4D9U | Genus

Total Genus 92

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	92
sequence length	307
structure length	307
Chain Sequence	VQQLHRNSIQFTDGYEVKEDIGVGSYSVCKRCIHKATNMEFAVKIIDKSKRDPTEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYDDGKYVYVVTELMKGGELLDKILRQKFFSEREASAVLFTITKTVEYLHAQGVVHRDLKPSNILYVDESGNPESIRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLERQGYDAACDIWSLGVLLYTMLTGYTPFANGPDDTPEEILARIGSGKFSLSGGYWNSVSDTAKDLVSKMLHVDPHQRLTAALVLRHPWIVHWDQLPQYQLNRQDAPHLVKGAMAATYSALNRNQ

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords	Ribosomal protein S6 kinase alpha-3
publication title	Reversible targeting of noncatalytic cysteines with chemically tuned electrophiles. pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	92
structure length	307
sequence length	307
ec nomenclature	ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date	2012-01-12

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00069	Pkinase	Protein kinase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4d9uA02
3.30.200.20	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Phosphorylase Kinase; domain 1	Phosphorylase Kinase; domain 1	4d9uA01

4G6LA 4FV8A 1SM2A 2VWXA 4YHJA 5EW9A 3VS0A 3VUTA 4Y95A 4HVGA 1PXPA 4M12A 5E1EA 4BGGA 3CS9A 3U8WA 3W32A 4RA5A 4YTFA 5AAFA 3KMMA 3GC7A 1R78A 4FMQA 5H2UA 3LCOA 3EZRA 4J52A 3R00A 3GCUA 3N51A 4TRLA 5ANGA 2PZ5A 2ZV7A 4K8AA 4PMMA 5IA1A 2X81A 3IONA 5CY3A 4AN2A 2R7IA 3PG1A 2VWBA 3M42A 4UMRA 1F5QA 2WPAA 3S95A 3SXRA 2Q83A 1M14A 3BBTB 3MTLA 3F82A 2YDJA 4MCVA 2GQSA 1UWHA 2RFSA 5IA2A 4FKVA 5IKWA 1OPLA 3P4KA 4QP9A 5BMSA 5HHWA 1J7UA 5FDPA 2C5NA 5I9XA 2XNNA 4LUDA 3IQ7A 1MQBA 4OTDA 2G01A 3F66A 1L8TA 2XNMA 2J0JA 4K9YA 4KSQA 4P4CA 4CFNA 3LHJA 4DGOA 4ZLYA 3KL8A 4EOMA 4FV0A 4JRVA 4B8LA 5BVKA 4XG8A 2EVAA 4XV2A 3VBVA 5IA4A 1U54B 4HGSA 4UY9A 3P86A 4BGQA 4BBEA 1H07A 4IB0A 4RJ8A 2QCSA 3ZLWA 3DPKA 3IW7A 3NW5A 2DQ7X 3KU2A 4HZRA 4LGGA 1STCE 4QYGA 4R1VA 3R1QA 4ZSGA 4IBMA 3A61A 3QQHA 4I5PA 2QOKA 2QVSE 3L8SA 2WAJA 5BYZA 1Q8TA 4IVDA 3VHEA 4D4YA 3Q4TA 2C6KA 2QOBA 3A7FA 2WIHA 3E8NA 3ZZWA 4DGGA 1U4DA 1KUTA 4PPAA 5FTQA 1Q99A 3LVPA 2ZDTA 4ZAUA 3SOCA 4C59A 3F2NA 2WMQA 4HCUA 3OBJA 2Y9QA 4N6ZA 2UZWE 4YTIA 2WTKC 5CXHA 5FP5A 2ZB0A 2OIQA 3ZC5A 3NAYA 4FTTA 5I0BA 5BPYA 4XUFA 4FSRA 5D41A 2VWYA 5FEEA 2V22A 3NDMA 3NNWA 5AP5A 4A9UA 4Y85A 4OW8A 4EBWA 3UIUA 3SKCA 1ERKA 2CPKE 3OTUA 5EDRA 2R3PA 4GV1A 5TOZA 2HXQA 2JAMA 3ANRA 3BLRA 4R5SA 3NPCA 3ROYA 1JVPP 3VW8A 4USEA 4RVLA 5FM2A 4G3FA 4XRLA 1M7NA 2PVLA 2ZM1A 3ORZA 3MY5A 4EOLA 3DK7A 3R21A 1T45A 1XKKA 4CKJA 1H4LA 5K0XA 4YLLA 4W4WA 3W2PA 4CQGA 5GZ9A 4QT1A 2ITXA 4MKCA 3VIDA 5KMOA 5KNJA 5HCZA 2WTCA 5FQDC 4C4HA 1YOMA 3SXSA 4QYEA 4M15A 4MYGA 3VF9A 3WF9A 2RKUA 4YJPA 5JEBA 3DXPA 4E4XA 4DHFA 3KRJA 2PSQA 5HCYA 4S34A 2JLDA 4TWPA 4JX7A 3LXKA 2XNBA 2VO7A 2ZM3A 4FL1A 3I81A 4ZY5A 4C62A 4J97A 3TEIA 5CEOA 4D2VA 3KVXA 5A4EA 1GIJA 4WO5A 1YI3A 3QKLA 2GQRA 3AC5A 3RPRA 4FF8A 1Q3WA 4UYAA 4RIYA 1ND4A 4QP3A 3FMLA 4O0RA 4O0XA 4YJUA 3HA6A 2XEZA 4KABA 1SZMA 3QQUA 5KZIA 4DH1A 3MIAA 4QPAA 5E8VA 3VS4A 2QOIA 4QRCA 4CMTA 4DGLC 2WGJA 3NUPA 1QPJA 2IW6A 3ZYAA 3LCTA 3RK7A 5IQAA 3L9LA 3DJ6A 3F5UA 4XLIA 2J5FA 2VTTA 3ZH8A 2PE1A 3H9OA 4FI1A 3KMUA 3KXHA 3MA3A 3GVUA 3QGWA 2QG7A 2CCHA 3ANQA 3GI3A 4JG7A 4GG5A 2W1GA 3SOAA 5IQGA 4BZDA 3VBXA 4EOSA 1Q97A 5ICPA 4C61A 3PTGA 4FYNA 4XV9A 3HA8A 1KOAA 4AOJA 2YLEA 4F7JA 5E8TA 2BRHA 2ITZA 4LOPA 3HGKA 3E7OA 4KWPA 4YNOA 3D4QA 5HKMA 2OJJA 4AGDA 2YZAA 3R83A 3PIZA 3CR0A 4O22A 2IVTA 3RPVA 4YUQA 4MXYA 4D2SA 2UV2A 2JKQA 4ID7A 3KFAA 5FWKK 2WMTA 3T3VA 5L2QA 5IH5A 4RSSA 1OL7A 4Q9SA 3JS2A 3FXXA 3ATSA 3R9RA 4D4RA 5C1QB 3GENA 3GU6A 3S1HA 2PMNX 4JBQA 3ZXZA 1OVEA 3GOKA 3P1AA 2GHLA 4TTHB 5DT3A 4EK5A 5IG1A 3NS9A 5HGIA 4AWIA 2VRXA 4NTSA 3MPMA 1YWNA 2Z7RA 5DEYA 2H96A 4GU9A 4GT3A 1O6KA 4PP7A 5EOLA 5IH4A 1G3NA 3RTPA 3UOJA 3BU5A 4TN6A 4Y73A 3UO5A 1OB3A 3V5TA 4JR7A 1YHWA 4NW5A 3FPQA 4XLVA 3QZFA 4MBJA 3BEAA 3GU4A 2WFYA 3LJ1A 1ZZ2A 3ALNA 3E8EA 4L3JA 5DIAA 1FVVA 4LYNA 3ZFXA 4U44A 5HLPA 3CD8A 4Z7GA 3ALOA 4CV8A 2OFUA 3VJNA 4E4MA 4PL4A 4QP4A 2BR1A 4ACCA 4QMPA 1PMNA 3RAWA 4QPSA 3VHKA 5K5NA 2CMWA 4LUEA 4X21A 4QD6A 2B7AA 1DI8A 4YSJA 2R64A 3UOLA 4FOCA 4ZTLA 3SDJA 3V5PA 3DQXA 4DFLA 4RX7A 5IZFA 3GUBA 3QRKA 3UQGA 3V5QA 4FEVA 3OG7A 5DHJA 5DBXA 3HZTA 5CSXA 3EMGA 5ANEA 3V04A 4AZEA 4TXCA 4XS2A 4II5A 1YWVA 4NH1A 4QMVA 4CQEA 1NW1A 2VTQA 3H10A 3WYYA 5KBRA 4CMUA 5FXRA 2R2PA 2B0QA 3RNIA 4OGRA 4ZOGA 2ITTA 1QMZA 4EH6A 1H0VA 2QOFA 1YHSA 3DDQA 3PXFA 3MVMA 5CI7A 4PL5A 3FJQE 2W17A 4B4LA 4IANA 4NM5A 4NZWB 4QYYA 2GNGA 1YXXA 5HLWA 2RL5A 5C27A 4ZJJA 3OVVA 4C3RA 3I6WA 4WHZA 2UW4A 2XK8A 5I4NA 3O51A 4BKYA 5AP0A 4ACDA 4O82A 2Y7JA 5AMNA 4ACHA 4IAYA 3KQ7A 3Q52A 5DE2A 2ZM4A 3QQKA 4C4FA 4W8EA 3DJ7A 5AP4A 1FQ1B 4ZS0A 3UPZA 3LFAA 3PLAE 2X7OA 4H3BA 4FZAB 1YDRE 4ZTNA 4C3PA 2GFSA 1A9UA 4EUTA 3IKAA 3QWJA 4L01A 4G6OA 4BWXA 4W4VA 2H8HA 4IWDA 4TWCA 4XG9A 3F5XA 4ZTHA 3FZTA 3UDBA 4YZMA 3WILA 2W4JA 4YHFA 3PRIA 2VWVA 5D1JA 3UVRA 4RJ5A 3G90X 3TM0A 2WHBA 1REKA 3KF4A 4Y8DA 1IA8A 4YZ9A 3W16A 4J96A 3DAEA 4NM3A 4S32A 3VNTA 1RW8A 3EN5A 3LQ8A 3UNZA 4Y46A 3E7VA 4DFXE 4EOOA 2HXLA 3N9XA 2YISA 3GU8A 4YHTA 4IDTA 4FZFB 4DEIA 1AGWA 5EHLA 2XKFA 3WBLA 3IG7A 2NNWB 2F2UA 5IMXA 2JKMA 3FKLA 4U5JA 1KE8A 3QQJA 3PSBA 4RZWA 5IUGA 3NVKI 4IE9A 1ZLTA 2IO6A 4U9AA 3TN8A 3ZEPA 2UZNA 2BMCA 4O0UA 3QTSA 4ZJIA 1CKIA 4CYIA 5KMNA 1KE7A 2YM6A 4HZSA 4N6YA 4E6AA 2X0GA 3ZFMA 3TDWA 2VTLA 2ACXA 5EM6A 3SW4A 2OJFE 2CNVA 2PE2A 4KS8A 2H6DA 4QMZA 2BPMA 3VBYA 4BCOA 2Y8OA 4JQ7A 4O27B 5KKRC 4D5HA 4PL3A 4WSYA 3WIGA 2JDOA 4AOIA 4UN0C 4YU2A 3LFDA 3QD4A 3CIKA 3R02A 3EH9A 4FKUA 3UMXA 1E9HA 5EDQA 5FXSA 2PU8A 1U59A 4N70A 5LWMA 2B4SB 3II5A 4K1BA 4AZVA 5L2IA 2W1CA 4F6UA 3PXZA 5AR2A 4MXXA 1H28A 3IW4A 4U43A 2UZDA 2B9IA 3A8XA 5D10A 4OTFA 4U97A 4CVAA 3LFQA 1L3RE 4RX9A 4ZMEA 1PY5A 3NYVA 2CKEA 2RFEA 1NVRA 3NYNA 3H3CA 3QRIA 4JXFA 1H27A 3NUSA 4U81A 1LEWA 5HVKA 3KCKA 5KMMA 3TJCA 4G17A 1YW2A 3MY0A 3TCPA 3NRMA 4LQMA 5L4QA 3U6JA 2WMRA 5JKGA 5CU0A 2PZYA 3NCGA 4GUEA 5HU3A 5CVFA 3EN9A 2QU6A 4ANSA 4EHZA 2VU3A 4AZFA 1CM8A 3PPZA 4Z9LA 1S9IA 4FG9A 4BCFA 1IG1A 2PZPA 4MD9E 4ITJA 1PYXA 2XJ0A 3RALA 3VBQA 3U55A 2WMUA 4KKHA 4PNIA 1M2PA 3QWKA 4AA5A 3DNEA 4J1RA 3JXWA 5L6OA 3HMPA 4E20A 2A1AB 3AT2A 4BCMA 4C0TA 3HV3A 3PXQA 5ACBC 4CKIA 1Q8ZA 1G8AA 3NUYA 3KULA 3R7OA 3R7YA 2RFNA 3ZU7A 5EM7A 2JKOA 3BV2A 4EI4A 2WMBA 4PV0A 1VYWA 3Q04A 5AX9A 4YURA 4TWOA 3A99A 1I09A 2BZHB 3PA4A 5AUVA 3UG2A 3DA6A 3WZKA 4IZ5A 1JQHA 2OXYA 3DKOA 3I79A 2OI4X 4AU8A 4EOIA 1JSVA 2BKKA 3E62A 2EU9A 3MH2A 4KIOA 4L3PA 4F65A 4ANQA 4RIYB 3R8LA 5BQ0A 1H0WA 2JDTA 3QD3A 3ZO2A 4RX5A 3DJ5A 3KRRA 2FSOX 1JKKA 2JIUA 3ZSIA 5FXQA 1Y6AA 3A2CA 4RIXA 2BRBA 5EG3A 1NT2A 3FKOA 4FIEA 3P08A 4FTJA 2YWPA 3UIBA 3QC9A 3NWWA 4U7ZA 2QO2A 1KSWA 3WE8A 2UW3A 4QMTA 4FBXA 4I0SA 5K5XA 2YA9A 5JFWA 4YO4A 2GDOA 5AUYA 4XH6A 1Z9XA 4EQCA 4FZ6A 5EKOA 4FV1A 2GFCA 4XOYA 3WZJA 5B7VA 2GTMA 4EHEA 1T46A 4I22A 4TY1A 3MFSA 5CANA 3BWFA 3EQGA 1BKXA 4QQ5A 5I3OA 5IQDA 1W98A 3RVGA 2VTPA 4BICA 4CZUA 3FXWA 4RPVA 5ACKA 1OECA 3C13A 1J7LA 4EJNA 4D1XA 4C4JA 5KHXA 3DTWA 4EWQA 4QP8A 5I3RA 2XBAA 4YJVA 4B7TA 1M2QA 3LJ0A 2OG8A 5EW3A 2XKEA 2C6IA 3WOWA 3R04A 4UBAA 5CQWA 5CX9A 4ANNA 4MQ2A 2H34A 3C51A 3F88A 2OJIA 3RAHA 2V7AA 2CSNA 2HZNA 2JGZA 2I0VA 4FVQA 4LOOA 5BUJA 5M44A 4ZSAA 4N4SA 5KMJA 5DRBA 3BEGA 3GT8A 5FM3A 4BDDA 3PVBA 2J6MA 4I6HA 4GK2A 3ROCA 4IEBA 4NL0A 5B2LA 1ZARA 5E8XA 5HG9A 4EQMA 3HV5A 5EQPA 3ACJA 4DE4A 3HAMA 4LMNA 4ACMA 5AUUA 2WTWA 3UMWA 3FPMA 3QCQA 1OL1A 1ZOEA 5HVYA 5CLPA 4A9YA 2P55A 2XIZA 4C7TA 5M51A 3QF9A 4BHNA 3FYKX 3CKXA 4TT7A 4MVFA 5A9UA 3POZA 3VS7A 4RJ7A 4QP6A 3VS6A 5CU3A 4D58A 3PRFA 4AT3A 2J90A 3ZS5A 1WZYA 4F9WA 2C0IA 4R6VA 3CY2A 5HNBA 2JAVA 3LAUA 4I5MA 3S4QA 4C2WA 2YAKA 3AT4A 3BWJA 3A7JA 2LAVA 1R0PA 2WTJA 3FLYA 2I40A 4FEQA 4L67A 4B9DA 4IM0A 4RJ4A 3AD6A 3ELJA 3R30A 5HO7A 3EFWA 3MH1A 5IQHA 1H25A 5HE0A 4DEBA 3KC3A 4HGTA 4I5CA 5IU2A 3I0OA 3SLSA 4DG0E 2IVSA 3N4UA 4AFJA 2Q0BA 4QMWA 4R3RA 2XH5A 4HVHA 2XYNA 3QTIA 4FKGA 4QYFA 1TVOA 4C4IA 4HGEA 2OIBA 3S00A 3UVPA 4L52A 5KZ0A 4NM7A 2NPQA 5L6WL 5F1ZA 1Q62A 4FIGA 5E8YA 4WIHA 1JNKA 4BIEA 4E6DA 2WOTA 3CXWA 3IW5A 3ZBFA 2CGXA 3HV6A 3G15A 4G9CA 4F0GA 4KD1A 3HDMA 3HUCA 3H9FA 3FZSA 4I23A 3V6SA 2LGCA 3MIYA 5DYJA 4LMUA 4BTFA 5DVRA 5BNJA 5AFVA 4HCVA 4O0WA 4FTKA 5AP3A 4O7TA 5C8NA 4E7WA 2Z8CA 2XNGA 3ODYX 4BCHA 1W7HA 1GY3A 1ZYCA 3EQCA 3W2OA 5EYCA 3ZSGA 2ITOA 2YDKA 3IGOA 4TWNA 5E8ZA 5IQEA 4CT1A 3B2WA 3RAIA 2W1HA 3BQCA 3D2IA 1YKRA 4E5WA 4L43A 3Q9WA 3C7QA 5AIKA 1OUKA 3G6GA 3QYZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4D9UA

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