4AMCA

Crystal structure of lactobacillus reuteri 121 n-terminally truncated glucansucrase gtfa
Total Genus 272
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
272
sequence length
1019
structure length
1019
Chain Sequence
QYYIDPTTGQPRKNFLLQSGNNWIYFDSDTGVGTNALELQFAKGTVSSNEQYRNGNAAYSYDDKSIENVNGYLTADTWYRPKQILKDGTTWTDSKETDMRPILMVWWPNTLTQAYYLNYMKQHGNLLPSALPFFNADADPAELNHYSEIVQQNIEKRISETGNTDWLRTLMHDFVTNNPMWNKDSENVNFSGIQFQGGFLKYENSDLTPYANSDYRLLGRMPINIKDQTYRGQEFLLANDIDNSNPVVQAEQLNWLYYLLNFGTITANNDQANFDSVRVDAPDNIDADLMNIAQDYFNAAYGMDSDAVSNKHINILEDWNHADPEYFNKIGNPQLTMDDTIKNSLNHGLSDATNRWGLDAIVHQSLADRENNSTENVVIPNYSFVRAHDNNSQDQIQNAIRDVTGKDYHTFTFEDEQKGIDAYIQDQNSTVKKYNLYNIPASYAILLTNKDTIPRVYYGDLYTDGGQYMEHQTRYYDTLTNLLKSRVKYVAGGQSMQTMSVGGNNNILTSVRYGKGAMTATDTGTDETRTQGIGVVVSNTPNLKLGANDKVVLHMGAAHKNQQYRAAVLTTTDGVINYTSDQGAPVAMTDENGDLYLSSHNLVVNGKEEADTAVQGYANPDVSGYLAVWVPVGASDNQDARTAPSTEKNSGNSAYRTNAAFDSNVIFEAFSNFVYTPTKESERANVRIAQNADFFASLGFTSFEMAPQYNSSKDRTFLDSTIDNGYAFTDRYDLGMSEPNKYGTDEDLRNAIQALHKAGLQVMADWVPDQIYNLPGKEVATVTRVDDRGNVWKDAIINNNLYVVNTIGGGEYQKKYGGAFLDKLQKLYPEIFTKKQVSTGVAIDPSQKITEWSAKYFNGTNILHRGSGYVLKADGGQYYNLGTTTKQFLPIQLTGEKKQGNEGFVKGNDGNYYFYDLAGNMVKNTFIEDSVGNWYFFDQDGKMVENKHFVDVDSYGEKGTYFFLKNGVSFRGGLVQTDNGTYYFDNYGKMVRNQTINAGAMIYTLDENGKLIKASYNSD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords GLUCANSUCRASE
publication title Structure of the Alpha-1,6/Alpha-1,4-Specific Glucansucrase Gtfa from Lactobacillus Reuteri 121
pubmed doi rcsb
source organism Lactobacillus reuteri
total genus 272
structure length 1019
sequence length 1019
ec nomenclature ec 2.4.1.5: Dextransucrase.
pdb deposition date 2012-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01473 CW_binding_1 Putative cell wall binding repeat
A PF02324 Glyco_hydro_70 Glycosyl hydrolase family 70
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.20 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. Aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit, C-terminal domain 4amcA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4amcA03
3.20.20.470 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glucansucrase 4amcA04
3GXMA 3SCUA 2VR5A 4OKDA 2DIEA 4CU6A 1UR1A 5I78A 2W91A 3N12A 5A6BA 5M03A 3E1F1 4F8XA 2J79A 3EMCA 3FNDA 4DUVA 2X0HA 3WF0A 5JIPA 1QVBA 4FYYB 3AXHA 5E70A 3ZMRA 4P8WA 1R8LA 4J7RA 3PZOA 4P7LA 3T2OA 4ACYA 5GNYA 3TTOA 4A3HA 4KGLA 1UA7A 1VBUA 1SMAA 1W9DM 3RJYA 2XGBA 3VGDA 1G9HA 1CNVA 4GINA 4AIOA 3AQUA 4FYWB 1GPFA 2VO5A 1XSJA 3AIVA 3DHUA 2G4FA 5A1AA 1ZJBA 2QMKA 2Y5EA 4X0VA 3EDFA 4UQ9A 2YBUA 4AIEA 3MKKA 2PWHA 2WWDA 4TTUA 4AWEA 1UH4A 1JNEA 3BMWA 3WH6A 4U3CA 4D6CA 2RGMA 2CETA 4MDOA 1WNOA 5AT1B 1ISVA 2VQUA 4MPKA 4AZBA 2WBGA 1VJZA 1V3MA 1EQCA 4YN5A 1EOKA 4PMQA 3ZOAA 1JI2A 3WQ4A 2VRKA 3CHEA 1PPIA 3SEPA 4UFKA 3WDRA 1ZB5A 4GI6A 1VB9A 3ECQA 4AZ7A 3WF3A 4TVCA 3BLKA 1ITXA 1C7TA 1D7FA 3PHAA 3DC0A 3EBVA 4M24A 3FAXA 4MB5A 1VFFA 4GZJA 1LL7A 1FH8A 4BS0A 1KBBA 3OLGA 2BS9A 3K8KA 3MANA 3CUFA 4CUCA 4MADA 3BCDA 2XFRA 2IPOB 2EPNA 1HF6A 4WKHA 1JZ2A 2O9PA 1RAFB 1V0KA 1V6XA 2XVLA 3VDCA 3SCQA 4CD6A 3VMNA 4PTWA 2NT0A 3ZSSA 3NCOA 5I77A 5BCAA 1EZZB 3FAWA 4PRWA 1R0CB 4NRRA 3OB8A 1E6PA 3HZ3A 2VR4A 2WVVA 3UERA 3GBEA 4J3UA 2V5DA 2UWFA 1E73M 5KEZA 1C92A 3WQ8A 2QV4A 3GM8A 3F5JA 2EPKX 5A6JA 2DIJA 5ECUA 2DSZA 1J0ZA 1S46A 3ARPA 3GH4A 3BC9A 2ZIDA 4UTFA 8A3HA 1B90A 2YA2A 2YL8A 5AC4A 3ZSTA 2ZUTA 2XPKA 4MNMA 1QI4A 1V08A 1NM9A 1V0MA 3AIRA 4FYVB 1XSKA 5CSYA 1OIFA 4CVWA 1H3GA 2YA1A 1BLIA 1E6XM 1IV8A 2CNCA 2WMIA 3VILA 4DUXA 2WZEA 5IHRA 1WE5A 3CZ8A 1UD8A 1HP4A 2WWCA 3OLIA 3WEMA 2CBUA 2VZSA 3DHPA 4W7WA 4PSPA 4D6GA 4ML4A 4J3WA 1TUGB 1W32A 3KL5A 2CEQA 5I79A 2WCAA 2D0FA 3N13A 4AIUA 1KBKA 2ZX7A 1GQJA 1KQYA 3A4WA 1QOXA 1B3YA 2ZX8A 4UQDA 4JKMA 5EMYA 3AI0A 4PYSA 1C8QA 4LYQA 3CHDA 4JHZA 2FZCB 3WEOA 1LQ0A 2QPUA 1U30A 2D20A 3AS1A 2XSAA 4JFWA 2OSYA 5A6SA 3A47A 3G6MA 4DUWA 2UY5A 1WDPA 1KR1A 4JCLA 2XFFA 5E9AA 1TFVA 2WVVB 2EBNA 4RE3A 2C0HA 1WDRA 3KE0A 4U33A 2CXGA 1MYRA 3DYOA 4WSJA 3SCNA 5FIPA 4GIAA 4OBSA 4P7QA 2J8FA 1K9TA 3IJ9A 5HOSA 3RIKA 1E70M 3KWXA 1DHKA 6AT1B 5I3DA 3PZIA 1MFUA 4M81A 2GJPA 3BAWA 1JZ8A 3VINA 2D23A 1PZ3A 1W9BM 2WLZA 4F79A 2J7DA 3VTRA 2GUYA 4GZEA 3VVGA 3EMZA 1DWGM 2O9RA 4CGTA 2X09A 4WIWA 3BAXA 1EDQA 2VRQA 1BYBA 3NSMA 4QLJA 3SCVA 1HL9A 1WZKA 1H49A 1I1XA 5BRQA 1UWTA 5DT5A 3W0KA 4UOQA 3TTSA 1QNOA 9CGTA 5A6AA 1PEZA 8AT1B 1DWJM 3QGVA 3FN9A 1CDGA 2G41A 5EB8A 1V3LA 5TD4A 3VM7A 3ZO9A 1W1PA 2FHFA 3F5KA 1WCGA 3GTNA 2WMKA 1VF8A 1UZ4A 2VZOA 2FGLA 2J4GA 2Y4SA 4EANA 3BAJA 3QR3A 1TR1A 3WNMA 1SFSA 1C7SA 1PX8A 1HJXA 4D71A 3TP4A 3WH7A 1BYDA 1HJWA 2TAAA 2QMJA 2X0YA 1R0BG 2D24A 3FHAA 7AT1B 1G01A 1CGYA 6CGTA 1JFXA 2J74A 1TMQA 3T0AA 2GDVA 4FF5A 2PWEA 1KXHA 2YL9A 2H3EB 1J18A 4Z2IA 2EXOA 2VQTA 1CGXA 2YL5A 3M46A 4NZCA 4JFUA 3PZUA 4BQ2A 1C3FA 5A2BA 1OGBA 4WKAA 1RD6A 4QP0A 4KGXB 1KXTA 4XV0A 2WM0A 4KGJA 1UWRA 1M03A 2C7FA 1R7AA 1J01A 1E1FA 5M17A 4B3KA 4DWSB 1BSIA 4E2FB 3VGHA 3WF4A 3RDKA 1HL8A 5HDRA 3WUEA 3WH8A 1KCKA 3U7BA 3K8MA 1SMDA 1ZL1A 4DM1A 1MVYA 3PZ9A 2NW0A 2XWEA 2E40A 1G5AA 4FLRA 4C7FA 1JD9A 1AVAA 2YIHA 2ZUSA 1XYFA 2WW5A 4E4PA 1KWGA 1RABB 4QDMA 4U5IA 1PJ9A 4GO9A 4IUGA 3AYRA 3CHFA 2G3IA 1WDSA 1B2YA 1H0GA 3SIMA 3CZLA 2W92A 4ZE4A 2Y2WA 3WD4A 1JZ6A 3W28A 4P8VA 3AIUA 1J0JA 1HKMA 1QNQA 4Z2KA 5EFFA 1J0HA 1JAEA 4HMEA 3UR8A 3O2LA 3AIEA 2DSVA 1Q4NX 3W38A 2GDUA 1UR4A 4FMVA 3GH7A 4NI3A 5C8BB 1UD3A 3O9NA 2CCRA 3VMPA 3AXXA 4W5UA 5E6ZA 1G94A 5GNZA 3VIPA 4JAWA 1FP8A 3AROA 2B31A 2WPGA 4AZIA 1MQRA 1EO7A 2YDQA 2WMFA 4U3AA 2BNJA 1XH1A 4UQCA 3VO0A 4HP5A 4TTGA 5AYBA 5DEZA 3N04A 1DTUA 2ZXDA 1MW1A 1DWFM 4B9ZA 2G3JA 5I0DA 1PBGA 3WNLA 1AMYA 1UKOA 3RMEA 1BQCA 3L4XA 1OBAA 1CGUA 1FFQA 1U2YA 2ZICA 3BAIA 4U2YA 2XFYA 4YPJA 1XRVA 1K6AA 4W5ZA 5E0FA 1E40A 1OM0A 1LL6A 2EEXA 3AS3A 3BXWA 4WJXA 3L2LA 2QGFB 4C7GA 2GVYA 2JE8A 4OOUA 1DWAM 4MDPA 1W1YA 3DECA 2ZUUA 1NWUA 4IM4A 4AZCB 2WLYA 3PN8A 4AT1B 3APGA 5A2AA 1UKQA 5CXPA 2YLLA 1RP9A 4LGXA 3L2MA 1V3JA 4CN6A 1FP9A 3W6MA 4DWSD 3VGGA 3GDBA 4URIA 2WZIA 1J0KA 1ZU8A 3KEHA 3SCWA 3ZJ6A 4RE4A 4UOZA 4ZXLA 1W3HA 3KL3A 1JXKA 4LYPA 3VDBA 3QOMA 4F9JA 2AAAA 3WDPP 1RAHB 3LPGA 5D9OA 1HKKA 1E6QM 2E0PA 2E9LA 3UEQA 3GXFA 4MTVA 2Z1KA 3NDZA 2PC8A 3U57A 2JIEA 5BROA 3ZM8A 1EA9C 5LA1A 4HA4A 4ZFMA 2BY0A 2CIPA 3ARXA 3L4WA 1UG6A 1G0CA 3GXDA 1JXJA 4UQEA 3VIMA 5FL1A 5HPCA 3VMOA 1XGZA 1B30A 2VCAA 4MJ4A 1BVZA 4AY1A 1UKTA 3GNPA 5BYWA 2PB1A 3IJ7A 3ALGA 4D6EA 1E5JA 2VRJA 5LYRA 3WQ6A 5BXRA 4J3SA 2W67A 3CUIA 1E15A 1VIWA 4AZGA 3VD3A 1J11A 3SURA 2Z1SA 1GOQA 1NBEB 1PIGA 1HP5A 3GZAA 3K8LA 1UZ1A 5JIWA 3WD2A 3VNZA 1TTHB 1B3XA 5A8OA 3QHOA 1E56A 2J25A 1GCYA 1Q95G 4XZBA 4CCEA 3ZJ7A 2XGIA 3CZGA 4KRUA 4XB3A 1G1YA 2XHYA 1OB0A 1E6RA 1JYXA 1LL4A 3AHVA 3N17A 4GI8A 3WDHA 1UKSA 4JFVA 4KRTA 1ISWA 4CKQA 1B31A 2A3AA 4UCFA 3AS2A 4W89A 4FYXB 3IANA 1JFHA 1JZ4A 1BHGA 4WK9A 3RM9A 1A47A 1VFMA 2WKLA 4JL2A 3ZR6A 5EBAA 1PX4A 3B8SA 4JHOA 1HXJA 1QNRA 3TTQA 1V02A 5CPQA 1B1YA 4AEFA 1WO2A 3KL0A 4M8UA 4BQ4A 4EAMA 2A3EA 3VGFA 2ZUWA 2DH2A 1GOKA 3MO4A 3B9EA 4H8VA 1US2A 4CN1A 3WENA 4WLCA 1GOMA 3AT1B 1JD7A 2WHLA 3AMLA 3WSUA 4ATWA 1K9FA 1UWUA 4HZ6A 2CPUA 5C70A 3WQ5A 2WB5A 1J9YA 4B3LA 3CZJA 1U33A 3WUGA 4E8CA 1V6WA 4W8BA 5C71A 4AISA 1EDTA 3MPUB 3VNYA 2VX6A 3T0BA 5I6SA 4UFHA 2A0FB 2PWGA 4OUEA 3VIOA 2ZXAA 2VURA 3BH4A 4OBRA 2DH3A 4AD5A 2E9MA 4GKLA 4J3TA 4AEEA 2G3MA 1XV8A 1IZKA 3MU7A 4JIEA 1OWQA 1QHZA 3NSXA 4R5EA 3CUGA 1BFNA 3AIBA 3THDA 3POCA 5CZKA 1IT0A 2DT1A 2XJ7A 1NOUA 1OIMA 2A3HA 2WCGA 1LF1A 2PF0A 5M5DA 3OBAA 2E8YA 2VX7A 2XIIA 3FHQA 4PCSA 1TVNA 3T09A 3VD9A 5M3WA 4TX8A 1VENA 1OD8A 4OJYA 4PBGA 4J3VA 3VIFA 5JBFA 1D3CA 3CHCA 4BF7A 3ZJ8A 4AW7A 2XIBA 1Z32X 2JFEX 1E3XA 2BFGA 3T2PA 1H09A 2WVUA 2ZX6A 2BXZA 3S2CA 2DT3A 4AD3A 4M56A 2J7CA 3ALFA 2YDSA 4CVUA 4KWUA 1VAHA 4IPNB 2VZVA 1TU0B 3IJ8A 3HJEA 1OGGA 3BAKA 1ESWA 1EGZA 1V3HA 2CBJA 4KMQA 1JYNA 1CGTA 4P8XA 1H4PA 2EPMX 1NP0A 3QHNA 1GOIA 4IISA 1CYGA 1JF5A 4W8AA 4ZE5A 3VDHA 3AZSA 1UWSA 4X0NA 4AZ5A 1DWHM 1W2VA 1ZA1B 3B9AA 3U5UA 1H2JA 2EPOA 4U31A 5I23A 3VU2A 2WVTA 2ZOXA 3M6DA 5JUVA 3SUWA 3MUZ1 1TG7A 3WDQA 3WY1A 1E0XA 1W9UA 3PTQA 3GNRA 3NJ3A 4RL3A 5DF0A 1FHDA 5D9NA 4F66A 5FCZA 1V6YA 2J7EA 3EDDA 2A3CA 2X2YA 3FW6A 4W86A 5GNXA 1JI1A 2HSEB 1JAKA 4H41A 1ZA2B 3VD4A 2DQXA 3WD1A 2HVMA 5GQBA 1SR0A 4UOJA 2GK1A 1B9ZA 5A95A 2JEPA 1H1NA 4H8UA 2J7FA 1ZJAA 3GYCA 1UH3A 2X8RA 5A6BD 5FOOA 1E3ZA 2ZUNA 3N18A 3QHMA 3NDYA 3F5LA 3W27A 3CZEA 1KCLA 3UESA 2V3GA 4D6HA 5CJ5A 1RAIB 4JFTA 1UQYA 4ACZA 1RH9A 2WMIB 3NUKA 1AT1B 1CXKA 4ATDA 1E72M 2CITA 1E55A 1R85A 2BHYA 2W62A 2YJQA 3AOFA 3W53A 4AD1A 5HPOA 4MNJA 1PX3A 3CO4A 3GBDA 2D0HA 3AHZA 1CTNA 1FHLA 4XUYA 3L4ZA 4AD2A 1UD2A 1E6NA 1NOWA 1E4NA 3K4AA 7TAAA 1LWHA 4QLLA 1UUQA 3CUJA 1XD0A 3UG3A 4CU8A 3VD7A 4RE2A 5A69A 3ARYA 5A94A 2V38A 2VT0A 5IDIA 2FZGB 5BRPA 2JF7A 1N82A 1WZMA 5A3HA 2CESA 2V3FA 3MUY1 3ZIZA 4Q7NA 4CD8A 4BA0A 2QLYA 1W2PA 3WDIA 2C8NA 2DEPA 2GJXA 2O92A 1VEPA 5I24A 4UQAA 1BYAA 4IPLA 3QOKA 1V0NA 3VDAA 2OWXA 1E4MM 1E4IA 3SCSA 5ABGA 1UD6A 1MW3A 5ABEA 1C93A 3AISA 3WDJA 3OLDA 1HNYA 3WELA 2FZKB 3RPMA 3F4VA 1ACMB 1W91A 2WSKA 4E8DA 4CCDA 2OYLA 4HMDA 4J27A 1JGIA 4ZXOA 2OLHA 2BXYA 5CSUA 1GHRA 5CLWA 4OZOA 1CGVA 3CTTA 1HVQA 4AD0A 3OIHA 4HU8A 2F61A 1M01A 1UQZA 1XJWB 2PBOA 3UG5A 1GJUA 4TX6A 1CEOA 1O6IA 3ARUA 3NIYA 1JYWA 3WF2A 1HN1A 1MQPA 2JEQA 1MW2A 1CLXA 1ITCA 2IXUA 3FXYA 3PZGA 4ATLA 2W63A 5DMYA 1JNDA 4CD5A 3VM5A 1OD0A 4JCMA 4AYGA 1QPKA 1UA3A 2OSXA 1AQMA 1JZ7A 3THCA 4MNKA 3KLLA 1XH0A 1X6LA 4H7VA 5D9MA 5IHSA 4W88A 5I5RA 1KQZA 4X9YA 1XCXA 2BVYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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