4BQLA

Crystal structure of archaeal actin
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
DKSPDPMGVISDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords ACTIN/ACTIN FAMILY PROTEIN
publication title Structure of Crenactin, an Archaeal Actin Homologue Active at 90Degc.
pubmed doi rcsb
source organism Pyrobaculum calidifontis
total genus 126
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bqlA01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bqlA02
1HKCA 3EO3A 5JLHA 4BRKA 4O5FA 2QWOA 4BRFA 3WQTA 4BRLA 4A61A 3WXIA 5BRFA 2CGJA 2A5XA 4ISEA 4CI6A 3GG4A 4H5NA 1BDGA 5AQJA 2FXUA 3MK6A 2NRHA 1QQOA 2AA4A 4FWQA 2IIRA 3A5NC 4CZJA 4XH1A 1NGEA 1P8ZA 2FLOA 3WEEA 3ZX0A 1RGIA 4BC3A 1NGBA 2ASOA 3B8AX 1NMDA 3QICA 4HWIA 4CZIA 5EOYA 5ADXA 4BREA 1BA0A 3ZETA 4H0YB 2VWBA 5KPZA 3QDKA 4B1WB 4I6MA 1SAZA 3CJ1A 5FPMA 1GLCG 3O80A 3D7EO 2E88A 4H0VB 2E1YA 5KPRA 4NB4A 2IVPA 3O1WA 5EXWA 1ZXOA 3VESA 1HKGA 4BGAA 5AFUA 4DHYA 4FSVA 3ZX3A 1Q18A 5EVZA 3JS6A 4EHTA 1MA9B 4ISGA 2F9TA 2YHWA 3LM2A 4FOIA 1HKBA 2ASPA 3O08A 2PBDA 3CJ9A 4BRMA 3CJBA 3ENOA 2V7YA 3BEXA 5AQSA 4BG8A 1GLLO 4CBXA 1C0FA 2Q0UA 4EAHD 3WXJA 2BUPA 5AQRA 2P9LB 2D0OA 2YI1A 3MN9A 2CH5A 2A41A 1ATRA 2E20A 3WEEB 3HSCA 1V4TA 3H3NO 1YAGA 4BG9A 3A5LC 4FWNA 5FPNA 4MLEA 4BGBA 2P9IA 3FZKA 1GLAG 4IXCA 3ZETB 3BF1A 1NBWA 4DB3A 2UYTA 2E2NA 5BRDA 4I6MB 2E1ZA 3LDLA 3MCPA 3UE5A 4WQ4A 5AQQA 4CZKA 4CZHA 1GLEG 5AFUH 4BRAA 2QWMA 3VEWA 3LM9A 3QBWA 3GOIA 4PKGA 3VF6A 1RFQA 1TYQA 2YHXA 3AARA 3EKUA 3O1BA 4GY2B 5F2RA 4PL7A 1JCFA 1HUXA 3VEZA 2A3ZA 1ESVA 4FWRA 1BA1A 3VPZA 3AAQA 3C7NA 1QZ6A 1Y64A 1EQYA 4IJNA 3HBTA 2IVOA 1WOQA 5AZJA 1QHAA 3BF3A 3I8BA 3DXMA 4H5WA 4QS8A 3TU5A 1V4SA 1KAYA 1YVNA 2ASMA 4K42A 2YJEA 4PKHA 1NGAA 3QMLA 2P9IB 3QFPA 3ZX2A 5BN8A 1G99A 4BVPA 1HLUA 3S41A 2I7NA 1YXQA 3CQYA 5LY3A 1WUAA 3GL1A 4PL8A 5E84A 1BWFO 3VGKA 4A2BA 1NGCA 2Q0RA 4BR5A 1ZC6A 3CI5A 1TYQB 4FWLA 4LC9B 2VYPA 4QS7A 2QW9A 3FE1A 3HZ6A 3MN5A 4BRQA 2KHOA 3UB5A 3WXLA 3FR0A 3QFUA 5AQYA 2GELA 4Y0WA 1NGHA 3C7NB 1IG8A 3LL3A 2D0PA 2P9KA 5AZJB 4BC4A 3DXMB 3M3ZA 3O4WA 4KBOA 4M63C 1NLVA 1JCEA 1GLFO 3CIPA 3FGUA 3SJHA 4FPBA 3W0LA 3A0IX 3JXUA 3EKSA 3VENA 1ATSA 1TUUA 4BRCA 2GWJA 3FZFA 5AQGA 1C0GA 1NGJA 3L0QA 1T6CA 1QZ5A 4BVOA 4BQLA 2CGLA 3O6WA 3QBXA 4RCHA 3IUCA 4H0PA 2GWKA 2QXLA 2E8AA 3VF2A 4FWKA 1HJOA 4H0TB 2W41A 4BROA 1BO5O 4WQ5C 3LDQA 3SLCA 3ID8A 3FZHA 5EY4A 4QS9A 2FF3B 3ATUA 4K41A 1HX1A 5BPNA 3UKRA 5KQDA 4F9OA 1MWMA 2E2PA 4CZMA 2F9WA 1NGDA 2P9KB 4XH4A 4YDUC 4GNIA 4K25A 5FPDA 1J6ZA 4M7YA 3EZWA 5AQPA 5ADXH 3DXKA 4CZGA 4CD1A 1DGKN 5AQLA 1QQMA 3C0BA 1ZBSA 4B1UB 4H5RA 3AY9A 4C23A 5AQOA 2ITMA 4JD2A 3P4IA 3H6EA 4EFHA 1GLBG 2HOEA 5TKYA 5E26A 3RSEA 2FSJA 3CHWA 1T44A 2YCHA 5LJWA 5LJVA 3HM8A 1JCGA 3R6MA 3M6GA 3VERA 1MWKA 2CGKA 2ZGYA 1S22A 1Z05A 1CZAN 4BRIA 1BG3A 1S3XA 3UKUA 3F9MA 1X3NA 2Q31A 4O8KA 3SMPA 4CD3A 3UKRB 1OKJA 1KAZA 3U9DA 3O5BA 4IJAA 3H3OB 2P9SA 3MN6A 3ATVA 5JMVA 2ZWHA 4H03B 2QWRA 5BPMA 4BRPA 3GBTA 3SK3A 3IMXA 3DWLA 2E2OA 3DXKB 3FLCO 5AQHA 3VOVA 1NGFA 2V52B 4FL9A 4CJ7A 5AR0A 3MN7A 4JD2B 1KXPA 3DAWA 4BC5A 3RSEB 3VGLA 2GTDA 3VEXA 3DJCA 1NWKA 4EHUA 1TUYA 4A2AA 1K8KA 2J4RA 4AM7A 3D2EA 4BRHA 5KQ8A 5JICA 1XUPO 1Z6RA 1NGIA 2D4WA 4WYBA 5EX5A 3UKUB 3LDOA 2FSNA 3VEYA 3KHYA 3VETA 5BREA 3L4IA 4H5TA 3LDPA 3BP8A 2P9SB 4FPAA 3A8YA 1DKGD 1GLDG 1DEJA 5BPLA 2YJFA 5F0XA 1RDWX 4CBWA 1T6DA 3EN9A 4H5VA 2P9NA 4CZFA 2QWLA 5AQFA 1E4GT 5AQTA 5BR9A 2V7ZA 4FWMA 4BQZA 1HPMA 3CJ7A 2VCPA 1ATNA 5AQUA 3MMVA 5AQVA 4Z94A 3O8MA 2Q2RA 2H3GX 2IVNA 3A5MC 1LOTB 2V51B 4B9QA 2P9LA 4BRNA 2P9PA 2QWPA 1XQSC 3ZEUA 3VEVA 1NGGA 2QWNA 2OANA 3D2FA 1K8KB 3G25A 4JHDA 3D2EB 2Q1NA 4J8FA 3VGMA 4A62A 2A40A 1GLJO 2ZF5O 2FF6A 4BR9A 3CJAA 4B1YB 3M1FA 3U4LA 4CZEA 3H46O 1X9JA 5AQXA 4E1JA 3FZLA 4BR4A 3FZMA 3CERA 3KZBA 5AZIA 4H0OA 2PAVA 4IZ9A 3MDQA 4NO7A 4FO0A 2P9NB 4JAXA 5AQZA 1U6ZA 4M7XA 4RTFD 4WQ5A 3CQXA 3WXKA 3GDQA 4EIAA 4FWOA 1D4XA 4MO4A 4XEIA 5AQMA 4H0XB 5BN9A 5BRHA 2CH6A 1IJJA 1BU6O 4AM6A 2YHYA 2E2QA 2Q97A 5AQNA 2P9PB 4YDUA 3TPQA 3H1VX 4HTLA 4WQ4C 3W3DA 3ZEUB 4CZLA 2ZGZA 3ENHA 1KAXA 5AQWA 2EWSA 3ULEA 3D2FB 4JHDB 3R8EA 2NZTA 3H1QA 3QB0A 5ELZA 2NLXA 3LDNA 2P9UA 2DPNA 3AAPA 5B8HA 3CJCA 1MDUB 1BOTO 3VEOA 4BC2A 4IO8A 3GE1A 3L6QA 4JNEA 4B1VA 4PKIA 4DCHA 3WUHA 5CE3A 1SQKA 4FWSA 5I9EB 3OHRA 3HI0A 5AZIB 3IFRA 4IWVA 3WQUA 4B1ZA 2FSKA 2A6AA 5KPTA 4BR0A 1E4FT 2BTFA 3BUZB 4BRGA 1SZ2A 1QQNA 4BRDA 2AP1A 3SMSA 1U2VA 1YUWA 3EL2A 3FFKB 2HMPA 4BR7A 2I7PA 4K43A 3R9PA 1NM1A 3U8XA 2W40A 3ULEB 2D1KA 4ISFA 4MLHA 2HF3A 3KVGA 2QWQA 2P9UB 3CETA 3IDHA 4MO5A 5AQKA 5FPEA 4L3QA 3A5OC 5AQIA 1R59O 1H1VA 2QM1A 2A42A 2HF4A 1BUPA 4XH5A 4DQ8A 2WUSA 2GUPA 3H45C 4FOEA 4CBUA 3HTVA 4JN4A 3WT0A 3VF4A 5F1XA 5JLFA 4RWTA 3I33A 4BR2A 4B1XB 1XC3A 2GEMA 1LCUA 4FWPA 3U9ZA 2Q36A 1X3MA 3J8AA 1U2VB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FJ7A 2QEXN 3EO3A 4O5FA 4IOAL 3JYTA 5BRFA 4DSJA 4DFKA 3BZKA 1EWQA 2P5OA 5AQJA 3MK6A 1E3MA 4CZJA 3A5NC 1ASUA 2FLOA 3ZX0A 4BC3A 1NGBA 2UUAK 2ASOA 3B8AX 1NK6A 1NMDA 3G4SN 4OKEA 4CEAA 3ALYA 4DF8A 1T05A 2Q3SA 4FJJA 4B1WB 4I6MA 4KTQA 1SAZA 3CJ1A 1BHLA 4C1NK 4CJTA 2E88A 2IVPA 3JSMA 1HKGA 5AFUA 4GV6A 4CF0A 3K5LA 1Q18A 3Q7CA 5DK5A 5EVZA 4EHTA 5C12A 4ISGA 1S1TA 3NHGA 2PBDA 3CJ9A 3OYDA 3LPTA 4C8NA 4CHPA 4BG8A 5HRNA 1JLBA 4EAHD 3KK3A 3DRPA 3KWIA 4BE2A 3MN9A 4JS5A 2O8CA 3OBWA 3OYEA 2E20A 3CM6A 2BH1A 1XHXA 1VQPN 3CCVN 3A5LC 3AGKA 4E7KA 2UYTA 2E2NA 5BRDA 4I6MB 2E1ZA 2EHGA 4BDZA 2JWKA 1GLEG 4CZHA 5AFUH 4N76A 2OZMA 1JJ2M 1NJYA 4WF9L 3TABA 3DLEA 3CCLN 4PY5A 3ZSQA 2ZJPL 5F2RA 1HMVA 3OYGA 2IDOA 3SYZA 1C0MA 1ESVA 3QEVA 2O8CB 1X9WA 1EQYA 3V81A 2QI2A 3NH0A 3SZ2A 1YJNN 3NH2A 4LF6K 4CEBA 1G15A 4QOZB 3DM2A 4NXMK 1S1XA 3NVMA 1RBSA 4HHTA 1G99A 1HYVA 2NRRA 4BVPA 4R79A 4U7BA 1KSPA 3GL1A 1A5WA 1EX4A 3ZSWA 3C6TA 4A2BA 4CIEA 5HRPA 1KVBA 2Q0RA 4M3WA 3K5NA 3ZT0A 1RDUA 3KK7A 4FJ8A 5LL6Z 4HUGA 3AO3A 4CHOA 4DTMA 3HZ6A 3NH1A 4KHQA 4BRQA 2WBNA 4CJQA 1XNRK 3QFUA 1NKEA 5AQYA 4Y0WA 1EO1A 2X6NA 2YNFA 3VQEA 4DV0K 4FW1A 2D0PA 4GV9A 3HP9A 4CHQA 3M3ZA 1N36K 4KBOA 4M63C 1NK0A 4AH9A 5SWMA 2X74A 3SJHA 4PUOA 4HCBA 1RTJA 1N8RO 1VSFA 3PSFA 2VWKA 4BRCA 4CJPA 4FZXC 1NGJA 3L0QA 4BVOA 3AVJA 3RRGA 4RCHA 3IUCA 3LDSA 3L2VA 1SKWA 2KFZA 1HJOA 1RBRA 4JK8A 4KFBA 3ID8A 5EY4A 2FF3B 2NUBA 1HX1A 3E9LA 3UKRA 5BPNA 3KLGA 4FK4A 2X6SA 1K6YA 5I42A 2E2PA 4LH4A 2W6LA 1NGDA 2GBZA 3G6EN 5CYMA 3MXIA 4DU4A 1SKSA 4DF4A 3I8DA 5ADXH 3DXKA 4CZGA 2HBMA 4O0IA 1ZBSA 4JI1K 2UUCK 3HRGA 5AQOA 3A2FA 5I3UA 4FLWA 4PQUA 4DU1A 3DI6A 4ICLA 5GAEP 3E66A 4LF8K 3R6MA 4W5OA 1SL2A 3VERA 1MWKA 3ZSOA 4DKWA 2XY6A 1Z05A 4H8KA 3VA0A 3AVKA 1UOCA 4O8KA 3UKRB 5M1OA 5C42A 3M8RA 2P9SA 3CD6N 3AVFA 2VWJA 5BPMA 4LF4K 4NCGA 1YTAA 2YX6A 4JKHA 5FDLA 3GBTA 2XHBA 4NYFA 1JXBA 3DXKB 2O8DA 1Q86O 1GOCA 4C8LA 5GAHP 4CJ7A 4FL9A 1VSJA 3SQ1A 2OTJN 4CEDA 4NYNA 4BC5A 2KZMA 3VGLA 3NGYA 1NWKA 1TUYA 2D5RA 2D0BA 1VQ5N 3OJSA 4E3SA 3VTIA 2AJQA 3OTOK 1HRHA 4WYBA 5EX5A 3O4QA 1SL1A 3OYLA 4OKKA 3BP8A 3S3NA 2PZSA 2P9SB 2F8TA 3OYNA 1GLDG 1DEJA 5F0XA 4M42A 4CZFA 2G8WA 4DV7K 1J5OA 5AQFA 3AV9A 5BR9A 2V7ZA 2O8DB 4FWMA 3L2WA 2I5JA 3CJ7A 4Z4HA 1NU0A 5AQUA 2IVNA 1XHZA 1LOTB 2WFBA 2V51B 4CIFA 4BRNA 2P9PA 3VTHA 4ZTJA 3VEVA 2WC9A 1KVAA 1NGGA 2QWNA 4CGJA 3D2FA 1W0HA 1LWEA 1QVGM 3ZSXA 4FJMA 4W5TA 2HNDA 4CJSA 2A1SA 1WSGA 1Q7YO 4DR5K 3FZLA 4BR4A 5JS1A 3FZMA 3SUOA 4KHWA 4DV3K 3MDQA 4CGGA 4BY9C 3VQCA 2HHWA 4JAXA 3MWTA 4RG8A 3WXKA 3GDQA 4RW9A 1DTQA 3RWUA 4KHUA 4RW7A 2XY7A 1L3UA 5KRTA 3L3UA 2CH6A 3K58A 1EKEA 2NRTA 3ZLJA 1IJJA 4KI4A 2UXDK 1RDCA 3DRSA 3HYFA 2KFNA 2P9PB 1JLQA 1IBKK 3SUQA 2ZGZA 4E7HA 3NAEA 1W9HA 5J1EA 2EWSA 3D2FB 3LALA 3BDPA 2HHVA 3H1QA 1W2BM 2E6LA 3CCQN 4JS4A 4DTPA 4EP4A 3O3GA 2DPNA 3AAPA 3CJCA 3RMBA 4X65K 4QAGA 4JI7K 4DCHA 1KC8O 3PY8A 4FWSA 5I9EB 2HHUA 3OHRA 3WQUA 1IBMK 3C6AA 2WONA 4FLTA 1E4FT 2BTFA 4BRGA 3HM9A 3WNEA 4DTXA 4LF7K 4FLXA 2AP1A 2YHAA 2OTLN 3FFKB 3P38A 4IKFA 4BR7A 3QEPA 4RW8A 3T7ZA 2I7PA 2HNYA 4LF5K 4AHTA 2RF2A 2P5GA 4B9TA 4CGIA 4CJRA 4ISFA 2QKBA 1XMOK 3AVAA 4MLHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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