4AVFA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa inosine 5'-monophosphate dehydrogenase
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
467
structure length
314
Chain Sequence
MLRISQEALTFDDVLLIPGYSEVLPKDVSLKTRLTRGIELNIPLVSAAMDTVTEARLAIAMAQEGGIGIIHKNMGIEQQAAEVRKVKKHETYPLASKDEQGRLRVGAAVGTGADTGERVAALVAAGVDVVVVDTAHGHSKGVIERVRWVKQTFPDVQVIGGNIATAEAAKALAEAGADAVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQISAIANVAAALEGTGVPLIADGGIRFSGDLAKAMVAGAYCVMMGSMFAGTEEAPGEIELFQGRSYKSVPYKGALSAIVHQLMGGLRAAMGYTGSADIQQMRTQPQFVRITGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
publication title The Aeropath Project Targeting Pseudomonas Aeruginosa: Crystallographic Studies for Assessment of Potential Targets in Early-Stage Drug Discovery
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 98
structure length 314
sequence length 467
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4avfA00
4NZJA 3LRLA 3QM3A 2NXGA 1GVSA 2JGQA 3L2IA 3AJXA 1X6UA 3LLFA 3C8FA 1F05A 4MYXA 4WJEA 4LS2A 4UFHA 2ZRYA 6ALDA 3BARA 5CG7A 4O1AA 4WY0F 4QM1A 1Z41A 4UC5A 3HPZA 3M1ZA 1M7PA 1V7YA 2GJLA 3LI0A 4Y96A 4MYAA 1TV8A 2VKZG 1JCJA 3W1QA 3DFQA 4CNPA 2QUVA 1OX6A 5C6MA 3UWWA 1A5SA 1LDCA 4M7TA 2VEKA 2Z0IA 2XN1A 1W5MA 4S2CA 4DF2A 3A9IA 5KTLA 3LTPA 3EWUA 5ABTA 3C2OA 2QJGA 1JCMP 4PCFA 4HT3A 2VENA 1N55A 1ICQA 4QNWA 1AW2A 4UTTA 4MZYA 2ZZ4A 4LUIA 1OJXA 3S5ZA 4ADSA 4E38A 4LY8A 1W5OA 2A7NA 5I3HA 2YDAA 1QMLA 1KBIA 3UPWA 3GXPA 1BWLA 1I4NA 2GQ9A 4QSHA 3PUEA 2Y88A 2CZDA 3LHVA 4JS3A 1H62A 2AAMA 4FNSA 5AYYA 5AB3A 4Z1AA 1TRDA 4AHOA 3F4WA 4BF9A 4HNVA 2CLLA 2FLIA 5AYZA 3LXBA 1VZWA 1O94A 1XFBA 1W1ZA 4RV8A 2X30A 3M9YA 1OK6A 1EPXA 1OF6A 3LCGA 2H8XA 5DY3A 2DZTA 1G69A 1SZEA 4WD0A 1GQNA 4DBEA 3IIVA 3FJ6A 4LTSA 5LHEA 2BLEA 1PHQA 2IQTA 3W1RA 3FOKA 5CPNA 1IXNA 1ZNNA 4WOQA 4UTHA 2JK2A 2GOUA 2C14A 1G67A 1KFLA 1TPFA 3KVKA 2NLIA 2ZZ5A 5AC6A 3IGUA 4FNUA 1O60A 3MUXA 1DJQA 3OG3A 5K3VA 1GT8A 4ICNA 1MZHA 3GDTA 1HTIA 4WQ6A 1RQEA 3S6DA 3EX4A 1I2NA 5K4XA 2PCQA 2B7PA 1WXJA 3S5NA 1TPVA 2ZFAA 4FHAA 1R30A 1GG1A 2E09A 2HTMA 4QQ3A 4XKYA 3MI2A 5CPLA 3U2OA 4DF0A 2ZTJA 4UXDA 4TU1A 5KZMA 3N14A 3O16A 3GLCA 2JGYA 1IGSA 1ZJIA 3W7NA 1PCKA 4LOCA 4DO6A 3WJZA 1FXPA 3GR8A 3USBA 2E77A 1QNVA 1SO6A 3IVSA 4MZ8A 3N2MA 1K7XA 5FEXA 3O07A 5FI8A 1MEWA 3NAVA 5EPDA 5HUPA 1HO4A 1UASA 5CPOA 1NF0A 1TPC1 1V5XA 5D32A 1RV8A 3KHJA 3TDFA 3UZJA 5FF7A 2WNQA 2VC6A 4UNKA 4O1CA 4BK9A 3GDMA 4UTJA 3GIYA 3ZFHA 4LV4A 3EKZA 1WX0A 3ABQA 2QCFA 4UTIA 4AWUA 2X16A 4IJBA 1JJKA 4LVFA 2YXGA 2V2DA 4N4PA 4U4MA 5F4XA 3TAOA 1ME7A 1YXYA 1FX6A 4MKNA 3ABOA 4Z0SA 1XBVA 3HGJA 5BW6A 2QCNA 3P8JA 2NUYA 3TC6A 4PTNA 3ZWTA 2CU0A 3NYZA 1VPXA 4LVAA 4H3DA 3QZEA 4HIBA 4UFKA 3TUUA 4O18A 1SZNA 4ZVJA 1J5TA 4UFJA 3W2JA 2V5LA 4E2BA 1QOPA 2GQAA 4KWVA 4XZ9A 3E49A 3T55A 1LM1A 1W3NA 4J9JA 3GXTA 2ZTKA 5HULA 1TV7A 4PA8A 3LHUA 4R33A 4ZQPA 2R8WA 1GPWA 1KFJA 4X2RA 1ICPA 1KFBA 1LOSA 1W3TA 3B04A 3N2XA 5FF3A 3HBLA 3QMRA 1TTPA 4PFMA 3OEXA 2J27A 2C1HA 1KM0A 2X1SA 3LDVA 2E5DA 1FCBA 4K39A 2JKPA 1P4CA 1DL3A 5F1VA 3HIJA 3MHGA 4E0CA 1OFAA 3L5MA 4ZMGA 5AN7A 4ADTA 1VJIA 1OHLA 2TMDA 3L67A 4K7YA 5HMSA 1DORA 2I9EA 2VFFA 3E02A 5HQEA 3OVQA 5GVJA 4K6AA 3S1WA 3EX2A 2X1UA 1OVDA 1WBHA 2R14A 2TYSA 3MP5A 2VFGA 4JIQA 5J5RA 5F4WA 3RF9A 3A5VA 1WOAA 3EWWA 3PS7A 1QO5A 2QJHA 4O17A 5G1YA 1W31A 1GVQA 4RXFA 2C0AA 3T40A 1TTJA 4ZQOA 3QC3A 1Z44A 3W7OA 4NJKA 3FKRA 1Q6RA 3NPXA 3EX3A 4K38A 2PRMA 3VE7A 3MI3A 2A0NA 3W1PA 2DU2A 1MEHA 4MFEA 3W23A 5IM51 1MO0A 1PVNA 3W7PA 3ATZA 3NNTA 5C5YA 4AH7A 3BK0A 4LRTA 3FKKA 3U6WA 4DO4A 4CQ9A 4OV4A 1H5YA 2J24A 4A21A 3B0UX 3C56A 3DFTA 4Z1BA 3NQ7A 4JX5A 3THAA 1QPRA 2RDTA 1FWTA 3CC1A 4O11A 4GUFA 4ZQMA 1U5JA 2CFFA 2FPVA 4QISA 4XTDA 1IXQA 1FCVA 4JTKA 3QF0A 3RFAA 4LUJA 1A5AA 1B4KA 1ZY9A 3LM7A 4ZL1A 3G8EA 4IOTA 3TH6A 4UMCA 3LRMA 4LC6A 2YX0A 3QW4B 3LCLA 2F7FA 3OVPA 5DXYA 4XBKA 3NXFA 1JRCA 1VCFA 5K9DA 3NGJA 3D0CA 3CU2A 2CLMA 3ZS4A 1ME9A 4S1FA 5KITA 1XXXA 4Z08A 1M6JA 1NF7A 3NQVA 4N2YA 2E6AA 3EXRA 4YL2A 3UWQA 5BNKA 4DPPA 2Q8LA 3BV4A 4NU7A 3W3OA 2WKJA 2E6FA 2DORA 5TBOA 1F5ZA 3PSVA 4CCCA 3G1AA 3DENA 4FF7A 1C8VA 4LS0A 4GXMA 3TR2A 4O54A 1GWJA 1QWGA 3GDKA 3NQFA 1EA0A 3BVJA 3HF3A 4MY9A 2XN0A 2ZRXA 2B0MA 1JQVA 1FDZA 4UMBA 3P61A 4OHQA 1YLVA 1TRIA 3BO9A 1A5CA 1OK4A 2B7NA 3KAOA 2V2CA 5FF0A 4FNPA 4CCDA 2DZXA 1Q6LA 4AB4A 4HKPA 3NQ6A 3LV5A 1P5BA 2C6QA 4AXKA 2A6NA 2H8ZA 2P1FA 1UUMA 1W5PA 4ZQNA 1HG3A 4TX9A 5E0KA 3QH2A 3LHWA 3LV6A 2W6RA 3KVMA 4WXZA 1H60A 4UTMA 2YZRA 2ISWA 4JN6A 4O52A 3GB6A 2E5BA 2NX9A 4EF9A 5AHEA 3ABRA 3GNDA 3EWYA 1TJRA 4FNTA 1KA9F 3FJLA 4NNBA 1L9WA 2W79A 3P7YA 3T44A 3HOJA 3QSTA 2C16A 3DI1A 1TO3A 4NXKA 4YCOA 1QPQA 5D30A 4IXHA 2J6XA 3B0PA 4X9SA 3PBVA 4QAIA 4N9EA 2VFDA 5FEWA 5D37A 3BG9A 4FX6M 1HL2A 5G5IA 1TSIA 1VR6A 4MLJA 1R2TA 3LTSA 3N9RA 3NM1A 1C29A 4DPQA 1XKYA 1D9EA 1KTNA 1W5QA 1HO1A 4NJHA 1JVNA 4I7UA 4AF0B 1LBMA 1SZGA 2QJIA 1LP6A 2A21A 2QDHA 3DKLA 3LCIA 1FUYA 4O8RA 4O15A 3DBPA 2FIQA 3HGOA 3HG5A 5FEPA 3W6YA 2QKFA 4M19A 5DCBA 3QQ0A 1EWDA 2EAWA 1CI1A 1F6PA 1OFQA 4JY9A 1PV8A 3IV3A 4DQWA 1SPQA 2A7PA 5L6UA 3W74A 3GKFA 4CNOA 2NUXA 1KTCA 5D2TA 1GTHA 3LCWA 3B8DA 3BLEA 3M5ZA 3PR2A 4RJEA 1YDVA 1TJPA 3FLUA 4O57A 1QPOA 1ZFJA 3W76A 3GDLA 3ZR4A 3CEUA 1WV2A 3W1LA 4XQ6A 2G5WA 1VHCA 3GVGA 3LB0A 4AWTA 1PS9A 3GAKA 3PBWA 2NX1A 3S1XA 2AQWA 4HNUA 4JD4A 1W56A 4HNNA 1OFRA 3W2KA 3HG3A 1KM6A 4IX0A 1G7VA 3NM3A 4YLWA 4AEOA 2XN2A 5AHLA 1J2WA 2OZ0A 1K8ZA 3IRDA 5MHBA 2FJKA 3FA5A 4CQAA 5DCEA 4ALDA 2FQIA 1WDWA 3TIMA 2QCLA 4O50A 4NZFA 5AHFA 1OYAA 3FEMA 3HGSA 3W7MA 1EP2A 2ZQ0A 2TSYA 3NQMA 4O28A 2OT1A 3TXZA 1N7KA 3DI0A 2PRHA 2RFGA 2O7SA 1F7BA 5DY2A 3UWVA 4IPJA 2YYUA 2J9XA 5H2ZA 4FXSA 1LRNA 2CZFA 3NG3A 3BG5A 3PB2A 4O0KA 3WK0A 1KLZA 3G8RA 2FB3A 2FTPA 1EUAA 2J9YA 4QITA 1FDJA 1VYPX 2CLIA 1DHPA 3L5LA 1YDNA 1JULA 1MXSA 2P0OA 2QCGA 2V9DA 1XBYA 2YYTA 2ATSA 2DJXA 2NV1A 2QCEA 3SFKA 2CZEA 3TXVA 2TPSA 1X7FA 3TW7A 1K03A 1LBFA 3EXSA 3C0JA 1QFEA 4MOZA 5AHMA 3SI9A 3T78A 2NXIA 3O06A 3W75A 4PC8A 3BG3A 3CTLA 3MYPA 1PL9A 5CSRA 4MLRA 4JTSA 1H7PA 3M7WA 3HJZA 1T0OA 1ICSA 2ZZ2A 3G0SA 5DCDA 1RVGA 3NPWA 1H7NA 3HQ1A 3LOTA 3W2MA 2BX7A 3B05A 2VFEA 2P10A 4RZ5A 3O05A 1K7EA 3SY5A 3G24A 4LW7A 4PL1A 2G96A 1EX5A 1SQ7A 3QPYA 3Q94A 4UUIA 3W7IA 3TU9A 5KZDA 2OT0A 4JYFA 1TREA 2A1YA 1VC4A 3QSRA 3W22A 3HGRA 1MEIA 3CQ0A 3MHFA 3S5YA 3SW6A 1TIMA 1W5NA 3NEVA 5I3FA 1H7RA 1TPB1 4OV9A 3CM4A 1M7OA 1TB3A 3UWYA 4GUGA 3G18A 2WSRA 1EP1A 5D03A 3W7CA 3C2EA 1YTDA 4FIQA 2BSLA 1D3HA 4AVFA 3AO0A 1WQ5A 4IMEA 4N9BA 1KTBA 3PAJA 5KZEA 1X8FA 2HS8A 3EKLA 1UUOA 3W7EA 3TSBA 3PBYA 3QRHA 3GAYA 3PWAA 4NX5A 1PE1A 3W7DA 1F76A 4OWGA 3MI6A 1O5XA 5FF4A 5F1UA 1FXQA 1YPIA 3PVFA 4O0ZA 5DLCA 1HFBA 4BI6A 2V8ZA 3L65A 3P5YA 3F03K 3NL2A 5HR7A 1GG0A 4WUIA 3P81A 3W7LA 3R5EA 3TE9A 3NOEA 3C3NA 4BR1A 4LVGA 2R91A 1XCFA 1GVFA 1I45A 1Q6QA 3MJYA 1FWRA 5D05A 1G4PA 1KFKA 3OBKA 5BMWA 4MY8A 1ML1A 3G3DA 5LZLA 3DGRA 2RH9A 1BWKA 3M6YA 2V0TA 3CWOX 1XDLA 2NWRA 4XWUA 5D2XA 5AYXA 5KSWA 3P82A 3PY2A 2NX3A 3PG8A 3ZWSA 1VCGA 3UYCA 4O19A 1QCWA 4RXGA 1QPNA 1SW3A 4AWSA 4K36A 3VFLA 2Y7GA 1NFBA 4RR4A 2O7QA 5EMUA 3GKAA 3LXAA 2GJNA 4AF0A 2VFHA 3UWZA 1SUXA 4CNNA 5CPMA 5AFDA 2YFNA 3LCXA 4GC4A 4OU1A 4NXSA 3R12A 3MHUA 3S0CA 3L0GA 1EIXA 3STFA 4N6EA 1OX4A 3OIXA 2FDSA 4HNTA 4W9TA 1R2SA 2X1RA 2B4GA 3HPSA 2ZDRA 5G4EA 3S5OA 1C9DA 4HSOA 3QMTA 3N3MA 4XUGA 3TCEA 3L68A 4MJMA 1KM4A 4ML9A 1KFCA 3HMJG 5C55A 4N9DA 3E96A 1K8XA 4ORMA 3W2NA 3W72A 3S1VA 2ABAA 4GBUA 3P67A 4JDBA 1Q3NA 1NAL1 1G4SA 3U8GA 3C61A 3MBFA 3IGSA 3RNDA 8TIMA 2DZWA 1DV7A 3KRZA 3NQ8A 1LOLA 2VXNA 3ABSA 3W7QA 2HS6A 1OFEA 3WK1A 1E51A 2E1DA 2D73A 4I7WA 2Y6ZA 4EIVA 1XI3A 2C15A 5LHFA 3L0KA 1KV5A 1WBJA 3SGZA 3W9ZA 5IBXC 3TNOA 1SW7A 3S9YA 1KLYA 3L0NA 4NT0A 4RK8A 4FNRA 3CWNA 1GZGA 3TFCA 4JIPA 4RX0A 1OYCA 3G3MA 3PC0A 3W85A 4HPJA 1I2RA 4N6FA 1F74A 3IIPA 1I2OA 3EXTA 2H3DA 2WOQA 2RDWA 3RK8A 3QPZA 4WY0B 3THQA 2WSQA 3H54A 1N8FA 4P61A 5I3JA 1CX9A 3HG4A 2CLEA 1SR9A 1RD5A 5AHNA 2V2HA 3LCFA 3NZRA 3I7RA 3P62A 4MPQA 3DU0A 1XL9A 1S3HA 5I3KA 1K8YA 3MMTA 5CZSA 5HWNA 1R47A 2VELA 4NJGA 4Y8FA 4BI5A 4X22A 4LRSA 2ATMA 2QCMA 1H51A 5E93A 1VLIA 1JR1A 5BMXA 2Q3OA 3NO5A 2DZUA 4JEQA 1OABA 3M43A 2EPHA 3TQKA 3B03A 1JQXA 1GEQA 1AW5A 3PUOA 5DBTA 1H7OA 2ISSA 3BLFA 3C2FA 3MP3A 3FS2A 5H91A 2YSWA 1YXDA 5LNUA 4E2DA 1BKSA 1JCNA 2PC4A 1BTMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3LRL A;  3L2I A;  3LLF A;  1A0E A;  1DXI A;  3ARZ A;  1I1X A;  2GK1 A;  5BCA A;  1R7A A;  4S3B A;  1H11 A;  4E5T A;  6ALD A;  1BD0 A;  2XII A;  4O1A A;  4PMO A;  1UZ1 A;  4CVW A;  3ITY A;  3HM7 A;  1BRL A;  2GJL A;  3FA3 A;  4F79 A;  2VKZ G;  3CUZ A;  5C6M A;  1A5S A;  2VEK A;  4DF2 A;  2J7D A;  3A9I A;  1Q4N X;  3LTP A;  3APT A;  3C2O A;  2QJG A;  4HK6 A;  4HT3 A;  4W7U A;  4C60 A;  1Y5W A;  2ZZ4 A;  3B8I A;  4QDM A;  4DBS A;  1OZM A;  4V28 A;  3VOC A;  5I3H A;  2AMX A;  4UQC A;  4K2S A;  4MPK A;  5CBJ A;  1BWL A;  4QSH A;  2D1Z A;  1RCX B;  4AZB A;  3AYS A;  2OU4 A;  3IAR A;  2Z1S A;  3N3T A;  2PTD A;  1FHV A;  4BF9 A;  4HNV A;  1B3V A;  3UEQ A;  1HJW A;  3GE7 A;  3GO2 A;  2HV5 A;  3CYJ A;  3MMW A;  1UC4 A;  4ZB0 A;  4R7O A;  3LCG A;  4WSJ A;  2DZT A;  1XRT A;  2PWE A;  3U2E A;  3FJ6 A;  1LF1 A;  3OLE A;  1F3E A;  2IQT A;  4OOU A;  3SN0 A;  2WHL A;  1ZNN A;  4UTH A;  2G3F A;  1WDP A;  1FWE C;  3OG3 A;  1T7L A;  3QN3 A;  2WAG A;  4L56 A;  4ERI A;  4M51 A;  3MQT A;  4ICN A;  1VBJ A;  1WUF A; 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