4AZBA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
425
structure length
408
Chain Sequence
NEKLAKKKIVSIDAGRKYFSPEQLKEIIDKAKHYGYTDLHLLVGNDGLRFMLDDMSITANGKTYASDDVKRAIEKGTNDYYNDPNGNHLTESQMTDLINYAKDKGIGLIPTVNSPGHMDAILNAMKELGIQNPNFSYFGKKSARTVDLDNEQAVAFTKALIDKYAAYFAKKTEIFNIGLDEYANDATDAKGWSVLQADKYYPNEGYPVKGYEKFIAYANDLARIVKSHGLKPMAFNDGIYYNSDTSFGSFDKDIIVSMWTGGWGGYDVASSKLLAEKGHQILNTNDAWYYVLGRNADGQGGGNLDQGLNGIKNTPITSVPKTEGADIPIIGGMVAAWADTPSARYSPSRLFKLMRHFANANAEYFAADYESAEQALNEVPKDAIRSLDSNLSRAQQDTIDQAIAKLQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 154
structure length 408
sequence length 425
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4azbA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4azbA01
2XTKA 4NRSA 4KGJA 4H8HA 1QPKA 1CDGA 1EO7A 4YHGA 2J79A 1V6VA 3EMCA 1DTUA 1VB9A 4MTVA 2YOCA 3WENA 5C8BB 4E4PA 2QF8A 3CUIA 3TONA 3WFLA 2C7FA 4GXPA 1FP9A 2AOSA 2YDQA 1HJUA 4TVDA 4M82A 4UR9A 3SUWA 4CCDA 1WZKA 2WAGA 3VMNA 2EO7A 4QCFA 4CVUA 2X8RA 1H49A 2FH8A 4KWUA 3VIFA 2FHFA 2X0HA 1HKKA 1AVAA 2A3EA 2ZUSA 5ABHA 5A8NA 4GI9A 5HOSA 5I0DA 1B3XA 1LJYA 1GHRA 1MXGA 1JNEA 3AIWA 3EDJA 3PZGA 2WLYA 2PC8A 2OYKA 2AMGA 3IJ9A 1Q4NX 3WNNA 1G01A 4V28A 2CEQA 5D9PA 5I5RA 1ZS2A 3FNDA 3ECQA 2YLLA 3WD3A 2FGZA 2WC7A 3QOKA 4DUXA 1H0IA 4ZE5A 4XZBA 2ZXBA 3GXFA 3W27A 3U7BA 4JFVA 3EMQA 2TAAA 3L4WA 3AXHA 4HU8A 1JZ6A 2DSZA 2J7EA 3GBEA 1D7FA 4HMCA 2WMFA 5DMYA 1U2YA 4Z2HA 1ESWA 5I2UA 3OBAA 3THCA 3L4VA 2WMKA 1UR9A 4A3HA 3SCRA 3VKKA 4CD6A 2W66A 5A6LA 2VZOA 4FK9A 1DWHM 3WF3A 5KEZA 1FH9A 2XYLA 1VEOA 1LG2A 4V27A 3WQ8A 1OD0A 2VQUA 2A3HA 3ZJ7A 4B3LA 4M56A 1OIMA 1PPIA 3MKKA 4V2XA 1M04A 3AS3A 1QOXA 2VCCA 4C7DA 3L4ZA 1BFNA 1JZ7A 4W93A 1JZ8A 3QGVA 3AIQA 2VR5A 2WYSA 1W3HA 2J25A 4M81A 3ZQ9A 1H41A 3J7HA 3ARTA 2VI0A 4X0VA 3OB8A 1JI1A 2W5FA 3RIKA 4HMDA 2GSJA 2XIBA 3PZTA 3VIMA 1NOFA 2J77A 5IDIA 1V0KA 3A4AA 1CEOA 1TZ7A 4MB1A 4CCCA 2V5DA 4JL1A 1GOIA 4H2CA 1BVZA 1JI2A 3K8KA 3WEMA 1G5AA 4UOZA 1BGGA 1KBBA 1QNRA 4LYPA 3RCNA 3UCQA 3TTQA 3ZIZA 4AY1A 3WKZA 2XG9A 2VUYA 3PZUA 4DWSA 1HJVA 5A3HA 4PRWA 1NWUA 2XGIA 3CGTA 4J27A 3WQ5A 1K9FA 2J8FA 4J3TA 4AIOA 3S6TA 1F4HA 1EHNA 2E3ZA 2VVSA 4AZCA 1XSIA 2EPNA 6CGTA 4EANA 4UFLA 1VFMA 1EA9C 1JNDA 4MNJA 1OT2A 2GDVA 4M29A 5D8ZA 1C7SA 2UY4A 2XGBA 1KWGA 4GQRA 4PSPA 4D6IA 1QNSA 1UG6A 2PWHA 3AHZA 2VZSA 3VGBA 1UZ4A 2GJXB 3I3DA 1ZB5A 2DEPA 2NSXA 2JF6A 1J0IA 1PZ2A 2D2OA 1CXHA 1WNOA 3CO4A 3CUHA 1US2A 2YJQA 4Y7EA 1IZJA 5A6SA 1GUVA 1OSEA 3OLDA 2W63A 4FZPA 1FFQA 4Q7NA 3FAXA 3A3HA 1ISYA 4OOUA 3WDRA 2WCAA 3CUJA 4HMEA 4GZJA 2W61A 1V02A 2WHJA 4QLKA 3F5KA 4P7RA 3F4VA 1RD6A 1XSJA 1QI2A 1UKOA 3SCTA 2BVTA 3VNYA 3TA9A 1GQIA 3N12A 3OIHA 5A95A 4L4PA 5M03A 3QHOA 2ZX8A 3WD1A 5IFPA 1MQQA 1ISXA 1E0WA 1JFXA 2WC3A 2PBGA 1NOWA 4R5EA 1BSIA 1C8QA 4BQ2A 5F7UA 4RE3A 2OSYA 1JG9A 3B9EA 3IJ8A 5CPSA 2B31A 4UOJA 3ARXA 3VINA 3IK2A 1KGWA 2XFRA 4WIWA 2D20A 4JAWA 1BAGA 5LA2A 1W2PA 2X1IA 3O6AA 1V0LA 5IFTA 4KMQA 4X0NA 4R27A 3VM7A 1WCGA 1KXQA 1W91A 3W0KA 4Z2KA 2CCRA 3W53A 4W84A 4D71A 3SCPA 1W9UA 3VMPA 4AD5A 3AMDA 1RP8A 2D3LA 2WWCA 3BAKA 4UFHA 4AZHA 3WY1A 4PMRA 3VD7A 4JFWA 4UQBA 4BF7A 1W9XA 3HMCA 4EK7A 2WC4A 1CWYA 4AXNA 1TA3A 4D1JA 2VRKA 4CCEA 3WN6A 3LPGA 5JBDA 4C7FA 4F66A 2D0FA 1FOBA 4AZ7A 4UFKA 3WEOA 1UWUA 1EQPA 1VRXA 5A2AA 2OWWA 1L8NA 3ZJKA 4P7OA 3BSHA 2O9PA 3APGA 3D5HA 5A6MA 2VR4A 2EPKX 3ZSTA 3GDBA 3G6LA 1JXKA 5HXMA 1J12A 2XJ7A 4PMOA 5CJ5A 1KQZA 2CERA 3MV11 1SMAA 2PWFA 2Y5EA 4D6HA 2W62A 1C91A 1NM9A 1Z32X 4YPJA 1CXLA 3W26A 2WVTA 3FN9A 1V6YA 2VMFA 5CLTA 1W1YA 1W3KA 3AFBA 2DT3A 1QI5A 1HKIA 1Y7VA 2O9RA 3AOFA 2XUCA 2EPLX 2GK1B 1FHLA 1BYAA 9CGTA 2XFFA 2XVPA 2CPUA 2W4XA 1G94A 1LLOA 3VX0A 2ZE0A 3WFZA 3DECA 4JKLA 1FH7A 1PIFA 1XH1A 4ZENA 2YDRA 1NWSA 2CITA 4DWSD 1IV8A 3KL3A 4ATDA 5LA0A 4QLLA 1Q6DA 2W67A 1MXDA 1W9BM 2G3MA 3DYOA 4P8UA 1WZMA 2V38A 3ZM8A 2NW0A 3BC9A 3WMCA 4PMNA 4HOZA 3K46A 2BHZA 2WCSA 2CHNA 4WKAA 3AMLA 4OJYA 2ZWYA 1QBBA 5GPRA 1V0NA 1JXJA 3BAXA 3W25A 4BQ3A 1CZ1A 2QMKA 4ACYA 2ZX6A 5JUVA 1X6NA 4TVCA 2OO2A 3OLGA 4ZFMA 4BQ5A 2OZNB 1YQ2A 1UD4A 1B3WA 3W82A 1WKYA 4W85A 4UTFA 2YBTA 3OGVA 3PTMA 2UY5A 3N11A 3ARSA 1PAMA 3CH9A 3IAPA 3TTSA 1BYCA 3N04A 2ZX9A 2VOTA 1OT1A 1MW3A 3MSGA 4D72A 2J7BA 3E1F1 1H4PA 1H11A 3PZOA 3VIPA 3PZIA 3WH9A 1W1PA 3GBDA 1DWFM 4EE9A 4UQ9A 1VIWA 1OM0A 3AJ7A 2XM2A 4AIEA 1W3JA 3L4UA 1C7TA 5A69A 3ARYA 3L4XA 1OGBA 1X6LA 3AIVA 4ATWA 3B8SA 1HP4A 4MNMA 1QI0A 3WQ4A 1JD7A 3VVGA 4TX8A 2DSVA 3FAWA 3NJ3A 2WHMA 1UKQA 2PMRA 2ZXDA 1B1YA 1JL8A 1NP2A 2VX6A 3DYPA 3VDBA 5AYBA 5BXPA 2JEPA 5BXTA 2WBGA 5CZKA 2GUYA 5M3WA 1GVIA 5ABFB 2ZUTA 2WLZA 2CHOA 3VGEA 3WMBA 1WZAA 2WZEA 5IHSA 3OLIA 1Q6CA 1HJQA 1VBRA 5FIPA 3S2CA 1KCKA 3CZKA 3W37A 2WSPA 3AIRA 1JYVA 2QHAA 5BCAA 1V6XA 1DWJM 1J0JA 2GFTA 4PMDA 1LWHA 4GZEA 1OBAA 3VD9A 4JCLA 4S3KA 4PYSA 3VU2A 1H09A 1GJUA 1UQZA 5I77A 1CXKA 1JGIA 2X2YA 2DGAA 4TOQA 1EGZA 3GZAA 3RM8A 5DEZA 2GDUA 4N42A 2NT1A 2F61A 3K4AA 3SCVA 1SR0A 3ZO9A 4U33A 1YHTA 4PUDA 1EDQA 5A8OA 3QHMA 4JHOA 1PZ3A 1FHDA 2GJXA 3WQ6A 4GKLA 1AQMA 1SMDA 5EBAA 5LYRA 1D2KA 1K9TA 2WSKA 4H7VA 4GPNA 3LMYA 3WNLA 4WF7A 3PZ9A 1ZL1A 1CBGA 5KZ6A 3WNPA 1CPUA 2WKLA 3T2PA 1KWKA 3BGAA 3WUFA 1ZU8A 2BVDA 2J78A 2J74A 3ZSSA 1R85A 1G9HA 1B3YA 2WVUA 1ZBWA 1UWTA 3NSXA 1QNPA 4BS0A 1UH2A 3UEQA 2WHLA 2G3JA 3K1DA 3LPPA 1E43A 3FHAA 3IANA 4FLOA 2PF0A 1KR1A 4ZEPA 2ZUVA 5CGTA 5C70A 1UD3A 1VFOA 1V03A 2BFGA 5BXSA 1CLVA 1QVBA 3SIMA 3DYMA 4YN5A 1E70M 2ZUWA 1GW1A 1BTCA 1UR0A 1XD1A 3BMWA 3F5JA 3CMJA 4AIUA 2BVYA 2XSAA 4IM4A 3CHDA 2WVSA 4JKKA 4AISA 1J18A 3GH4A 1UOKA 1UR1A 1XH2A 1J10A 2CETA 3EMZA 1JIBA 3KZSA 2VT0A 1E9LA 1E73M 4ZE4A 1QW9A 3NIYA 3QR3A 3BAYA 4UZSA 4LQ1A 2XIIA 1HT6A 1CGYA 1UD2A 2WNWA 5LA1A 1EO5A 4QAWA 5D9OA 3MUAA 1HF6A 4CN6A 3TTYA 1J11A 3OZPA 4DUVA 3SUTA 1BLIA 2V3EA 3VDAA 1JFHA 1ISWA 4P7LA 4AW7A 2G3IA 4U2YA 2PI6A 4OOZA 3WL1A 3N9KA 3NDYA 4AD0A 3AHTA 5FKYA 3CZJA 3VM5A 6TAAA 1XHGA 1TE1A 4WK9A 4D6DA 2WMIB 1AQ0A 2BY0A 3AS0A 1C8YA 4JIEA 3M6DA 2HISA 3A47A 1EXPA 2E9MA 4J3WA 4RL3A 5FD0A 1QI4A 4CU7A 5A2BA 5EMYA 1CENA 3W81A 1UR2A 5TD4A 3VD3A 2QMJA 3WSUA 1E6QM 1DEDA 2PWEA 2WZIA 4PMVA 4UOQA 1HX0A 2DT1A 4EAMA 2GK1A 3B9DA 3GH7A 2VQTA 1UA7A 4LX4A 2XFYA 1E4NA 3PBGA 4D6CA 3AZRA 2PWDA 1MW0A 2J75A 2ZIDA 1JF5A 1UWRA 4PSRA 2YL5A 3KWXA 3BCFA 1SFSA 2XWDA 4W8LA 3WD4A 4H41A 2QPSA 4JFUA 5D8WA 4DM1A 1XH0A 3WUEA 1UH3A 1HP5A 3AQUA 1KFWA 2E4TA 1HJSA 4LGXA 2V3FA 2E40A 1BG9A 2ESCA 4IISA 3FY1A 3GYCA 4MNKA 2XVGA 1IZKA 2C0HA 4DUWA 1KXVA 3ARWA 4B9YA 3MUIA 2WWDA 4HZ8A 1W9VA 4BCEA 4EKJA 2VTFA 3ARVA 5FL1A 2DSUA 1US3A 1EIBA 1ITXA 2WW5A 2X05A 4PTMA 6A3HA 4W88A 7CGTA 4XB3A 1XYFA 4B9ZA 4CU6A 3AHXA 2J7GA 1V3HA 4AMCA 2PB1A 3L2LA 5BYWA 1MVYA 4TX6A 2CKRA 4FLQA 1LL6A 4WKFA 3LPOA 3BAJA 3OGSA 5A6JA 1B2YA 1GOKA 1WDQA 2VX4A 1E3XA 2YA2A 2FHCA 4MDOA 1R87A 1UD5A 1E0XA 3T2QA 4W87A 3SCNA 3VD5A 2EQDA 4OBSA 5A8MA 3AHYA 4AZIA 1AQHA 1PX3A 4HPGA 4C7GA 2BY1A 4TTUA 4CD5A 3U57A 3L2MA 4CN1A 4Z2JA 1DP0A 4AYSA 1LWJA 3VGHA 1WZLA 2D1ZA 3WH5A 1E6ZA 3WBEA 2OSXA 2IXVA 3CHCA 1CNVA 2YLAA 4PMZA 3UG5A 3T08A 2W92A 4P8VA 3UERA 3GXIA 3KE0A 2NT0A 3MMDA 1NQ6A 5IHRA 4DWSC 5ABFA 5CPTA 3BLKA 1FA2A 3MU7A 2CESA 2VZTA 2D3NA 1XD0A 3UG3A 1R8LA 3SCWA 4J3UA 4CU8A 1GQKA 2J7CA 3ZJ6A 5FOOA 4ATLA 1Q6GA 5DF0A 2X09A 1GQLA 1KR0A 4P7QA 3T0BA 2CBVA 3BAWA 4J28A 2J7HA 2WM0A 3PZVA 5E0CA 1E5JA 3QHNA 4KRUA 1Q6EA 2JNKA 1MFVA 3THDA 3WF2A 1C3FA 1J0KA 5CGMA 4W8AA 2BXZA 2VO5A 1HXJA 2G3NA 3IAQA 4PCTA 5GQBA 1UWSA 1GJWA 3RM4A 1HN1A 3GH5A 1WPCA 1V0MA 1PEZA 1GCYA 1NP0A 3L4YA 4PMYA 1W9DM 4YHEA 2YL8A 2G41A 5I24A 1KXTA 1O6IA 2OYLA 3K4DA 1BHGA 4KRTA 2O9OA 2XVNA 3BSGA 4XX6A 2XVKA 2V5CA 1W32A 3VIJA 3TTOA 2VZVA 1CXFA 2CBIA 2ZUUA 2JFEX 2DIEA 4QCEA 3U5YA 3D3AA 8CGTA 3AIEA 1OGGA 1L0PA 3SCOA 2BHYA 4XUYA 4W7UA 2VCBA 3GNRA 2DH2A 3AROA 1A3HA 1XC6A 2ZUNA 4HA4A 5CQ1A 3GNOA 1WDPA 4PTXA 1GOMA 5I79A 1UA3A 3ARRA 4GI8A 5CXPA 4B16A 3FW6A 3VIIA 1BVNP 1WDRA 3VIKA 4NSBA 3U5UA 4E8CA 2ZICA 2Y8KA 5ABEA 5HPOA 2V3DA 3QOMA 4CN4A 4UFJA 4J3SA 2BV9A 2WK2A 7A3HA 4U2ZA 1NH6A 3WUBA 2EBNA 3K8LA 3MUZ1 3WELA 1KGUA 5BRQA 1FFRA 3SUUA 3RM9A 4A4AA 3AYSA 4WJXA 3WIJA 7TAAA 1W1VA 2F8QA 3WDHA 1LL7A 3EBVA 2CXGA 3RMEA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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