4DXBA

2.29a structure of the engineered mbp tem-1 fusion protein rg13 in complex with zinc, p1 space group
Total Genus 208
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
208
sequence length
637
structure length
637
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHWGSGGGHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGSATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Sugar binding protein, hydrolase
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, Beta-lactamase TEM chim
publication title Structure of an Engineered beta-Lactamase Maltose Binding Protein Fusion Protein: Insights into Heterotropic Allosteric Regulation.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 208
structure length 637
sequence length 637
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.5.2.6: Beta-lactamase.
pdb deposition date 2012-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF13354 Beta-lactamase2 Beta-lactamase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxbA01
3.40.710.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Beta-lactamase DD-peptidase/beta-lactamase superfamily 4dxbA03
3NDGA 2HZLA 3DWKA 3HBRA 5KZTA 2V2FF 3LBSA 3SS5A 3ITAA 2ZQ8A 4JWOA 3AXFA 4S2MA 4EDPA 3FV2A 1JW5A 3A3UA 3CRBA 5FTHA 3VVEA 2XXHA 4OKPA 3MZEA 3PBQA 3ONMA 1DY6A 3A3EA 3ZFZA 4OPQA 1XGJA 2QSXA 5AQ7A 3KEIA 4QB8A 5DT6A 1FQCA 4ZJ2A 4MLVA 2F36A 1RCJA 3WS1A 2ZM2A 2W7YA 3VLWA 1USYE 2F35A 4ZZAA 3I7JA 4S2NC 1PI4A 3PAEA 4KZ4A 4OEVA 1RGYA 5I2NA 2XF3A 1US4A 1D9YA 3OSQA 1A55A 3QAXA 1KVMA 3PTEA 1ZMGA 5HM4B 1W8YA 1MPDA 2PU2A 1BULA 2Y4AA 4CJNA 2X02A 1CEFA 4XTCQ 2NOOA 4O3AA 3M8UA 4OHNA 3G4PA 3ZDJA 4WZ5A 1IKGA 4RXLA 4H5FA 4LV2A 3S4UA 1D9VA 4G68A 3DP6A 4U4SA 3A3DA 5DVFA 1IZ1A 4E3NA 1B6HA 4NF4A 3K00A 4EUZA 4DXBA 1PZPA 3OZHA 3BECA 1YLTA 3GBBA 3VP1A 5ISUA 1CK3A 4MEZA 4OERA 5A90A 5FHMA 4C0RA 2VOZA 5FQJA 4LQ2A 4OFJA 4JSDA 2R9JA 3DLNA 1IUDA 3ZSFA 3EHSA 5EHSA 2GHBA 2ZYOA 2ZLYA 4GD6A 3TDJA 5CGWA 1GVCA 3EN3A 1FCNA 1B51A 2XDMA 2I58A 2EX2A 5GHYA 5DYHA 4PM6A 3CG1A 3IJXB 2RKMA 4ZEBA 3SEWA 4UA9A 5DTSA 4YFMA 3LCEA 3C33A 1K57A 1YLZA 4R72A 1NRFA 4RA1A 3PUYE 1PB8A 5H8QB 1B40A 4ZDMA 3P98A 1MQJA 4OQOA 1NZUA 2PX1A 1YLPA 5EOOA 4FCFA 1DPEA 1HD8A 5FTIA 1SDNA 4TLMB 1L0GA 3I3VA 2ZXTA 1MBLA 1BSGA 3C34A 4P6BA 3PD8A 1XVXA 5M2VA 2ZYNA 1MXOA 3UE0A 2E8IA 1OMEA 5FHOA 4GOTA 4ESXA 3TFLA 1Z6FA 4R4SA 3O66A 2Y2QA 4I8CA 3MC2A 3U92A 3FUZA 5FQQA 1IXCA 1KE0A 1DJAA 5FAQA 2DP8A 2Z22A 4WZ5C 1P1UA 4C1TA 4N07A 5HX9A 1BT5A 3PPRA 3WAFA 4RA7A 4E0XA 3EHTA 5AA4A 2QRYA 5H8FA 3G31A 1G6AA 3HLCA 4BDNA 4FATA 3W8KA 3HLGA 1QUJA 2HCAA 4NF8A 1XC1A 4FD8A 2DE2A 2O84X 1ZG4A 1Y3QA 1RYXA 5TP9A 2YJPA 5J8XA 2XLNA 1E4DA 1H8YA 4BD0A 3UPNA 1B5JA 3IAZA 1SW2A 2PT1A 5HAPA 4KI0E 5H8HA 1KDWA 1UTBB 5A93A 1S6RA 1ES3A 1NXYA 2WGIA 1B3LA 3PBOA 2J8YA 3HHFA 4ZDXA 3OELA 5AA2A 3UORA 3FGSA 4DXCA 3LC8A 4GF8A 4OONA 4E3OA 1IKIA 2UXAA 1IXGA 4ZEIA 1HSEA 3VLVA 3K6UA 4OOMA 3HLEA 4JXSA 4EQIA 3UPPA 4N9LA 3V89B 2Y2IA 2P9VA 2DWAA 2WZXA 2ZQDA 1MQGA 2DE3A 1ZJLA 4WMCA 2NWJA 4F39A 4LV1A 4YZZA 3G34A 5I2KA 4HCYA 4ZS9A 2JCHA 1E3UA 2DVCA 3Q28A 3V5MA 3PMVA 3D4GA 4GLIA 3HL9A 3QXMA 1DSNA 1A99A 2XH9A 4LENA 2VGKA 1VQQA 3QUJA 2ZQCA 4UA6A 1MDP1 2Y7PA 5AA1A 4BENA 4GIZA 1YLWA 3IH9A 1NH8A 3MUQA 3G3HA 4GL8A 3CSBA 4PPRA 1MXXA 2WAFA 2AL5A 1MY4A 1QMEA 3SETA 3BEBA 4F3PA 3N7WA 1H43A 1SYHA 3MZDA 4K0WA 4JBFA 3HSTA 3KJTA 1MY1A 4PFTA 3O86A 4RK2A 3IORA 5TPAB 4MBHA 2WZZA 1P1QA 1LGBC 3CFXA 2UYEA 1HZOA 1ZC2A 1TFAA 3SEXA 1K55A 3FVKA 3ZKLA 3IHBA 4BDRA 2ESNA 3C31A 3E2KA 4F31B 3Q29A 1B3FA 3OSRA 3ZG7B 2XD1A 2OJTA 1PBPA 2I49A 5M1AA 1LB9A 1ONGA 5DF9A 1N04A 1XXMA 3MKEA 4OPRA 3OENA 4XUZA 1FCKA 2OBGA 2C5WB 3NIAA 5I56A 4HBTA 3VSKA 3IXDA 4F1VA 2XXVA 4GD5A 3G2ZA 5E2HA 5KSCA 4G8NA 3BRMA 1ERQA 3ZG5A 2ZQ7A 3HPIA 2D21A 3MZ1A 4U0XA 1YMXA 3OEKA 3BFUA 4YMBA 5H8FB 4NF5A 4QY5A 4EBLA 1GR2A 1ESUA 5D3OA 4YMAA 3A3IA 2F7CA 1WDNA 3BM6A 4RYAA 5M19A 1YT4A 4IBRA 3UA8A 5TP9B 5AA3A 4X68A 2XX8A 1H8ZA 4KYSA 4S2OA 2H9BA 1XOCA 1N76A 2YLNA 3O97A 4Z0IA 2NXOA 4BLMA 5H8HB 4Q8RA 3CJMA 3ZNTA 2WGVA 2UVIA 4OPZA 1LHYA 3U1OA 5AA2B 5FQKA 3PU5A 1XA7A 3IJOB 2G2UA 3W15C 3VOYA 4U23A 5ITPA 4OTEA 3Q07A 4R1GA 5ICTA 4DDYA 3B3XA 2DYXA 2Y84A 4GWOA 3O3VA 4GXSB 2H98A 2V84A 4DLDA 1HVBA 5L8DA 5L9OA 4GL0A 2ZC4B 5I2KB 4EWFA 4EQ9A 1WYBA 3GQZA 3VFFA 4GFRA 3KJ7A 3P09A 1MWRA 2WADA 3GXAA 3MKFA 3I6VA 1PWDA 3PUWE 2E1SA 1FCOA 1NZOA 2X7PA 2X26A 1ALQA 5CHUA 1M5EA 3C7UA 4GN2A 3IOVA 1JTDA 2WGWA 4AQ4A 4Y0OA 2R9WA 1SI0A 1XHYA 2UYFA 1D3KA 1SI1A 1YAEA 3ILTB 2QS4A 2X71A 1K38A 5CMMA 4LZ7A 3IX1A 2I0CA 1NMUA 4IBXA 5L9MA 1I2SA 2O1MA 5JK4A 1SDEA 4P0GA 4B4ZA 4PM7A 3FXRA 1K56D 5AQ9A 1GA0A 4HBUA 4R75A 2B3FA 1O64A 3AGDA 3LY3A 3W9WA 1G68A 3N4IA 5FHNA 1BLFA 3PMXA 2HP5A 4X1BA 4YKPA 3FVOA 4THIA 4RY1A 4KR5A 1W5DA 3BFCA 2BG1A 4IVIA 4MBKA 2XXYA 4LONB 3IOWA 1K6RA 1TT1A 3EPEA 3HO7A 1N3WA 4IGTA 5FQMA 1BLHA 1BLSA 2P1SA 3TKDA 3OXNA 3CI8A 3D4FA 1ZKJA 1KE4A 3PV0E 3DP4A 3HCQA 2HXWA 2OSUA 3Q7VA 1XKZA 4RPNA 1I5QA 1N84A 3FVGA 4NF5B 3FIRA 2XXTA 3BKIB 1LL5A 2YPNA 3ZG0A 3IH8A 4PMAA 1EU8A 1ATGA 1SW1A 1TWYA 3SKPA 3T9VA 1S7YA 2XD2A 1K54A 1LCTA 4E3JA 4WEPA 4YKKA 4RX2A 1OVBA 5H8SA 5K2YA 1BTLA 1A8FA 5FASA 5E2GA 4BDLA 4DXUA 3LY4A 4OOLA 1MM6A 4ECFA 4BL3A 1B5IA 1CE2A 3V83A 4PQJA 4LATA 4K3FA 4UA8A 1BKAA 1XT8A 3CZDA 4JDFA 1JEUA 1MPCA 3G3KA 4G8MA 4S2NA 3FJGA 2ANJA 4NMYA 1NNFA 4CPKA 5CBSA 4OP8A 1YPNA 4FSFA 1KWHA 4ZTKA 2R9XA 4LZ5A 4KZ8A 2IWBA 3U8QA 1EI5A 2G93A 2A3UA 2XK1A 3P7IA 2EXBA 4S2JA 4WEKA 4BDMA 5HAIA 4GD8A 1OMPA 3SESA 3OO9A 5H8QA 2Z8EA 1MKIA 5CM6A 3T9HB 3GR2A 1KE3A 4BL2A 2V3TA 3G3JA 5JYPA 2RF1A 2JC7A 3TSGA 5BOHA 1A8EA 4R0QA 4NE4A 4NK3A 4N1HA 4OENA 4EF1A 2OV5A 3WS2A 2XX9A 3Q27A 2DSFA 1M40A 1IYOA 4UACA 5CERA 2M8CA 1XS5A 5BWJA 1SDXA 1B1XA 3MP8A 2Q89A 4X48A 4GVOA 1SBPA 2IA4A 3JV9A 3KSXA 2GHAA 1P1WA 1GA9A 3RPWA 4OVJA 4NWCA 4Y0UA 4U1ZA 4RYEA 3S22A 2X01A 3A3CA 1LAFE 1BZAA 2O7UA 2H0YA 2QMWA 1L5TA 3G7WA 4UHUA 3G30A 1Q2QA 3N8LA 3MZFA 1I2WA 2DE4A 4WBGA 2EXAA 4G8HA 4KZ7A 1FCMA 2I3VA 3H6VA 5FATA 2ZNTA 2RL3A 4XKNA 1JVJA 4X1DA 3FWLA 4QSCA 3ZVWA 1W7FA 2WUQA 3Q7VB 5E43A 4R6KA 3RN8A 1FQBA 1UTBA 1UTHA 1MPBA 3OPLA 3KOTA 4YB6A 4U21A 1P1NA 4RNSA 4ND9A 2ZMBA 4JKTA 1R9LA 1VR5A 2O7IA 4ZJ3A 1GHIA 2ZM8A 3NDEA 4KENB 5GLDA 3CG5A 2B3BA 3K01A 3EQVA 2CMOA 1IYPA 3C4OA 1XX2A 2O69A 3MP6A 1PIOA 4MH5A 2O51A 4FJPA 4FECA 4EUOA 1QMFA 4R23A 5JYOA 1SYIA 1FOFA 1AOVA 2EX8A 1IIWA 1LAXA 5FI6A 1K4EA 2VD2A 1MRPA 3IO6A 4EBPA 3HLWA 5EVID 1FQEA 1DOTA 3M3LA 2AIXA 2P0SA 1UQWA 1SKFA 1A54A 3K02A 4WXJA 3G35A 4PFYA 1B1HA 2ZMAA 1B5HA 5FAOA 1II5A 2DS9A 2XXPA 1YM1A 4ZJ1A 1ZKBA 2QZ6A 1FSWA 3HUMA 5KZHA 3HLBA 4MLQA 2J9PA 3RNNA 3S2VA 1LBBA 4DE8A 4KZ3A 4OQIA 1WVJA 2IWCA 5FAPA 3MXRA 3WS0A 4X69A 3LO7A 3M2KA 3E4RA 5TPAA 3IF6C 4LZ8A 3W9VA 1E25A 5DEXA 4DKIA 3PBNA 2DWHA 4F22A 5CEDA 3GBAA 3IB0A 2I0BA 4IO5A 3BFTA 1MH4A 5F82A 3UGWA 1LAGE 4LA9A 1PZOA 1MXYA 3G2YA 5F83A 4FIMA 3CVGA 3QYTA 5KDTA 3TODA 2UVHA 1IQ7A 1AXBA 1I69A 1N4OA 3HLFA 3SS4A 3H03A 5E2EA 1JWPA 2BLSA 3K2DA 4U0TA 5TGFA 3VP2A 4GDBA 3FASA 4OP5A 1ES5A 3UIFA 1MG1A 3MJNA 2FYIA 3M2JA 4FORA 3GMWA 1T0KA 1FW0A 3S9LC 1B3GA 3R6UA 3S9NC 3C5AA 3MAMA 1PBQA 3RJUA 4H1XA 3PD9A 5CMKA 1IYSA 1KGFA 4IGRA 2C6WB 4KZ5A 3UDXA 4BD1A 2Y2KA 1AL3A 2Y2JA 1MQHA 4E3LA 1IEJA 1ZTYA 1XVYA 3DP8A 2H5YA 2XR0A 1UIUA 1UTHB 2ZQ9A 1B3EA 2HAVA 3H6WA 5U47A 2Q9MA 3E9XA 3K6VA 1MY3A 2Y2LA 1OQHA 4F1YA 2QJEA 1MXZA 2I4CA 1CEGA 5HBCA 2WYXA 2O1LA 2QMIA 3TUSA 3QIMA 1IEMA 4N92A 3VE1B 1SD3A 1TDLA 1MQIA 1ZIUA 3JZJA 1JW4A 1MY2A 4N9KA 4EF2A 3Q81A 4NF6A 5F1FA 5HL1A 1ES4A 2OLBA 4Q0CA 2WAEA 3MWBA 3GRJA 1NNPA 4KZBA 3GSGA 3BBRA 2F6GA 3UDFA 4D2OA 1LAHE 4WEJA 4HEFA 1Q2PA 3DW0A 1MPLA 2OWTA 3IR1A 1L0DA 1OLCA 4KYEA 2QPQA 4KG2A 1P1OA 2P74A 4FEBA 1CI9A 3C9HA 4EXLA 1AIVA 4FE8A 3USDA 3PPOA 5CMCA 4QHQA 3W4QA 4L17A 5DEXB 3W4PA 3FKWA 4OOYA 3TQLA 3O88A 4OLDA 1B4HA 1DTZA 4QFPA 4P0MA 1VM1A 1S9TA 2WKIA 3IXBA 2OZZA 3WS4A 4O3CA 4I9DA 3A3JA 4F29A 4QU3A 4S2IA 1DMBA 3LSXA 4KQOA 1QULA 1MWUA 1RGZA 3A3FA 3VVDA 3UE1A 1B32A 5A5XA 5KDTB 4E3MA 2XFSA 3OO8A 5ELVA 3K1PA 2Z2MB 3CFZA 1QUKA 1Q1KA 5EUAA 4BDQA 4M3KA 2QL3A 3MP1A 3RXWA 1IELA 4IVKA 1O7EA 1BP5A 2EFUA 3WRTA 3IK6B 1RP5A 4WYYA 4DZ1A 1W79A 3CMZA 1Y3NA 3G32A 5CRYA 3H6TA 1XA1A 3OCNA 4Y7PA 4ELOA 4RVAA 4LCLA 3G3IA 2PT2A 1HSJA 1US5A 2QS1A 3T9XB 3ZKKA 4X56A 4PM9A 3PAGA 3PPPA 3K1MA 3O29A 1JWZA 3M3FA 2VHAA 1Z7NE 5AA2D 1VSOA 3UN6A 4DCXA 2Y55A 2XQZA 4R4RA 5IAIA 4GB7A 4XXUA 3OC2A 1PB7A 1URSA 1SW5A 3TEPA 4ELPA 1YTVA 3SS3A 2WK0A 2RCBA 5IKBA 1ZG6A 4RX3A 2V1ZA 4PFWA 4YAHX 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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