4C7DA

Structure and activity of the gh20 beta-n-acetylhexosaminidase from streptomyces coelicolor a3(2)
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
493
structure length
493
Chain Sequence
EPTPLDRVIPAPASVEPGGAPYRITRGTHIRVDDSREARRVGDYLADLLRPATGYRLPVTSHGHGGIRLRLAEGPYGDEGYRLDSGREGVTITARKAAGLFHGVQTLRQLLPAAVEKDSAQPGPWLVAGGTIEDTPRYAWRSAMLDVSRHFFSVDEVKRYIDRVALYKYNKLHLHISDDQGWRLAIDSWPRLATYGGSTEVGGGPGGHYTKADYEEIVRYAASRHLEVVPEIDMPGHTNAALASYAELNCDGVAPPLYTGTKVGFSTLCVDKDVTYDFVDDVLGELAALTPGRYLHIGGDEAHSTPQADFVAFMKRVQPIVAKYGKTVVGWHQLAGAEPVEGALVQYWGLDRTSDAEKAQVAAAARNGTGLILSPADRTYLDMKYTKDTPLGLSWAGYVEVRRSYDWDPAAYLPGAPAEAVRGVEAPLWTETLSDPDQLDFMAFPRLPGVAELGWSPASTHDWDTYKVRLAGQAPHWEAMGIDYYRSPQVPWT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
publication title Structure and Activity of the Streptomyces Coelicolor A3(2) Beta-N-Acetylhexosaminidase Provides Further Insight Into Gh20 Family Catalysis and Inhibition.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces coelicolor
total genus 186
structure length 493
sequence length 493
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2013-09-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4c7dA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4c7dA01
2GJRA 2XUCA 1VB9A 2WM0A 3TP4A 3F5JA 2BS9A 2ZWZA 3MO4A 4PMZA 4GZIA 3KL3A 3M6DA 1UR0A 2WMKA 3VGHA 1E5JA 5A95A 1CZ1A 3TA9A 1S46A 5A3HA 4W7WA 2FDMA 5AYIA 4QDMA 2GK1B 1HNYA 2O9PA 3ARPA 1K9EA 1E6QM 1P6WA 2BXZA 2J74A 4AIUA 2WK2A 5FKYA 3SURA 3AIBA 3BC9A 4CD5A 3AICA 1G0CA 1B9ZA 1ISZA 4D6DA 3SCQA 2CBUA 3GNOA 3QOKA 3K4AA 4PTXA 5I24A 3VDBA 3SUUA 2RGLA 3WMBA 3WEOA 4XZBA 2PWEA 1V3KA 1O6IA 3AHTA 3K1DA 1V03A 4R5EA 1J0YA 1PIFA 3EMCA 2WCGA 4GIAA 1J11A 2XSBA 5A6AA 4PUDA 1K9FA 1CDGA 1HKIA 4TOQA 1WDRA 2Y5EA 3EMQA 3VU2A 5I77A 4DWSC 3BH4A 2OYLA 2IXUA 2BHUA 3WH9A 4V27A 3A47A 3MMWA 5BYWA 1RP9A 2DGAA 4A3YA 2NSXA 3ALGA 5IDIA 4U5KA 1JF5A 1DWJM 3MUAA 1ZS2A 4RE2A 1E9LA 3F5LA 1DWFM 4UQBA 1WDSA 3I3BA 2DQXA 3VD3A 4GO8A 2ZWYA 1B0IA 1BPLB 4J28A 5A94A 2GDUA 1JL8A 4IPNB 1BGAA 2IUZA 3FN9A 1EXPA 4AD0A 4MJ4A 1JFHA 2O9OA 4CU7A 3CUJA 2VX6A 3HMCA 2X09A 3ZJ6A 1GHSA 1W32A 2EO7A 5DMYA 3CHDA 3ZIZA 3ARXA 3RM9A 4MB4A 1WDQA 4B9ZA 3T0BA 2XHYA 1W3KA 1H11A 3ZJ7A 3AI0A 1UKPA 5LA0A 2WC4A 1NWUA 2Y8VA 4M8UA 2AOSA 4H04A 1BG9A 3MUY1 2Z1KA 1M01A 5LYRA 4QLJA 5DT5A 2CXGA 4U3AA 4E2OA 1H41A 1VJZA 1UZ4A 3AMDA 5A8MA 4D6CA 2ZUWA 2EPKX 1GJUA 4LQ1A 3LPOA 1HVXA 4Z2KA 3CIVA 5E6ZA 1OD8A 3GXDA 1OIMA 2V3FA 1DWHM 1X6NA 5D9PA 1R7OA 3BMVA 1KXQA 2F61A 4L4OA 3VX0A 5BXSA 2XPKA 4QP0A 3WH8A 2DSKA 5ABFA 2ZXDA 1SMDA 1UKSA 2CKSA 3UESA 4CN1A 1C90A 3CMGA 1OWQA 5HXMA 1UH4A 2WBKA 5KEZA 3S2CA 2XIIA 4FLRA 4LXFA 3VM7A 3GM8A 1KWGA 1WE5A 3WD1A 3DYPA 3VIJA 1MQPA 2J79A 2CITA 3CHEA 2C8NA 4D6FA 3BAYA 4UFJA 3NUKA 3T2PA 4UQCA 2CYGA 4FK9A 3N1AA 3QHOA 4H8VA 3CUIA 5CLTA 3VTRA 3ARUA 3MV11 3NSXA 2WZEA 2PC8A 2XVKA 4PTMA 2JF7A 2YL6A 3PTKA 3VVGA 3U7BA 2XVGA 2VX7A 4UFIA 7TAAA 4W8LA 2GSJA 4M56A 3BCFA 4S3JA 1HP5A 3L4VA 4ACZB 1CXKA 1ZU8A 1E5NA 3AFBA 2VRKA 3TTQA 3VMPA 5HBFA 3OGVA 1E40A 5CGTA 1J0IA 1E4NA 4HOXA 3ARSA 4PMOA 1V02E 1AQHA 1BLIA 1OBAA 3DECA 1ITXA 3TTYA 4UFMA 6A3HA 3MU7A 4AEEA 1D2KA 5E70A 2E8ZA 4W84A 2AAAA 4WSKA 1QNOA 3HU7A 2DH3A 2NT0A 4CN4A 2J25A 3GXMA 2GK1A 2WBGA 3PZIA 2E9LA 1VEOA 1C8XA 3VNYA 5I5RA 1C8YA 4M24A 1J10A 3T2OA 2FH8A 1MW0A 2J77A 1E3XA 4EANA 3N9KA 1RD6A 4NZCA 1ZL1A 3L4TA 4IUGA 5CPSA 2DH2A 1EIBA 1W2VA 1UWUA 3E1F1 4QCEA 5GNXA 1BVNP 2W61A 2VX5A 4OUEA 2DSVA 4LYRA 4U5IA 2QLYA 1ODUA 4AZBA 3CZLA 1UD4A 1ECEA 3M46A 1ISXA 3ARVA 3AIVA 3PZMA 3WQWA 4PMDA 1TCMA 3VIGA 3KZSA 3SCWA 4AEFA 2JIEA 1D3CA 1CGWA 4PEEA 5HPOA 3BAJA 1J0HA 4MNJA 3CUFA 5D8ZA 4M81A 3QHMA 5CSUA 1JZ2A 3UR8A 2ZUUA 3ZO9A 1L0PA 2BNJA 2CBVA 1JXJA 2DIEA 1W1PA 3SCPA 1VEPA 4GI6A 4XB3A 4MNKA 3W28A 1B1YA 1WP6A 1ZB5A 1CGXA 3WH6A 2WLYA 1HJQA 1H4PA 4MB3A 2BY2A 1MFVA 2VC9A 4WKFA 3CUGA 3HJEA 4ZE5A 2X8RA 5BRPA 3L2MA 2D20A 4B15A 2E0PA 4JHZA 4PCSA 3W25A 2GJXB 4UQEA 4AXNA 2QF8A 1LF1A 5DFAA 4XZWA 1JNEA 3VIKA 3KWXA 2PF0A 2VQUA 3MSDA 3IAPA 4JL2A 2CHOA 3UR7A 1QBAA 4QFUA 1BYCA 1W1YA 5E0FA 3PTMA 1KCLA 1HT6A 4ATDA 3APGA 2J7DA 4ZEPA 2G3JA 1LG1A 3LPPA 4NRRA 1VEMA 1HJUA 4HMDA 3W6LA 4CCDA 3ZM8A 1UR1A 1ITCA 1BAGA 4H7VA 3WD4A 3WQVA 1US2A 4JAWA 3BGAA 4JFWA 2VZVA 1UQYA 3WF1A 3OB8A 4ZXLA 1WAWA 3LMYA 3B8SA 3PZVA 4WSJA 1NWRA 1XH0A 1UYQA 2WKLA 3D5HA 5AC4A 3ARYA 3WDRA 1E0VA 1H5VA 4UR9A 3A4XA 2W63A 3WNPA 4U3CA 4Z2GA 1X1NA 4HA4A 3W6MA 2J4GA 3WF3A 2Z1SA 5D9NA 3SCVA 1OGSA 2Y2WA 9CGTA 3ZJKA 3BAIA 4A4AA 2QPSA 4U33A 4A3HA 3MANA 2BHZA 4IPLA 5F7UA 1LG2A 1EGZA 1W3JA 2UY5A 2W5FA 4P7QA 1ZBWA 3GNPA 3A4WA 3AS3A 1VFUA 3OGSA 4GXPA 1IT0A 1H2JA 1EH9A 3TTSA 3VIMA 4CD4A 3WD3A 5AY7A 3EYPA 2W66A 2ZUTA 1B30A 3F4VA 2PWHA 4CD7A 1NQ6A 1G94A 1NP0A 1U2YA 3TTOA 4KRTA 3K8LA 1UWQA 4K68A 1MW1A 1J18A 3N15A 4DWSB 3W0KA 1GZJA 4ACZA 2D23A 1I75A 5LA1A 1KR1A 2F2HA 3A4AA 3WSUA 1PIGA 2EPMX 1C91A 3TONA 2ZICA 4TTGA 1CWYA 3EMZA 2WKGA 1QBBA 4JFSA 2XFRA 3FAXA 1OIFA 2VZTA 1RH9A 3W24A 2HVMA 4CGTA 2JF6A 1KXVA 4KGLA 1MFUA 1K9DA 1QI3A 3SCNA 2VI0A 3PN8A 1QNQA 5EMYA 4UOQA 2CNCA 3RPMA 1JZ6A 1EA9C 1J0KA 1CXHA 2WPGA 1UZ1A 1OSEA 1W9VA 1KGWA 1G01A 5JBDA 3VD9A 4TXEA 3SUTA 1VAHA 3W82A 2OWXA 5I6SA 1EQCA 1NOWA 4URIA 1C7TA 1JI2A 2XSAA 4B9YA 4YHGA 5A8NA 4IM4A 4YN5A 2WMIB 1H0IA 4B3LA 5HDRA 4PMXA 1HJXA 1G1YA 3IANA 1IV8A 3VGDA 2EPLX 3VGEA 2CBJA 1HP4A 3AHXA 4NF7A 1WPCA 2EBNA 4HOWA 3NIYA 3VPLA 2C7FA 4XUYA 3NJ3A 2XVLA 1PBGA 5GPRA 4FF5A 2YL9A 4J3SA 3AXHA 1V6VA 1HL9A 3WFZA 2BHYA 1EOMA 4HU8A 3K4DA 1E0XA 1QNPA 3JUGA 4HOZA 1JFXA 2E9BA 4FLSA 3U5UA 3AIQA 2DT1A 4RL3A 2OSXA 4AZ7A 4MB5A 3VMOA 4W88A 2PWFA 3M07A 4JCLA 1IZJA 2VVNA 2XFFA 3QOMA 3ARZA 5JBEA 2ZE0A 1XCWA 4HZ8A 5A2AA 3VNZA 3RJYA 1GVIA 4GINA 4PBGA 5IXEA 3N17A 1R7AA 1BYAA 1HKMA 4TUFA 4JKMA 4C7GA 3WF0A 1JYWA 1UWIA 4J7RA 1U33A 1CYGA 2IXVA 5EFFA 2AMGA 3MMDA 3WEMA 3MKKA 3WMCA 1E0WA 1PZ2A 4W5UA 1XV8A 5DEZA 2F8QA 1K9TA 1FHDA 4P7RA 5A6MA 4W5ZA 2OSYA 3AHVA 4C90A 1NARA 1TR1A 2YOCA 2GJXA 3A3HA 5A1AA 1UKQA 4XV0A 5ECUA 5BWFA 3U5YA 3AIEA 3OA5A 1N82A 1KXTA 2MANA 3WY1A 3QHNA 1QNSA 3G6MA 1JZ7A 1JDCA 2NW0A 1VBUA 5LA2A 3S6TA 1G9HA 4B16A 1UWSA 4BF7A 2J47A 2WHLA 3UEQA 4BCEA 4AD2A 1NP2A 4OOUA 1L8NA 2VZOA 1JDDA 4W93A 1JYXA 4MAVA 1Q6FA 3WUEA 3PBGA 1LLOA 1OB0A 3FXYA 1GQLA 2D24A 3PZOA 2D2OA 4ATWA 3AMGA 5FCZA 2WC7A 3T0DA 3VIPA 2VCBA 1CNVA 2G3MA 1E73M 1SR0A 2D0HA 3N13A 4HTYA 1W9XA 4EAMA 4PMNA 3UETA 1E4MM 3SUVA 3SUSA 1ODZA 3WF4A 1I1WA 1GOMA 4AZIA 3AXXA 4M80A 2G4FA 4PRWA 2WMHA 2CEQA 4FLQA 2ZUSA 1MYRA 2WANA 1BGGA 4DWSA 1CXLA 4HPHA 4J3WA 3W27A 1GQIA 1H49A 1UWTA 4P8UA 5CJ5A 5GNZA 5DF0A 2DT0A 2OWWA 1E72M 1CXEA 4V28A 1KFWA 3GNRA 4PUEA 1F4HA 1V3HA 1QI0A 4FMVA 1HX0A 3VDAA 3THCA 2XFYA 3G6LA 4LPCA 1TFVA 1DTUA 1HF6A 1HKKA 4Y7EA 2G8ZA 1OM0A 1YHTA 1JXKA 5JIPA 2XGIA 5D9OA 4UOZA 3LPGA 1E71M 2VMFA 4J3TA 1XH1A 1VENA 1UWRA 3M7SA 2E4TA 1GOKA 2WHJA 1B3VA 2EJ1A 3CZ8A 3RO8A 3POCA 2WVSA 3AXIA 1UD8A 4QLLA 1UH3A 1LL4A 3U7VA 1B3YA 3EDKA 2WMIA 5CGMA 5EFDA 3W38A 4QLKA 5A6LA 3RCNA 5FD0A 4HZ7A 2J7EA 1W9DM 4AD1A 3VINA 1E6PA 4GQRA 3WIJA 2VJXA 3WDHA 2WXDM 1BFNA 5C71A 1JZ5A 3OZOA 4EK7A 1TA3B 4HPGA 1B2YA 4P7OA 1ZBCA 1JAKA 1NOUA 3EDFA 2UY4A 4C7FA 2WZIA 3DYMA 4GQQA 3UG3A 1VIWA 4W85A 4E8CA 3WDQA 4GZJA 4AZ6A 1JD9A 4X0VA 3ZT5A 2WMFA 1CXFA 2E8YA 4CUCA 4CVWA 1B90A 1OINA 4W8AA 2XTKA 1DHKA 4J27A 4BZYA 2Y8KA 4PMVA 5DT7A 3A6OA 3MSGA 2DEPA 2ZIDA 1VBRA 1CEOA 3BCDA 4DUXA 3KL5A 1VJSA 5FL1A 5A6BA 1JDAA 4RE3A 1J12A 3FAWA 3MMUA 2VVSA 5BXPA 5M17A 1H1NA 3L4YA 2YBTA 4CKQA 5A8PA 4E8DA 1OCQA 2A3CA 4HA3A 1BYDA 3WDIA 3CTTA 2WWDA 1FH7A 2EPNA 1O7AA 3VD7A 4P8VA 3DC0A 5CG0A 1B3ZA 1FHLA 1VFOA 4ML4A 2D0FA 2XYLA 2DSUA 2ESCA 3NYDA 2BY0A 2WZHA 2ZX5A 2WCAA 3SCSA 2JE8A 1E6XM 1WO2A 5I79A 2J7BA 3WDJA 4CCEA 1SFSA 2YDQA 3RMEA 1OGGA 1UD5A 2HISA 2RGMA 4UCFA 1RP8A 4D1IA 1UA3A 2X1IA 5A69A 1UD2A 3ARWA 1EDTA 2X2YA 4YHEA 4UOJA 2J75A 1XSIA 1B3WA 4KH2A 3VIHA 1MXGA 4JHOA 4Z2IA 1OGBA 4M82A 1JAEA 1J9YA 2D0GA 5EB8A 1TUXA 4DWSD 2WMJA 3CZEA 3BLKA 2WVTA 1MXDA 2D3LA 3AOFA 4PSPA 4W89A 4QAWA 1G5AA 1PX8A 4MNLA 1E4LA 3WQ5A 3ZR5A 1PPIA 2PI6A 1U30A 4OOZA 4AY1A 2WWCA 2VURA 1OT1A 5HPCA 1KR0A 3SCRA 4JIEA 4RE4A 3GH4A 4D6HA 4KGJA 4Z2LA 3T0AA 1FP9A 2GDVA 2D3NA 4W8BA 2BY1A 3L2LA 4D6GA 3WH7A 1AQ0A 3FHQA 3AQUA 3AZRA 3TOPA 3BSGA 3CPUA 3AMLA 3BAWA 1CLVA 4Z2JA 3SEPA 1HN1A 1CPUA 3DHUA 3OBAA 4R27A 2WC3A 4NRSA 1TZ7A 5HOSA 1B3XA 3AIRA 4EE9A 3OGRA 2Y4SA 3ZOAA 1UQZA 4GO9A 3AMCA 5I23A 4B3KA 1XCXA 2V3GA 4XX6A 1WZLA 5KZ6A 2VR4A 1E1FA 4U2ZA 2B31A 2VX4A 4KWUA 1MVYA 3VDCA 1VFMA 1WZAA 2WHKA 4WJXA 1XSKA 1SYTA 4MAZA 3ZSSA 2E40A 3VIOA 1XHGA 3VILA 1ZJBA 3KE0A 1UOKA 3AHZA 3B9AA 3WNKA 3I3EA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2GJR A;  2XUC A;  1VB9 A;  2WM0 A;  3TP4 A;  3F5J A;  2BS9 A;  2ZWZ A;  3MO4 A;  4PMZ A;  4GZI A;  3KL3 A;  3M6D A;  1UR0 A;  2WMK A;  3VGH A;  1E5J A;  5A95 A;  1CZ1 A;  3TA9 A;  1S46 A;  5A3H A;  4W7W A;  2FDM A;  5AYI A;  4QDM A;  2GK1 B;  1HNY A;  2O9P A;  3ARP A;  1K9E A;  1E6Q M;  1P6W A;  2BXZ A;  2J74 A;  4AIU A;  2WK2 A;  5FKY A;  3SUR A;  3AIB A;  3BC9 A;  4CD5 A;  3AIC A;  1G0C A;  1B9Z A;  1ISZ A;  4D6D A;  3SCQ A;  2CBU A;  3GNO A;  3QOK A;  3K4A A;  4PTX A;  5I24 A;  3VDB A;  3SUU A;  2RGL A;  3WMB A;  3WEO A;  4XZB A;  2PWE A;  1V3K A;  1O6I A;  3AHT A;  3K1D A;  1V03 A;  4R5E A;  1J0Y A;  1PIF A;  3EMC A;  2WCG A;  4GIA A;  1J11 A;  2XSB A;  5A6A A;  4PUD A;  1K9F A;  1CDG A;  1HKI A;  4TOQ A;  1WDR A;  2Y5E A;  3EMQ A;  3VU2 A;  5I77 A;  4DWS C;  3BH4 A;  2OYL A;  2IXU A;  2BHU A;  3WH9 A;  4V27 A;  3A47 A;  3MMW A;  5BYW A;  1RP9 A;  2DGA A;  4A3Y A;  2NSX A;  3ALG A;  5IDI A;  4U5K A;  1JF5 A;  1DWJ M;  3MUA A;  1ZS2 A;  4RE2 A;  1E9L A;  3F5L A;  1DWF M;  4UQB A;  1WDS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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