4BC4A

Crystal structure of human d-xylulokinase in complex with d-xylulose
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
525
structure length
525
Chain Sequence
RRCCLGWDFSTQQVKVVAVDAELNVFYEESVHFDRDLPEFGTQGGVHVHKDGLTVTSPVLMWVQALDIILEKMKASGFDFSQVLALSGAGQQHGSIYWKAGAQQALTSLSPDLRLHQQLQDCFSISDCPVWMDSSTTAQCRQLEAAVGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIYQQNPEAYSHTERISLVSSFAASLFLGSYSPIDYSDGSGMNLLQIQDKVWSQACLGACAPHLEEKLSPPVPSCSVVGAISSYYVQRYGFPPGCKVVAFTGDNPASLAGMRLEEGDIAVSLGTSDTLFLWLQEPMPALEGHIFCNPVDSQHYMALLCFKNGSLMREKIRNESVSRSWSDFSKALQSTEMGNGGNLGFYFDVMEITPEIIGRHRFNTENHKVAAFPGDVEVRALIEGQFMAKRIHAEGLGYRVMSKTKILATGGASHNREILQVLADVFDAPVYVIDTANSACVGSAYRAFHGLAGGTDVPFSEVVKLAPNPRLAATPSPGASQVYEALLPQYAKLEQRILSQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords XYLULOSE KINASE
publication title Structure and Function of Human Xylulokinase, an Enzyme with Important Roles in Carbohydrate Metabolism
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 181
structure length 525
sequence length 525
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.1.17: Xylulokinase.
pdb deposition date 2012-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc4A01
4M63C 4B1WB 1IG8A 5E26A 1TUYA 4MLEA 2EWSA 4QS7A 3AY9A 3DJCA 2ZGYA 2P9NB 5AQMA 3WXIA 4CBWA 3ZETA 2ASOA 4M7XA 2V51B 4BRPA 4CD3A 1NBWA 2FLOA 3H45C 5EY4A 3H1VX 1X3NA 4GNIA 4IXCA 4CBUA 2GWJA 2P9LB 4BR0A 2P9NA 2Q0UA 5JICA 3R8EA 3U4LA 3BF3A 3SLCA 1ZBSA 3ENHA 1HUXA 1HKGA 4EHTA 3VENA 2A6AA 2A41A 4NB4A 1DKGD 3WQUA 1WOQA 3DAWA 2P9LA 4CD1A 1BO5O 3GDQA 1C0GA 2VWBA 3QB0A 1BA0A 3HZ6A 1XUPO 2V7YA 3EL2A 2YJEA 3O1WA 5EVZA 2Q31A 1BA1A 5FPEA 1KAYA 2D1KA 2WUSA 1DEJA 1OKJA 4FSVA 4CZMA 4FPAA 3QBXA 3M6GA 3D2FB 1NGGA 3TPQA 2E2PA 3VF2A 3QDKA 4BQLA 3CQXA 2NZTA 1E4GT 2E1ZA 5FPNA 3CERA 2Q2RA 4FWKA 3KZBA 1GLFO 3KHYA 3DWLA 3H6EA 3OHRA 4CZEA 3D2FA 3WXKA 5AQPA 3CQYA 4H0VB 3LM2A 4DQ8A 1LOTB 1YAGA 2VCPA 4H0TB 3ZX2A 2CH5A 2P9SB 3A5LC 4KBOA 4MLHA 1NGCA 3JXUA 3EKSA 3BUZB 4F9OA 4PKIA 5KQDA 3CETA 1X9JA 2IVPA 1MWMA 3QFUA 2ASPA 4BR2A 2CGLA 3A8YA 4QS9A 3BEXA 3A5OC 5AFUA 1IJJA 3J8AA 2P9SA 4M7YA 1TYQB 3DXKB 1TUUA 5BPNA 5B8HA 4FWNA 4FWSA 3B8AX 2VYPA 3VESA 5FPMA 2PBDA 4CZLA 4EHUA 3IUCA 1QQOA 3EKUA 4RCHA 2E1YA 4EFHA 3W0LA 5E84A 5BRFA 2UYTA 1TYQA 1BDGA 3DXKA 5AQQA 3WT0A 3R9PA 4BVOA 1KXPA 1CZAN 1ATSA 2Q97A 2QWNA 1T6CA 5AQVA 5AQHA 2E8AA 5JLFA 3CJCA 4IJNA 3ZEUB 1S3XA 2W40A 3LDLA 4XEIA 4H03B 5AQFA 3ZX0A 3ID8A 1X3MA 3CJ7A 3QBWA 1S22A 3G25A 3UKUB 4JAXA 3ULEB 4DHYA 4BRFA 3UB5A 4L3QA 3R6MA 3ZEUA 4BR4A 3BF1A 3U8XA 4PL7A 1EQYA 3C0BA 5BN9A 1BOTO 5JLHA 4BRLA 3U9ZA 3UKUA 3F9MA 4Z94A 3FZKA 4ISFA 3ULEA 3QMLA 1NGBA 3AARA 2QM1A 2YJFA 5KPRA 3HM8A 2GEMA 3FFKB 4MO4A 3D2EB 1MDUB 4BRGA 1XC3A 2P9IB 2P9KB 4JN4A 5AR0A 3EN9A 2P9UB 3O6WA 4PKGA 3A0IX 4C23A 1QQNA 2Q36A 4BRDA 4JNEA 4A61A 3LDNA 2IIRA 4B9QA 1U2VB 3FZLA 3D2EA 1YVNA 3MN6A 3HBTA 2P9KA 2A40A 3VEXA 3VF6A 4B1YB 1RGIA 5ELZA 2P9UA 2W41A 3FR0A 4H0XB 1SZ2A 4NO7A 2A3ZA 3L6QA 2P9PB 3ZX3A 5AQWA 4IO8A 3SMSA 3H3OB 3FLCO 1D4XA 1U2VA 3M1FA 3VERA 4BRMA 3SJHA 4CZFA 4I6MB 2QWQA 5F2RA 2E2QA 3IFRA 3RSEB 5AQNA 5TKYA 5AQIA 2P9PA 3JS6A 3VEZA 4FO0A 1GLAG 3GOIA 3CHWA 3SK3A 4BG9A 4BR7A 1ESVA 4CZKA 3CI5A 1LCUA 5AQXA 1GLJO 1MWKA 2V7ZA 4H5NA 2V52B 3TU5A 4B1ZA 2D4WA 1NGIA 1NWKA 3FZHA 2GELA 3GE1A 4I6MA 4K41A 3MMVA 1HJOA 1T6DA 3RSEA 4BRQA 3MN5A 4IJAA 2E2NA 3QFPA 3M3ZA 4H0YB 1WUAA 1E4FT 3H1QA 2QWOA 3O1BA 3ATVA 4CJ7A 5BREA 4CI6A 1ZC6A 2FXUA 1V4TA 5F0XA 2Q1NA 3LDOA 2D0PA 4BRAA 4FOEA 4BGBA 5AQOA 3VGLA 1HKCA 3QICA 2HF4A 1HLUA 1R59O 1NLVA 1NGHA 2E20A 4FWLA 2ASMA 4IWVA 3VGKA 1Q18A 4K42A 2ZF5O 4E1JA 1YUWA 1KAZA 1NGEA 4H5VA 4CZHA 1Z6RA 5AFUH 2FSNA 2GTDA 3VF4A 2ZWHA 5BRDA 4PKHA 4EIAA 2I7NA 1BU6O 5ADXA 4CZJA 3W3DA 5BRHA 2BTFA 2GWKA 4FPBA 4BREA 5BN8A 3AAQA 3VEWA 3LDPA 4YDUA 1BUPA 4K25A 5AQKA 3UE5A 3H46O 5AQRA 3VGMA 4JHDB 1RDWX 4WYBA 4RTFD 3GL1A 1NGJA 3CJAA 4FOIA 4WQ4A 3WUHA 5AQUA 4BQZA 3IMXA 3WEEB 2HF3A 2YCHA 4ISGA 2HOEA 2A5XA 1BG3A 2FF6A 4JHDA 1J6ZA 3HSCA 2YHXA 5KPZA 1RFQA 4YDUC 2PAVA 2CGJA 3CIPA 4BGAA 5KQ8A 3LL3A 2E2OA 1GLCG 1SQKA 3VEVA 5KPTA 3WEEA 3D7EO 1G99A 3VEYA 3WXJA 4H5RA 4IZ9A 5EOYA 1NGDA 3UKRB 2QXLA 4WQ4C 2YHYA 3C7NB 4HWIA 4WQ5A 2QWPA 3EO3A 3CJ1A 1C0FA 1Z05A 3O08A 5AQGA 3WXLA 4BC4A 5LJWA 3I8BA 4XH5A 1HX1A 2QWMA 4LC9B 5EXWA 4BG8A 4FWOA 3GG4A 4DCHA 5FPDA 2CH6A 2P9IA 2FF3B 4EAHD 4BRNA 3UKRA 2ITMA 1NGFA 4A2BA 4FWMA 1QQMA 1DGKN 2IVOA 2OANA 3C7NA 2D0OA 3HI0A 1ATNA 3L4IA 4BRKA 4BC3A 4QS8A 1GLDG 4XH1A 4A62A 2QWRA 3KVGA 1QHAA 1T44A 5BPMA 3FZMA 3LDQA 4WQ5C 3HTVA 3L0QA 1GLBG 4BRHA 4B1UB 2IVNA 5BPLA 2NRHA 2Q0RA 2BUPA 1NMDA 3BP8A 3MN9A 4BRIA 1H1VA 3EZWA 5AQZA 2KHOA 3ENOA 4FL9A 1HKBA 3LM9A 3WQTA 4GY2B 3FZFA 4K43A 4Y0WA 1BWFO 4CZIA 4J8FA 4H5TA 2AP1A 2QWLA 4BR5A 2F9TA 2NLXA 5AQSA 5AQJA 5I9EB 1ZXOA 2FSJA 1JCEA 1JCFA 4BR9A 4JD2B 3O80A 3FE1A 5AQYA 4HTLA 3O8MA 3VOVA 3I33A 4FWQA 4FWPA 4BC5A 5LY3A 2QW9A 3MK6A 5AZIB 3SMPA 1QZ6A 4JD2A 3DXMB 4PL8A 4H5WA 2CGKA 4O5FA 1MA9B 4FWRA 4H0OA 5AQTA 2YHWA 1QZ5A 4RWTA 1JCGA 2DPNA 3A5NC 1XQSC 3VPZA 5JMVA 2E88A 4H0PA 1NGAA 5F1XA 5LJVA 5AZIA 3S41A 4BC2A 3DXMA 5AZJB 4B1XB 1V4SA 4CZGA 5EX5A 2J4RA 3H3NO 3U9DA 1GLLO 5ADXH 2YI1A 2ZGZA 3CJBA 1SAZA 4BVPA 3O5BA 4O8KA 3MN7A 4B1VA 3ATUA 3CJ9A 5BR9A 5AZJA 2H3GX 2I7PA 4A2AA 4DB3A 1NM1A 3VETA 3A5MC 1K8KB 2F9WA 5AQLA 4BROA 3GBTA 1P8ZA 1YXQA 3VEOA 4AM6A 1KAXA 4AM7A 4BRCA 3MCPA 3IDHA 3MDQA 2FSKA 2HMPA 5CE3A 3AAPA 1GLEG 2AA4A 3ZETB 3FGUA 3O4WA 4XH4A 1Y64A 1U6ZA 2GUPA 1HPMA 2A42A 4ISEA 1K8KA 4MO5A 4CBXA 3P4IA 1ATRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4M63C 4B1WB 3T3FA 3S3NA 3DLBA 4CF9A 3QERA 4N41A 1RBUA 3THXA 3CC2N 4BRPA 3K0SA 1NBWA 2FBTA 4DFPA 2ZQBA 1KRPA 3OYJA 4PWDA 1RDUA 3SQ0A 3OS2A 3H45C 3OW2M 1U4BA 4GNIA 2RPIA 2E4LA 5J1EA 3DLEA 1TAQA 3G4SN 4CBUA 3TANA 4CGHA 2PZSA 1RBTA 3M8RA 3P39A 1JLAA 1IV0A 2A6AA 4Z4FA 2VGMA 3C65A 4CFDA 4CF1A 1S5JA 3KK2A 2ZM6K 1S72N 2JLEA 2QXFA 4DSFA 2P9LA 3P5JA 3J7YP 1C0GA 2P51A 3TSPA 4RG8A 1SKRA 4CVNE 1BA0A 3HZ6A 4CGJA 1IKWA 2YJEA 3O1WA 2Q31A 2ZJQL 4E89A 1BA1A 1KAYA 4E7JA 1DEJA 4FSVA 4CZMA 4FPAA 4I9QA 1JL1A 3CQXA 3AO4A 4DTMA 1TV6A 1KSPA 2WC9A 3VN5A 3CERA 3SNNA 1VQ5N 3T1HK 3DWLA 3H6EA 3D2FA 3QEPA 3CQYA 1N36K 1YAGA 4KHWA 4CK2A 2KFNA 1VSLA 2CH5A 2NUBA 2P9SB 4IEEA 4MLHA 1NKEA 1TL3A 5HBMA 1N8RO 4JKFA 4F9OA 1T3VA 1NK5A 4GV3A 5KQDA 4CEBA 4AHSA 4FJLA 3CETA 2IVPA 3QFUA 3HP9A 2CGLA 3A8YA 2BGGA 4JKDA 1IJJA 2GUIA 3CCQN 3J7ZO 1RTDA 2AJQA 4CJPA 3EZ5A 5B8HA 4CEAA 4FWSA 2PBDA 4CZLA 1QE1A 2OCEA 2A1SA 1QQOA 4C8MA 4DR2K 3EKUA 4LY7A 5I42A 3V6DA 1XHZA 2WTUA 2O8CB 1TYQA 3DXKA 1BIUA 1OVYA 3AA2A 1KXPA 1SS6A 4L8RB 1ATSA 5J2PA 1C0MA 4ZTJA 4M3ZA 2QWNA 5H1SQ 4A5BA 5AQVA 1L3TA 5GIPA 3ZX0A 3RTVA 1X3MA 1FKOA 3QBWA 3CMAN 3VQ8A 1KD1O 2KKZA 3QIOA 5M1FA 3OTOK 2F8SA 4O8UA 1GOAA 3BF1A 1K9MO 4KI6A 1EX4A 3F73A 4BACA 1BOTO 2OTLN 4BRLA 3U9ZA 2QEXN 3UKUA 3F9MA 4Z94A 4ISFA 3ULEA 3QMLA 2E5LK 1TVRA 4AF1A 5KPRA 4CJ4A 2DFFA 1WB9A 3D2EB 3ZSQA 1XC3A 1HQEA 2P9IB 4JEPA 5AR0A 3TAQA 2E6LA 1XNRK 3MX5A 2P9UB 4PKGA 4BRDA 4F2RA 3TARA 2P5GA 3KLFA 1VSMA 1WSFA 4NYNA 4O44A 4KTZA 1QHTA 4DU3A 1YVNA 3MN6A 3TAGA 4WCEL 1HRHA 2P9KA 4GKKK 4E1MA 3THVA 4B1YB 2W41A 1SZ2A 3KK3A 2P9PB 3HPHA 1S1TA 2G8FA 4Z4GA 1HYZA 3SMSA 2VWJA 3TWHA 1U2VA 3M1FA 1TAUA 4BRMA 1SUQA 5TKYA 3DOLA 4CJQA 1YHQN 3VEZA 4FO0A 3GOIA 1ESVA 4Z4EA 3DM2A 1GLJO 1A5VA 3CXCM 1JJ2M 4B1ZA 3FZHA 2GELA 3DOKA 4H0YB 2JWKA 3M3ZA 2HW3A 1KVAA 2BDPA 4CJ7A 3VQ6A 5BREA 1N5YA 3EEQA 1NK4A 3CPEA 2YV0X 4J2AA 3QEIA 1S1WA 2KLAA 1OVQA 3QICA 2HF4A 1R59O 4NCBA 1NLVA 1BQNA 1WNSA 2YX6A 3VGKA 5GAGP 3S9HA 4DTRA 1C0TA 3KLGA 1JLFA 1T05A 4E1JA 3TAFA 1HYSA 1UOCA 1NGEA 4H5VA 3AO5A 4OLAA 1LWCA 2ZD1A 2F96A 4ZHRA 3BDPA 1RT2A 2FSNA 3E01A 2ZWHA 3CF5L 4PY5A 1KVCA 4CHQA 5ADXA 5M1KA 5SZTA 4LF6K 3THYA 4QAGA 4BY9C 4FPBA 3RRHA 1OH5A 1BCOA 1HNVA 5CZ2A 1BUPA 5AQKA 3UE5A 3LP1A 5AQRA 3PUFA 1SL2A 4OVLA 3TSUA 4CFCA 3GL1A 3AVNA 4C1NK 1NGJA 4UY8O 4FOIA 1Q8IA 5AQUA 4KB0A 4G9ZA 4FW2A 3JYTA 3K5OA 2HOEA 4B9LA 2A5XA 2O8BA 1BG3A 4JHDA 1BQMA 4OPHA 1JLEA 1J6ZA 5CYMA 4KTWA 1M1KO 5KPZA 4B3MK 5LMNK 3P38A 1NG9A 2CGJA 1YTAA 3O9TA 3MX2A 1GLCG 2B6AA 3WEEA 2UUBK 3V1QA 4H5RA 4IZ9A 3V1OA 4JLHA 4DG1A 4OKKA 4DS5A 4ID5A 3VTIA 2YHYA 3C7NB 1C0FA 4X66K 2KZMA 5LJWA 3HJFA 1NK6A 4DCHA 4KPYA 1A5WA 3LZJA 3S3MA 4BRNA 2ITMA 1NGFA 4A2BA 4FWMA 4E7KA 4DFMA 4HTUA 4M3YA 3PLAA 4DV1K 3SUQA 5C42A 3ZSXA 2BE2A 3LP3A 4XH1A 1MU2A 4CEQA 1T44A 3HTVA 1WN7A 3VQQA 1T7PA 2P1JA 4DF4A 1IG9A 3UIQA 1CZ9A 2IC3A 2KHOA 2KFZA 3VQ5A 4HCCA 3WQTA 4GY2B 2WFBA 1WSGA 3NDKA 4FJGA 1BWFO 4J8FA 4Z0UA 3E66A 4DV0K 3PX0A 4Y1DA 3MCAB 1IO2A 3DLGA 1FW6A 4PUOA 1UA1A 4LF8K 2NLXA 2QK9A 3O9RA 3E9LA 1RNHA 3OYEA 1JCEA 2HVHA 1RCHA 1JCFA 4CF2A 3S3OA 2IS3A 2O8DB 3QNOA 3SBTA 2O8FA 4ICLA 4DKWA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4IOA L;  2O4I A;  4X62 K;  3WUH A;  1BL3 A;  3WEE B;  4CGF A;  4AHC A;  2YCH A;  1B9D A;  4NXM K;  4LF7 K;  1VSJ A;  4DV6 K;  5KRS A;  1HR0 K;  1VSI A;  3SPZ A;  4YDU C;  4BGA A;  4CER A;  3LL3 A;  2E2O A;  3VEV A;  1G99 A;  5EOY A;  1YT3 A;  5C10 A;  4DQS A;  3SV3 A;  3MED A;  2VG7 A;  5BR8 K;  2B5J A;  4CHY A;  4WQ5 A;  2D5R A;  2QWP A;  3O08 A;  3WXL A;  4PHT X;  1KTQ A;  1BI4 A;  2FF3 B;  3CCJ N;  3NH2 A;  3UKR A;  4CHZ A;  1OH7 A;  1U47 A;  1DGK N;  1FXX A;  4FW1 A;  2G8U A;  3VQB A;  2Q3S A;  3L4I A;  1C0U A;  1IKX A;  2VWK A;  1SKW A;  4DTU A;  3R3L A;  1RT3 A;  4BC3 A;  3OYN A;  4QS8 A;  2WON A;  3KVG A;  4CJF A;  3L2Q A;  3FZM A;  4WQ5 C;  4U67 L;  1O1W A;  1GLB G;  3L0Q A;  3M8S A;  3ALY A;  4BRH A;  3L2R A;  2Q0R A;  4IO9 L;  2BUP A;  3BP8 A;  3MN9 A;  4BRI A;  4TSX A;  3MAQ A;  4Z4C A;  3EY1 A;  3ENO A;  2PFU A;  1HKB A;  3LM9 A;  1ZYQ A;  1G15 A;  4Y0W A;  2HHS A;  2QTD A;  4CZI A;  1Z26 A;  2O8F B;  4X64 K;  1RBS A;  3A2F A;  4BR5 A;  4CCH A;  2F9T A;  5AQS A;  3SZ2 A;  1EWR A;  5AQJ A;  3ZCM A;  2VGN A;  3HOT A;  2D0B A;  1YF5 L;  3RWU A;  4BR9 A;  2XO7 A;  3O80 A;  3L2U A;  4CJ3 A;  4E3S A;  3L2V A;  4CJE A;  4CJK A;  1TK8 A;  1I39 A;  3OJU A;  4FWP A;  4BC5 A;  1BHL A;  2QW9 A;  5AZI B;  4JYA K;  5C0Y A;  4PL8 A;  1VQO N;  1Q9X A;  3VQ9 A;  1MA9 B;  4W5O A;  2YHW A;  1QZ5 A;  3F9K A;  4RWT A;  3B6P A;  1XQS C;  4RW9 A;  3QEV A;  1KQS M;  4RW8 A;  4AIL C;  3IG1 A;  3DLR A;  4UQG A;  3I56 N;  3KWG A;  1HNZ K;  1V4S A;  4AHT A;  2E6M A;  4DR6 K;  1IBL K;  4DLE A;  2YI1 A;  4E0D A;  3CJB A;  3CPW M;  1SAZ A;  2RN2 A;  4O8K A;  3OYI A;  3MN7 A;  3OYM A;  3ATU A;  2JWL A;  5C24 A;  3PO4 A;  1ILY A;  3NH1 A;  3AO1 A;  3RRG A;  2H3G X;  3LPU A;  1NM1 A;  1K8K B;  4E19 A;  3T69 A;  3KTQ A;  4BRO A;  1KAX A;  4AM7 A;  3AVH A;  4DWI A;  3LAM A;  3HL8 A;  2OZM A;  3ZET B;  3O4W A;  3HT3 A;  1YJW N;  4MDA A;  1K8A O;  4CBX A;  1ATR A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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