4BC3A

Crystal structure of human d-xylulokinase
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
525
structure length
525
Chain Sequence
RRCCLGWDFSTQQVKVVAVDAELNVFYEESVHFDRDLPEFGTQGGVHVHKDGLTVTSPVLMWVQALDIILEKMKASGFDFSQVLALSGAGQQHGSIYWKAGAQQALTSLSPDLRLHQQLQDCFSISDCPVWMDSSTTAQCRQLEAAVGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIYQQNPEAYSHTERISLVSSFAASLFLGSYSPIDYSDGSGMNLLQIQDKVWSQACLGACAPHLEEKLSPPVPSCSVVGAISSYYVQRYGFPPGCKVVAFTGDNPASLAGMRLEEGDIAVSLGTSDTLFLWLQEPMPALEGHIFCNPVDSQHYMALLCFKNGSLMREKIRNESVSRSWSDFSKALQSTEMGNGGNLGFYFDVMEITPEIIGRHRFNTENHKVAAFPGDVEVRALIEGQFMAKRIHAEGLGYRVMSKTKILATGGASHNREILQVLADVFDAPVYVIDTANSACVGSAYRAFHGLAGGTDVPFSEVVKLAPNPRLAATPSPGASQVYEALLPQYAKLEQRILSQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords XYLULOSE KINASE
publication title Structure and Function of Human Xylulokinase, an Enzyme with Important Roles in Carbohydrate Metabolism
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 185
structure length 525
sequence length 525
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.1.17: Xylulokinase.
pdb deposition date 2012-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc3A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc3A01
1KXPA 1NGIA 2IVNA 2GWKA 2QWLA 4PKIA 2J4RA 3CJ9A 3CJCA 3EKUA 2P9SB 5AZIB 4A62A 4MO5A 4QS9A 5BPLA 4BC2A 4IJAA 5KPTA 3HTVA 3F9MA 4BRQA 3QBWA 3EKSA 2V52B 5FPEA 4HTLA 3LL3A 3MCPA 3VESA 4AM7A 3W0LA 5KPZA 2ASPA 4FWOA 3ZEUB 2UYTA 3BEXA 3H3OB 3O1BA 1IJJA 2ASMA 2P9UA 1HLUA 3HZ6A 5BRFA 3IDHA 3HI0A 2VYPA 5BREA 3ENHA 1ATSA 3ZEUA 5BRDA 4BRKA 2F9TA 3ATUA 1BG3A 1GLEG 1ATRA 1C0FA 2HF4A 3O8MA 5AQZA 3DAWA 1WUAA 3VF2A 2H3GX 4IO8A 3FLCO 5KQDA 4K25A 2A6AA 4FWKA 5AQXA 5EX5A 5AQNA 3LM2A 1E4FT 2CGKA 2IVPA 2HOEA 5LJVA 1TUYA 1DKGD 3UE5A 3VGMA 4CD1A 3WUHA 4H0VB 4BRAA 4FWQA 1HJOA 4CZFA 4QS8A 3R9PA 4RWTA 5AQOA 1NGFA 3ZETB 1JCGA 4B1YB 3HSCA 1HKGA 4JNEA 4B9QA 2BUPA 3BP8A 1SZ2A 4CZMA 1R59O 1X3NA 2E20A 1EQYA 1V4SA 3ULEA 4IWVA 3OHRA 3MN7A 3VEYA 3FGUA 5LJWA 3I8BA 3MDQA 3A5NC 4BR5A 4O8KA 2PAVA 1YUWA 4FL9A 5AQIA 4H0PA 5BPNA 1U2VB 3ATVA 3B8AX 3CJAA 1BUPA 3U9DA 4B1XB 2P9IA 3RSEB 1T6DA 3H6EA 5AQLA 3WQUA 4MLEA 1NWKA 3AY9A 4F9OA 5I9EB 2VCPA 3DXKA 2E1ZA 2W41A 3C7NA 4BVOA 3GBTA 3R8EA 4RTFD 3QBXA 2QWQA 4RCHA 2YJEA 4BGAA 1BA1A 5AQWA 3IUCA 4XH4A 2QW9A 1NMDA 3FZKA 4H5NA 2CH5A 3A0IX 3CHWA 3ZX2A 4BRFA 5ADXA 4CJ7A 3KHYA 2P9SA 5AZIA 2Q36A 2ZGZA 4EAHD 3EO3A 4IXCA 4FWNA 2NLXA 5FPMA 4FWPA 4IZ9A 3FFKB 4ISEA 4JHDB 4IJNA 2FSKA 3VEVA 2P9IB 1HUXA 2P9LA 1MDUB 3DXKB 3O1WA 3W3DA 1QQMA 2D1KA 3VOVA 2FSNA 3DWLA 2Q31A 1GLLO 2W40A 3BUZB 3QFPA 5AQKA 4H03B 3CJ1A 3U8XA 2CGLA 4GNIA 3H46O 4H0XB 1J6ZA 3ZX3A 4BRDA 2ITMA 3FZLA 1HKCA 5ELZA 5FPDA 3DXMB 2A42A 4BVPA 3O80A 4WYBA 3GDQA 1XQSC 2V51B 3JXUA 4H5WA 2P9LB 1MA9B 1MWKA 1C0GA 3SJHA 3H1VX 5F1XA 1X3MA 4A2AA 3D7EO 2A40A 2OANA 3UKUA 4BRNA 2FF3B 4HWIA 4JN4A 5JICA 2Q1NA 2QXLA 4L3QA 5AFUH 4BR9A 3KVGA 4BROA 1S22A 2IIRA 5AQGA 2P9PB 3HM8A 2D0OA 1SAZA 4B1WB 5BRHA 1KAYA 3EZWA 4BG9A 2HMPA 4AM6A 3ZETA 1LCUA 1P8ZA 2WUSA 4PKGA 4CBXA 3KZBA 2YHWA 1JCFA 1QZ6A 4BRMA 3H3NO 1HKBA 3WEEB 1RGIA 1S3XA 3VEZA 4DQ8A 2V7ZA 1DEJA 4KBOA 3UKUB 5KQ8A 1SQKA 3WXJA 3C0BA 4A2BA 3DJCA 2AP1A 1U2VA 3H45C 4M63C 3SMSA 4BRCA 2QM1A 4WQ4C 2YCHA 1YAGA 5AQHA 3IFRA 5AQYA 3P4IA 3RSEA 4B1ZA 3UKRB 5AZJB 2NRHA 1QZ5A 1K8KA 3M6GA 3VEOA 2AA4A 2QWNA 1GLBG 4B1VA 3CJ7A 3M1FA 5F2RA 5E84A 3VF6A 2E8AA 4EFHA 3LDQA 1JCEA 3BF3A 1QQNA 1T6CA 3A5MC 5AQJA 4BG8A 2FLOA 4BQLA 3EL2A 4J8FA 4WQ4A 4BREA 3LDPA 2A3ZA 3MK6A 2D4WA 3D2EB 1NGJA 3VGKA 3M3ZA 2E2PA 1ESVA 2CGJA 4FOEA 3AAPA 4PKHA 4JHDA 3WXLA 5AQTA 4ISFA 1NGAA 4CZHA 4XH5A 1K8KB 4LC9B 4B1UB 1ZXOA 3JS6A 3MN9A 1BU6O 3SLCA 2D0PA 3A5OC 2E2QA 1BO5O 2P9KB 1CZAN 4MLHA 2GWJA 4M7YA 4BR7A 1GLFO 2CH6A 3DXMA 3CERA 3SK3A 4BC3A 2A5XA 1HX1A 3UB5A 5AQVA 1U6ZA 2I7PA 3O5BA 3QMLA 5EXWA 3TPQA 1NGEA 3HBTA 1D4XA 4BRGA 3VGLA 1V4TA 2FXUA 4YDUC 1ZC6A 3AARA 5JLFA 5AQFA 5EOYA 4H5RA 1G99A 4BRIA 5BN8A 3L4IA 4BC4A 4H5VA 5BR9A 3SMPA 1E4GT 4A61A 2GELA 4I6MB 3ID8A 4BR2A 1TYQB 1NBWA 2P9PA 5TKYA 4YDUA 4FWSA 3LDNA 3QDKA 1IG8A 2GUPA 5JMVA 2I7NA 4WQ5C 1OKJA 3FZFA 3WEEA 1WOQA 1DGKN 4O5FA 1ZBSA 5BPMA 1NM1A 2E88A 3R6MA 4CZLA 5JLHA 5EVZA 5AQSA 3ZX0A 1NGCA 2QWOA 3U9ZA 4CBUA 1H1VA 5AFUA 4BC5A 3CI5A 4JAXA 4FSVA 3VPZA 2IVOA 3VEXA 3FR0A 2YJFA 4CD3A 3I33A 2A41A 4WQ5A 4DCHA 2ASOA 5AR0A 3FE1A 1Q18A 3S41A 3WXIA 4FOIA 4C23A 3GOIA 4H0TB 1GLDG 4H0OA 3UKRA 4CZGA 5AZJA 1XC3A 3VF4A 4EHUA 3CIPA 4QS7A 2Q97A 2PBDA 3L0QA 4BGBA 5CE3A 1KAXA 3D2FA 3LDOA 4BRHA 3FZHA 3MMVA 2FF6A 3CETA 4H0YB 4M7XA 3D2EA 1X9JA 1Z05A 3GE1A 1BDGA 4ISGA 1RFQA 5KPRA 5AQUA 5LY3A 2QWMA 1LOTB 2QWPA 2ZGYA 3WQTA 2YHYA 1GLCG 3GG4A 1YXQA 2E2OA 3WT0A 3QFUA 3G25A 4BR0A 1RDWX 4FPBA 2V7YA 4PL8A 2ZWHA 4CZJA 3D2FB 2P9KA 3QICA 3L6QA 2P9UB 2ZF5O 2BTFA 2NZTA 3MN5A 3VEWA 4FWLA 2GTDA 3GL1A 4FPAA 4CZIA 3LDLA 1ATNA 2E2NA 1BA0A 2P9NA 3J8AA 4BRLA 5F0XA 2KHOA 4XEIA 3H1QA 5AQPA 1Y64A 2DPNA 4XH1A 4E1JA 1YVNA 3A5LC 2F9WA 1NGBA 3CQYA 4FO0A 1T44A 4K43A 1KAZA 2Q2RA 1MWMA 4BRPA 1Z6RA 3LM9A 1XUPO 1NGGA 3FZMA 3ENOA 2FSJA 4JD2A 4BR4A 2QWRA 4Z94A 4FWMA 5AQRA 2P9NB 5BN9A 3VETA 5EY4A 1QQOA 4BQZA 4CBWA 4I6MA 1BOTO 1TYQA 3O08A 2EWSA 2Q0UA 2HF3A 4NO7A 5FPNA 3IMXA 3O4WA 3ULEB 4CZEA 2GEMA 5AQMA 4CI6A 3MN6A 2Q0RA 4PL7A 2E1YA 2YHXA 3U4LA 5E26A 3VERA 4DHYA 4GY2B 1TUUA 4JD2B 3EN9A 3WXKA 3AAQA 2VWBA 3BF1A 1QHAA 5ADXH 4DB3A 4NB4A 4K42A 3O6WA 1NGDA 3CQXA 4H5TA 5AQQA 4EIAA 5B8HA 4EHTA 4MO4A 4CZKA 1BWFO 1GLJO 4Y0WA 1NLVA 3C7NB 3A8YA 1GLAG 3TU5A 1HPMA 4K41A 4FWRA 3QB0A 3CJBA 3VENA 1NGHA 2YI1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UQGA 3QERA 1KXPA 2QWLA 4PKIA 4A5AA 2J4RA 3CJ9A 4J2EA 3EKUA 5AZIB 1HNWK 4CCHA 1W7AA 4A62A 2E4LA 4CFAA 3U3GA 4MO5A 4QS9A 1QQCA 3CYMA 2UU9K 1X9MA 4BRQA 3SV3A 2OZMA 2QI2A 3LL3A 3W0LA 4F2RA 1NKEA 5KPZA 2ASPA 3BEXA 2B4JA 1JLGA 3CCSN 4CEDA 3IDHA 3HI0A 2UXCK 2VYPA 5BREA 1SKSA 1KCFA 3C6TA 3VQPA 1XHXA 2F9TA 5TKWA 4PY5A 3AVIA 5AQZA 1EO1A 1WUAA 4CF2A 3OYGA 4B9TA 4DFKA 3TANA 4FZYA 2P1JA 4C8LA 5KQDA 3DLGA 5HOOA 5EX5A 5AQNA 5C25A 1E4FT 1LWCA 1N8RO 3TARA 4ZTJA 3TSUA 1NJXA 5GADP 2OPRA 1DKGD 1TKZA 4CD1A 4DUYK 4RW6A 1RDDA 4BRAA 3J7AP 4DU3A 1NGFA 3ZETB 3HSCA 1HKGA 4N76A 4Z0UA 4X66K 3UIQA 3L4QA 3BP8A 1SZ2A 4CZMA 3QIOA 3THXA 1QVGM 1X3NA 2E20A 3TSQA 3ULEA 3WNGA 4ICLA 3TAMA 1OH7A 3MWPA 3MN7A 4KTZA 4CGJA 4BR5A 3OJSA 3DRPA 2RF2A 3N4PA 4DQQA 3L8BA 4YOVA 4CJVA 3HO1A 5AQIA 2W6LA 3ULDA 3B8AX 1BCOA 3V9WA 1O1WA 4E1MA 3RSEB 3L2RA 3NVKA 2KW4A 3VA3A 4F9OA 3DXKA 4FLZA 3SAFA 1KQSM 3GBTA 4OPHA 3V1QA 2UUCK 4DR7K 3QBXA 2QWQA 4DQSA 3IUCA 4XH4A 2QW9A 4H5NA 3AVLA 3NHGA 3CHWA 4KI6A 2BE2A 5ADXA 1I3AA 1TK5A 3QEVA 2NRTA 1ZYQA 2VGMA 4IXCA 2NLXA 4FWPA 4CJSA 3LWLA 4ISEA 5FLXO 4F4KA 2P9IB 1HUXA 1ZBUA 2RHKA 1RNHA 5CYMA 1OH8A 1NJWA 1ZBFA 3VOVA 3T3FA 2HBJA 3DWLA 4H4OA 1NG9A 3HP9A 1GLLO 5LMUK 4H03B 4WFNL 1YJWN 4BRDA 4O55A 5ELZA 3DXMB 2A42A 1X1PA 3O80A 3SUQA 2KFNA 3NF6A 3RRHA 3RMCA 1D9DA 1WNSA 3K0SA 4B3MK 1VQ6N 1SV5A 4HTUA 2P9LB 2PZSA 2NUBA 3WNHA 3RVCA 4FZZA 3B6OA 3SJHA 3THVA 1E3MA 3EE9A 3WNFA 5DMRA 4BRNA 4U7BA 4HWIA 4JN4A 2Q1NA 2QXLA 1RCHA 3QNOA 2HVIA 4BR9A 3KVGA 2QKKA 4BROA 3DM2A 3E9LA 4KH4A 1BGXT 1UAXA 4E89A 1C0TA 2UXBK 4FVMA 1SS6A 4BY9C 1LCUA 3ZYYX 3AVNA 3CPEA 4F3TA 4DTSA 1EX4A 2NRVA 1QZ6A 4M3YA 3I0RA 4ELTA 3CG7A 1IG9A 3WEEB 4OPJA 1TAUA 4DR2K 4PWDA 3O4NA 1ZBHA 3NGYA 2G8VA 3CCUN 4DR4K 5CZ1A 2OTJN 3WXJA 4E0DA 2W6KA 4A2BA 2HHTA 3ZSQA 5C2DA 4BRCA 5IT9O 2QM1A 4LF7K 2YCHA 5AQYA 1VQ8N 4E3SA 3L2WA 4B1ZA 4FW2A 3UKRB 5AZJB 3LANA 3M6GA 3AVHA 1GLBG 5F2RA 4ELUA 1RT3A 4FLVA 2E8AA 3BF3A 1T6CA 3A5MC 2JWKA 4BQLA 3T1YK 2Y1JA 3DYAA 3EL2A 4G1QA 4WQ4A 1IKYA 5CY4A 3D2EB 3VGKA 2YNIA 1L3TA 1ESVA 4O0JA 4B9LA 4ELVA 4X62K 3WXLA 4ILGB 4BDYA 3OW2M 3TTDA 1A5WA 2QA4N 1K8KB 3LALA 3JS6A 4JK9A 3C6UA 2DTUA 3SLCA 2D0PA 3A5OC 2X6SA 2P9KB 3TAEA 3VQ5A 4OLAA 3LP1A 3CMEN 4BDZA 1LW0A 5DK5A 1Q9YA 3OBWA 1J5OA 3HP6A 3AA2A 1K6YA 4DV1K 4BC3A 2A1SA 3O5BA 4CECA 1A5XA 1FW6A 3VTHA 2G8FA 1DTQA 4CFDA 4OX9K 4KPYA 1D4XA 4BRGA 4IEIA 1BCMA 4DTNA 4B9UA 1V4TA 4YDUC 2OA8A 3AARA 3KKSA 3V9ZA 5AQFA 1WN7A 4BRIA 4FJKA 3QEPA 4H5VA 1E4GT 3ID8A 1A5VA 1YTAA 1TYQB 2VG5A 4JKBA 1XMQK 1NBWA 3NDKA 1BL3A 3OBYA 4JKAA 4WE1A 2HNYA 1LWEA 1C1AA 4M3WA 3HJFA 3K5NA 4B9NA 2IGIA 4DKWA 4CJ3A 4O5FA 2E88A 3ZX0A 1NGCA 2O8DB 5C24A 1XMOK 3THWA 3VPZA 2IVOA 3FR0A 4CD3A 3T1AA 2ASOA 4DWIA 3AVFA 3L3VA 4CZGA 1GLDG 4LF4K 4EHUA 1KFSA 4AILC 1RT2A 4NYNA 3L3UA 3G10A 4AHTA 4LF6K 2Q97A 4KTQA 4IG3A 1NK7A 3D2FA 3CF5L 3LAKA 2WFBA 4BRHA 4DU4A 5GAEP 5M1KA 3AA4A 4W5TA 4NCGA 4FZXC 1N34K 1RFQA 5KPRA 2XO7A 5LY3A 2QWMA 2Y1IA 1YJ9N 1TL3A 2F8SA 1VQNN 3U3YA 3O9UA 4BR0A 1RDWX 3HM9A 3HVTA 3NE6A 3T7ZA 3LZJA 4KV8A 4PL8A 4IKFA 3DLRA 3P83D 3K5LA 1HYSA 1T7PA 3VEWA 1BHLA 4FWLA 3GL1A 4CZIA 4Z4FA 2Z1GA 1ATNA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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