VPXA 5AHNA 1HFBA 2DP3A 1GVOA 3MO7A 4O1BA 1LRNA 3NVTA 2QAFA 2PCQA 1SO3A 3G8RA 4UR8A 2YYTA 3UYCA 3ZFHA 2LLEA 4LS1A 3U8GA 5ABTA 4Q32A 2RDWA 2TYSA 3BARA 1OF8A 4JN6A 2OJPA 4WY0F 2Y7DA 4BI7A 2ZZ5A 4O15A 2PRHA 5HR7A 5G5IA 4MLRA 3W74A 5C2XA 1OF6A 3AJXA 1TQXA 1EP3A 1G4PA 2Y6ZA 4N6EA 4OWGA 3TU9A 4RZ5A 2CU0A 5D2TA 3PG8A 4RK8A 5LSMA 1UUMA 1YPIA 5LGXA 3W7JA 1X1ZA 5EKYA 1FDYA 2A2IA 3SY5A 1KBIA 2DZPA 4LVFA 1K8ZA 5G4EA 1OFPA 5HQEA 3TE9A 3STCA 1TTQA 3KVLA 3UWYA 2G96A 4LC6A 4CNNA 1J2WA 4QSHA 4NZJA 1YXDA 2OZ0A 3HIJA 1AK5A 3L68A 4IOTA 1MEHA 3SI9A 3ZWTA 3GB6A 4M6PA 1PHQA 3TX9A 4DBEA 3MP3A 3I7SA 1JQVA 4DO4A 3NNTA 3TC7A 4R7JA 1NSJA 2X2GA 4HN4A 1TJPA 3HMJG 2GVLA 5E1QA 3IRDA 3GAYA 4NZFA 1DQXA 2YDAA 5D2VA 1I2NA 4Y8FA 2VFIA 1K7FA 3FOKA 1FWRA 2AGKA 5CZJA 2PE4A 3MP5A 4FB7A 2BTMA 3I65A 5D38A 3W75A 3A5FA 4M19A 1I2RA 4MJZA 2OCZA 1TPWA 5CPOA 5AN7A 4JYEA 2C0AA 5AHEA 1Z48A 1W5OA 5FEWA 4LT9A 4RKAA 1WOBA 2HTMA 3QH2A 4ZMGA 5DCEA 1FXPA 4HSOA 1PHWA 1KFJA 3G0UA 4XTIA 4AXKA 1TCDA 2Q3OA 2F84A 3STFA 2EAWA 1R30A 3DU0A 3Q37A 2E68A 2WO5A 3P8IA 4E2BA 3MHGA 2Z6JA 3OG3A 4JDYA 4KFNA 2NWSA 3FYOA 2YW3A 5E93A 5KZMA 3MWAA 5D02A 2QR6A 3FYPA 3F03K 1U5JA 1TB3A 4JIPA 1OYAA 2VXNA 3L2IA 2CZ5A 1ICSA 2RDUA 3NQ2A 1ZAIA 4OGZA 3TSMA 2ZZ4A 1TTJA 2C16A 3QEZA 4UFJA 5F2GA 1OFEA 3TMQA 2FPVA 4DO6A 2ZZ1A 2VFFA 2ZRWA 3L5LA 3NAVA 3W2NA 1A53A 3OVPA 1OFQA 3C56A 3W7CA 3FFSA 5CGQA 1R2TA 5KINA 3VKJA 3TFXA 1FCVA 1Q6OA 2I14A 2ZCGA 1EUAA 4ZZ9A 5DN1A 2XN0A 5D09A 3G0SA 1VHNA 5AYZA 4XKYB 5HUPA 1BEUA 2YSWA 1RPXA 1YPFA 3LERA 3B04A 2Y85A 3DKJA 3W7LA 3B03A 4HHPA 3NM1A 3BW3A 4UIOA 3G3DA 2VOMA 1TTIA 2C6QA 1TPVA 1W8SA 3BLEA 2Y89A 2O7QA 4MZYA 1HL2A 1UBSA 3TXZA 4QNEA 1H51A 1A5SA 4HPJA 1AL8A 3M43A 4JTGA 2H8XA 5KMYA 1JUKA 2QCHA 5I3FA 3I6RA 5K2ZA 2WQPA 3W7GA 3VNDA 3LOTA 3C2FA 3DFNA 2BLEA 2YFNA 2Y88A 1O60A 2QJGA 1KLYA 3UD6A 2J9ZA 2W0UA 1JRBA 3QMSA 4JY9A 4LW7A 4XWUA 5EPDA 2C3ZA 2ZRVA 2ABAA 1FCQA 4UTMA 3WJZA 4H6KA 3CLMA 2R91A 1YDOA 1B3OA 3NGJA 4GUHA 3LRLA 2FDSA 3W71A 4O12A 1VJIA 4MY1A 4AEOA 1PV8A 1XCFA 2WSYA 2A7NA 1ME9A 1IIHA 1JCMP 3E12A 1KFEA 2PRLA 3DHFA 3GXTA 1XI3A 2E5BA 3W84A 5AB3A 2AAMA 3N2MA 5HWNA 1VLWA 4FNRA 5AHLA 2ISWA 3UNDA 4HPXA 6ALDA 4PTNA 1TMHA 2V5BA 4GXMA 3R2GA 3NQVA 2B7QA 2C18A 1GWJA 3NQ7A 4KWWA 4JTEA 4Q33A 3L5AA 3MI6A 1EB3A 3HF3A 3VE9A 1XKYA 4UUIA 4YXGA 3NDOA 5D37A 4O19A 3NQCA 1W3NA 3M6YA 3CM4A 3DI0A 1B9BA 5G2WA 3IGSA 1ONRA 5L6UA 4OV9A 5BW6A 4EF9A 2BX7A 1BKSA 2Y7GA 4RXFA 4K8HA 1SUXA 1TQJA 1H7PA 2BZNA 1OFOA 1JULA 3TCEA 3UWQA 5E0KA 4LOCA 3BG3A 3OHIA 3P7YA 5CPMA 3CT7A 2JKPA 1WBJA 3T55A 3UY7A 3C0JA 3EKZA 2WPBA 5HMSA 1IF2A 3GIYA 4MFEA 2BSLA 3Q58A 1NF7A 1BWKA 2V5LA 2ATMA 4ORIA 4LY8A 2ZQ0A 3ABRA 2ZYFA 2DZTA 3QPYA 4UNLA 2F7FA 1I4NA 3TIMA 3B8DA 4NJGA 5FF0A 4NNBA 1M6JA 5LNVA 1KTCA 5BRBA 2Z1BA 4U4MA 2QAPA 1KTNA 3ATYA 4XUGA 4RCXA 3UXDA 3W2KA 5KITA 3IVUA 3GYEA 3W7EA 1WQ5A 3HJZA 3BLIA 3W86A 4JYFA 3P5ZA 2DJXA 1FDJA 1Z44A 3N3MA 2EF9A 4NJKA 2QCFA 3G18A 2QUUA 5TBOA 1VYSX 5K4XA 3EXTA 3W7OA 1QNVA 2H6RA 5EBUA 3W7KA 3T4CA 8TIMA 1VR6A 5HULA 3CQ0A 4ADUA 4MY8A 2UV8G 5KZDA 1G6CA 3E9AA 5DCBA 2Q3RA 4K6AA 1CI1A 1KFCA 5HJLA 3TJXA 3M1ZA 3DXIA 4PEKA 2ZZ3A 4YLWA 3LHWA 1W3TA 1TPB1 4DPPA 4X3ZA 3ZR4A 2A1YA 3A9IA 3HO8A 5FEXA 3LCLA 4UC5A 2RHGA 2Y7EA 4O13A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4ALDA

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