4B3K | Genus

Total Genus 185

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	185
sequence length	461
structure length	461
Chain Sequence	LAFPKEFWWGGATSGPQSEGRFAKQHRNLFDYWYEEEPDLFYDYVGPDTASDAYHQIESDLTLLASLGHNSYRTSIQWTRLIDDFEQATINPDGLAYYNRVIDACLANGIRPVINLHHFDLPIALYQAYGGWESKHVVDLFVAFSKVCFEQFGDRVKDWFVHNEPMVVVEGSYLMQFHYPAIVDGKKAVQVAYNLALATAKVIQAYRRGPAELSDGRIGTILNLTPAYPASQSEADMAAAHFAELWNNDLFMEAAVHGKFPEELVAVLKKDGVLWQSTPEELALIAENRVDYLGLNFYHPKRVKAPDAIPVISPSWSPEWYYDPYLMPGRRMNVDKGWEIYPEAVYDIAIKMRDHYDNIPWFLSENGVGISGEDRYRDETGQIQDDYRIQFLKEHLTYLHKGIEAGSNCFGYHVWTPIDGWSWLNAYKNRYGLVENNIHTQVRRPKASAYWFKKVATHNRL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	BETA-GLUCOSIDASE
publication title	Structure and Activity of the Streptococcus Pyogenes Family Gh1 6-Phospho Beta-Glycosidase Spy1599 pubmed doi rcsb
source organism	Streptococcus pyogenes
total genus	185
structure length	461
sequence length	461
chains with identical sequence	B, C, D, E, F
ec nomenclature	ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date	2012-07-24

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4b3kA00

2XGBA 3VX1A 3BMVA 3WFLA 2WMFA 4JFTA 4FK9A 1E5NA 2E4TA 1E6PA 2V38A 4GINA 3SCOA 4P8WA 2O9RA 3QR3A 1HKMA 2EPNA 4JFWA 2V3DA 2X1IA 4V27A 1WAWA 2PBOA 2XM2A 3BMWA 1B0IA 1NWSA 5A69A 3AFBA 3IK2A 2OYLA 4AIUA 2VCCA 5A1AA 1K9TA 4Z2IA 3DYPA 4CD6A 4JKMA 3ALFA 4OKDA 1B1YA 4L4PA 3EYPA 4QLJA 3MUAA 2WCGA 2YOCA 4Z2GA 1JD9A 3VIFA 4D72A 1KR0A 3KL5A 5FKYA 2CBIA 3CPUA 1I1WA 1TMQA 2WHKA 1KQZA 1UG6A 3WQ6A 3WQ4A 1WZKA 4GO9A 3WELA 1ZJAA 3AHXA 3UESA 1V08A 3EDEA 5M3WA 2J47A 2JFEX 1CECA 2BHYA 4PCSA 3B9EA 4AZ5A 1CYGA 2XSBA 3F5JA 1M01A 4PBGA 2VNCA 2Z1SA 1J11A 1CDGA 1R85A 1E5JA 1E4NA 3EMZA 3GYCA 4AIEA 4PTMA 1LF1A 3ARYA 4GQRA 2GJXA 1CBGA 2CITA 1NH6A 1K9DA 3WNNA 2Q8XA 4TX6A 3PHAA 1XCWA 3NCOA 3PZMA 4C7DA 5A8QA 1E6XM 2NT1A 5E0FA 3VM7A 3MO4A 3B8SA 1HVQA 3W53A 3ALGA 1DEDA 3PZIA 4QCEA 3IAQA 2DSKA 2FHCA 2PWFA 3VMOA 1JL8A 1NP2A 1BLIA 2ZX5A 1VJSA 4W89A 4E2OA 2VX4A 2ZXQA 5CPQA 1XCXA 4CUCA 2XVKA 1SYTA 3QOKA 3WDRA 3CZGA 1QHPA 5TD4A 3MUZ1 2G3IA 3DHUA 3AYSA 1UA3A 5BCAA 2EXOA 3RIKA 4AISA 3BSGA 4PYSA 4PCTA 4DM1A 3LPGA 5LA1A 2ZUUA 2ZX8A 1N82A 1JGIA 2J7FA 3CHFA 3VD9A 1K6AA 3TTQA 2GK1B 3K8KA 3VKKA 2GSJA 3T0AA 1PX3A 4QDMA 3ZT7A 2D0HA 4P8VA 1TE1A 4AZCB 5I3DA 4QCFA 1GHRA 3AROA 5A8PA 1V02E 4UFJA 2VZSA 3ZT5A 3SCRA 3WQ8A 1V03A 3M6DA 4FLRA 1ESWA 4PMOA 1BVNP 2WKLA 3WBAA 2J7CA 1US3A 3DC0A 1C3FA 2G41A 3NUKA 4ACZB 2F61A 2VUYA 3ZSSA 3PZGA 1WZLA 4UCFA 4F9DA 1UZ1A 4M29A 1UWQA 3AIRA 2J79A 5A6AA 2X2YA 1I75A 4C7GA 3GBEA 1ISZA 1PPIA 2QF8A 5LYRA 3RM8A 4K68A 3OBAA 3RPMA 5CLTA 4JFUA 2A3EA 4AZ7A 3J7HA 2YJQA 3O6AA 1P6WA 3ARQA 4AYSA 2WAGA 2OLHA 2WC7A 1HX0A 5D8ZA 5DF0A 5I23A 2ZICA 4FMVA 4YHEA 7CGTA 4QFUA 3ARPA 1XH1A 1W9DM 3UR8A 2DT1A 1MYRA 5IFPA 1JI1A 1ITXA 1MW1A 3AXHA 4F9JA 2YDRA 1JXKA 4J3WA 1M04A 2VI0A 1JZ2A 5C8BB 2J25A 1NWUA 3TTSA 4M82A 4S3JA 4LYRA 1E4IA 2WC3A 4UTFA 2WB5A 1CNVA 4P8UA 2DSWA 3PZ9A 2VX5A 1JZ8A 2X8RA 1V0LA 2WVUA 2WVSA 1AQMA 5GNYA 1MXDA 2X09A 3CZ8A 4H8VA 1NM9A 4XV0A 2PI6A 4CU8A 4ZXLA 3ARTA 4UFKA 4WSJA 1W32A 1GVIA 5CPTA 1EA9C 1EO5A 4HOZA 1KFWA 4PMYA 1Q6CA 3PZQA 3NIYA 1H41A 1WCGA 1UR9A 2BY0A 5E9AA 1OBAA 1ZU8A 1GQKA 4MDPA 2YA2A 1LJYA 2WSPA 2WYSA 2XGIA 2BY1A 1WDPA 3KL3A 3AZRA 2BVYA 1CGTA 1CZ1A 1QNSA 3EDJA 2D23A 4WF7A 1FP8A 1B3ZA 1S46A 4W88A 4ZE5A 1FH9A 1US2A 3I3DA 4AC1X 2DH2A 1BAGA 4CCEA 1KWGA 3ZO9A 2WLYA 1HJXA 4PUEA 1VENA 3I3BA 1ZBVA 4UFIA 3WF1A 2WHMA 1G94A 2VX7A 3VDCA 1FP9A 1D7FA 1NP0A 3FAWA 1E56A 4P7OA 4QAWA 5FD0A 1WKYA 3VMPA 1UWRA 3WDQA 4J3SA 3WD1A 4BQ4A 3HJEA 2XIBA 2E8YA 1TCMA 2E8ZA 4H8HA 3CHEA 4KWUA 4HOWA 4W7VA 4ZEPA 1JDCA 2GFTA 3WD0A 1G0CA 4TUFA 3AIWA 4HPHA 5I77A 5D8WA 2J62A 1JDAA 1ISVA 3PTQA 4AD4A 5FCZA 4MNKA 3IJ8A 2YLAA 1KGWA 1BSIA 1V3LA 6A3HA 4OOUA 3N9KA 3VOCA 1ZBWA 1TVNA 3OLDA 3VNZA 1BTCA 4EANA 2QPSA 2OYMA 3L2LA 2X0HA 3OA5A 5E70A 4OBRA 4JFSA 1BF2A 1ODUA 1UHVA 1U2YA 5AC4A 3SEPA 1PJ9A 1B3WA 5ABEA 3S6TA 3FW6A 1JZ3A 2WWCA 1GOIA 4PMUA 1E72M 4UQDA 1E40A 1OGSA 4W8AA 1SMAA 1H4PA 3ZOAA 1CGVA 3A4AA 4XX6A 3K1DA 4MPKA 1FH7A 2BHZA 1XH2A 5CGTA 1E1EA 3VIJA 5HXMA 1PZ2A 2D0GA 1SFSA 2WMGA 1KBKA 2UY4A 1EDTA 2ZWYA 3BAYA 1JIBA 1TZ7A 1C7TA 3SCWA 4H41A 2CHOA 2JEQA 3AIBA 1NARA 1D2KA 4XUYA 1UQYA 1UKPA 2BVTA 2OYKA 1C91A 3KEHA 1ZJBA 3RDKA 3ARWA 4UQCA 5D4YA 3UG3A 4MB5A 2ZUTA 5CXPA 4XB3A 5I79A 5A6KA 3F4VA 2JE8A 3ARZA 2W61A 3VIPA 4AZCA 2CEQA 3VO0A 2G4FA 5ABFB 3B9DA 1B90A 2YDQA 1UR0A 1LG2A 1E6SM 2WMKA 3RM9A 4AWEA 3E1F1 4MNJA 4UNIA 1A47A 3VILA 1U33A 1F4AA 6TAAA 2NT0A 2ZUMA 2D20A 1JZ6A 1BGGA 2YLLA 2XFRA 1QNQA 2WWDA 3WNPA 5FL0A 1J18A 1IZJA 1UD5A 1J0HA 3A47A 2QLYA 4ACZA 1KXQA 3B9AA 4HMCA 4JL1A 1AMYA 2WMIB 3AZTA 4BS0A 2D24A 2XJ7A 1UR8A 3WH9A 3CUHA 1AVAA 3MUIA 3EMCA 4XZWA 2DT2A 4V28A 5JBEA 1HJWA 1GOQA 3VD7A 1GPFA 2O9TA 4ZFMA 1WB0A 2FDMA 1WDSA 3VX0A 1E71M 3W26A 4H04A 1HVXA 2PF0A 3L4YA 4ATWA 3MKKA 1UKOA 4HA3A 2WZIA 2QHAA 4J3XA 4U3CA 1UR2A 2CBVA 4MTVA 4URIA 3T0DA 2AOSA 1TR1A 2W5FA 4N42A 1Q6EA 1X6LA 1W9VA 4JCMA 1M03A 2VVSA 1OB0A 5A95A 4R27A 3MANA 2ZIDA 2A3HA 1MXGA 4AD0A 3NYDA 4W8BA 1TG7A 2J7GA 2OSYA 1E73M 2WCSA 3CMGA 3SUTA 3VGGA 2W66A 4GPNA 2FHBA 4AD5A 2QMKA 4A4AA 1MW3A 4W7UA 3WH6A 1EO7A 3ARVA 3FXYA 2ZX6A 3QHNA 1UD2A 3L4UA 4D71A 4JAWA 1DHKA 2CPUA 2D1ZA 2OSWA 5AY7A 3AIVA 3ARSA 1MQPA 5DT7A 2QMJA 4LYQA 2C7FA 1W1PA 3PN8A 2V3FA 2EPKX 2D22A 1OIFA 2VRJA 4D6IA 3CHDA 1E1FA 4B16A 1KCLA 1WO2A 2EPLX 2YIHA 1BG9A 2DT3A 3TONA 3UERA 1VEOA 1R7OA 5D9NA 3VD4A 1E4LA 1CLVA 4OBSA 2RGMA 5DFAA 1PZ3A 1I1XA 2J77A 3F5LA 1V3MA 3WEMA 5BYWA 1FHLA 1TA3A 4MNLA 3AXIA 3GXIA 4W8LA 3ZQ9A 1R86A 5A8MA 1XV8A 4R5EA 5D9PA 4AZGA 3W4RA 1FHDA 2YKKA 4EK7A 1GOKA 3MMWA 1HP5A 4LX4A 1CXFA 2XFFA 4EKJA 1Q6FA 3POCA 3WH7A 4D6FA 1UH4A 1E15A 4NI3A 1HXJA 3CUJA 9CGTA 1B2YA 1GORA 3IJ9A 4XZBA 1WZAA 4D1JA 3N17A 3G6MA 1PIGA 3CO4A 2XG9A 4PMDA 1B3VA 2FGLA 4D6DA 3QGVA 4M81A 4J28A 1V6YA 3WKZA 3T2QA 3GNRA 3D3AA 3MUY1 3PZTA 1OGBA 1W3HA 5IXEA 2E0PA 5JUVA 2YBUA 3RILA 4P7RA 1EHNA 8A3HA 5E6YA 5I78A 2Y5EA 4IISA 2GVYA 3ZJ7A 3SCQA 3N04A 4DWSD 5HOSA 1C8XA 1JAKA 3SCPA 4GKLA 3WEZA 1OM0A 4LQ1A 1IT0A 2A3BA 1JYVA 1QNOA 1BYDA 3W29A 2X05A 1DP0A 1EXPA 4MB1A 3WDPP 3UG4A 3AICA 4UFHA 4YN5A 3WQWA 3WSUA 3U7BA 3W6MA 3OLGA 1BPLB 3THDA 1ISXA 1O6IA 3VGHA 4U5IA 4W5UA 4HA1A 3GXDA 1OT2A 3FHAA 1QNRA 3SCVA 3L4ZA 4DWSC 1QW9A 2VURA 3GDBA 4TX8A 4P8XA 1W2VA 3OGVA 4A3YA 1L8NA 3VIOA 4DUWA 4JHZA 2GJPA 5FOOA 2G3MA 1BVZA 2B31A 2WMJA 1VFMA 3NSMA 5IHRA 1NOWA 1VJZA 1V6VA 2JIWA 1H09A 1JZ4A 1E6RA 3SUUA 2EPMX 5ABFA 1UH2A 5BRQA 3SUVA 1CXKA 1C8YA 1QOXA 2CKRA 2VRKA 1JYWA 2V3GA 3GH7A 3RMEA 3WMCA 2BXYA 1ITCA 4MADA 3GNOA 2Y24A 4MJ2A 3JUGA 1E0XA 5DMYA 2JF6A 1W9XA 2F2HA 5A2BA 5A2CA 2ZUVA 2OWWA 1W2PA 2XVLA 4UFMA 4PMZA 2WMIA 1UZ4A 2ZUNA 2QPUA 1HN1A 1E70M 4W84A 2CXGA 2G8ZA 1K9FA 1R7AA 5BXTA 5C71A 4JFVA 5EFDA 2VL4A 1C90A 1E6QM 4HA4A 2YL5A 3L4TA 3VGDA 2WVVB 2ZX9A 1AQHA 2QV4A 1OD8A 1XD0A 2J7EA 1O7AA 4AZIA 1OIMA 2DH3A 1H1NA 1H2JA 2F8QA 5I6SA 4DWSB 3AYRA 2WBKA 4C7FA 1J12A 1H3GA 1R87A 2EPOA 2NSXA 2EO7A 2CKSA 3CMJA 1QPKA 4U33A 4J3UA 2CESA 2PWHA 4J3VA 4D6HA 4GI9A 2XVGA 2OWXA 1W3KA 4GIAA 2BS9A 3DYMA 4MAZA 4MJ4A 3K8LA 4LPCA 3UEQA 3FAXA 2W92A 3PTMA 2DSZA 3VMNA 1F4HA 4F66A 1XC6A 1JAEA 4OZOA 1G9HA 3GH5A 4Q7NA 1OD0A 5CGMA 3BAIA 4BF7A 4J3TA 1B9ZA 1KQYA 3W82A 3PZUA 5LA2A 3CZLA 1RH9A 4JKKA 3N12A 4UOJA 4BZYA 2XTKA 1CGXA 1V0KA 4M80A 3W25A 4JIEA 3EDDA 1G5AA 5E6ZA 3VTRA 2EQDA 4N0RA 3KL0A 3WUBA 4B9ZA 1W9PA 3ZJ6A 1UR4A 2XIIA 2PWEA 2WVTA 3WBEA 1HJVA 2E40A 1GONA 1UD8A 4D6CA 1MW2A 1DWJM 4EE9A 4MB4A 1UOKA 3WF0A 3WF4A 4KRTA 3WNKA 2D0FA 4AD1A 1OINA 4EAMA 4JHOA 5A8NA 4AD2A 3BAXA 5E0CA 1V3HA 4NRRA 3PZVA 1W9BM 3A6OA 1J0KA 1D3CA 3VIKA 5IHSA 1RP8A 3CZJA 4DUXA 4FLOA 3VIGA 3G6LA 2ZUWA 4HMEA 1CXIA 1V02A 2FHFA 3VIIA 1Z32X 1CTNA 3ZMRA 2DQXA 1HL8A 1J01A 3M07A 1LL4A 1V3IA 1UKQA 5D9OA 1JNEA 4PSPA 3HMCA 4OUEA 3CUIA 1A3HA 2UY5A 3T08A 1H0GA 1HIZA 4GZIA 5GNZA 4WKFA 4BCEA 5GQBA 5A2AA 1B3YA 1BYAA 1TVPA 1J10A 4W86A 5EFFA 1HT6A 1PX8A 3RM4A 2J7BA 1UA7A 2WW5A 2W67A 3QHMA 2VR4A 1SR0A 2DEPA 1NWRA 3WL1A 1EGZA 3WDJA 4CVUA 3AIQA 4B9YA 1JNDA 5CPSA 1JI2A 3WMSA 1WP6A 2ZXAA 2NW0A 2WK2A 1HKJA 2XUCA 5HDRA 3WUFA 4PMXA 2VZUA 3SIMA 1XH0A 3FNDA 2OSXA 1X1NA 5M03A 5ABGA 1HKIA 1TFVA 3VNYA 2DGAA 3NDYA 2DIJA 4OJYA 5JBDA 3AQUA 4B3KA 1E6NA 2D2OA 4B3LA 4PMNA 4BA0A 4OIFA 2E9MA 2UY2A 5BROA 2GK1A 3WQVA 3NSXA 4CU7A 3WDHA 4Z2KA 4HOXA 3U5UA 2C8NA 2CBJA 3SURA 1XYFA 1E0VA 1J0JA 2O92A 4D6JA 1DTUA 1MW0A 2DDXA 1V3JA 4IPNB 1PIFA 4HZ7A 4J7RA 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4PTWA 4NRSA 1PAMA 2JALA 4NF7A 2GDVA 3CLWA 1ISYA 2IXVA 3EBVA 2CYGA 2DSUA 1E4MM 5BXPA 4HZ6A 3DHPA 1C7SA 3AS1A 1VBUA 3OZOA 3PZOA 1QHOA 1V3KA 3GZAA 3AMDA 2VQUA 3WUEA 3IAPA 5CG0A 1CIUA 1NOFA 4B15A 2YA1A 5C70A 4H2CA 1KB3A 1LL6A 5FIPA 5KZ6A 2DIEA 3AOFA 1H11A 3AMLA 1QI2A 2CCRA 1LWJA 1OCQA 4A3HA 3CBWA 3KWXA 1RD6A 1VB9A 3WL0A 3NSNA 5HBFA 1HF6A 2EBNA 1TUXA 4Z2JA 3T2PA 1MQRA 4F8XA 1W9UA 1DWHM 4AEFA 1V0NA 3EDFA 5EB8A 2X0YA 3FY1A 3N18A 2WMHA 3U7VA 3BAJA 4UZUA 3DYOA 1ZS2A 3II1A 1ZBKA 2XFYA 1EQCA 3RO8A 3W27A 5CQ1A 1V6UA 2ZWZA 1XSIA 1KR1A 1UQZA 2WC4A 2WANA 3WD2A 4AEEA 3VGFA 3OGRA 1X6NA 4E8DA 2XVPA 3W6LA 2VZVA 3BC9A 3TP4A 1LWHA 1GOOA 1EDQA 3WUGA 1GNXA 5DT5A 5HPCA 2FGZA 1CXLA 3MU7A 3K46A 1R8LA 3BAKA 1LG1A 3T0BA 1BHGA 4QLLA 2CHNA 4AXNA 2XSAA 2E9LA 1UD3A 1FFQA 3T2OA 1ZB5A 3TTOA 2V3EA 1MWOA 4MB3A 1M7XA 3AMGA 1J0ZA 5AC5A 4ATDA 4Q22A 3LPPA 1KXHA 4U2ZA 3WF2A 1BYBA 3ZT6A 1JDDA 2VQTA 3ARUA 1M53A 3N1AA 2J8FA 4TVDA 4CD7A 1RP9A 4QP0A 3WIJA 2J78A 1XHGA 5LA0A 2V5DA 1XSJA 1H5VA 1GOMA 3MSGA 2O9OA 1W1TA 3N13A 1W3JA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4B3KA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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