4BDIA

Fragment-based screening identifies a new area for inhibitor binding to checkpoint kinase 2 (chk2)
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
307
structure length
290
Chain Sequence
MSVYPKALRDEYIMSKTLGGEVKLAFERKTCKKVAIKIISKALNVETEIEILKKLNHPCIIKIKNFFDAEDYYIVLELMEGGELFDKVVGNKRLKEATCKLYFYQMLLAVQYLHENGIIHRDLKPENVLLSSQEEDCLIKITDFGHSKILGETSLMRTLCGTPTYLAPEVLVSVGTAGYNRAVDCWSLGVILFICLSGYPPFSEHRTQVSLKDQITSGKYNFIPEVWAEVSEKALDLVKKLLVVDPKARFTTEEALRHPWLQDEDMKRKFQDLLSEENESTALPQVLAQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK2
publication title Fragment-Based Screening Maps Inhibitor Interactions in the ATP-Binding Site of Checkpoint Kinase 2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 290
sequence length 307
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4bdiA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4bdiA01
5J5SA 1F0QA 5BNJA 5J7HA 2J0LA 5M44A 3VS7A 2ZAZA 4FNYA 2YITA 4TPTA 3S0OA 2P0CA 3AQVA 5FRIA 1FGKA 1MP8A 3GCQA 4YJNA 4E6AA 4KINA 5L8LA 3GU4A 5IA5A 3BWJA 4H1MA 2Y4PA 3NVMB 5DR6A 3KKVA 3NIEA 4CKRA 3BU5A 2HELA 4K33A 4OTGA 4C34A 2X9FA 2XKEA 2XF0A 4IAKA 4ACDA 3RVGA 1M7QA 4IAAA 5KNJA 4E93A 2FA2A 4QOXA 3V8WA 3K2LA 4PQNA 2YEXA 5LMAA 3A2CA 4R7IA 4AUAA 4A9TA 5HTIA 4G6NA 3BGZA 2ITUA 4XG6A 2CSNA 1Y57A 4L7FA 2VTHA 3TUDA 2HZ4A 3U6IA 4Q5HA 5HG7A 4HVGA 3W2OA 4EOSA 1IEPA 5DE2A 5EHOA 1ERKA 2BKZA 1BKXA 3ET7A 3QQKA 2JC6A 3HGKA 5CY3A 3NUUA 3UNZA 2OZAB 3VUDA 2E9UA 1CSNA 2I40A 3LQ5A 1MUOA 3O96A 4BGQA 2BCJA 1FOTA 2VX1A 4QYEA 5AP5A 1H25A 2W5BA 3Q2JA 1PKDA 1PMEA 4WBBB 5D12A 2OJ9A 4FG9A 4CMUA 3WIGA 4M0YA 1VEBA 3VWAA 3V51A 2NO3A 3EQCA 3IW4A 4J52A 5HE1A 3FMMA 3VUHA 1H24A 5DR2A 1SVEA 4TRLA 5AUYA 5CEPA 1UWJA 3QALE 1X8BA 3ZBFA 3LXNA 3COMA 1XH7A 5B0XA 4DF3A 3T8OA 5IZFA 3UQGA 3GOPA 3R1SA 3AMAA 4IDTA 4D5HA 3EQIA 5L6OA 2BRGA 3TZ9A 5L2SA 2XCKA 1T45A 4YZDA 5CX9A 1GZ8A 3C1XA 4WO5A 4F6SA 1AGWA 5EM6A 3QZGA 4MCVA 4HW7A 2B9IA 1OIQA 4YUQA 5D11A 4YHJA 3ZLSA 1Q4LA 1UU7A 3TWJA 4MQ1A 1T46A 3R0TA 4BDGA 4BIDA 2H6DA 4RVKA 4ZS4A 3ERKA 3HRFA 3KRWA 3NCZA 4TXCA 4CG8A 3GT8A 3MESA 2PVKA 2O0UA 5LMBA 3LAUA 3I0OA 4I5HA 5F4NA 3QX4A 3NAXA 5ACBC 2SRCA 3GCSA 3G9LX 3ZBXA 2BRNA 4QMTA 5JFVA 3ZXZA 3PLAE 5GINE 4I1ZA 3FPMA 4ZTLA 4A7CA 4FKOA 4RA5A 3TXOA 4BZNA 2OU7A 3H3CA 4ZXTA 3ORNA 2UW8A 2W96B 4LMNA 3ORPA 1Q41A 1AD5A 2FH9A 3BHVA 5F20A 5FXSA 4N57A 2BRBA 3MFSA 5KE0A 1XH8A 4YZNA 2YFXA 4BKYA 4EUTA 3EL7A 4PP9A 3DAJA 2R7IA 4MTAA 3BIZA 4HGSA 5BX0A 4QP1A 2H9VA 3E5AA 3S00A 3ZDUA 4EOJA 3DAEA 2GTMA 2VTTA 4R3PA 2WQBA 3W2RA 3N9XA 3EL8A 3UG2A 3RK5A 2WIPA 3TI1A 1DAYA 3PXKA 3UOKA 3QTXA 3PRFA 3QTIA 2ITWA 4JG7A 2WQNA 5CEOA 2PYWA 3FXZA 3A7JA 2DQ7X 3IOPA 4EOMA 4CRLA 3NUNA 2UZBA 4ALWA 3ZC6A 4EORA 4F63A 4RWLA 3NZ0A 4ZMEA 3DQXA 4AT3A 4FT9A 3R02A 4F99A 4YSJA 3F7ZA 4Y46A 3VJOA 2UW7A 2R3GA 3UBDA 4E4LA 5LVPA 5KZIA 4FEXA 2R3NA 3DK6A 4WNKA 5CF5A 3VQUA 3N4VA 2HW6A 3EFJA 3VRYA 4WBOA 1NY3A 4XRJA 2GHGA 2QOHA 4F65A 5GJDA 3Q52A 1PXPA 4U9AA 4FGRA 5DA3A 4MD9E 3PP1A 1RE8A 3BHHA 3OY1A 3NUPA 2R7BA 4AT4A 5IEVA 1YDRE 2VTAA 5EH0A 3R63A 5BUIA 3FSKA 2IW9A 3T9TA 1FVVA 3UC3A 4Z3VA 4G3EA 4JDHA 4U8ZA 4C2VA 2FSOX 2VWIA 3BYOA 3PJ1A 3AC8A 1ZAOA 3DJ6A 3NMUF 2UZNA 4G3DA 4EOLA 5I3RA 4DYMA 4EH7A 5IH4A 5HCYA 4O82A 3D9VA 4FEUA 2Z7QA 3KA0A 2F57A 3LOKA 2ITOA 2C6KA 3ZXTA 4FSMA 2JITA 5E8WA 3OTVA 1V0BA 3GU7A 3IDBA 4FYOA 4TYIA 1M2PA 5DEYA 3E7VA 4BCIA 4F7LA 3QQGA 4I3ZA 3NNVA 3SHEA 4JIKA 5H8GA 3UZTA 5ANOA 2BFXA 5E8VA 2YHVA 4FSTA 3GQIA 2WMBA 3UOLA 4RT7A 3QD3A 3MN3A 5JT2A 3VW6A 3GQLA 5L2TA 3FMJA 2C5XA 4K1BA 4FTJA 3Q96A 4FI1A 3AGMA 4DEGA 4QMVA 3ID6C 4DN5A 2EB3A 5AADA 4U97A 3O7LD 3V01A 3DLZA 4EH4A 1CM8A 1JWHA 4NU1A 3FMLA 4GV1A 4I24A 4PTEA 1OIRA 3VS0A 3VUTA 2XBAA 3BHUA 4C35A 5IDPA 4ZP5A 4EL9A 3LCDA 4HVDA 3R8VA 4GJ3A 1BI7A 3HUBA 3CQEA 3LM0A 3RPYA 3RZBA 3KK9A 2UZEA 2GCDA 5ANJA 1VZOA 3DDPA 5JGDA 2R3HA 4RZWA 5EDQA 2O64A 4QP6A 3THBA 1WVYA 3Q9XA 4YP8A 5FM3A 4EHGA 1ZYJA 5GJFA 3SXSA 2GTNA 4G31A 2YM6A 3QTQA 2FUMA 3QTWA 3UQCA 2YM5A 3ZSHA 1JLUE 1P2AA 2EXEA 4L43A 4S33A 4GYIA 1LEZA 2UZUE 4L8MA 4E5BA 2C3LA 4AZTA 3WBLA 3VVHA 3FAAA 4O1OA 5CTPA 4FOBA 1PYXA 4II5A 4YC3A 4ORKA 3TJDA 2BTSA 5DIAA 1E1VA 5L8KA 2V7OA 3E7OA 4DH3A 3MIYA 1KOAA 1W8CA 1OIYA 2XJ1A 3MPTA 3PA5A 4LL5A 4DG2E 4BCQA 3W2QA 3V6RA 2BAKA 3OHTA 3LIJA 5AA8A 3R7GA 3PJCA 1LR4A 4QMXA 2RF9A 4NJDA 2R3KA 4WSQA 1ZWSA 1GZNA 1MQ4A 3R2YA 4KIOA 4C57A 4G5JA 4YBJA 3K5UA 3NX8A 3RAKA 3NIZA 3OFMA 1WBTA 4O7LA 2X7OA 4ANMA 4D2VA 3AOXA 3MFRA 2QURA 4FT5A 3WZUA 1ZYLA 4FIFA 4DFXE 4KKHA 4QMLA 2VRXA 1PYEA 4L3LA 3PIZA 5D1JA 3R71A 3K3IA 4I0SA 2YWPA 4UEUA 3PP0A 3LCOA 2OF2A 5IMXA 2EUFB 4RQVA 2W4JA 3SOCA 3ZOSA 5FBOA 5BYYA 4O7YA 1O6LA 3B2TA 3R9NA 5HBJA 3DBDA 2R3LA 5CVFA 3NUXA 2ITVA 2OJJA 4F1OA 2C6MA 3RK9A 5KZ0A 1RQQA 3DTWA 4HGLA 4FA2A 2XKFA 2XJ2A 3R8UA 4JLCA 5J8IA 1M2RA 4GFMA 5HGIA 3SLSA 2XNNA 3FE3A 3FLZA 3DDQA 3LXKA 2A4LA 3O50A 4F0IA 2EXCX 5M4UA 3BE2A 4YJSA 3PVUA 3UP7A 2CN5A 4AZWA 3ATSA 3HRBA 4XHKB 3JYAA 2C5YA 5CU3A 3FI8A 2CNUA 5C8NA 4L00A 4YHTA 4DC2A 3EYHA 5K9IA 4RPVA 3IKAA 4EOKA 4PDSA 5L8JA 5AJQA 4TKSA 4MNEA 4X2KA 5LWNA 4B9DA 3SRVA 2Z02A 4EWQA 3IW5A 2J6MA 4TYEA 5CU0A 4OGRA 3R7IA 2O63A 1WZYA 1Q3WA 4D4SA 2OFVA 4O7VA 1Q8UA 4KABA 5HBHA 2DUVA 1OGUA 2W7XA 2XK6A 4L68A 4XH6A 3ZLXA 4DGNA 3P78A 1V1KA 3A7IA 2WPAA 5DH3A 3A61A 3LJ2A 3QZIA 3KF4A 3MH0A 3PZEA 4B6LA 4HVIA 4O83A 2WEVA 3ZTXA 2IW8A 5HG9A 4YSMA 3ATTA 4AXAA 3ALOA 1G3NA 1H1PA 3ETAA 3KC3A 4PL4A 2JDTA 3NUYA 5BVKA 2YIXA 4TWPA 2VV9A 5FTOA 2BAJA 2VNWA 4FT7A 5EQYA 3WF5A 2OXDA 1O9UA 2E9PA 4HCVA 3UG1A 3WZDA 2F7EE 4NT4A 5DHJA 5HESA 3PXFA 2ITXA 4FV3A 3TUCA 2GNJA 3I79A 3I6WA 3CGOA 2IVSA 5JQ8A 4O21A 3ZH8A 3OUNB 4GFGA 1OL2A 3WF9A 2IWIA 3CKWA 4ZSGA 4E4NA 3CY3A 2XP2A 4YBKA 3VO3A 3PPZA 3ZS5A 4CV9A 3OVVA 5HVYA 3DBCA 3WILA 4F4PA 4CTBA 4M68A 2CHLA 3IW8A 4D28A 1YXSA 4CFNA 1O6KA 2Z7LA 5DRDA 4D4VA 1YXVA 3DBQA 3E93A 2C6EA 3TV7A 3VS5A 5HG8A 3QU0A 4QMPA 3UGCA 3R8PA 2PUUA 1Y8GA 3QGWA 4EYJA 4CFFA 2R0IA 4F1TA 3WIKA 3BCEA 3ROCA 3D5UA 3FZTA 3ORLA 1W98A 3PY1A 2W1FA 5M4IA 4MAOA 2H34A 4HGTA 3QF9A 3KULA 4LV8A 4AG8A 3HX4A 5E92A 3A62A 4RJ8A 2V5QA 1LEWA 3A7GA 2IPXA 4V05A 3QHRA 3RPOA 4Z55A 3KRRA 5TR6A 1YDTE 4M13A 4E6QA 2E9NA 3QTZA 3EN9A 3GVUA 4NUSA 5HKMA 4TN6A 3COKA 2WMRA 3K3JA 3QYWA 4MHAA 4MXYA 4K2RA 4DGGA 3V04A 3I4BA 3N4TA 4DG0E 5I0BA 1KE6A 3W10A 4RMZA 2P55A 4X3FC 3I6UA 3Q4ZA 4C62A 4CSVA 3EQGA 3NWWA 3OT3A 5L6PA 3UZRA 1TQMA 3IECA 3KRJA 1Z5MA 4FZ6A 4FL2A 2YN8A 3QQLA 1DM2A 3ZRKA 5I9ZA 3PSCA 4EK6A 5K0XA 4X3FB 2PPQA 3R21A 5JFXA 4AWIA 2UW9A 2VTNA 2XEZA 3NGAA 3MYGA 4IB5A 4IWQA 4RJ7A 4BC6A 4BCPA 4CFWA 2NNWB 4EK5A 3A7FA 4YLLA 4IFCA 5BQ0A 2IZRA 5M51A 4QMYA 4K11A 4RIOA 3DCVA 1ZOEA 3FQHA 5KBRA 4LG4A 1XKKA 3CD3A 1SMHA 3CS9A 4FT3A 4IX6A 5CU6A 4FKWA 3ZUUA 3UMWA 4XBUA 5H9BA 2UW5A 3IW7A 5K4JA 1PXOA 2RKUA 4MQ2A 2QQ7A 4ASDA 4UMPA 2EB2A 5M53A 5HD4A 4PY1A 3UPXA 2JKQA 4LI5A 4H3BA 1GIIA 4XOYA 1CKJA 4AGCA 4F7NA 5CSXA 4FVRA 4BTMA 5KMIA 2QHMA 2WOUA 3HNGA 4HZRA 4TT7A 3ZHPC 4BWPA 3HV7A 3CJFA 1NT2A 5B7VA 2IN6A 3PXQA 3ZEWA 3ZRMA 4L44A 1IAHA 1M2QA 2BIYA 4J98A 3C50A 3CBLA 4Q9SA 5H8EA 4UXQA 3WI6A 4EHZA 3R9HA 5J7BA 2H96A 1U5QA 4XP2A 4BHZA 4PDYA 1CKPA 4JAIA 3LJ0A 4XV2A 5HLWA 1PXLA 1UV5A 3QXOA 3ORMA 2PMIA 4OTDA 5GZ9A 5LVLA 3BYSA 3R7YA 4YHFA 1M7NA 5HE3A 1P4FA 4FKVA 4RFYA 1F3MC 2XRUA 4AX8A 1O6YA 5E8TA 3U6HA 1XR1A 5AV3A 3M1SA 5AA9A 2VAGA 3IDCA 3Q9WA 3VW8A 2OW3A 4JL9A 4Y72A 4QPSA 4I6HA 2VTSA 3EKNA 4RIYA 4X2GA 3FC1X 5G1XA 3GFWA 3MVJA 4L53A 4UYNA 5E8SA 3VS2A 3PA4A 5IA0A 5GIOE 4EOQA 5EKOA 1XH6A 5DN3A 2WTDA 5CNNA 4JBPA 5AM6A 4E7WA 2WQEA 2IW6A 5A3XA 2Y6MA 4PL3A 2OLCA 2VWUA 3LXPA 5K5NA 2HENA 3DKGA 3RAIA 4O7NA 1GAGA 4IE9A 1BYGA 2XMYA 2C3IB 5D7AA 4CKIA 3ZO1A 4CCBA 3PSDA 4EK3A 1XQZA 5E91A 1MRVA 3I81A 3NCGA 1H0WA 2V55A 4S32A 3I1AA 4I23A 4APCA 1S9JA 5A4CA 2IVUA 3ULIA 4S2ZA 4BTFA 4F09A 2GNHA 2G2IA 4O0UA 2GS6A 3O8UA 4BVUA 5HIEA 4ZMFA 2C6OA 1KWPA 1A06A 2NRYA 1LPUA 4GEOA 4XG9A 5I9VA 3U87A 3LMIA 3FZPA 4XV3A 5CT0A 4PMSA 2V7AA 3DK3A 4GIIA 3EZVA 4MWHA 4UYAA 2HY81 1R1WA 5IU2A 4MWIA 3TM0A 3TZ7A 2V0DA 1JVPP 2O3PA 2J51A 5CAVA 2PUIA 2VTPA 2B1PA 4FSNA 3SKCA 1OB3A 2XKDA 1ZOHA 4GVJA 2X8IA 2I6LA 2XIZA 3EYGA 3FLQA 3TV4A 4F6WA 2XNGA 4OTFA 1NVSA 3R9DA 3RBWA 3U55A 3H30A 3NYOA 3PSBA 1OKYA 1H08A 2YCSA 3HMIA 1UNHA 4P5QA 5CF8A 1G8SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5JKG A;  4ARK A;  4B7T A;  3R7U A;  2WHB A;  4E5W A;  4I6B A;  1JKS A;  2R9S A;  5DT3 A;  4CRS A;  3DB8 A;  2ITZ A;  5H2U A;  3ODZ X;  2GDO A;  4BIC A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 5J5S A;  1F0Q A;  5BNJ A;  5J7H A;  2J0L A;  5M44 A;  3VS7 A;  2ZAZ A;  4FNY A;  2YIT A;  4TPT A;  3S0O A;  2P0C A;  3AQV A;  5FRI A;  1FGK A;  1MP8 A;  3GCQ A;  4YJN A;  4E6A A;  4KIN A;  5L8L A;  3GU4 A;  5IA5 A;  3BWJ A;  4H1M A;  2Y4P A;  3NVM B;  5DR6 A;  3KKV A;  3NIE A;  4CKR A;  3BU5 A;  2HEL A;  4K33 A;  4OTG A;  4C34 A;  2X9F A;  2XAL A;  2XKE A;  2XF0 A;  4IAK A;  4ACD A;  3RVG A;  1M7Q A;  4IAA A;  5KNJ A;  4E93 A;  2FA2 A;  4QOX A;  3V8W A;  3K2L A;  4PQN A;  2YEX A;  5LMA A;  3A2C A;  4R7I A;  4AUA A;  4A9T A;  5HTI A;  4G6N A;  3BGZ A;  2ITU A;  4XG6 A;  4AXE A;  2CSN A;  1Y57 A;  4L7F A;  2VTH A;  1W2D A;  3TUD A;  2HZ4 A;  3U6I A;  4Q5H A;  5HG7 A;  4HVG A;  3W2O A;  4EOS A;  1IEP A;  5DE2 A;  5EHO A;  1ERK A;  2BKZ A;  1BKX A;  3ET7 A;  3QQK A;  2JC6 A;  3HGK A;  5CY3 A;  3NUU A;  3UNZ A;  2OZA B;  3VUD A;  2E9U A;  1CSN A;  2I40 A;  3LQ5 A;  1MUO A;  3O96 A;  4BGQ A;  2BCJ A;  1FOT A;  2VX1 A;  4QYE A;  5AP5 A;  1H25 A;  2W5B A;  3Q2J A;  1PKD A;  1PME A;  4WBB B;  5D12 A; 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