4BCKA

Structure of cdk2 in complex with cyclin a and a 2-amino-4-heteroaryl- pyrimidine inhibitor
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
299
structure length
298
Chain Sequence
GSMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/cell cycle
molecule keywords CYCLIN-DEPENDENT KINASE 2
publication title Comparative Structural and Functional Studies of 4-(Thiazol- 5-Yl)-2-(Phenylamino)Pyrimidine-5-Carbonitrile Cdk9 Inhibitors Suggest the Basis for Isotype Selectivity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 298
sequence length 299
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2012-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4bckA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4bckA01
3V5TA 2R2PA 4B9DA 4RIYA 2OGVA 3FBVA 4O1OA 4HCTA 3RAHA 4C4IA 4FVQA 4PMSA 4L3JA 5K3YA 4FKJA 1GZKA 4GMYA 1ERKA 5F9EA 5EKNA 5FEEA 2ONLC 4QRCA 3MY1A 3FMJA 5C27A 4D1SA 2J90A 4G3GA 5JT2A 3DBFA 3OMVA 3OEFX 3PIZA 4AGDA 3ZCLA 4MX9A 4EKKA 5LMKC 1LPUA 3D15A 3AMAA 3VO3A 3AC5A 2BIKB 3KKVA 4EOOA 2B53A 3AC2A 3MW1A 4X6RA 3RP9A 4N6YA 1PHKA 3QALE 3GQIA 4BKZA 2R3IA 2X7GA 2QOLA 4BB4A 4F63A 4M67A 1WVYA 3VQHA 3FMNA 1GJOA 4GYIA 4YTHA 4MXZA 3QA8A 4GRBA 5JFVA 5IQGA 2GNIA 3GBZA 2YN8A 5M4IA 2QLQA 5D12A 4F1TA 3AT3A 5AP3A 3TUDA 4II5A 1W0XC 2VV9A 3D7TB 4O7VA 5HCZA 3SW7A 3S00A 3FZTA 3C7QA 2PHKA 2C1BA 4UY9A 3BBWA 2ITOA 3FAAA 4YLJA 5CALA 1A9UA 1H1SA 4JAIA 4KAOA 4AXAA 3HDMA 3ZRMA 2B55A 5L2QA 1Q61A 2C6MA 4BZNA 3DGKA 3PA5A 1H24A 2RFSA 4AOJA 3IQ7A 3MFTA 1Q41A 1XH6A 4WNOA 3GXLA 2H8HA 5BVDA 3OOMA 1MUOA 3ENHA 3AGMA 2FSTX 3G2FA 1OIRA 4IX6A 3VN9A 5E9EA 4CFFA 3KMUA 2C68A 3BGZA 3IOPA 3V5WA 2EXMA 5LWNA 2WNTA 2G2IA 3FLZA 3OCGA 5GZ8A 3L8XA 4FODA 4RWIA 3V6SA 3ZU7A 1PKDA 5FWKK 3H9OA 2WQBA 3LKMA 5A4QA 1PMNA 3Q4UA 5AAGA 1BI7A 3EQGA 5EH0A 4XV1A 2WMRA 3VHEA 3EQIA 5HICA 4X2GA 2VWZA 3LOKA 4IVAA 4JRVA 4FA2A 4NCTA 4CG8A 3U87A 4RJ8A 5FM2A 2W5AA 2EB2A 2H96A 3OC1A 1LR4A 5BUEA 4JBQA 2QOFA 5AR3A 2XK7A 3O8UA 3OVVA 4UEUA 3QX4A 2PVMA 4XP3A 5G1XA 4HVSA 3LXPA 3FLWA 5L3AA 2HK5A 4QNYA 5M51A 3NS9A 3JVSA 2IZSA 3UNZA 2WQNA 4ZZOA 5CQWA 3UE4A 4E6DA 1IA9A 1DM2A 3LQ8A 3FZOA 5DT4A 4Y5HA 4O2PA 4J8MA 3PLAE 4LRKA 5AV1A 3B8RA 4OTDA 3FPMA 3RTPA 4YHTA 5LQFA 4M8TA 5DG5A 4F6UA 3HMNA 2W1GA 2PZYA 3ORTA 4FSTA 4OTIA 4FIJA 4KINA 4JOAA 5AP4A 1FMKA 5T68A 2WIHA 2OIQA 1GZ8A 2GNJA 1PYXA 3E5AA 5D7VA 2XNEA 5FM3A 3L9LA 4RFZA 5FTOA 2CJMA 4Z7GA 2PVFA 3DKCA 3F82A 4ASDA 4U6RA 3EMGA 5KUPA 2PUIA 4NJDA 4XG8A 3M2WA 3G9NA 2VO6A 3NW6A 3P86A 3RHKA 3QHWA 4MCVA 3VRZA 4BCGA 4F0IA 3R21A 1FVRA 4BBFA 3H30A 3LM0A 5FUTA 4DA5A 1H1QA 3DK6A 4U7ZA 2PVKA 2Z2WA 3COKA 3FKOA 4OTRA 3DOGA 5IQDA 4K9YA 3E62A 3UG1A 5IG1A 1CTPE 2WMSA 5GZAA 1JBPE 5JGBA 2EVAA 1TQPA 4QMQA 4O7TA 3HA6A 2GNGA 2ZMDA 4TYIA 2A2AA 4R7IA 5F94A 4FNWA 3VRYA 5ANGA 3JS2A 4L9IA 2QVSE 3T8OA 3GNIB 3SOCA 3VUGA 3FV8A 4HVGA 1PJKA 2ZV9A 3MBLA 3MWUA 2HZIA 4L53A 4OTWA 4MHAA 3FZSA 2X9EA 2GHGA 3C4ZA 2VO3A 5BNJA 1MRUA 5AUUA 2X9FA 4E7WA 1ZWSA 3AXWA 4ORKA 3MVLA 2QR8A 3QKLA 3ZO2A 5C8MA 1YI4A 2PK9A 4MF1A 5HE2A 4F0GA 1XH7A 4JVGA 1MRVA 3DJ5A 2HY0A 4O7RA 3F7WA 4F09A 1MQBA 2CLQA 3FMHA 4CFNA 3F2RA 2XCHA 3NYOA 2BAKA 2XYUA 4CFMA 1OM1A 4I94A 2WMWA 3R7GA 4L45A 1URWA 4G34A 4OUCA 4PL5A 4QPMA 5H8BA 3W2SA 3HAVA 1WBOA 1QMZA 3VBWA 2OF4A 2ZV8A 2QOBA 4WG5A 5DMZA 3R7VA 1IA8A 2VTSA 4L8MA 4ZTLA 3NX8A 4M66A 4BWPA 3K3JA 2YHVA 3BX5A 3QZHA 4HCVA 3KRWA 4DBXA 1L8TA 5CU3A 4IE9A 4EC9A 1XH9A 1ZOGA 4ZY6A 2CGUA 2UZNA 4PTCA 1ZRZA 2C5NA 5EDPA 3PPZA 3E64A 2Z7SA 4D5KA 4BDKA 4Y83A 5K0XA 2BHHA 2W0JA 2X6DA 2XKCA 2X2KA 4V0GB 4E6QA 5HGIA 1PKGA 3K3IA 3KXZA 2V5QA 3HMPA 4G31A 4I5CA 3TUCA 2JIUA 4C7TA 2YIXA 2YWPA 3OUNB 3DBDA 2CNVA 2W7XA 4WKQA 1DAWA 4Y46A 3MY0A 3QL8A 4XG4A 4QT1A 4MH7A 3C5IA 4HPTE 4FVPA 4E93A 5HX6A 4R77A 3VUDA 2HCKA 2WGJA 3D7TA 5HTCA 3ANRA 2W5HA 3EKKA 2DWBA 3RI1A 3SG8A 4FTNA 4V05A 1DI9A 3L8SA 2JKOA 1PW2A 3F3UA 3QQFA 3ATSA 1UNGA 4XNEA 2VNYA 3ATTA 3W8LA 4N4SA 3F3ZA 3OCTA 2FSLX 4Z55A 3R7EA 1W7HA 1GZOA 2B9FA 2C6KA 2ZYBA 3IG7A 4TXCA 3ZS5A 3EZRA 4A9TA 2YZLA 2XB7A 5IEXA 2Y6OA 4BF2A 4HVIA 2PUUA 3I1AA 1IEPA 3PLSA 2BDWA 3VUKA 1A06A 4C4GA 4EC8A 5AV3A 3T9TA 3ULIA 4LI5A 3O2MA 5DHJA 1UWHA 2OIDA 3WILA 4D4VA 4IWOA 2CCIA 2CN5A 2AUHA 3OXIA 5BMMA 4JDHA 4BGHA 4ZY5A 2R0UA 2V7OA 5HD7A 3H9FA 3LFAA 2OJGA 2WEVA 3GCUA 3QQHA 4L46A 4X2KA 3N4UA 3PJ8A 5DRDA 1ZYJA 4AT4A 4IZAA 3COIA 3FE3A 4J71A 5IMEA 4YURA 3C51A 1CKIA 3ZUUA 3M42A 4JDJA 1JKSA 3ZO3A 5CXZA 2WTIA 4IAFA 3R7UA 2XK6A 1ZAOA 4DGGA 4XP0A 4I6HA 5EI8A 2GQSA 4G3FA 2C0IA 3V8TA 3V5PA 5KZ0A 3OWLA 2HZNA 2UW3A 3KK9A 3R71A 3VJOA 2X7OA 4UMRA 1OKYA 4YJOA 4TWNA 3TJCA 4AWIA 4FKIA 4E6CA 2WQEA 3QZIA 4PTGA 4DH5A 3SKCA 4EEVA 3ODZX 3AMYA 4AA4A 2YJSA 4DFYA 2R3HA 2YITA 4I92A 4QYFA 5HG8A 4GJ2A 5EM7A 5HBEA 1XBAA 3HECA 2OH4A 3RK7A 1E1XA 2XMYA 3KQ7A 3RALA 4EORA 3PXQA 4G6OA 4IHPA 4GIIA 4PP9A 4RWLA 1CKJA 4PDSA 5CSVA 4E73A 1JSTA 4QPAA 2XEZA 3WF9A 5JQ5A 2X7FA 3CTJA 5DOSA 2XNMA 4NIFA 3QCYA 1ZYSA 3BI6A 5J9ZA 4PL3A 3KXHA 2UW8A 4FYOA 2UZTA 3PP0A 4UWYA 3QYWA 2G2FA 4USDA 5EDRA 2BVAA 2WMXA 3DB6A 4QMUA 4YJNA 2O8YA 2WMQA 4O7ZA 1KWPA 2XRUA 2YISA 4PPBA 1XR1A 2XIYA 4ALWA 1YW2A 3CE3A 3MPMA 2OK1A 4YHJA 3DCVA 2QKWB 4NW6A 4FYNA 2F57A 3BPRA 4FNYA 4R1VA 3MPAA 1MQ4A 2ERKA 4Y73A 3RAIA 2X2MA 5J1VA 2R3KA 5CSWA 4LUEA 4H3PA 4UMQA 3EFWA 3TNIA 5HO7A 1Q4LA 1U59A 4HW7A 2QLUA 3C9WA 1G3NA 1GIJA 2XCKA 1CMKE 3D4QA 4QYEA 3W2OA 1OL5A 4ARKA 5AA9A 4I6BA 3FLYA 3E8DA 4KSQA 4L42A 2J0LA 3IW4A 3S2PA 3UIXA 1OPJA 1YWNA 1B6CB 3DT1A 4TPTA 2G1TA 1YDRE 1ZYLA 1S9JA 3V04A 4DLJA 2ZOQA 3FC1X 3BLRA 3QXOA 4TYJA 4S34A 3FSKA 1OKWA 4FKWA 5CZHA 4FR4A 4QP2A 4FIHA 4FTTA 3QD0A 3OTVA 3EJ1A 3F5GA 5HG9A 5DR2A 3SRVB 5IU2A 5DPVA 5EHYA 4ENYA 4DFBA 3SQQA 3EYGA 2CSNA 2F49A 2X0GA 1WBTA 1QCFA 2A19B 2ZDUA 3ORPA 4P5QA 4QMXA 3VS2A 4C33A 4WNMA 2IW8A 5KMNA 4WBBB 3EQDA 3QAME 1KE7A 3S3IA 5HKMA 1P4FA 2XKEA 3H3CA 4NH1A 4TT7A 4RBLA 4BDHA 4EBVA 3UIBA 2WHBA 4F9WA 1E9HA 2GFCA 2DYLA 3HRFA 4HVDA 5JFSA 5ACBC 1BYGA 1ZZ2A 3F66A 4IX3A 3BHHA 3KMMA 4ZSEA 3QTIA 4FSRA 3VC4A 1W98A 1WVXA 3HEGA 3KXGA 4M97A 4EI4A 2B54A 3W2PA 5CS6A 4K18A 3RK9A 4BBEA 4IANA 2P0CA 2VTIA 5EKOA 1H4LA 4IWQA 5JQ8A 3PVUA 2YM3A 4V0GA 2AC3A 4DTBA 4D2SA 4ZJVA 3R8ZA 4OAVB 3VVHA 4CCBA 3I6UA 2NRUA 3A4OX 5CVFA 4ASEA 4C57A 4A9SA 4AW2A 4YJPA 4E6AA 5DEYA 3O23A 3DFAA 1NA7A 4CKRA 3FMEA 3FHIA 4HYIA 3Q04A 4K11A 4C35A 4FVRA 4IMYA 3OHTA 4TYEA 4C4EA 1KE6A 3BZ3A 1VYWA 4GH2A 4J98A 4FEVA 4TNDA 4D0XA 1SVEA 2WAJA 4BRXA 3I5ZA 3IW8A 4IB3A 2XNGA 4D4YA 2C47A 2XH5A 4YLLA 3V5QA 1B39A 4RG0A 4EQCA 3DDQA 5L2TA 3UOJA 4G5JA 3NSZA 3UDBA 2B4SB 4AZFA 4U97A 2UW6A 3RNYA 4ZIMA 4QTBA 3ZDIA 1M17A 1XWSA 2YM6A 2W05A 3D2KA 4MYGA 4UB7A 5IUHA 5JN2A 4F7LA 3WYYA 4C61A 3BYVA 3LFFA 1ZYDA 3A2CA 5KBQA 2J0IA 3FYKX 4NM3A 3ZC5A 4ZLYA 5JFXA 1IAJA 4LYNA 5BVNA 3NVMB 1O9UA 2UUEA 1R0PA 1QL6A 4OT5A 4R6VA 5H8EA 3PWDA 4QP8A 3TV7A 5IA2A 1FOTA 2B0QA 4RIWB 4M3QA 3BYUA 4QYHA 5FEDA 3OT3A 3VS7A 3EIDA 3MN3A 3RM6A 2C3KA 3R9HA 2OBJA 2QOHA 4AZTA 4ZTSA 3NYXA 4NJ3A 5AUZA 5IH4A 3EOCA 5TKDA 5CVHA 3CGOA 4FV2A 3TZ9A 2P2HA 4DT8A 3SG9A 2EB3A 3UC3A 5ITAA 3OTUA 5CSPA 3ZZWA 1LEZA 4F9CA 3HV6A 2PMIA 1XKKA 2W1ZA 2IW9A 3UGCA 5CF5A 3RNIA 5CF6A 3PRIA 4PQNA 3WIKA 3PSBA 4F99A 2OG8A 3DNDA 4D0WA 3VS4A 3FEGA 4BCJA 5IDPA 2RF9A 2Y7JA 3O0GA 4YPDA 4EOSA 4LUDA 4DC2A 4FMQA 4OTGA 4E3CA 4EOQA 3LAUA 5A6OA 3QLFA 4FX3A 3BLQA 3QCSA 2PUNA 2XIKA 4X7QA 4I5MA 4GVJA 4Q9SA 3WF6A 4EZ7A 4FZFB 3UP2A 1UNLA 2VRXA 4YJVA 4HGLA 2VX3A 3CXWA 3UG2A 5C4LA 2WKMA 1H1PA 4JG6A 4EH9A 5HLNA 3MH0A 3FZRA 2XF0A 3TACA 1YHVA 3QQUA 5A4LA 2QQ7A 4LV5A 4UMTA 5CEMA 4XYFA 3LQ3A 3TWJA 1JPAA 2YERA 5CAOA 2C1AA 2G15A 2XK8A 4FUXA 2VAGA 4AP7A 4BDEA 4NK9A 5IQHA 4TWPA 4R1YA 1DI8A 1Z9XA 3F2AA 4IC8A 4QQCA 5DE2A 4CMTA 4DEHA 1S9IA 4YJUA 4EYJA 3AD6A 5EYMA 4F6SA 4A07A 4ITHA 2PVRA 4L3LA 5CT0A 4W8EA 4AN3A 5GINE 4ZTMA 3GP0A 3MY5A 4PRJA 3UOHA 1OL7A 4FSYA 3KY2A 4RQVA 3A60A 3D83A 3L9NA 3RK5A 2XP2A 5JK3A 3VS0A 5ETAA 1W83A 3IS5A 4IWPA 5EM5A 4ZMFA 1OZ1A 2J7TA 3GCQA 2QOKA 3FXWA 4LMNA 4AT5A 2RFDA 4QTDA 3ZLSA 3O8TA 3O71A 1UA2A 3R1QA 4WO5A 3ERKA 3Q9ZA 4U0IA 5BMSA 4AT3A 2HOGA 4A9RA 4W8DA 2DS1A 4AFJA 1YXSA 3MESA 3PJ1A 4MBJA 5ANDA 2BMCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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