The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
61
|
structure length |
61
|
Chain Sequence |
NQVYFAVYTFKARNPNELSVSANQKLKILEFKDVTGNTEWWLAEVNGKKGYVPSNYIRKTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| molecule keywords |
DYNAMIN-BINDING PROTEIN
|
| publication title |
Structural Details of Human Tuba Recruitment by Inlc of Listeria Monocytogenes Elucidate Bacterial Cell-Cell Spreading.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
|
| structure length |
61
|
| sequence length |
61
|
| chains with identical sequence |
C, E, G
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-10-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HSP A; 2I0N A; 1BB9 A; 2FRY A; 1E7O A; 2L3P A; 3REA B; 1OOT A; 2DIL A; 2HDA A; 2KEA A; 3H0I A; 2JMA A; 4LNP A; 1TUD A; 4OML A; 5GJW B; 2RN8 A; 2CH4 A; 1RI9 A; 4F14 A; 1NLO C; 2BZY A; 2JT4 A; 3EGU A; 3UA7 A; 2L0A A; 4F17 A; 2DL7 A; 4J9E A; 1E6H A; 2IIM A; 2FO0 A; 1M3A A; 2FPD A; 5ECA A; 3EHQ A; 2RQT A; 2JW4 A; 2RNA A; 2ROL A; 2K6D A; 3SEM A; 1BU1 A; 2JTE A; 2ED1 A; 4CC4 B; 3VS4 A; 1AVZ C; 4RTW A; 1ZSG A; 1WFW A; 2BZX A; 2EPD A; 4HVW A; 1GCQ A; 4J9C A; 1W70 A; 2JXB A; 2H8H A; 2B86 A; 2J06 A; 2LMJ A; 2A08 A; 3KFV A; 1SHF A; 2DRM A; 1VYT A; 4ESR A; 1WI7 A; 1M3B A; 1G2B A; 1X69 A; 1OV3 A; 4RTT A; 3UAT A; 2LQN A; 1SPK A; 1V1C A; 2X3W D; 3SHW A; 4AFZ C; 1UUE A; 4JPB W; 2VKN A; 1H8K A; 2DBK A; 1BBZ A; 2KGT A; 2KRS A; 4RUG A; 2RPN A; 2FRW A; 4AG2 C; 2FPF A; 1FMK A; 2BZ8 A; 2KT8 A; 2LCS A; 1OEB A; 3QWY A; 5I11 A; 2YUP A; 5I22 A; 4D8D A; 1H92 A; 1T3S A; 2JS2 A; 2KRN A; 1UJ0 A; 4AFU C; 2QDL A; 2KRO A; 1RLQ C; 2FPE A; 4J9F A; 2JM8 A; 2D8H A; 3TSW A; 2F2W A; 4JZ4 A; 1VYV A; 2EW3 A; 2O9S A; 3M0S A; 2YSQ A; 1CKA A; 3RNJ A; 5FW9 A; 2YUN A; 2YUQ A; 4CC2 A; 3TSZ A; 3M0R A; 1JEG A; 2RQR A; 4GLM A; 3UA6 A; 3VS6 A; 5L23 A; 3VRY A; 1ZBJ A; 1SHG A; 2MCN A; 1UG1 A; 4LUE A; 1KSW A; 1W1F A; 2KXD A; 1VYU A; 1H3H A; 1YNZ A; 4CC7 A; 1JQQ A; 1X6B A; 1M30 A; 1JU5 C; 1PRL C; 2LJ1 A; 1UDL A; 4OMQ A; 4RTU A; 4HVV A; 1TG0 A; 2DL5 A; 1K9A A; 1N5Z A; 1Y0M A; 2L3S A; 1GFD A; 1PWT A; 1ARK A; 1HD3 A; 2JS0 A; 1PKS A; 4J9D A; 3EG0 A; 1KJW A; 1X2Q A; 5FWB A; 2FEI A; 4ZNX A; 1SRM A; 3UF4 A; 4HXJ A; 1GCP A; 4IIM A; 2AKL A; 2F2V A; 3PE0 A; 4RTX A; 1PRM C; 1RUW A; 2GNC A; 1GL5 A; 4GBQ A; 1Y57 A; 2GQI A; 3EG2 A; 1AD5 A; 2JM9 A; 2CH4 W; 3PVQ A; 2DNU A; 4E6R A; 2A36 A; 2DBM A; 2G6F X; 2OAW A; 1U06 A; 3QWX X; 2J7I A; 1UTI A; 2FG0 A; 2KBT A; 1GCQ C; 2ABL A; 2EGA A; 3M0Q A; 1YWP A; 2EYY A; 2RMO A; 2L2P A; 5IHN A; 2C0I A; 2SEM A; 2A28 A; 1QCF A; 1QWF A; 3EG3 A; 1Z9Z A; 2EGC A; 4J9G A; 2HEQ A; 1U3O A; 5IHI A; 1JXM A; 4HVU A; 2YUO A; 1J3T A; 2K7A A; 2RQV A; 3EG1 A; 1VA7 A; 1AWJ A; 2JMC A; 3M0P A; 2KE9 A; 2A37 A; 3ULR B; 2VVK A; 1KFZ A; 2EBP A; 2KYM A; 3VS2 A; 3VRZ A; 4Y92 A; 2OJ2 A; 4DEX A; 2EKH A; 1QKX A; 1AZG B; 1BK2 A; 2MIO A; 2GGR A; 2DJQ A; 3I5R A; 1ZUY A; 1YP5 A; 2M51 A; 1QWE A; 2J05 A; 3U23 A; 1AEY A; 2ECZ A; 2ESW A; 2D1X A; 2MOX A; 5IHK A; 1YN8 A; 1X2K A; 1TUC A; 5IXF A; 4OMP A; 2EGE A; 3O5Z A; 4CC3 A; 2DYB A; 2DLP A; 2LX7 A; 2NWM A; 2KRM A; 1WXB A; 2V1R A; 2NUZ A; 3C0C A; 3PVL A; 1CKB A; 1GRI A; 3NPF A; 2DRK A; 2K2M A; 4JJD A; 2DM1 A; 4K11 A; 3VS5 A; 1AWX A; 2PNI A; 4KRT A; 1YCS B; 1SRL A; 2BTT A; 1UEC A; 2PZ1 A; 1UHF A; 1CSK A; 5GJV B; 2DVJ A; 1PHT A; 1ZUK A; 1ABQ A; 2LP5 A; 1JXO A; 1OPL A; 2DX1 A; 2YT6 A; 2D0N A; 2KYB A; 1X27 A; 4R0K A; 2X3X D; 2C0O A; 1S1N A; 5FWC A; 2KXC A; 1YWO A; 2AZV A; 1G83 A; 1WX6 A; 2EYZ A; 1HJD A; 1K0S A; 4EIK A; 1MV0 B; 4LN2 A; 3VS3 A; 3VS1 A; 2LZ6 B; 1ZUU A; 2K9G A; 1WXT A; 2DL3 A; 4J9H A; 3REB B; 4HCK A; 3H0H A; 3I35 A; 1A0N B; 2O88 A; 1WLP B; 2C0T A; 2DF6 A; 2V1Q A; 1IO6 A; 3VS7 A; 1UJY A; 5EC7 A; 2ENM A; 5IH2 A; 4OMO A; 1B3Q A; 1K1Z A; 1M8M A; 1I1J A; 2O2O A; 2CT3 A; 2J6K A; 3I9Q A; 1WDX A; 1SSH A; 3EHR A; 2SRC A; 1NEG A; 2GTO A; 2KT1 A; 3IQL A; 3NGP A; 2KNB B; 1NG2 A; 2M0Y A; 4J9B A; 3FJ5 A; 2K79 A; 3A98 A; 2O9V A; 4AG1 C; 1FYN A; 3M0U A; 3H41 A; 2KR3 A; 1NYG A; 3NHN A; 5IXB A; 1HSQ A; 1GBR A; 1UFF A; 1K0X A; 1NEB A; 2AZS A; 2LJ3 A; 4DEY A; 1WXU A; 2W0Z A; 4M4Z A; 2DL4 A; 2W10 A; 4ORZ A; 1ZLM A; 1U5S A; 1X6G A; 4LUD A; 1AWO A; 1T0H A; 2E5K A; 2J6F A; 4Z88 A; 4X1V A; 1WIE A; 4F16 A; 4RTV A; 1UE9 A; 1T0J A; 3I5S A; 4RTZ A; 1AOJ A; 2CUD A; 2DL8 A; 1Z9Q A; 2D8J A; 2EYW A; 3LH5 A; 1LCK A; 4JJB A; 2DE0 X; 2DMO A; 2CSI A; 1NLP C; 1JO8 A; 4Z89 A; 4JZ3 A; 1QLY A; 2P4R A; 3RBB B; 3JV3 A; 1QKW A; 4QT7 A; 1AWW A; 1UHC A; 2EQI A; 1PNJ A; 2L3Q A; 1KIK A; 2HCK A; 1WA7 A; 4IIO A; 1OPK A; 4LE9 A; 1M27 C; 2HBW A; 3GBQ A; 1NM7 A; 3TVT A; 3CQT A; 1ABO A; 4WCI A; 1MV3 A; 3R6N A; 1PKT A; 4FSS A; 2CSQ A; 4AFS C; 2RF0 A; 1WYX A; 1E6G A; 2LQW A; 2RQW A; 1AZE A; 2F2X A; 3M0T A; 1GBQ A; 2O31 A; 2GTJ A; 3THK A; 5HCK A; 4JJC A; 4AFQ C; 2LJ0 A; 2EYX A; 2CT4 A; 2CUB A; 4Z8A A; 4J9I A; 1X43 A; 2CRE A; 2RQU A; 2GBQ A; 1MUZ A; 1SEM A; 2ED0 A; 3H0F A; 1UGV A; 1NYF A; 1B07 A; 2EVR A; 1RLP C; 2CDT A; 2XMF A; 1GFC A; 2OI3 A; 1W6X A; 3ZL7 C; 4D8K A; 1K4U S; 1M3C A; 2J6O A; 1XOV A; 1I07 A; 1EFN A; 2YDL A; 3VS0 A; 2VWF A; 2PTK A; 1ZX6 A; 4RTY A; 1T3L A; 2AKK A; 2DA9 A; 4OMM A; 1K76 A; 2ROT A; 2LNH B; 3NMZ C; 4A63 B; 2AK5 A; 4OMN A; 2K3B A; 1I0C A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2EQK A; 2DET A; 1D3B A; 1E7O A; 3PTA A; 5I21 A; 1ZSZ A; 2BKD N; 3MEW A; 4ZTF A; 3I55 A; 4X9C A; 1LNX A; 1RI9 A; 1B34 B; 1NLO C; 2JT4 A; 2MK5 A; 3UA7 A; 4F17 A; 1E6H A; 4PJL A; 4ZN3 A; 2FO0 A; 1HXD A; 3Q1J A; 1VQM T; 4L6V 5; 4C0Z A; 1WJS A; 1QVG P; 2LT4 A; 2RQT A; 2RNA A; 2ROL A; 4J8O A; 1H3Z A; 1BU1 A; 2JTE A; 3UDC A; 1AVZ C; 2VXF A; 3EG9 A; 4EMK B; 1WFW A; 2BZX A; 3CMA Q; 2QYZ A; 3E1S A; 4HVW A; 3X24 B; 1Y96 A; 5I2M A; 5GAN 2; 1M2V A; 2A08 A; 3KFV A; 2GF7 A; 3CCQ Q; 3V7S A; 3CCJ Q; 3HRU A; 1TU0 B; 1M3B A; 1YIJ Q; 1JB0 E; 3FLG A; 2JTF A; 4PJO E; 4HCC A; 1G3T A; 3SHW A; 3MP6 A; 1H8K A; 2V8K A; 4BD3 A; 2QQ9 A; 1ZBX A; 3QJY A; 3G71 Q; 5GAN g; 2KSS A; 2KRS A; 4DBR A; 2CP0 A; 1TXQ A; 2RPN A; 4AG2 C; 4QVD A; 4RCB A; 4XQ3 A; 2NUT B; 3A5Z B; 2C06 A; 4J6W A; 2OTJ A; 4XU1 A; 4XU2 A; 5GMK e; 2JS2 A; 1D1B A; 3JB9 G; 3HTR A; 2KRO A; 1KHI A; 3QKJ A; 1N6A A; 1NJI R; 1D0Z A; 1N9S A; 3CXC P; 4PJO A; 2O9S A; 3CBO A; 4O5V A; 3RNJ A; 3G6E T; 4X9D A; 3CPW P; 4CC2 A; 3TSZ A; 1NE8 A; 3QG1 A; 1JEG A; 4DBF A; 3I56 T; 5LJ5 j; 4GLM A; 3RER A; 3JB9 I; 2VC8 A; 1ZBJ A; 2IG0 A; 2MCN A; 1VQ6 Q; 5AT1 B; 3TEE A; 4LXC A; 1WZO A; 4MML A; 3QO3 A; 4EPC A; 2QI2 A; 1VYU A; 2QA4 Q; 1H3H A; 4A4E A; 3OYY A; 1IGU A; 2CS7 A; 3CBP A; 1K9A A; 1JJ2 P; 3D7S B; 4RCC A; 3VUZ A; 4OGC A; 1TWB A; 2CKK A; 3HP9 A; 3UF4 A; 1VQ7 A; 2K5I A; 3L2W A; 4BAC A; 4GBQ A; 2O01 E; 3EG2 A; 4QKU A; 2CH4 W; 4OP0 A; 4B9W A; 3PVQ A; 2DNU A; 2A36 A; 2QQR A; 2CZ1 B; 2G6F X; 3V8L A; 4OB3 B; 4BI8 B; 1U06 A; 1D1A A; 5FLX E; 4M77 D; 3QWX X; 4BE1 A; 4FYX B; 4E2F B; 4UC4 A; 2QQB A; 3CMA A; 4JS5 A; 5GAM f; 1QCF A; 1QWF A; 2MWP A; 1TS9 A; 3C95 A; 3OS1 A; 1YIT T; 2HEQ A; 1U3O A; 5IHI A; 2YUO A; 2E1H A; 1YIJ A; 4M7A D; 2VGN A; 2RHI A; 2FB7 A; 2HBP A; 4M75 E; 1YI2 A; 3M0P A; 2KE9 A; 1FMV A; 2CGH A; 5L8R E; 1VQ4 A; 1UGQ B; 3CCV Q; 4V2S A; 2EBP A; 4BE2 A; 4M77 F; 3OS0 A; 4ATO A; 1AZG B; 1WHM A; 2KAF A; 3VKI A; 2GGR A; 3I5R A; 2DIG A; 2M51 A; 1OX9 A; 2J05 A; 4M75 C; 2DD4 A; 5IHK A; 3RKW A; 1TUC A; 3CCE A; 5IN1 A; 4KUD K; 1P92 A; 2H3J A; 5IXF A; 3LWI A; 2DD5 A; 2EGE A; 4M7A F; 3P8B B; 1VQN A; 4C5E A; 2DYB A; 2LX7 A; 2KRM A; 3S6W A; 4ME7 A; 2FZC B; 4L5G A; 1GRI A; 3CPW A; 1K9M R; 2DRK A; 1YHQ A; 4JJD A; 4K11 A; 3OY9 A; 4KRT A; 2COZ A; 2DEU A; 4C92 F; 2YT6 A; 4A4F A; 4EMH A; 2RI3 A; 2XU8 A; 4C8Q D; 1W2B A; 3WXM B; 4CRI A; 3JSC A; 1G83 A; 4N4G A; 4EIK A; 4C0F A; 3JAM E; 3CC4 Q; 2EIF A; 1LVK A; 5KYN A; 1Y71 A; 2EAY A; 3OQ5 A; 4MDX A; 1FX7 A; 4M7D D; 1VQ5 T; 2G3R A; 1IO6 A; 3WVE B; 5GAM e; 3JB9 J; 3OYL A; 3ER0 A; 1TOV A; 2CT3 A; 4PL6 A; 2EKO A; 3RUX A; 2XDD A; 1VQ9 T; 3EHR A; 4C8Q F; 5IAY A; 1XNI A; 2OTL Q; 3IQL A; 4F7U B; 2PVD B; 1MHN A; 4J9B A; 3FJ5 A; 3X28 B; 5GAN d; 5GMK m; 2QQA A; 2FYK A; 4AG1 C; 1FYN A; 1RL2 A; 3NHN A; 3CC2 T; 3J80 E; 4E7H A; 1K0X A; 3OMC A; 2MAM A; 4Y28 E; 1WQ7 A; 4M77 B; 3CCU T; 2W0Z A; 2DL4 A; 2W10 A; 4M7D F; 1T0H A; 2EWN A; 2NLU A; 4LDU A; 2QEX Q; 1UE9 A; 1T0J A; 3O8V A; 3OYF A; 4AT1 B; 1Z9Q A; 1BI3 A; 4M7A B; 2RHU A; 1LCK A; 4R55 A; 2DE0 X; 2DMO A; 5KE3 A; 4IUU A; 1NZ9 A; 2EQJ A; 3H8Z A; 3RDV A; 1PC0 A; 1UHC A; 2EQI A; 1NPR A; 3A8M B; 1WA7 A; 5FU6 B; 2DKG A; 2HBW A; 5GAM g; 1K73 R; 2DK3 A; 4KUI A; 2EQM A; 2DXB A; 2CSQ A; 3MEA A; 1M1G A; 4XTV A; 2RQW A; 2LC4 A; 3M0T A; 1LOJ A; 3VJP A; 2DTO A; 4JJC A; 1OI1 A; 2LJ0 A; 1IHV A; 2EYX A; 4M78 G; 2RB6 A; 3LYI A; 4DA4 A; 1VQM Q; 4J5Y A; 4C0D C; 1MUZ A; 3OBY A; 1SEM A; 2O4X A; 2ED0 A; 4QVZ A; 2LCC A; 1Q81 C; 1LJO A; 4O6J A; 5KYX A; 2CDT A; 2XMF A; 5AYF A; 2AHJ B; 4BY6 B; 5DY9 A; 3MEU A; 3ZL7 C; 3CC4 A; 4D8K A; 1S72 T; 5LJ5 h; 1WHL A; 1K4U S; 4FYW B; 4C8Q B; 1M3C A; 2BE7 D; 3CCL A; 1I07 A; 1R77 A; 4CI0 C; 2R57 A; 2K5F A; 4LD9 K; 1WPY A; 3LH0 A; 1WHJ A; 2ROT A; 3BDU A; 4Z02 A; 3DLM A; 2LNH B; 5A0G A; 2X35 A; 4MZM A; 3EGD A; 1EX4 A; 3TU4 K; 1N8R C; 1Q7Y R; 3PFS A; 4MZT A; 4E47 A; 2L3P A; 2DIL A; 3OYN A; 1WJR A; 3H0I A; 1FWZ A; 4LNP A; 4PJO F; 1U1T A; 4M7A C; 3AHU A; 4KUL A; 4A53 A; 1QP3 A; 2ZPH B; 5GJW B; 1QP2 A; 4KGX B; 2RA2 A; 3A8H B; 1YJW T; 1WHH A; 2BUD A; 2FPD A; 2DFU A; 5GAN 8; 2KVQ G; 3EHQ A; 2B8A A; 4BB7 A; 2QEX A; 2HL5 C; 3G6E Q; 3SEM A; 4ELZ C; 3PGG A; 2EYQ A; 4OB1 B; 4CC4 B; 3OW2 A; 3ME9 A; 3DB4 A; 4C92 C; 1ZSG A; 3I56 Q; 3JCM b; 2ZPB B; 3L2Q A; 2EPD A; 3EGX A; 5GAN j; 2QGF B; 1GCQ A; 2QTV A; 1N9R A; 2JXB A; 2EQU A; 2DTH A; 3HFO A; 4PJM A; 2DRM A; 1VYT A; 3V8K A; 4ZTJ A; 1G2B A; 1RAB B; 1X69 A; 4RMO A; 4RTT A; 3UAT A; 2LQN A; 1SPK A; 3OS5 A; 1V1C A; 2RHY A; 5GAO m; 2E64 A; 3QYG B; 1UUE A; 2DBK A; 2KI7 A; 3UWN A; 2GFU A; 4N0A C; 1M1K R; 2FRW A; 5I11 A; 2FVU A; 1BIB A; 4MZP A; 4D8D A; 1QW1 A; 1H92 A; 1MNE A; 1T3S A; 2PVO B; 3CCR T; 1N27 A; 3DLL A; 4BDY A; 2MWO A; 4AFU C; 4E7Z A; 1JBM A; 1VQM A; 1KC8 C; 4J9F A; 2JM8 A; 1Y7X A; 2EJF A; 5KYY A; 1D0X A; 3CBM A; 4FCY A; 1VYV A; 4J83 A; 2EW3 A; 2YSQ A; 4FT2 A; 4NS5 A; 3M56 A; 2A7Y A; 2RH2 A; 3C4S A; 4M75 D; 5FW9 A; 4E7K A; 5CKF A; 2RQR A; 4M7D C; 3UA6 A; 3VS6 A; 2DXC A; 4XTX A; 3EFO A; 5D6Y A; 3CME T; 3CPW S; 2XHC A; 1YIT Q; 1UG1 A; 3S3M A; 3QXE B; 3OB9 A; 2KXD A; 4GY5 A; 4BI4 A; 4CC7 A; 2XG8 D; 5GMK j; 1UDL A; 4OMQ A; 1YJ9 A; 1WGS A; 1KC8 U; 1TG0 A; 1M5Q 1; 2DL5 A; 2L3S A; 1GFD A; 1ZSZ C; 1ARK A; 9ATC B; 1HD3 A; 2DXT A; 2JS0 A; 3CCS T; 3OSV A; 3EG0 A; 1VQL A; 4JRQ A; 4M75 F; 2FEI A; 3E2U A; 4HXJ A; 5CQY A; 2YLC A; 3PMI A; 1VIE A; 2AKL A; 4RTX A; 1PRM C; 1F1B B; 1GL5 A; 1ZHI A; 1Y57 A; 4HKE A; 3EFS A; 1BCM A; 4M78 E; 3SWN A; 1VQP A; 2DBM A; 3M5A A; 2RHZ A; 2KQW A; 2XD0 A; 1UTI A; 3CC7 A; 5GAM d; 2EGA A; 3M0Q A; 1YWP A; 3CCM A; 2X4Y A; 1Q86 R; 4VUB A; 2DYI A; 1NPP A; 2FZK B; 5HKC A; 4OF1 A; 2DZ9 A; 2EGC A; 3H9N A; 5LJ3 d; 2LVM A; 2K7A A; 4XTU A; 2RJF A; 1G3S A; 2WSE E; 3JCM f; 1AWJ A; 2OAU A; 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