4AVAA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
332
structure length
327
Chain Sequence
DGIAELTGARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 94
structure length 327
sequence length 332
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avaA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avaA02
1S3ZA 3FE5A 4U9YA 3R96A 4IEUA 3SXNA 3TNPB 3NVCA 2QNKA 3S6HA 3E5QA 2XL9A 4LUKA 4MGKE 3RYPA 5FDBA 5FCCA 1Q2YA 1DZRA 2GU9A 4BHPA 2FIWA 2RC4A 4MY3A 4QXKA 3FYNA 2B58A 1J3PA 3PVBB 4KWKA 3ZDSA 2C27A 3FX3A 1UPIA 1Q2CA 3D0JA 2ZXVA 2BNOA 1KUVA 4D7SA 4YSFA 3FXTA 4H89A 4KZTA 1L3JA 2HKXA 5EZWA 2BEOA 3IBMA 3H3UA 2K9ZA 4AG9A 2EVXA 2WC2A 3E97A 3NL1A 3WW1A 1ZRCA 1FT9A 1M4DA 3UKVA 3FRMA 1Y7RA 3C26A 3FWEA 5FLIA 5HI0A 1NZCA 1O3RA 3BB6A 4PJYA 2VZYA 4FAGA 1MJ9A 4QGNA 1XE8A 4YARA 4F0YA 4RD7A 1WWZA 2B9UA 1NE4A 3BALA 1RL3A 4Q29A 4Z07A 5I0SA 3N4MA 4KOYA 3LOIA 4WVZA 1WK4A 3EBRA 3TO9A 1LKNA 4HLTA 4I09A 2FIAA 3EJKA 1NE6A 1CAXA 4F7ZA 1P4NA 2F4PA 4CAXA 3B02A 3HQXA 1FY7A 3R1KA 4R8HA 1EPZA 4KLWA 1RUOA 4JWPA 3S6GA 2O8QA 4DINB 4AXOA 4EV0A 3S7IA 3WW3A 4HZFA 1SQ4A 4WBBA 4E2SA 4PIZA 1IB1E 2VXKA 2ATFA 5H84A 4B5PB 3MPBA 3NE7A 4AB7A 4UBGA 2AJ6A 3S6KA 2Q0AA 5JR7B 4KVME 3S7EA 3IWZA 1YLEA 5F49A 3MYXA 1S60A 4CRZB 2OU2A 2IXJA 4UWJA 1WGPA 3RYKA 3I9SA 4JTNA 4IEYA 4L8AA 4O9EA 2B4DA 2JDCA 1CJWA 3H50A 3VHRA 3LWCA 3UKNA 5LRSA 4MV2A 4KU8A 5IV0A 3TTHA 4KUBA 4XF9A 3U0ZA 4J3GA 1N71A 2XHKA 2Q1ZB 2Q04A 4R57A 2V09A 4UBHA 3OF1A 4IERA 5BPXA 2GC0A 2GIVA 2B8MA 5JQ4A 2ZW7A 5KTDA 2OZJA 2MPFA 1EY2A 4ZU4A 2OZHA 1QXJA 5DWNA 5HMNA 1UD1A 4H7LA 4JVAA 3PZJA 1Q5OA 4E2AA 2ET1A 5FQ0A 5J3UA 2B5HA 1UIJA 3QAHA 2CV6A 4JD6A 2IXHA 3JUWA 2UY8A 4MJ8A 2IXKA 3CL1A 4NCZA 3CLPA 5EFUA 2ZPAA 2Y0MA 1X82A 4IEXA 2OPKA 5JAXA 3F0AA 5ISVA 1OFNA 2HQYA 5JCTA 3WW4A 2OB0A 4XPDC 4BMHA 2HUZA 4KORA 4Z82A 4E8OA 2PAMA 5C8WA 2EVNA 2OYZA 1CAXB 1BOBA 3M70A 4KOSA 4CAWA 4ZU5A 4LULA 3EC4A 1JUHA 1Q3EA 4HN1A 1K4JA 1M4IA 1QSMA 3KGZA 2BYVE 1YR0A 2PR1A 3ZJ0A 4JXRA 3TOBA 1YFWA 4CS0B 2R8VA 1YLLA 2PAEA 4YRDA 1L0CA 3LA3A 3EHKA 2MNGA 1S7FA 3HT1A 1S5KA 3RDIA 3SCFA 5DWMA 1YVOA 2JEVA 1Y9KA 3W6XA 3I7DA 3V8IA 2DCTA 3R9FA 1CGPA 1GQGA 1O4TA 4MH0E 2CNSA 4IEQA 4Q0QA 1J3QA 3K9UA 4AVAA 5CNPA 3T90A 1Y9QA 3G8WA 2PFWA 4FD7A 4FD6A 4NEXA 1OI6A 2CNMA 2B3UA 3IDCB 3GY9A 1XE7A 1ZREA 1VJ2A 5LEKA 5KHIA 3KSCA 1ZZBA 2ET7A 2JDDA 4XPKA 3USSA 5KHGA 1MK4A 1QSNA 1ZRFA 4XNHC 1IICA 1B6BA 2CNTA 1O3SA 2FXFA 1TQ5A 4QX5A 3SXOA 2PTMA 4Q0PA 4MZUA 4O9GA 1RC6A 1VR3A 3H7JA 1J3RA 2QVSB 4ONUA 3P2FA 3RYOA 3G7DA 4YNIA 1ZX5A 5KHHA 4WZCA 1VKCA 1CAWA 2GH2A 5EBVA 1BO4A 3E5UA 5GCNA 2R98A 1FXZA 4KOTA 1NYWA 1YFUA 1WLTA 3H7YA 4KU7A 2VQAA 4KOUA 4PV6A 4F8AA 5FPXA 2D4OA 2GC1A 4XFHA 5F1RA 4JJXA 2VECA 5BV6A 3FNCA 3EO6A 2R1IA 5KTCA 4MGIE 2IXIA 5I0CA 1YFYA 5C6CA 2QDRA 5JSOA 3D82A 1LB2A 2XKPA 1IYKA 2BGCA 2QECA 2QMLA 1RO5A 3R9EA 3OGJA 3I59A 2OZ6A 4KVXA 4PK2A 4M85A 2FQPA 2B5GA 1Z4EA 5HH1A 2P6EA 2O1QA 2BL1A 2IC1A 1GQHA 1YFXA 5EC4A 4EWAA 2Q4VA 4KWJA 4LUMA 2P6GA 5FLJA 1V70A 4IETA 1M44A 4R9MA 4JTOA 4NXYA 4I0AA 2JLMA 3MZHA 4PIXA 4XPLA 1PMIA 3IGRA 3O14A 3VWEA 4KWLA 5CVRA 2H5MA 2PRBA 3CO2A 1RTVA 4F6AA 4I3PA 4MY0A 2J8MA 1QXRA 2J8NA 3ZZIA 2FL4A 1QY4A 1TIQA 1CAVA 1OD5A 4JXQA 4XNHB 1MJBA 3LAGA 4EVYA 2MHFA 5LRRA 1SQHA 3DDDA 2XGXA 4IEOA 2B4BA 2Z11A 4R3LA 1I12A 5J7MA 5FLHA 3IDBB 5H86A 1O5LA 1SFNA 1LR5A 1QSRA 2I79A 3KMHA 1B87A 3RZZA 4KVOE 4E0AA 3ACLA 2Z69A 3RYRA 3FFQA 3UKTA 5E1RA 5IX3A 5I0RA 1X8EA 3PLQA 2BNMA 1YK3A 4MI4A 3SCHA 2PC1A 4FT8A 1I21A 1VHSA 3WR7A 4LA2A 1ZZ8A 5I8TA 3D0SA 3TCVA 5BXXA 2FT0A 2NMTA 1Q2DA 3F8KA 4QGMA 2D40A 2XLFA 3NSTA 2FE7A 3H4QA 3N7ZA 3P2HA 3OWCA 3F5BA 3T9YA 1PUAA 5KHJA 1UCXA 5BUVA 4RS2A 1H1MA 4HNXB 2XLAA 4IEWA 3I59B 1O7FA 3BJ8A 4P9GA 2D93A 3SXWA 1PU9A 2B5GB 2Z0ZA 2VEZA 4YRHA 2Q44A 2GC2A 3H1YA 3QACA 5KHKA 3LA7A 2N7GA 3CEWA 3DV8A 3MDPA 4QM8A 1CX4A 2CY2A 3E0KA 3JZVA 4UBRA 4QMAA 3ROUA 2Q4SA 2PSWA 4LUAA 3SMHA 2BUEA 3I54A 5I93A 1DGRA 3BU7A 4KOXA 1XIXA 3S6FA 3TE4A 1S7NA 1P0HA 4IESA 2VPVA 3OTFA 4L89A 1CAVB 3GYDA 2QIRA 4AG7A 3SHRA 3ES4A 1S7LA 2G0BA 4PSXA 2C0ZA 4FAHA 3NJZA 4PK3A 4XFCA 2FMYA 2H6CA 2K5TA 3D2MA 2REFA 4UXAA 1KUXA 4AVCA 4QC6A 4BYYA 3EXNA 4GULA 3HT2A 3C3VA 5BY5A 4B5PA 5I91A 5I0TA 3RPQA 4NVPA 4DNCA 1YVKA 2ZW6A 3KCCA 2GE3A 2J8RA 4E2QA 2ETEA 3D2PA 4QUSA 5KTAA 4Y49C 2E9QA 3E6DA 2B4DB 1FI2A 2VZZA 3TOAA 1DZTA 1KUYA 4BH9A 2GANA 1CAUA 3W6SA 4X5KA 5AVPA 2XKOA 4FBFA 5IB0A 3CXQA 2WFPA 3ETQA 4MX3A 2QJVA 4OLLA 3E5XA 4IEPA 5I8YA 1DGWA 3BCWA 1H1IA 3OD0A 2FCKA 1XMTA 2ARHA 4XF3A 3GYAA 1YUDA 1IPKA 1NE9A 2Z2SB 1J59A 1IIDA 1RXTA 1ZVFA 5FQ0B 5I8SA 4XEZA 3SCGA 3DR8A 2Q0YA 5C88A 5J8FA 2H0VA 5D1IA 4ORFA 4U9ZA 3M3IA 3UY5A 3EY5A 4YYOA 1KZFA 4FD5A 3L2HA 2AE6A 1I1DA 3CF6E 4K8FA 4XETA 1UFHA 4XPDB 4UWIA 2K0GA 5E96A 3EFAA 3LODA 1RGSA 4M3SA 5FPZA 3FHIB 2Q30A 1GHEA 3D8PA 3W91A 2G3AA 4HNWB 4B5OA 3S0MA 4QBJA 4IEVA 3ELNA 4Q0VA 3DSBA 3JVNA 1WA4A 5I0UA 4META 4QVTA 4AQ6A 2P17A 2QCSB 3R6SA 4HN0A 4I2OA 4R52A 4X6QB 2GAUA 1R57A 3E6BA 3PNAA 1Q43A 4N9IA 1OZPA 1YREA 4JV4A 3R9GA 4MBUA 5KBFA 2XL7A 2ZW5A 2DXQA 2D5FA 4I01A 4RI1A 1YX0A 3BLNA 4Y49B 3RNSA 4OFGA 3QOPA 3I3GA 4YGOA 1I5ZA 3ES1A 3DL3A 2VI7A 3EO4A 3FIXA 1ZZ6A 5K8SA 4QGLA 3TT2A 5F46A 4OAEA 4XFBA 3DR6A 2OZGA 1CAUB 2PQQA 2PQ8A 2I00A 1SEFA 3FB3A 2D4PA 4MHDA 4YFJA 1YHFA 2WPWA 5JPHA 2I45A 4LLOA 2R7HA 3NKTA 2BEIA 4E2GA 2BNNA 2OH1A 4I49A 3R95A 4PIYA 2Y0OA 2CGPA 4HSLA 4KLVA 4UA3A 5F48A 4HVQA 4XFFA 4L11A 2CAUA 1NSLA 3H9AA 3IWGA 2PR8A 1I6XA 3DNSA 4LX9A 4ZBGA 1U6MA 1EP0A 3DKWA 2KCWA 2VBQA 1CAWB 3QB8A 4QM9A 2B3VA 4GS4A 4HKFA 1XRUA 2Q4YA 3OCPA 1UW8A 4ZU7A 1X7NA 5J48A 1CM0A 2PHDA 2IXCA 4HBNA 4OADA 3CJXA 1MJAA 4PSWA 4KOWA 1O5UA 3TFYA 4XF1A 3B8GA 2PA7A 1Z9UA 5T3NA 2OZUA 2ATRA 2ZCWA 3H8UA 1IYLA 4Q0UA 4U5YA 1ZZ7A 2EA7A 2UY9A 1RUNA 4QB9A 2ZKLA 3IIAA 2O28A 3BPZA 4CYDA 4D7TA 2G3TA 2OA2A 4NSQA 4TLFA 3LD2A 5FVJA 2KXLA 3FZ3A 5LEJA 1XEBA 2Z10A 3ST7A 2PAKA 4AQ2A 3H3ZA 1QSOA 1QWRA 1J4JA 1M4GA 3HIFA 3EQEA 4XFIA 3WW2A 4IEZA 1XF8A 3U10A 2P6FA 2X7BA 1U12A 3GKRA 4KUAA 3H1WA 1O3TA 4II9A 4B29A 1ON0A 4IUSA 4EWEA 4KOVA 1OMIA 4XFAA 3VWDA 1X8MA 1J1LA 2BSWA 3PGPA 5JSRA 3NW4A 2CAVA 1NXMA 1ZRDA 2A4NA 2FS5A 2PDOA 3BJ7A 4AVBA 3TNQA 2IL4A 1IPJA 3MGDA 1HW5A 5C82A 1YWKA 1ZNPA 3FBUA 3KKWA 1S7KA 1Z4RA 1Y3TA 4Q0SA 4HMZA 2ZW4A 3DN7A 2FSRA 2VQYA 4FD4A 3TO6A 4MUVA 4HVOA 3U11A 1G6NA 2XLGA 1NMTA 4EROA 4EWDA 3TO7A 1LRHA 3CXPA 4LA3A 4KL1A 5CU1A 2Q7BA 3LZZA 3G3SA 2H6BA 4K30A 1UIKA 2GC3A 4H6UA 4HNYB 2GZWA 1O3QA 2HJIA 4XFGA 4NF1A 4CRYB 1ZZCA 4LTAA 4L2NA 1V0CA 2D5HA 3GBFA 4HSJA 2HV2A 4J1XA 4BIFA 4IF5A 1VP6A 5J8CA 4MGZE 2EUIA 2IXLA 1J58A 4I02A 2REEA 3SHPA 4I0BA 1EYBA 2WPXA 2EAAA 3CXSA 1LRZA 3LA2A 3KGLA 5F47A 1XE4A 4LEJA 4MGYE 1QSTA 4H6ZA 4A2UA 2PYTA 4N9HA 4XF4A 1Y9WA 2UYAA 4X6RB 5E16A 3H1MA 4R87A 5JSPA 3E6CC 4JLYA 1ZZ9A 4CAVA 5CADA 3PP9A 4J1WA 1PM7A 3D3SA 4R3KA 1ZRRA 4HVRA 4XF0A 1YGHA 2F5IA 2P0WA 1M1DA 2PHLA 2UYBA 3FJSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XJAA 3TNPB 3E5QA 2WT0A 1W8HA 1LHUA 2DPTA 2GNDA 3O1TA 4KZTA 2NP0A 1REEA 3B35A 3CJIA 2EIDA 3T2TA 1QOTA 3BTXA 3J9SA 5FOBB 4LO5B 1PGSA 3LOIA 3TO9A 3F2ZA 1UKRA 2Y6HA 3NNMA 1X9PA 4MADA 3ME2A 4HZFA 2XH6A 1S0JA 2EIEA 3IDEA 1DLLA 4JTNA 1S0DA 4O9EA 5IVJA 2PHFA 4L8AA 3VHRA 1AYM1 3TTHA 1UWWA 3N36A 5JLVA 4YZ3A 1RUC3 1UY3A 1YQ8A 3LF7A 2Y60A 1VBA3 3IMMA 3NH8A 5FYIA 1Y7EA 2ARXA 3ACHA 4CCDA 2NMNA 4Z82A 5C8WA 1OFSA 4Q7AA 5C4WB 3GJBA 1W0NA 2BYVE 4JXRA 2PAEA 2OUJA 3J8F3 3HT1A 2V72A 3VZJA 3R9FA 3FMGA 3ZXDA 1ALYA 3K9UA 2OXBA 1Y9QA 1MQTC 1UYXA 1S1AA 1VJ2A 5FXXA 4XNHC 2CYFA 3CQOA 5KR7A 2VW0A 5EJ3A 3B93A 1W06A 2CNAA 3LDRA 5KHHA 4DEQA 2WRAA 1RUG1 3VZKA 4A6OA 3H7YA 4FTEA 4PV6A 3MV01 1LJ7A 4Q4V1 3EO6A 3VDCA 1X36A 5I0CA 2NQYA 5C5TA 3S6PA 4JZ0A 3VBHC 5ANQA 2JXAA 4GH4A 1GQHA 1Z7S2 4P44A 4KWJA 2X10A 5A28A 4RGKA 1PZ9A 4P4EA 2JDNA 1ASJ2 2WSUA 1RUF3 2W94A 4FOYA 2DVGA 3LAGA 5CG8A 1EV12 2HWD3 2HWE1 1AL0G 4A7ZA 3KMHA 1UXZA 3NNFA 4LMFA 2XJVA 4PF1A 1RMU3 1JYTA 1JHNA 3PTYA 1ZZ8A 1PNFA 4IGPA 2EAKA 3N7ZA 3ZYFA 3OY8B 1HDQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1S3Z A;  3FE5 A;  4U9Y A;  3R96 A;  4IEU A;  3SXN A;  3TNP B;  3NVC A;  2QNK A;  3S6H A;  3E5Q A;  2XL9 A;  4LUK A;  4MGK E;  3RYP A;  5FDB A;  5FCC A;  1Q2Y A;  1DZR A;  2GU9 A;  4BHP A;  2FIW A;  2RC4 A;  4MY3 A;  4QXK A;  3FYN A;  2B58 A;  1J3P A;  3PVB B;  4KWK A;  3ZDS A;  2C27 A;  3FX3 A;  1UPI A;  1Q2C A;  3D0J A;  2ZXV A;  2BNO A;  1KUV A;  4D7S A;  4YSF A;  3FXT A;  4H89 A;  4KZT A;  1L3J A;  2HKX A;  5EZW A;  2BEO A;  3IBM A;  3H3U A;  2K9Z A;  4AG9 A;  2EVX A;  2WC2 A;  3E97 A;  3NL1 A;  3WW1 A;  1ZRC A;  1FT9 A;  1M4D A;  3UKV A;  3FRM A;  1Y7R A;  3C26 A;  3FWE A;  5FLI A;  5HI0 A;  1NZC A;  1O3R A;  3BB6 A;  4PJY A;  2VZY A;  4FAG A;  1MJ9 A;  4QGN A;  1XE8 A;  4YAR A;  4F0Y A;  4RD7 A;  1WWZ A;  2B9U A;  1NE4 A;  3BAL A;  1RL3 A;  4Q29 A;  4Z07 A;  5I0S A;  3N4M A;  4KOY A;  3LOI A;  4WVZ A;  1WK4 A;  3EBR A;  3TO9 A;  1LKN A;  4HLT A;  4I09 A;  2FIA A;  3EJK A;  1NE6 A;  1CAX A;  4F7Z A;  1P4N A;  2F4P A;  4CAX A;  3B02 A;  3HQX A;  1FY7 A;  3R1K A;  4R8H A;  1EPZ A;  4KLW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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