4C67A

Discovery of epigenetic regulator i-bet762: lead optimization to afford a clinical candidate inhibitor of the bet bromodomains
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Cell cycle
molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
publication title Discovery of Epigenetic Regulator I-Bet762: Lead Optimization to Afford a Clinical Candidate Inhibitor of the Bet Bromodomains.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 44
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4c67A01
4LDFA 5FFVA 5I83A 4NR8A 4A9JA 5E9KA 4OUFA 5IGNA 3IU5A 1X0JA 5D3LA 4NR7A 4O78A 4KV4A 4UIVA 2LSPB 2RNWA 5DY7A 5EGUA 4YK0A 5HFRA 5CQ7A 4A9MA 5E73A 4TYLA 2WP2A 5IGMA 5HRVA 5C87A 4IR5A 3U5NA 5CU8A 3TLPA 5E9VA 4A9HA 4UIZA 5ETBA 4AKNA 4CL9A 4HXPA 4TZ2A 5F3AA 5ETDA 5HCLA 4MENA 5L98A 3O37A 5A7CA 5D3JA 4XYAA 5FE3A 5BT5A 5HRXA 4QEWA 5HQ5A 4CURA 5HM0A 4QYLA 5HFQA 3AQAA 4Z6HA 3UVWA 5HLSA 5F2PA 5DYCA 5CP5A 4A9FA 4TT2A 2YEKA 4YYKA 3LXJA 3P5OA 4BW4A 5FDZA 5KO4A 4BW3A 4YYMA 3HMEA 4NR9A 4O7BA 5D3RA 5F61A 4QSPA 4YY4A 2OSSA 5FFYA 4J0RA 5J0DA 4A9LA 5CRZA 4YABA 5AD3A 4N4HA 5FE5A 2F6JA 4TT4A 5CY9A 4HXKA 4HXSA 4UIWA 5K29A 5HENA 2E7OA 4O74A 4Z93A 4XUAA 5CUBA 4O7CA 5D3PA 4TTEA 3Q2EA 5CQ6A 5A5RA 2DVSA 4O70A 5CRMA 5JWMA 5D3SA 4QNSA 4QY4A 5EISA 4O71A 4NUCA 4X2IA 5C7NA 5FE8A 4PTBA 4CUTA 2YYNA 3MB3A 5A5SA 3O34A 2RO1A 4LZ2A 4HXMA 4WIVA 5LKUA 5FE1A 2RNXA 4O7FA 4YYDA 4NS5A 5DW1A 3O36A 5DFDA 3U5PA 4UIUA 4YH4A 5EWVA 4UIXA 4QC3A 5C85A 4TT6A 3MB4A 5FH6A 3U5OA 5CQAA 5DX4A 5FG4A 4UYHA 5I89A 5D3NA 4ZC9A 4PCEA 4HXOA 4RVRA 5II1A 5G4SA 1EQFA 4Q0NA 2DWWA 3UV5A 2YQDA 4HBXA 4TU4A 5L97A 4WHUA 5CQ5A 4OGIA 2DKWA 5FG6A 5F62A 5E7DA 5ENBA 3U5MA 4MR3A 4IR4A 3S92A 4PKLA 4C66A 5E3DA 2DVQA 5IG6A 3UW9A 1WUMA 4UYDA 4CUPA 2I7KA 5E0RA 5CQ8A 5BT4A 2MJVB 5F36A 3UVXA 5D7XA 4YYGA 5DFBA 2RFJA 5EM3A 3P1CA 5CTLA 3FKMX 3JVLA 5DLXA 5EQ1A 4CUUA 3I3JA 4O7AA 4BHWA 2F6NA 4C67A 4N4FA 5CS8A 5CUGA 5CUCA 4BJXA 5ENFA 3P1EA 2R0YA 4NR4A 3UV4A 3U5JA 4QBMA 4ZQLA 4YYIA 5A5NA 5LJ0A 2R0VA 5F1HA 3JVJA 4GPJA 4NRBA 3QZTA 4YY6A 4XUBA 4A9EA 3ONIA 5E74A 5CUDA 5EVAA 3U5KA 4IR3A 4QUTA 2D9EA 5ENGA 4QYDA 4IOQA 2YEMA 5FE9A 5IBNA 5EV9A 5FE7A 5E9LA 3QZVA 5DFCA 5ENHA 4O72A 5ENJA 5IIDA 4QR5A 5EU1A 4QB3A 5II2A 4O77A 5JI8A 4O75A 4NXJA 4A9KA 5I86A 5LJ2A 5A83A 3AADA 4CUQA 4NQMA 3G0LA 5EWDA 5I29A 4NR6A 5E9YA 3RCWA 5D3HA 5FE2A 3JVMA 3UVYA 5D3TA 5DKDA 4HBWA 2DATA 3SVGA 5A5OA 4CFLA 5I40A 2L85A 2OUOA 5H1VA 4QSRA 2RNYA 4HBVA 5I88A 5A82A 5LKXA 5D25A 3JVKA 3O33A 4LYSA 1ZS5A 5DKCA 2H60A 5D0CA 4QSUA 4YH3A 4QSWA 5FFWA 5L8UA 5E9IA 2L5EA 3MQMA 4CLBA 5CUAA 5EP7A 4HXNA 2E7NA 4MEPA 5FBXA 5CZGA 2GRCA 5LJ1A 4NRCA 5DW2A 4A9IA 2RS9B 5I1QA 5FB0A 4MR6A 4YATA 5CPEA 4J1PA 5IGKA 4TS8A 4HBYA 5KTWA 5F1LA 4YYNA 4ZW1A 4NUDA 4N4IA 3HMFA 5DYUA 5DLZA 2OO1A 5KTXA 2D82A 2E3KA 5A5PA 4CFKA 2R0SA 3Q2FA 5EK9A 2G4AA 4NQNA 5C8GA 4UYFA 4LYWA 1E6IA 5I7YA 5I80A 5LVRA 1JSPB 3IU6A 4MR4A 4LYIA 4ALGA 4A9NA 3MUKA 3LQHA 5L99A 2R10A 4LRGA 5TCMA 5F60A 5LKZA 4Y03A 2FSAA 4O7EA 1F68A 4PCIA 5DYAA 4UYGA 5A5QA 4J3IA 4J0SA 2I8NA 4LZSA 5AMEA 5F5ZA 5CQ3A 4ALHA 5COIA 5AD2A 4XY9A 4NYXA 4PY6A 5FH8A 5C4QA 3D7CA 5CGPA 4BW2A 2N9GA 5CQTA 3K2JA 5FG5A 3ZYUA 4TQNA 3LQIA 4E96A 4O76A 4YBMA 5FB1A 3SVHA 5HQ7A 3UVDA 4Z1QA 4TZ8A 4QZSA 4YAXA 2RI7A 4MEQA 4F3IA 5D26A 1N72A 5EWWA 5EA1A 4UYFB 5ENIA 4DONA 5C89A 4YBSA 2KTBB 4MEOA 4OGJA 4QR4A 5LUUA 4HXRA 5FH7A 4CUSA 4YC9A 1WUGA 2WP1A 5BT3A 3U5LA 4IORA 4UYEA 5HQ6A 5H1TA 4LZRA 5KHMA 4XY8A 3P1DA 5A81A 5ACYA 4UITA 4MR5A 4N3WA 2YW5A 4N4GA 4IOOA 5DBMA 3O35A 4QEVA 4IR6A 5FE4A 5L96A 5G4RA 5CFWA 3MULA 5D24A 5LKTA 4PS5A 2YDWA 5F25A 4NRAA 5ENCA 4YYHA 4KV1A 5EPRA 5HRWA 5A85A 2DVRA 4HXLA 3NXBA 4QEUA 5IGLA 5LVQA 4NR5A 4QSTA 4A9OA 5CQ4A 3P1FA 3QZSA 4QR3A 3DWYA 4UIYA 3HMHA 5TB6A 4WHWA 4YYJA 5L8TA 5ENEA 4NYVA 4Q0OA 5H1UA 5KTUA 5F63A 1JM4B 4NUEA 4Z1SA 5CUEA 5H85A 5I7XA 4QSXA 5EWHA 3LQJA 5FE6A 5DKHA 4QSQA 5DYXA 5FE0A 5EWCA 5AMFA 3S91A 4LC2A 5EPSA 5HEMA 4QUUA 3MXFA 4BW1A 4YADA 5HJCA 4NYWA 4QSSA 2L84A 4QSVA 4YBTA 5KU3A 4TU6A 4KCXA 2NXBA 5E9MA 5E3GA 4Z6IA 2YELA 4FLPA 5EICA 4LR6A 3LJWA 3UV2A 2DVVA 5HELA 4QC1A 3G0JA 5EPBA 5EI4A 3GG3A 3SVFA 3DAIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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