4CY6 | Genus

Total Genus 181

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	181
sequence length	582
structure length	561
Chain Sequence	SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFRVGVAALRMIRPWNKWICVWEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	2-HYDROXYBIPHENYL-3-MONOOXYGENASE
publication title	Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution. pubmed doi rcsb
source organism	Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus	181
structure length	561
sequence length	582
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date	2014-04-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4cy6A03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4cy6A01

2V6OA 4B1BA 4J33A 1OJTA 3CNSA 1K0JA 2FJDA 5KXJA 4AP3A 5FS9A 2B9YA 2EQ6A 1CJ4A 2GVCA 4J2WA 1GTEA 3RP8A 1H81A 3SGLA 3AEBA 4A6NB 4AOXA 1ZOYA 3K30A 4ZCCA 1VDCA 1AOGA 4C77A 4O5QA 1L0VA 1NDAA 3EPTA 1K0IA 4B65A 4CRTA 5BULA 5L46A 1D4EA 3KU9A 2RABA 2OALA 2XLTA 3HZLA 2V60A 4Z2RA 1OJCA 1F8RA 2XLPA 2BC0A 2WEUA 3AEFA 3V3NA 1Y56B 4EMIA 4U2SA 4FX9A 2YG6A 2F5ZA 1KDGA 4XWZA 4YWOA 3DJEA 3COXA 4IVMB 3UTGA 3GD3A 3OZ2A 1PXBA 2RGJA 4BJYA 3NGCX 4C74A 1JNRA 2TMDA 1NHSA 3LJPA 1ZKQA 2HQMA 3QFBA 3UKHA 3AEGA 4Z24A 5J60A 2GQWA 3CNPA 1KNRA 3KPFA 3BNMA 4NEWA 5GSNA 1CL0A 3GDNA 4YSXA 2AAQA 2YQUA 2XLUA 1DJNA 4X9NA 3CNDA 3ISHA 2XLSA 3L1RA 2C7GA 2YM2A 3NK1X 1TDOA 4A5LA 4I59A 4JDRA 1PS9A 4A79A 3B3RA 4J57A 1NHRA 1O5WA 3V76A 3DA1A 1TYPA 1CC6A 1GT8A 4IV9A 2FJEA 4APNA 3NTAA 3F8DA 4OCGA 4C3XA 4OPIA 5ER0A 3SFDA 4H4XA 1PHHA 2C76A 1ZK7A 4A7AA 3NLCA 4OPCA 2YVGA 3UOXA 1FECA 1OJ9A 5KOWA 2B7RA 3NTDA 3CGBA 2C3CA 4OPGA 2Q6UA 2XVEA 1GERA 4JY2A 2WU2A 1H83A 1GEUA 3AE2A 4B67A 3QSMA 3NHOX 4B68A 2RGOA 3ICSA 2XDOA 5IQ1A 3LXDA 4Y4MA 4XWRA 4GCMA 5J7XA 3KA7A 4U2LA 3DK9A 2PYXA 2QAEA 1MO9A 1YQ3A 3UKPA 3AEDA 2VZ2A 3BI4A 4P9SA 5FS8A 2R9ZA 3UKFA 2J3NA 1DOBA 1LJ1A 2JB2A 2VQBA 3NN0X 2BK4A 3AE4A 3AYJA 4YTMA 3S5WA 3DJJA 2A89A 4H4TA 4K5SA 4FK1A 1CHUA 2YLZA 3KLJA 3P4RA 3VR8A 2E1MA 2WPFA 1L9CA 1K0LA 1NG4A 2EQ7A 1LQTA 4H4SA 4U8LA 2XFPA 4JY3A 1IUUA 1M64A 4USRA 4H2QA 1F8WA 2ZZ0A 1LTXR 2V3AA 3CGEA 3NK0X 4H4WA 5C3JA 2H88A 1F6MA 4WX1A 3P4SA 4BV6A 1RYIA 1E1LA 2YG5A 1E6EA 2C64A 1FEAA 3GWFA 2Y6RA 3NKSA 3VRAA 1PBFA 1XANA 1YQ4A 4YSZA 3RHAA 4U8NA 4AOSA 2B76A 4YTNA 5U63A 2E5VA 1E1MA 2BS3A 2CFYA 1GXFA 4CCQA 4CNKA 4Y4LA 2JAEA 1GSNA 2VRMA 3T37A 2B9XA 2CDUA 3RNMA 1H82A 2YR6A 2X8GA 3ALJA 1JEHA 1FEBA 2GR3A 3V3OA 5CKUA 4REKA 1XPQA 2AQJA 3D1CA 2E4GA 4A9WA 2WP5A 2GMHA 3NYFA 3CIRA 4AT0A 1DJQA 2APGA 3OC4A 3AD7B 1ZOVA 3AE7A 1V59A 4X9MA 2B7SA 4UDRA 2AR8A 3AD8B 4EQRA 2UZZA 2OLNA 1UKVG 4KPRA 5M10A 1OJAA 1ZMDA 4Z25A 3NNEA 5BRTA 1GTHA 2XVFA 4RG4A 1COYA 1P2HA 2WDQA 1Q1RA 1D7YA 3LB8A 4EMWA 4ADWA 1TRBA 5U1OA 3ALLA 3BI5A 2TPRA 4CNJA 4YKGA 3CNJA 3AB1A 2XVIA 3FBSA 5FS7A 2BCGG 2IVEA 3AYIA 3II4A 4U8PA 1ONFA 4UDQA 3H8LA 3I6DA 4CY6A 4JN9A 2IIDA 5HHFA 1PXCA 2YAUA 4GDPA 4H4UA 4TLZA 3I3LA 4CBQA 2GR1A 1TDFA 3UKQA 2YLTA 1EL5A 2C70A 2YLSA 2H89A 3PVCA 4JNQA 4NTDA 1JU2A 3CPIG 1Y0PA 3M0OA 3AE3A 3UCLA 2BXSA 3H8IA 3F8PA 3K7QX 4O5UA 2X99A 3NN6X 1H84A 1KSSA 1NPXA 3GSIA 3GD4A 4H50A 2FJAA 4EIPA 2BYBA 4IA5A 1GESA 2BCPA 1NG3A 1RP0A 1H7XA 2WOIA 2NVKX 3ATRA 3ZYXA 4EM3A 1W4XA 3IC9A 5JCLA 3FMWA 4H4PA 1JRZA 2JB1A 2C3DA 5DBJA 3VR9A 2VVLG 2WHDA 2V5ZA 3ADAB 1CC4A 1BWCA 1B37A 1YY5A 4NTCA 4BK1A 2I0ZA 4K2XA 1O95A 3UTEA 3GYIA 3AE8A 4B63A 3CPHG 4A99A 1S2QA 5EB5A 1GALA 4GDEA 3AEAA 3AE1A 3URHA 4B69A 2RGHA 1F3PA 4U2TA 4Z44A 1PBEA 1XDIA 4TM3A 3UOVA 4OPDA 4JNAA 4Z26A 2R4JA 3LZXA 1CF3A 3IHMA 2QA2A 1TDEA 2WESA 3KKJA 3DK8A 3QJ4A 4EQSA 4ECHA 2Z5YA 3JSKA 2YLXA 2R0GA 1FOHA 4J36A 4PABA 2X8CA 1OJDA 2PHHA 1CJ3A 4U8KA 4U8OA 2XLRA 1PBBA 2YG4A 3DGZA 3VRDB 3UTFA 1GRTA 3CNTA 4H2PA 2JKCA 5IQ4A 4FK1C 3LZWA 3ALMA 1KF6A 3GMBA 4JQ9A 3AWIA 3UP4A 4FDCB 1YKJA 3LOVA 3P4PA 4XXGA 4U8JA 1LVLA 4HA6A 2W0HA 2XFNA 3ABVA 4MJWA 4H7UA 2VRLA 4K22A 5EOWA 5KVIA 2DKHA 1E7PA 3IF9A 4EM4A 3NK2X 4BK2A 4NZHA 1RSGA 3B6DA 2R45A 5TR3A 3SM8A 3IHGA 2VVMA 4PAAA 3AYLA 4A6NA 2YR5A 2BS4A 1PJ5A 1GRGA 3DJGX 5U25A 2WOVA 2GV8A 2BS2A 1H7WA 2DKIA 4H4QA 2VQ7A 3REDA 1S3EA 3QFAA 1L9EA 1IUSA 1DOCA 1GOSA 3EANA 3RP7A 2YLWA 4OPTA 1NHPA 2BK3A 1BGNA 4RG3A 5FS6A 4LIIA 2EQ8A 3AE9A 2C72A 1K4QA 1HYUA 3BI2A 3M12A 1Y56A 1VG9A 4DSHA 3UP5A 1GRBA 1N4WA 4NEVA 3Q6JA 5KVHA 4B64A 3AE6A 4WCTA 1PN0A 4YT0A 4K8DA 4TM4A 2C75A 1BF3A 1X31B 1ZP0A 3ITJA 4H4VA 3BNUA 1DODA 3KD9A 2GEWA 1IUWA 1NENA 2XFQA 4TM0A 1EL7A 3FG2P 5HYMA 2NPXA 3VRBA 4BK3A 4YTPA 1N1PA 1IUVA 2R46A 1DOEA 1PDHA 3M13A 1BKWA 2WPEA 4J56A 1PBCA 2X8HA 1IUXA 1PBDA 2ARDA 4LU6A 2XVJA 2WU5A 3CGDA 4EQXA 2XVHA 3C4AA 1CC2A 1N4VA 3UOYA 2WP9A 5JCKA 5M0ZA 1JRXA 1E39A 2JBVA 3S61A 3QVPA 3EAOA 4H4RA 1VRQB 3O0HA 3H4KA 5JCNA 4J34A 3UOZA 1EBDA 2CVJA 4IVOB 2GAGB 1YQZA 3AD9B 3CTYA 3GDPA 2YVJA 3P1WA 2X50A 4CY8A 1D4DA 1IUTA 5KRQA 2C65A 1PXAA 1D4CA 1ZDLA 5IPYA 4HB9A 1GRAA 3G5SA 2ZBWA 3VQRA 4EIQA 2IVDA 2GAHB 3P4QA 1PJ7A 2XFOA 1KSUA 2BC1A 3SQPA 4GF7A 4ZCDA 3ICTA 3P9UA 5JCIA 2GR2A 4D04A 2ACZA 1JOAA 2GRTA 3G5QA 4M52A 3GYJA 2EQ9A 3IWAA 2XFUA 3G5RA 3SFEA 4H4YA 3WE0A 5KWFA 3K7TA 2GB0A 1GNDA 4N9XA 4UDPA 3UKLA 2XYOA 5BVAA 2B9WA 4YKFA 5FMHA 1D7LA 1GETA 2WS3A 1NEKA 2A8XA 4YXDA 2GH5A 1ZX9A 1D5TA 2A87A 4H2NA 5BUKA 1Q9IA 4AT2A 5CQFA 2R0CA 4K5RA 1E1NA 1XHCA 1LQUA 2QA1A 1B8SA 1MOKA 2YLRA 3DK4A 2WOWA 3NYEA 2JB3A 4BURA 1S3BA 4ZN0A 3CGCA 4U8MA 1GRFA 4YSHA 1F8SA 4GUVA 2FBWA 1EL9A 2GQFA 2Q0KA 2BA9A 2FJBA 3QSSA 4BJZA 5HXIA 2Z5XA 4H2RA 2WBAA 3NT6A 3GRTA 5JCMA 4GRTA 2WPCA 4UP3A 4D03A 1QO8A 1ELIA 2OAMA 1B4VA 4Z2UA 1BZLA 3L8KA 1VQWA 1O94A 1TDNA 1GPEA 3D8XA 2V3BA 1ZMCA 1EL8A 4OPLA 4I58A 5LV9A 2VVLA 2OLOA 3PO7A 1CJCA 1JNZA 1Q1WA 3QVRA 4U8IA 3ZDNA 2YWLA 3AE5A 3UKAA 4EMJA 2C73A 2XCGA 4Z2TA 3GRSA 4C3YA 1IJHA 3NG7X 2WDVA 4LA1A 4NTEA 4ICYA 4DGKA 1NHQA 2WDRA 3DMEA 1B5QA 3FIMB 2R0PA 2R4EA 2ZZCA 3K7MX 5EB4A 3UKKA 1QJDA 4DNAA 1DNCA 2YVFA 5EBKA 3AECA 3RP6A 2JK6A 2YR4A 3DGHA 5KOXA 2BK5A 2V61A 1LPFA 1QLBA 4E0VA 1TYTA 1KNPA 2C67A 4TM1A 3E1TA 2YG7A 4EQWA 5C2TA 1VG0A 3KVEA 2GR0A 3BHKA 3CN8A 3NRNA 3NYCA 3R9UA 4KX6A 4J31A 1TDKA 3QSEA 1Z6LA 3DH9A 1N4UA 3F8RA 3CPJG 4TLXA 1PJ6A 2BABA 4C5OA 2GMJA 1H86A 1M6IA 4CCRA 2QCUA 4IA6A 4K7ZA 2GF3A 1LV0A 1SEZA 2VOUA 1H6VA 4A65A 1JRYA 2BXRA 1KFYA 3C4NA 4OVIA 2Q0LA 4Z43A 2WETA 3ICRA 1NAAA 1L9DA 3DJDA 3UTHA 1S2YA 2YM1A 1FCDA 2YG3A 1E1KA 2Y6QA 3ATQA 4YSYA 1ZY8A 2WP6A 2ZZBA 4B66A 1REOA 4H4ZA 3GMCA 2C66A 4GR1A 2OA1A 4X4JA 3BHFA 1MXTA 3NIXA 2O9ZA 1DXLA 1CBOA 2WQYA 1GV4A 1CJ2A 4AP1A 1BGJA 3NH3X 3FPZA 3AXBA 3LADA 3PS9A 3GWDA 2BACA 1FL2A 3Q9TA 4RSLA 2CULA 3EF6A 3C96A 4Y4NA 2X3NA 1P2EA 4USQA 5HY5A 4OPUA 1GRHA 3AEEA 2Q7VA 4DSGA 1GREA 5GRTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

4EE0A 4BWQA 3CNSA 4XS6A 4ZBAA 3TUEA 2B6MA 2B9YA 2H75A 2GVCA 4K8MA 1GTEA 2WULA 2LJKA 3SGLA 3AEBA 2DJ1A 2VCXA 1VDCA 4X0XA 4C77A 4O32A 3LJRA 1K0IA 5L46A 3KU9A 2RABA 3SY4A 1BX9A 2QKEA 3GYXA 2XLTA 4EMIA 3ME7A 4FX9A 1EP8A 1SK2A 1QXHA 4PTSA 2YG6A 1KDGA 3QOUA 4MJCA 1GUKA 5ECOB 3UTGA 3OZ2A 3JCML 5G5FA 5IO0A 3LJPA 3QFBA 3UKHA 3AEGA 4Z24A 2ZUPA 4N30A 2WB9A 5J60A 3TGZA 4K0GA 5GSNA 1YY7A 1LBKA 3SZ0A 1DJNA 3VPQA 1T00A 3BCIA 3P7XA 3CXGA 3NK1X 1FW1A 1PS9A 3U5RE 4NXIA 2A4HA 1NHRA 2NBSA 1O5WA 3DA1A 1CC6A 3PR8A 3UJ1A 3U6VA 4APNA 3NTAA 4H4XA 2C76A 4A7AA 3HVVA 4OPCA 1FECA 2B7RA 4BPYA 1GTUA 3CGBA 1AIUA 5JCUA 2Q6UA 1O6JA 3VPTA 2XVEA 4ZBBA 2WU2A 1R4WA 3AE2A 1HQOA 2RGOA 5IPHA 4NPBA 5JCGA 5IQ1A 3A5IA 5D9WA 5J7XA 3DK9A 1AUCA 2AUVA 2VZ2A 2GS3A 2GZPA 3BI4A 4P9SA 3DXBA 1SYRA 2HRNA 3UKFA 1DE1A 1Y6EA 2GQLA 1DOBA 1LJ1A 2VQBA 3AYJA 4II3A 2VCTA 2YP6A 2FHEA 2MZCA 3DJJA 2A89A 4H4TA 3ZMKA 3Q74A 1CQHA 2YLZA 4G19A 5HFIA 1L9CA 1K0LA 1XXUA 1LQTA 3IXRA 1PD21 1TTZA 2CZ2A 1LTXR 3CGEA 5FWGA 1F6MA 3GIXA 3GL3A 4BV6A 2YG5A 2IPAA 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3UP4A 3KTLA 3GUSA 1YKJA 4GQCA 4TW5A 3GV1A 3O76A 1AXDA 2HSHA 4MJWA 2G2QA 3NZNA 4PNFA 1F6MC 3TCOA 1E7PA 3IF9A 1IYIA 2PUKC 3SM8A 2M80A 3MSZA 2DJ0A 1M9AA 2IMDA 4PAAA 3TOTA 2PMTA 1OKTA 5COHA 5U25A 3UOMA 2MBSA 2H76A 3REDA 3MAKA 1IUSA 4AGSA 5ECPB 4GSNA 4MF6A 4OPTA 4HU9A 3AE9A 2AYTA 2GSRA 1Y56A 1VG9A 3CRUA 3W8SA 3UP5A 2JL4A 4NEVA 3UEMA 5KVHA 2HSMA 4FYCA 1PN0A 4YT0A 3ERGA 4DSQA 2C75A 4ECBA 1X31B 2C0DA 2VL2C 2ZCTA 3KXOA 3VRBA 2LRNA 2N5BA 3LW9A 3Q18A 1DOEA 3DGQA 1BKWA 3MYDA 1TI1A 1IUXA 4G6HA 4ML1A 2PGTA 3IA1A 2LS5A 2VCQA 3CTFA 2AB6A 2XBIA 2WU5A 3LORA 4WR5A 3CGDA 5LD0A 4EQXA 2XVHA 3C4AA 1YJ6A 4YAVA 3NOFA 2OACA 5J3RA 4FYBA 4ID0A 3S61A 1E39A 2JBVA 1VRQB 3QDNA 3A2WA 3KM6A 2GAGB 2LSTA 1K0BA 1AQXA 3P1WA 2X50A 1IUTA 3IDVA 4RI6A 4ZL8A 2GQKA 5IPYA 2B5XA 4HB9A 4EXJA 2ZBWA 2DJ2A 5ECNB 3EWLA 3SQPA 4GF7A 4ZCDA 3LWAA 3ICTA 1WJKA 4OMVA 4OO4A 5KEJA 3P9UA 5JCIA 4D04A 1JOAA 4M52A 3VLNA 4QL7A 2XFUA 2RLIA 4H4YA 5KNLA 5BVAA 4UDPA 4MCUA 2XYOA 3N5OA 2WS3A 5BUKA 1Q9IA 4AT2A 2HRAA 4K7NA 5ECKB 1E1NA 3DIEA 4EL1A 2A4VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4CY6A

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

pfam database annotations