4AZCA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
419
structure length
416
Chain Sequence
GSHMEKLAKNKVISIDAGRKYFTLNQLKRIVDKASELGYSDVHLLLGNDGLRFLLDDMTITANGKTYASDDVKKAIIEGTKAYYDDPNGTALTQAEVTELIEYAKSKDIGLIPAINSPGHMDAMLVAMEKLGIKNPQAHFDKVSKTTMDLKNEEAMNFVKALIGKYMDFFAGKTKIFNFGTDEYANDATSAQGWYYLKWYQLYGKFAEYANTLAAMAKERGLQPMAFNDGFYYEDKDDVQFDKDVLISYWSKGWWGYNLASPQYLASKGYKFLNTNGDWYYILGQKPEDGGGFLKKAIENTGKTPFNQLASTKYPEVDLPTVGSMLSIWADRPSAEYKEEEIFELMTAFADHNKDYFRANYNALREELAKIPTGYSKESLEALDAAKTALNYNLNRNKQAELDTLVANLKAALQGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 166
structure length 416
sequence length 419
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4azcA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4azcA01
2VX4A 3OZOA 3WEOA 5LA1A 3W29A 4D6HA 5JIPA 2OSYA 3NYDA 2UY3A 4NZCA 1A3HA 4JFTA 4LPCA 2EPOA 1QI4A 1C3FA 2F2HA 1JZ2A 1M7XA 5LA2A 1HVQA 1TR1A 5C71A 3MO4A 4UQCA 2ZX5A 1R86A 1Q6CA 2ZUSA 2CXGA 2VVSA 4CD8A 4ZEPA 1AVAA 3BLKA 3WNMA 1W1PA 3AZRA 3SUSA 1EDTA 5CGMA 2D0FA 2WVSA 4J3TA 2WHJA 1U30A 1WDPA 3VIMA 2FHBA 3EDKA 3VUPA 4M81A 3N15A 2NW0A 1CXKA 3RILA 1CPUA 1JXJA 2CEQA 4AEEA 1D3CA 3CZLA 1NWSA 3T2QA 3AMLA 1K9DA 4OOZA 1GOQA 4PTXA 3T2PA 1DWIM 1EGZA 3AHYA 4FK9A 2O9TA 3TTSA 3MV01 4HPGA 3TP4A 3WF2A 2CKSA 4ZENA 2YIHA 1E0XA 3WMSA 1E4LA 2ZXAA 1JNDA 4W7UA 2GJXA 1OIMA 3OGSA 3WD4A 3AIRA 4JL2A 4OBSA 4CCCA 2CETA 3NDZA 2VQTA 2DQXA 2E3ZA 1V3JA 4FLQA 3VM5A 4R27A 3M6DA 2VX7A 4WSJA 5DT5A 4IISA 6TAAA 4NSBA 4UOJA 4EANA 1VENA 1J0IA 1JDCA 1UR9A 1ZS2A 5A6AA 4M80A 1CXIA 1E43A 5D8ZA 3RO8A 3AIQA 2VZOA 1X6NA 3VD7A 5BXRA 4PMXA 1BLIA 3CGTA 1HKMA 3EDEA 2DSKA 2A3CA 3CZGA 3AS3A 3IAPA 1TVNA 1JD9A 2UWFA 1DWFM 4MNKA 1JFHA 2A3HA 3WQ6A 2WC7A 4WK9A 1JAEA 2J77A 5HDRA 4HA1A 2VT0A 1TVPA 1KR1A 5CZKA 2E40A 3BLPX 2BVDA 4B16A 1W3LA 2WHLA 2ZUMA 2GFTA 1NM9A 4B9ZA 2WMIB 1W9XA 1WDSA 1XCWA 4YN5A 3EBVA 1KQZA 2EQDA 1CTNA 2ZWYA 5A1AA 3PTKA 1QI0A 3ZOAA 3SEPA 1E73M 4NRRA 5BCAA 5I78A 4AC1X 4TXEA 1EA9C 1D2KA 1KGUA 1HT6A 5JBDA 1HJWA 3OGVA 2CBIA 4AZIA 1FOBA 2JNKA 2E4TA 3OGRA 1G5AA 2JE8A 4AEFA 2ZUWA 2PMRA 4QDMA 1UA7A 2WMGA 1B0IA 2JEPA 1OGSA 3FAWA 3VKKA 3MUY1 1TG7A 1CLVA 1UD4A 3TONA 1KQYA 3AS2A 4J3XA 3WDPP 6A3HA 4PMVA 1E3ZA 2V5DA 1HP5A 4P7NA 3WH5A 3WD2A 2CBUA 3ARWA 1UR2A 3UG3A 3EDDA 3WL0A 4M56A 3AHZA 4AZ5A 1E6PA 3CMJA 1CGVA 2CYGA 1G1YA 5JUVA 2XVNA 3VD4A 3SCPA 1W1TA 2JIEA 2VZVA 4V2XA 3A47A 5D9PA 1V02A 2E9MA 3FNDA 3FHQA 2VO5A 2WC3A 5A6JA 4GQQA 3TOPA 2DT3A 3WDRA 1G94A 3AS0A 2OO2A 1I1XA 3BMVA 4TX8A 5HNNA 4PN2A 4AWEA 3AIWA 2EPMX 3KEHA 5BXSA 3QOKA 2X0HA 3MMUA 3VD9A 2XUCA 4RL3A 3F5KA 3PZQA 1SR0A 1GNXA 1ZBWA 5CPSA 1E15A 4KMQA 2J78A 1JZ3A 1HJQA 3KL0A 1ZBKA 1GQKA 1C93A 1W9PA 5I0DA 3GXMA 1Q6FA 3MU7A 1PX3A 1JDDA 4XZWA 2BV9A 4U5IA 1VB9A 3RDKA 3N11A 4Z2KA 1E40A 3MV11 1CDGA 2DEPA 1QNSA 1B31A 3ZO9A 4PCSA 2O92A 2EEXA 1UD8A 2AMGA 2D20A 2WVVA 4UQAA 1LWJA 2J8GA 2YA2A 1FFRA 2JF7A 2ZXDA 3SCWA 1WKYA 1R7OA 4EKJA 5KZ6A 3M7SA 3VIJA 3VDBA 1S46A 1KXTA 2WMHA 3PZTA 3BAXA 1XSJA 2GDVA 2W4XA 1V6YA 1C8YA 4J3UA 3CUGA 1JZ6A 5F7UA 2OWCA 3GH5A 5JBEA 1BFNA 4HU0A 4GO9A 1RP9A 4J28A 3ALFA 1NOWA 1D7FA 2W66A 3CHFA 1X6LA 4URIA 3VIPA 2PBGA 2XG9A 1UG6A 1KWKA 2BY1A 4TTGA 2XM2A 4EE9A 3SCOA 1CYGA 1SMDA 3W0KA 2J7HA 5CJ5A 4CU6A 1F4HA 3LPFA 5CPQA 2VCBA 3PZOA 5CPTA 4UFLA 1EHAA 3RM9A 4NF7A 5EMYA 1BTCA 1VEOA 2WKLA 1WZKA 1KXHA 4DUXA 2D2OA 2BVTA 3AOFA 2PC8A 4M82A 3CUIA 3BAIA 4EAMA 5HPOA 4LQ1A 2G4FA 4E8CA 1ISXA 1B3VA 1KXVA 5I23A 2D3LA 5IHRA 1VEPA 5ABEA 1OCQA 1CGUA 2O9RA 2PWDA 4OKDA 3RPMA 5ECUA 1UH2A 2OLHA 4WF7A 3QHMA 4UFIA 3EMZA 1UR0A 1CXFA 2BHUA 1QOXA 4WKAA 1TE1A 2GJPA 4RE2A 4OUEA 1UKTA 2G3JA 3HN3A 4MB1A 1GQIA 3AHVA 3UESA 1IZKA 4MAZA 4MNJA 2CPUA 3SUTA 1NOUA 3VU2A 4W84A 1BSIA 5D4YA 2Z1KA 1UA3A 3NIYA 4D6EA 1SFSA 5DEZA 3GDBA 1J11A 3I3EA 1V03A 2VJXA 5E9AA 1JI2A 1BQCA 5A6LA 1JGIA 2J7GA 3MSGA 1UOKA 5A69A 5GNYA 1BYDA 4W89A 2CHNA 3PN8A 3NCOA 4UFHA 2EPKX 1H41A 1JI1A 1J0KA 3VGFA 4AISA 1Y7VA 1OWQA 2DGAA 2YL8A 3WH9A 4IPNB 5EFFA 3MMDA 4H04A 1XH1A 2ZE0A 2F8QA 1FHDA 1E1EA 4E4PA 3ARTA 4P8VA 2J47A 4CU7A 1C8QA 1J0ZA 1UD3A 1KBBA 2W63A 3WD1A 3VDAA 2J7DA 4XB3A 2V3FA 1UD6A 2JIWA 3N1AA 4KGJA 3ZR5A 1BHGA 4MPKA 3ZMRA 3POCA 5GQBA 1KWGA 2VRJA 1HJXA 4GZIA 3K46A 3FHAA 1CENA 2PB1A 2J74A 3OZPA 3WNKA 1UUQA 1NARA 4W93A 2YDRA 4H8UA 1QVBA 4HZ6A 5A8PA 3K8LA 5AY7A 3WD3A 1IT0A 2QMJA 2ZWZA 2XSAA 4Y7EA 1E5NA 3WKZA 4AIUA 1M01A 1R8LA 3CHCA 4MDPA 4GO8A 4PRWA 2OYMA 1E0WA 1CEOA 3GYCA 1ZU8A 4Z2GA 2J7BA 1UWRA 1BAGA 1H0IA 2VI0A 2XWDA 3VIKA 1J10A 1TA3B 1UYQA 2FH6A 3DC0A 3A6OA 3DYOA 1QNPA 1QHOA 1J12A 4DWSA 3S2CA 3O2LA 1LL6A 4UOQA 5CQ1A 4MB3A 4Z2HA 2MANA 1CECA 1R7AA 3AHXA 2YBTA 6CGTA 3F5JA 2YL6A 1E5JA 4M29A 5I3DA 4YHGA 3ZT7A 4AZ7A 5FCZA 2D23A 1SYTA 1WB0A 1DWAM 4HP5A 3WH6A 4JAWA 4ML4A 3VNYA 2EXOA 1BYBA 4AIOA 4IUGA 3ZQ9A 2DPEA 3CLWA 4GI6A 4W87A 4TVCA 1GW1A 3ARQA 3FAXA 2J8FA 2VTFA 1LLOA 1UWTA 1LG2A 2VOTA 1PZ3A 5M5DA 1JXKA 2E0PA 1GOWA 3CO4A 3MMWA 3EDJA 1MYRA 3T2OA 1LJYA 1V3KA 1UKQA 1MVYA 4MB4A 5A2AA 4AD1A 3WNNA 2VC9A 2DIEA 4CCDA 5A8OA 1J01A 3AS1A 5GPRA 1RPKA 2BXZA 1ZL1A 1JG9A 4AZHA 3WFLA 1NWRA 2ZUVA 1JF6A 3WUEA 5ABFA 3CZ8A 3WFZA 2EPLX 3AIBA 1JZ5A 1GQLA 1VRXA 1KBKA 5A6SA 1QI5A 3WDIA 1KCLA 2CBVA 1PBGA 3WEZA 3AISA 4CUCA 1HJVA 1H2JA 1QW8A 1CGYA 3KWXA 4D6DA 4UFKA 5DO8A 4GQRA 2WANA 3B9DA 4H8HA 4IPLA 5IXEA 1VFOA 5I2UA 1W9BM 2XTKA 3AZTA 2YJQA 1NQ6A 3ALGA 1PX8A 4UCFA 1VAHA 3EMQA 1E6RA 3RM8A 2OWXA 2QHAA 1BVZA 3T0AA 5BXTA 3PZIA 1H49A 3UETA 3KL3A 4CGTA 1J0YA 3M07A 4E8DA 1J0HA 1ODUA 2X0YA 3K1DA 3L4ZA 4HA3A 4MB5A 5JBFA 3AYSA 2O9PA 3OLGA 3ARYA 3VMOA 3WDJA 1GVIA 4JKLA 4MJ4A 2FHFA 2QF8A 1MW2A 3UEQA 2X1IA 1FH9A 2NT0A 4D72A 2E9LA 3F5LA 3VD5A 1CXLA 2W61A 2RGMA 1CZ1A 1VIWA 4CD4A 1WZLA 3VM7A 3BSHA 1V0LA 4H2CA 3AFBA 2A3BA 1OGGA 3CZJA 1GPFA 1K9EA 3I3BA 4JFSA 3FN9A 1JIBA 1X1NA 3VILA 4JFVA 2ZX8A 4A3YA 2VR5A 5FL1A 1ECEA 1DEDA 1Q6GA 3G6MA 2CNCA 1BVNP 3O6AA 1DHKA 4P7QA 1HKJA 1V0KA 2WM0A 3VVGA 1BGAA 1W2PA 2BY3A 4QLLA 2TAAA 1WAWA 2CITA 1UKOA 1JNEA 2CIPA 1HF6A 4P8WA 1JYXA 2XHYA 1WE5A 2GK1B 2OSWA 1QBAA 1RD6A 3W4RA 3EDFA 4UZUA 1M03A 3K4AA 2YL5A 4B9YA 3NUKA 3A3HA 1XSKA 2FGLA 8A3HA 2GSJA 3GNRA 1CIUA 4GKLA 3BGAA 3VDCA 1XYFA 4X0NA 1XRVA 2Z1SA 4UQBA 2F61A 1V3LA 4N42A 4PMDA 1NP2A 1W32A 3L4XA 3MS8A 5DMYA 1C92A 3AIVA 1JD7A 4PUEA 2J7CA 1PAMA 1RH9A 1H4PA 1V0MA 3GXIA 4BCEA 4AW7A 4F79A 4Z2IA 1W9UA 2RGLA 4QCEA 4P8UA 1CGTA 1TA3A 4ZXOA 1W1VA 1EOMA 3WDQA 3M46A 2WZHA 3AHTA 4U31A 3L4UA 3KZSA 3WNLA 2WMJA 1JYVA 1O6IA 1B90A 3AQUA 3W26A 3ARPA 3U5YA 3MUAA 4JKMA 3AMDA 2GUYA 1WP6A 2J25A 3WQVA 4U2ZA 3U5UA 3LPGA 4DM1A 1EO7A 3U57A 1EHNA 2BXYA 3K4DA 4PBGA 2X2YA 1GJWA 3S6TA 1VBRA 2D22A 2YLAA 3BAYA 3SCVA 2YDQA 3NDYA 4PMYA 2WHMA 1K9FA 1W1YA 3ARZA 1NH6A 4XX6A 1LG1A 4CN1A 3GZAA 3W6LA 4HOXA 5M17A 1DP0A 1AQMA 2XPKA 1FH8A 1MQRA 2V5CA 4HOWA 3SUWA 1E0VA 3WF0A 1ZB5A 3BAKA 3SCSA 2PI6A 2G3IA 1XC6A 3LMYA 1WZMA 4PMRA 2DSUA 4P7RA 4HU8A 4UOZA 1E56A 4A4AA 1ZJAA 4FMVA 3U7VA 1UWUA 3RJYA 5EB8A 3B8SA 4ACYA 2WCGA 1H1NA 2VZSA 4JHOA 3WF3A 2DT1A 5HOSA 1ESWA 1GZJA 4OIFA 5A6BD 3PHAA 5AC4A 5C8BB 3WBEA 4H41A 4AXNA 2GJRA 1MQPA 3CHEA 2ZUTA 1P6WA 2BHYA 1BYAA 2XFYA 1H09A 1AQ0A 1MW0A 2ESCA 1XCXA 2WVTA 1PJ9A 1ISWA 4JL1A 3B9AA 1E6QM 3VOCA 1JAKA 4WKHA 5A95A 4JCMA 1H11A 1XH0A 1V3IA 1SMAA 5HXMA 1ODZA 4ATDA 1I1WA 1B2YA 1MW1A 4LX4A 2XYLA 4PYSA 4H8VA 1GONA 4KRUA 1H3GA 2QPUA 2V3EA 1E1FA 2DSVA 3VIHA 3U7BA 2FH8A 1ZJBA 1IV8A 1LF1A 4A3HA 5JIWA 1ISVA 2VZUA 3MKKA 1J0JA 1TCMA 1OBAA 1GOMA 1UQZA 5EFDA 1CLXA 1E3XA 1E4NA 2VQUA 3AJ7A 3VIIA 2WZEA 4GZEA 3RMEA 1PIGA 1JYNA 3WDHA 2VNCA 5CLWA 2CESA 1JFXA 1OB0A 2ZUNA 3WEMA 4B15A 1OIFA 1QNRA 1EIBA 1E6NA 1XD0A 4GXPA 4P7LA 2VR4A 2WZIA 1E6XM 4R5EA 4J3VA 1V3MA 3AZSA 3QGVA 2OYLA 3L2MA 4ZFMA 3PZVA 1G01A 1HKIA 2XIBA 1C90A 1EO5A 2WMIA 1V6WA 3THCA 3SCTA 3VO0A 2WHKA 4F9JA 3UR7A 1MFVA 1E70M 1IZJA 4OBRA 4UQDA 5FIPA 2DT0A 4AZBA 1C91A 4YPJA 3L4TA 2VX5A 4AZCB 4TUFA 4WSKA 5CSUA 4JFUA 1ZBVA 3BCFA 2E9BA 1E4MM 4BQ2A 3IJ9A 2ZXBA 3VX1A 3N04A 4FLRA 1K6AA 2ZUUA 2CKRA 1B3XA 3NSMA 1OSEA 2WCSA 4PCTA 1JZ4A 4S3KA 2Y2WA 4OJYA 4ACZB 3A4WA 5ABHA 1U2YA 2WLZA 1UWSA 1KB3A 1UQYA 4AY1A 3GBEA 1QPKA 4W7VA 1LL4A 2PWGA 3WH8A 3WELA 4CVWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1X1O A;  3WEO A;  5LA1 A;  4HSO A;  4FNU A;  3KM8 A;  4AX6 A;  4JFT A;  2YZR A;  2F2H A;  5L9F A;  1WYI A;  4LB3 A;  2ZZ3 A;  4N9D A;  3UWY A;  4O1B A;  1FY6 A;  4AAJ A;  4V1Y A;  1Q6C A;  2ZUS A;  3UY7 A;  1GTH A;  2VVS A;  4ZEP A;  2GJN A;  2CW6 A;  1EDT A;  3BLI A;  4F4R A;  3H2M A;  1ICQ A;  2WVS A;  1U30 A;  2HRW A;  1QWK A;  3XIS A;  1AA1 B;  3GHS A;  4JWE A;  1JXJ A;  2CEQ A;  3DGB A;  4ILS A;  3LEP A;  3P84 A;  3T2Q A;  4OOZ A;  3C2O A;  1YDY A;  5F2G A;  1DWI M;  3VFC A;  5D37 A;  1YDO A;  2O9T A;  1TV2 A;  2DZX A;  4HPG A;  3TP4 A;  3DFT A;  2VDG A;  2CKS A;  1IXN A;  4NZ5 A;  1XC4 A;  2RDT A;  1E4L A;  3WMS A;  1JND A;  4GNJ A;  3QLL A;  3G8R A;  3Q4D A;  4HJF A;  4GC4 A;  4LAN A;  3WD4 A;  3C2Y A;  3SEC A;  2CET A;  1R5E A;  1N7K A;  4WGX A;  1V3J A;  4FLQ A;  2G37 A;  3GC5 A;  3G22 A;  2VX7 A;  5DT5 A;  3E0I A;  1Z69 A;  6TAA A;  1H51 A;  4WD0 A;  1JDC A;  1ZS2 A;  4M80 A;  2OTD A;  3AIQ A;  3U2E A;  3TAK A;  4PMX A;  2NV1 A;  3CGT A;  1HKM A;  1YBQ A;  2PDI A;  1HKW A;  3AS3 A;  3UFY A;  2ZC1 A;  3GD6 A;  3T40 A;  4LH8 A;  3M0Z A;  1ICS A;  3NQ7 A;  4MZ8 A;  4WK9 A;  2J77 A;  2IS7 A;  5HDR A;  4L4M A;  5B80 A;  1KR1 A;  4I7V A;  2E40 A;  2HXT A;  1R30 A;  2ZQ0 A;  2ZUM A;  1A5C A;  3I7Q A;  4NKC A;  1W9X A;  1ZUA X;  1XCW A;  3QNJ A;  1DQW A;  2ZWY A;  4JQ1 A;  1KKO A;  2CLM A;  3V4B A;  4YCP A;  4TXE A;  3R10 A;  1EA9 C;  3H22 A;  1KGU A;  2BAS A;  3GDM A;  1POJ A;  1JUB A;  2PLM A;  5FJJ A;  1OX6 A;  5HME A;  4DB7 A;  2JE8 A;  2PMR A;  2ZZ5 A;  4LNY A;  2BB0 A;  3KRB A;  3WLP A;  2PRH A;  3FAW A;  1JUL A;  3MUY 1;  3HMJ G;  1LUC A;  1TG7 A;  1UD4 A;  4B5U A;  2HRO A;  3TON A;  1DXI A;  1KQY A;  4O10 A;  3UZJ A;  3WDP P;  1C9W A;  4DQW A;  5DCD A;  5DCE A;  1VYP X;  3LRL A;  4P7N A;  4UC5 A;  3WL0 A;  3QF0 A;  1UJP A;  4AZ5 A;  3N19 B;  1F05 A;  1SPQ A;  1YNY A;  5CC6 A;  2IPW A;  4FR6 A;  5PTD A;  3C0Q A;  1FWT A;  1K4H A;  3GUW A;  1KNW A;  3EEG A;  4QJ3 B;  1W1T A;  2BDQ A;  2VZV A;  1V02 A;  4GLE A;  3M1Z A;  3PUO A;  1I0B A;  1M5W A;  2WC3 A;  5A6J A;  2IQT A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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