4BACA

Prototype foamy virus strand transfer complexes on product dna
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
368
structure length
368
Chain Sequence
LDAELDQLLQGHYIKGYPKQYTYFLEDGKVKVSRPEGVKIIPPQSDRQKIVLQAHNLAHTGREATLLKIANLYWWPNMRKDVVKQLGRCQQCLITNASNKASGPILRPDRPQKPFDKFFIDYIGPLPPSQGYLYVLVVVDGMTGFTWLYPTKAPSTSATVKSLNVLTSIAIPKVIHSDQGAAFTSSTFAEWAKERGIHLEFSTPYHPQSGSKVERKNSDIKRLLTKLLVGRPTKWYDLLPVVQLALNNTYSPVLKYTPHQLLFGIDSNTPFANQDTLDLTREEELSLLQEIRTSLYHPSTPPASSRSWSPVVGQLVQERVARPASLRPRWHKPSTVLKVLNPRTVVILDHLGNNRTVSIDNLKPTSHQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/dna
molecule keywords INTEGRASE
publication title Assembly of Prototype Foamy Virus Strand Transfer Complexes on Product DNA Bypassing Catalysis of Integration.
pubmed doi rcsb
source organism Human spumaretrovirus
total genus 82
structure length 368
sequence length 368
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.7.49: RNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date 2012-09-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00665 rve Integrase core domain
A PF17921 Integrase_H2C2 Integrase zinc binding domain
A PF18103 SH3_11 Retroviral integrase C-terminal SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.2300 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 4bacA04
1.10.340.70 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Endonuclease III; domain 1 Endonuclease III; domain 1 4bacA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4bacA02
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4bacA03
3H8ZA 3KJVA 2EFIA 1LV5A 4CEZA 1NK7A 4DTUA 3DOLA 4Z4FA 3RMCA 1VK0A 2ETJA 1XNIA 4O4GA 2Z1JA 2G8HA 2HHTA 4PA1A 2EQMA 4BWJA 2I5JA 2B4JA 1RI0A 3AVLA 2G8WA 2DIQA 1FXXA 2BGGA 4LH5A 4NYNA 3OYKA 1KVAA 4DTSA 4MFBA 5KRSA 1BGXT 4FU6A 1F21A 2D0CA 5C0MA 5HROA 3VN5A 3L2QA 2IAJA 4KHWA 1RNHA 3TR8A 3LP1A 4FM0A 1GOAA 3ZT2A 3SQ1A 2XO7A 3HSTB 2XY8A 1S1TA 3OS1A 2EQKA 1RILA 2PQWA 4CJRA 4BD3A 3NH0A 3IG1A 2D9TA 3DRPA 4KHQA 2G3RA 3NH1A 4PLIA 3DB3A 4Z4IA 1KCFA 5DK5A 4E7IA 4A4EA 2VWKA 5J2PA 4A4FA 4CHPA 3AVCA 5FRNA 4DU4A 4Z4GA 4FJMA 4HUEA 4K8XA 2MWPA 3DI6A 4DMNA 1Q9YA 3HPOA 2RHYA 4DFKA 4E7JA 5FDLA 1CLQA 2G8KA 4IUQA 4HCBA 4PLLA 1S6PA 3AA5X 4ID1A 2PY5A 1RT4A 4IDKA 4DTRA 1Z26A 1HRHA 3OJUA 1RT1A 4K8ZA 3LYIA 4BDYA 3L2UA 5D6XA 1UAXA 3DYAA 4CK3A 1WAJA 3JSMA 4DSFA 4Y1DA 4RG8A 2F8SA 2HB5A 5HBMA 2Q3SA 2OZSA 3NFAA 4DG1A 1TVRA 4CJTA 5HRNA 4FJJA 3ZT1A 4CIFA 4N56A 1CXUA 4DTOA 3OYIA 1CZBA 3KD1E 5C6SA 3AVHA 3DB4A 3VQEA 4HHTA 3IAYA 4F8RA 2RHUA 4BE0A 3AA2A 1JLQA 4LD6A 3F9KA 2DIGA 4E3SA 1ASWA 4OKEA 4QQDA 4FJXA 3SUQA 1G15A 4OVLA 2VYTA 2YNFA 1SL0A 2ATQA 2E4LA 1FKPA 4CEDA 4RW7A 2AJQA 2YRVA 3OA6A 1S5JA 3OY9A 2RI5A 1BIUA 5T7BA 1YT3A 3NF8A 3MXIA 4I7FA 3AVKA 1L3TA 1TGOA 1EP4A 3V6DA 3NF7A 4RW4A 1KLMA 5CYMA 4FJLA 3DLMA 4DTNA 1TAUA 3TAGA 3KD5E 3OYCA 3H08A 4B08A 3LX7A 2LTOA 4E1MA 5CYQA 4IUTA 1NK6A 3L2WA 2Z1IA 2E6MA 5D6YA 3T1AA 2IGIA 4EP5A 3MEGA 3KK1A 4IBNA 3CG7A 3KTQA 1NOYA 3OMCA 1HQUA 1U04A 4N76A 1RT3A 3MP6A 4QVZA 5M9OA 3M8RA 3TAPA 1IKWA 4F2RA 1C1AA 2ZD1A 1GOCA 4BDPA 2JTFA 4QOZB 4M3RA 4I2QA 3K5NA 4YFUA 4C5GA 1TL3A 4M45A 1L3SA 4M3UA 3KLEA 3O4NA 4WE1A 2RJFA 3V9WA 4LSLA 3ZSYA 1KHCA 2HHUA 3IS9A 1HYVA 3ZCMA 5IN1A 4OPJA 4CJUA 2HNDA 3SUPA 3L2VA 1IO2A 2RO0A 3ZT4A 4M3XA 4DTJA 4CFCA 2YHBA 1VSHA 3MEVA 2HQEA 3S9HA 1UOCA 1U47A 1C6VA 3AO4A 2IOCA 3RRHA 2GFAA 4CIGA 3ME9A 2P0KA 3QERA 4CF2A 5KGWA 1U48A 3OS0A 1SKWA 2EX3A 2Y1IA 1UA0A 1DTTA 1BQMA 2YNIA 4KHSA 2HVHA 1JXEA 3M8PA 1ZBIA 1QS4A 2JLEA 4C8MA 4PL6A 3LALA 3KK2A 3AV9A 2M0OA 2WACA 1JL2A 3V1RA 3P5JA 4HCCA 5HRRA 3FDRA 4IUUA 1QE1A 4CERA 1S9GA 1LWCA 3KLIA 5C25A 3C95A 3HYFA 1MHNA 4CRIA 1VSMA 3B6PA 3AA4A 4QAGA 1KFSA 3DM2A 4OKJA 4J2DA 1HNIA 4FJHA 1FK9A 1TAQA 3T3FA 1OZ3A 3U3YA 3KKRA 4RW9A 2W42A 5J2MA 4FW2A 4Z0UA 3MEWA 4OGCA 4OLAA 1B9DA 1MU2A 3LZJA 4O0IA 4CJWA 3DOKA 1D9FA 3LP0A 1JLAA 3NCIA 1ASVA 2OPQA 4FJKA 1SL1A 2GUIA 1JLFA 3D45A 4F3TA 4KREA 1LWFA 3S3MA 2X74A 3PNWC 1WJRA 3OJSA 2D5RA 5KE2A 2M1HA 3ITHA 1KRPA 3SV4A 3DLHA 2L8DA 4DTMA 5J39A 3ZT3A 2EKOA 2QKKA 4CGIA 4CEEA 2G8VA 3M9QA 2X35A 3PO5A 2M16A 1QQCA 3OYBA 3TI0A 3T19A 1FKOA 4IFYA 1N6QA 1QSYA 3NTIA 3NAEA 4DU1A 1QHTA 4W5QA 3MEAA 2ZQBA 4E19A 1BIZA 3OYFA 3CFRA 2IS3A 4W5RA 2O4XA 1U4BA 4KHYA 1SUQA 3WNFA 3P83D 1X9WA 3AVJA 4FLYA 2KFZA 2GV9A 2BKDN 2GBZA 4FK4A 4DQIA 2EQJA 3PY8A 5SZTA 4BACA 2ITGA 3FC3A 4CHYA 4FM2A 4KFBA 1TK0A 3VQQA 3PV8A 5I3UA 3UT1A 2G8IA 4DQPA 3BGRA 4JRPA 1X9SA 1T7PA 4ZTFA 3HJFA 3SQ2A 3VQ8A 4NZGA 2E6NA 2DFHA 3RTVA 1NJYA 3PO4A 5KE3A 1NKEA 2OA8A 2KFNA 2XY7A 1CZ9A 2BANA 2VG6A 4HVJA 3AO2A 4FW1A 2HQXA 3SUOA 1S1UA 3QEIA 4IFVA 3QESA 2E5QA 1EXQA 5KRTA 1X9MA 3QEWA 5D3GA 3OYAA 1S9EA 1QSLA 3K5LA 5FRMA 3C94A 4ELTA 5J26A 5KCHA 2WONA 3MP8A 5E41A 2F8TA 4FZZA 1HYSA 4QQ6A 5HLFA 3F70A 3PUFA 4DSLA 1NKBA 4FLZA 4DS4A 4HCZA 4CEOA 2KTQA 4E0DA 4B8AB 2YHAA 1TL1A 4FZYA 4DSKA 1RDAA 3BDPA 3ASKA 4E7KA 4FLUA 3SQ0A 4PQUA 1WSHA 2XRIA 1NK4A 3O3GA 2FHDA 3S3OA 3VQ4A 4FLTA 2GF7A 1DLOA 3SYZA 1RT2A 4CF1A 4OKKA 3V9ZA 2IG0A 1WLJA 2VG7A 3AO5A 4G1QA 4CFDA 1RBSA 3V9SA 1BISA 1LW2A 3SV3A 3CM5A 3RMBA 3OYDA 4C8OA 1SV5A 1WSEA 1YVUA 4FJGA 1NK5A 3FLGA 3CM6A 4CF0A 2DFFA 2FC0A 3AO3A 1OI1A 1RDDA 3RWUA 4C8KA 2X4YA 4CJSA 4LY7A 1N27A 4B9VA 4ELVA 4CJ5A 1J53A 4XIUA 1T05A 2QQSA 4EP4A 1NJZA 3VQ5A 1JLGA 4M3YA 4H4OA 3P8HA 1VSDA 4HUFA 4A4GA 1XHXA 4N47A 4QQGA 4B9MA 1HMVA 3HXMA 2FBVA 1BQNA 4EDUA 3QLHA 3ZT0A 4KRFA 3QNOA 2L89A 1I39A 1VSEA 3AO1A 1IKVA 3SZ2A 3KIOA 3SJJA 5HRPA 4KAZA 4N4IA 1C0MA 4DSIA 4LH4A 2OPSA 4RW6A 4ELUA 2B8AA 1ITGA 1SSFA 1B92A 3D0PA 5J1EA 4O44A 5JS2A 2R5MA 3B6OA 1N5YA 2K3XA 3VQBA 4CGGA 3OYEA 3K58A 1QSSA 1LW0A 1A5WA 4HUGA 4AHSA 3TAQA 4AHCA 1JL1A 3NGYA 3V1OA 3MXMA 4IUVA 4CJQA 3LP2A 3QINA 4ICLA 1VSJA 2YNGA 3EZ5A 3SCXA 4Q5VA 4CJKA 4B9XA 3AVFA 2XHBA 1IKYA 1OZ2A 3MEEA 3Q1JA 2OZMA 2QKBA 3WNEA 3FEOA 3VQ9A 3VQAA 4CFAA 1L3VA 2HHQA 4HTUA 4AHVA 4W5OA 2HHVA 3I8DA 3G10A 1Q8IA 3V1QA 2F5KA 2YNHA 2X6SA 1ZYQA 1XI1A 1UWBA 4CJFA 3ZSOA 1QTMA 3DMJA 4AHUA 2B6AA 4DF8A 3I0RA 2XY5A 4L59A 2DY4A 2LCCA 4B9WA 3M8SA 4CJLA 4B8CA 4FJ9A 1BI4A 1SKRA 1RTDA 3CFOA 2XY6A 4J2BA 1ZBLA 4CJ3A 4NCBA 2LVMA 4TSXA 3OYHA 5C42A 2R7YA 4FVMA 4DFPA 2R57A 2FBYA 3K5OA 5EU7A 2HVIA 2HHWA 2FBTA 4FJ7A 1A5XA 4CJPA 4E7HA 1VRTA 3FFIA 4GMJB 3JYTA 3LDSA 2YKMA 4NCGA 4OPKA 2XDPA 3E01A 4Q5WA 3NGZA 4Q0BA 3U6FA 4E89A 4CHQA 2D0BA 3WNGA 5KGXA 3ZSRA 1K6YA 2X4WA 1Y97A 3KKSA 4FZXC 2RI3A 4BWMA 1KTQA 2KZMA 3LAMA 3VQDA 1L5UA 4O0JA 3KUFA 1HJRA 2KW4A 3MXJA 3RR8A 4H4MA 4CESA 4J2EA 5K14A 4CCHA 4OJRA 3AVAA 3NBPA 1D9DA 1HYZA 1WGSA 3E9GA 4AILC 4FL6A 3PX6A 4FJ8A 3UIQA 3G0ZA 3BDLA 1BCOA 4DU3A 1EKEA 4DWIA 1WNSA 4CEFA 3TAMA 3HL8A 3K59A 3QBYA 3MEDA 3VA3A 1C0TA 4N4HA 1LAVA 1HQEA 4C5EA 1BL3A 3QNNA 1VSFA 3AVNA 3S3NA 2RJCA 3V81A 3VQPA 4W5TA 1TK5A 3AVBA 4RW8A 2LRQA 3I0SA 4DQQA 2HHSA 3MAQA 4B9LA 4DS5A 4FXDA 3OYLA 3ZSQA 1BHLA 3KLGA 3QEXA 1JXBA 2P51A 4AH9A 1S1XA 1RCHA 2YV0X 4KHUA 4OLBA 3DRRA 4B9UA 4CK2A 2Y1JA 5D6WA 2RN2A 2NUBA 4ZTJA 4LSNA 5CZ1A 3HT3A 3CFPA 4OVAA 2WOMA 3OYNA 4CF8A 3SNNA 3L42A 4FK0A 3PFSA 1D5AA 1RTHA 1VRUA 4CHNA 2HNZA 3LPTA 2DFEA 4KV8A 5CY4A 5KH6A 3PMTA 4GY5A 4DFJA 1NK8A 3OYGA 4NS5A 4CGDA 1C1BA 3NE6A 1S1VA 3KLHA 4DSJA 4Z4CA 4X34A 3OS2A 4CIEA 4CFBA 4NYFA 5KI6A 4DQSA 1BCMA 1S1WA 2OYQA 4DFMA 4IKFA 4CJVA 1HNVA 2L3RA 5J2NA 4PWDA 3DLBA 2BIVA 4J2AA 2IC3A 3HK2A 5JS1A 4GVMA 2GFUA 3DLEA 4O5BA 3QIPA 2O4XB 1RDBA 2LDMA 4CEAA 4C5IA 5DMRA 4KI4A 4IURA 2X78A 4E7LA 3V4IA 1NJXA 2FBXA 4CK1A 1RT6A 3KLFA 3OYJA 2BE2A 1X1PA 4PUOA 3P8DA 2PZSA 1TV6A 1ZBHA 3QJ6A 4DTPA 5CZ2A 2O4IA 2E6LA 4CEQA 3PX0A 1IG9A 1JLEA 1RDCA 2LSNA 4M3TA 1TK8A 5J2QA 3QEPA 2G8UA 4KTQA 1OYXA 3L8BA 3MP1A 3KK3A 4Y1CA 2VWJA 4UQGA 1NJWA 4ZHRA 2K3YA 3HM9A 4KTZA 3NTHA 1WN7A 5C24A 1KFDA 1XC9A 3C4SA 4C8NA 1ASUA 1JKHA 4LD0A 2OPRA 3L2RA 3HP6A 4OGEA 4R5PA 3A2FA 4B9TA 3NF9A 5KTQA 1VSIA 3K2PA 4C8LA 2HHXA 1JLBA 3E9FA 2RHIA 2HMIA 3ASMA 3META 1C1CA 2X6NA 1W9HA 4IG3A 3TAEA 3OVNA 3U3GA 1RBUA 4FYDA 2P5GA 3ISNC 3DLRA 4MQ3A 4II1A 3MO8A 3DLGA 3CEYA 1A5VA 1KVBA 3O4QA 2MWOA 1WSGA 3O3HA 3CYMA 3ZEHA 2PYJA 3NGIA 4KB0A 3PMIA 3OYMA 2A1RA 4H8KA 2DTUA 3ULDA 2PYLA 1REVA 1CXQA 1TKXA 2YKNA 2R58A 1C0UA 3HO1A 4FJNA 1HPZA 3O8VA 3LPUA 3LH0A 2ZE2A 4CJEA 1I3AA 3SD4A 4YNQA 2HNYA 4FLVA 2RPIA 3QO9A 4FLXA 2JZ2A 4EZ9A 4DSEA 3QETA 4PY5A 3C6TA 1UA1A 3VA0A 1U45A 3TAFA 3S6WA 3RMAA 3SI6A 1G5VA 3NHGA 3AA3A 1ZBFA 1WSIA 3SPYA 3V9XA 1EETA 4JS5A 4JRQA 2BDPA 3C6UA 2XK0A 4F4KA 4B9NA 4N41A 4B9SA 1RT5A 3HP9A 4I9LA 2QQRA 1JLCA 4FM1A 1RTJA 3UWNA 3IRXA 4CF9A 3EY1A 4N5SA 4QCLA 5HRSA 2EHGA 3MEUA 1SKSA 1WJSA 1KSPA 4JS4A 1L3UA 2Z1HA 3LAKA 1WSJA 3AVGA 3QIIA 4CHOA 2R5AA 3THVA 4KB1A 1IKXA 1J54A 3V9UA 1NKCA 4CJ4A 3L3VA 2RHXA 3AVIA 1LAWA 4KKOA 3LWMA 3HPGA 1U49A 2D0AA 3M8QA 5IAYA 1WAFA 1RBVA 4Z4HA 2F96A 4A4HA 3ZSZA 1IH7A 4JLHA 4W5NA 2B5JA 4CGFA 1RT7A 4FJIA 4I9QA 3EAEA 4NCAA 4E1NA 3VQCA 4KHNA 1NK9A 3RR7A 4FK2A 4Z4EA 1J5OA 5SWMA 4DF4A 3ZSXA 1DTQA 1TKTA 5KCOA 4DLGA 4GW6A 4IG0A 3RMDA 4F2SA 4KTWA 3P1GA 4CEBA 1T8EA 3QEVA 1GOBA 4DQRA 3VQ6A 4M3ZA 4QW2A 1LWEA 5FROA 1J9AA 4FLWA 3L3UA 2KZZA 1RBRA 3TARA 3HPHA 5CIUA 3DRSA 4FJ5A 4ID5A 2RHZA 4Z02A 4I2PA 1B9FA 1R0AA 1WJQA 2X4XA 3HVTA 3NDKA 4F3OA 1EX4A 3NNQA 1XWLA 3TANA 4M42A 3SUNA 4BDZA 4AHTA 4FCYA 2RF2A 1SL2A 3MECA 1O1WA 1T03A 1BI4B 4M3WA 5HP1A 4CECA 3NTKA 3WNHA 2OPPA 4EZ6A 4CGHA 1ZBUA 3DLKA 1YTUA 3EYZA 3SPZA 4M41A 3ZSWA 1NOZA 3LANA 3F73A 2RKIA 3TWHA 3LP3A 3QKJA 1YTAA 3GOXA 1W0HA 2VG5A 3AVMA 4KO0A 3OB9A 1H3ZA 1VSLA 2EQUA 2KQ2A 3RRGA 2A1SA 1Z25A 2RJEA 1KVCA 2JGUA 1S6QA 2NLUA 3NH2A 4O55A 1TKDA 4CE9A 4CGJA 1VSKA 4N4GA 4KPYA 3HVRA 4B3OA 2CKKA 2P5OA 2O4GA 2Z1GA 2HW3A 1RBTA 3SQ4A 3LGLA 3H6ZA 3LZIA 1XHZA 2IDOA 3LWLA 3LLRA 1KLNA 3ALYA 2RJDA 3OMGA 1WSFA 4IUPA 4C5HA 3CQ8A 4DTXA 2BUDA 1D8YA 4AHRA 2RI2A 3PX4A 3LGFA 2QXFA 3TABA 3ZSVA 4BE1A 2G8FA 3OQ5A 3VQ7A 2QK9A 5I42A 3NF6A 1RTIA 4KI6A 4CHZA 3O3FA 4DLEA 4L8RB 1NK0A 2P1JA 1Q9XA 4BE2A 4UC4A 3K57A 4RG2A 3QIOA 1TKZA 2DAQA 3K5MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2EV0A 3OIQA 5LJ5e 2P0PA 3KJVA 5D5UB 3CF5F 1V55H 4QS7A 1LV5A 4QVDA 2ZPFB 2O0YA 4Z4FA 1AKHB 1GLFO 3QU6A 1ZRDA 4XLAA 4PGHA 5LMUK 1VK0A 3S2WA 1EH6A 4XU1A 1Q82R 3KZYA 3GG4A 2HHTA 2EQMA 2MIOA 2DAOA 2AKLA 5IPAA 2DJZA 4HDUA 3H1CA 1MMGA 1RI0A 1VQ5I 5AQRA 3BW1A 3COAC 2NXNB 4IO8A 3ZYYX 2E10A 1Y0MA 1AZEA 1Z9QA 3MN9A 2BZYA 4NOYA 1A6IA 1OX9A 3M8JA 1QP2A 3T5XA 1XGMA 3LSPA 3CI5A 5HROA 3VN5A 1IXDA 3CHWA 2EQRA 4KHWA 3PVLA 1RNHA 5LJ3j 3TR8A 3OIPA 2F2EA 2FSWA 2M9HA 2XAJA 3ABKH 1RFQA 3ZL7C 3ZRGA 3E1SA 4EJUA 5FLXE 5EC7A 5C4XJ 3CLOA 4LK1F 4OFAA 2PQWA 1NH3A 4CJRA 2Y9ZA 3LWIA 2ZJPF 4LB5A 3NH0A 4ENNA 4YPHA 1EBMA 2FMYA 2KYMA 2FSJA 2D9TA 3ZETB 5EEHA 1Z91A 2EIFA 2G3RA 4Q48A 1TUUA 4IJNA 2VE8A 3QO3A 3M5AA 3NH1A 1WHHA 2XAGA 2CW0F 4Z4IA 5DK5A 1UG1A 1KQSA 5AQIA 1YJNN 2EZHA 2DJIA 2VWKA 5J2PA 5AZIA 3DU5A 4FIBA 2VONA 3FHGA 4DU4A 3CP8A 4FJMA 5IHNA 5M1QA 3DTEA 5HS7A 3EEQA 4YY3K 1GDTA 1KG7A 1ZELA 4BGAA 1HA8A 2OZ6A 3D4VA 2NUZA 1BJZA 4KGZB 1YYVA 1ERDA 4AT1B 1F5TA 2DMOA 5K7ZA 4ELZC 3W6VA 5EEAA 1V5FA 3CCRT 5L3CA 4EJOA 4PLLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2RHX A;  3AVI A;  1LAW A;  4KKO A;  3LWM A;  3HPG A;  1U49 A;  2D0A A;  3M8Q A;  5IAY A;  1WAF A;  1RBV A;  4Z4H A;  2F96 A;  4A4H A;  3ZSZ A;  1IH7 A;  4JLH A;  4W5N A;  2B5J A;  4CGF A;  1RT7 A;  4FJI A;  4I9Q A;  3EAE A;  4NCA A;  4E1N A;  3VQC A;  4KHN A;  1NK9 A;  3RR7 A;  4FK2 A;  4Z4E A;  1J5O A;  5SWM A;  4DF4 A;  3ZSX A;  1DTQ A;  1TKT A;  5KCO A;  4DLG A;  4GW6 A;  4IG0 A;  3RMD A;  4F2S A;  4KTW A;  3P1G A;  4CEB A;  1T8E A;  3QEV A;  1GOB A;  4DQR A;  3VQ6 A;  4M3Z A;  4QW2 A;  1LWE A;  5FRO A;  1J9A A;  4FLW A;  3L3U A;  2KZZ A;  1RBR A;  3TAR A;  3HPH A;  5CIU A;  3DRS A;  4FJ5 A;  4ID5 A;  2RHZ A;  4Z02 A;  4I2P A;  1B9F A;  1R0A A;  1WJQ A;  2X4X A;  3HVT A;  3NDK A;  4F3O A;  1EX4 A;  3NNQ A;  1XWL A;  3TAN A;  4M42 A;  3SUN A;  4BDZ A;  4AHT A;  4FCY A;  2RF2 A;  1SL2 A;  3MEC A;  1O1W A;  1T03 A;  1BI4 B;  4M3W A;  5HP1 A;  4CEC A;  3NTK A;  3WNH A;  2OPP A;  4EZ6 A;  4CGH A;  1ZBU A;  3DLK A;  1YTU A;  3EYZ A;  3SPZ A;  4M41 A;  3ZSW A;  1NOZ A;  3LAN A;  3F73 A;  2RKI A;  3TWH A;  3LP3 A;  3QKJ A;  1YTA A;  3GOX A;  1W0H A;  2VG5 A;  3AVM A;  4KO0 A;  3OB9 A;  1H3Z A;  1VSL A;  2EQU A;  2KQ2 A;  3RRG A;  2A1S A;  1Z25 A;  2RJE A;  1KVC A;  2JGU A;  1S6Q A;  2NLU A;  3NH2 A;  4O55 A;  1TKD A;  4CE9 A;  4CGJ A;  1VSK A;  4N4G A;  4KPY A;  3HVR A;  4B3O A;  2CKK A;  2P5O A;  2O4G A;  2Z1G A;  2HW3 A;  1RBT A;  3SQ4 A;  3LGL A;  3H6Z A;  3LZI A;  1XHZ A;  2IDO A;  3LWL A;  3LLR A;  1KLN A;  3ALY A;  2RJD A;  3OMG A;  1WSF A;  4IUP A;  4C5H A;  3CQ8 A;  4DTX A;  2BUD A;  1D8Y A;  4AHR A;  2RI2 A;  3PX4 A;  3LGF A;  2QXF A;  3TAB A;  3ZSV A;  4BE1 A;  2G8F A;  3OQ5 A;  3VQ7 A;  2QK9 A;  5I42 A;  3NF6 A;  1RTI A;  4KI6 A;  4CHZ A;  3O3F A;  4DLE A;  4L8R B;  1NK0 A;  2P1J A;  1Q9X A;  4BE2 A;  4UC4 A;  3K57 A;  4RG2 A;  3QIO A;  1TKZ A;  2DAQ A;  3K5M A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3QO3 A;  3M5A A;  3NH1 A;  1WHH A;  2XAG A;  2CW0 F;  4Z4I A;  5DK5 A;  1UG1 A;  1KQS A;  5AQI A;  1YJN N;  2EZH A;  2DJI A;  2VWK A;  5J2P A;  5AZI A;  3DU5 A;  4FIB A;  2VON A;  3FHG A;  4DU4 A;  3CP8 A;  4FJM A;  5IHN A;  5M1Q A;  3DTE A;  5HS7 A;  3EEQ A;  4YY3 K;  1GDT A;  1KG7 A;  1ZEL A;  4BGA A;  1HA8 A;  2OZ6 A;  3D4V A;  2NUZ A;  1BJZ A;  4KGZ B;  1YYV A;  1ERD A;  4AT1 B;  1F5T A;  2DMO A;  5K7Z A;  4ELZ C;  3W6V A;  5EEA A;  1V5F A;  3CCR T;  5L3C A;  4EJO A;  4PLL A;  3LA3 A;  2H1K A;  1U3O A;  3F0Z A;  1R8O B;  5LJ5 g;  1RT4 A;  5CVI A;  4F16 A;  1HRH A;  3CMA T;  2VPR A;  2A3Z A;  5E26 A;  3LYI A;  4OIN F;  3JAM E;  1GXI E;  3FZM A;  1N9S A;  2R7Q A;  2ZO4 A;  1PKS A;  2VC0 A;  4CK3 A;  2LQN A;  2GIV A;  2I0N A;  2BVM A;  2DK8 A;  1VQ8 N;  1VQO Q;  3CXC M;  2NYX A;  1ZGW A;  1Y0N A;  4JKB A;  3G4S T;  4H0V B;  2JSC A;  5HBM A;  2DTH A;  1VI0 A;  2OZS A;  4A5N A;  3SAH A;  3S14 J;  4CJT A;  4FJJ A;  3EGD B;  1NPR A;  1CXU A;  4BU2 A;  3OYI A;  1X1C A;  4XOR A;  1QZZ A;  2DPP B; 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 3DLK A;  2WAF A;  4RB1 A;  4X9C A;  3EYZ A;  4KUL A;  2DMU A;  3ZSW A;  4EA5 A;  1NOZ A;  2TCT A;  4DNC A;  4S04 A;  2VXE A;  2P9L A;  3HTU A;  4KIF A;  2GNC A;  3GOX A;  4F7U A;  4O5F A;  2VG5 A;  3QYB A;  2YHY A;  4IQJ A;  3CWA A;  1H3Z A;  3VKI A;  1WQ7 A;  4JP0 A;  4RTW A;  4G8X A;  5JMV A;  4CC4 B;  2QQ9 A;  4BYY A;  3TDU C;  3BY5 A;  1VQO N;  4CZG A;  3VEN A;  2BEO A;  2GBQ A;  2RJE A;  1KVC A;  1S6Q A;  4BHC A;  4LIV A;  3LFK A;  1S72 T;  3VGL A;  4WCG A;  4EMK B;  1OPC A;  5FWC A;  1TC3 C;  1KYW A;  2H8W A;  4CE9 A;  1W36 C;  4ORZ A;  1HNW K;  5ICC A;  4C1N K;  5AQJ A;  4KIC A;  1VSK A;  5A2Q K;  1Y8R B;  1RLP C;  1VQK Q;  4AM3 A;  4C2T A;  1NG2 A;  2CKK A;  1RBT A;  3O2P E;  1G3S A;  5A2Q E;  5AQY A;  5FLV A;  1WJC A;  4YOT A;  2DJN A;  1XHZ A;  4OAZ A;  4OIO F;  1QHG A;  4MGR A;  3I55 I;  3AG4 H;  2QA4 T;  4J7I A;  1KLN A;  1T6C A;  3ALY A;  2QGG A;  4OAY A;  3PSF A;  1R36 A;  2HS5 A;  1JJ2 M;  3I5S A;  4C5H A;  5IXF A;  3E9L A;  4MZT A;  2HQA A;  3TO6 A;  4Z89 A;  4B6M A;  2L01 A;  2RC4 A;  1T44 A;  2K6D A;  2EFN A;  3DEW A;  3O1W A;  3UKR A;  1XX5 A;  2G8F A;  1QVF P;  3OQ5 A;  3VQ7 A;  2QK9 A;  3NF6 A;  1ZRC A;  1V4S A;  4E9H A;  4MO4 A;  4R0K A;  3H45 C;  1VQO A;  1BYM A;  1GFC A;  3CJQ B;  2WSF E;  3SEM A;  4L6V 5;  4B1W B;  5D6E A;  1MDU B;  4A3L J;  4HXJ A;  1YX3 A;  4ESB A;  3DLA A;  1FN7 A;  3PNY A;  3EET A;  1O57 A;  2QI2 A;  3KXT A;  3I0X A;  1BM9 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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 3SQ1 A;  3ZRG A;  3E1S A;  1U1S A;  4M77 C;  5FLX E;  2XO7 A;  2V4J C;  3HST B;  3SEQ A;  2XY8 A;  1S1T A;  3OS1 A;  2KDS A;  2EQK A;  1RIL A;  2PQW A;  2XID A;  1Y6I A;  3BY7 A;  4CJR A;  3PFY A;  2VKH A;  1KG1 A;  2V75 A;  3LWI A;  4BD3 A;  4D9J A;  3QPH A;  1O75 A;  3NH0 A;  4F3Q A;  2VQC A;  3IG1 A;  1YJN T;  4LIT A;  3CBO A;  3GPL A;  2D9T A;  4M7D E;  4MML A;  3DRP A;  1VQL A;  1Y7X A;  4KHQ A;  2EIF A;  4BQQ A;  2G3R A;  4F7U F;  5DLO A;  2KHM A;  3QO3 A;  3M5A A;  3NH1 A;  1VQ4 A;  3DKY A;  5CKD A;  4PLI A;  3DB3 A;  4Z4I A;  1KCF A;  5DK5 A;  4E7I A;  1KQS A;  4EPC A;  1WJF A;  3A1Y A;  1QVG A;  4A4E A;  2DJI A;  2VWK A;  3HXL A;  5J2P A;  4A4F A;  3DU5 A;  4FIB A;  1N8R C;  2E1M B;  3AVC A;  5FRN A;  2ZPH B;  4CHP A;  2KY9 A;  4DU4 A;  4Z4G A;  3W3C A;  3CP8 A;  4FJM A;  2W7N A;  4HUE A;  3PIO A;  4K8X A;  2ZFU A;  3DTE A;  2MWP A;  3JCM J;  3DI6 A;  3TCJ A;  4DMN A;  1Q9Y A;  1P9Q C;  3HPO A;  1ZEL A;  1HA8 A;  4DIQ A;  2RHY A;  4DFK A;  5HK3 A;  2HVQ A;  1ERD A;  3A8M B;  4M75 C; 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