4BDHA

Fragment-based screening identifies a new area for inhibitor binding to checkpoint kinase 2 (chk2)
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
303
structure length
282
Chain Sequence
SVYPKALRDEYIMSKTLEVKLAFERKTCKKVAIKIISKNVETEIEILKKLNHPCIIKIKNFFDAEDYYIVLELMEGGELFDKVVGNKRLKEATCKLYFYQMLLAVQYLHENGIIHRDLKPENVLLSSQEEDCLIKITDFGHSKILGETSLMRTLCGTPTYLAPEVLVSVGTAGYNRAVDCWSLGVILFICLSGYPPFSEHRTQVSLKDQITSGKYNFIPEVWAEVSEKALDLVKKLLVVDPKARFTTEEALRHPWLQDEDMKRKFQDLLSEENESTALPQVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK2
publication title Fragment-Based Screening Maps Inhibitor Interactions in the ATP-Binding Site of Checkpoint Kinase 2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 87
structure length 282
sequence length 303
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4bdhA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4bdhA01
2YCRA 3NWWA 3EKNA 3Q32A 3UNJA 3VUDA 2GQGA 3BQRA 3NUUA 3EN4A 4QYHA 4DGGA 5M4FA 5FLFA 3KULB 4AQCA 5GIPE 4WD5A 3RBWA 3VBQA 4DGNA 1DI9A 5AP2A 5C8KA 4QQ5A 4TNDA 2X2MA 3PVGA 4EONA 2CCHA 4EQUA 5CEOA 3IOKA 3V3VA 4YURA 4K2RA 2QO9A 3DQWA 4YJTA 4LGHA 3VC4A 4BTJA 3QC4A 5AAGA 5HO8A 1KOAA 3UZTA 4TT7A 5EK7A 4CRLA 3AD5A 4EK8A 2RL5A 3R1QA 3VAPA 4QYGA 2PVLA 2OO8X 3Q9ZA 4WUNA 3OG7A 4MKCA 4J8NA 4YJQA 4L42A 4R7BA 3VF8A 4FV3A 1GZKA 4AUAA 3QKKA 2FB8A 5I3OA 1P4FA 2QOIA 4W4YA 2YHVA 3AT2A 3UMXA 3UOKA 2VO3A 5E8UA 4OTRA 4ANBA 4G3EA 4IWOA 4YJVA 4JVGA 2WFYA 3QTRA 5G1XA 5CF4A 3QTQA 2W1EA 3RAHA 3CS9A 4NKSA 2C5OA 5IQBA 5KHWA 3OCGA 1WBSA 4BBEA 2ZM3A 3ZXZA 4CCUA 3EYGA 2A19B 4YBKA 5I0BA 4O7SA 2PL0A 1UKIA 2YIYA 3WARA 2H34A 3GU7A 4A9YA 5HLNA 4GU6A 3QA0A 3GENA 4BI0A 4FZDB 3G90X 3LFSA 4BWPA 2UVZA 3CTQA 2F49A 2B53A 4QP9A 3D4QA 4YBJA 4Q9ZA 5A4EA 3LMGA 3BV3A 1TQIA 3COMA 5A14A 5IQHA 5ANJA 3B8RA 4WSQA 3U6HA 4WG5A 2OI4X 4XV9A 4WHZA 3UP2A 1YDSE 2XMYA 4WRGA 4UB7A 4WG4A 3W2CA 5L2TA 2WD1A 4GJ2A 2V7OA 5A9UA 1UU3A 3FMMA 3BPRA 3DJ7A 4WNKA 4AFJA 2WGJA 3E8DA 4KBAA 2EB2A 5AP3A 4IAKA 4BDGA 4BI2A 4X2JA 5JRQA 4RX9A 4M15A 5HICA 4CNHA 4X2GA 3PXQA 5FG8A 4EC9A 4GT5A 2B7AA 2QONA 2XBJA 2Z7QA 4BHNA 2W5BA 4YMJA 4JNWA 4V0GB 3D7TB 4AT4A 4CFMA 3RWPA 4AA4A 3F61A 3L9NA 3D7ZA 3IW8A 1XHAA 4NEUA 4P5ZA 3VQUA 3R7VA 4Y5HA 2IO6A 4A4OA 2VWVA 4DT8A 1FOTA 2XNOA 2W1CA 2PZYA 3AGLA 4M8TA 1IAJA 3QQFA 4MAOA 4FR4A 3R22A 4EHEA 2F2UA 4TYGA 3DK7A 4X3JA 1UU7A 4MH7A 3PJ2A 3PXYA 1H08A 3HMMA 2A1AB 1PXNA 2R2PA 3F5UA 3NPCA 2QLUA 5HLPA 5CALA 3KXZA 4C0TA 2BILB 2JGZA 3GNIB 3PSBA 5HG8A 2IPXA 3PPKA 4UXQA 3ZLYA 1GZ8A 5CSPA 4D9UA 4BDEA 3CE3A 3O8TA 5M56A 4MF0A 4R3RA 5BYYA 4MD9E 1WCCA 4H36A 3TN8A 4E6AA 1BMKA 4O7WA 3E8EA 4YHJA 3DDQA 2ZVAA 3Q9YA 5CEKA 4GH2A 3ZRLA 4IH8A 1U54A 2J5FA 4JDIA 4BDDA 4EH5A 1WBNA 4E4XA 2G1TA 4I6QA 3VBVA 4AN2A 4APCA 4YTFA 4S30A 5JN2A 2FH9A 2C5XA 3TEIA 4M69A 4BVUA 1V1KA 3NUPA 5K5XA 1U46A 5L2WA 1QMZA 4KD1A 3HGKA 4F1MA 3SA0A 5GHVA 2C6KA 4R5YA 2YJSA 5CF6A 2QKWB 2BKZA 3EQIA 3NUYA 5GJGA 5HBHA 3NS9A 4WT6A 4YC3A 3EWHA 4XG2A 4FTMA 5AP1A 4GFMA 5CNOA 5FEEA 2HYYA 3DBDA 4EQCA 1VYWA 3EMGA 4F0IA 2VTHA 3UBDA 4JR3A 3ZFYA 3CJGA 1ZOEA 4CZTA 5HTCA 4PWNA 1OIRA 2FSLX 5IA2A 3D5XA 1W0XC 4XX9A 5AUUA 3BKBA 4BCFA 4AXAA 5M51A 3BYSA 2QVSE 2JKQA 3FMLA 5FM3A 2KTYA 5HE0A 4LUDA 5KMKA 3A8XA 4DF3A 2Y7JA 4MD8E 5HIDA 3VUIA 2CGWA 5IEVA 2QD9A 1J1CA 3ATTA 5J7BA 2JDOA 4AW2A 2WTIA 4JXFA 3ODZX 3ORLA 4MBIA 3W10A 4FTTA 3VIDA 3ZO3A 2B9HA 4WBBB 4RX7A 4X2KA 1BL7A 4L53A 4L68A 4FK6A 4S2ZA 5CS6A 2HZ0A 3GP0A 3VBYA 3DKOA 5EKOA 2ZDUA 2VTQA 3UGCA 2H6DA 4X0MA 4CZUA 3W18A 2HW7A 4BC6A 1HOWA 1A9UA 2QOQA 4IACA 3KN5A 4XG9A 4R7HA 1U5RA 2PK9A 4QP7A 5JFSA 4PF4A 4JRVA 5L6OA 4EH8A 3H4JA 3PUPA 3L9PA 3R8PA 2F2CB 1OMWA 1ZRZA 3CP9A 4QO9A 5DOSA 4O7ZA 3CR0A 4XYFA 1OPJA 5FXQA 5F94A 4F63A 3F3WA 2P55A 5BYZA 3GU6A 5LVMA 3VNTA 1CKPA 4YNOA 3KXHA 2VNYA 4HYHA 3R8VA 3PWYA 4GK2A 3LHJA 4QYFA 3H0YA 1DS5A 1FVRA 1GZNA 3KB7A 4TYHA 5AA8A 3AMAA 3QD3A 3P1AA 4JX3A 4NM7A 2XIRA 4YU2A 4J95A 1O6YA 1IR3A 3DK6A 4K0YA 3VJOA 1DAWA 3JVRA 2FYSA 3W2RA 1ZAOA 4IQ6A 3SHEA 3UIXA 4HVSA 2XIYA 3GFEA 3NYXA 4OTGA 4AGCA 2W4OA 3R7OA 4FBXA 4M69B 3R9OA 2GNIA 3O8UA 4I24A 4M67A 1AD5A 2X8IA 3HEGA 5E90A 4FKJA 3MGYA 5BVOA 2RFDA 4J8MA 4YJOA 4G3CA 5CYIA 3ROYA 3LJ1A 1OVEA 4BCPA 4YO6A 2CPKE 4TWNA 2VO6A 3N9XA 2R64A 4G34A 5HVJA 4UWBA 2RIOA 2WMXA 4FSQA 4O2PA 5C01A 4A9UA 1NW1A 5DT3A 2JLDA 2OFUA 4MXYA 4FICA 2B0QA 4R77A 4MQ2A 4CKRA 4FC0A 4LGGA 4DCEA 5IA4A 4O84A 3PE1A 3D83A 4RT7A 2V22A 4UYNA 4YJPA 1OI9A 4EH7A 2UZDA 5EYDA 2W5HA 1WVWA 2PMOX 4RQKA 3DPKA 3FZSA 4WBOA 5CU4A 4IC8A 3EQPA 2YACA 3G33A 1PHKA 3I5NA 1E9HA 2XJ1A 4L9IA 4BKJA 2R3JA 3UYTA 2RSVA 4CFVA 2VU3A 4LYNA 2BALA 2QURA 3ZSHA 3FHRA 3A4PA 4ZLZA 3I4BA 3ELJA 2JFMA 4AG8A 3N4UA 3FLZA 3FXWA 3I7BA 4BCHA 4OBOA 2QO7A 5E8YA 3WYXA 4FTQA 2BDWA 4IWPA 2PPQA 2XVDA 4YZNA 5AR7A 3QLGA 4C7TA 3EN6A 4JS8A 5LMBA 5AV4A 3ZBFA 5TOZA 4EK4A 2W9FB 3GU5A 3O96A 4Y73A 3PTGA 4O0WA 4ENXA 4F0FA 3U6JA 3S1HA 5FP5A 4YZ9A 5BUJA 1YXVA 4M0ZA 3LE6A 4JBQA 5AV0A 4GJ3A 4K8AA 3CGOA 4FZ6A 2RGPA 4KB8A 3UQCA 4FTIA 5ETCA 2XK9A 3IGOA 5GZAA 3KGAA 5A54A 4IAAA 2ERKA 2PE1A 3PIZA 4YZMA 3FPQA 2BROA 4LUEA 1JQHA 5BYLA 3COHA 2YIWA 3ZFMA 4ID7A 4IZAA 3R01A 3JUHA 5AIKA 4JIAA 5AV2A 4JDKA 4K77A 4TYHB 4JAJA 4DFZE 3ET7A 3QALE 3QD0A 3B2TA 4IANA 3POZA 3IDCA 5J1WA 3RKBA 4CRSA 1L3RE 5CAUA 3HA8A 4JRNA 3OMVA 2PZIA 3DJ5A 5IG1A 5BNJA 3RWQA 2GHMA 3HLLA 3TUBA 5I9UA 5AP0A 2YJRA 3DY7A 4O86A 3F2AA 3OBJA 4L67A 4YUQA 4C57A 4PL3A 3W55A 3RM7A 2BVAA 2EWAA 4EEVA 2OZAA 2IVSA 3OC1A 4X3FA 1R78A 4RJ8A 1M7NA 2ZB1A 3I79A 4OT6A 4FIGA 4IC7A 3OWKA 4R8QA 5CVGA 4MNFA 3E64A 3MVLA 5EI6A 5DLSA 4IX4A 2UZVA 3BHHA 5AV1A 4B6LA 3QD4A 4G6OA 2BAQA 2W17A 3LIJA 3IG7A 3OWPA 4D2SA 3UE4A 1KE6A 4MCVA 1LPUA 3HYHA 3NNWA 4R5SA 4QMOA 4HVHA 3NYOA 4H58A 1VZOA 3ACJA 2Q0NA 3JR1A 5FD2A 4HJOA 2O65A 2OF4A 3TKHA 4UMPA 1PXIA 4MWIA 4U40A 5L3AA 3EQFA 3L8SA 4JI9A 2PVFA 3H10A 3Q53A 1OBGA 1Q3DA 4FKUA 5CXZA 2UW0A 5CASA 4O2ZA 3T9TA 3KKVA 2HZIA 4L8MA 3QHWA 3LFEA 4FTAA 4DH7A 4D28A 4FV5A 3ZLSA 4DFYA 1GIIA 2BRNA 1Y91A 2UW3A 4NIFA 3HECA 3V8WA 5IZFA 3PSDA 2YAKA 1PXLA 3Q9WA 3ZZEA 3QC9A 3EJ1A 4MEDA 1W83A 2GNLA 2PTKA 3TZ7A 2VWUA 4GVAA 5C8MA 4OGRA 4D5KA 1XQZA 5KBQA 1OITA 5HVYA 1CM8A 2R4BA 4V01A 2C6OA 2G9XA 3FWQA 4KRCA 3DCVA 5HTBA 3O7LB 4K1BA 4TWOA 2GNJA 2UW4A 1XO2B 5IQFA 1P2AA 3PP0A 2PVMA 2YCSA 4CTCA 4GKIA 3NR9A 1Q8YA 4OTPA 4FTKA 3QRKA 3NGAA 1SNXA 1PXPA 4ZEGA 3E87A 1NVSA 5K4JA 2ESMA 3DU8A 3V51A 3U9CA 5HO6A 3VUGA 4PP9A 3VBWA 3RPVA 4EQMA 5HLWA 5JMSA 5FWKK 3PLAE 3FLYA 3BE9A 4FTLA 4FKGA 1ND4A 3PJ3A 2QHMA 4FV8A 4QP1A 3AC1A 3QCSA 3VS0A 3G0EA 2ACXA 1JBPE 4FV7A 5EOLA 3VUKA 4CFFA 3FZPA 4NUSA 4M13A 2O64A 3KMWA 3IW4A 4J96A 2XK7A 3A7HA 4XJ0A 1R1WA 4AZSA 2YN8A 1BX6A 2ITXA 2IVVA 4FSWA 2YZLA 2XKFA 1Y57A 3K5VA 3NUNA 4BHZA 1PXMA 1YHWA 5HIBA 1SM2A 3TV4A 3FL4A 3LFFA 2XA4A 4CD0A 2OXXA 3IECA 4EH6A 2OZAB 4ZSGA 3KVWA 4X3FB 2GSFA 2WIHA 4U3YA 3GU4A 4YO4A 2QR8A 3VBXA 1PYXA 2WQEA 3MN3A 4XV2A 4GUEA 3U8WA 4AOIA 3NNUA 1ZXEA 4S33A 3OUNB 2ITNA 3ZU7A 2C6LA 4FV2A 5CVHA 3LQ8A 2JD5A 4BYIA 1UU8A 4HYSA 4Y72A 4F9CA 3ETAA 2B55A 4O7RA 4XV3A 4IHPA 5CXHA 4UMTA 1OECA 2J0IA 3TNPC 3MYGA 2LAVA 4ZJJA 3BHTA 2XM8A 3U4UA 4AT3A 1TKIA 2RKUA 3HV6A 4XBRA 3D5UA 2ONLA 3HL7A 3QCXA 4X2NA 3K3IA 1H4LA 1YOJA 4Q5EA 1XH5A 4AP7A 2OJGA 2NO3A 1IRKA 2XIZA 2WMQA 3HMOA 3OT3A 4I0SA 4YP8A 2A4LA 3MPMA 3OWLA 3B2WA 2Y9QA 3BBTB 3FMHA 4WRSA 3KEXA 3AOXA 3AD4A 2R3FA 3GCPA 3A7GA 4HCTA 4LL0A 1MRUA 2I6LA 4WNMA 3OW3A 3R1YA 5CI7A 4PTGA 1ZMUA 3PY1A 4JG7A 5CQWA 4GS6A 3T3UA 2F7XE 2UZWE 1YXTA 2WB8A 2XRUA 3BEAA 3BYOA 3ENMA 3L9MA 3QCQA 2PZ5A 2I0YA 3KN6A 4MTAA 2CSNA 5AIRA 1CSNA 5FP6A 5K4IA 2PE0A 4CQGA 2GQSA 4Z9LA 1MRVA 1GY3A 3MA6A 4IXPA 5HG5A 1YRPA 3FSFA 4EBVA 2CNVA 3ZFXA 4GW8A 2BHEA 3BZ3A 2X4FA 2W0JA 2X6EA 2XNEA 3LFAA 2I40A 4BWKA 3A4OX 4YSJA 4ZTQA 4FSUA 2Y6OA 3DJ6A 3LPBA 4H1MA 4TL0A 2ZV2A 4K9YA 3CCNA 4XG4A 2WOTA 3AC8A 4IVCA 4M84A 4RIOA 3GEQA 4MYGA 1JSTA 1JVPP 1WVYA 2PY3A 1S9IA 3DKCA 3K5UA 3GUBA 3GFWA 1VJYA 4QTCA 3QQHA 4KKEA 4AFEA 5HHWA 2IVTA 4NFMA 1BI7A 2H96A 3OZ6A 4QMZA 2XNNA 4J99A 1W82A 5J95A 3PDTA 5D9HA 1H26A 1I44A 4FKWA 3FHIA 4G5PA 3IW6A 4N70A 5AR2A 3FXZA 1E1VA 1R0PA 3FY0A 2CLXA 2LGCA 3FKOA 4GIIA 4U79A 2PVNA 3PXZA 4L01A 1H0VA 3R2BA 4ZSEA 4CSVA 4KSPA 2RFEA 5FXSA 1ZYJA 3RI1A 3C4EA 4IM3A 4NT4A 4EUUA 2JKMA 5DI1A 3V5TA 3ZDUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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