4EAHD

Crystal structure of the formin homology 2 domain of fmnl3 bound to actin
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
368
structure length
356
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title FMNL3 FH2-actin structure gives insight into formin-mediated actin nucleation and elongation.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 104
structure length 356
sequence length 368
chains with identical sequence F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4eahD01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4eahD02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4eahD03
4FPAA 3CIPA 3AAQA 5E84A 4CZJA 3D2EA 3HZ6A 4AM6A 4YDUA 3D2EB 5KQ8A 2AP1A 5LY3A 2Q0RA 3UKUA 4JHDA 4A2AA 1DGKN 3EKUA 4H0VB 4HTLA 4JHDB 4CD3A 2YCHA 5KPRA 2YJEA 4CZGA 1TYQA 3ATVA 1S22A 1V4TA 1ZBSA 5AQVA 3VETA 3HM8A 3D2FB 1R59O 4IO8A 4BRMA 4JNEA 3FLCO 2DPNA 4M7YA 3ZETA 2YHYA 4E1JA 4B1ZA 3H45C 5JLFA 2FXUA 3QMLA 4H5RA 3FZFA 1V4SA 1GLFO 4MO4A 3U9DA 2FLOA 1C0GA 3A8YA 1GLBG 4B9QA 4CJ7A 4BRNA 4I6MB 2ASMA 4CZEA 3CJCA 3IDHA 1XUPO 1DEJA 4DQ8A 1LOTB 5KQDA 4BC3A 1GLEG 5AFUH 4FWRA 1NBWA 4PKIA 4B1UB 4CZMA 2E88A 4BRCA 3QICA 4A62A 4BGBA 3CHWA 1YVNA 5F0XA 1NWKA 5AQYA 4FWMA 4XH5A 3BP8A 3DAWA 3MN5A 3WXIA 4CZFA 4K25A 1NGFA 5KPZA 2A41A 2Q97A 3IUCA 1WOQA 1NGCA 3GL1A 3H1VX 2FSKA 1K8KA 3FZLA 4IJNA 2E2PA 1K8KB 2J4RA 3VEYA 4BR5A 1RDWX 3HTVA 1NGEA 4PKHA 2A40A 4FWPA 2E8AA 1HUXA 1XC3A 3FZHA 3VPZA 3GDQA 3CJBA 4FWLA 5FPNA 5BPLA 4RCHA 2GUPA 3GG4A 3VENA 5AQWA 5AFUA 3UKRB 1JCFA 2Q1NA 2D0PA 4BGAA 3I33A 3BUZB 1KAZA 3W0LA 4CZLA 1BU6O 3M3ZA 4DB3A 3VEXA 2GWJA 3ID8A 4JD2A 1NLVA 2P9KA 1QZ6A 3L6QA 4BC5A 3SMPA 4WYBA 2A3ZA 1BA1A 5I9EB 3A5OC 3WEEA 2PAVA 3D7EO 5AQFA 1U2VB 2NZTA 1CZAN 2YHXA 2H3GX 3FZKA 1HKCA 3C0BA 4H0PA 2CH6A 1ZC6A 1RFQA 3CQYA 4BRFA 2HF4A 2E1YA 1Z05A 1Y64A 3DJCA 5ADXH 2CGJA 4IXCA 5AR0A 4C23A 5ELZA 3VEZA 4B1VA 4CBXA 1BOTO 1KAXA 3O1BA 3DXMB 1BDGA 5F1XA 1NGJA 3VF2A 1H1VA 1EQYA 3A0IX 2QWLA 1RGIA 4BR0A 4BRQA 5EX5A 4J8FA 1IG8A 1Z6RA 3GE1A 3QFPA 3UKUB 5AQXA 5JMVA 3HSCA 2I7NA 3FFKB 1MA9B 4XH4A 2QWPA 1TYQB 3QDKA 4GNIA 3O08A 1NGHA 3AARA 1ATSA 2OANA 1BUPA 3QBXA 3MN7A 3LDOA 2A5XA 3J8AA 1DKGD 2QM1A 3BF3A 3ZETB 5AQZA 5AQKA 3ZX3A 4BQZA 2GTDA 3JXUA 5BRHA 3HBTA 3FGUA 4FL9A 2Q36A 1D4XA 4EAHD 5E26A 2ZF5O 3VEVA 2EWSA 3VF6A 4BRIA 4PKGA 1NGGA 2CGLA 3DWLA 4BRGA 4B1XB 1KAYA 3H3NO 5AQTA 3M1FA 2A6AA 4FSVA 1GLLO 3WXLA 3CERA 4BR9A 3KHYA 4BVPA 3CJAA 3CJ9A 4JN4A 3EZWA 1QHAA 4FOIA 2D1KA 3VEWA 3MMVA 2ASOA 1P8ZA 2V7YA 2GWKA 2W41A 4O8KA 1X9JA 4FWNA 2YHWA 4BRLA 2V7ZA 1LCUA 3H6EA 3FE1A 2ZGZA 2P9UA 5EXWA 3EO3A 2P9UB 5BREA 3CQXA 2ASPA 1HX1A 2BUPA 3A5MC 4CI6A 5AQUA 1SAZA 3SMSA 4BRAA 3W3DA 3TU5A 4BG8A 2P9SA 5BPNA 3MK6A 5AQLA 2QWRA 1GLDG 3B8AX 2F9WA 2P9SB 1JCGA 4FOEA 2YJFA 1JCEA 5AQSA 4MLEA 3ZX0A 3MN6A 2D0OA 4H03B 3UE5A 3LM2A 3LL3A 1QQMA 4K41A 1X3NA 4M63C 1C0FA 3QBWA 4CBUA 4QS8A 4JD2B 4EFHA 2P9KB 4M7XA 3GBTA 4BRPA 2F9TA 1MWKA 5EY4A 1NGAA 2IVPA 5FPEA 2UYTA 3VOVA 3WEEB 2FF6A 1HJOA 1YAGA 4AM7A 2FF3B 2ITMA 4FWSA 4B1YB 4WQ5A 4KBOA 3CETA 4A61A 1BO5O 4BR7A 4FWOA 1HLUA 1BG3A 5JICA 1S3XA 2W40A 4QS9A 4H5NA 1OKJA 3AAPA 3ENHA 5BPMA 3O80A 4ISFA 1U6ZA 2PBDA 3GOIA 4BC4A 1HKBA 4GY2B 1KXPA 4H5VA 3H46O 4ISGA 1NGDA 2QWNA 4H0OA 4H0XB 1T6DA 1NMDA 2VWBA 3ZX2A 3R9PA 5KPTA 1T44A 3WQTA 2HOEA 3AY9A 3BF1A 4CZIA 1HPMA 2V52B 4BG9A 4RTFD 3G25A 4K43A 2IVNA 3F9MA 2VYPA 4BQLA 3H1QA 4IWVA 5F2RA 4FPBA 4ISEA 3IMXA 1NM1A 3M6GA 4XEIA 2AA4A 5AZIA 3VESA 3EN9A 4EIAA 5BN8A 1QQNA 5ADXA 5AZIB 2HF3A 2Q31A 4DCHA 1J6ZA 2Q2RA 3BEXA 3R6MA 3QB0A 3CJ7A 2FSNA 1IJJA 3I8BA 3RSEA 2HMPA 4H5TA 3RSEB 2I7PA 1ATNA 4O5FA 3WQUA 5FPMA 3MN9A 3O1WA 4BR4A 2E1ZA 5AQMA 2QXLA 4NO7A 4Y0WA 2P9NA 4WQ4A 4QS7A 2P9NB 2QW9A 4JAXA 3KZBA 3LDQA 4LC9B 4F9OA 3VEOA 4BROA 4CZHA 2YI1A 3FR0A 1SQKA 5LJVA 2ZWHA 1ESVA 3D2FA 3VGLA 3LDNA 3LDPA 4HWIA 1BWFO 2V51B 4IZ9A 5BRFA 3ENOA 4H0TB 2WUSA 1SZ2A 3MCPA 4H5WA 1E4GT 4RWTA 1G99A 3ULEA 3O5BA 3ULEB 4WQ5C 2BTFA 4I6MA 2IVOA 1TUUA 3FZMA 5AQOA 3L0QA 5BRDA 3U9ZA 3IFRA 3JS6A 5AQGA 4IJAA 3ATUA 2E20A 4L3QA 3VGMA 5FPDA 2E2OA 5CE3A 2P9LA 2CH5A 2IIRA 4MLHA 3LDLA 3U8XA 5JLHA 2P9LB 2CGKA 1GLJO 5AQNA 3U4LA 3A5NC 3DXKA 4BC2A 3DXKB 3P4IA 2QWMA 3UB5A 5AQIA 2D4WA 3EKSA 3H3OB 3O8MA 5BN9A 3R8EA 3CI5A 4H0YB 4BRKA 4FWKA 1BA0A 5LJWA 1YXQA 4XH1A 5AQQA 5TKYA 1T6CA 3SJHA 1ATRA 2NLXA 1XQSC 4NB4A 4BVOA 3VF4A 4YDUC 3WUHA 1MWMA 5EOYA 4EHTA 5B8HA 5AQJA 2QWOA 1X3MA 2Q0UA 1MDUB 3WXKA 3CJ1A 2E2QA 4BRDA 1GLCG 5AQRA 3WXJA 3EL2A 5AQPA 4WQ4C 3UKRA 3VERA 4BREA 4EHUA 1HKGA 3KVGA 3HI0A 1ZXOA 3TPQA 3L4IA 4MO5A 3A5LC 2P9IA 2P9PA 1NGIA 2QWQA 2P9IB 2P9PB 3WT0A 4DHYA 3S41A 1Q18A 4CD1A 4B1WB 2A42A 2GEMA 1NGBA 3SLCA 2NRHA 1U2VA 2ZGYA 2FSJA 2VCPA 3O4WA 2E2NA 3OHRA 4FWQA 1TUYA 4FO0A 5BR9A 3QFUA 4BRHA 3SK3A 5AQHA 1WUAA 1QQOA 5EVZA 3O6WA 3ZEUA 4CBWA 3LM9A 3C7NA 1YUWA 3ZEUB 3C7NB 4BR2A 2GELA 2KHOA 3MDQA 4Z94A 3DXMA 3VGKA 1GLAG 4K42A 4CZKA 4PL7A 1E4FT 1QZ5A 5AZJA 5AZJB 4A2BA 4PL8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5E84A 3ZSRA 4DV2K 4DSKA 4WCEL 2HHXA 1VSLA 3K5NA 4UQGA 4DLGA 4N47A 2YHBA 1J5OA 4I9LA 2KZMA 4JHDA 5TKWA 4DQRA 2YJEA 4N5SA 3ATVA 4DTOA 5AQVA 3B6OA 3VETA 2XY7A 3SYZA 3D2FB 1R59O 4BRMA 1VSDA 4M3TA 2YHYA 4E1JA 3QMLA 2G8VA 3I0RA 1GLBG 3LWMA 1NNEA 4I6MB 2ASMA 4CZEA 2GUIA 4CGFA 2NRTA 1YI2N 4DQIA 1DEJA 3TAMA 3MEDA 2ZM6K 1VSFA 1C1BA 1GLEG 5AFUH 4CF9A 2ZJRL 4PKIA 4CZMA 3QICA 4A62A 2OCEA 4U67L 1FKOA 3CHWA 3BP8A 3C6HA 1L3SA 3NGZA 3AA2A 1VSHA 2A41A 2Q97A 5DM6L 3OYAA 3IUCA 1C0MA 4M3RA 2HHQA 1K8KA 2ZJPL 1SL1A 1X9WA 1TL3A 3AV9A 4BR5A 3H08A 3HTVA 3NE6A 3CPWM 1I94K 4FWPA 2E8AA 1ZBLA 2NRWA 5GIOA 3RTVA 2UXDK 4KHUA 1RBSA 4RCHA 5AJ3K 1HJRA 2Q1NA 3OTOK 5HL7L 3I33A 3BUZB 4DR2K 4CZLA 1BU6O 3NVKA 3M3ZA 4PWDA 4JRQA 1DT9A 2GWJA 4KHQA 4DKWA 3OYDA 1NLVA 4JI1K 3K57A 5JVGL 4C8NA 4WYBA 3CCUN 3VA0A 3ZSQA 2NZTA 2XRIA 4B9TA 4CFDA 4Y1DA 1HKCA 2NUBA 5FRMA 4E89A 4PQUA 3ZT2A 2BDPA 4CHOA 4IXCA 5AR0A 4CGGA 1BOTO 3HJFA 2XY8A 4KHSA 5GAHP 4KH4A 1KVBA 4Z4CA 3KJVA 3VQQA 3VTIA 4JI0K 4DQSA 2W42A 1IKWA 3QNNA 2OTLN 4BACA 4J8FA 3D6RA 1Z6RA 1IKVA 4YOXA 4OPAA 3CXCM 3V9XA 4CECA 1YJNN 4LF4K 3QFPA 3UKUB 5GADP 2F7TA 5JMVA 4DTMA 2IS3A 4QCLA 1LV5A 1VQNN 1TAUA 3QBXA 4CEZA 2A1SA 3MN7A 1DKGD 1JLGA 1KCFA 2QM1A 4ELUA 3WNHA 2XY5A 3JXUA 3FGUA 4FL9A 1NJZA 2Q36A 4YOUA 1HNXK 2QTDA 4KAZA 1LWEA 3QO9A 3VF6A 4BY9C 3VQ7A 4CJQA 4B1XB 2HBKA 1T8EA 4W5OA 2KLAA 3SUOA 1IKXA 4BWMA 3CJAA 1VSKA 1RCHA 2G8IA 1UOCA 4FZZA 4FOIA 2F4VK 2HHUA 5KGXA 1P8ZA 2OPSA 4KB1A 5KRTA 1GOBA 2W41A 4FK0A 3OA9A 1NK8A 3HOSA 4FWNA 2YHWA 4BRLA 2P9UA 4KH5A 5BREA 2BUPA 3A5MC 4IOXA 3SMSA 3CMAN 4Z4HA 1JLBA 3TU5A 4DS5A 4BG8A 5BPNA 5AQLA 2F9WA 2P9SB 1JCGA 4FOEA 2YJFA 1WN7A 4LFCK 2D0OA 4H03B 2KZZA 5CHIA 2NRZA 3UE5A 1QQMA 5J1EA 1W2BM 2DFEA 3QBWA 4BDPA 4QS8A 5CY4A 4EFHA 4IBNA 3THVA 3O3FA 4M7XA 3GBTA 4BRPA 2F9TA 2OPQA 3L2RA 2UYTA 5JS2A 2HHTA 3K9KA 1TVRA 4K8ZA 3AO1A 3KLIA 2FF3B 4AM7A 3TANA 3T19A 3THYA 4IG0A 1BO5O 2YNFA 4JI2K 4BR7A 1HLUA 4CJ5A 1S3XA 2OPPA 1OKJA 3SQ0A 4JI3K 3ENHA 3CCSN 1HMVA 1CXUA 1J53A 4DQPA 2F8TA 5IT9O 5M1OA 3LP0A 4BC4A 1HKBA 4HUFA 3H46O 4JI8K 3HPOA 3RMDA 4DSFA 3F9KA 3PX6A 1T6DA 4BDYA 3ZCMA 2HVHA 3AY9A 4CZIA 2V52B 2G8HA 3IAYA 3ITHA 4FPBA 1NM1A 4XEIA 3ENBA 2AA4A 5AZIA 4X65K 3VQ4A 3ZSYA 4FJGA 5DMRA 4CK3A 3NBPA 2QI2A 4IKFA 1KTQA 1IJJA 1I39A 4PHTX 2QKBA 1N6QA 4IFVA 3WQUA 5FPMA 4CF0A 3O9TA 4F9OA 3KZBA 4LC9B 3VEOA 3S3MA 2W6LA 3C6AA 4IDKA 5LJVA 2ZWHA 3L2VA 3D2FA 5HRSA 2V51B 1S9GA 1NK7A 3ENOA 3BDPA 3VQEA 3NH0A 1SZ2A 3MCPA 4HUEA 2VWKA 4OGEA 3ZT0A 2D5RA 5J2MA 4I6MA 1NJYA 3SUNA 5LMUK 2KKZA 4YOWA 1TKDA 2IVOA 4CFAA 1JJ2M 3ATUA 4DFPA 4LF6K 2E20A 1HNVA 4KHPK 4KTZA 4OJRA 3CFOA 4FZYA 2O4IA 3U8XA 3LDLA 1J5EK 3THWB 1KFSA 4B9UA 3OJUA 1EXQA 3I55N 4DUYK 1JLCA 3TARA 2HVIA 3MECA 4CIEA 3V1QA 1S6PA 1Q82O 3K5OA 4F3TA 3CI5A 4H0YB 5AQQA 4A5BA 5JENA 1XQSC 3TWHA 1VQ9N 1N33K 3VF4A 4YDUC 3DOLA 4BWJA 4FLVA 4NCBA 3OYFA 4IFYA 3V1RA 3OYNA 2Q0UA 3CJ1A 2I5JA 4BRDA 4HVJA 1YITN 1GLCG 4BE0A 5EU7A 5AQPA 4BREA 3CPEA 2D0AA 1U48A 4NLBA 4JI6K 3R1XA 2P9IA 1N34K 2P9PA 2P5GA 2QWQA 1D5AA 3A2FA 4CEEA 2VGNA 3WT0A 5CR4A 1Q18A 3K2PA 1FXXA 4FCYA 2NRHA 4DFMA 2FSJA 2E2NA 4GV6A 2NRXA 4MQ3A 3V9SA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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