4CZFA

C. crescentus mreb, single filament, adp
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
337
structure length
329
Chain Sequence
ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEHPKWMKGVLEST
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
source organism Caulobacter vibrioides
total genus 105
structure length 329
sequence length 337
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czfA03
5I9EB 5F1XA 1EQYA 2QM1A 5BPNA 1LCUA 2GEMA 3I8BA 4FSVA 4JNEA 5CE3A 2P9SB 1JCEA 1BA1A 1DKGD 3BF1A 4BRGA 4FOEA 3ZETB 4XH5A 2ZGZA 3DXKA 2QWRA 1WOQA 2YJFA 2HOEA 4E1JA 5AZJA 5AQRA 5B8HA 3GDQA 3HBTA 2QXLA 4BR4A 4M7YA 3O8MA 4AM6A 3ATUA 2CH6A 5AFUA 1KAXA 3CIPA 4ISEA 5KPTA 5AZIA 3CERA 5BPLA 1KAZA 2ZGYA 4H5TA 3WXJA 4BRHA 3BUZB 3QBXA 4H0OA 4DB3A 1BDGA 4BR5A 4FPAA 1GLLO 3M6GA 5AQIA 2P9PA 1MDUB 3VETA 1QZ5A 1GLBG 1TYQA 2E2QA 1XC3A 3GG4A 3DXMB 4MO5A 3FZMA 5AQVA 4FWOA 3LL3A 3R9PA 4C23A 5FPMA 1KXPA 2F9TA 1ZXOA 2FLOA 3HM8A 3O6WA 4CD1A 4CZMA 1ZBSA 4A2AA 3GE1A 5JMVA 1R59O 3H6EA 3I33A 1G99A 1HKGA 2GWJA 2GELA 1GLDG 2P9PB 2V7YA 5EXWA 3D2EA 3SJHA 3FGUA 3VEVA 5AQUA 4B1XB 4CZHA 2HF4A 5FPDA 4FWLA 3UKRA 4BQZA 1BOTO 4JAXA 4K43A 1HLUA 5FPEA 4JHDA 3WXKA 3WXLA 1TUYA 3FZFA 4QS8A 1MA9B 2P9IB 3SLCA 4BG9A 3BP8A 4FWQA 3VEZA 2YI1A 5BRFA 1ATNA 3EKSA 3VEYA 1T44A 3MN5A 3RSEB 4JD2B 2W41A 3CQYA 2PAVA 1MWMA 1ESVA 3A8YA 3W3DA 3U8XA 2YHYA 2YHXA 5AQYA 3UKUA 4PKIA 3MDQA 2FSKA 3CJ7A 3FLCO 3FE1A 2A40A 3MK6A 1HKBA 3W0LA 3HZ6A 4BVPA 4K42A 4WQ4C 2BTFA 2NRHA 2P9NA 4L3QA 2ZWHA 2Q2RA 2P9KB 3A5NC 3GOIA 1Y64A 2EWSA 3OHRA 1T6DA 2D0PA 4WQ4A 1CZAN 4FWNA 3AAPA 1IJJA 4CI6A 3MMVA 5BN9A 5AQPA 5AQZA 3UKUB 4BRNA 3IFRA 1T6CA 4FWMA 3MN9A 3ENHA 5BN8A 4FL9A 2J4RA 3H3OB 3WEEA 2F9WA 3WXIA 4K41A 4BG8A 4BRCA 2V52B 4GNIA 5EY4A 1DEJA 3D2FA 1NGGA 1KAYA 1BA0A 1K8KA 1D4XA 3CJCA 3DJCA 5AQWA 5KPRA 3O5BA 4O5FA 2IVPA 4CZLA 1Q18A 4I6MA 3GBTA 1IG8A 4CZFA 1HPMA 2ASOA 4H0TB 2FSJA 2A42A 3QICA 5AQKA 5AQQA 2CH5A 3H46O 3U9DA 3UE5A 2HF3A 4B1WB 1SAZA 3KVGA 3C7NA 3VERA 3ZEUA 2ASPA 3O1WA 1JCGA 2QWMA 4FWKA 4IZ9A 3IDHA 1H1VA 3D2FB 1BWFO 3ULEA 5FPNA 2YHWA 1X3MA 3EL2A 3L4IA 2PBDA 3DWLA 3DXKB 4NO7A 2BUPA 2Q0RA 3VESA 2Q0UA 4Y0WA 5AZJB 3KZBA 3QFUA 4BR2A 3DAWA 2IIRA 2AA4A 4XH4A 3SMSA 1E4GT 3WUHA 2NLXA 2IVNA 4H0YB 1YUWA 2FF6A 3CJ9A 5AZIB 2HMPA 4EIAA 1U2VA 4B1ZA 4O8KA 1BUPA 3AAQA 4MO4A 2QWLA 3SMPA 2ITMA 5AQJA 1GLCG 2E1YA 5EVZA 1OKJA 2W40A 4A61A 3CJAA 5AQLA 3QBWA 2QWQA 2E20A 4FWSA 3ZX3A 3FZHA 3M1FA 2UYTA 5JICA 1TYQB 3JXUA 4EFHA 1YAGA 3LM9A 3VF2A 1V4TA 3R6MA 3D7EO 5KQDA 4QS9A 1YXQA 4BRMA 5E26A 1X3NA 3L0QA 4IO8A 4PKHA 4IXCA 3VGMA 3LDQA 3LDPA 1NGCA 4BRQA 3HI0A 4H5VA 5KQ8A 3U9ZA 2P9LA 2A3ZA 4CBXA 3VGKA 4LC9B 1X9JA 1HKCA 3D2EB 4QS7A 5AQMA 4CZIA 3J8AA 3O80A 4B1UB 4CZKA 3ZX2A 1NWKA 4IJNA 2D0OA 1QHAA 1ZC6A 1SZ2A 3C0BA 2AP1A 3UKRB 2VYPA 5AFUH 3CHWA 4JHDB 1Z6RA 1QQOA 2Q31A 4H0XB 4JN4A 1ATRA 4B1YB 1HX1A 2CGKA 4EAHD 3FR0A 5AQFA 2DPNA 4CZEA 2FSNA 1SQKA 5EOYA 3P4IA 2P9UA 4BVOA 1GLFO 2WUSA 4NB4A 4FPBA 4BREA 4IWVA 3VENA 3H3NO 4DHYA 3LDNA 4B1VA 4BRIA 3U4LA 4BC2A 3ENOA 4CBWA 4MLHA 4DQ8A 3HTVA 1NGBA 3L6QA 5KPZA 3EKUA 2I7PA 4BRAA 4ISGA 5LY3A 2P9NB 4PKGA 1NGDA 3JS6A 2Q97A 2P9SA 3WQUA 3VGLA 2OANA 3R8EA 5F0XA 2E88A 1NLVA 2A41A 1NGIA 3QB0A 5BRDA 2GUPA 4BROA 3MCPA 2YCHA 3MN7A 1V4SA 1TUUA 1U6ZA 4HTLA 3ID8A 2ASMA 4FOIA 3FZLA 4BRDA 1QQMA 4H0VB 3S41A 3O4WA 3H45C 2E8AA 3O08A 5AR0A 3WEEB 3F9MA 4FWRA 5AQNA 4MLEA 4BR9A 1MWKA 3B8AX 1NGFA 1WUAA 4HWIA 4K25A 4H5WA 4BC4A 5AQGA 2E2NA 2V7ZA 5JLFA 3H1VX 2VCPA 1K8KB 1BO5O 1S3XA 2E2PA 4BRPA 2QWOA 1RDWX 2Q1NA 3FZKA 3G25A 5LJWA 2QW9A 4I6MB 4PL7A 3H1QA 4RCHA 3DXMA 5ELZA 3CQXA 3VEOA 1ATSA 4J8FA 3TU5A 3C7NB 3ZEUB 4IJAA 1NBWA 3GL1A 4M7XA 3EO3A 3QMLA 4RTFD 1NGEA 1C0GA 3ULEB 2D4WA 1Z05A 4H5RA 1QZ6A 3AY9A 5BR9A 4BGAA 4WYBA 4BR0A 3QDKA 3A0IX 3KHYA 2E1ZA 4GY2B 4B9QA 1NGJA 2I7NA 2KHOA 5F2RA 3WQTA 3EN9A 5BPMA 5ADXH 2NZTA 4KBOA 4BRFA 1S22A 2H3GX 1U2VB 3CJBA 4Z94A 3LDOA 1DGKN 4CD3A 2P9IA 5JLHA 3IUCA 3SK3A 1HJOA 3LM2A 4A2BA 4BQLA 3WT0A 3AARA 1BG3A 5AQHA 2GWKA 3RSEA 3BEXA 4JD2A 1QQNA 1BU6O 1NMDA 2V51B 4YDUC 4BC5A 2A5XA 2YJEA 4ISFA 5E84A 4RWTA 3A5LC 4EHTA 3A5MC 4M63C 1RGIA 3CJ1A 2Q36A 3UB5A 5LJVA 5TKYA 4YDUA 1JCFA 1E4FT 2E2OA 5AQSA 4H0PA 2IVOA 3IMXA 2A6AA 1LOTB 3ZX0A 4XH1A 2QWPA 2CGJA 2P9LB 1NGAA 2ZF5O 5EX5A 2P9KA 3EZWA 1NM1A 4FWPA 4CZJA 3MN6A 4EHUA 4WQ5C 3VEWA 3VEXA 3VOVA 3VF6A 4AM7A 5BREA 1C0FA 5AQXA 4DCHA 3ATVA 4BRKA 4WQ5A 2GTDA 1NGHA 5BRHA 4XEIA 1XQSC 1GLJO 4BGBA 3VPZA 1HUXA 3TPQA 4CJ7A 2CGLA 5AQTA 5AQOA 4A62A 1XUPO 2P9UB 3HSCA 2VWBA 1P8ZA 3BF3A 3CI5A 3FFKB 3VF4A 4BR7A 4PL8A 3CETA 4CZGA 4FO0A 3O1BA 3ZETA 4CBUA 2QWNA 1J6ZA 3A5OC 1GLEG 2FXUA 4H03B 4F9OA 1YVNA 3M3ZA 4H5NA 4BC3A 2FF3B 5ADXA 3LDLA 3QFPA 1GLAG 1RFQA 2D1KA 4BRLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CIEA 3SV3A 3CPWM 1YJ9N 3CCSN 2G8HA 1XHXA 2P9SB 2OZSA 1BA1A 5J2PA 3DLEA 3R1XA 3DXKA 3TTDA 2YNGA 1RDAA 1VQPN 3GDQA 2KQ2A 5FROA 5AFUA 4GKKK 5BPLA 3OYAA 3QLHA 1CLQA 4BRHA 1HNWK 1BDGA 3P1GA 3KK2A 4KHWA 1YTUA 3CG7A 1IG9A 1YTAA 3AVNA 1GOBA 4F3TA 1MDUB 3E9PA 1GLBG 4KPYA 4HHTA 4CGDA 4B3RK 4MO5A 3FZMA 5AQVA 4CJTA 3OJUA 1X1PA 1TAQA 4E7IA 3BDPA 3R9PA 3M5RA 3RVCA 2VG7A 3HM8A 3O6WA 1ZBSA 4XIUA 4LF8K 3SAFA 1GLDG 4DR2K 1HNVA 3D2EA 3RRHA 4KTZA 4RW6A 3G10A 1JXBA 5FPDA 2W6KA 4DF4A 4CIGA 1VSIA 4M42A 1BOTO 4DFPA 4LF5K 3WXKA 3WXLA 3VQEA 4JKHA 3OYDA 4DTMA 2KFNA 3AO3A 4O5BA 3BP8A 3VEZA 1RTJA 3VEYA 4FCYA 4JI0K 3RSEB 3QEXA 3V9XA 2W41A 3CQYA 1ESVA 3A8YA 3V1QA 1NOZA 3BGRA 3U8XA 4CK1A 2YHXA 3SNNA 4CFBA 4OVLA 4PKIA 3SI6A 3NVKA 3K5OA 3CJ7A 3NF8A 2WBNA 1BCMA 2BTFA 1HNZK 4B8CA 2NRHA 2ZWHA 3ZT3A 3IS9A 2Z1GA 3CYGA 1IJJA 4ZHRA 1HPZA 3KK7A 3MECA 5BN9A 5AQZA 2HMIA 3DLKA 4JI8K 1X9MA 4W5OA 4DLGA 5HOOA 4DSIA 4FWMA 5HL7L 3AVHA 4Q0BA 3U3YA 3V1RA 5BN8A 4WFAL 3AA4A 3CFRA 3H3OB 1RT3A 3LANA 4NCGA 4YHHK 3S5TA 2G8IA 4DTUA 4BRCA 4RW9A 4GNIA 5EY4A 1DEJA 3O9TA 4CGHA 5HP1A 2P1JA 2ZQBA 4FXDA 1RILA 3AVLA 5IWAK 4CGFA 3OYCA 3QESA 4FJJA 4FLWA 5KPRA 4O5FA 2RN2A 3IKMA 4I6MA 3GBTA 1WNSA 1OH7A 1FJGK 1Q8IA 1HQUA 3VQAA 4OLBA 3QICA 2HF3A 4B1WB 3C7NA 1D8YA 4DKWA 2QWMA 5D3GA 4DR4K 2HBJA 4LH5A 3AO4A 3I56N 5JVHL 2KW4A 3BY5A 5FPNA 3AVGA 2ITGA 1WSJA 1X3MA 3EL2A 3L4IA 1KRPA 1JLFA 4LSNA 3KZBA 2RPIA 5H1SQ 4PWDA 1RDUA 3EE9A 3PSFA 2LSNA 3SMSA 2NLXA 3QO9A 5LMNK 3V9SA 3CC4N 4DTSA 5AZIB 1JLQA 4B1ZA 3CXCM 5AQJA 3RR7A 1ITGA 3DOKA 3C65A 2W40A 3KWGA 1RDDA 2E20A 1BQNA 2UYTA 4AHCA 2YHBA 1Z26A 4EFHA 1RNHA 1N33K 5KQDA 4DQRA 4QS9A 4BE7B 3C6UA 4E7KA 1X3NA 3L0QA 1QE1A 2XRIA 1I94K 4YOTA 3LDQA 1NGCA 2O8DB 4H5VA 3L3VA 3U9ZA 3OYJA 2PZSA 2A3ZA 4CBXA 3KLEA 1NK4A 3DYAA 1IO2A 3Q7CA 2F8TA 4DR6K 4FJ5A 5AQMA 1IKYA 2UXBK 4DV6K 3J8AA 1EP4A 4CZKA 3WXMB 4BACA 3KD1E 4IJNA 2D0OA 1QHAA 3DM2A 1ZBHA 2VG6A 1U49A 2Q31A 2QEXN 1J54A 1VQON 4B1YB 3CCRN 1YHQN 1RDCA 5GIPA 4A59A 1QHTA 2P5GA 3P38A 3B6PA 1TK5A 1SQKA 1LWEA 2Q3SA 3K5NA 4BREA 4FJ8A 1CZBA 5M1NA 3LDNA 4C8MA 2Z1HA 3ASMA 4E89A 5C2DA 2HVIA 4DQ8A 3F2KA 3HTVA 3L6QA 3VQ8A 2I7PA 4BRAA 3NHGA 3ZSRA 3S3MA 3SQ2A 3QEIA 2DFHA 2P9SA 3WQUA 2OANA 1NGIA 3ID6A 2IC3A 3ZCMA 1V4SA 3T3FA 2Z1JA 2ATQA 3ID8A 3VQ9A 1QQMA 4H0VB 1ZBIA 4U7BA 4CFCA 1YT3A 4DQSA 5AR0A 1LAVA 4KHYA 1EETA 4BR9A 1T7PA 1MWKA 4MFBA 4K25A 4H5WA 1TVRA 4BC4A 3U6FA 3HVRA 4N47A 3H1VX 3QIOA 4H4MA 3QNNA 2E2PA 4KREA 2HBLA 1TKTA 4I9LA 3KLHA 2X6NA 1RBTA 4XJXA 3CQXA 4FLYA 1VQ7N 3ZEUB 4CEEA 3NF9A 4DUYK 1NBWA 3MEDA 1L3SA 2XO7A 1GOCA 3EO3A 4JEPA 4OGCA 4CK2A 5BR8K 5MLCQ 4ELVA 3AY9A 1Q9YA 4AQYK 3QDKA 1YVUA 4GY2B 5CR4A 3T69A 4DR5K 1W2BM 5CZ2A 2HHWA 5F2RA 1I39A 1NKEA 3EN9A 4YOVA 4KBOA 1SL2A 4BRFA 2HHQA 4Z0UA 3WNGA 3OY9A 3MAQA 3KIOA 4W5TA 3LP0A 5JLHA 3IUCA 2FC0A 4FZYA 3RSEA 1SUQA 3BEXA 3V6DA 2A5XA 3OYBA 3A5LC 3P83D 1TK8A 4M63C 4BE2A 3CJ1A 2Q36A 4H8KA 1N8RO 4N5SA 2YKNA 5TKYA 1E4FT 1XC9A 2PYLA 2IVOA 1TV6A 2A6AA 4GV6A 3ZX0A 2QWPA 2P9LB 2ZF5O 4R5PA 3AA5X 3KK1A 3CCVN 3DI6A 3P5JA 4FWPA 4DFMA 4CZJA 3AO2A 3AVJA 3VEXA 3KLGA 1A5XA 4CEBA 3NGZA 3SZ2A 1VRUA 1NGHA 1C6VA 1XQSC 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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