4CACA

Refined structure of human carbonic anhydrase ii at 2.0 angstroms resolution
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE FORM C
publication title Refined structure of human carbonic anhydrase II at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1991-09-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4cacA00
3D9ZA 5DRSA 3T85A 2WEJA 3M3XA 2H15A 1CAOA 3IBIA 2FNKA 1RAYA 1F2WA 4FL7A 4N16A 1LGDA 4M2WA 5JDVB 4CNWA 4MDLA 4E9OX 5FNLA 3RYVB 5DSNA 1AZMA 1JD0A 1TEQX 2HL4A 5FLSA 1ZFQA 1G3ZA 1FSNA 2Q38A 3MWOA 4PYYA 3D8WA 5JG3B 4QSAA 1FQNA 4KNMA 3JXFA 4Z1JA 3FW3A 3KOIA 2X7TA 3IEOA 4Q0LA 5EH5A 5FL6A 4TWMA 5FLOA 3V7XA 4Q83A 1BN3A 1CA2A 4Q7PA 4Z1NA 5C8IA 3TVOX 1CNXA 2H4NA 2CABA 4YGJA 2IT4A 5LMDA 4ZWIA 2FOQA 5JG5B 1I9NA 5CACA 1TBTX 4E49A 4JSSA 3S8XA 1CZMA 4FVOA 3W6IA 3T5UA 3DV7A 5SZ6A 1CNKA 5JQ0A 2FW4A 3U45X 1CINA 4HT2A 1UGFA 5SZ5A 3LXEA 3TVNX 2OSFA 1FSQA 5JGSB 9CA2A 1TG3A 4JS6A 3S77B 1HUGA 4YGFA 4YX4A 4L5WA 4HEYA 5BYIA 2EU2A 4GL1X 1I9OA 5BNLA 3U7CA 4R5AA 5DOGA 1BZMA 3ML2A 4E4AA 4ZWYA 1BN4A 4K0SA 3DVCA 3S75B 1G1DA 1YO1A 5EH8A 4QTLA 3P58A 1CCUA 3NB5A 3K7KA 3DC3A 1IF5A 4Q7SA 4KNJA 5E5UA 1CAIA 1OKMA 4E3GA 4QIYA 3DBUA 1UGGA 3PO6A 4Q8XA 1CALA 1CVDA 2HKKA 4QY3A 5DVXA 3JXHC 4QJMA 4MLXA 4RUZA 4YXIA 4PYXA 1IF7A 4RIUA 3ZNCA 3KLDB 4YGKA 3KKXA 4HU1A 4YXOA 1IF6A 1UGCA 5FNJA 1YDBA 3MHMA 4RIVA 5FLTA 2Q1BA 5EHEA 2EZ7A 2FMGA 2AX2A 5A6HA 3M1JA 3VBDA 3P3HA 1EOUA 1HEBA 4R59A 3D0NA 4QK2A 3RZ0B 4YXUA 4Q81A 4Q99A 3S71B 3KOKA 4KV0A 1BV3A 4E3FA 4Q8YA 3HKTA 4KUWA 3V2JA 3MNUA 1XPZA 1I9QA 2W2JA 3MDZA 4E3DA 1YDAA 3KIGA 4QJWA 4YYTA 4XIWA 4MDGA 4Q7VA 3V3FA 2CBEA 3RYZA 1OKNA 3CZVA 4QJXA 4KUYA 3RJ7A 3OKVA 4Z1KA 3MHCA 1LZVA 1YO2A 2FOSA 4KP5A 3S97A 1ZSCA 3PJJA 4Q08A 5EOIA 3P5LA 1CNYA 5E2KA 3RG4A 5DSRA 4ITPA 1ZH9A 5DOHA 3CAJA 1RZDA 3B4FA 4KP8A 4YWPA 3P55A 4Q49A 1DCAA 1BNMA 4DZ9A 4L5VA 5SZ4A 3DVBA 3RZ5A 1CCTA 2NNVA 1KWQA 4Q90A 2EU3A 4YGLA 1AM6A 1BN1A 1CIMA 3JXGA 4M2VA 5CLUA 3GZ0A 1CVCA 4CNVA 4Q8ZA 2GEHA 5DSLA 4XZ5A 3DCSA 1ZE8A 2QO8A 3M2YA 1I90A 4Q78A 4M2RA 3UYQA 1ZFKA 2ZNCA 5FNIA 1DMYA 1Z93A 4YHAA 3N4BA 3M1WA 3EFIA 1XEGA 4XFWA 4Q87A 3ZP9A 5DSMA 3BL1A 4QJOA 1LUGA 2POWA 3M2XA 3NJ9A 3CYUA 3DD8A 3F4XA 3DVDA 5L3OA 3EFTA 2VVAX 1HECA 5FDIA 3S73B 1UGBA 5IPZA 3RZ7A 3T5ZA 1TEUX 1FQRA 1KOQA 1ZGEA 3IBLA 1XQ0A 3DAZA 1FR7A 4CACA 2FNNA 1CVHA 1CVAA 4WW8A 3HKUA 3MYQA 3OILA 3U47A 2CBAA 3MNHA 3IAIA 3SAXA 3MMFA 4LHIA 2FOYA 4Q07A 1FQLA 3UYNA 3R16A 3DA2A 3HKQA 4RFDA 3DCWA 4YVYA 2CA2A 4ZWXA 2WD3A 4FVNA 4HEZA 3V3GB 1CRAA 1ZGFA 5EKMA 5DSQA 1HUHA 4ZX1A 4K13A 5G0CA 5JESB 3V5GA 4UOVA 2NWYA 2QP6A 3RZ1B 4ETQC 4FRCA 3SBHA 1URTA 1XEVA 3M04A 4Z0QA 1BNUA 3SBIA 5DSOA 4CNXA 1HEAA 4CA2A 5EHVA 1TB0X 1I8ZA 2F14A 4COQA 1CAYA 2AW1A 4E3HA 5E28A 5EH7A 3S78B 4BCWA 1TTMA 1RJ5A 1HVAA 4PZHA 5JEGB 3FFPX 5G0BA 12CAA 1CNHA 2POUA 1ZNCA 1FR4A 2CBCA 4K1QA 2NWOA 1H9QA 2WEOA 4MO8A 4ZWZA 4RUYA 1KOPA 3MNKA 1KEQA 1THKA 3P44A 1YDCA 3MNAA 4FPTA 4ILXA 5L6KA 4BF1A 1RAZA 1TG9A 3M2ZA 3M96A 4ZAOA 1G46A 2NMXA 3BL0A 1Z97A 5CJFA 1DCBA 3MNJA 1RZEA 1CNBA 2HOCA 4HT0A 4QSBA 2OSMA 3T83A 1Y7WA 1G6VA 1I91A 2FNMA 4TWLA 3M14A 4Z1EA 4BF6A 1BNVA 3P4VA 1H9NA 4WR7A 1BNWA 2WD2A 1FSRA 3D93A 5JEHB 2FOUA 3QYKA 3PYKA 1A42A 1BNQA 4CNRA 5BRVA 4KUVA 1V9IC 1CA3A 1YO0A 3L14A 1CRMA 3OIMA 5DSPA 1BNNA 1CVBA 4HEWA 1HCBA 3OIKA 5SZ3A 1CAZA 3D92A 4Q6DA 3F8EA 1CCSA 1G4JA 4QJPA 5G03A 1CVFA 3OYSA 7CA2A 5BRUA 2NWPA 5JEPB 2WEHA 1CNJA 3OYQA 2NN7A 4ZX0A 2X7UA 1H4NA 1AVNA 1DMXA 4RFCA 3M40A 3MHLA 4XE1A 5J8ZA 4YGNA 5DSJA 4FIKA 2NXRA 2NNSA 3M98A 5E2SA 3DC9A 2FOVA 2Q1QA 2NN1A 1G53A 5SZ1A 1I9LA 5EIJA 4KNIA 1BCDA 3P5AA 5FLRA 5DSIA 3IBNA 1UGDA 5FL4A 2FMZA 2HNCA 2NXSA 3KWAA 4Q7WA 1RZBA 5FNHA 3RGEA 2QOAA 4KNNA 4Y0JA 5SZ2A 3K2FA 1CVEA 4Q9YA 4K0TA 3RYYA 5HPJA 5FL5A 5E5RA 1I9MA 3M5SA 5DSKA 3IBUA 5FLPA 3K34A 3KONA 3N0NA 2CBBA 3RZ8A 1UGAA 3RYJB 4DZ7A 5EKHA 4QK1A 1TE3X 4JSWA 4WUPA 1CNGA 4PXXA 1G48A 2HD6A 3V3JA 1CNWA 2POVA 3RYXB 3M5EA 5SZ0A 4QEFA 1YDDA 2NNOA 3B1BA 4PQ7A 4Q09A 3CA2A 1FLJA 2CBDA 3SAPA 4QIZA 3S9TA 4MDMA 2NXTA 1FQMA 3MZCA 1LG5A 5E2MA 1CANA 3HLJA 5A25A 1HEDA 4CQ0A 4ITOA 4RN4A 1G0FA 1RZAA 5G01A 2NWZA 4IDRX 4RUXA 5EKJA 3RLDA 3M67A 1MUAA 1RJ6A 4QK3A 1G45A 3R17B 3S76A 3MHIA 3MNIA 3FE4A 4KAPA 1HCAA 1MOOA 2VVBX 4WUQA 1TH9A 4C3TA 3V2MA 5BRWA 3ML5A 1JCZA 2WEGA 4Q6EA 1Z9YA 3HFPA 1IF9A 1CNIA 1G54A 5JGTB 1G0EA 3HKNA 5E2RA 4HBAA 2ABEA 2X7SA 3N3JA 1ZSBA 3V3HB 5FLQA 3U3AX 4M2UA 5FNKA 1I9PA 4QSIA 3S72B 2HFWA 5CA2A 2ILIA 1LG6A 4IWZA 3OY0A 4FU5A 3KS3A 1CILA 4WL4A 4L5UA 1CAKA 3BETA 4LP6A 4RH2A 3M1QA 4N0XB 4JSZA 5E2NA 2NNGA 1G52A 3S74B 3W6HA 3M5TA 5JQTA 4LU3A 3MHOA 3T82A 3NI5A 4QSJA 3DD0A 4MTYA 3OKUA 5AMGA 1T9NA 4X5SA 4R5BA 3C7PA 1CAHA 1J9WA 4WW6A 5FNMA 1RZCA 6CA2A 1OQ5A 1ZSAA 4Q06A 8CA2A 5FNGA 3KNEA 5SZ7A 3N2PA 2GD8A 3M1KA 3F7BA 4HF3A 3TMJA 1IF8A 1V9EA 4E5QA 1BNTA 3HS4A 4JSAA 3IGPA 4XIXA 1CNCA 5EHWA 4K0ZA 4G7AA 1G4OA 2O4ZA 1CAMA 3F7UA 3T84A 4QJ0A 1BICA 1KWRA 5AMDA 5FDCA 1CAJA 4MLTA 1UGEA 5AMLA 5EZTX 3P3JA 3RG3A 3V3IB 3DCCA 3M2NA 3Q31A 4G0CA 1JV0A 1OKLA 1IF4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3D9Z A;  5DRS A;  3T85 A;  2WEJ A;  3M3X A;  2H15 A;  1CAO A;  3IBI A;  2FNK A;  1RAY A;  1F2W A;  4FL7 A;  4N16 A;  1LGD A;  4M2W A;  5JDV B;  4CNW A;  4MDL A;  4E9O X;  5FNL A;  3RYV B;  5DSN A;  1AZM A;  1JD0 A;  1TEQ X;  2HL4 A;  5FLS A;  1ZFQ A;  1G3Z A;  1FSN A;  2Q38 A;  3MWO A;  4PYY A;  3D8W A;  5JG3 B;  4QSA A;  1FQN A;  4KNM A;  3JXF A;  4Z1J A;  3FW3 A;  3KOI A;  2X7T A;  3IEO A;  4Q0L A;  5EH5 A;  5FL6 A;  4TWM A;  5FLO A;  3V7X A;  4Q83 A;  1BN3 A;  1CA2 A;  4Q7P A;  4Z1N A;  5C8I A;  3TVO X;  1CNX A;  2H4N A;  2CAB A;  4YGJ A;  2IT4 A;  5LMD A;  4ZWI A;  2FOQ A;  5JG5 B;  1I9N A;  5CAC A;  1TBT X;  4E49 A;  4JSS A;  3S8X A;  1CZM A;  4FVO A;  3W6I A;  3T5U A;  3DV7 A;  5SZ6 A;  1CNK A;  5JQ0 A;  2FW4 A;  3U45 X;  1CIN A;  4HT2 A;  1UGF A;  5SZ5 A;  3LXE A;  3TVN X;  2OSF A;  1FSQ A;  5JGS B;  9CA2 A;  1TG3 A;  4JS6 A;  3S77 B;  1HUG A;  4YGF A;  4YX4 A;  4L5W A;  4HEY A;  5BYI A;  2EU2 A;  4GL1 X;  1I9O A;  5BNL A;  3U7C A;  4R5A A;  5DOG A;  1BZM A;  3ML2 A;  4E4A A;  4ZWY A; 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