4CD6A

The structure of gh113 beta-mannanase aamana from alicyclobacillus acidocaldarius in complex with manifg
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
315
structure length
315
Chain Sequence
SAFDLGFIRGMTFGFVGQHGTWGTDEARASMRALAEQPFNWVTLAFAGLMEHPGDPAIAYGPPVTVSDDEIASMAELAHALGLKVCLKPTVNCRDGTWRGEIRFEKEHGPDLESWEAWFGSYSDMMAHYAHVAKRTGCEMFCVGCEMTTAEPHEAMWRETIARVRTEYDGLVTYNCNHGREEHVRFWDAVDLISSSAYYPIDRWRDRVPVLREVAEAHEKPLFFMEVGCPSRSGSGACPWDYRHPGAVCLDEQARFYEAMFAAMPDEPWFKGYMLWEWPWKLYPREAASEDGSYCIYGKPAEDVVARAFSAIANR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDO-BETA-1,4-MANNANASE
publication title Combined Inhibitor Free-Energy Landscape and Structural Analysis Reports on the Mannosidase Conformational Coordinate.
pubmed doi rcsb
source organism Alicyclobacillus acidocaldarius
total genus 126
structure length 315
sequence length 315
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2013-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4cd6A00
2XWDA 3W6MA 2GK1B 2G8ZA 1ZBCA 2XFRA 1VJSA 3QR3A 3W26A 3VTRA 1J0HA 3QOKA 3WNPA 2XIBA 1MFUA 4CD7A 2X1IA 1QI5A 5JBDA 4JFTA 1G9HA 1E6QM 4JKKA 1LWHA 4P7QA 3CO4A 2C0HA 3BSHA 1B3VA 1KGUA 3DYMA 2QPUA 3K8MA 4LX4A 1W32A 4LGXA 1VF8A 4A3HA 3W29A 1BGGA 4WSJA 1BAGA 4MPKA 1H2JA 1C90A 2ZIDA 3PZIA 4MB1A 2YIHA 2QMKA 1V6WA 1KGXA 2B31A 1UH2A 2WSKA 2DPEA 1PIFA 1GJUA 3WFZA 2EO7A 1G01A 2DEPA 4EKJA 1E55A 4UR9A 4AZGA 4HA1A 4UQDA 1Q4NX 3FHAA 3AHYA 3THCA 4D6CA 2GDVA 1EA9C 1ITCA 2YDRA 1FHLA 4MDPA 2J7BA 3NDYA 1AMYA 3BMWA 3ZOAA 2PF0A 4U3CA 3B9DA 2HVMA 4UQCA 2VVSA 4M1RA 2C7FA 1ISYA 5BXTA 2ZOXA 1ZL1A 3ZQ9A 1G1YA 3BXWA 1H0GA 3DYPA 2WMFA 4M81A 5CLTA 3CBWA 3IJ8A 1QBAA 3MKKA 4XZWA 3RMEA 1PZ3A 3VO0A 3AHXA 2WVSA 1MVYA 3I3EA 2ZXAA 2A3HA 4PTMA 3SCSA 3VGEA 1EDTA 4CU7A 5CQ1A 5D9MA 3HU7A 3WUBA 3GZAA 1ODUA 1WZLA 1FFRA 1VIWA 1CECA 3AHTA 1CGTA 3AMCA 1QHOA 4OOZA 1TA3A 1CXEA 1E1EA 2A3AA 3VNZA 4P7OA 2YLLA 1UYQA 3AZSA 1CXLA 2WKLA 4P7RA 1IV8A 2VR5A 3D3AA 3UG4A 3CZGA 4CU6A 4JFUA 2G41A 4E4PA 3SCQA 2PWFA 2DIJA 3GXIA 5M3WA 2VRJA 4DUVA 2EPMX 1V02A 2JE8A 1JXJA 1A3HA 2ZXQA 2XUCA 3K46A 3AIQA 4JCMA 5FKYA 4LYPA 3J7HA 3WDRA 2XG9A 2VX7A 1VFFA 4PMRA 4MNMA 2QF8A 2XGBA 4Z2KA 1C93A 3WIJA 5ABEA 4PMZA 1XD1A 3ZT5A 2Y8VA 3VINA 3QHNA 3EYPA 3UR8A 1W9XA 4J3UA 1E72M 5IXEA 5CGMA 1E1FA 1Q6DA 3L2MA 2G4FA 1V0MA 3WQ4A 1SR0A 2ZWYA 4UCFA 1E70M 5I2UA 1NWRA 1C8QA 2WXDM 1W1PA 4PSRA 1GHSA 2WVVA 3EDKA 1HKKA 1XSJA 1E3ZA 4W86A 4WK9A 3CH9A 4F9JA 4URIA 1DP0A 4M24A 3F5JA 4TVUA 2BY2A 1FP8A 1E4NA 1TG7A 2ESCA 2GJXB 4AEEA 4W93A 4PTWA 3VD4A 1OM0A 1KCLA 3N11A 2XVLA 2E4TA 2ZXDA 4ACYA 5JIWA 3FW6A 4W88A 3PZTA 5ABFA 4W89A 4HMEA 1OSEA 2YA2A 3NCOA 4AZIA 4OJYA 2WM0A 3ARSA 1DWIM 1MWOA 1C8YA 1WP6A 2OYMA 4HA3A 4JKMA 3S2CA 4ML4A 5A95A 2WVTA 3N15A 5DEZA 3U7VA 3VMNA 3WD2A 4CVUA 2CKSA 1E9LA 1UZ4A 3SCUA 4D6JA 2FHBA 4UFJA 4AYSA 1FH7A 3MUAA 4FMVA 4NI3A 3U7BA 3N12A 3WMBA 4QFUA 3A47A 3PZOA 2VRQA 1WAWA 3CMGA 4N0RA 2ZWZA 4TXEA 4X0VA 3SUUA 3ARUA 4D6HA 1E4MM 1V0KA 4JHOA 1NWSA 1SFSA 4QLKA 4V27A 3VIOA 1H5VA 2WMGA 2WHLA 4OUEA 4JFSA 3T0AA 4D6GA 3AIRA 1XSKA 4UQBA 3PZVA 4IPNB 2BFGA 1BPLB 3VX1A 1Q6GA 2CYGA 2X0HA 3ARTA 4HU0A 4J7RA 3A3HA 4P8XA 1JDCA 4HU8A 1BGAA 3LPOA 4Y7EA 5M03A 3W37A 1JD9A 1CTNA 1ODZA 2YKKA 5E0CA 2E3ZA 5A8PA 1JZ4A 4MNKA 4W87A 3WL1A 2CESA 2XWEA 3VIJA 4DM1A 1TVPA 2YOCA 2NT1A 3WUFA 4J3VA 2DT1A 3ZJ7A 4QLLA 2G3MA 1WCGA 1HN1A 3MANA 2Y5EA 1R87A 1CGYA 3QHOA 3AYRA 4CN1A 1W1YA 4HOWA 1JDDA 1UWQA 2F2HA 4C7FA 2IUZA 5A2BA 2WZEA 3SUSA 1VB9A 3PZGA 1E43A 4AZ7A 2ZX6A 4X0NA 2DSKA 1CBGA 2YL5A 2BY3A 1G5AA 3EDEA 2GSJA 1D2KA 1RP9A 3TTOA 3GXMA 1FHDA 3SUWA 3WH6A 1WDRA 4H41A 3WH7A 2OWWA 3FAXA 5I23A 4U2YA 1HJUA 2DDXA 4ACZA 3VIMA 3OIHA 4OBRA 4ZXLA 2YDQA 3SEPA 2QLYA 3WQVA 3DHUA 1DWFM 1UKPA 3GNPA 3EDDA 5BRQA 1QVBA 4GINA 3NUKA 3CHCA 4CKQA 3GXDA 5A8QA 1OT1A 1MW2A 3L4YA 1QNOA 1NOFA 2E8YA 2V38A 3NYDA 3SCRA 3EMZA 1PIGA 4AZCA 3BLPX 4XB3A 1FH8A 1QNRA 3BSGA 1NH6A 4TX6A 3WF2A 1QW9A 2WLYA 3MU7A 4WIWA 2FDMA 3AIUA 8CGTA 1NOWA 3DC0A 1CZ1A 3N9KA 3VD3A 3I3BA 1KQYA 2X09A 2E9BA 3CHFA 4PMNA 3PHAA 1E0VA 3FHQA 1W91A 3K4DA 4CU8A 2J7GA 3VGDA 4HOXA 1TFVA 4CN6A 3IAQA 1E6RA 4YN5A 1LL7A 2WC4A 3OZPA 2WBKA 1WB0A 3VNYA 2DSUA 1EOMA 2YA0A 4ZE5A 3T2PA 3VU2A 3CZKA 3BAIA 3ZMRA 1VEOA 2PWHA 3ARPA 2XFYA 4W5UA 2O9RA 3TP4A 2VUYA 3M07A 2X05A 1UR9A 4DWSC 2WMIB 2BV9A 1UD8A 3WQ8A 4Z2LA 5D4YA 1HJSA 4BS0A 5HXMA 3CUIA 1UH3A 2FHCA 3CTTA 4JHZA 4AD2A 1EHAA 1JAEA 1XV8A 4C7DA 4F79A 5A8NA 2XJ7A 3SCPA 1XD0A 3OLEA 3T0DA 1RH9A 3AIVA 4YHEA 3VIFA 4GQRA 4OZOA 2GJRA 3ARQA 3E1F1 1V3HA 3POCA 4NRRA 5CG0A 1UWTA 5E09A 1FFQA 1WNOA 2XTKA 2X2YA 1V0NA 1GCYA 3MSDA 3TA9A 2W5FA 5A1AA 4DWSA 2EPNA 1HF6A 2JF7A 1HNYA 4MNLA 4H7VA 1BFNA 3ZO9A 2VOTA 1S46A 2YBUA 4QP0A 3IJ7A 4D1IA 1V6UA 1PPIA 4A3YA 1TMQA 3WH5A 2GVYA 1CGXA 2XYLA 1K9FA 1HVQA 1LG1A 5JIPA 3WF3A 2XPKA 1LLOA 1OT2A 2CEQA 1MQRA 3MUZ1 4P8VA 3ZJ8A 2GUYA 1ZS2A 1EO7A 2VCCA 1UD2A 4DUWA 1V6XA 1LJYA 3POHA 3WNOA 2WMJA 4UFLA 2EXOA 4AEFA 1KFWA 3ZM8A 5A6SA 4W7VA 3NSNA 3WD1A 3IANA 4UOQA 3WBAA 1VEPA 1VJZA 1E40A 2QMJA 2WYSA 4OKDA 1X6LA 1W2PA 1TCMA 4WKAA 1I1WA 3AQUA 3AZTA 1K9TA 1KB3A 1GW1A 3OBAA 1GOIA 4GQQA 3WDIA 1JF6A 3O2LA 4AZBA 3KE0A 3PBGA 3UR7A 3AIEA 3AS2A 4AZ5A 3PTKA 3ARWA 2EPKX 1XRVA 3N13A 1HJQA 1OB0A 3BGAA 4GPNA 3L4VA 1J0JA 3GM8A 1HKIA 3EDJA 1UWUA 3IK2A 4UNIA 4AW7A 3VKKA 5CZKA 3AI0A 4PUDA 4RE4A 3THDA 4PMVA 4HZ7A 3L4UA 1IT0A 4N42A 3WEOA 2UY5A 2E0PA 2QHAA 2VR4A 1ITXA 2UWFA 1PEZA 1W1TA 1EQPA 5FL1A 3ALFA 4CD6A 2VX4A 1J9YA 1UR8A 1V6VA 2WANA 2FGLA 5EBAA 1JG9A 3AZRA 1BYDA 3W0KA 5HOSA 3ZT7A 2ZX7A 3N04A 4IISA 2WWDA 3S6TA 4BQ4A 4TTGA 4WKFA 4LYRA 2GJPA 5A6LA 1Q6FA 2ZUNA 1LL6A 1GOQA 1H41A 4PBGA 1KR0A 1SMAA 5D9NA 4U2ZA 1CGUA 1R7OA 1JFXA 1V3MA 1X6NA 1LWJA 4GO9A 1W1VA 2OSWA 2EBNA 3L4TA 2MANA 2VZUA 5HPOA 1IZJA 2VL4A 5A2AA 3CIVA 3CUFA 1R85A 1BF2A 3MUY1 1TZ7A 5A3HA 4CD5A 1BYCA 1XC6A 2YL6A 2G3JA 4FLOA 1CPUA 4ZXOA 3CLWA 4UFMA 4H8UA 3WH8A 1CXFA 3AHZA 5E70A 2HISA 4M29A 2JEPA 2PC8A 4CGTA 8A3HA 2RGMA 4S3JA 1JZ3A 1KR1A 2E9MA 1QI4A 4J27A 2VO5A 3TOPA 4B3LA 2WHMA 5I5RA 6A3HA 2X0YA 1GOWA 2IXVA 3F5KA 3WBEA 1E3XA 1DTUA 3RO8A 2J62A 1LQ0A 2FH6A 1JZ7A 3BAYA 4PRWA 3ZIZA 2WVUA 2Q8XA 1WZMA 4JAWA 5A8MA 4AISA 4JCLA 3ZSSA 4EE9A 2IXUA 2RGLA 3NJ3A 3B9AA 4GXPA 1OINA 1F4HA 2W61A 4UFHA 5AY7A 2GK1A 1MYRA 3L4ZA 3O9NA 2BHUA 2CNCA 3WQWA 3G6LA 1JI2A 4OIFA 1LL4A 2UY2A 5A6MA 4MDOA 3WY1A 4UTFA 4AWEA 1M7XA 1GORA 3VOCA 3IJ9A 4GIAA 1XYZA 4W8AA 5BXRA 1CGVA 2D0GA 3ARRA 2E40A 5FOOA 2J25A 4J3XA 4UFKA 5BROA 3PZUA 5BXPA 2ZE0A 4MAVA 1E6NA 1M04A 2OLHA 2Y2WA 4TVCA 2OYLA 3AS3A 4UZUA 4V2XA 3BCDA 3SCNA 5IHSA 2ZX8A 3II1A 5AYIA 1IZKA 3VX0A 1QNSA 3KL5A 1W9UA 2Z1SA 1B0IA 3MMWA 2J77A 1UWSA 1UWRA 3KL0A 4FK9A 4M80A 5DT5A 7A3HA 2VT0A 3AMGA 3K8KA 2WKGA 5BWFA 2ZUTA 3TTYA 4FLSA 1XYFA 3OGSA 3AOFA 3BCFA 3UCQA 2DT3A 1JDAA 1M03A 1GVYA 3SCOA 1VAHA 3AHVA 1KBBA 3PN8A 5FCZA 1OWQA 3GH5A 1CLXA 5EFDA 2XM2A 3ALGA 1H49A 3MO4A 3HN3A 4IPLA 5C71A 2WC7A 2ZUVA 3N1AA 3BLKA 3WNMA 1E15A 1BG9A 2DQXA 2JIWA 1AQMA 1VENA 1QI3A 5D8WA 5GNXA 4U5KA 2W91A 4J3SA 3VDBA 4JKLA 1H4PA 1RP8A 1GPFA 4F9DA 3U5UA 1V3IA 4TX8A 4MJ2A 3FN9A 3BC9A 1U33A 3VIKA 4DM2A 3WD0A 1BVNP 2QV4A 1J0KA 2W92A 1VBRA 4QCEA 2D0FA 1ZB5A 5I24A 1W9BM 2BXYA 1MW1A 1L8NA 3WENA 4UZSA 2ZUWA 4AD4A 3EMQA 4E8DA 3GH4A 1ZBKA 2Y8KA 2D2OA 2J7EA 2O92A 3D5HA 4PMUA 1H11A 1H0IA 5LA1A 2DGAA 3VM7A 5A94A 1KXVA 1BYAA 5D9OA 1UWIA 3WF0A 5AYBA 1WZAA 1ZJAA 2AOSA 2WNWA 5EMYA 4H8VA 4IUGA 1UZ1A 2ZICA 2Z1KA 4F66A 5IFPA 3BAXA 3GNRA 4HMDA 3AJ7A 4GZJA 4B9YA 3BAWA 4PMOA 2VZOA 1JZ6A 2TAAA 1R86A 1NARA 1G0CA 1FP9A 4AXNA 2BVTA 4KRUA 1UKOA 2PI6A 1QOXA 4P7NA 2J75A 5C8BB 1V3JA 2J7DA 3AXHA 1JYVA 2DSWA 3ZJKA 3W81A 2WHKA 2QPSA 1HJVA 4R27A 2PWGA 4L4OA 1WDQA 4GKLA 2VQUA 2GJXA 2UY3A 3ZJ6A 1XCXA 1QNPA 1B3WA 1D3CA 1BLIA 1GQKA 3VUPA 1NWUA 1NOUA 2Y4SA 4HZ6A 3WUEA 4TVDA 1BHGA 3AMDA 2G3NA 4NRSA 3K1DA 5I78A 1X1NA 4PTXA 3VD9A 2CBJA 2GDUA 4W84A 4LXFA 3GYCA 2XSBA 5HNNA 4B15A 1PJ9A 4F8XA 1HVXA 3KWXA 3DYOA 4RL3A 1CGWA 3M7SA 1GJWA 4UQEA 1OCQA 2XHYA 3WNLA 2D24A 4GZEA 3B8SA 4MB3A 1ZJBA 4W5ZA 1W9PA 1QHZA 5FD0A 5LA2A 2OYKA 1MXDA 3CMJA 4NSBA 3RJYA 1LF1A 4JFVA 2JFEX 1F4AA 1MQPA 3AS0A 1E6XM 3L2LA 2DT2A 1R8LA 1ISXA 3PZ9A 1M01A 3PZNA 4RE2A 1Q6EA 2WK2A 3OB8A 3RM4A 5BRPA 3AMLA 3AFBA 1M53A 5GNZA 1C3FA 4GI6A 4BF7A 3AIBA 4MJ4A 1JAKA 3CUHA 1UR4A 1UUQA 2D23A 1SYTA 1CEOA 4AZHA 5HPCA 2WBGA 1V08A 3N18A 3T08A 1WZKA 4A4AA 1JGIA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2XWD A;  3W6M A;  2GK1 B;  2G8Z A;  1ZBC A;  2XFR A;  1VJS A;  3QR3 A;  3W26 A;  3VTR A;  1J0H A;  3QOK A;  3WNP A;  2XIB A;  1MFU A;  4CD7 A;  2X1I A;  1QI5 A;  5JBD A;  4JFT A;  1G9H A;  1E6Q M;  4JKK A;  1LWH A;  4P7Q A;  3CO4 A;  2C0H A;  3BSH A;  1B3V A;  1KGU A;  3DYM A;  2QPU A;  3K8M A;  4LX4 A;  1W32 A;  4LGX A;  1VF8 A;  4A3H A;  3W29 A;  1BGG A;  4WSJ A;  1BAG A;  4MPK A;  1H2J A;  1C90 A;  2ZID A;  3PZI A;  4MB1 A;  2YIH A;  2QMK A;  1V6W A;  1KGX A;  2B31 A;  1UH2 A;  2WSK A;  2DPE A;  1PIF A;  1GJU A;  3WFZ A;  2EO7 A;  1G01 A;  2DEP A;  4EKJ A;  1E55 A;  4UR9 A;  4AZG A;  4HA1 A;  4UQD A;  1Q4N X;  3FHA A;  3AHY A;  3THC A;  4D6C A;  2GDV A;  1EA9 C;  1ITC A;  2YDR A;  1FHL A;  4MDP A;  2J7B A;  3NDY A;  1AMY A;  3BMW A;  3ZOA A;  2PF0 A;  4U3C A;  3B9D A;  2HVM A;  4UQC A;  2VVS A;  4M1R A;  2C7F A;  1ISY A;  5BXT A;  2ZOX A;  1ZL1 A;  3ZQ9 A;  1G1Y A;  3BXW A;  1H0G A;  3DYP A;  2WMF A;  4M81 A;  5CLT A;  3CBW A;  3IJ8 A;  1QBA A;  3MKK A;  4XZW A;  3RME A;  1PZ3 A;  3VO0 A;  3AHX A;  2WVS A;  1MVY A;  3I3E A;  2ZXA A;  2A3H A;  4PTM A;  3SCS A;  3VGE A;  1EDT A;  4CU7 A;  5CQ1 A;  5D9M A;  3HU7 A;  3WUB A;  3GZA A;  1ODU A;  1WZL A;  1FFR A;  1VIW A;  1CEC A;  3AHT A;  1CGT A;  3AMC A;  1QHO A;  4OOZ A;  1TA3 A;  1CXE A;  1E1E A;  2A3A A;  3VNZ A;  4P7O A;  2YLL A;  1UYQ A;  3AZS A;  1CXL A;  2WKL A;  4P7R A;  1IV8 A;  2VR5 A;  3D3A A;  3UG4 A;  3CZG A;  4CU6 A;  4JFU A;  2G41 A;  4E4P A;  3SCQ A;  2PWF A;  2DIJ A;  3GXI A;  5M3W A;  2VRJ A;  4DUV A;  2EPM X;  1V02 A;  2JE8 A;  1JXJ A;  1A3H A;  2ZXQ A;  2XUC A;  3K46 A;  3AIQ A;  4JCM A;  5FKY A;  4LYP A;  3J7H A;  3WDR A;  2XG9 A;  2VX7 A;  1VFF A;  4PMR A;  4MNM A;  2QF8 A;  2XGB A;  4Z2K A;  1C93 A;  3WIJ A;  5ABE A;  4PMZ A;  1XD1 A;  3ZT5 A;  2Y8V A;  3VIN A;  3QHN A;  3EYP A;  3UR8 A;  1W9X A;  4J3U A;  1E72 M;  5IXE A;  5CGM A;  1E1F A;  1Q6D A;  3L2M A;  2G4F A;  1V0M A;  3WQ4 A;  1SR0 A;  2ZWY A;  4UCF A;  1E70 M;  5I2U A;  1NWR A;  1C8Q A;  2WXD M;  1W1P A;  4PSR A;  1GHS A;  2WVV A;  3EDK A;  1HKK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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