4CNPA

Structure of the salmonella typhi type i dehydroquinase inhibited by a 3-epiquinic acid derivative
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
252
structure length
252
Chain Sequence
MKTVTVKNLIIGEGMPKIIVSLMGRDINSVKAEALAYREATFDILEWRVDHFMDIASTQSVLTAARVIRDAMPDIPLLFTFRSAKEGGEQTITTQHYLTLNRAAIDSGLVDMIDLELFTGDADVKATVDYAHAHNVYVVMSNHDFHQTPSAEEMVLRLRKMQALGADIPKIAVMPQSKHDVLTLLTATLEMQQHYADRPVITMSMAKEGVISRLAGEVFGSAATFGAVKQASAPGQIAVNDLRSVLMILHNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords 3-DEHYDROQUINATE DEHYDRATASE
publication title Mechanistic Insight Into the Reaction Catalyzed by Type I Dehydroquinase
rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhi
total genus 97
structure length 252
sequence length 252
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2014-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4cnpA00
1H60A 4EF8A 3L0NA 4OV4A 3NR0A 3W7KA 4WX2A 2F7FA 2GJLA 3W75A 1PHQA 1R46A 3E49A 1RQEA 4IMGA 3DFPA 1BKSA 4A22A 1CW2A 5F4WA 3KVMA 3NPVA 5HUPA 4JXCA 2WNNA 1FCQA 4LUIA 4GRSA 3BG3A 1DV7A 4AWUA 4BWLA 3I68A 4CQ9A 3NL3A 1XC4A 4HSOA 3PC0A 5G5IA 2PE4A 2TYSA 2A5HA 3IRDA 1ZFJA 1ZCOA 3P81A 4KFOA 5CGQA 1KW1A 3CU2A 1YXYA 2I14A 3IIXA 2VKZG 1LDCA 3GKAA 5AYYA 3EX4A 1ICSA 1NF7A 3VE9A 2Y7FA 4HPXA 4UFLA 5C2XA 3LERA 1A5AA 3EWBX 2WKJA 3LV5A 1BWKA 1SUXA 3VE7A 4WY0F 4FX8A 3EWYA 3I7SA 1A5CA 3PULA 5E0KA 1TTPA 5KZMA 4E2BA 3W7MA 2ZRXA 4GC4A 2A6LA 1GTEA 1KBIA 2H3BA 4WY0A 4AHOA 3H55A 3NPXA 1WAUA 2ISVA 4IXHA 1KM5A 3KRZA 4UCGA 1WBJA 5KSWA 2VFDA 4JD4A 4N4QA 3R5EA 1PIIA 1TIMA 5LNRA 4XTDA 2V2HA 1TPC1 3TXVA 2W79A 3USBA 3PG8A 4O1BA 3FJLA 1LROA 3L0GA 3IIVA 1AW1A 2C1HA 2VEPA 4Y6GA 1RD5A 2W6RA 4WY0B 2J6XA 5CPNA 4JR5A 4LC6A 3B06A 3RNDA 1KFKA 4BR1A 3CEUA 1LRQA 4I7UA 1P1XA 4JS3A 3L5MA 3WJYA 4A2RA 1SU5A 2ZCGA 3FLUA 2CZFA 2DZTA 3I7QA 4OT7A 1AL7A 3W23A 5BOOA 3GLCA 4O54A 5AYXA 3TCEA 1VLIA 1JCJA 1UASA 2ZZ1A 1W1ZA 2JBMA 4EIVA 5FF7A 3NPUA 4O13A 5EPDA 5AHNA 1KV8A 2VENA 4RX0A 1OFRA 1F05A 5AFDA 1WXJA 3BW3A 2H8XA 2PC4A 3UWZA 2V5LA 3UYCA 4N4PA 2NX9A 3PSVA 3A9IA 2VEMA 4Q32A 4Z0JA 4DQWA 3LRMA 4FO4A 2PURA 1S3HA 4K38A 2ZRUA 1SR9A 2RDTA 3MJYA 3OIXA 1XBVA 4JICA 5AC7A 5K4XA 1S5TA 1G4EA 1EX5A 3NM1A 4JX6A 4A21A 5FEWA 4QITA 3W7GA 1LRTA 4X22A 4LY8A 4JYDA 3TH6A 4HNNA 2NLIA 1EA0A 2RHGA 4MJZA 3BGJA 1TRIA 1GQNA 5F1VA 4UNKA 4FIRA 3C61A 3W1AA 3ATYA 2JGQA 5DBTA 4O53A 2DZSA 5AHMA 4UTUA 4YCOA 2X2GA 4S2BA 4GUGA 1X7FA 3P8JA 4A2SA 3TFCA 1SPQA 1G4PA 1D9EA 3CHVA 3HB9A 3DFOA 3HGJA 4Q4KA 1FWWA 3KVKA 3N19B 1O60A 1W5PA 3TA6A 4CNNA 2BSLA 2NUWA 5LKYA 1FCVA 2E6YA 4WD0A 4K39A 3LXCA 4JTEA 1Z44A 3DXIA 2CW6A 1CX9A 3HPXA 3LHYA 3PB0A 5I3GA 1LOLA 1SO5A 2C14A 5AOUA 2QCDA 3MMTA 4RZ6A 3EWZA 1K7EA 1VYSX 3P7YA 1IXPA 1O95A 3PBYA 3TQ0A 3AO0A 3C2EA 2YYUA 1W37A 3BGGA 1QMLA 4DPQA 1ZY9A 3IIOA 3EEGA 4BF9A 1MSSA 4LVBA 1W31A 4LVGA 3MO7A 4PEKA 4U4MA 3QC3A 1W3TA 1QOQA 4K7VA 2H3DA 3S1UA 5EMUA 1OX5A 1MO0A 3MHFA 2QCDB 3W22A 2Y7DA 4MLJA 4O50A 1VPXA 3TXZA 2WJZA 1TCDA 5HNRA 3KAOA 1AW2A 2B7OA 2EGZA 1LYXA 3B0VC 3EXTA 1F76A 4WUIA 2QAFA 2ZRZA 4M7TA 4UFKA 5C54A 4TO8A 5AHFA 1XI3A 5F2LA 1FWNA 4JTIA 2A7RA 1Q45A 2YFNA 2QCEA 2WO5A 4TIMA 5AHEA 2Z2UA 3LLFA 2GPTA 3GXNA 4N9DA 1TYGA 2QEZA 3E9AA 5HWJA 4L4MA 4A3UA 3CEPA 3D0CA 1EP3A 1TPFA 2YW3A 3TUUA 4NX5A 4HPJA 1KM4A 2D73A 2O7SA 4UFMA 1QOPA 3G22A 1W0MA 3A21A 1B9BA 3EX3A 3UWQA 1OFAA 2DZVA 3EB2A 3L65A 4UTJA 4ALDA 1WX0A 3PBUA 1X6UA 3G1VA 3CPRA 4JDYA 3NM3A 2QJGA 3C2VA 4LRSA 2YGYA 1WOBA 4WXZA 1HUVA 4GFSA 3G1XA 4IXXA 5K9DA 4O14A 1N8FA 2QCLA 2QCMA 2G5WA 1VCFA 5FI8A 4XZ9A 1X8FA 3NEVA 2YYTA 3FYOA 2WSRA 1NF0A 3GDTA 4ZQOA 5DY3A 3QQ1A 4ADSA 4NXKA 2PRMA 3A24A 1YPIA 1VYRA 4ADTA 1TREA 5D32A 2DU2A 2B0MA 3UY8A 1OVDA 1VZWA 1KM3A 4FNRA 3W9ZA 2JK2A 4AHQA 3QMSA 5HULA 1BTMA 1QPRA 2TRSA 3N9RA 3N9SA 5E1QA 1SZGA 1GTHA 1LTDA 3ABSA 1LBLA 1OFBA 2TMDA 3SGUA 3GIYA 3STFA 3HG5A 1EWDA 1OF6A 4OQVA 5A8GA 3LXAA 3SZ8A 1TTQA 1SFJA 4EOUA 1S5VA 3JR2A 5DN1A 1XKYA 1W54A 4UMCA 1UBSA 3IEBA 3TC7A 5I3IA 4LU0A 3SY5A 4NZFA 4YMZA 4UTTA 3PSWA 3QH2A 4FNPA 3HG2A 5DELA 3LBCA 3LBMA 3FYPA 4PODA 3TMQA 1B57A 2ALDA 4PC8A 2RDWA 1AK5A 1OG0A 3LTSA 3FKKA 1QDSA 5CSSA 3GNNA 5SWUA 1EP1A 1YXCA 2V8ZA 3G1SA 4OE7A 5EKYA 6TIMA 4DEFA 1W3NA 1XM3A 3ZS4A 2Y61A 5EYWA 5AC6A 3N3MA 3Q58A 1XXXA 1MXSA 3TE9A 4EF9A 5K9XA 4IPIA 2WOQA 4NNBA 1F2JA 1C9DA 3MW7A 4NQ1A 2PRHA 3DI0A 3OEXA 3M43A 2C6QA 4O18A 1RQHA 4UR7A 1OF8A 3QM3A 4LS2A 5MHBA 4Z1AA 2A0NA 4POCA 1KBJA 2BX7A 3W84A 3IV3A 1R2TA 3BPWA 2DP3A 4JTLA 5HR7A 4JGDA 2VELA 3G0XA 1IIHA 1OFOA 5F4SA 3E02A 3TSBA 4AWTA 5AHLA 2VFEA 5I3JA 3KFTA 2CLMA 4Y96A 1YLVA 3B8DA 1GWJA 1I2PA 4MY9A 3O1NA 3UNDA 1QPOA 4P61A 4BFAA 4IPJA 2C0AA 4IMEA 5D2YA 3LHVA 4E2DA 1ADOA 1PCKA 2OT1A 1NFBA 4X9SA 1TQJA 3WJXA 3CLMA 2NXGA 1G4TA 1H61A 4WXYA 3TJXA 4NT0A 1T96A 2DJXA 2Y7EA 1H1YA 4XUGA 3BW2A 3NQ6A 3DBPA 1V5XA 2WQPA 2ZZ4A 5E93A 3C0JA 4IMCA 1DQWA 5CKSA 5DY2A 2NUYA 3VKJA 4NJKA 1OFPA 2PCQA 4O12A 1GG1A 3P60A 3DAQA 4ZQPA 3LHWA 2B7QA 3BK0A 4UFHA 1Q3NA 2QJIA 4K8HA 1DQXA 3DFSA 2O7QA 4GBUA 3S5ZA 1TPUA 4LC8A 4M7SA 2J27A 3M41A 5FEPA 4MOZA 3MI2A 2X16A 1J2WA 3BO9A 3KX6A 2BXVA 3R13A 5I3KA 1JCLA 1VHNA 3W7RA 2FJKA 1WDWA 3MHGA 3FIGA 3QMRA 1UUOA 3A5FA 3NQ7A 4BWLC 4O17A 5BRBA 3W7DA 1F6KA 3M44A 4AH7A 3I7RA 2ISWA 3GDMA 3NO5A 3IGXA 1KFCA 2GQAA 3DHDA 4LTSA 2V82A 3M1ZA 4LV4A 1JR1A 2YCEA 4JY9A 2B7NA 1GPWA 4DBEA 1LP6A 4O11A 1L9WA 4C1LA 5F2GA 3W7CA 4MZYA 4O28A 3TKFA 1OX6A 3PAJA 4Z1CA 2X1RA 5L9FA 3EX2A 1LRNA 1YXDA 3NG3A 3OVRA 4LVAA 2W0UA 2V0TA 2NWRA 3NL5A 3BG9A 3O06A 2EF9A 3C56A 5G2WA 3CTLA 2CZDA 4AVFA 4FHAA 4KFPA 3MI3A 3HPSA 1OX4A 4CQAA 4MZ8A 3I6RA 4RKAA 1K8XA 4AB4A 3DFNA 3CT7A 3TR2A 3T55A 3F1QA 1FWSA 3KVLA 3M47A 1FWTA 4CQ8A 1GT8A 1P0KA 3MYOA 5G1TA 3M16A 4MUZA 2CLIA 3G1DA 3TC6A 5LHEA 5AC8A 3PUEA 2VFFA 5I3FA 2Y7GA 4MVAA 3F4NA 1HTIA 3B05A 5BNKA 1OK4A 4O1DA 1MEHA 3LRLA 3P62A 1DBTA 3RK8A 3W1XA 3MWAA 4OBTA 5AB3A 3A5VA 1OX4B 3SR7A 3CIXA 3AJXA 1KA9F 4MKNA 5G2HA 4M19A 4LOCA 3W1TA 2A6NA 1P5BA 1GOXA 1VLWA 1JJKA 2ZYFA 1DJQA 4PL1A 2FQIA 3C2RA 3DENA 2V30A 4AMAA 3L2IA 1VCVA 3CWNA 4UTHA 1H7NA 1H1ZA 1G4SA 4LV9A 1JCNA 2A21A 2HTMA 2OCZA 1OK6A 3WK3A 1H7XA 2NX1A 2BWGA 4UXDA 4ONVA 3E0IA 4PFMA 4GE8A 4JYEA 2YSWA 1JRBA 4O0ZA 3ZR4A 5FESA 2X1UA 5D38A 3H53A 3TFXA 3S1VA 4YLWA 3ELFA 2YPIA 4XBKA 4XTIA 5HWNA 1M5WA 3FS2A 5KZDA 3LI1A 5FF2A 1J4EA 3TNOA 1A50A 2C13A 1SW0A 3DU0A 1KM0A 3A23A 3LDVA 1Z41A 1RQBA 3FEMA 3TV8A 4CNOA 5K7JA 5BMWA 1JUEA 4IOTA 1VGAA 3PUOA 3W74A 5LHFA 2ZRYA 2CZEA 4YWIA 4G1KA 2B4GA 3HIJA 3W7JA 3N14A 2PRLA 3NZ1A 4AAJA 3SIZA 2ATSA 3M9YA 1R2RA 1VC4A 4Z1BA 2ZQ0A 4UTIA 4DF1A 2YR1A 1HO4A 1O94A 3T44A 1TV8A 1GYNA 2JKAA 3UWVA 2CLLA 4LW7A 2G96A 3C3NA 1JCYA 4JTHA 3QW3A 4E38A 3O16A 4FXSA 1H7RA 5EL1A 4OHQA 3G1HA 1L6YA 3WK2A 1FDYA 5HMSA 1K8YA 1YDVA 2CLOA 1TPVA 1ICPA 1K8ZA 4UMAA 2QCCA 2QJHA 1KFEA 3C2FA 4GUIA 3HG3A 4HNTA 2GQ8A 1P0NA 1QFEA 3FA5A 2Y6ZA 1A53A 4MY8A 4N02A 3W1RA 1FDJA 4LT9A 1IXOA 3MUXA 5DXXA 4AWSA 1R2SA 1I2RA 3BLEA 3LHTA 1ML1A 4N6FA 5D2XA 2P10A 2YW4A 1DL3A 2ZDRA 3NL2A 3P74A 3P67A 2VXNA 1JQVA 3PY2A 2YDAA 1TPWA 2ZZ2A 2Y63A 3GAYA 3C6CA 3LHZA 3TDFA 5KTLA 4MJMA 4NX0A 1QPQA 1D3HA 1QCWA 4TMCA 3EXSA 3G1YA 3P61A 3LCGA 3LRKA 2E1DA 1R47A 5T26A 4JTKA 3UWYA 2WSYA 1FWRA 1TV5A 3NYZA 4RXGA 1MEIA 3HGSA 3MHUA 1EUAA 4FX7A 3TW7A 2DZWA 3SGZA 1W5OA 2JKPA 3O63A 1DHPA 1SO6A 3NQMA 3DKJA 3HGRA 1GG0A 1KFBA 1PV8A 3EX6A 3F03K 3LCHA 2A2IA 3W1NA 1VRDA 4QNWA 4UTWA 5CPOA 4XKYA 3DFTA 4L4LA 4DF2A 1RPXA 1GVFA 2JGYA 3IIPA 1YADA 1U83A 3L21A 4O4VA 3W2NA 2ZA2A 2VEKA 2QDHA 3L68A 2XN1A 3P82A 1VQTA 2Z1BA 1KLYA 4I7VA 3NQAA 3HJZA 2GVJA 5EBUA 3GVGA 2TSYA 1VHCA 2ISSA 3M5XA 4Z0SA 3W3OA 3GDKA 4IMFA 4XKYB 1QAPA 4NNAA 4ML9A 4NNCA 1FCUA 3O07A 3NOEA 3QMTA 4Y90A 2DORA 1ALDA 1WA3A 1I45A 3DGRA 3ATZA 1HG3A 1SO4A 2Z0IA 1QNVA 4JTFA 2QKFA 4H6KA 1NVMA 5FF4A 3T78A 2QCGA 3G8EA 4O57A 3PF3A 4UNLA 3RU6A 5HR6A 1A5BA 2FDSA 3IVSA 2OMAA 4O0KA 3S42A 1H50A 2VEIA 1SSDA 4BI7A 1AL8A 1OFQA 5K2ZA 3I65A 4UIOA 4O1AA 2IQTA 1OYAA 1RR2A 1K03A 4YCPA 1TTIA 3NNTA 5A5WA 2FB2A 5DCDA 3S1XA 4X2RA 3NQGA 2GOUA 4UC5A 1W5NA 2ZTJA 3PVFA 1TSIA 3HO8A 1QO5A 2JKEA 4JTSA 2WSQA 1HO1A 5U4NA 1DORA 1EWEA 3SECA 3QEZA 3M5VA 4NXSA 2Z6IA 4M6VA 1NSJA 4W9TA 2RFGA 1I2NA 4CCCA 4QISA 1Z42A 4UTTC 1U5JA 1IF2A 5DBUA 2V9DA 2Y70A 1KFJA 2A7PA 3UPBA 1IXNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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