4CJ7A

Structure of crenactin, an archeal actin-like protein
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
426
structure length
426
Chain Sequence
SDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords ACTIN/ACTIN FAMILY PROTEIN
publication title Crenactin from Pyrobaculum Calidifontis is Closely Related to Actin in Structure and Forms Steep Helical Filaments.
pubmed doi rcsb
source organism Pyrobaculum calidifontis
total genus 105
structure length 426
sequence length 426
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cj7A01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cj7A02
2V7ZA 2GEMA 4CZJA 1QQOA 5KQ8A 4BRHA 4IWVA 4IXCA 1TYQA 3ZEUB 4FWSA 3A5OC 4RCHA 5EOYA 5AQOA 3DXMA 3U9DA 1V4SA 4L3QA 5AQIA 3CJBA 5E26A 4BRNA 3IDHA 2YHWA 3GBTA 1MWKA 2IVOA 1KXPA 3O1BA 1JCEA 1QZ6A 5BREA 1LCUA 3UKUB 5EX5A 4AM6A 2NLXA 3FZFA 3QBWA 3L4IA 3WEEA 3SMPA 4BRDA 4B1WB 4EFHA 4CZKA 2A41A 3RSEB 3VEZA 5BN8A 4CZFA 4KBOA 2FSNA 3WXKA 5BN9A 2D4WA 3GDQA 4B1VA 1BWFO 5F2RA 2E88A 4NO7A 5AQSA 1GLAG 2IVPA 3VEWA 1YXQA 4BC3A 2HF3A 3MMVA 1BO5O 1HPMA 1R59O 3AY9A 2VYPA 3LDOA 4CD1A 3GOIA 4FWNA 1QQNA 2VCPA 4EHUA 1EQYA 4JD2A 3LL3A 3EZWA 1QQMA 5AQGA 1ZXOA 2E1ZA 2HMPA 5ADXH 3UE5A 3QDKA 2P9PA 3CHWA 1U2VB 4K43A 4A62A 4C23A 3WT0A 3FFKB 2W40A 5AQRA 1X9JA 3O6WA 5JLFA 1YVNA 3BP8A 3BF1A 3VF4A 4B1ZA 3ENHA 4JN4A 4FO0A 5AQPA 1MDUB 1TUUA 3CIPA 4BRFA 1WUAA 5BR9A 3FE1A 1T44A 2Q0RA 5BPNA 3D2FA 5AQHA 1Z6RA 3WQUA 2FF6A 2P9IB 1XQSC 2CGKA 4WQ5C 4XH5A 5FPMA 3MCPA 1IG8A 3VETA 5AFUH 2E2PA 3B8AX 2YCHA 3H1VX 1NLVA 2Q2RA 3R6MA 5EXWA 3MN5A 4PKGA 5AZIA 2FLOA 4HTLA 4FWMA 4ISGA 4BRMA 3UKUA 3HTVA 1G99A 5EVZA 4BRQA 2GWKA 4BGAA 3SMSA 3QMLA 4H0VB 1E4GT 3SK3A 2GWJA 5KPRA 2E20A 4F9OA 3H1QA 2I7PA 5F1XA 4HWIA 5FPDA 2WUSA 5JICA 1SAZA 4O5FA 1LOTB 3ZX2A 4BG8A 3O80A 2W41A 3IFRA 1MWMA 1P8ZA 5AQKA 3CQYA 4B9QA 4FWLA 4CBUA 4MLHA 3GG4A 4DCHA 4CD3A 1U2VA 3HBTA 3MDQA 2P9UB 3BF3A 4BRKA 3A0IX 3H45C 4FOIA 4FPBA 3H3NO 4WQ4A 4Z94A 3IMXA 5AQMA 4BVPA 1HUXA 3D7EO 3MN6A 3UB5A 3VEXA 3CETA 1HJOA 2ASPA 1RGIA 2HOEA 4H5WA 1S3XA 4A2AA 2P9IA 5AZIB 4QS7A 1NGFA 3TPQA 4FWOA 2OANA 1BA1A 1BDGA 4WQ5A 5AQUA 1NM1A 3ID8A 1WOQA 2UYTA 3VGLA 3H46O 5I9EB 1DGKN 2A42A 3I33A 3FZHA 3CQXA 4A2BA 2D1KA 3VESA 4BGBA 1H1VA 1NGJA 4K25A 4RTFD 2P9NA 3LDQA 3R8EA 2AA4A 1NWKA 2YJFA 3C0BA 4PKIA 4FWRA 4DHYA 1ESVA 1K8KA 2GUPA 3M1FA 3H6EA 4BR2A 5ADXA 4IO8A 3SJHA 5JLHA 3AAQA 3EKSA 2E2QA 3VEYA 1RFQA 3A5LC 4BQLA 3C7NA 4MLEA 3CJCA 4PL7A 4BR0A 1QZ5A 4CBXA 3LDNA 3JS6A 2F9TA 4WYBA 3CI5A 5ELZA 2E2OA 3HSCA 4J8FA 1DEJA 3AAPA 4H0OA 3ENOA 2QWMA 5AQZA 1NGAA 3FZMA 4EAHD 3HI0A 3BEXA 2QM1A 4BRAA 4WQ4C 1HKCA 4XH4A 4BR9A 2QWQA 3EKUA 3QFPA 2P9UA 1GLEG 2PBDA 3MN7A 4M7YA 3CJ7A 5AQTA 2Q36A 2NZTA 1ATSA 3EL2A 3L6QA 4BRCA 1J6ZA 2A3ZA 2QWOA 4MO4A 4CZIA 5TKYA 3OHRA 2P9LB 3O4WA 4BR5A 4CZLA 1TUYA 4ISFA 1KAXA 4M7XA 4EIAA 2QWLA 1QHAA 4E1JA 2V51B 3VF2A 3CERA 1NGEA 3BUZB 2P9NB 3F9MA 2YHYA 1RDWX 4H5NA 1K8KB 5AQQA 2A5XA 3IUCA 2E1YA 2IIRA 3ULEA 5AQFA 3R9PA 2ZGZA 4FWQA 1S22A 2PAVA 3WXJA 4BR4A 3KHYA 1HKGA 4YDUA 3C7NB 5AQJA 4CZGA 2E2NA 2A40A 1ATRA 3LM9A 1Z05A 4FWPA 1U6ZA 4AM7A 2FSJA 5JMVA 4K41A 2GELA 3O5BA 5AQVA 3S41A 4BRGA 1DKGD 5AZJA 5KPZA 2CGJA 3GE1A 2P9KB 4A61A 3D2EB 5AR0A 1GLLO 3DAWA 4BRPA 3HZ6A 4H5RA 3HM8A 3A5MC 1NBWA 1ZC6A 3DWLA 4JHDA 4FL9A 3QB0A 4XH1A 2H3GX 1XUPO 2EWSA 2IVNA 2ZF5O 3FR0A 3VGKA 4FWKA 2P9SB 3ZETA 4RWTA 1KAZA 4B1XB 1BU6O 4M63C 3ZX3A 1NGGA 3W3DA 4EHTA 3AARA 5FPNA 4O8KA 2HF4A 1X3MA 3EN9A 5LJWA 4BC5A 1Q18A 2CH6A 2P9LA 3UKRA 3ATUA 3O1WA 4BQZA 3O08A 3VF6A 3JXUA 4BR7A 3U4LA 4JAXA 3DJCA 3O8MA 1SZ2A 1NGHA 3ULEB 4JNEA 3U9ZA 5LY3A 5LJVA 5FPEA 3FZKA 2CGLA 3VPZA 1KAYA 4H5TA 3CJAA 4BREA 1GLJO 5F0XA 4YDUC 3MK6A 2NRHA 3L0QA 3FZLA 5AQLA 4B1YB 3MN9A 4NB4A 2ZWHA 1YUWA 1NGBA 2E8AA 1NGDA 4BRLA 3FGUA 4BG9A 1GLBG 2VWBA 3DXKB 4CJ7A 2QWPA 5AZJB 3KVGA 5BRFA 3CJ9A 4BROA 2ZGYA 5AQWA 3CJ1A 4K42A 4PL8A 5E84A 4JHDB 1T6DA 2ASOA 2P9KA 3D2EA 2YHXA 3VENA 4CZHA 2F9WA 1D4XA 1JCGA 5BRDA 3ZETB 4CI6A 4I6MB 3H3OB 5AFUA 2AP1A 3M6GA 3J8AA 4FSVA 1E4FT 3M3ZA 1NGIA 2V7YA 4BVOA 2I7NA 4MO5A 2A6AA 2P9SA 4IJAA 1NMDA 4CZEA 3VERA 3UKRB 2FXUA 4DQ8A 3QFUA 3WXLA 1CZAN 1C0GA 3KZBA 3U8XA 2ASMA 3WQTA 2ITMA 2Q0UA 2V52B 2QWRA 4GY2B 4B1UB 1GLDG 1TYQB 2FSKA 3VOVA 1HLUA 1IJJA 3DXMB 4CZMA 3WUHA 4QS8A 5KQDA 3A5NC 5B8HA 3I8BA 1NGCA 4H0XB 1YAGA 3QBXA 3LM2A 3ZEUA 1SQKA 3P4IA 1GLFO 4Y0WA 3SLCA 3WEEB 1ATNA 4GNIA 2GTDA 4H03B 2KHOA 3QICA 3W0LA 2D0PA 5BRHA 1ZBSA 2Q31A 3DXKA 3FLCO 1OKJA 1BUPA 4FPAA 1T6CA 4LC9B 3RSEA 1BA0A 4H0PA 2DPNA 2YJEA 2YI1A 1C0FA 2QW9A 3GL1A 4ISEA 2FF3B 4BC4A 3ZX0A 2Q97A 3TU5A 3EO3A 4BC2A 2CH5A 4JD2B 5AQYA 1XC3A 3LDPA 2QXLA 1V4TA 1MA9B 5BPMA 3LDLA 2P9PB 4IJNA 2BUPA 5EY4A 1BOTO 2J4RA 3A8YA 4I6MA 4DB3A 5CE3A 4H0YB 4QS9A 4XEIA 3VEVA 5KPTA 1X3NA 1Y64A 3WXIA 2D0OA 4H0TB 1BG3A 4CBWA 3ATVA 2QWNA 1HX1A 2Q1NA 4BRIA 3VGMA 3VEOA 4FOEA 1GLCG 4H5VA 1HKBA 1JCFA 5AQNA 5AQXA 4PKHA 5BPLA 3D2FB 2BTFA 3G25A 4IZ9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MEEA 3CXCM 2GEMA 3VQCA 1YI2N 4IWVA 3DLRA 2OTJN 1TYQA 3ZEUB 1TAQA 4FWSA 3CF5L 1K73O 1V4SA 3O4QA 1K6YA 3AVBA 4BRNA 4FJLA 2YHWA 3VQEA 4K8ZA 5HROA 1JCEA 1QZ6A 4X62K 5EX5A 2XHBA 4EFHA 5HRSA 1NG9A 5BN8A 1TL3A 3D0PA 2ZJQL 4B9NA 3K5MA 4JK9A 1NKBA 3ZT2A 2E88A 1QHTA 3K9JA 4F3TA 2IVPA 1BO5O 3LP3A 3J80O 4W5TA 3CCQN 2OPPA 4NCGA 2VYPA 4DR4K 4BE0A 3OBYA 2O8DB 4W5NA 1ASWA 4JD2A 3EZWA 4FVMA 4C1NI 1KCFA 1ZXOA 2E1ZA 2HMPA 3HXMA 1NNEA 4A5BA 2WOMA 4YOXA 1VSKA 3B6OA 3QDKA 2P9PA 3CHWA 1Z26A 5GADP 2KTQA 2O4IA 4FJ5A 1C0UA 5AQRA 4O55A 3O6WA 2QA4N 2LSNA 5KRSA 4O8UA 4B1ZA 4JN4A 1MDUB 2VG6A 2NRVA 1NJWA 4DKWA 3SQ1A 4DS4A 3FE1A 3D2FA 3QEIA 2I5JA 3K9KA 5C42A 3PY8A 4M3XA 5T7BA 2CGKA 4WQ5C 4XH5A 4KHUA 1IG8A 3ULDA 3OYMA 3MXJA 2YNIA 4KKOA 1LW0A 1D8YA 3TAQA 3NVKA 3VQ6A 1UAXA 2IS3A 5CZ1A 2WTUA 4BRMA 3UKUA 5SZTA 4DTRA 4B08A 3TTFA 3AVLA 2GWKA 1JLEA 1U48A 3CPEA 3SK3A 1B92A 3ZSZA 4F9OA 5F1XA 4CF2A 4LFAK 4O5FA 1R0AA 1IV0A 4FLVA 3ZX2A 3NFAA 3VQ9A 1WSGA 5AJ3K 3PV8A 5HRPA 2X6SA 4DTJA 5AQKA 5GINA 3CFPA 4GV3A 3ZSRA 3EE9A 2PYLA 1RT4A 4CD3A 2OZSA 1U2VA 2NRXA 2F4VK 3MDQA 4IEIA 4BRKA 4I7FA 4MQ3A 2HBLA 3H45C 4I2PA 4JKFA 5MLCQ 4FPBA 3H3NO 3AVGA 4ILJA 3CFRA 3V9WA 4DR5K 2IOCA 4HUFA 4JKCA 2ASPA 5J2QA 1RGIA 4CEEA 4H5WA 1S3XA 2P9IA 3QIOA 1XNRK 3TPQA 4FWOA 2NNWA 2OANA 3NH2A 4CEOA 1XC9A 3ID8A 3IAYA 1SL2A 1HQEA 5HOOA 3DLLL 4BGBA 4RTFD 3LDQA 4WF9L 2YJFA 4ELTA 4PKIA 3AO1A 3MAQA 3OYFA 4AHRA 3CCRN 3QETA 3QINA 1O1WA 3SJHA 4KH5A 1EWRA 3VEYA 1TL1A 3OYCA 3C7NA 4PL7A 4BR0A 4NXMK 3TWHA 5DMRA 3S3MA 2G8HA 4Z4GA 3R1XA 5HL7L 2Y1JA 4N41A 3JS6A 2HMIA 2QEXN 1F21A 1RNHA 1XMOK 5M1KA 1VSIA 4GW6A 5ELZA 1Q81O 4H0OA 4A59A 1W9HA 4FJJA 4EAHD 1Y97A 2QM1A 5LL6Z 2Z1HA 3ISNC 5DM7L 4CERA 5HP1A 4CJVA 4UY8O 3EKUA 2P9UA 3AO5A 1GLEG 1NK7A 4OGEA 2UXBK 2BE2A 5AQTA 3T1HK 2Q36A 2NZTA 2PFUA 3OS0A 4CZLA 4E19A 1BI4A 4DV3K 4M7XA 3VQ5A 4IOAL 4I9LA 3PLAA 5DM6L 3AVIA 1WBBA 5LMUK 5FRMA 3CM6A 4CHOA 5AQFA 2FBYA 5JVGL 1YTUA 3R9PA 3AA4A 1RTJA 4CGGA 2ETJA 4M3TA 4FLZA 4OJRA 3C7NB 5AQJA 1VQNN 4ELUA 2A40A 2NRTA 1WAJA 4RG8A 2BDPA 2FSJA 5JMVA 4DUYK 3O5BA 1C6VA 5AQVA 3OTOK 3TAMA 5KPZA 2B6AA 4FK4A 3CFOA 3NF6A 3DLGA 1KFSA 4YOUA 4H5RA 1QVFM 3S3NA 4B3OA 4FL9A 3CCJN 4XH1A 1XUPO 4RW9A 4B9MA 2IVNA 1NOYA 4LH5A 3FR0A 3VGKA 2P9SB 3ZETA 3VMFB 3ZX3A 5HLFA 1T05A 3AARA 2OPRA 1BI4B 4KAZA 4O8KA 2HF4A 3AA2A 4KTWA 4HVJA 1IO2A 4BC5A 1Q18A 3ATUA 1W0HA 4BQZA 2GV9A 3JXUA 3U4LA 2VWJA 4CJRA 4DS5A 2W6LA 1TK8A 3OYBA 3L2WA 4JKAA 2VQEK 3VPZA 1VSFA 1S6PA 1BGXT 2ITGA 4K0KK 2DFEA 3CJAA 2EX3A 4YDUC 3MK6A 2NRHA 1G15A 3IS9A 4CF0A 3FZLA 5AQLA 4E7KA 4NB4A 2ZWHA 2KZZA 1YUWA 1NGBA 1ZBHA 4BG9A 1GLBG 3DXKB 4OPKA 5BRFA 4NCBA 4BROA 3CJ1A 4E1MA 4JS4A 2UUCK 1NOZA 4JKGA 1T6DA 2P9KA 1RBUA 3OYLA 3RVCA 1S5JA 2B4JA 1KSPA 4FZYA 1JCGA 3ZETB 4CI6A 4I6MB 1NK5A 3J8AA 4WFNL 3M3ZA 4DU3A 2V7YA 3PX4A 4E1NA 2I7NA 3S3OA 1HJRA 2F96A 4IJAA 4CZEA 5C2DA 4DQ8A 4Y1DA 3O4NA 4DTPA 1C0GA 3KZBA 1K9MO 4GKJK 2ITMA 2Q0UA 4GY2B 3EEQA 3CMAN 1YJNN 3NDKA 4FLXA 1HLUA 2OTLN 3DXMB 4HTUA 4KB0A 4CEAA 5JS2A 4W5QA 5B8HA 1ZBLA 4H0XB 2Z1GA 4QCLA 4PWDA 1SQKA 3TSPA 4YY3K 2FBXA 1U45A 2GTDA 2KHOA 4R79A 4B9UA 3UIQA 3W0LA 4KHSA 2D0PA 4EZ9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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