The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
68
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structure length |
68
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Chain Sequence |
PFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGMDYWIVKNSWGTGWGENGYFRIRRGTDECAIESIAVAATPIPKL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase
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| molecule keywords |
DIPEPTIDYL PEPTIDASE 1 EXCLUSION DOMAIN CHAIN
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| publication title |
Cathepsin C Inhibitors: Property Optimization and Identification of a Clinical Candidate.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
7
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| structure length |
68
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| sequence length |
68
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| chains with identical sequence |
F
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| ec nomenclature |
ec
3.4.14.1: Dipeptidyl-peptidase I. |
| pdb deposition date | 2013-10-31 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) | Cysteine proteinases. Chain C |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4CDF C; 2DJF C; 1ICF B; 4CDC C; 4CDD C; 4OEM B; 4CDE C; 2DJG C; 1K3B C; 4OEL B; 1MHW C; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DGY A; 3E3X A; 1SEB D; 3GTG H; 5IYC G; 4A3K H; 4K2K A; 2AQ2 B; 3K5M A; 4HJ8 A; 2RSO A; 3DEO A; 1STB A; 4B3M Q; 4K5W A; 5C5L A; 1IYV A; 3Q23 A; 2RQX A; 4P72 A; 2PCF B; 2TSS A; 3OWE B; 1SDF A; 5JVG 3; 4LFB L; 3EN2 A; 1CQV A; 3URY A; 3TZD A; 1WCM G; 2GA4 B; 3GTG B; 4A3K B; 1HR0 W; 1UEB A; 1PH5 A; 1UE7 A; 4DFA A; 5C0X J; 2PO4 A; 5K5P A; 2BOS A; 1HZA A; 2PMZ B; 5ELO A; 1LV9 A; 5JJL A; 2K50 A; 2E75 C; 5D3D A; 1BR9 A; 2K52 A; 4G7O C; 5I2Y A; 2F4V L; 1PYS B; 4MNO A; 4DV7 L; 1LAC A; 4OON A; 1PFN A; 1LTL A; 2MPM A; 1SNQ A; 4R4T A; 3I3C A; 4DUY Q; 4FF2 A; 2K5N A; 1FGU A; 1D5M C; 5E4X A; 3R93 A; 3R3O A; 5LMN Q; 1KAB A; 1S5D D; 2Y0S B; 2KEN A; 1FYC A; 4BBR H; 3A56 A; 4XT1 B; 2WAQ G; 1D7Q A; 4DV5 L; 4X64 L; 2L55 A; 2PZW A; 4DAY A; 3GQB A; 2CCZ A; 1KDC A; 5E3F A; 1MJC A; 3IKJ A; 4A3E H; 1J8I A; 4BBR B; 1H9K A; 1KHI A; 4GNX B; 1AFP A; 1HH2 P; 3T1Y Q; 2F0U A; 4Y7N H; 4YIJ A; 4RH6 A; 3CC7 A; 1UEA B; 1W6K A; 1B3A A; 2MFI A; 1I4X A; 3NEM A; 5EBD A; 4A3E B; 2NBF A; 5M3F H; 2A5H A; 1JIC A; 2YTX A; 2MJ8 A; 4OIJ A; 1N36 L; 1E2W A; 2NTT A; 1VQK A; 4Y7N B; 3TRE A; 4LF9 L; 4IUP A; 1J5E Q; 2NYZ D; 2OTL A; 4ZYS A; 1WTV A; 1PFB A; 1NMG A; 5IGC A; 1VQP A; 4X64 Q; 2R7F A; 2A69 D; 5M3F B; 2BE5 D; 5ELE A; 1JC7 A; 3J81 L; 1PZI D; 3S24 A; 3MFG A; 3W2D A; 4IFD H; 1Y1W H; 1VMC A; 2KHS A; 1OO9 B; 3ULP A; 5C4Z A; 1GUW A; 2I5M X; 1PZJ D; 2Z8L A; 3OIQ A; 2WV6 D; 4KKU A; 1HA5 A; 1CUK A; 2BDN A; 3C3L A; 3U9S A; 1HUM A; 1QVG A; 2DY7 A; 2PZT A; 1D8L A; 2BH8 A; 2KBN A; 2C9O A; 4DAV A; 1PH9 A; 1Y1W B; 2R92 G; 1JCK B; 4DF7 A; 3KF8 B; 3CF5 A; 4C2M H; 3CCQ A; 3TP6 A; 1A0I A; 1KAW A; 4X62 L; 4L5R C; 2HQL A; 3HOX G; 4LJZ C; 3S1M H; 2OCE A; 1KLG D; 3T51 B; 4YY3 Q; 4LF9 Q; 1I4G A; 4FF4 A; 1SE2 A; 3K80 C; 1ESF A; 1X6O A; 1A2U A; 1B44 D; 3JAM E; 1YNN D; 3CAM A; 4ZKC B; 1EIF A; 2O2L D; 5C6A A; 1FVI A; 2CW0 D; 4C2M B; 4F87 A; 2FXQ A; 3KF6 B; 3F8T A; 5D14 A; 2NTS A; 4RKL A; 3CCJ A; 3S1M B; 1V1P A; 1B7Y B; 3C1F A; 4BY1 H; 4JBK A; 2DJG C; 4R4O A; 3OW2 A; 1WJJ A; 4A3D H; 1E24 A; 1K8A C; 2JE6 I; 2NZ1 D; 2QGQ A; 1V43 A; 4UP9 A; 1X56 A; 3S2D H; 1XYI A; 3NPP A; 1ENA A; 1LT6 D; 2OWO A; 4UY8 C; 1LM0 A; 1RL2 A; 3RN2 A; 4BY1 B; 1VQ4 A; 3FDT A; 3U4V A; 1SFO H; 4OL7 A; 1PTO F; 4JW0 A; 4WJ3 M; 4FXK C; 2XGT A; 1VQI A; 3A8K E; 4JI0 Q; 4A3D B; 3N6R A; 3SK8 A; 2Q2H A; 1P16 A; 1SNP A; 1STN A; 3S2D B; 1GO3 E; 3OTO Q; 4FO2 A; 2IL8 A; 4KD3 A; 3QR8 A; 4H7B A; 4RFB A; 5LL6 X; 1MJE A; 4Y52 H; 2CH4 W; 2A6H D; 2UUC L; 1NE3 A; 1MD2 D; 4NB3 A; 2P5Z X; 1SFO B; 3RD4 A; 1CZG A; 1XPO A; 5C44 H; 1BQQ T; 1M90 C; 4DNI A; 1SRO A; 2R7Z B; 3CD6 A; 2NN6 I; 1CI3 M; 3PSI A; 4DV0 Q; 3HOV H; 1XPR A; 2JA8 H; 2IWH A; 1O7Z A; 1WI5 A; 2V4D A; 1I4H A; 2EYL A; 1J9O A; 2I0Q A; 3O13 A; 4G57 A; 3PIO 3; 1G6Z A; 4IFD G; 5C44 B; 4AYB E; 5ELB A; 1YJW A; 3E0J A; 5GQO A; 1QJO A; 4LF4 Q; 4HSV A; 2B2T C; 1PHJ A; 4HIM A; 3HOV B; 4KY7 A; 1I4P A; 2F0H A; 2C35 B; 3KK7 A; 1KDA A; 4L8J A; 1NR2 A; 4PMC A; 1KRT A; 3S1N H; 2F0T A; 2ES2 A; 2Z6K C; 5CV8 A; 2OTJ A; 2AUK A; 1G2T A; 3E6Z X; 5FO7 B; 1WTH A; 5JOB A; 1VCI A; 3PUZ A; 2K6A A; 2KEC A; 4X66 L; 3J80 L; 1LTB D; 3PCO B; 4JI1 Q; 3D8G A; 4KLK A; 3S1N B; 3FEW X; 1HNW L; 5GRO A; 1EY6 A; 2MO0 A; 1KLU D; 2CQA A; 5FJ8 H; 1E0B A; 4KN4 C; 3CCU A; 4UP8 A; 5IE8 A; 1N32 L; 1EWH A; 2HHH Q; 2LFN A; 3TN2 A; 3GDE A; 4FF1 A; 3FPU B; 5H1S E; 1EQV A; 1PH4 A; 4GKJ L; 4EQO A; 4H02 A; 4TRD A; 4GLX A; 3GTP H; 1QB5 D; 4AYB G; 1JWS D; 2AQ3 B; 2D0O A; 3P1H A; 1IW7 D; 2L4N A; 1PH7 A; 4IUV A; 4NXN Q; 2HIV A; 1ROD A; 1T5E A; 1DOL A; 5I6W A; 2B8G A; 2D62 A; 2PQA B; 2O4X A; 4IUN A; 2QW7 A; 3HFZ B; 3J81 i; 4JYA L; 4DR7 Q; 3IFD A; 1G2S A; 3NTI A; 3GTP B; 4LMQ D; 3E5S A; 1CHQ D; 3IFT A; 4GS3 A; 4DV4 Q; 4FXD A; 2KJX A; 5FLX L; 4OX9 L; 1HZB A; 4YWL A; 4IOC A; 5C0X H; 1K3B C; 5C4X H; 5EPK A; 2IW3 A; 3LWU A; 2RVL A; 4BBS H; 3IRB A; 1IBK Q; 4BY7 G; 5C44 G; 3J81 j; 2EYH A; 4GOP A; 1II3 A; 4A93 H; 1FGB D; 4WOR A; 3VR6 A; 2A68 C; 3BYY B; 2JA8 G; 5C4X B; 2R93 H; 4AQY Q; 4DV3 L; 1H9R A; 2M00 A; 3MAQ A; 4H13 C; 4NPS A; 4POG A; 4BBS B; 4A3L H; 2F0J A; 2NVQ H; 1SE8 A; 1BDO A; 3NWS A; 3K0Y A; 1U4R A; 4A93 B; 3BZC A; 5I6Y A; 3MVV A; 4F7X A; 1H9M A; 1SNM A; 4X6A H; 4A3G H; 2R93 B; 2YV5 A; 2ICI A; 1IL8 A; 4QF4 A; 2WII B; 4KKT A; 5HGQ A; 2NVQ B; 3G7L A; 3SDZ A; 3V96 A; 2CW0 C; 3FPP A; 1ZKO A; 3MXP A; 5M5Y H; 2RHQ B; 1Z47 A; 1BBX C; 1PRT C; 2WP8 J; 2VUM G; 2WB1 G; 4A3G B; 1MSG A; 4N9P A; 2DN8 A; 1Y8N B; 2LKV A; 2SNM A; 2CH4 A; 1YHB A; 1VS0 A; 2R3Z A; 4CKB A; 2B2Y C; 2B39 A; 1Z9F A; 5M5Y B; 3KJO A; 1EZ8 A; 4X3K A; 3G6J B; 4ZAI A; 2KCN A; 3S1R H; 2E8G A; 5CYU A; 1Q1B A; 2F0G A; 4JOI A; 4JI6 L; 5EGT A; 3CP0 A; 1HFG A; 2MNA A; 2LS0 1; 3S1Q H; 4OO1 I; 3RR5 A; 3TEH B; 3BVM A; 4DNT B; 1GOZ A; 1T9H A; 3S1R B; 4P73 A; 3C1E A; 1JR0 D; 1HQR D; 2JA5 H; 2RHS B; 2ZM6 Q; 3TZU A; 4ZLT F; 1S5B D; 1BOS A; 2A6H C; 2QIL A; 4O42 A; 4A76 A; 3AFQ A; 2E5L L; 2I07 B; 2Z4I A; 4GLA C; 3H15 A; 4DV1 L; 5IIF A; 5IT9 E; 1SAP A; 3S1Q B; 4BXX H; 2EY1 A; 3NWT A; 3S14 H; 5DAU A; 4H44 C; 3SXH A; 2N55 A; 3M7G A; 3I2Z A; 4M1U B; 5FLM H; 1P8L A; 5FO8 B; 5TSS A; 5JEA J; 2JA5 B; 1A3U A; 3NBH B; 1T5X D; 1SYB A; 1W2B A; 4MIU A; 4KN7 C; 3TP5 A; 2ZTE A; 5IP9 H; 5EKK A; 4JPB W; 3T4A C; 5IGD A; 2JJQ A; 2R6G A; 5DEH A; 4N9T A; 3CHB D; 3S14 B; 1NMF A; 4PZ7 A; 5COY A; 1QG7 A; 3AEV A; 4LUV A; 5CR3 A; 4DR4 Q; 2IHF A; 5I9P A; 1X3F A; 1U4P A; 1OXV A; 1EFI D; 4NDX A; 4DU9 A; 3M9B A; 4DN4 M; 2AWO A; 1Y8P B; 3FKI G; 3J80 i; 3QWN A; 4B3S Q; 3KLS A; 1FNV A; 2M9V A; 5KNC A; 1D2B A; 4XXE A; 1XJV A; 4K14 A; 4B3T L; 3DWA A; 1X3G A; 1EY7 A; 3RLN A; 3H3V C; 2OEO A; 2N3S A; 3CC2 A; 1V1P B; 1WCM H; 5F2D A; 1L1O C; 1EIH A; 4LF8 Q; 4LF5 Q; 2EJG C; 3BS1 A; 1E1O A; 2KCC A; 2ZTD A; 3D4W A; 1JWM D; 3VA5 A; 2UXB L; 3S9W A; 1RHP A; 3GTM H; 3M85 A; 3HOY G; 4DK1 A; 1ONL A; 2KUM A; 2NZH A; 2QEJ C; 2D5D A; 3BDC A; 4PZ6 A; 3MWY W; 4A3M G; 4CJ0 B; 4X65 Q; 3CPW A; 3HZX A; 1WCM B; 1EYD A; 2IX1 A; 1S5C D; 3DEP A; 4K2L A; 3K0X A; 2QCP X; 5M5W H; 4OWX B; 1I4R A; 2MO1 A; 3GTM B; 5BN3 A; 4GKK L; 4L6T B; 1WTQ A; 1HNX L; 3PUY A; 3CRL C; 1VQC A; 1ML0 D; 1TWH H; 1YEZ A; 1XNR L; 1A2T A; 2K14 A; 3DHQ A; 5IOD A; 3BDO A; 1F2M A; 4RGM A; 5M5W B; 1XMQ Q; 4DR3 Q; 1HRJ A; 4IFD I; 2KVM A; 2B2W A; 1WTW A; 5IYD G; 2UXB Q; 3A8J E; 1K8M A; 1C7Y A; 1LT4 D; 2WAQ B; 1PVO A; 1JE5 A; 4IOA A; 3PUW A; 1TWF H; 5JAV A; 1TWH B; 4B3M L; 1Z7T A; 2JA9 A; 2TMP A; 4HCS A; 1QNK A; 4RGO S; 1VQ7 A; 4MZ9 A; 3I91 A; 3VDY A; 3BVZ A; 3I4M G; 3KDF A; 5M5X H; 3QOL A; 2AQ1 B; 1TS4 A; 1E22 A; 4PZ8 A; 1B70 B; 1B9M A; 1KRS A; 1TWF B; 1PH8 A; 1E7Z A; 2JP1 A; 3Q6S A; 1OXS C; 5CV5 A; 1JWU D; 3OSO A; 1HCZ A; 3NK9 A; 4JI7 Q; 5M5X B; 1XNR Q; 1WOC A; 4LAA A; 1B53 A; 2ATW A; 2BA0 A; 4C3J G; 1F2L A; 4CDC C; 4Q5V A; 4P75 A; 4HCE A; 4DUY L; 3K6O A; 2O5I C; 1AE2 A; 2IPK D; 2LXK A; 5LMN L; 3OPO A; 1Q3L A; 2NWG A; 4RHS A; 4JI2 Q; 1C8C A; 3NTK A; 4Q0F A; 1WD0 A; 2N78 A; 1B50 A; 3QB3 A; 5A2Q L; 1JOO A; 3P7J A; 1EEI D; 2R92 H; 3IAY A; 4ZUJ A; 1SYE A; 2QA4 A; 4XQJ A; 5GAG C; 4JV5 Q; 5CBE E; 1VQO A; 4B3R Q; 3HOX H; 2EXZ A; 1C48 A; 3I8Z A; 1Q7Y C; 3M7N A; 1OXX K; 1STA A; 2IY5 B; 2OF1 A; 3DLL A; 3T1Y L; 4A3I G; 2JN4 A; 1BKB A; 3K58 A; 2R92 B; 2EJF C; 3CME A; 2YYZ A; 2VZA A; 1R4Q B; 5IT9 c; 1HR0 Q; 2F0V A; 3GTQ H; 3HOX B; 3NQI A; 4PV1 C; 3MTS A; 4U67 3; 2JYO A; 3ERQ A; 3I70 A; 4PMB A; 1PH6 A; 2EOT A; 1J5E L; 3STB C; 2VNU D; 1EY9 A; 5LMN W; 4ZKB B; 2QDL A; 3EFX D; 4FYD A; 4HMI A; 1K9M C; 1PMR A; 3GTQ B; 1EUJ A; 1YI2 A; 5FKA C; 5C4H A; 1DOK A; 3A5Z B; 1JOQ A; 4DV6 Q; 4GOP B; 1B8A A; 4LW1 A; 1NSN S; 3G48 A; 4KJN A; 3HGB A; 1QOH A; 1LYL A; 3LWE A; 5I2X A; 1AH9 A; 2NVT H; 4LUZ A; 2G9D A; 3EBE A; 3T1H Q; 4GN4 B; 1ET6 A; 1ASZ A; 3HP3 A; 1ICW A; 3LX0 A; 2DNC A; 1G8Z D; 4QUF A; 4EX5 A; 3NSW A; 2UXD Q; 4HMJ A; 1FJG Q; 1EL0 A; 3P20 A; 3D0F A; 2WKD A; 4YY3 L; 1Q8I A; 3AU7 A; 2NVT B; 3F1Z A; 4GLV B; 4WRD A; 1EYG A; 2FFK B; 3PGZ A; 2EYO A; 4S3S A; 4XQN A; 1HTP A; 2RCN A; 2F0I A; 2QDB A; 1LLR D; 1A63 A; 2RA4 A; 3F2U A; 2KHJ A; 4K5V A; 3H6M A; 1GD7 A; 2VB3 X; 5KEE A; 3J81 E; 3NBH A; 3HRZ C; 3CCS A; 1LTI D; 1VQ6 A; 5JPM C; 2K5H A; 4F8M A; 4KHZ A; 1RCV D; 2F0E A; 3EJI A; 2VL6 A; 2UXC L; 2Z1C A; 1A8V A; 2A68 D; 3DXJ C; 4KY6 A; 5CV7 A; 5ELF A; 2L15 A; 1QUQ A; 5T1I A; 3SHL A; 2PZU A; 1QVC A; 1TWA H; 2SOB A; 3T53 B; 3GD7 A; 2NVX H; 3R8B A; 1Q12 A; 2EYF A; 4YWM A; 1STH A; 2Q8R E; 1N33 Q; 2JXM B; 2K7V A; 1CA6 A; 1SND A; 1OXU A; 4JI0 L; 1PYW D; 5E4W C; 2PI2 A; 1SNC A; 4F88 A; 2B63 G; 3OTO L; 2K5Q A; 5EPJ A; 1TWA B; 2BDO A; 5C0X I; 2NVX B; 1VQ9 A; 2E2I H; 2B2V C; 4E6I A; 4R9W A; 3VYS A; 2MHV A; 4OEL B; 1W6J A; 2O5J C; 3CQZ H; 1VMP A; 4JCV E; 4YHH Q; 1PRT D; 1X32 A; 1GHJ A; 1HPC A; 1A6X A; 1WFQ A; 1I4Q A; 4IPG A; 3WOF A; 1CKN A; 1MI2 A; 1H9S A; 4OIK A; 3G6E A; 3ZYY X; 2JA7 G; 2UXC Q; 1X3P A; 4DV0 L; 1SXT A; 5JJI A; 2EDG A; 1CSP A; 4POF A; 3CQZ B; 5J39 A; 3EIV A; 1OTC A; 3LGJ A; 1NR4 A; 1C4Q A; 5ISR A; 4HJ7 A; 1N34 Q; 3BZD B; 1TWC H; 2RKS A; 3SR1 A; 3K59 A; 1EOV A; 4I7Z C; 4LF4 L; 1DOM A; 1X3Q A; 1WD1 A; 3BZK A; 3H09 A; 4G4K A; 4AYB B; 4DA2 A; 2UUA Q; 3A7L A; 3CXC A; 1HNZ Q; 1B4O A; 1SJE D; 1TWC B; 1VQM A; 2F3W A; 2KHI A; 1EFW A; 4OWW B; 1QZH A; 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