4DXVA

Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
TIQGSIVAIVTPMLKDGGVDWKSLEKLVEWHIEQGTNSIVAVGTTGEASTLSMEEHTQVIKEIIRVANKRIPIIAGTGANSTREAIELTKAAKDLGADAALLVTPYYNKPTQEGLYQHYKAIAEAVELPLILYNVPGRTGVDLSNDTAVRLAEIPNIVGIKDATGDVPRGKALIDALNGKMAVYSGDDETAWELMLLGADGNISVTANIAPKAMSEVCAVAIAKDEQQAKTLNNKIANLHNILFCESNPIPVKWALHEMGLIDTGIRLPLTPLAEQYREPLRNALKDAGII
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Dihydrodipicolinate synthase
publication title Crystal structure of Dihydrodipicolinate synthase from Acinetobacter baumannii complexed with Mg and Cl ions at 1.80 A resolution
rcsb
source organism Acinetobacter baumannii
total genus 111
structure length 291
sequence length 291
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.52: Transferred entry: 4.3.3.7.
pdb deposition date 2012-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4dxvA00
1SO4A 5F2IA 2WSYA 3IGSA 1LRTA 2C6QA 1FXPA 3DHFA 4LV9A 4AHOA 1A5SA 2TPSA 1SZNA 4BWLC 4IWWA 2NX3A 3W7MA 1JCJA 3D0CA 3G1DA 2QDGA 1S5TA 4UR7A 4DELA 4UMCA 3DKLA 2P0OA 4LVAA 4W9TA 3BLFA 4L4LA 2EF9A 2DZTA 1N55A 3HPZA 1LORA 1TRDA 3CB8A 1TCDA 3P5YA 5I3KA 2ZZ6A 2PRMA 5AHIA 3C4UA 1TB3A 1QCWA 1TPWA 3GB6A 1XM3A 2QCLA 3E49A 1EWDA 3T7VA 2A1YA 3W85A 4OT7A 3QSTA 2Q8LA 2YFNA 2VC6A 3GDKA 4IMFA 3FYPA 3NPXA 5G2HA 3EKLA 1F73A 2WJZA 2KZHA 3LTYA 3A21A 4O18A 3LRMA 2BWGA 3LBMA 1GTEA 3IIVA 4G1KA 3W7PA 1QOQA 3IV3A 4WY0A 2CLHA 3QW4B 4LC8A 3RK8A 3E02A 4Z1BA 3LCFA 3B05A 3W22A 3EWBX 2ALDA 3IEBA 4LVDA 1JRCA 2GOUA 4CCCA 1J4EA 4ZQOA 3W7IA 1Q3NA 3GDMA 4AVFA 5SWUA 4NJIA 3FLUA 4I7VA 5D05A 4U28A 5EPDA 4E2BA 2RDUA 4JYDA 2ABBA 2I1OA 3W83A 5AHNA 1EUNA 5FESA 3NQ6A 3S8HA 3O8AA 3C0JA 4DXVA 5HULA 1LROA 4UTKA 1FCUA 1JUKA 2VFGA 5HR7A 3N2XA 4JTEA 3TXZA 3M44A 4H4IA 4NJGA 3I65A 3MYPA 3NQDA 1J2WA 3PY2A 4K7YA 1ZJIA 4IJBA 5BMXA 3F1QA 4NQ1A 5G2WA 1MSSA 3UY8A 1KFLA 4JDBA 1GVRA 4OV4A 4ZVJA 1GEQA 3UPBA 2NWSA 1UUOA 1KFEA 2JKAA 4L4MA 1O5KA 3G22A 4JTUA 4O13A 3BPWA 3KVKA 4I7WA 2JK2A 1QOPA 3N9RA 5CZTA 2Z6IA 2WSQA 2Y62A 3DFNA 4RCXA 2FJKA 2PCQA 4JTSA 4YCPA 2VENA 4GRSA 5F4WA 1I2QA 2C13A 4O8RA 4ORMA 1EX5A 4QISA 2TSYA 1T96A 1QO2A 1VPXA 3L0KA 3LRLA 5FF0A 3W7EA 4WZHA 1U5JA 5TQLA 2A85A 2XFWA 3T55A 3TXVA 1KLZA 5H91A 4ML9A 5HR6A 4BI7A 3IRDA 3W7KA 5F1VA 4NJHA 4N9EA 4AWUA 1DBTA 1RR2A 3QJAA 3STFA 1RQEA 4M7TA 4HNTA 1IXNA 3ZR4A 3ZFHA 1YADA 1L2UA 1GVFA 1PL9A 5A8GA 1SFJA 5DXXA 2NXGA 3IIPA 3W2NA 1SO5A 3V1PA 2P10A 4O17A 1H7PA 2X2GA 3B0UX 5DCDA 3TFXA 2CLLA 1VCGA 5AFDA 2BX7A 3A5FA 4O1CA 2E5DA 4GE8A 3QRHA 3QMSA 3ELFA 1TPH1 2OZ0A 4DEFA 4UFKA 3LLFA 5F4XA 1ZY9A 3C6CA 2NUXA 3DU0A 1TMHA 3C2EA 4I7UA 3UWYA 4LW7A 3GX9A 3W1MA 4ZQMA 3GAKA 4N9BA 4TIMA 1FY6A 5CG7A 4XUGA 1ZNNA 4HNVA 3W88A 2DZSA 3Q37A 4RJEA 3NNTA 2VEMA 5L9FA 4WXYA 3LXCA 4LRTA 2Y89A 4UFMA 4LS1A 2QCEA 2OMAA 3P62A 1YXDA 3TSMA 1H1YA 4UR8A 1SU5A 3R12A 5F2MA 3FFSA 2ZRYA 3CM4A 2VEPA 3HMJG 1QAPA 3B0VC 4UTIA 3TV8A 2OX1A 3E96A 5FI8A 1EA0A 4EF9A 3MHFA 1XI3A 2VKZG 3TQKA 3DFPA 3W1LA 4UMAA 4JX5A 1W0MA 3WJZA 3O15A 4K36A 2ABAA 3W2LA 3W2MA 3SZ8A 1KTBA 2QUUA 3NEVA 1IIHA 1F76A 4LY8A 2X30A 4UFLA 4GUJA 3OA3A 4OV9A 1R2TA 3S5YA 1DHPA 3CEPA 3UYCA 3EWZA 4WXZA 1LLZA 3OEXA 4Y8FA 5HUOA 1MXSA 3LCHA 3WK3A 2ZQ0A 4FO4A 4MZ8A 3HO8A 1NF7A 4FF7A 4TMBA 1C29A 1BWKA 2ZTKA 3HGJA 5DCEA 2ISVA 5CSSA 1KFBA 2A7PA 2WO5A 4AF0A 3CHVA 4AHPA 2X16A 3HG3A 4IMCA 3H53A 1HL2A 2X1UA 3OVQA 1SZFA 3DHDA 1ICPA 1I2NA 1VC4A 2NV2A 2EAWA 3NG3A 4LC6A 1W5QA 4X22A 4N4QA 2PURA 2X1SA 1Q6QA 3P60A 2WQPA 2X1TA 2QAPA 4JY9A 1QWGA 1P5BA 1WOBA 1J5TA 1YPFA 3DAQA 5AN7A 5KSWA 1P1XA 2A2IA 3C2RA 2W6RA 4JX4A 1UBSA 4IMGA 4AWSA 3TAOA 4EIVA 3TK7A 3L0GA 1D9EA 2PC4A 3A23A 4XBKA 3LI0A 1YTEA 4JN6A 3DI1A 3M7WA 3SGZA 5MHBA 2HSAA 4HPXA 5GVJA 2BLEA 4R53A 4PL2A 5T26A 3PSWA 3W7HA 3O16A 4AAJA 4WOQA 3LXBA 4FX7A 3VFLA 3V75A 2H90A 1ZCOA 3G24A 1B4KA 3LHUA 3W70A 3ABSA 3CIWA 2VFIA 1A5AA 4XQ6A 4TMCA 3P81A 3FS2A 3M5XA 1DVJA 5CPOA 3M5ZA 3U2OA 1VLWA 1HO1A 1TYGA 2FB2A 4X3ZA 3RF9A 1H7OA 1EEPA 5LHFA 1K7EA 3BVJA 5LNVA 3TA6A 3PC0A 1FWTA 3G8RA 1LRNA 1ZAIA 1N8FA 3NAVA 5TIMA 4A21A 5D2WA 2CLIA 4M19A 3TKFA 3W1NA 4P61A 5LGZA 3GAYA 4OHQA 4BI6A 4LVBA 5E1QA 2QCDA 4IQLA 3CQ0A 4Q4KA 1WV2A 4OBTA 2YR1A 3SR7A 2V81A 5AYYA 4JTKA 2WNNA 3OIXA 2E6FA 3QFEA 2QF7A 4Q33A 1M5WA 1SFLA 5D2VA 1X1ZA 2FLIA 3CWOX 3EX3A 2H3DA 3LX9A 3TU9A 1TTIA 2QCCA 3IIXA 1CX9A 1DL3A 1O4UA 3JS3A 5A5WA 3W1XA 3AJXA 3KOFA 2HS6A 4QQ3A 5L6UA 3GDRA 4UTLA 3TC6A 3CTLA 3R5EA 3NR0A 4ONVA 4YLWA 4FNUA 4MUZA 4O4VA 1YDVA 1FUYA 3NQCA 3TQVA 3EXRA 3W2JA 2DZWA 1TV8A 2V82A 1XC4A 4ADUA 1OX5A 1JUBA 4GUHA 1W3IA 4IXHA 5DY3A 1KM0A 4FIRA 3UZJA 3S1XA 4UTHA 5C54A 4BR1A 5DN1A 3VE9A 3C2VA 2UV8G 3C52A 4U4MA 1JCYA 1JUEA 5D04C 3W7LA 1FXQA 5FEWA 3N34A 2V9DA 4LUJA 1D3HA 3N19B 4O0ZA 4JY8A 4MIMA 1M6JA 2O7SA 3M1ZA 1H5YA 3RLUA 3E9AA 2NLIA 3LB0A 1MEIA 5G4EA 3EXTA 3W1QA 4JYFA 4YCOA 1F5ZA 3O6YX 4JIQA 1K03A 2YXGA 4O52A 1OJXA 1RZMA 3AO0A 3G1XA 4FHAA 4O15A 5LNRA 3L0NA 2FPTA 2VFEA 1W3NA 5D2YA 4S2BA 5LSMA 3IVSA 1TPUA 4N2YA 4MYXA 2ZA2A 4MKNA 3HQ1A 3BGGA 1I2PA 2JKPA 1KA9F 1JQVA 2ZDRA 2FPYA 3MP4A 4DF2A 3M16A 3P8IA 1NAL1 3NQVA 4NJKA 4TU1A 4YL2A 3WFAA 1G4EA 3MMTA 3KXQA 1M7PA 3THAA 3W72A 5EY5A 4N6FA 4Y9AA 5G4WA 1GG0A 2Y63A 1KM2A 1P4CA 1M7OA 1AG1O 2GPTA 2HTMA 3LHWA 2IQTA 1W1ZA 1FDYA 1LBMA 3BG9A 4JTLA 4GUIA 2E09A 2JGQA 2FTPA 3T4CA 5EYWA 5AHEA 3W7NA 4PCFA 2H8XA 1OVDA 4LS0A 1TQJA 3UWVA 3L65A 3G1SA 4NJJA 3SSJA 1TPEA 1VS1A 1W31A 3QM3A 4UUIA 2YYUA 5HJLA 4HNUA 3CPRA 3TW7A 4LS2A 1ML1A 4C1LA 4WX2A 3NVTA 1VCFA 2VXNA 3ATYA 2QAFA 2G97A 3LHVA 1W5NA 3JRKA 3P82A 5CZ0A 4UTWC 3W87A 3UZ5A 4OU1A 4K7VA 4YWIA 4GUGA 3N14A 5KZMA 1OHLA 5K4ZA 3TJLA 2QJGA 4Z08A 4EVZA 2ISWA 3A22A 4O53A 3DFSA 1TIMA 4H3DA 1KM5A 1KW1A 1NSJA 5DXYA 3TR2A 1MO0A 1VHNA 3T44A 1G69A 4HT3A 3K30A 3LDVA 3CC1A 3QZEA 4HNNA 4RKAA 3C61A 1TQXA 3MYOA 4UTMA 1P0KA 3TROA 2NXIA 1L9WA 1RD5A 3BO9A 3RMJA 1ONRA 2Y70A 2ZCGA 1EP2A 4DO5A 3FOKA 3FJLA 3W75A 3LTPA 4LUIA 4XWUA 3USBA 1H63A 2RKXA 1T8XA 2C1HA 2ZRXA 4C1KA 2DJLA 5LNWA 1FCBA 4YXGA 1IXQA 1GG1A 3G0XA 4E0CA 2CU0A 3LCWA 1IGSA 4ADSA 2FB3A 1V5XA 3TIMA 4AEOA 1PCKA 3PWAA 1OFOA 5K4XA 3LV6A 4Q32A 2BSLA 1TPB1 3BW3A 3LCXA 5G2IA 4MZ1A 3W2UA 3W7QA 3GDTA 1RV8A 2FIQA 3STEA 5G5IA 3TC7A 1NEYA 4M6VA 3MHGA 1KFJA 4JDYA 5CPMA 5LNUA 2WNZA 3THQA 1N7KA 3RNDA 3FKRA 3GR7A 3G0SA 1YTKA 1I4NA 2OT0A 3TMQA 4ZQCA 2WKJA 4KFNA 2GUUA 3LGEA 4UTTA 2QEZA 3NPVA 4GJ1A 4CQ9A 3CIXA 2I14A 1ZAJA 3EB2A 3BV4A 1E51A 3DFTA 3DZ1A 1CW2A 3PUDA 1ME7A 2PRLA 4DO6A 3HBLA 4WD0A 1SUXA 4N9CA 5FF3A 3FYOA 3NZRA 3M6YA 3F03K 3C2OA 3TH6A 3QYQA 1F74A 3L68A 4K38A 3NL2A 2Z0IA 1XBYA 4XTDA 1OYCA 2VOMA 4GXMA 3EWUA 3LERA 3MI2A 3PBYA 1JCXA 3EX4A 4JICA 5K9XA 4OQVA 2NWRA 3SJ3A 5D32A 5HINA 3PBWA 4OE7A 4NVTA 2Y88A 5AHFA 1R2RA 2QUVA 1B9BA 1QR7A 4QM1A 4XZ9A 5F1UA 3W7OA 4WQ6A 1Q6LA 3STGA 3MP5A 4NZJA 4S2CA 1OFDA 5HQEA 3S0CA 3OHIA 3B0PA 3N3MA 3GIYA 1OK6A 4ORIA 1I2RA 1OFAA 1SW3A 5U4NA 4LVFA 3EWWA 3S5NA 4K8HA 5AC6A 2V2DA 4FXRA 1BEUA 4NT0A 4OGZA 5KZDA 1QFEA 3DFOA 3EX1A 4QSHA 4QAIA 4UTJA 3P8JA 1QDSA 3NPUA 1W3TA 3M41A 4ZMGA 3NYZA 2C16A 1VHCA 1C9DA 2P1FA 2FFCA 3VNDA 4M6PA 2YZRA 3TSDA 4A2SA 1W8SA 1X6UA 1H1ZA 2ZZ5A 5LGXA 3MO7A 4HN4A 1YYAA 1DQXA 2C0AA 3MBFA 4ZL1A 5LNSA 1QPRA 2D73A 1YDNA 4RZ6A 3NM3A 3EKZA 3HOJA 3S6DA 2EKCA 2Y7DA 1OFEA 5CZJA 4JTIA 4UNLA 5AYZA 3PG8A 2E6YA 2DZXA 4NUWA 3G3MA 1LTDA 2CW6A 3PBUA 1OX4B 1ME8A 2Y6ZA 1OFQA 1KTCA 4HIBA 3PG9A 4MLJA 2C3ZA 1H50A 3ATZA 2YPIA 2ZZ2A 3GK0A 1LOSA 1H60A 1GVQA 3FIGA 1MZHA 5EBUA 1WA3A 1HO4A 1TO3A 2QCNA 3NXFA 2HS8A 3W07A 3G1AA 1WDWA 2JKEA 4K8EA 1F2JA 3HG5A 4FEZA 1GYNA 4BF9A 1KTNA 1F6PA 1XFBA 5FF4A 1BTMA 4POCA 3HJZA 1OABA 3ANYA 1GT8A 4GNJA 3NL5A 3NQGA 3MP3A 3NO5A 1U83A 2QCHA 1S3HA 4UTTC 2WSRA 3I6RA 1JULA 3TW6A 3P67A 4WY0F 1T99A 4JX6A 5EMUA 5I3GA 1DJQA 4UCGA 3A5VA 4Y6GA 1AL7A 5LHEA 1VYSX 5DELA 2EPHA 3O63A 3KVMA 2XN1A 3W7CA 1TPDA 4HSOA 4LU0A 1OYAA 2CFFA 4FIQA 4PODA 2NV1A 3QQ0A 3N73A 5I3FA 2FPVA 3OG3A 5I3HA 5DLCA 4JTHA 3UQNA 3PSVA 1A50A 1WBJA 3UD6A 4DF1A 1P0NA 3CT7A 5KTLA 4BK9A 3LCLA 1Z41A 4HHPA 3UPWA 3P5ZA 1W5OA 4IXXA 4NNCA 1RQHA 1H51A 5FF2A 3SECA 4RV8A 5K9CA 1TREA 3DFQA 3IVUA 3M5VA 3NQ8A 1FWNA 4JTJA 1NFBA 3TFCA 2LLEA 3GXNA 5KINA 4K6AA 1JRBA 4A29A 4CQ8A 3LHYA 2A4AA 3HB9A 3W74A 2GQAA 1KM6A 2F7FA 1KFCA 1A5CA 2Z2UA 3R89A 3W3OA 2VELA 4KKXA 4ZZ9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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