4CLMA

Structure of salmonella typhi type i dehydroquinase irreversibly inhibited with a 1,3,4-trihydroxyciclohexane-1-carboxylic acid derivative
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
251
structure length
243
Chain Sequence
KTVTVKNLIIGEGMPKIIVSLMGRDINSVKAEALAYREATFDILEWRVDHFMDIASTQSVLTAARVIRDAMPDIPLLFTFRSAKEGGEQTITTQHYLTLNRAAIDSGLVDMIDLELFTGDADVKATVDYAHAHNVYVVMSNHDFHQTPSAEEMVLRLRKMQALGADIPKIAVMPQSKHDVLTLLTATLEMQQHYADRPVITMSMAKEGVISRLAGEVFGSAATFGAVIAVNDLRSVLMILHNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords 3-DEHYDROQUINATE DEHYDRATASE
publication title Irreversible covalent modification of type I dehydroquinase with a stable Schiff base.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhi
total genus 95
structure length 243
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2014-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4clmA00
4Q33A 1K8ZA 5AB3A 5EMUA 2AGKA 2AQWA 3RMJA 1Q6QA 4FNQA 1GTHA 3DH7A 3HB9A 4NZJA 1HL2A 4UTWA 4ZQMA 1S3HA 4MPQA 1GQNA 1TPUA 3CIXA 4HSNA 5I3KA 3S5YA 1EX5A 3PUDA 3WJZA 3HGJA 4UNLA 1WOAA 1Z41A 2FDSA 1PCWA 3S42A 1DBTA 2TSYA 2Y7GA 3Q37A 2G95A 2I9EA 4WY0F 5AFDA 1L6SA 1HFBA 3DZ1A 2WSRA 3G1XA 3EEGA 4AF0A 5A8GA 1RPXA 3V75A 4MKNA 4XBKA 3B03A 3QSRA 2VEKA 5G1TA 3UZJA 3G24A 1GG1A 4MFEA 2GVLA 5TBOA 1L6WA 3DFOA 3C4UA 3KRSA 4CQAA 3TQ0A 3TW6A 3W84A 1GYLA 4JTTA 4N9CA 3TE9A 2BWGA 2FPYA 5KSWA 4KFOA 1WYIA 2CW6A 3W2MA 2V30A 1YPFA 3G22A 5HULA 2CZ5A 1G4EA 1LOSA 4PCFA 5FF3A 5DN1A 4LRSA 3QC3A 2WJZA 3UD6A 1CW2A 3WFAA 3HBLA 3N3MA 5FEPA 2HS8A 1H62A 5KITA 1H50A 3G18A 4ZQOA 4HIBA 4ZMGA 4I7WA 2Z1BA 1DOSA 4I7VA 1JUBA 3CC1A 2GQAA 4HNVA 4KFPA 3EKLA 3HJZA 2J9ZA 3FKKA 4BWLA 3HG3A 1KM6A 3EWBX 1H7WA 1QAPA 2A7PA 3TC6A 1FWWA 4GXMA 2CWNA 4N4PA 4IX2A 1GVRA 4FNSA 1T96A 4N6FA 1XI3A 3TV8A 1XC4A 1FQ0A 3QFEA 3CWOX 4AWSA 1W37A 1VCFA 2E09A 2ZZ1A 4JIPA 4QAIA 2ZRWA 1ZNNA 2FQIA 4XKYA 5AHEA 5IBXA 4GUGA 2OJPA 2NX1A 4FNTA 2V82A 4Z08A 3S1VA 4O54A 4PH6A 3W2LA 3U2OA 4ZL1A 3M5YA 3NZRA 3NQCA 1E51A 4NJJA 3NAVA 4UTIA 5G4WA 3B0PA 3QZEA 3A22A 4M5PA 4GUJA 1AL7A 1X6UA 5LNSA 2Y70A 1QNVA 2V81A 4Z1DA 3DGRA 3UY7A 4PEKA 1VS1A 1QOPA 5EBUA 2VFIA 1SZNA 3P74A 1B9BA 1SFJA 3NPUA 5I3GA 2JBMA 5LGZA 3P62A 3GKAA 4Q4KA 3IVTA 2PE4A 1SZFA 5E93A 4MJMA 1T99A 1FCBA 1I8JA 3W86A 1VCVA 3N73A 4YCPA 3MBDA 1YADA 3IV3A 4UTMA 3N14A 3VKJA 4QISA 3TK7A 3MP5A 3INPA 3W7OA 2A21A 4Y90A 2FPVA 1OF6A 2BXVA 5BMXA 1KA9F 1W1ZA 4AWTA 1BKSA 1TQXA 1W56A 4OV9A 1FCQA 1IXPA 3I7SA 3HG4A 1FY6A 1NAL1 3C52A 2DZTA 4RZ4A 1ME9A 3G0SA 1SW7A 3UYCA 4P2VA 1M7PA 1TJPA 1ONRA 3C56A 3PG8A 1B57A 3PG9A 1VPXA 2J24A 3SR7A 4C1LA 3LBMA 1DORA 4RZ6A 4ZQPA 4H6KA 1I45A 1OJXA 1TQJA 2A0NA 4UMAA 4HSOA 5FF7A 4RXGA 2DJLA 4UFMA 4DPQA 4BI7A 1QPRA 1VR6A 2WSQA 4JDBA 1WDWA 3LHVA 3WJXA 4YL2A 1EEPA 1VGAA 3TAOA 3UWYA 1XM3A 4POCA 3IIOA 1KV5A 3A24A 2IQTA 3O8AA 5F2LA 1U5JA 3E49A 3IVSA 2Z0IA 3SECA 4EOUA 5HR6A 1GG0A 1KLZA 2B0MA 4XTIA 1KFCA 1JQXA 1DHPA 1W3TA 3LCHA 3M16A 3W73A 4N9EA 3T4CA 5F2GA 3P61A 4HPXA 3BGGA 2NLIA 1MO0A 4JY8A 4CCEA 4FEZA 1PHQA 4AVFA 3ANYA 3W07A 3BPWA 4IXXA 1LM1A 2A1YA 3F4WA 3QYQA 4NT0A 1LBFA 4FO4A 2DORA 5IM51 2X1SA 2WOQA 3S6DA 4R33A 4HN4A 4IXHA 1VLIA 1G7VA 3LCIA 3KVJA 3DFSA 1FDYA 3GNDA 2OT1A 1HUVA 4YLWA 4BI5A 1O94A 3PY2A 3PSWA 4FB7A 4M19A 4D2JA 3DI1A 4ML9A 4OQVA 4TR9A 5DY2A 3C2OA 3EB2A 8TIMA 3U6WA 4S2BA 5AN7A 3TQVA 2ZZ2A 3JS3A 3TIMA 5AHIA 1W5QA 2ALDA 4N4QA 5DCDA 4IQLA 3MJYA 2QR6A 1YYAA 2A5HA 1T8XA 3NQMA 3I6RA 4NUWA 1LRTA 1Q6OA 2TPSA 3O1NA 3LXCA 1LRNA 5H91A 3O16A 4AB4A 4DF2A 5LSMA 5DLCA 4LC6A 2QCNA 1PCKA 2OX1A 4JNMA 4C1KA 4OGZA 1DQWA 3G0XA 3GKFA 2CLLA 2DP3A 1OX5A 4GWEA 3EX2A 3LGEA 3WK0A 3EWXA 3W1MA 1T0OA 3GZ3A 5CZJA 5D33A 3NM3A 2ZBTA 1RVGA 3PULA 5DCEA 2QCGA 4Y9AA 1G69A 1SSDA 3M7WA 2VOMA 2V2DA 1H51A 2RDUA 4JTSA 5HINA 3W2KA 4Z1AA 2QUUA 1DJNA 3W9ZA 2QF7A 2QJGA 4RK8A 4Z0JA 2Y7FA 3PR2A 3W1TA 4O0ZA 3PB0A 4GE8A 4FX8A 3W72A 1SU5A 3W2JA 3UQNA 3DFQA 1Z42A 3UXDA 2D73A 4K8HA 2PC4A 3THAA 3W7DA 3BG3A 1ICPA 4A29A 4A21A 1HTIA 4MY9A 1NFBA 2PRLA 4BFAA 4O13A 1TPC1 2JGYA 3B05A 2VKZG 3CU2A 4NNBA 3P67A 4JYFA 3A21A 4Z1BA 4O52A 4E0CA 2ZA1A 3GDMA 1TTQA 3TCEA 3ZS4A 1TRDA 1J5TA 4JIQA 3DKLA 4HPJA 5ABTA 1W54A 4H3DA 4TX9A 4UTJA 3W3OA 4ADTA 4WQ6A 3P81A 3UXAA 1R46A 2CFFA 3CEPA 3ATZA 2V2HA 2OZ0A 3NXFA 1JULA 3FOKA 4RXFA 4UTWC 2AAMA 2ZRYA 3QH2A 3MHUA 4TO8A 3NDOA 3KHJA 3EX4A 3HGOA 2A4AA 1TV5A 1Y0EA 1F76A 3IIZA 3HIJA 3N9SA 5L6UA 1XXXA 2GOUA 3BGJA 1OYAA 1SO4A 3NM1A 3T55A 4N02A 3SIZA 2CZEA 2QDGA 3W7RA 2VFFA 1HO1A 2E6YA 4UMCA 3TSDA 4RV8A 3WJYA 2HS6A 3GIYA 4XWUA 3BW4A 1RZMA 4IX0A 2ZTJA 1VCGA 1XL9A 4FIQA 3P60A 4O16A 4CNNA 3O06A 2NXHA 1AL8A 3MO7A 3BLFA 3PWAA 4MOZA 3EX3A 3IIVA 3NG3A 3G1HA 5D32A 4FF7A 3W76A 5DXXA 1K03A 3WJSA 5HUOA 4FNRA 4JR5A 3NL6A 2YXGA 3P5ZA 1D9EA 4PL2A 4EVZA 2GJLA 2R91A 1VHNA 1ME8A 2PRMA 2LLEA 4OE7A 2PCQA 1L6YA 4WZHA 4NZFA 3UZ5A 3PC0A 5EPDA 4JYEA 3LTYA 4EF9A 4CNPA 5LNVA 5G5IA 2J9XA 2B4GA 3GDLA 1P0KA 2VFGA 2NX3A 1P5BA 1PHWA 3C61A 1OFOA 3JRKA 4AEOA 3HMJG 1W0MA 2ZRZA 5K4XA 3G3MA 3PBUA 2C15A 1RR2A 2YYTA 4E38A 2QUVA 1BWKA 4UR8A 3CTLA 4IGHA 3DHDA 1EP1A 3TC7A 3W7PA 2YDAA 3SGZA 1QCWA 4JTEA 1WBHA 3ABSA 3L66A 1YXDA 4O1DA 5TIMA 3ZWTA 5IBXC 2X1TA 5BOOA 1A50A 1W3IA 1GOXA 2DZVA 1PE1A 1XDMA 4Z1CA 3TR2A 5J5DA 3W83A 1VH7A 1YPIA 1TREA 5AHLA 2EAWA 4FXSA 3TFCA 5K9DA 1VRDA 3E12A 3G0UA 3UPBA 1EP3A 2YX0A 2ZA3A 4AH7A 3CM4A 2ZZ6A 3O63A 4NJGA 3M44A 4NNAA 2VEPA 3T78A 3YPIA 5KTLA 3P80A 4RZ5A 4IJBA 1IIHA 4NJIA 3FYOA 2C0AA 1OFEA 3STEA 1LLZA 4DBEA 2NXIA 4R34A 4AHQA 1G7UA 5HWNA 1GVSA 1JUKA 4GNJA 4UFHA 5CGQA 3LCXA 4ALDA 3KFTA 5H2ZA 3Q2DA 1TPWA 2P1FA 4XZ9A 1TPDA 3NQAA 4W9TA 1N7KA 1ZAHA 2E1DA 3W7IA 4B5NA 1SZGA 3KVMA 3NPWA 3LXAA 4JYDA 1GVOA 3NZ1A 4IMCA 3ABQA 1EUAA 1W5OA 3PM6A 1XKYA 3QMSA 4PTNA 4Y6GA 2H8ZA 2GUUA 5CPMA 1LBLA 2DZPA 7TIMA 1WV2A 1GVFA 1H7RA 2J9YA 4UTLA 5F1VA 5C55A 1VLWA 1LYXA 2VEIA 4WOQA 3P82A 1LOLA 4J9JA 2BX7A 1JCJA 3P8JA 1LCOA 3W2UA 4RJEA 3M9YA 3T7VA 1O5KA 4N6EA 2E6FA 4K36A 1J4EA 1D3GA 1C9DA 3KXQA 3UWVA 5K9CA 3NEVA 4S2CA 4XBSA 5G1YA 4ZQRA 1OG0A 1NVMA 3IEBA 1K7XA 1X7FA 2EPHA 3L9CA 4MYAA 3PVFA 3TH6A 1TPVA 4CQ9A 4UTTA 4LVFA 1OK4A 1AW2A 4EWND 3C3NA 4O28A 2FB3A 1TPFA 4UTUA 1R30A 3C2EA 1I2OA 4OV4A 1SO3A 3A23A 3PS7A 3VCRA 4QJ1A 4YMZA 1G6CA 1LBMA 3OVRA 2V8ZA 5AHFA 5BMWA 3TXVA 3W2NA 1QDSA 5L9FA 3N19B 3E0IA 1KTNA 3G1DA 1ZY9A 3F4NA 5F2MA 3UPWA 5FF0A 3LRKA 4DELA 1M6JA 5AHNA 2QCFA 3SZ8A 1ZCOA 2ZZ3A 3G8RA 1ALDA 3FS2A 3N34A 4JX4A 3DI0A 3LBCA 3B0UX 1OK6A 4LVGA 2Y89A 3ABOA 1LORA 2GVJA 3TDFA 6ALDA 2ISSA 3C2FA 1QO5A 4O1BA 2QCLA 2E5CA 4JEQA 1MEHA 3GXPA 1FWSA 5LNUA 3W71A 1Q6LA 1TJRA 1K7EA 1TMHA 2Z6JA 4MUZA 1Q45A 3GR7A 4K7YA 4UMBA 1OHLA 4R7JA 2X2GA 1P4CA 4K7VA 3VE9A 4N2YA 3QW4B 1M5WA 1G67A 1RQBA 4BF9A 3W85A 2C13A 2YZRA 2FJKA 2TRSA 1ZHAA 3WK2A 3T40A 3LV6A 1GZGA 4N9BA 5K9XA 3LDVA 4BK9A 1THFD 1XCFA 4A2RA 3PBYA 4FIRA 3N2MA 4U4MA 4G1KA 4LS2A 5HNRA 1X1ZA 1DL3A 4LW7A 1H63A 2NV2A 2RDTA 3LXBA 1QFEA 2YGYA 3GB6A 1KFKA 4MIMA 5CPLA 3TAKA 1B4KA 3CIWA 1TTJA 3USBA 2DZWA 2CLKA 3MWAA 5HMSA 3W7JA 5KZEA 2H8XA 3QJAA 2ATMA 3BVJA 5HWJA 3OA3A 1TIMA 1KLYA 2CLFA 4O11A 3L5AA 4OWGA 1EWEA 4LS0A 4R53A 4KWVA 3NR0A 3M43A 3NQ6A 5EKYA 4ZQCA 3VNDA 1I2NA 1OFAA 3GDKA 2YYUA 5G2WA 4AAJA 4KFNA 4DPPA 1LDCA 5K7JA 2GPTA 4P61A 3E9AA 4DO4A 1NF0A 3NQ8A 1G4TA 3G8EA 1OF8A 3H55A 2J88A 4NNCA 4O14A 1R2RA 5D02A 2DZSA 1KM0A 1JUEA 3BO9A 2A7RA 3AJXA 3PB2A 3MW7A 4NXSA 3M47A 1A5BA 2EKCA 2ZRUA 3LHTA 4CNOA 2CZFA 1LTDA 2H3DA 1QPQA 3C8FA 3PSVA 1W5NA 4LNYA 4LT9A 1XBZA 2ZZ4A 3TQKA 2B7PA 2TMDA 3W1LA 2QAPA 2YPIA 3MHGA 1OYBA 3CHVA 3TMLA 1EUNA 1P0NA 3I7QA 2PRHA 3IIXA 3SJ3A 2JKAA 3P8IA 1SSGA 2C16A 4DXVA 4LTSA 3B04A 2V9DA 3GXNA 4JTHA 1KTBA 3C2VA 2YW3A 1U83A 2WV8A 5DY3A 1JR1A 3P7YA 1JRCA 3P84A 4JGDA 3IGXA 1UCWA 1PVNA 3HPSA 4DF0A 3VFLA 3GVGA 4HKPA 2PURA 2W79A 1HO4A 4IOTA 4LVAA 2Y62A 4JD4A 5T26A 4O12A 5A5WA 4UTHA 3L0NA 3QMTA 2NXGA 1QR7A 4O10A 4JX6A 3SI9A 3DFNA 5DELA 3RFAA 4HHPA 5BNKA 4BR1A 2HTMA 3L2IA 1JQVA 2V2CA 1KM1A 1W8SA 4L4LA 2WQPA 5D30A 3W88A 3NYZA 1VYPX 1LRQA 4KKXA 4IMGA 2CLEA 4EF8A 4LVBA 3MYOA 2A6LA 4GJ1A 3L21A 2H6RA 5LHEA 3KRZA 4IMDA 4HNNA 2A6NA 2TYSA 4MLRA 4LV4A 3KX6A 3RNDA 4ZZ9A 1EWDA 5KZMA 4M6PA 3GXTA 3HPZA 1TPEA 1QPNA 3A5VA 4TIMA 1W5MA 1YDNA 4JY9A 4GRSA 4RCXA 1NF7A 4M6VA 3CLMA 3RLVA 3W7HA 3CEUA 1A5CA 3NL5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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