4ANRA

Crystal structure of soluble lytic transglycosylase sltb1 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
300
structure length
297
Chain Sequence
PQVAEFVSEMTRDYGFAGEQLMGLFRDVNRKQSILDAISRPAERVKQWKEYRPIFISDARISRGVDFWNKHAEDLARAEKEYGVPAEIIVSIIGVETFFGRNTGSYRVMDALSTLGFDYPPRADFFRKELREFLLLAREQQVDPLSLTGSYAGAMGLPQFMPSSFRAYAVDFDGDGHINIWSDPTDAIGSVASYFKQHGWVTGEPVVSVAEINDESAESAVTRGVDPTMSLGELRARGWRTLRDDQKVTAMRFVGDKGIEYWVGLPNFYVITRYNRSAMYAMAVYQLAGEIARARGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords SOLUBLE LYTIC TRANSGLYCOSYLASE B
publication title Calcium-Dependent Complex Formation between Pbp2 and Lytic Transglycosylase Sltb1 of Pseudomonas Aeruginosa.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 101
structure length 297
sequence length 300
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.350 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Bacterial muramidase 4anrA01
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4anrA02
1KIPC 5ILFA 1NQIA 4H9CA 5LVKA 5M1YA 4ANRA 1UBZA 4H8YA 4LFXA 5C6LA 3WULA 4TWSA 3ATOA 1HERA 5IDDA 5LA8A 1XEKA 1D0MA 3N9EA 1WQOA 1UC0A 1XGQC 2DQAA 1LJFA 1TBYA 1YANA 2LYOA 4N8ZA 4BAPA 4H90A 4NY5A 1LHMA 3K3TA 1XEJA 3M18B 4WLXA 2A7FA 4ETCA 4OOTA 1GHLA 1T3PA 1CKGA 1LCNA 1E8LA 2MEFA 4LFPA 3AB6A 4DDCA 2YBMA 3ATNA 4RW1A 2BQFA 5AMYA 4DDBA 1GB7A 3B0KA 2DQHY 2YDGA 1UIDA 4LT1A 1FKQA 2BLYA 4WM4A 4UWVA 5F81A 1DZBX 1HFYA 1B5XA 4WLTA 2YVBA 1XGUC 1YROA 3CSQA 1LSPA 1KXYA 1LKSA 4MSTA 3WUNA 1HEOA 1JSFA 1LSCA 2CJLA 5I4YA 1BHZA 3B0IA 1QTKA 3W6FA 5I4WA 1HFXA 1B5VA 5E9RA 1IP2A 132LA 2X0AA 5T3FA 1GE3A 1LZGA 1WVVA 1QQYA 208LA 2ZYPA 1BVXA 1RCMA 3WVYA 4CFOA 1D0KA 3AZ4A 4NGJA 4OWHA 2ZNWY 4UWUA 4AGAA 1HEPA 1C7PA 1H87A 3WXUA 4H9AA 1EQ5A 1YAQA 4RLMA 5FELA 4N1CC 2YBNA 4PRUA 1LJIA 4TSBA 3CT5A 1LYSA 1LHJA 1OUFA 1DI5A 4HV2A 5F9XA 1LZAA 4B4IA 1IY4A 1A4VA 2ZYCA 4H9FA 5LVIA 1J1OY 1LZ1A 5KXNA 1JKAA 2ZNXY 1IR8A 3AYQA 1UACY 4WM1A 5KXWA 5ILCA 1LZYA 1JITA 2CGIA 1DKJA 1GBZA 4QGZA 5KKIA 4WLDA 4L41A 5HMVA 3N9AA 1GE1A 1NMMA 1LMTA 3WW5A 1B5YA 2BAAA 1BWHA 3A3QA 4GCDA 4B4EA 1CJ7A 1UIAA 2MEEA 3CSZA 4NHTA 1LHKA 3A92A 2HUBA 4PHIA 1LZDA 4IJ4A 4NG1A 4HJZA 1QUTA 3AJNA 2FYDA 1JKCA 1GB3A 5APEA 4TSCA 3MGWA 1NBZC 3T36A 2BLXA 5LAGA 1QSWA 3WW6A 5HLLA 3W6CA 1DI3A 2DQJY 1AT6A 2YBLA 3B0OA 1LMOA 2D4KA 2FBDA 4GLVA 4WO6A 3RZ4A 3TMVA 1VDSA 1YAPA 2HECA 3LN2A 4Z46A 4HTNA 2BQBA 5LINA 1VDQA 4U3XB 1LZ9A 1UIEA 5HMJA 1B7RA 3BKVA 4WL6A 1LZTA 1LZRA 5KXXA 1IY3A 3J6KA 5B59A 1LHHA 1BB3A 2Z18A 1B7LA 4NEBA 4WL7A 4KT3A 4P2EA 2W1LA 1LHIA 3TMUA 3TXIA 4NWHA 1JISA 2NWDX 1IOQA 4XJGA 1LSBA 4ET8A 1CJ6A 1LJGA 3FI7A 4OOOA 1C43A 1DXJA 1IC4Y 1OUDA 1B0DA 1EL1A 2DQDY 3WUAA 1RE2A 1LSDA 1LZ8A 1YILA 2MEAA 3WU9A 4ZEEA 1FLWA 1VATA 2ZILA 1LOZA 3D3DA 3IJUA 4GCFA 3TXFA 1OUEA 1GFVA 4BAFA 1LYZA 5JENB 1HHLA 1FLUA 1GF4A 4BS7A 1LMAA 4GCCA 4NGZA 2W1MA 135LA 5LYZA 1HELA 2XJWA 1GE2A 4N1EI 1HSWA 1V7TA 3WH1A 1WQPA 2EQLA 1G7IC 5B06A 1JTPL 1JHLA 3M3UA 1IEEA 1HEWA 1LKRA 1GFUA 4PPOA 1D6QA 2AUBA 1IP4A 2VB1A 4J7VA 5IELA 3RNXA 2BQMA 1LHLA 4OW1A 5APFA 4LYMA 4NHQA 4WM6A 1YKXX 2EKSC 2BQJA 1LZ4A 1IR9A 1IX0A 1GEVA 1YKYX 4E3UA 1OUCA 4WM2A 4Z98A 1NBYC 4ZIXA 5D5FA 5C6JA 2RSCA 1CNSA 1NKHA 3GXKA 4J1AA 1YQVY 4WM3A 3A96A 1F6SA 1JEFA 2YBJA 5APCA 1IWTA 153LA 1BWIA 3KAMA 4HP0A 4GN3A 3W6EA 1JTTL 3EXDA 4Z41A 3A3RX 3A93A 1IR7A 3N9CA 4UWNA 4XYYA 4CGEA 4N0JA 4MCKA 2G4QA 5A3ZA 5KXKA 4WG1A 1IC7Y 1B5WA 2Z2EA 5B1FA 1QTEA 3E3DA 2DQFC 2BQEA 4ETEA 5HNCA 1UA6Y 4ETDA 3QNGA 3LZTA 1GFTA 4H9BA 1PZYA 1BB5A 3P64A 4NHPA 4NSHA 1HC0A 1LZBA 4H8ZA 1BB6A 4NIJA 4NSJA 3WMKA 4O34A 3WVXA 3ULRA 4EOFA 1LPIA 4IASA 1DQJC 5J7CA 1JJ0A 1IOTA 5LXWA 4A7DA 4DD0A 2D6BA 1YAMA 1O23A 2A7DA 4LYZA 7LYZA 5LYTA 1OP9B 4YF2A 4DT3A 1IP5A 1LSMA 1LMCA 1XEIA 1HNLA 2HU3A 3LYMA 6LYTA 2EIZC 5L3IA 4QY9A 1CKHA 1XFPL 1YIKA 1I1ZA 3GXRA 5KY1A 4EMNA 5FSTA 1AT5A 1YKZX 4G49A 1GB8A 3CSRA 4XENA 1HMKA 5D5CA 5KXSA 5KXOA 1TEWA 1BGIA 1JSEA 1HFZA 1ZVHL 4FJRA 1IWXA 1GBYA 2HEBA 3AGHA 4NFVA 1LSZA 1GFAA 5LVJA 1QIOA 1WVUA 1B7SA 4N5RA 3WPJA 3AGIA 1UICA 4AXTA 1GWDA 4J0LA 2F4GA 1NDGC 2DQEY 3A95A 4PRQA 1B9OA 2IHLA 1GFKA 1KXXA 3A6CY 5HNLA 2Z37A 1LJJA 1IO5A 1LZ5A 4NGKA 5B07A 4D9ZA 4R6CA 1XGPC 1XGRC 1RI8B 4XJFA 2FBBA 3A67Y 3T6UA 5FCPA 2F4AA 4G4CA 1LYOA 4TX7A 1LJEA 2MEGA 1IWUA 4HTQA 4XADA 1GE0A 2LYZA 4LYCA 3TXJA 3P4ZA 1OUAA 1IP3A 133LA 1P2CC 2BPUA 3AW7A 5FHWA 2BQKA 1DI4A 2HEDA 3A8ZA 2F2NA 4ZFPA 3CT1A 2ZQ4A 3OK0A 1VFBC 2EPEA 3FE0A 9LYZA 3TXGA 4CHXA 1YL1X 4LGKA 1HENA 2D91A 5I54A 3G3AB 1BVKC 1JPOA 1LJHA 1XGTC 207LA 1GBWA 1RJCB 3RW8A 1OUGA 1IIZA 1NDMC 1SLYA 1OUIA 1UIGA 5KXLA 4OWBA 5A3EA 5KJ9A 3P65A 4XJIA 2H9KA 4G4HA 1FLQA 2BQHA 2FYCA 2BQOA 4XJDA 1AZFA 2MECA 1VAUA 2YSSC 5KKJA 1WQRA 1A2YC 1GBXA 1HF4A 1NHEA 1LSEA 1LMQA 1GEZA 1SQ2L 1WTNA 4OWCA 1IVMA 5K7OA 3WPLA 1EQEA 1GB0A 1G7HC 1GXV2 2Z2FA 1I20A 4OWAA 4XJBA 3EBAB 3AGGG 4NGVA 4C3WA 1GB5A 1GDXA 1FDLY 1DPWA 1I56A 1IORA 1F6RA 5FDJA 1G7MC 3TXBA 1B7QA 3WYHA 1IP1A 1TDYA 4B0DA 1MLCE 3TXEA 134LA 1T6VL 1YAOA 4KPMA 1KIQC 1W6ZA 2Z39A 1GDWA 3CQLA 2ZIJA 1GF7A 1HEQA 1CJ9A 1MELL 5LVGA 1ZVYB 1UCOA 1TCYA 2D4IA 5F9UA 2D4JA 1J1XY 5L9JA 2BQIA 3HFMY 4H9HA 1JKDA 1GF5A 2CDSA 4H94A 3HBDA 3W6DA 5KXTA 1QDTA 1REZA 1V7SA 2I26L 2LHMA 4ML7A 4ET9A 4LT3A 5I4XA 2W1XA 4ETBA 4OWEA 1FKVA 1LJ3A 1IOSA 2Q0MX 1JTOL 1OQMA 1G7JC 4LT2A 3HBHA 3A90A 4NSGA 4NHIA 2BQCA 5B1GA 2Z38A 2LYMA 1GF6A 4I8SA 1CJ8A 3W3EA 4WM5A 4DD7A 2ZWBA 3B6LA 1XSFA 1B5UA 4LYOA 1IP6A 1B7OA 1BQLY 1NWGA 1VDTA 4Z3MA 4DD2A 2MEHA 5I5QA 1JIYA 3TXHA 5DLAA 4N9RA 1INUA 2C8PA 4WOAA 4QEQA 1LMPA 4MR1A 3IWRA 4NWEA 4NGOA 1JKBA 4WG7A 2HU1A 4M4OA 1JWRA 1REMA 2XBRA 4J1BA 4WO9A 1D0LA 1AKIA 1IC5Y 1LSFA 3LYTA 1QUSA 4XJHA 3J4GA 2XTHA 1JUGA 1KIRC 1GB2A 2N5ZA 2GV0A 4HJVA 4W94A 4WLYA 4YENA 1LZNA 4DD1A 1LTMA 2DKVA 3RT5X 1GBSA 4G4BA 1GXXA 3CT0A 1LSAA 1LZSA 4TUNA 1GFRA 3LYOA 1TAYA 1IP7A 4B4JA 4DC4A 2MEIA 4ETAA 5KXRA 4NG8A 1LSGA 3ZEKA 3A34A 1GFEA 3WL2A 1C10A 1WQNA 3D9AC 3BKHA 1CKFA 4H9EA 1IWZA 2LZ2A 1IOCA 5EBHA 5F16A 2H5ZA 4PGJB 2HEEA 3QE8A 3RU5A 4B49A 1ALCA 4W96A 4NSIA 5I53A 1DKKA 1UIBA 1GPQC 1DPXA 4CFPA 3P68A 3W6AA 1GB9A 4HTKA 2F30A 4G9SA 1LJNA 1HSXA 2B5ZA 2BQNA 4KL7A 4RLNA 1F10A 5B05A 4HPEA 6LYZA 3TMWA 1H6MA 3ZVQB 5HQ1A 2H9JA 4NGYA 4R0FA 2HTXA 1G7LC 3TMXA 4NGWA 4II8A 2G4NA 1LYYA 2LZTA 3HBEX 4H93A 1VDPA 3WU7A 5DM9A 1PS5A 5E4PA 3SP3A 1GD6A 1LZ6A 1N4FA 4LT0A 4RDSA 3EO5A 1OUBA 4H9IA 4IATA 4LZTA 3A91A 3WPKA 1IWYA 2PC2A 194LA 1GAZA 2WARA 4NHSA 1LAAA 4CJ2A 2Y8PA 4PJ2C 4XN6A 1GE4A 2C8OA 2DQIY 3A94A 1W08A 5LAFA 1LSNA 2YBIA 1F0WA 1IWWA 5LIOA 1REYA 4TTDA 1LZEA 3QY4A 3A6BY 5APDA 1KXWA 1FN5A 1GAYA 1GF8A 5KXPA 1UUZC 1D9UA 2YBHA 1D6PA 3CB7A 1QDRA 5C6IA 1LSYA 2BQDA 4RW2A 2BQAA 1CKDA 2Z12A 3P66A 5KXMA 1C46A 1NF5A 4H1PA 193LA 1Z55A 4DWXA 1GF3A 4B1AA 2DQCY 4GCBA 3AZ5A 1J1PY 4DD9A 1FBIX 4C5FA 3TXDA 4YOPA 2ZQ3A 1JJ3A 3G3BB 4M6DA 1ZMYL 1C45A 1B7MA 3EMSA 3VWOA 1LJKA 3F6ZA 4QDNA 1LZCA 3OJPA 1EQ4A 3ZVQA 3AW6A 3WXTA 1CKCA 2MEBA 4FDYA 1GF9A 4HJYA 2HEFA 1GF0A 5F14A 5FEKA 2BQGA 4YM8A 5II3A 4DD3A 2MEDA 1OUJA 4H8XA 5KXYA 5LYMA 1GB6A 2ZIKA 5DL9A 1FLYA 5L3HA 4LYTA 8LYZA 4GN5C 4YEMA 1LJ4A 1B2KA 154LA 2CWIA 4GN4A 2G4PA 4H92A 1BB7A 1BWJA 4GLAA 4HSFA 5IHGA 1REXA 2DBTA 2DQGY 3B72A 4KXIA 1WQMA 1C08C 2XBSA 1UIFA 3LZ2A 1JJ1A 3LHMA 1GFJA 2I25L 1B7NA 3WU8A 5KXZA 5DN4A 1RFPA 4I0CA 1B7PA 1GBOA 1QSAA 3IJVA 4H91A 3WUMA 3TXKA 1HMLA 1WTMA 2I6ZA 1B5ZA 3LYZA 1ZV5L 1LMNA 1AM7A 3AZ7A 4BADA 5LA5A 1BB4A 3AZ6A 2Z19A 1GFGA 2W1YA 4X3BA 4NGIA 1UIHA 3W6BA 1HEMA 4NGLA 4DDAA 1GFHA 2HEAA 2BQLA 5DN5A 4HPIA 1OUHA 1VEDA 1YL0X 4HV1A 4LYBA 4WMGA 4DYGA 1IWVA 1WQQA 4GCEA 4YEOA 5LVHA 2IFFY
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KIPC 5M1YA 2KNVA 1UBZA 3ATOA 2L2DA 5IDDA 1D0MA 4D9ZA 1XGQC 4BAPA 1LJFA 5LMUM 2DI0A 4X64M 3J27B 4NY5A 1L92A 2XZFA 3SC3A 155LA 1GL7A 2QB0B 5EQTA 4OOTA 1T3PA 1E8LA 1E9RA 4G4NA 2CWBA 2EKKA 1NV8A 4ARJA 2YBMA 2BQFA 2DQHY 3FTCA 1OTRA 3DN1A 1FKQA 2BLYA 1L27A 4UWVA 1C6LA 1DZBX 2YVBA 3CSQA 1LKSA 3PNVA 1L39A 1DYGA 3LMMA 1L71A 1SWYA 235LA 244LA 5E9RA 2X0AA 1K3XA 132LA 1GE3A 1BVXA 1RCMA 3GPYA 4OWHA 3FUTA 1H87A 2DAGA 3WXUA 4EJ4A 4LJ5A 3ODUA 2RBQA 1OFHA 4M9XA 4EIWA 1Q3CA 1P64A 3GUOA 3J7BA 2C9CA 197LA 4B4IA 4LF9M 4H9FA 5LVIA 3K9OA 1JKAA 2ZNXY 3W0LB 4DV5M 1QAMA 4IJEA 1UACY 1CV1A 5KXWA 5ILCA 1L0JA 1L77A 4QGZA 4WLDA 2Z4SA 4L41A 1LMTA 3GUJA 1L2BA 3HX3A 3A3QA 4GCDA 4B4EA 2MEEA 4NHTA 3A92A 4P17A 4NG1A 239LA 4MH0E 1QUTA 4GH9A 4LY6A 3AJNA 3MGWA 4DAJA 3TL4X 1R5LA 2JXNA 1L07A 3T36A 3WW6A 4NSRA 3W6CA 3OTOM 2DQJY 4WO6A 3B0OA 1L69A 2FBDA 1SX7A 1IY1A 1TH4A 3LN2A 4Z46A 173LA 1VDQA 1Y8GA 1OQYA 3AOGA 1ZURA 3BKVA 1C69A 1IY3A 2R45A 1LHHA 1JTNA 4Y28F 190LA 4DR1M 2NWDX 1IOQA 2Q9EA 4IAPA 3FI7A 4OOOA 3LW5F 1P6YA 1Z5CA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1KIP C;  5M1Y A;  1UBZ A;  3ATO A;  5IDD A;  1D0M A;  4D9Z A;  1XGQ C;  4BAP A;  1LJF A;  4NY5 A;  1L92 A;  155L A;  2QB0 B;  4OOT A;  1T3P A;  1E8L A;  4ARJ A;  2YBM A;  2BQF A;  2DQH Y;  3DN1 A;  1FKQ A;  2BLY A;  1L27 A;  4UWV A;  1C6L A;  1DZB X;  2YVB A;  3CSQ A;  1LKS A;  1L39 A;  1DYG A;  1L71 A;  1SWY A;  235L A;  244L A;  5E9R A;  2X0A A;  132L A;  1GE3 A;  1BVX A;  1RCM A;  4OWH A;  1H87 A;  3WXU A;  4EJ4 A;  3ODU A;  2RBQ A;  3GUO A;  1P64 A;  197L A;  4B4I A;  4H9F A;  5LVI A;  1JKA A;  2ZNX Y;  1UAC Y;  1CV1 A;  5KXW A;  5ILC A;  1L0J A;  1L77 A;  4QGZ A;  4WLD A;  4L41 A;  1LMT A;  3GUJ A;  3A3Q A;  4GCD A;  4B4E A;  2MEE A;  4NHT A;  3A92 A;  4NG1 A;  239L A;  1QUT A;  3AJN A;  3MGW A;  4DAJ A;  3T36 A;  1L07 A;  3WW6 A;  3W6C A;  4WO6 A;  2DQJ Y;  3B0O A;  1L69 A;  2FBD A;  1SX7 A;  3LN2 A;  4Z46 A;  173L A;  1VDQ A;  1ZUR A;  3BKV A;  1C69 A;  1IY3 A;  1LHH A;  1JTN A;  190L A;  2NWD X;  1IOQ A;  2Q9E A;  4IAP A;  3FI7 A;  4OOO A;  1P6Y A;  1B0D A;  3WUA A;  3WU9 A;  4ZEE A;  1LOZ A;  3TXF A;  3DMZ A;  1LMA A;  1HEL A;  2XJW A;  4N1E I;  1G7I C;  1QSB A;  1JTP L;  1JHL A;  4YXA C;  4PPO A;  176L A;  2AUB A;  4J7V A;  3RNX A;  3VW7 A;  2BQM A;  1LHL A;  1C6E A;  4LYM A;  4WM6 A;  1IR9 A;  1OUC A;  4ZIX A;  192L A;  4WM3 A;  1LGX A;  2YBJ A;  1JEF A;  3C7Y A;  3HH3 A;  3W6E A;  1JTT L;  219L A;  138L A;  1L04 A;  2B74 A;  3E3D A;  5B1F A;  1QS9 A;  3P64 A;  4H8Z A;  2RBR A;  2RBN A;  3WMK A;  4O34 A;  253L A;  1DQJ C;  5J7C A;  1JJ0 A;  241L A;  4A7D A;  174L A;  1D2Y A;  1L97 A;  1YAM A;  1O23 A;  2A7D A;  5LYT A;  111L A;  1HNL A;  3LYM A;  1WTH A;  232L A;  2EIZ C;  3GXR A;  1L79 A;  1G0P A;  4XEN A;  3CSR A;  1HMK A;  5D5C A;  5KXS A;  1BGI A;  1JSE A;  1HFZ A;  3AGH A;  1C66 A;  1L84 A;  1GFA A;  4AXT A;  3RUN A;  3DN4 A;  2F4G A;  2DQE Y;  1B9O A;  1GFK A;  1XGP C;  2B6W A;  1L11 A;  1LYO A;  4TX7 A;  1LJE A;  2MEG A;  4XAD A;  3TXJ A;  3CDT A;  1PQO A;  1OUA A;  102L A;  228L A;  2B6T A;  2HED A;  2ZQ4 A;  2EPE A;  4CHX A;  1C6T A;  1ZYT A;  4LGK A;  2D91 A; 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