4ECBA

Chimeric gst containing inserts of kininogen peptides
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
225
structure length
202
Chain Sequence
SPILGYWKIKGLVQPTRLLLEYLEEKYEEHLYERDLEFPNLPYYIDGDVKLTQSMAIIRYIADKHNMLGGCPKERAEISMLEGAVLDIRYGVSRIAYSKDFETLKVDFLSKLPEMLKMFEDRLCHKTYLNGDHVTHPDFMLYDALDVVLYMDPMCLDAFPKLVCFKKRIEAIPQIDKYLKSSKYIAWPLQGWQATFGGGDHP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase, protein binding
molecule keywords chimeric protein between GSHKT10 and domain 5 of kininogen-1
publication title Chimeric glutathione S-transferases containing inserts of kininogen peptides: potential novel protein therapeutics.
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma japonicum
total genus 70
structure length 202
sequence length 225
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2012-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4ecbA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ecbA01
3F3QA 3CMIA 1GUHA 4MZWA 4KDUA 1QUWA 3JCML 4LA1A 1NM3A 4G0LA 2YN1A 4KB3A 1PX7A 3HZ4A 3FZ9A 3P7XA 2IMEA 3GKKA 2GSTA 4MF6A 3M9JA 1HQOA 1B4QA 4HEA2 4IN0A 3VWVA 22GSA 1JLWA 3ERFA 4TR1A 3G9BA 1BQ7A 1BEDA 3GSTA 3E3EA 2G0FA 2PUKC 1XIYA 2EC4A 3HDCA 1QK8A 3VPQA 4PQ1A 5ECQB 1GSDA 3I6AA 3RDWA 3HKRA 2F8FA 2AV4A 2X8HA 14GSA 5ID2B 2NDOA 3KJYA 3RPNA 2LNSA 3TJFA 3LYPA 1QFNA 1X5CA 4V1Ap 2PPTA 5CRDA 3EMXA 4O32A 2HNLA 5D93A 1ZL9A 3V1WA 5ELGA 2HXKA 1GH2A 2KUCA 3LQ7A 1FHEA 3Q19A 1SJZA 3EE2A 3QFAC 2A2RA 1GRXA 1PMTA 5ECRB 4XS4B 5J9BA 3DIEA 2VCXA 2FUG2 4BPYA 5CNWA 4K9ZA 4TR4A 1DSBA 2B3SA 5IMZA 2K8VA 1V98A 3UARA 3IPZA 1V57A 3TB2A 3CSJA 2B1LA 5J9CA 3GX0A 3IDVA 2E0QA 1A0FA 2REMA 1CQGA 3LORA 2HSYA 3QR6A 1GNEA 3US3A 1GLQA 3TKPA 1XW9A 3FZ5A 4IW9A 2FY6A 3FR9A 1U3AA 2PU9C 4ZB9A 6GSWA 2FNOA 5HR1A 3UIWA 2HSMB 4ML1A 4EVMA 4G10A 1K0BA 1EGOA 3CTFA 3QD9A 2K8SA 6GSTA 1O81A 1CQHA 3D4MA 4I8BA 2H0GA 2DC5A 1M0UA 2KLXA 2XPDA 4Q5RA 5ECOB 1SKWB 4IQAA 5B6MA 2VCTA 4Q5FA 2Z9SA 2GDRA 3VPTA 2TIRA 3UEMA 4D73B 2O87A 4WBRD 3KM6A 4ECCA 4TXVA 3LXTA 4Q5NA 3LXZA 4JR6A 6GSSA 1X5EA 3PGTA 3PPUA 3TUEA 1M7TA 5GAND 1F37A 3DXBA 1WJKA 3QAGA 1XXUA 3P90A 4EC0A 2KOKA 3IK7A 4HOJA 5C04A 5IMFA 2LRCA 3F3RA 4LL4B 2YV7A 2HRNA 1HNBA 2B5XA 4DSSB 1M2BA 5JWRB 2GVPA 1O85A 4HS1A 1N8JA 3IRAA 2CVDA 1QGVA 4EUYA 1EOHA 4PNFA 3M0FA 2L5OA 1URMA 4MPGA 4TXOB 5INYA 2L4QA 3IBHA 3FZ4A 4OO4A 4OD7A 3U5RE 5DAKA 2TRCP 2VCVA 6GSVA 3QFBC 1ZOFA 3U6VA 4NV2A 2DJ1A 5CAXA 2B7JA 3CTGA 1KNGA 1GSEA 3H1NA 2H71A 4XIHA 5DJLA 2HLSA 5ID2A 2YWIA 3TKSE 1GUMA 2HSNB 2LQQA 2GS3A 2NBSA 1SK2A 3HVXA 3TOTA 3GX8A 3APQA 2WCIA 3GIXA 1JZWA 1AIUA 3EYTA 3BOAA 5COHA 5D9WA 2C0EA 2RUEA 4F03A 3QAVA 2KP2A 5FWGA 2X64A 5LNKe 3GKXA 4ZIJA 3NOFA 18GSA 1RQMA 4FIWA 1GL8A 2WB9A 3UJ1A 2IMIA 2WDUA 4XS4A 1WOUA 5F07A 4NPBA 2YWMA 4G0IA 2C0DA 3DGQA 4EL1A 3ZREA 4HJ2A 4YAVA 2C0GA 2AJQB 5KEJA 3VFIA 3UBLA 2NTOA 4RQRA 4MP4A 2XBQA 3TJKA 1TRWA 2GZPA 1SD9A 2VM1A 5B8BA 3GMFA 1V40A 13GSA 2YV9A 2GTUA 4JEDA 2OA7A 2HSMA 1OKTA 2N5BA 2LJAA 2HQTA 4IVFA 4MK3A 3WT2A 4KNDA 2XHFA 4HI7A 2IPAA 1JHBA 4ECIA 3VI5A 1QXHA 3ZITA 3ZIJA 2VAFA 1PSQA 3DYRA 5DALA 4BA7A 4WXTA 5HR2A 1HYUA 1G7EA 1A2JA 3HZ8A 1O7UA 4I2UA 5BMUA 1ST9A 3IV4A 2HRFA 1XOBA 2LNTA 1QMVA 2I4AA 4IS0A 4G2EA 4AJ8A 1V9WA 1OVNA 3L0HA 2B1KA 3D21A 5D9XA 2MBSA 2YOIA 4V2MA 5EY6A 2MMAA 4MJCA 5A4WA 2H01A 5G30A 4MZBA 1EWXA 2LTKA 4NMUA 2H6YA 5F06A 2DJKA 1EZKA 1VGLA 2H1BA 1B9YC 5J41A 1GTIA 3KMNA 1TK0B 2YP6A 3EMPA 3H8QA 3LSZA 3TDGA 5HFKA 4HQSA 4POMA 2LRNA 4DSSA 2DMLA 2H1DA 4HU7A 3HCZA 1MTCA 5J4UA 3FZAA 4N0VA 1WP0A 4PURA 2MYGA 1KBNA 4HU9A 2QC7A 3RAZA 3F6DA 5IO0A 3TGZA 1U88A 2DMMA 3C73A 4ZBDA 5D96A 4TOPA 2UZ8A 4TXOA 2NVLA 4TN8A 1OE7A 4MJAA 4K0GA 1X9MB 1F3AA 2DIZA 4ZL8A 1HNCA 1UVZA 2OE3A 1OE8A 1G7OA 1TDIA 3FEUA 3TKQA 1A8YA 3GKMA 4MDCA 3KGKA 2H19A 2ZCTA 5D73A 2FWGA 1ZCPA 2YZHA 3BCKA 3A2WA 4EO3A 1HNAA 3DKSA 1VF4A 3C71A 4GQCA 2C8UA 2O85A 4IELA 4TW5A 4L0UA 11GSA 1A24A 1USBA 5CYYA 1PD21 1TW9A 2F9SA 2B5EA 4MA9A 1Z7RA 3G7JA 2K9FA 4L0WA 5ECMB 1KTEA 1GSUA 1MDKA 4PX1A 5C00A 1SJ6A 3WGEA 2VL9A 2VCWA 5G5FA 3P8WA 5DAKB 2X8GA 3TJBA 1YKCA 4L8EA 1TXXA 7GSSA 4GSTA 1KEBA 1H75A 3RHBA 4HJMA 1Z5YE 3C8EA 4YH2A 1FW1A 1G0TA 2GT6A 2OACA 4WBJA 1YJ6A 1A0RP 2K18A 2P5RA 5JCUA 3GL5A 3TCOA 1SU9A 1X5DA 4PUAA 2C4JA 1SYXA 1SENA 2KP1A 1M2AA 2H73A 3W8SA 3VK9A 3IXRA 4JE1A 2PWJA 3R3EA 4RI6A 4PGTA 2B7KA 4GSNA 3TKSC 4MZCA 1K0MA 4AJ7A 1BX9A 3LFLA 1ABAA 1PRXA 3C1RA 1FG4A 1WWJA 4PNGA 1PA3A 2C3QA 2CQ9A 2CVBA 1AW9A 4XRDA 6GSYA 2DSAA 1R26A 2RLIA 1TU8A 2V1MA 2LRTA 1ON4A 4WF5A 4IP6A 3RBTA 3ME7A 5IIZA 3ISOA 1V2AA 1VRSD 3WT1A 3ZMLA 1XBSA 4X0XA 1B9XC 4XS6A 2H6ZA 1TKDB 1Z3EA 3KTLA 3HJMA 1Z7PA 3ZZXA 3FK8A 4P3YB 3A2VA 4POKA 5G5EA 4K7OA 2YCDA 4XHMA 3O76A 2C3NA 5EVOA 4OCFA 2V6KA 2O89A 5F8BA 2FWEA 3TKSA 4BVXA 2HRAA 2C0FA 2YPMA 1Q4JA 3H79A 1GSQA 1JZRA 4ECBA 2H76A 2VL2C 3PR8A 4HZ4A 3VLNA 4F2IA 2PVOC 3A5WA 4AGSA 2N5FA 4RI7A 3TJJA 1A23A 3L9SA 1QQ2A 2KHPA 1SL2B 3ERGA 1YEPA 2E7PA 2HZEB 4LMVA 1Z9HA 1YEXA 5DALB 4I2TA 4IBPA 1YQ1A 3IK9A 2JZSA 2YWOA 2YJ7A 4DSRA 1TRVA 2VLUA 3ZYWA 1S3CA 3F4SA 2ZUPA 2YWNA 3ERWA 3KXOA 3DMLA 3C1SA 1XWGA 4GSSA 1DE1A 2LKUA 2LQOA 2J9HA 1AQWA 1R5PA 4I5QA 2L4CA 1ZYQB 5ECNB 2LJRA 3O3TA 3HXSA 3LYKA 1Q98A 4K1FA 2VL2A 2P5QA 5D8IA 2AUVA 3L9VA 3FYGA 1MD4A 1G6YA 5ENUA 5G31A 1ZGNA 4WR5A 4KF9A 3GNJA 3P2AA 1F2EA 3Q74A 5G1KA 2E2MA 2QGVA 2OBIA 2N5AA 3F63A 5D9VA 4MLYA 4KA0A 5HQPA 5IMAA 1TP9A 1ZYEA 5ECKB 2IFQB 4USSA 5E59A 2IWTA 2OJLA 4O5RA 2IL3A 2JACA 2BMXA 3CSHA 3EU4A 2H1GA 5JWQB 2J23A 4OCEA 3CSIA 3I9V2 3BD2A 3SWLA 3BBYA 2NPBA 4GQFA 5CREA 1T3BA 2LEGA 1NHYA 5HR0A 2GGTA 4OO5A 1RW1A 3ED3A 3SBCA 2CVKA 2DIYA 5GZZB 3HD5A 4TVEA 4PUFC 4OFTA 2DJ3A 2BJXA 2IJYA 4ACSA 3LJRA 2AAWA 5EPFA 1XW5A 3Q6OA 3TKRA 1JFUA 1GSYA 4NHZA 2FD3A 4DVCA 5LCZA 4CHSA 3VURA 4KW6A 4BL7B 2JL4A 1T4YA 3L78A 1EGRA 5HR3A 3GH9A 4OMVA 5ECHB 2DJ0A 2FWFA 5L71A 3F0IA 4K7IA 3F9UA 1I9DA 2QSIA 5KN2A 2H8LA 2V6OA 3OR5A 1OC3A 1DUGA 4GLTA 3WYWA 8GSSA 2HYXA 2LUSA 3KH7A 2VLTA 2FWHA 5B6NA 1T8EB 4PXOA 3KCMA 2WRTA 4NXIA 3GH6A 5A4VA 5DCGA 1K0CA 5D9TA 3FR6A 3J7Yk 2LS5A 4ULXA 2IMKA 3KZQA 2VCZA 5FT3A 3ZTLA 2F3MA 3ZVJA 4O92A 5J3RA 1NHOA 1BAYA 3APOA 3FY7A 1X9WB 4FYCA 2R6KA 1RK4A 3EINA 5G1LA 1R4WA 5JCWA 3EURA 3IR4A 3ZL5A 3BCIA 4L5LA 4IJIA 1ERVA 4ZILA 3QCPA 2RM6A 3Q18A 1MDJA 3WD6A 2HZEA 3WGDA 1ERWA 2XBIA 3VWWA 2OBKA 1IYHA 3IHQA 3QOUA 1XWKA 2TRXA 1TTZA 4KUNA 5ECSA 5KN0A 4TR0A 2C3TA 3LEFA 4NWYA 3VWUA 3FW2A 3R2QA 3G7YA 1K3LA 1GTAA 4TKYA 1PGTA 1VF3A 4KH7A 1GULA 1SK1A 1ILOA 4GCIA 4ZB6A 3AY8A 1S3AA 2H72A 4MPFA 2ZNMA 5DVBA 4ZBAA 1M2DA 4XTSA 3F6FA 3ZLPA 1XCCA 4V1Ag 2PVQA 2C1YA 3GHAA 1EP7A 2OADA 5HFGA 2AYTA 2GQMA 2JU5A 2IIYA 3UVTA 1ACVA 2BTOT 5JWOB 3GKNA 4J57E 4BVXB 1BJXA 3N5OA 4K2DA 4BVYB 3IC4A 3QPMA 4X1UA 1Z6NA 4KAEA 1HD2A 2H30A 2IFQA 3MAKA 5A5KA 5ABRA 4NAXA 4JBBA 1SYRA 1PX6A 1WE0A 4RQXA 2IN3A 4ILFA 3ZFBA 2M80A 2H1AA 2PBJA 4G0KA 5DQYA 4HDEA 1I5GA 3MNGA 1O6JA 3FKFA 2HFDA 2B5YA 4EF0A 2YNXA 1PKZA 4Z7XA 3DVXA 3EC3A 1V58A 4G9HA 1GTUA 1A2MA 5KN1A 2WJUA 1EV4A 4K0NA 2FLSA 3FRCA 4O7HA 4L5OA 2R2JA 5IMDA 1IYIA 4K6XA 2AHEA 4ML6A 3M1GA 1Z6MA 4BWQA 2EIQA 2LSTA 1JLVA 3VWXA 1AXDA 1X9SB 3D6IA 3HJOA 4J2FA 3F8UA 4TR3A 2M72A 1XPVA 4I6XA 1LBKA 2ON5A 2RUFA 4MCUA 2MMOA 3F4RA 4IGJA 4GWRA 1MDIA 9GSSA 4KX4A 1E2YA 1H4OA 4NHWA 2FGXA 1GWCA 2VO4A 4MH2A 3D0ZA 5CRHA 3UVHA 4BWSA 2I3YA 4BL7A 1DBYA 3M9KA 1WMJA 2YJHA 2MMZA 2JADA 3DEXA 1K3YA 1OC9A 16GSA 1M99A 1G6WA 3DWVA 2YANA 2A2SA 1UA5A 3QDNA 2JZTA 4LMWA 1XWCA 1FO5A 4F82A 4CDOA 4FQUA 1TJDA 2OE0A 2P0GA 5AN1A 1JZOA 1R5AA 1EOGA 4EDYA 2DLXA 1GUKA 3WGXA 3IAS2 2R5GA 1OKDA 2GLRA 2JZRA 1AUCA 2O8VB 2O7KA 4HUAA 5J5NA 4JRRA 1SKRB 1YF1A 3TJGA 2CX3A 5LD0A 4XS1A 5H5SA 1WPIA 1TRSA 3HVVA 4N30A 3S9FA 4CW9A 4MF7A 4DEJA 1W4VA 1YF0A 3F4TA 1EV9A 4EXJA 3G7IA 2G2QA 3D22A 3I43A 3FR3A 3M8NA 1EP8A 1WIKA 3ZMKA 3RPPA 4XCSA 3NIVA 4IQ1A 3LWAA 3CRTA 5E4WA 4GXZA 2WGRA 3VI7A 2ES7A 1K0DA 4EDZA 2R4VA 1MD3A 2RIIA 4IP1A 2EIOA 1YDKA 2IMFA 2MZCA 5DCHA 2VCQA 3GUSA 3CBUA 3APSA 4ZXGA 2CZ3A 3KEBA 2I1UA 3KH9A 2H66A 1T00A 5CRWA 3NZNA 1XWAA 2DJ2A 4ZL9A 5IO2A 4IHUA 1GP1A 2LV3A 3IE3A 4KGIA 3TRXA 3HA9A 4ECJA 4J56E 1XFLA 5IM9A 5AIXA 3EU3A 5CRGA 6GSUA 2VM2A 4YQUA 2FA4A 2H75A 2CAQA 4PQIA 4MF5A 1UN2A 5CO3A 4Q5QA 1O8XA 2CX4A 1EEJA 4BVYA 1T7PB 3GTUA 4MABA 4FO5A 2D2ZA 4G19A 3IC8A 1BG5A 3QAWA 4GTUA 1TOFA 1R7HA 5F0GA 4MH3A 1W89A 4FYUA 3DRNA 4F0CA 4F0BA 1NSWA 5IPHA 3DD3A 5AIVA 2GSSA 1J08A 2R3XA 2IMDA 1XWBA 3C7MA 4OFMA 2GT5A 1ZZYA 5DQSA 5GSSA 1TI3A 4N11A 4IJ3A 2F8AA 3FHKA 1ERUA 5ECPB 3KD0A 1B48A 3E9JB 3UBKA 3UL3A 1BYEA 4N0ZA 1X0RA 5ELAA 1YZXA 1THXA 2RM5A 1VF2A 3QMXA 2CAIA 1B4PA 3ZVJD 2WULA 10GSA 3W6GA 2VOCA 2CZ2A 1GLPA 4WKWA 3H4KA 4E8HA 4HQZA 2GZZA 4AJ6A 3TRQA 2HE3A 1OC8A 1SK0A 3LG6A 4QL9A 1FB0A 3E0UA 5JCGA 4KE3A 5IMVA 3ZRDA 1YY7A 2FCHA 1ZMAA 3EVIA 4RUVA 2ON7A 1FOVA 2PMTA 1N2AA 3MDKA 5EL8A 4QQ7A 2HZFA 1C72A 2VD0A 2JSZA 19GSA 3CXGA 2HRKB 1PL1A 2HI7A 5ECLB 1M9AA 12GSA 2FA8A 2L59A 4JU5A 1F9MA 4KDXA 4LL1B 5H5QA 4WR4A 3TOUA 1A2LA 5DBQA 2K6VA 4AF2A 4V2LA 3GV1A 5DJMA 2WFCA 5KN3A 3A2XA 5IOWA 2X8CA 4MMMA 2I9HA 3GN3A 2L5LA 4PQHA 2E2GA 4GF0A 1WRYA 2DBCA 3GFKA 3ZFLA 1J0FA 4JZQA 5G2ZA 1PN9A 4KCAA 4ISDA 1AQXA 3MSZA 2CT6A 2P31A 4KDYA 4NV5A 3CRUA 1THOA 4ZB8A 3KP8A 3LGCA 4I97A 2L6CA 3D5JA 2MBTA 3HVSA 1F6MC 4DSQA 3O6TA 1OC9B 1K0NA 4YAPA 3BJ5A 4X43A 3KTBA 2H70A 1SKSB 5AISA 3W8JA 2CV4A 2MMNA 4TRXA 1GNWA 4OWYA 3IAM2 4K7NA 4KSOA 1U87A 3HJPA 2LJKA 2VD1A 1FVJA 4POBA 3GL3A 1M9BA 1T4ZA 2F51A 1K3OA 4V2NA 2GSRA 5HFIA 1O73A 3KMOA 4TR1B 4KCEA 4IKHA 3GRXA 4XRAA 1FVKA 3DVWA 3L4NA 4K8MA 2GQKA 2H0HA 5A4UA 2PGTA 2JSYA 1PKWA 1TI1A 4N10A 1AAZA 5ECIB 2R37A 2V2GA 3D4TA 5FHIA 1S3DA 2VL3A 4KSMA 1GSSA 1VF1A 2AB6A 2C80A 4WEYA 2L6DA 4GRFA 2OKAA 2PN8A 4ZBBA 4PTSA 5F05A 1YKAA 2H6XA 5IMCA 5IQYA 3KIJA 5GSTA 3GA4A 5H5RA 3TRPA 4QL7A 2H0IA 1SD8A 4EKZA 1LU4A 1PQNA 3J7Yb 3CYNA 3L9UA 5CP1A 3UMAA 3RHCA 1OAZA 3IOSA 1NW2A 1K0AA 2H74A 1TU7A 3H93A 1J9BA 3GYKA 1AC1A 4HZ2A 2V41A 1TK5B 2GSQA 5IPGA 4D73A 2X99A 20GSA 4ID0A 1Y25A 2V32A 3GURA 3PINA 1XZOA 4EE0A 1EEMA 3IA1A 3M3MA 4WF4A 4H86A 1Y6EA 3GSSA 1A8LA 3A3TA 3HYPA 1K0OA 2B6MA 2GZYA 1XW6A 4JR4A 2HT9A 2ALBA 4POLA 3I69A 4F9ZA 3GTUB 4FH8A 2DJJA 2WZ9A 2A4VA 1T1VA 2VIMA 3HY2A 3ZIVA 5IOXA 4YQVA 1SL1B 4YQMA 1XOAA 4LLRA 2L57A 3HHVA 4OFNA 2HSHA 1XVWA 4ZL7A 1TRUA 2HRKA 1FB6A 1SL0B 3UAPA 1GSFA 3EWLA 5B8AA 6GSXA 2QKEA 2VUPA 2M46A 2I81A 1UC7A 2PERA 3K8NA 1O8WA 3PH9A 1JZDA 2XC2A 1PL2A 4E8EA 2WS2A 1U3IA 4WETA 1SJIA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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