4DQ8A

Crystal structure of acetate kinase acka from mycobacterium marinum
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
380
structure length
373
Chain Sequence
NRVVLVLNSGSSSLKFQLVEPDSGMSRATGNIERIPDHDAALRRVFEILAEDDIDLQSCGLVAVGHRVVHGGKDFYEPTLLNDAVIGKLDELSPLAPLHNPPAVLCIRVARALLPDVPHIAVFDTAFFHQLPPAAATYAIDRELADVWKIRRYGFHGTSHEYVSQQAAEFLGKPIGDLNQIVLHLGNGASASAVAGGRPVETSMGLTPLEGLVMGTRSGDLDPGVIGYLWRTAKLGVDEIESMLNHRSGMLGLAGERDFRRLRAMIDDGDPAAELAYDVFIHRLRKYVGAYLAVLGHTDVVSFTAGIGEHDAAVRRDTLAGMAELGISLDERRNACPSGGARRISADDSPVTVLVIPTNEELAIARHCCSVLV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Acetate kinase
publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium marinum
total genus 124
structure length 373
sequence length 380
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2012-02-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4dq8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4dq8A02
4K42A 3VENA 2GELA 3A5NC 3FZKA 2E2PA 1J6ZA 1OKJA 3O6WA 1E4FT 2J4RA 3ZX0A 3R9PA 4L3QA 4FWOA 2QXLA 1QQNA 2CGLA 1MWKA 3O1WA 4XH4A 1GLJO 3GDQA 3DJCA 3W0LA 3GG4A 1NGAA 1DEJA 1T44A 3WXKA 3KVGA 5AQGA 3MN9A 3SLCA 3CERA 3M1FA 4NB4A 4C23A 1BOTO 1YUWA 2ASPA 4B1XB 3D2EA 4DCHA 1SZ2A 4CBXA 3SK3A 4NO7A 2GTDA 5LJWA 3DXMA 2E2QA 3VETA 3KZBA 3VEXA 2D4WA 2QM1A 1SAZA 3D2FB 2ZWHA 1NGDA 1BO5O 5B8HA 2D1KA 2P9SB 3ATVA 2GUPA 1U2VA 4QS9A 4A62A 4H5VA 2QWQA 3O5BA 2Q97A 4M7YA 5JMVA 1JCGA 1KAXA 3TPQA 2FSJA 3JXUA 4BRCA 5AQLA 5I9EB 3TU5A 5F2RA 4BR4A 1X3MA 3KHYA 3ZETB 1ATRA 3CHWA 1Q18A 3QICA 1JCEA 2F9WA 3DXKB 2E1YA 4JNEA 4CD3A 1MWMA 4BRIA 4H0PA 2ASOA 3FLCO 4BC2A 5FPDA 2GWJA 2DPNA 4K25A 5F1XA 3AARA 2P9NA 1LCUA 3QBXA 4XH1A 4BR7A 4WYBA 2P9UA 3A8YA 2YHWA 3U8XA 4XEIA 1QZ6A 4BVOA 5JLFA 3VEZA 2ZF5O 1GLAG 3EKUA 4H5NA 4QS8A 4FO0A 4BRAA 3EKSA 4H5TA 1K8KA 4BVPA 5AQMA 3GL1A 3L0QA 3A5LC 2CGJA 4O5FA 2PBDA 4BRFA 4EIAA 2QWRA 1TYQB 3ENHA 4B1WB 3ENOA 2FLOA 4FWQA 1WUAA 2VYPA 4BRGA 5BRHA 4WQ5A 1TUUA 3LDNA 4PKGA 3FZHA 3O80A 2CH6A 3L4IA 4B1ZA 3WEEB 2Q36A 3WQTA 3ULEA 2W41A 2P9KA 4IWVA 5AQIA 4IJNA 2E8AA 4BRLA 1RDWX 2IVOA 2BUPA 2P9IA 1BDGA 2YI1A 3LM2A 3HTVA 1GLEG 3CQXA 3R8EA 1MA9B 3SMPA 2V51B 5EXWA 2H3GX 4K41A 5BREA 2E2OA 3WXJA 4AM7A 3U9DA 1QQOA 1RGIA 4H0OA 3MN6A 5AQTA 5TKYA 1GLCG 3W3DA 1U6ZA 3UKUB 5KQDA 2VCPA 1NLVA 4GY2B 4DB3A 3GOIA 4H5RA 3IFRA 3VPZA 4MO4A 5AZJA 3DWLA 4ISEA 4H0VB 4YDUC 5F0XA 2W40A 4BGAA 4BRQA 4JHDA 5AZIA 1NGEA 4RCHA 4XH5A 4BQLA 3VEYA 4CZLA 4CZJA 5BN9A 3GBTA 3L6QA 5AQFA 2YJEA 3JS6A 4O8KA 1X9JA 3WXIA 1HKGA 1ZXOA 3DXMB 2A6AA 2YHXA 1NGHA 3U4LA 3CJ1A 3HSCA 5BRDA 5BN8A 4EFHA 3MMVA 4BR2A 3UKRA 4BR9A 3H1QA 4FOIA 3AAQA 4MO5A 3MK6A 4WQ4A 4RTFD 4EAHD 3GE1A 4EHTA 3LL3A 3FZLA 4IO8A 1XQSC 3SMSA 4FWMA 4CD1A 4H0TB 2V7ZA 1KAYA 3LM9A 5AQWA 5LY3A 4J8FA 4QS7A 1X3NA 3M6GA 2GEMA 3VGMA 4E1JA 3VOVA 4FSVA 4CZMA 4BRMA 5BPNA 1IG8A 3VF6A 1GLDG 1HX1A 1ATNA 1NBWA 2Q0RA 4FWKA 4A2BA 3EO3A 3VEWA 3D2FA 2P9NB 1HLUA 4IZ9A 5EVZA 3VF2A 2ZGZA 1GLFO 1T6DA 3O1BA 3LDPA 3BP8A 2GWKA 5LJVA 4A2AA 3QFUA 4BC3A 2IIRA 5E84A 3LDLA 4CZEA 3O8MA 2AA4A 3VEOA 3HM8A 1BU6O 3H6EA 3IUCA 3FE1A 2FSKA 1HKBA 4HTLA 3RSEA 3LDOA 1K8KB 2E88A 2I7PA 2E2NA 2V52B 3ZEUA 3M3ZA 2IVNA 3C7NB 4JN4A 2CGKA 4B1VA 4I6MA 3O08A 3WXLA 4H0YB 1IJJA 1RFQA 1GLBG 3ULEB 3CJBA 4EHUA 3VESA 1V4SA 1TUYA 2P9IB 1SQKA 1S3XA 3WT0A 1DGKN 4DHYA 5KPZA 1ZBSA 4PL7A 4BRDA 2PAVA 2FF6A 4JD2A 4ISFA 3H46O 5AQXA 2Q31A 2ZGYA 3A0IX 1T6CA 4IXCA 1GLLO 2UYTA 2KHOA 3P4IA 5AZJB 1WOQA 1Y64A 4BRKA 4BC4A 4WQ5C 4H03B 1CZAN 3FGUA 1QZ5A 3WUHA 2NRHA 4CJ7A 3CIPA 2QWPA 5AZIB 2QWMA 4H5WA 3WEEA 3FZFA 4FPBA 5AQHA 2P9PA 5AQRA 4MLEA 5AQUA 1YVNA 1S22A 1ESVA 3CJCA 1NGJA 3DAWA 4HWIA 1R59O 4PKIA 4FWPA 2ASMA 2YJFA 2A40A 1EQYA 4FL9A 5JICA 1D4XA 1YXQA 1Z05A 2P9LA 3O4WA 3D2EB 3QBWA 3ATUA 2FF3B 5ELZA 3FZMA 5JLHA 3BUZB 3CETA 1DKGD 3UKRB 4M7XA 5AQQA 1Z6RA 1JCFA 3LDQA 4CBWA 3A5OC 5KQ8A 5AFUH 5FPEA 4BRNA 1NMDA 2E1ZA 3WQUA 3F9MA 3MN5A 3UKUA 3H1VX 3MCPA 2NZTA 5AQYA 4CZIA 4MLHA 3VGLA 1H1VA 4FWLA 2FXUA 3B8AX 3UB5A 2BTFA 5ADXH 3H3NO 1XC3A 1HKCA 1U2VB 4FWSA 4BC5A 2D0OA 1BWFO 2QWNA 2ITMA 4FWNA 4CZKA 1NGGA 3VERA 4BRPA 4GNIA 2YHYA 3H45C 3ID8A 1BA0A 4AM6A 2EWSA 2VWBA 3H3OB 5AQSA 3S41A 3QDKA 4RWTA 4BREA 2E20A 3HI0A 1BUPA 1P8ZA 3CQYA 1NWKA 4Y0WA 3U9ZA 5BPLA 3EN9A 2AP1A 5EOYA 1YAGA 2HF4A 3FR0A 4JAXA 4WQ4C 4B9QA 5AQVA 1G99A 3SJHA 3BF3A 2QWOA 2IVPA 1KXPA 2HMPA 3HBTA 3CI5A 3IMXA 4CI6A 2FSNA 3RSEB 2P9UB 2A5XA 4B1YB 2P9SA 3VGKA 3QB0A 1LOTB 5AQOA 4BROA 3ZEUB 5KPTA 1HUXA 1NM1A 4FPAA 4CZFA 3R6MA 4I6MB 3ZX3A 2V7YA 5BR9A 5AQNA 1V4TA 3ZX2A 3MDQA 3ZETA 4ISGA 5EY4A 1NGCA 3QFPA 3A5MC 3CJAA 4BG9A 5BPMA 1NGFA 2I7NA 3I33A 3EL2A 2Q2RA 3DXKA 2P9KB 4A61A 5AQZA 4H0XB 4IJAA 2YCHA 4M63C 2QW9A 1QHAA 3CJ7A 4PL8A 3HZ6A 1BA1A 4BR0A 4F9OA 2HOEA 3J8AA 1E4GT 4Z94A 4JD2B 4KBOA 3BF1A 3AAPA 3VEVA 1NGBA 5AFUA 5AQJA 1ATSA 4CBUA 1BG3A 1KAZA 5ADXA 4B1UB 2Q0UA 1ZC6A 3C7NA 4CZGA 1HJOA 3OHRA 4BRHA 4K43A 2OANA 1QQMA 3BEXA 2A41A 3UE5A 4BQZA 2P9PB 1TYQA 5E26A 2D0PA 5BRFA 2Q1NA 5KPRA 4YDUA 4JHDB 3EZWA 2A3ZA 4FWRA 5FPMA 3D7EO 1C0FA 4BR5A 5AR0A 2A42A 4CZHA 3I8BA 4PKHA 2P9LB 1MDUB 5CE3A 3FFKB 5EX5A 1NGIA 3CJ9A 3QMLA 2QWLA 3IDHA 4FOEA 3AY9A 1C0GA 5AQKA 4BGBA 3G25A 4LC9B 3MN7A 5AQPA 3C0BA 2NLXA 3VF4A 2CH5A 1HPMA 2HF3A 4BG8A 2F9TA 5FPNA 2WUSA 1XUPO 4DQ8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A5NC 1D5AA 2J4RA 3O9TA 3ZX0A 4LSNA 1FW6A 4C8LA 2IS3A 4CGJA 2KTQA 4FJGA 4AHSA 1HYSA 1KC8O 3DM2A 3DJCA 5DMRA 3W0LA 3GG4A 1BCMA 4W5OA 1T44A 3NGZA 3I56N 3SLCA 3G0ZA 4NB4A 4C23A 1VQLN 3AVKA 2ASPA 4GV9A 4FLXA 3D2EA 3SYZA 1IKWA 1SZ2A 2YX6A 4CJTA 3SK3A 4EZ9A 2E2QA 1CXQA 3VEXA 2D4WA 2QM1A 1SAZA 3B6PA 4YOVA 3OJSA 4OGCA 3CC7N 2HHQA 1WBDA 2P9SB 2PFUA 3ATVA 2GUPA 4DV1K 4A62A 4E7KA 2QWQA 1KFDA 5JMVA 4FJJA 1KAXA 3AVAA 4CJ4A 5I9EB 4JLHA 4KV8A 4NXNK 5F2RA 4BR4A 1X3MA 1Q18A 2JWKA 4HCBA 2F9WA 2E1YA 4Z4GA 3MCAB 1MWMA 4CK2A 3VA3A 1I39A 3AVHA 3TAEA 2P9NA 4CEAA 1YHQN 4XH1A 4BR7A 4LSLA 3M5RA 3LDSA 3HXMA 2YHWA 3U8XA 4XEIA 1QVFM 3CPWM 1KSPA 3VEZA 3MECA 4H5NA 1YJNN 4BRAA 4H5TA 1K8KA 3CMAN 4BVPA 4ZTJA 5JS2A 4B3SK 4CVNE 3G6EN 1LW0A 4UY8O 1TYQB 3SUPA 1IKXA 4FVMA 1VQMN 3ULEA 2W41A 1N6QA 1G15A 1BI4A 5C24A 4DTRA 3U3GA 1HNXK 3LM2A 5I42A 2P9IA 1REVA 1GLEG 4ILGB 3DLLL 4W5RA 3HM9A 4B9UA 1OVYA 5EXWA 4K41A 4WFAL 2OTLN 5BREA 1FK9A 4KB0A 1RGIA 4H0OA 4OKKA 4CHPA 2W42A 5HRRA 2HHVA 1NK4A 4IO9L 2VCPA 4OLBA 4JKGB 4J2DA 3IFRA 2PZSA 1IBKK 5FLXO 1XMQK 3JSMA 5AZIA 2NRXA 4NLBA 3V9WA 1VQON 4B3TK 1E3MA 1HYZA 2HB5A 2GBZA 3VEYA 5KGXA 1J54A 3VN5A 3GBTA 4LD0A 4DR5K 3TANA 3CD6N 3G71N 1HKGA 1ZXOA 1BIUA 4CF2A 3KKRA 1WB9A 1NJYA 4EFHA 3MMVA 5EU7A 1QQCA 1XMOK 4WCEL 3VQ9A 4E7LA 3PX6A 1O13A 4KHPK 1XQSC 3SMSA 4K8XA 5HRSA 4FJ8A 3CFPA 1T05A 4JYAK 3HP6A 4B3MK 4DKWA 3RMAA 2YNFA 4M3YA 1ILYA 1YT3A 3VOVA 4FSVA 4CZMA 5KI6A 3SQ0A 1VQ5N 1HX1A 1ATNA 3I0RA 3MX2A 1A5XA 4FLZA 4I2PA 1UWBA 4CEOA 3AV9A 3CQ8A 4DSLA 3ZT4A 4NLCA 3BP8A 3V1RA 3HJFA 4CF9A 3O3HA 3QFUA 1ZYQA 3C6AA 3HM8A 3FE1A 2FSKA 1U48A 5CYQA 3P38A 5J2MA 3HVTA 3NVKA 4I9LA 1ASWA 3WNFA 5CZ1A 4DR4K 3S3OA 4JN4A 1QSLA 4B9MA 3U3YA 5C12A 4CJEA 1RFQA 1HMVA 4CHQA 1K8AO 4ELVA 4JI5K 3V4IA 3NH2A 4BE1A 1S3XA 2B4JA 4F2RA 3QIPA 4CHNA 1DGKN 5KPZA 3AVFA 4KH6A 4DU1A 5CY4A 3PO5A 2PAVA 2FF6A 3AVBA 2HVIA 4DFPA 2ZGYA 4FW2A 4IXCA 3CFOA 2E6MA 3T1AA 1S1TA 3SQ2A 1WOQA 1JLCA 3EE9A 3ASMA 4BRKA 4KHQA 2O8EB 2VG7A 4H03B 4QAGA 3FGUA 3WNGA 4CJ7A 3CIPA 3ZSOA 3QERA 2G8UA 3KLFA 4F4KA 5AQRA 3V6DA 4MLEA 4KKOA 1GOBA 1YVNA 1S22A 4Z4EA 3NDKA 3TSQA 3AO5A 3PV8A 2XRIA 3CJCA 1NKEA 3DAWA 4GV6A 1R59O 3MWPA 4DTSA 1TK8A 3PSIA 5JICA 1D4XA 1YI2N 3RRGA 1RT6A 4DWIA 1VQNN 4DV6K 2FF3B 1DKGD 5AQQA 5LMUK 4RW7A 5KQ8A 4KFBA 5AFUH 1NMDA 3WQUA 1JL1A 5AJ3K 1VSKA 4CZIA 4MLHA 1TK5A 4CJWA 3VGLA 2FC0A 2ATQA 2HHTA 2BTFA 2O8DB 1VSEA 1SS6A 3AGRA 2QWNA 5SWMA 2ITMA 1NGGA 1CLQA 4R5PA 4O0JA 3WXMB 3ID8A 3JYTA 1KCFA 2D5RA 4AM6A 1N36K 2VWBA 1MU2A 3S41A 4Z4HA 4DU4A 3QIOA 1NJXA 4RWTA 1SL0A 4LF4K 2KQ2A 3CC2N 4LF8K 3CCVN 3CQYA 2G8WA 4Y0WA 5BPLA 4FK4A 5EOYA 5K14A 3KLGA 3V9ZA 3P83D 5C10A 4X65K 3FR0A 1VQ8N 4WQ4C 4B9QA 1J53A 1EWRA 1G99A 3TR8A 3BF3A 4CW7B 2AJQA 3L2WA 3HBTA 3CI5A 4JRPA 3D6RA 3DLKA 3AA5X 3I55N 2RN2A 3VGKA 2RKIA 1DT9A 3VQ7A 2PYLA 5SZTA 5AQOA 4BROA 4J2BA 3THWB 3OW2M 5KPTA 3TTCA 3AA4A 4B9TA 3LAKA 2YHBA 4DUYK 4CFBA 3CCUN 2UXCK 4CF8A 2GUIA 4DLEA 3CJAA 1OVQA 2I7NA 3I33A 2P9KB 3QESA 3OTOK 4GVEA 4IJAA 2YCHA 2WTUA 3OVNA 4C1NI 3KK2A 4PL8A 1VQ9N 2HOEA 4JD2B 5AFUA 4CESA 5AQJA 1Q81O 2D0BA 2BANA 3QEXA 2G8HA 4FJ9A 1VAZA 5CZ2A 5FDLA 4HTUA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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