The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
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sequence length |
116
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structure length |
116
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Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Ribosome
|
| molecule keywords |
16S rRNA
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| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| total genus |
25
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4YHH K; 3T1Y K; 4DV2 K; 1IBK K; 5A2Q O; 2VQF K; 2UU9 K; 4DR6 K; 4JI5 K; 4JI6 K; 1XMQ K; 2UXD K; 4NXN K; 4DR4 K; 1N33 K; 1XNQ K; 2UUA K; 4DUZ K; 2F4V K; 4JI8 K; 4JI7 K; 1IBL K; 3JAM O; 4DR5 K; 4KHP K; 1N34 K; 4B3T K; 4X64 K; 3J81 O; 4DUY K; 4OX9 K; 4JYA K; 4DV6 K; 4LF5 K; 5IWA K; 4X62 K; 4DV3 K; 5LMU K; 5AJ3 K; 4DR3 K; 4DV5 K; 1HR0 K; 4JI2 K; 4B3S K; 3J7Y P; 4LFA K; 1FJG K; 4LF4 K; 4JI4 K; 5LMN K; 3J7A P; 3OTO K; 3J80 O; 1N32 K; 4JI0 K; 4V19 S; 4GKJ K; 1HNW K; 2VQE K; 4DV7 K; 2UXB K; 2HHH K; 1J5E K; 1I94 K; 4LF9 K; 4CW7 B; 1IBM K; 4DR2 K; 5IT9 O; 4JV5 K; 1XNR K; 4LF8 K; 4NXM K; 4B3M K; 4CVN E; 3T1H K; 4DV1 K; 1HNZ K; 4DV0 K; 5FLX O; 4AQY K; 2UXC K; 4K0K K; 5BR8 K; 4DR7 K; 4B3R K; 4JI3 K; 4LFC K; 4LFB K; 1HNX K; 4DR1 K; 2UUB K; 4DV4 K; 5LL6 Z; 2UUC K; 4X66 K; 4YY3 K; 4JI1 K; 1XMO K; 4LF6 K; 1N36 K; 2E5L K; 4X65 K; 2ZM6 K; 4LF7 K; 4GKK K; #chains in the Genus database with same CATH topology 3SJJ A; 1N5Y A; 3O3H A; 1CZ9 A; 1O1W A; 2FSJ A; 4XH1 A; 1F21 A; 2QXF A; 4AM6 A; 3A2F A; 4F9O A; 3NCI A; 4JNE A; 1RT5 A; 1U49 A; 5M1F A; 1VK0 A; 4DU3 A; 3CC4 N; 5FRN A; 2FBV A; 1V4S A; 4JAX A; 3P39 A; 4FO0 A; 2FBY A; 4IXC A; 1BQN A; 3MN6 A; 3LPT A; 3DRS A; 1KAZ A; 3M1F A; 4M41 A; 2OA8 A; 3LDL A; 3QET A; 4WYB A; 1FKP A; 4DG1 A; 3VN5 A; 1WBD A; 3TAG A; 1FK9 A; 3K9J A; 4RW6 A; 2D0C A; 3B6P A; 3V9S A; 3P5J A; 4DLG A; 4E7K A; 2GWJ A; 3ASM A; 2PZS A; 4BRE A; 5LMN K; 3TAR A; 1VQ6 N; 3NBP A; 3R3L A; 4V19 S; 1TUY A; 2KLA A; 1ATN A; 1GOC A; 2IVP A; 5AQI A; 3VTH A; 3ZSR A; 5AQH A; 3PX0 A; 2RKI A; 2GEM A; 2JLE A; 4U67 L; 4ISE A; 4M45 A; 1SL2 A; 1TUU A; 3AVA A; 1K9M O; 2WUS A; 1JL1 A; 4IKF A; 4LSL A; 1E4G T; 4R79 A; 3CMA N; 1HYZ A; 3U3G A; 1C0F A; 1K73 O; 3OYF A; 4CK1 A; 4K8X A; 4BRM A; 4JI3 K; 4YOV A; 4M7X A; 1NMN A; 5AQQ A; 3LZJ A; 3AVH A; 4PHT X; 4LFB K; 3NVK A; 5M1P A; 3OW2 M; 5AQJ A; 1IG9 A; 3CFP A; 2PYJ A; 1SAZ A; 2FBX A; 2V7Y A; 4DB3 A; 1QTM A; 1SS6 A; 2VG7 A; 1RIL A; 2NRZ A; 1Q86 O; 3DWL A; 3JYT A; 2HW3 A; 4NYF A; 5AQX A; 1RDB A; 2P51 A; 4I9Q A; 1VQL N; 1BIU A; 3B8A X; 1DEJ A; 2UU9 K; 4I6M A; 2RF2 A; 1VAZ A; 4DF4 A; 4IWV A; 4BRQ A; 4F3T A; 3F9K A; 2HBM A; 1J5O A; 4A5A A; 4Q0B A; 3KIO A; 3VQD A; 1RTJ A; 4KI4 A; 3K57 A; 3DLE A; 5AQS A; 4B9U A; 1JXE A; 2ZGY A; 4Z4H A; 1JLF A; 1WN7 A; 1VQO N; 2O8E A; 1QE1 A; 2D0A A; 4QS8 A; 3QEP A; 1VQP N; 1OH8 A; 2Y1J A; 2HVI A; 3K5O A; 3V1R A; 5CHI A; 2B6A A; 3SUO A; 3WNE A; 2F9T A; 4WFA L; 2OCE A; 4FJX A; 2VG5 A; 5FRM A; 2Q31 A; 4Z4F A; 3CFR A; 3QDK A; 3QES A; 2EHG A; 3C6H A; 1EET A; 4KTZ A; 2VQE K; 2ATQ A; 2GEL A; 4CF9 A; 2NRW A; 1NOZ A; 2ITM A; 3TAM A; 3WUH A; 4KTQ A; 3WQU A; 3EKU A; 2QW9 A; 1NJI O; 1VSH A; 4FCY A; 3UKU B; 2XY5 A; 4CFB A; 2EWS A; 4F3O A; 1Z6R A; 3AO4 A; 1HRH A; 1XNR K; 1LWC A; 3ZT3 A; 4CGF A; 1TK5 A; 4JD2 A; 4M42 A; 4Y0W A; 2G8H A; 1D4X A; 4KH5 A; 4ISF A; 5ADX H; 3GBT A; 3RMD A; 1ZBS A; 1B9D A; 1JCE A; 4J2D A; 4MLE A; 4CK3 A; 1GLA G; 2HMP A; 5B8H A; 1UA0 A; 4KHS A; 4JKG A; 4N47 A; 4BDZ A; 1C0T A; 4CD3 A; 3U9Z A; 3AVL A; 4Z0U A; 3KD1 E; 5K14 A; 1SUQ A; 4CJT A; 4PY5 A; 1OH6 A; 3DRR A; 5JLF A; 2P9N A; 4OKE A; 3SZ2 A; 2HND A; 4FJ7 A; 3RR8 A; 3CJA A; 3V9X A; 1J9A A; 2OAN A; 5MLC Q; 3DOL A; 2Q97 A; 3TI0 A; 3D2E B; 4CJ4 A; 1S6P A; 1BA0 A; 3IUC A; 4H0X B; 2UXD K; 1BI4 B; 3FZL A; 2V7Z A; 3GOI A; 2HVH A; 2J4R A; 3DYA A; 1VSD A; 4DR5 K; 3SV3 A; 2VWB A; 2D0O A; 2YX6 A; 1GLL O; 3QIN A; 4RW4 A; 3ZSZ A; 2CH6 A; 4Q5V A; 2VWJ A; 3PY8 A; 1SKW A; 3THV A; 3DXM A; 1IKW A; 2XY8 A; 3ATU A; 4I2Q A; 4JK8 A; 4CEZ A; 3EO3 A; 3O9U A; 4CF2 A; 4EHU A; 4LF4 K; 4M3T A; 4O55 A; 3IG1 A; 4B9L A; 4AF1 A; 3T19 A; 4FLU A; 4H5V A; 1EXQ A; 5DK5 A; 4FPA A; 5KPT A; 1N6Q A; 4LH4 A; 4FK4 A; 3HZ6 A; 4BR0 A; 4ILG B; 3AO2 A; 1Q9X A; 2ZJP L; 4FJG A; 3AVI A; 3AGR A; 1IBM K; 4FJL A; 3TPQ A; 4AHT A; 1TKT A; 4YOU A; 4RW9 A; 2GUI A; 1TK8 A; 4NO7 A; 1HYV A; 4CFC A; 3S3O A; 4DFK A; 4WF9 L; 4C8K A; 3NH0 A; 4FJ5 A; 2Z1I A; 1CZA N; 3OYL A; 5DM6 L; 1YVN A; 3MCP A; 5LJW A; 3CJ1 A; 2KFZ A; 2P9K B; 4DHY A; 1VSJ A; 3ALY A; 1U4B A; 5M1O A; 1QHA A; 2DFH A; 1QZ5 A; 4I9L A; 4OGC A; 1VQ7 N; 2UUB K; 3VMF B; 1ASW A; 1Q82 O; 4CJE A; 3OYN A; 3WNF A; 3SUN A; 2QTD A; 5AZI B; 4LF6 K; 2ZJQ L; 3F73 A; 4CGD A; 3L8B A; 1NG9 A; 3A0I X; 4LD0 A; 3NHG A; 4PL7 A; 4GV9 A; 1IG8 A; 5BN8 A; 3MEE A; 3DXK A; 2I7P A; 4FJN A; 3L4I A; 2KKZ A; 2QWR A; 3MEC A; 3SAH A; 3NGY A; 2CH5 A; 5C2F A; 4FZY A; 4DR4 K; 1VQK N; 2F4V K; 1GOB A; 4AHV A; 1NWK A; 4CJV A; 4ID1 A; 4BG8 A; 1YT3 A; 4FWO A; 1NK5 A; 3J81 O; 3CCR N; 3MDQ A; 3MED A; 3VEY A; 1ZBH A; 4IEI A; 5HRP A; 1JKH A; 3QML A; 4FLW A; 2XY6 A; 4M3X A; 1RGI A; 1S1U A; 2ZE2 A; 4DV3 K; 1X9W A; 3AVF A; 1L3T A; 3OYG A; 1VQ4 N; 3WXM B; 4DV5 K; 2NRV A; 4LY7 A; 1WB9 A; 4FJH A; 4RW7 A; 1XI1 A; 4BY9 C; 4CBW A; 1NGI A; 1HQE A; 5C0Y A; 4FWQ A; 4CF1 A; 2O8F A; 3V9W A; 2G8V A; 3LP2 A; 3CCL N; 4B1X B; 3P1G A; 2Z1G A; 1UA1 A; 1TYQ A; 1BU6 O; 3O80 A; 3P31 A; 2ZF5 O; 4BRL A; 1NGH A; 4CFA A; 3KLE A; 3ZX2 A; 4KPY A; 1GOA A; 3AAP A; 4Y1D A; 5AQW A; 4OLA A; 1OVY A; 3L6Q A; 1U6Z A; 3ZEU B; 1X9J A; 1Y64 A; 1X1P A; 1MWK A; 5I3U A; 3EKS A; 1DT9 A; 5HBM A; 3H1V X; 4FWR A; 3TSU A; 4N76 A; 1NGC A; 3KK3 A; 4GVE A; 1YI2 N; 3AVM A; 3RWU A; 2HHT A; 3DOK A; 1KFD A; 3J8A A; 4DSL A; 3DM2 A; 4Z4C A; 5AQY A; 2W6L A; 2YNF A; 3ZT0 A; 1XMO K; 4CCH A; 3TWH A; 1HUX A; 1N36 K; 4CEO A; 2E6L A; 4OLB A; 2OZM A; 4C1N I; 4IG3 A; 4E1J A; 4M7Y A; 2OYQ A; 1RBV A; 2HHV A; 4DV2 K; 3NAE A; 1S6Q A; 3LDQ A; 4IFV A; 2QKB A; 5J2Q A; 4F2S A; 2JWK A; 1S3X A; 3E66 A; 3F2K A; 3RMC A; 1WNS A; 5HRN A; 4CZK A; 3D7E O; 2Q3S A; 4JI5 K; 4PL8 A; 5BR9 A; 3O1W A; 2NRH A; 5KPR A; 3CC7 N; 3M8P A; 1C0M A; 3CM6 A; 3N4Q A; 2WBN A; 4NXN K; 2D5R A; 1JCG A; 4BE1 A; 2BAN A; 4PA1 A; 3QEW A; 1YIJ N; 3NF8 A; 1ZYQ A; 4A62 A; 4DLE A; 2ZWH A; 3G71 N; 4JI8 K; 2FSK A; 1IBL K; 4MO4 A; 1L5U A; 4KHP K; 2QWN A; 2O8B A; 4BDY A; 5KQ8 A; 1NMD A; 4OX9 K; 3SLC A; 1BG3 A; 3AVC A; 1YAG A; 2P9I B; 4KHY A; 3ZSY A; 1WUA A; 3SK3 A; 4B08 A; 1HR0 K; 1FXX A; 5AFU A; 5LY3 A; 3ZCM A; 1RTI A; 2CGL A; 1VSK A; 3VPZ A; 2VGN A; 1QQM A; 3V6D A; 1C0G A; 1WAJ A; 2LSN A; 5DM7 L; 1JL2 A; 1WSE A; 3TAP A; 3MN9 A; 5FPD A; 3IKM A; 3VER A; 1KC8 O; 3NDK A; 4JK7 A; 3LM2 A; 4ILJ A; 2E1Y A; 4O44 A; 4PUO A; 4CJU A; 1LOT B; 2A3Z A; 3BZC A; 3C0B A; 4ICL A; 1NKB A; 1KCF A; 3ZSW A; 4IBN A; 4WFN L; 3BGR A; 1QVG M; 3RRG A; 1KD1 O; 1VSM A; 4FW1 A; 3VGL A; 4FWK A; 2P9U A; 4CEQ A; 4MFB A; 4ID5 A; 3NVM A; 4K0K K; 3O3G A; 3R9P A; 3V4I A; 1D9F A; 1RNH A; 2BGG A; 2X6N A; 2GWK A; 4IEE A; 4FJK A; 1JLQ A; 3KWI A; 3QLH A; 3D45 A; 4BG9 A; 2P9S B; 4EHT A; 2YNG A; 3OYK A; 4A2A A; 2PYL A; 3L4Q A; 3T3F A; 3K58 A; 1XWL A; 5TKW A; 5AQN A; 4EFH A; 4OJR A; 3VQ9 A; 4X65 K; 3UE5 A; 3CF5 L; 4ISG A; 4E1M A; 4I7F A; 1KVC A; 1RTH A; 1NGG A; 5AR0 A; 3T1Y K; 1SV5 A; 1RBR A; 1QSY A; 4CGJ A; 3OJU A; 1IBK K; 2NRR A; 3D6R A; 1YTU A; 5CZ2 A; 1NK4 A; 3EE8 A; 4DTJ A; 4WQ5 A; 2Y1I A; 2GBZ A; 1W2B M; 4WCE L; 4FJM A; 3B6O A; 4BQL A; 3BF1 A; 3TSP A; 4DUZ K; 1B92 A; 2XY7 A; 2A1R A; 4B3T K; 1HKB A; 1LAW A; 1RBU A; 1Y97 A; 1A5X A; 1NBW A; 3R1X A; 3CPW M; 3KD5 E; 4IOC L; 2IS3 A; 3OYM A; 2IIR A; 3F9M A; 2QWO A; 3OYH A; 1DKG D; 3ZLJ A; 3HTV A; 1D5A A; 4B9V A; 3HOS A; 1HKG A; 3LWL A; 4FWN A; 4G9Z A; 3VF6 A; 3VQ8 A; 2X6S A; 4ZHR A; 3IAY A; 1NKE A; 1Q7Y O; 1HYS A; 4CJS A; 1EO1 A; 1KLM A; 3FLC O; 4CHZ A; 2NLX A; 2W41 A; 3S9H A; 2HMI A; 1XHZ A; 4J2E A; 2YHY A; 3ENH A; 4JHD A; 4EP4 A; 1X9M A; 3OA9 A; 3IS9 A; 3WNH A; 4DV0 K; 2F8T A; 3NF6 A; 4CHP A; 4J2A A; 1I39 A; 3HRG A; 3NF9 A; 4MLH A; 2W40 A; 3LDO A; 1T03 A; 4N56 A; 1OH5 A; 2O8C B; 4DU4 A; 3DLL L; 1JLG A; 4J2B A; 3DAW A; 3M3Z A; 3OBY A; 4BC4 A; 3VQQ A; 2HF3 A; 4GY2 B; 4JI1 K; 3W3D A; 4K41 A; 5AQK A; 3K59 A; 3CCS N; 4DQS A; 5HLF A; 3PO5 A; 3CJ9 A; 3NFA A; 3S41 A; 4CHY A; 3EN9 A; 1ZBF A; 4DSI A; 1C1C A; 2QK9 A; 4FSV A; 3O6W A; 1HJO A; 3UB5 A; 3S3M A; 4CI6 A; 4DQI A; 3M5R A; 4B3O A; 4NCB A; 2QWL A; 4H0V B; 4B8C A; 4A57 A; 4BR7 A; 4ELT A; 2FLO A; 1NK8 A; 5JLH A; 4HUF A; 4KV8 A; 1T8E A; 1L3V A; 1NGJ A; 5BRE A; 3VES A; 3G4S N; 1VSE A; 4H5R A; 3ZSV A; 1HX1 A; 5SWM A; 2NNW A; 3JAM O; 5KTQ A; 2KTQ A; 4Y1C A; 4X64 K; 3H08 A; 2ZGZ A; 4FK0 A; 4QS7 A; 4KHQ A; 3D2F B; 4FOI A; 5KGX A; 4JKB A; 3C6T A; 2QXL A; 3CC2 N; 1RDA A; 1IV0 A; 2HB5 A; 1TVR A; 3FE1 A; 3SQ2 A; 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1N34 K; 4O8U A; 1RBS A; 5T7B A; 4O5F A; 2KW4 A; 3CJB A; 5CE3 A; 4JKG B; 3I8B A; 3RRH A; 3IMX A; 2E8A A; 3P83 D; 5LMU K; 4M3W A; 4BWJ A; 4RG8 A; 3D0P A; 4B3S K; 3LAK A; 1U48 A; 1HPZ A; 3FZK A; 1KLN A; 5AQV A; 5E26 A; 3FR0 A; 2P9N B; 2E2N A; 1ITG A; 1N32 K; 4FW2 A; 2WON A; 3O9R A; 3HST B; 4Z4G A; 1REV A; 3QFP A; 4NLB A; 4IZ9 A; 2BE2 A; 3HBT A; 2OPQ A; 1KAY A; 5C25 A; 1R59 O; 3MMV A; 2AJQ A; 1HNV A; 1R0A A; 1NU0 A; 4B1U B; 4DTS A; 5AQG A; 1K6Y A; 4DTO A; 3MXJ A; 3EEQ A; 1NK7 A; 3ULD A; 3A5O C; 3SQ0 A; 4A5B A; 3WXJ A; 1RTD A; 1XC9 A; 5AQM A; 5HP1 A; 1NJZ A; 1JJ2 M; 5DMR A; 2KFN A; 4BR5 A; 2YJF A; 2P5G A; 4XH4 A; 3RR7 A; 3HM9 A; 4H4O A; 4PKH A; 4B3R K; 4FVM A; 1IO2 A; 2A41 A; 4BE2 A; 1JCF A; 5ADX A; 1BDG A; 3DLB A; 4LFC K; 5TKY A; 1CLQ A; 3DXM B; 4CGG A; 4WQ4 C; 4DS4 A; 3M8Q A; 3LAM A; 2FSN A; 4ZTJ A; 2XO7 A; 1RT4 A; 4HVJ A; 4W5O A; 3THW A; 2CGK A; 1KRP A; 4QCL A; 5JVH L; 3WEE A; 3OS2 A; 4FWP A; 3L2R A; 4JKF A; 1RT3 A; 4CJ3 A; 3CG7 A; 1RT2 A; 1KSP A; 4YOY A; 3QIP A; 1U2V A; 4OPH A; 3AVJ A; 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