4EAMA

1.70a resolution structure of apo beta-glycosidase (w33g) from sulfolobus solfataricus
Total Genus 198
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
198
sequence length
489
structure length
483
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDGYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-galactosidase
publication title Designing allosteric control into enzymes by chemical rescue of structure.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus p2
total genus 198
structure length 483
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2012-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4eamA00
3VIOA 1B9ZA 1TCMA 4M56A 3A4AA 3BAKA 1CGWA 4MAVA 1E1EA 3HJEA 1W91A 3WH5A 1M04A 5A6BA 1GNXA 9CGTA 1LL4A 4D6HA 2ZUVA 2DT0A 4Q22A 4W5ZA 2QLYA 3ARVA 4ATWA 1WO2A 3AIQA 1UD4A 1E6PA 1MFVA 3CMGA 1KR1A 3T2QA 3AISA 1XYZA 2D24A 2FHBA 1W1PA 3WNNA 5FD0A 2WKGA 4MNMA 1E4LA 1D2KA 3U5UA 3S6TA 4HTYA 1E40A 1GZJA 3VM5A 3LMYA 1PIGA 4D6FA 5A6LA 2Z1KA 4U5IA 3N9KA 1WCGA 5D9NA 3WDHA 3VD7A 2OSXA 4AEEA 3RJXA 1WDRA 3WH7A 4MTVA 4AZBA 1JZ6A 2E40A 4UQ9A 1Z32X 2WVTA 1KXQA 3VPLA 1EO7A 1H11A 5I77A 4GXPA 4JCMA 4NSBA 2HVMA 5KZ6A 1SMAA 3WQVA 4DWSA 4AZCB 5DMYA 3K8KA 2ZXQA 2XVPA 4BF7A 2VT0A 4H04A 1V02E 2F8QA 4MAZA 2DT3A 3BAIA 4U2YA 2VCBA 3QGVA 1UWIA 4BQ2A 1EIBA 1QI4A 4PMZA 3W37A 3W53A 4HZ8A 5A2CA 1OGGA 2A3BA 3AHYA 3L4WA 4UFLA 5D4YA 1AQHA 3N12A 1JNEA 4WSKA 2V3DA 3U57A 1JIBA 4A4AA 2RGMA 3WSUA 3BAWA 1JG9A 2J79A 1FH8A 3OGSA 5FIPA 2WC3A 3VDBA 1E4MM 2WW5A 4AISA 3WF4A 4TXEA 1VENA 1QI2A 4CN6A 2VZOA 5A8OA 3VIMA 3CH9A 2Q8XA 1JF5A 2G3IA 2ZIDA 3QHNA 3AMDA 2YA1A 1GCYA 3WF3A 3EDJA 2WHLA 3EDFA 4D72A 3K46A 4M1RA 4OBRA 1EXPA 4P8WA 3AZTA 2E9MA 1WZAA 2J74A 1J0YA 2WSPA 4PMYA 3IJ9A 4P8XA 2WCAA 1OBAA 4HOZA 1BYBA 1W9VA 3WBAA 1J11A 1E56A 1H1NA 4TTUA 2QV4A 1AQMA 4PCTA 1WZLA 1JI1A 1V3KA 1G5AA 2CEQA 4MB5A 1GVIA 2VO5A 1LL7A 1NOUA 3ARQA 4D1JA 1NWRA 3CLWA 5GNYA 1JYXA 3T08A 2V38A 2J75A 4JHZA 3HMCA 3TONA 2BVTA 3RO8A 4M29A 2J47A 3WQWA 2DH3A 1PEZA 3ZO9A 4PSRA 4U3CA 4V2XA 5BRPA 3WUGA 4L4PA 4KWUA 3AIUA 4HU8A 1E0WA 2XSAA 4NRSA 2PWDA 5BXTA 1KWGA 3WEOA 4AIOA 4B9ZA 1VEPA 1HN1A 4AW7A 1K9TA 4D6DA 1MW0A 4RE3A 2ZX7A 3KZSA 4CD8A 1OSEA 1Q6FA 3PTQA 1UZ4A 4TOQA 4WKAA 1JXJA 1XGZA 4W8LA 5HPOA 4TTGA 1GQKA 3W26A 3GH5A 3ARXA 1TVNA 4E8CA 4PCSA 3FHAA 4D6EA 1OD0A 4LPCA 1BLIA 2XVLA 1O7AA 2O9OA 3AXXA 2FHFA 1JF6A 2XVKA 3BLKA 3VVGA 4CVWA 2NW0A 1W9BM 3T2PA 1BTCA 4MJ4A 4W8AA 4OOZA 4LQ1A 3M7SA 3WD0A 2BVYA 4JL1A 5BXPA 2VVNA 4FF5A 2Y8VA 1PX3A 4ZE4A 3SUTA 2A3CA 4F8XA 2BV9A 4CU6A 1C90A 1FHDA 2UY4A 4CKQA 5I0DA 2J8FA 3GTNA 3GH7A 3FW6A 5TD4A 2VX4A 4MJ2A 3RJYA 4GI8A 4TUFA 1J0JA 4GIAA 1MYRA 2W62A 4H2CA 1W1YA 4F66A 3OB8A 4BQ5A 1HKKA 1GVYA 1G0CA 4BQ4A 4P7OA 2OYLA 3S2CA 3AXIA 1L8NA 5CQ1A 5LA2A 1W32A 5ABGA 3SUVA 3K8MA 2WYSA 2Y2WA 4GO8A 2XWEA 4PUEA 1ISVA 1ISZA 2YLAA 2D23A 4TVDA 4ACZA 5D9OA 3WD3A 2RGLA 3POHA 1ZU8A 1QBAA 2VQUA 2YIHA 1UA3A 4GI9A 5I78A 1B3ZA 2PBGA 2TAAA 1MQPA 2D22A 4P8UA 3POCA 2E8ZA 1DP0A 5A8QA 3VX0A 4OZOA 4LXFA 1UKPA 1E72M 3BCFA 5F7UA 1ZBKA 3OLEA 1VFMA 4WSJA 3MUY1 2PI6A 3DYOA 5CSYA 1BAGA 3AROA 1CBGA 3I3BA 2XGIA 1UD6A 2YL8A 4HPHA 4W88A 1B2YA 3CPUA 4D6JA 4DUVA 3OGRA 2BNJA 3OBAA 5IFPA 1KQZA 4H8UA 3F5KA 3ZJ6A 3WMBA 3UETA 3F5JA 2J7GA 3LPOA 2WMKA 4P7NA 3A6OA 1TA3B 2X09A 4Z2IA 1HVQA 2WZIA 2WVVA 4AXNA 3BSHA 2XM2A 3QOKA 1WZMA 3WDPP 1AQ0A 1ZBCA 1UWTA 1E5JA 4CD5A 5E6YA 2Y8KA 2VX6A 4PMRA 4EE9A 4ZXLA 2CBJA 3GBEA 5HNNA 1CXFA 1E71M 1Q6DA 1W1TA 1NARA 5D9MA 5A6MA 8A3HA 4AEFA 2YBUA 2BS9A 1ISWA 3KWXA 3BH4A 2XVGA 2DSUA 1BG9A 3VIJA 3WBEA 4NZCA 3SCWA 5JIPA 2UY3A 2GJXB 1EDQA 3UG4A 3WF2A 3AYSA 3PZUA 4CN1A 1E9LA 4AD0A 7A3HA 1KQYA 3WIJA 2XGBA 1HJWA 1VAHA 3CHDA 4J28A 3L4XA 1ITXA 5M17A 3W82A 1K9FA 3SIMA 4V27A 3AXHA 2PBOA 2W92A 3CZ8A 3CBWA 4HZ6A 3II1A 2VUYA 4AZ6A 3KL0A 2VNCA 3W81A 5A6KA 3ZJKA 3SCTA 1NWTA 3L4YA 1EQPA 5HBFA 3MV01 2BHZA 1GOIA 2HISA 4HP5A 3PZIA 5HXMA 4GQRA 5A6AA 5CGMA 1NWSA 1KBKA 3FAXA 2QPSA 4QAWA 5A6BD 3AIVA 2D20A 1BF2A 5I2UA 2WVVB 2XPKA 5A1AA 4CD4A 4YHGA 1CGTA 1E6QM 1NWUA 2W63A 2WLZA 4FLRA 3WNKA 2GK1A 3AHZA 2WCSA 4H8VA 1UZ1A 1B0IA 1J0ZA 1C8YA 1MWOA 4HOXA 1E6NA 1QW8A 1MXGA 3KE0A 1VJSA 3T0AA 4Z2KA 3CUFA 1H5VA 1R7OA 4RE2A 4Z2JA 5I5RA 4CCCA 5HPCA 4MB4A 3N11A 1VBUA 2IXVA 2W61A 3UR8A 1J0HA 1OM0A 1Q4NX 3BCDA 1C92A 3B9AA 4EK7A 1SFSA 4BZYA 4QLLA 1BYAA 1TUXA 3GH4A 4KGLA 1C91A 1UKOA 1LG2A 1SR0A 3IJ7A 3WFZA 1UQYA 3AIWA 1J9YA 4DWSD 1K6AA 4CCEA 3PZNA 2XVNA 4EKJA 4P7LA 3G6LA 5JBFA 2G41A 4J3TA 2JALA 5DEZA 1JFXA 3CZKA 1ODUA 3EMQA 4WIWA 1HKIA 2D0HA 4C7DA 3D3AA 2OWWA 4D6GA 4LYQA 5DO8A 5D8ZA 2W91A 2VZUA 3OLDA 2PC8A 3OIHA 1QVBA 1V3HA 1E15A 4GZJA 2EPNA 2OLHA 2JIEA 2ZICA 1B31A 1EDGA 4RL3A 2A3HA 1YHTA 1NP2A 1HIZA 1XHGA 3UCQA 5ECUA 3GNRA 4TVCA 4CU7A 5ABFA 2DSWA 3B8SA 5CXPA 2E4TA 4E4PA 2WXDM 1YQ2A 3MMDA 1XV8A 2X1IA 1HX0A 4DUWA 2VMFA 1KGXA 3WFLA 4W85A 3BAYA 3AOFA 1OB0A 4FMVA 1WAWA 1V08A 4MPKA 1OD8A 2G4FA 4CN4A 2J77A 1BSIA 1DWIM 2QPUA 3OA5A 4J3WA 1UWSA 3UEQA 3WMSA 2X2YA 1UR2A 3DHPA 3SUUA 1FP9A 1RD6A 3AIBA 4PUDA 3CZLA 1XSJA 2YA2A 1WE5A 5A2BA 3AQUA 1QNOA 1PZ3A 2QMJA 1PBGA 3GZAA 1MQQA 2CHNA 4J3VA 1WDSA 1N82A 1GOMA 3DECA 2FGLA 2CKSA 4HMDA 3PN8A 1UD8A 1UH4A 3SURA 1MFUA 5KEZA 4AD1A 1BGAA 2ZUWA 2YDSA 1NP0A 2WMIB 3KEHA 4AD5A 1UWQA 1B3VA 2CESA 1KWKA 2GSJA 2VURA 3E1F1 2VCAA 5CG0A 3K8LA 3T2OA 1IT0A 1JAKA 1A47A 4YPJA 3CO4A 5CSUA 1DWHM 4UQAA 5GQBA 3EMCA 5M03A 2J7FA 2FDMA 4N0RA 1GONA 3WD2A 1V6YA 1I1XA 2BY1A 1J0IA 6CGTA 1GJUA 1W3HA 4W89A 5DFAA 5DF0A 3TTYA 4WJXA 2WBKA 1Q6EA 1J10A 3UESA 2D2OA 3TP4A 2F61A 1W9DM 1JZ2A 1IV8A 3T0DA 2ZUMA 1VFUA 2WB5A 5IFTA 3T09A 1LQ0A 3W27A 3UR7A 1HJUA 3RILA 3AIEA 4PMVA 4B9YA 1W2VA 2C0HA 4HA1A 2W4XA 2VRJA 4YN5A 1CXLA 1TZ7A 1W3JA 3LPPA 1Y7VA 4W5UA 3PZGA 4PTVA 2JF6A 3ARSA 2CPUA 2ZUSA 3GYCA 1WB0A 3VMPA 1BVNP 2Z1SA 1WNOA 3MSGA 3NSMA 4B16A 2YDQA 3AS3A 4DUXA 4PSPA 3PZ9A 4UNIA 1F4AA 1VFOA 3RPMA 4UQDA 1CXKA 2O92A 3WEZA 1UKSA 4QDMA 3ZT6A 2VR5A 4PRWA 4IM4A 4ZEPA 5BYWA 1FA2A 4K68A 4DWSB 2Y4SA 4KH2A 3MMWA 3VU2A 3WELA 1M53A 2VTFA 3MO4A 1TVPA 3BXWA 3TA9A 2VRKA 3EDDA 3SUWA 2X05A 1VJZA 1LF1A 1OT1A 5LA1A 3ARRA 3HN3A 3APGA 5D9PA 3WNLA 4PN2A 3VD9A 1QNPA 3OZPA 4FLSA 3VUPA 3ALFA 1OWQA 2WZHA 5EFFA 1IZJA 1VEOA 4WKHA 3MANA 4CVUA 2V5DA 1E6SM 5EFDA 3ZQ9A 1V3IA 5BROA 1OGSA 1QI3A 4B3LA 1HKJA 3M07A 4U5KA 4JKKA 1CLXA 1D3CA 1E4IA 3I3EA 4URIA 5IDIA 2XTKA 3WUEA 4UFJA 1XD1A 3BAXA 1OINA 3RIKA 2DH2A 2J7CA 3OG2A 1TG7A 3L2MA 1CXEA 3CGTA 1UUQA 5AYIA 1L0PA 1NQ6A 1G01A 2DEPA 3MUIA 4UFMA 1VF8A 3VDAA 1RP9A 2ZX6A 2EPLX 2GJPA 2C8NA 4OKDA 1QOXA 1MQRA 3ZMRA 3AS1A 4NF7A 2IXUA 1JD9A 1V0LA 1I1WA 4P8VA 1DWFM 1CDGA 3ARZA 3G6MA 4HPGA 4M81A 5BWFA 3WDRA 3M6DA 3OLGA 2Y24A 4L4OA 5GPRA 1XRVA 2MANA 1V0MA 2WM0A 4HMEA 4GZIA 4W8BA 3O9NA 1W9XA 1KB3A 1W9UA 3FAWA 1QI5A 1C8QA 5JUVA 1Q6CA 2ZUUA 4LGXA 1Q6GA 4AZHA 2G8ZA 5IHRA 2EPOA 3ZJ7A 3BSGA 1CWYA 2ZX5A 4D6IA 5E0CA 1CNVA 5E09A 3TTSA 1UYQA 3VGBA 1HVXA 3PZMA 3VM7A 4R5EA 4XB3A 3UG5A 3N04A 1GW1A 3WN6A 3OZOA 5BCAA 2DSVA 4JFSA 4CU8A 4X0NA 1W3LA 5DT5A 1H41A 4JL2A 1NOWA 1FP8A 1GHRA 2GDVA 3WL1A 3AZRA 5EB8A 4HZ7A 1BQCA 2YL6A 1LWHA 2WHKA 2WZEA 3SCOA 1UD5A 2GUYA 4F79A 1XH2A 5A8PA 5IXEA 1PAMA 4C7GA 7TAAA 4GO9A 4KRUA 3VIGA 3EDEA 3N17A 3VGDA 1KXTA 4C7FA 3QHOA 3OLIA 1S46A 4LX4A 2EPKX 2XWDA 5IHSA 1UR9A 4U3AA 3MUZ1 1RPKA 4BA0A 1HJQA 2DQXA 1K9DA 3ZJ8A 1R86A 3WH9A 4V28A 1HP4A 3D5HA 4Q7NA 2D1ZA 3NDZA 4U2ZA 3RCNA 4UOZA 2AAAA 2ZWZA 2WKLA 5LA0A 1E6XM 1H0IA 3PZVA 1B3YA 1J12A 4ACYA 3WF0A 2VJXA 2X0YA 1CLVA 1GORA 3ZR5A 3W6LA 2D0FA 2E0PA 3FN9A 1QNRA 1I75A 1AMYA 5I24A 5EBAA 3N13A 4H8HA 4QLJA 1BHGA 1E3ZA 3W4RA 2WNWA 3ZSSA 4RE4A 1GQLA 4W7UA 1ISXA 4MNJA 4UTFA 1JDAA 2VC9A 4ZFMA 3WH8A 3O2LA 3K4DA 5A8MA 3PBGA 3WNPA 1GHSA 2D3LA 3L2LA 2G3MA 3W0KA 3VIFA 3L4UA 1H3GA 2V3GA 4KMQA 1WZKA 3SCUA 2VZTA 1CZ1A 2ZXAA 1WKYA 3GXMA 1OCQA 1QNQA 2CCRA 1WP6A 1JL8A 3GXFA 1EDTA 3VMOA 3CTTA 3L4TA 4JCLA 2ZUNA 3WQ6A 2VOTA 2VX7A 3VD4A 3EBVA 3VMNA 4ACZB 4OOUA 3ZR6A 2BY3A 1LG1A 1V02A 4CD6A 4PMXA 4BQ3A 5AC4A 1A3HA 1V3JA 2PWHA 4KRTA 1XYFA 3SCRA 2JF7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3VIO A;  1B9Z A;  1TCM A;  4M56 A;  3A4A A;  3BAK A;  1CGW A;  4MAV A;  1E1E A;  3HJE A;  1W91 A;  3WH5 A;  1M04 A;  5A6B A;  1GNX A;  9CGT A;  1LL4 A;  4D6H A;  2ZUV A;  2DT0 A;  4Q22 A;  4W5Z A;  2QLY A;  3ARV A;  4ATW A;  1WO2 A;  3AIQ A;  1UD4 A;  1E6P A;  1MFV A;  3CMG A;  1KR1 A;  3T2Q A;  3AIS A;  1XYZ A;  2D24 A;  2FHB A;  1W1P A;  3WNN A;  5FD0 A;  2WKG A;  4MNM A;  1E4L A;  1D2K A;  3U5U A;  3S6T A;  4HTY A;  1E40 A;  1GZJ A;  3VM5 A;  3LMY A;  1PIG A;  4D6F A;  5A6L A;  2Z1K A;  4U5I A;  3N9K A;  1WCG A;  5D9N A;  3WDH A;  3VD7 A;  2OSX A;  4AEE A;  3RJX A;  1WDR A;  3WH7 A;  4MTV A;  4AZB A;  1JZ6 A;  2E40 A;  4UQ9 A;  1Z32 X;  2WVT A;  1KXQ A;  3VPL A;  1EO7 A;  1H11 A;  5I77 A;  4GXP A;  4JCM A;  4NSB A;  2HVM A;  5KZ6 A;  1SMA A;  3WQV A;  4DWS A;  4AZC B;  5DMY A;  3K8K A;  2ZXQ A;  2XVP A;  4BF7 A;  2VT0 A;  4H04 A;  1V02 E;  2F8Q A;  4MAZ A;  2DT3 A;  3BAI A;  4U2Y A;  2VCB A;  3QGV A;  1UWI A;  4BQ2 A;  1EIB A;  1QI4 A;  4PMZ A;  3W37 A;  3W53 A;  4HZ8 A;  5A2C A;  1OGG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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