4DQWA

Crystal structure analysis of pa3770
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
466
structure length
415
Chain Sequence
MLRISQEALTFDDVLLIPGYSEVLPKDVSLKTRLTRGIELNIPLVSAAMDTVTEARLAIAMAQEGGIGIIHKNMGIEQQAAEVRKVKKHETAIVRDPVTVTPSTKIIELLQMAREYGFSGFPVVEQGELVGIVTGRDLRVKPNAGDTVAAIMTPKDKLVTAREGTPLEEMKAKLYENRIEKMLVVDENFYLRGLVTFRDIEKAKTYPLASKDEQGRLRVGAAVGTGADTGERVAALVAAGVDVVVVDTAHGHSKGVIERVRWVKQTFPDVQVIGGNIATAEAAKALAEAGADAVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQISAIANVAAALEGTGVPLIADGGIRFSGDLAKAMVAGAYCVMMGSMFAGTEEAPGEPYKGALSAIVHQLMGGLRAAMGYTGSADIQQMRTQPQFVRITG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
publication title MgATP Regulates Allostery and Fiber Formation in IMPDHs.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 121
structure length 415
sequence length 466
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.580.10 Alpha Beta Roll CBS-domain CBS-domain 4dqwA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4dqwA01
1PVMA 4AH7A 3O16A 3G1SA 3L31A 2TPSA 1TPC1 1F7BA 3W1TA 1OVDA 5AOUA 5DELA 3PSWA 1OFDA 4L3VA 2R91A 2X30A 1A5BA 3OVPA 2FQIA 4FX6M 1OX5A 3W87A 3DI1A 2PRLA 2QJIA 3ANYA 3N2MA 3NOEA 1SZGA 1F6PA 4QQ3A 1RD5A 4AMAA 2NZLA 2YZRA 4HNVA 2CLIA 1PV8A 3W7JA 3DDJA 4U28A 1R30A 2Y61A 2BWGA 1QR7A 1QPNA 2Z2UA 2CW6A 4O1BA 1SW3A 4Y96A 3IVTA 1KTBA 1PE1A 3CB8A 3TSDA 3OBKA 1PCKA 2A21A 3CEPA 2OJPA 3IVSA 2PE4A 1P4CA 3EWWA 1YAVA 1YPFA 3G3MA 1LCOA 1WBJA 3PUOA 5D04C 4BR1A 2EGZA 3WFAA 3SJ3A 6TIMA 4JTGA 4LUIA 4JX4A 5AN7A 1PL9A 4MY1A 3DFNA 4GXMA 1H7XA 2FIQA 3BGGA 5HJLA 1I2NA 1XC4A 2RKXA 4IMGA 1WDWA 4EF9A 2EPHA 4NJGA 4GUHA 1O4UA 4LRSA 3OIXA 1TPEA 2GOUA 4L0DA 3G0SA 3Q37A 2DU2A 2XN2A 5BW6A 1OG0A 2BLEA 3NQAA 4FNRA 2A6NA 4R34A 4DQWA 4I7UA 1DOSA 5L9FA 3GYEA 2FPVA 5HUOA 2V0TA 3TMQA 4NZFA 3N3MA 1EX5A 5DCEA 1JCMP 1LLWA 1LRNA 3LBMA 1QO5A 2G97A 5FF2A 1DKWA 1PHWA 4JIQA 5FEPA 3GR8A 3TX9A 3NZ1A 1JJKA 3B8DA 3P7YA 5FI8A 3Q58A 1E51A 1AL7A 2PC4A 2YFOA 1SW0A 1WV2A 2Y7FA 5D03A 2E6DA 3KRZA 4UNKA 3NQ2A 2NUWA 3E12A 5HWNA 2BXVA 2ZTKA 1FDJA 1QWGA 3DXIA 2A7PA 3O6YX 1QNVA 2P9MA 2ZRUA 1TTJA 4NJIA 4CQ8A 4WJEA 3EXTA 1H51A 5HWJA 1FWWA 3GB6A 3W9ZA 5F4WA 2A6LA 4HKPA 1GYLA 4IPJA 2WSQA 4S2CA 2WNZA 5AHFA 3W1XA 1ZHAA 3I6RA 3MBFA 4PEKA 3TJLA 3UQNA 5DLCA 4AHQA 1PIIA 1GG0A 3KHJA 4UC5A 3C2FA 5DCBA 3S42A 1KFLA 1H5YA 3C8FA 3M5XA 3W7OA 1VGAA 3GDMA 2ZY9A 2NYCA 5FEWA 3KAOA 1X8FA 3N19B 4IQLA 1Z48A 4LV4A 4O14A 2CLKA 1W5NA 4QM1A 4UTMA 3M41A 1W8SA 3H54A 2NYEA 1EUNA 1ONRA 1V5XA 2BZNA 1UJPA 3NQVA 3KVJA 2ABAA 2ATMA 1GZGA 4R33A 4FF7A 3PF3A 4UR8A 4GQVA 5GVJA 4HNUA 1HL2A 1HG3A 1TV7A 3L65A 2NX3A 4NQ1A 1GVFA 3W1NA 4JX5A 4UTTC 2WNNA 1GVOA 4JDYA 1W3IA 3C2RA 1YXCA 3BK0A 4QITA 3NG3A 3HG4A 1F76A 1QDSA 2FB3A 1TPB1 1AMKA 2ZCGA 3NPXA 1ZAJA 3L5LA 4UTTA 3GX9A 1NVMA 5BMXA 4ML9A 3SI9A 4OQVA 3N14A 4E2BA 4XUGA 3KH5A 5D2YA 5F4XA 3M16A 4P61A 4CCEA 3FIGA 2PRMA 4JS3A 1S3HA 3CU2A 1VJIA 4UTUA 3NQFA 1OF8A 3LCWA 5EYWA 4WUIA 4QJ1A 4UTJA 5HULA 3USBA 3OVRA 5HR7A 3UZJA 3DFPA 4CQ9A 3BW2A 4UR7A 2YR1A 2YXGA 2HS8A 5F1UA 3NQ6A 4IPIA 4MPQA 2D73A 2G96A 4S2BA 5K2ZA 3W71A 1SO4A 2Z6JA 2Y70A 2P10A 4JYDA 3W2JA 4LU0A 1S5WA 2XN1A 3DBPA 1OYBA 5G1YA 3BLIA 1DQXA 1YPIA 1HTIA 1VR6A 4WX2A 5K22B 1GTHA 1TPDA 4NX0A 4RZ6A 3CC1A 1GVSA 4O1AA 2QREE 4A2SA 3W23A 3O06A 1FWRA 4ZMGA 1TRDA 1W0MA 3NPWA 3FWRA 1MSSA 4NJHA 1L6WA 4K38A 2QCDA 3GLCA 1KM6A 1VQTA 3WJYA 1ICQA 1KFBA 6ALDA 2JGQA 5H2ZA 5LKYA 4BI7A 2QKFA 5DCDA 2DORA 3MJYA 1QAPA 2OX1A 3CM4A 2V2DA 3MYOA 1YTKA 2H8ZA 2Y89A 3ORGA 1KW1A 3I7SA 2C0AA 1VPXA 1TYGA 1Q6RA 2QUVA 2BTMA 3DH7A 3LV5A 3SSJA 3W2LA 3JR2A 4O4VA 4M6PA 3ZS4A 3T55A 2A2IA 3O8AA 1EPXA 1DBTA 5D33A 1DQWA 1ZALA 4MYAA 1R46A 3TE9A 4LC6A 3DKJA 4FEZA 5MMZA 1BEUA 1T99A 3F4WA 3NA8A 2Y62A 3B0UX 5BMWA 3CLMA 4DF0A 2Y88A 4O28A 4O10A 3FYOA 4N6EA 5D2XA 2V5BA 2FPYA 3LRKA 3LV6A 5KTLA 3P5YA 3LTSA 3NZRA 2NWRA 2Y7DA 4IMCA 2PCQA 1FCBA 1Y5HA 3MHUA 3S6DA 1H60A 5K24C 4TR9A 2H8XA 4RZ5A 4A21A 2J6XA 3GXPA 4OU1A 1R2TA 1LZOA 4UMCA 3GIYA 1OYAA 3W6YA 4Z0JA 4IX0A 2Y6ZA 2GQ8A 3K30A 3L2BA 2H3DA 3N73A 3B0PA 3LRLA 1OYCA 3C52A 5FEZA 5U4NA 4ZQCA 2V30A 4CNNA 3JS3A 3OCOA 2ZZ6A 4RXFA 2ISVA 3CHVA 3GDRA 1L2UA 3QM3A 4POCA 4UFJA 3W1LA 3EXRA 1FWNA 4O9KA 2VFFA 3M43A 4JY8A 5AHMA 2C1HA 3R12A 2CZFA 1RV8A 2RIHA 1SSGA 1TPWA 4N6FA 3MWAA 5IM51 5K9DA 3WK3A 4N9DA 3IIVA 3S1XA 3GDLA 3UPBA 4JYFA 4LUJA 4Y90A 2B7OA 3PG9A 2NXIA 2DJXA 2JGYA 4ZZ9A 1T8XA 5LNWA 1O60A 3IEBA 1LTDA 4A29A 1SO6A 1P1XA 4JTLA 3KFTA 3LFZA 2ZZ4A 5EPDA 3CWOX 5G2IA 5CZTA 5K4ZA 4PTNA 4YL2A 1DHPA 4DO5A 2CFFA 5AFDA 1M7PA 3MI2A 4IGHA 3QW4B 2RH9A 3NQ8A 4FIQA 1K03A 1KM3A 2QH1A 4K36A 3BGJA 3NEVA 4H4IA 3R13A 3TFXA 4Y6GA 3QPYA 1XCFA 4OE7A 4FNUA 4XKYA 3SFKA 1TJRA 4AVFA 4TX9A 3H55A 4NU7A 2QCDB 3LHVA 1VCFA 1D9EA 3OEXA 1KTNA 4O54A 3TFCA 1LM1A 4XTDA 3GNNA 4JEQA 2EF9A 1SZEA 4FXSA 4H6KA 2RDWA 4UTLA 1F05A 3TSBA 2ZZ3A 1IXQA 5I3KA 1U5JA 3NM1A 1JCXA 2J24A 3C4UA 3QQ1A 2DJLA 2E6AA 5LGXA 3GXNA 4OWGA 1AW5A 1JRCA 3W7RA 3QW3A 3TH6A 4FNTA 2WO5A 4AXKA 3W3OA 1MO0A 5G5IA 3P84A 5EBUA 4COOA 1R2RA 2RDUA 1H63A 3S5ZA 5C6MA 4MYXA 1MXSA 4QSHA 1LOSA 1JR1A 2V2HA 3TXVA 1FBAA 3MP4A 1H7OA 5KZEA 3FFSA 1GVQA 4JIPA 4JTIA 3C2OA 3RK8A 3THAA 3UY8A 3W1RA 1IIHA 4KWVA 5F2IA 3QMTA 2UV8G 4LTSA 2EKCA 2H90A 3TC7A 1DORA 2NV1A 3NYZA 1GEQA 3G1XA 3W73A 4JTUA 1F2JA 4L28A 3MO7A 1H7NA 3GXTA 1XKFA 2A7RA 2O7SA 3STFA 3M5YA 4R7JA 3NL6A 2QCLA 4NVTA 2DP3A 2YDAA 4MY8A 3LM7A 5AC6A 5D02A 4YCOA 3O1NA 3SZ8A 3W2KA 3TDFA 3NQEA 4R53A 1XBVA 4K7VA 1ZY9A 2NUXA 2X1SA 4M7SA 2QAPA 4BK9A 1TPFA 4UFIA 3WK1A 3W88A 5EKYA 2QCMA 5TQLA 5CPOA 3E02A 3PWAA 1CX9A 4MZ1A 2X1RA 4ALDA 4RKAA 2Q8ZA 3DGRA 3TNOA 4LOCA 1F6KA 3HPZA 1ZAHA 2GUUA 2CZDA 3HQ1A 5DY2A 1VCVA 1RZMA 3PC2A 2NXHA 4UMBA 5K25C 4IXHA 2X16A 2B7QA 4Z08A 1N7KA 3SGUA 3KPBA 1X7FA 3PVFA 1JCLA 1NSJA 1K7FA 4MJZA 1H7RA 1OFBA 1YDVA 4XTIA 3KXQA 3LXAA 1OF6A 1UB3A 3PR2A 1X1OA 4Q33A 2QCNA 4O17A 5J5DA 4PCUA 2VENA 4IOTA 3TROA 2QF7A 1TRIA 2FJKA 3LCHA 3EX1A 3MHFA 4OGZA 4DBEA 4O0ZA 1C9DA 1YDNA 5HR6A 1S5VA 4MFDA 3O07A 3HOJA 2R8WA 3G22A 1JVNA 2Q8LA 1DV7A 1SFLA 2E6YA 3C56A 4LY8A 4HIBA 3P81A 4OBTA 4W9TA 4XKYB 1O5XA 4GFSA 4ZQNA 4E38A 1IXNA 1S5TA 4O57A 3LOTA 3LHTA 4FHAA 3RLVA 1BWLA 4JX6A 1W31A 3GK0A 3SW6A 4RX0A 4HNNA 3LI0A 4NXSA 2ZZ5A 5I3HA 3VE9A 2EMQA 4O15A 5DXYA 5KS7A 2ZZ1A 3TDHC 3QF0A 1TREA 1OFEA 3L0GA 4A3UA 4U4MA 1M6JA 1LRTA 1VLWA 4K8EA 2AQWA 4PL1A 2E5CA 2GQAA 2VEIA 1JQVA 3DENA 1TQJA 2JKAA 3IIPA 1P0NA 3LTYA 4FB7A 1OJXA 3P62A 4RZ4A 2NV2A 3LCGA 4UTKA 3O6DA 3O15A 3R89A 4NNCA 2R94A 4YCPA 2QRDE 2ZZ2A 3C2VA 2E68A 5KSWA 1KFKA 2V2CA 3E49A 5HINA 4P1OA 4L4MA 4JTSA 4EOUA 4OT7A 3S5OA 1YADA 4EF8A 3LCXA 3LHHA 3LQNA 5AB3A 5I3IA 1XBZA 3V1PA 3WJWA 4FNPA 3ZR4A 2Z6IA 4C1KA 3EKZA 4IMFA 3GR7A 3UNDA 3NL3A 2J9YA 4IYSA 3STEA 1OHLA 4LVGA 3IRDA 4CNOA 3JRKA 3Q94A 3KVMA 1PVNA 3ABOA 3W07A 2TMDA 1VYRA 2VEKA 1ZENA 2E5BA 4Y8FA 2E09A 1YLVA 3PB2A 1EP2A 2I1OA 5EL1A 4DXVA 3QQ0A 1CI1A 2NX1A 1A53A 4N9EA 2GVLA 4NNBA 1Q3NA 2ZRWA 1F5ZA 3I65A 4OHQA 3EX6A 1VHCA 3PC4A 5G1TA 3HGOA 1Q6QA 1TMHA 4Z1AA 2OT1A 3PUDA 1QMLA 3W1MA 1XL9A 2C15A 5L6UA 2X2GA 3NL5A 3PSVA 1ZCOA 1WOAA 3HG2A 3QH2A 2NLIA 2CLLA 3LI1A 3NQGA 3P5ZA 5U7SA 1AW1A 1O50A 2FDSA 2C13A 1SFJA 4ZQPA 3BG5A 1O5KA 3INPA 2RFGA 4NT0A 1H7PA 4DEFA 5IBXA 3LHYA 4UCGA 3G18A 4DF2A 1I2PA 1MZHA 3W7CA 1NEYA 2HS6A 3OG3A 2NX9A 5F4SA 3TV8A 1SR9A 1GTEA 4NJJA 4FIRA 3N9RA 2GPTA 5AYXA 4N4QA 3NQDA 1SO5A 1J2WA 1YXDA 3QZEA 3UWQA 5AHEA 1KM1A 2CLMA 3N34A 2OZ0A 1K02A 3PBVA 2OOXE 3FJLA 4AWUA 3M0ZA 4B5NA 4UFLA 3EX3A 2YGYA 3K6EA 4LRTA 2CU0A 2J9XA 2VC6A 5CSRA 4WY0B 4IUOA 4MY9A 3T7VA 4ZQMA 4HHPA 3YPIA 3DFSA 1FX6A 3NR0A 3E0IA 1YYAA 3OVQA 4UNLA 2Q3OA 4IMDA 4PFMA 5CZ0A 1LRQA 1ALDA 1QPQA 5LNSA 2HTMA 4O11A 3G1HA 3UYCA 1OK4A 2AAMA 4UIOA 4M7TA 4HSOA 4QAIA 3LTPA 3WJXA 4LT9A 2O16A 3W1AA 1VHNA 4K7YA 3PBWA 2Y63A 1UUMA 3V75A 2YZQA 1OX4B 3O63A 2QAFA 4O0KA 5KMYA 4CCDA 5FF3A 1I8JA 1KLYA 2GJLA 5LHFA 5D2VA 2QUUA 2TSYA 3M44A 3IIOA 3QRHA 4ADSA 1LROA 4PC8A 1DJQA 1XDMA 1WBHA 3GAYA 3EWBX 1BKSA 2VFHA 4QNEA 3KVKA 1TJPA 1HFBA 4P1GA 3NQ7A 1T0OA 4JY9A 4P2VA 3LXCA 5BNKA 3ATZA 4GBUA 3P60A 4RK8A 3SIZA 1CW2A 2QR1E 2VELA 4MKNA 3BO9A 4M19A 2YVYA 2ZBTA 5G2WA 4BWLA 3TXZA 1TQXA 4JGDA 1HUVA 5KITA 5C55A 2J9ZA 4YLWA 1UCWA 3MW7A 1QCWA 4O50A 4HN4A 4ORMA 1UUOA 1EP1A 1M5WA 3FA5A 3OHIA 1XKYA 2YFNA 4O8RA 1LDCA 3UXDA 2WNQA 3SY5A 2DZXA 2OCZA 3RNDA 3B03A 1XBYA 4MZ8A 3LHZA 3UZ5A 1X6UA 3IV3A 2ZRYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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