4EFHA

Acanthamoeba actin complex with spir domain d
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
364
Chain Sequence
VQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMHTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMQKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein/transport protein
molecule keywords Actin-1
publication title Multiple Forms of Spire-Actin Complexes and their Functional Consequences.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 127
structure length 364
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4efhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4efhA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4efhA03
1U2VA 1U2VB 4BG9A 4WYBA 3A5MC 1MDUB 3H1QA 2HF4A 3VENA 2F9WA 3ULEA 2P9IA 3ULEB 4ISEA 2P9IB 5LY3A 1CZAN 1QHAA 2W40A 2CH6A 3L6QA 3D7EO 3M3ZA 1SAZA 2NRHA 5BRHA 1T6CA 2NZTA 4A61A 1NGDA 1GLEG 3A5OC 5EXWA 2V7YA 4DB3A 4FSVA 4JHDA 1X3NA 4JHDB 2VYPA 3RSEA 5AZJA 5BREA 3RSEB 5AZJB 1KAXA 3HI0A 4CZIA 2E20A 4K43A 3IUCA 1G99A 2YI1A 2Q97A 3H3OB 4A2AA 5AQFA 1E4FT 1HLUA 2FSKA 1SZ2A 2YHYA 5AQNA 4F9OA 4RTFD 2W41A 3CERA 4FWRA 4B1YB 2GUPA 3WXLA 4BVOA 3DJCA 5KPTA 4JD2A 4C23A 3HSCA 5BPLA 4JD2B 2I7PA 3ATUA 2GWKA 4BR4A 5B8HA 1MA9B 3FZFA 3ZETA 2Q2RA 5E26A 3ZETB 1HUXA 2P9LA 4XH1A 2P9LB 5AQOA 4BQZA 1QQMA 3LM2A 2CGKA 1RDWX 3F9MA 4B1XB 2Q1NA 1YXQA 1V4TA 2E1YA 2H3GX 1OKJA 4Y0WA 2FSNA 1J6ZA 5EOYA 4E1JA 1TYQA 4IJAA 1TYQB 3WXIA 1GLJO 4CZHA 3MN9A 4JN4A 1BOTO 4FL9A 3VESA 2HMPA 2ZGZA 4BRFA 3DAWA 4BRDA 5AQRA 4CD3A 5AQVA 3ENOA 4B1UB 1V4SA 1ATSA 4IXCA 4FWSA 3GDQA 3VEYA 2YHWA 1TUUA 3L4IA 2FSJA 2NLXA 1U6ZA 4B1WB 3QICA 3VEWA 2E2QA 5KQ8A 3VF6A 4CZKA 4CZFA 2GTDA 3GE1A 1NLVA 3QFPA 1NGCA 2WUSA 3BP8A 3WQUA 2QXLA 3CJCA 2YJEA 2Q0UA 2FXUA 4FWKA 3A8YA 1SQKA 5AQKA 1XQSC 3WT0A 1NGHA 5EY4A 2E1ZA 1GLCG 2GWJA 1JCFA 2QWMA 3AARA 3O8MA 1R59O 2FLOA 2EWSA 3WEEA 3WEEB 1BG3A 4DCHA 1HJOA 2AP1A 3MN7A 4A62A 3MCPA 4CJ7A 4QS8A 2A42A 1LCUA 4BR0A 5BPMA 3QMLA 4H0VB 3U8XA 2IVPA 4FPBA 2VCPA 5BR9A 3AAPA 3W0LA 1GLBG 3H6EA 1NGAA 5AQMA 1GLFO 3IMXA 3EL2A 3A0IX 3QBXA 4CBUA 3LM9A 3SLCA 3VPZA 1BU6O 4MO4A 3O5BA 5ADXA 3CJBA 3DXMA 4BR9A 3DXMB 3CHWA 1HKBA 4IO8A 4BVPA 1S22A 3VOVA 1H1VA 3UKRA 3UKRB 4BC3A 3BEXA 4KBOA 4GNIA 2YHXA 4BGBA 3KVGA 1JCGA 2E2PA 3P4IA 1QQOA 2OANA 3FZKA 4O8KA 1QZ5A 3EN9A 2A3ZA 3BF3A 4FOIA 3MN6A 4H0YB 2A41A 3EKSA 3SJHA 5FPDA 3O08A 1BO5O 4EIAA 4BC2A 1NGBA 4M7YA 3W3DA 2P9UA 3WXKA 2IVOA 2P9UB 3H1VX 1NGEA 3A5NC 4NO7A 3VETA 3ZX0A 2ITMA 4EFHA 1NMDA 3CJ7A 4WQ4C 3MK6A 5AQJA 4B1ZA 4BR7A 4CZGA 5AQQA 4JAXA 5FPEA 4CZLA 3G25A 4PKIA 1D4XA 1E4GT 4BRLA 2CGLA 3JXUA 1BDGA 1YUWA 4ISGA 3DXKA 4BRPA 3VGLA 3DXKB 5BN9A 4FWOA 2ASPA 1MWMA 2E2OA 1IJJA 3QFUA 4HTLA 5EVZA 5AQXA 3EO3A 3R8EA 3LDOA 5ELZA 4BQLA 4K42A 4BREA 5F1XA 3CQYA 3BF1A 2PBDA 4H5VA 1QZ6A 4O5FA 5JICA 2Q0RA 3HBTA 3SK3A 1QQNA 4BRKA 3HM8A 3MN5A 4WQ5C 3FZLA 2ZGYA 2D4WA 4ISFA 4BRHA 4AM6A 1T44A 3D2FA 4CBWA 1NGIA 3D2FB 5JMVA 3R9PA 4BRGA 5LJWA 3C0BA 5FPMA 4RCHA 5BN8A 1S3XA 5FPNA 5AQPA 4PL7A 4CD1A 1HX1A 1IG8A 1ZBSA 4CZJA 5AFUA 3D2EA 4H5RA 3D2EB 4IWVA 1C0GA 5I9EB 1YAGA 2ASMA 4H03B 2IVNA 2QW9A 4Z94A 3QB0A 3ID8A 3MDQA 4B1VA 2BUPA 3A5LC 4FOEA 1XC3A 4EHTA 3H3NO 1BUPA 5BPNA 4RWTA 4FO0A 3R6MA 1XUPO 3ATVA 3SMPA 5F0XA 2D0OA 5AQIA 3LL3A 3IFRA 4H5NA 3LDPA 5AR0A 2HF3A 2DPNA 3CJ1A 3FZHA 1X9JA 3CQXA 2YCHA 4WQ4A 3FR0A 2F9TA 1RGIA 5KQDA 3GBTA 5JLHA 1JCEA 4BRMA 4BC4A 4EHUA 4MLHA 1DEJA 3I33A 3KZBA 5LJVA 2J4RA 3BUZB 3LDLA 2V7ZA 2E88A 1KXPA 1C0FA 4BRQA 3LDNA 5AQWA 4YDUC 3O1WA 3VF4A 4IZ9A 4EAHD 1NBWA 2CH5A 2PAVA 5EX5A 3GL1A 4IJNA 4FPAA 4H0OA 5BRDA 3H45C 3IDHA 1NWKA 3SMSA 3ZX3A 4CZMA 1DKGD 2I7NA 4XH5A 5ADXH 3VGKA 1RFQA 5AQUA 1KAZA 5AQHA 2P9PA 3TPQA 2P9PB 1X3MA 3J8AA 2Q36A 3VGMA 4WQ5A 2ZF5O 3OHRA 2ZWHA 5AQZA 1GLLO 2FF3B 3O6WA 4XH4A 3WUHA 3O1BA 4CBXA 2QWQA 4GY2B 2A5XA 4FWNA 4H5TA 4H0TB 2CGJA 1ATRA 2IIRA 4HWIA 2A40A 3C7NA 3C7NB 5AQLA 4H0XB 1WOQA 3QBWA 4BG8A 5BRFA 5CE3A 3EKUA 4M7XA 1P8ZA 5F2RA 3GOIA 2QWNA 2P9SA 2P9SB 4H5WA 5AZIA 5E84A 5AZIB 4BRNA 2BTFA 3LDQA 3EZWA 4PKGA 4BR2A 4CZEA 3VF2A 4NB4A 4J8FA 3U9ZA 3FE1A 1HKGA 1NGGA 2GELA 3CETA 3FFKB 3KHYA 2VWBA 3I8BA 2QWLA 3WXJA 3O4WA 3AAQA 4DQ8A 3CJ9A 3CIPA 1NGFA 4JNEA 2Q31A 4DHYA 1HKCA 3VEXA 3JS6A 3DWLA 4B9QA 3QDKA 4BC5A 2ASOA 2FF6A 2KHOA 3CJAA 5AQGA 4MLEA 4MO5A 4QS9A 5AQYA 1Z6RA 2QWOA 1GLDG 1HPMA 4XEIA 1TUYA 3H46O 4YDUA 2V52B 3FLCO 2V51B 4M63C 2A6AA 3HTVA 1ESVA 1K8KA 1K8KB 1MWKA 2E8AA 4L3QA 3U4LA 5AQSA 4I6MA 2AA4A 4I6MB 5KPRA 2GEMA 2D0PA 1LOTB 2HOEA 1ATNA 4BRCA 4BRAA 4FWMA 1Q18A 4QS7A 4LC9B 3TU5A 3UKUA 4CI6A 1ZC6A 3UKUB 5AFUH 4A2BA 3M6GA 4AM7A 4BRIA 3VEOA 2YJFA 3UB5A 1GLAG 5KPZA 3HZ6A 3S41A 1ZXOA 3B8AX 1DGKN 1YVNA 2QM1A 3FZMA 4H0PA 4BR5A 1WUAA 4FWPA 3U9DA 4PL8A 3GG4A 5JLFA 2UYTA 3UE5A 3FGUA 1Z05A 4PKHA 5TKYA 3VERA 3L0QA 2D1KA 3VEVA 4FWQA 3MMVA 1BA1A 3VEZA 1T6DA 2P9NA 2P9NB 3ZEUA 3ZEUB 3WQTA 4K41A 1BWFO 1Y64A 2P9KA 4K25A 4BROA 2P9KB 2QWPA 4BGAA 5AQTA 2QWRA 1NM1A 3ENHA 3ZX2A 2E2NA 1EQYA 1NGJA 3AY9A 4FWLA 1KAYA 3M1FA 1BA0A 3O80A 3CI5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4X62K 4WYBA 3SZ2A 2ETJA 3PSIA 1SL1A 4B3SK 4CHQA 2IS3A 4CE9A 4CF9A 5C2DA 3ULEB 4ISEA 2P9IB 1IH7A 3V81A 1QE1A 1QHAA 3L6QA 2G8FA 2DFFA 3MX5A 5BRHA 1S1VA 2NRVA 1KFSA 3LALA 2WOMA 3BY5A 1OH7A 1I39A 3OS1A 4FSVA 4DTSA 4JHDB 4YOUA 3RSEA 5AZJB 3HI0A 4K43A 2W6KA 4JKEA 1T7PA 4C8MA 2HHQA 2Z1GA 1HNXK 4M3YA 5AQNA 1UWBA 1RTDA 1W97L 4RTFD 2W41A 4FWRA 3WXLA 1HPZA 3KKRA 5KPTA 1RDUA 3TI0A 4CGFA 4DR3K 4NXNK 2I7PA 3VQPA 1VK0A 1VSDA 2HMIA 3N4QA 3ZETA 3OA9A 4OVLA 3TTDA 4XH1A 3LP1A 5C24A 4BQZA 2CGKA 4KO0A 2O8BB 4B3TK 4GMJB 1YXQA 2NNWA 1J6ZA 4CF8A 5C25A 3RR7A 5C42A 4GVEA 4E1JA 4CHYA 4ELTA 4IJAA 1TYQB 3WXIA 4IFYA 3SUQA 1YTUA 3K59A 3TABA 1Q7YO 4BRFA 1W7AA 3SQ1A 5KI6A 4FWSA 2ATQA 1JLGA 3THYB 3GDQA 3AVKA 3TR8A 3CFOA 2VG7A 2FSJA 1S1XA 4ELUA 2GTDA 5FRMA 4IDKA 4H4OA 2GV9A 3E66A 1RT2A 3BP8A 4A5BA 3WQUA 2QXLA 1VSJA 3HM9A 3R3LA 4CK2A 4DSIA 1REVA 4CK1A 3RMAA 2KQ2A 4KHQA 1NGHA 3LANA 2E1ZA 3ZT1A 1JCFA 2Y1IA 5FRNA 2QWMA 3AARA 2FLOA 1TK5A 1YIJN 4ILJA 2EWSA 3VQCA 3AA5X 3I0RA 1HJOA 1BQMA 2AP1A 3MN7A 4JKBA 4O8UA 5TKWA 3D0PA 1CZBA 1HYSA 4QS8A 3ID6A 1LCUA 4BR0A 5BPMA 4N5SA 4H0VB 1HNZK 3PX4A 3CM6A 2IVPA 4FPBA 2G8IA 2VCPA 5BR9A 3W0LA 1GLBG 3H6EA 3OYKA 1NGAA 1O1WA 3AGKA 5LL6Z 1GLFO 1SS6A 3EL2A 3SLCA 3CPEA 1A5VA 1J54A 2HBLA 4MO4A 5ADXA 4IG0A 3K2PA 1M1KO 4RW4A 5FROA 3DXMB 4CGJA 3L4QA 4BECA 1WSFA 4CFDA 1H1VA 1KVAA 3S3OA 3UKRB 4KH4A 4BC3A 3S9HA 2HNDA 1Q8IA 4ILGB 4DQPA 4J2AA 4KBOA 3L8BA 4CEOA 4BGBA 3KVGA 1JCGA 2E2PA 5KRTA 3TAEA 5HRSA 1QQOA 1KQSM 2Q3SA 4OGCA 3TWHA 4IDHA 1TKDA 2OZMA 2A3ZA 3BF3A 4E72A 2A41A 3EKSA 1BO5O 4EIAA 4CJ4A 3W3DA 2NUBA 2P9UA 4KI6A 1MU2A 3K5OA 4FLTA 3A5NC 3VETA 3ZX0A 1CXUA 4EFHA 4BR7A 5J1EA 4B1ZA 4DTXA 5GIPA 4N47A 3PX0A 1VSFA 3L2VA 3T1AA 4PKIA 4X66K 3ZSYA 1HRHA 3CCUN 4EZ9A 4KPYA 4KKOA 2HHIA 1YUWA 3M5RA 1WBDA 3DXKB 3HVTA 4FK4A 4EP4A 4JKCA 2E2OA 1TK8A 2HBMA 3CCLN 4DTRA 4GKJK 4C1NK 1JLEA 5C15A 1WSJA 4BQLA 2C1GA 5J2NA 3CCVN 5F1XA 3SQ2A 3CQYA 4LF4K 4YFUA 4DV5K 4M3XA 4JI4K 4YY3K 3NH2A 4OPJA 1T44A 3AO3A 3OYNA 4DR5K 1QSYA 2HHVA 3I55N 1GOCA 4TSXA 3R9PA 3C0BA 4RCHA 1OVQA 2HNZA 2XO7A 1L3VA 4LFCK 4E1MA 1HX1A 1TL1A 2UUCK 5AFUA 3MECA 3J80O 3K5NA 4E0DA 2DFEA 3CQ8A 4H03B 4DUYK 1LWCA 4BDPA 1LW0A 4Z94A 3ID8A 4EHTA 1XC3A 3H3NO 3O4NA 5BPNA 3VQ4A 5JVGL 4IOAL 3DLEA 5F0XA 3LDPA 3DMJA 3CCJN 3FZHA 4BDYA 1ZBFA 4QCLA 2HHUA 4JK8A 1N33K 3OBWA 1NK4A 4EZ6A 1DEJA 3HK2A 3KZBA 3AVLA 2V7ZA 3VQ6A 3SV4A 1NBWA 2CH5A 2F8SA 4IJNA 4FPAA 1S6QA 4H0OA 3H45C 3ZT0A 4CZMA 1DKGD 3SUOA 4H8KA 1RTIA 4HUEA 5AQHA 4DQIA 3L2RA 3J8AA 5HRNA 1T05A 4DFMA 4M3UA 4DQSA 3FFIA 1DLOA 5AQZA 1GLLO 3O6WA 4CJQA 3O1BA 3QINA 2QWQA 1BI4A 4F3OA 4IG3A 2CGJA 2O8EA 3AVNA 1C0TA 2A40A 3AV9A 4H0XB 2FBXA 3OYFA 4M7XA 4B3RK 3G71N 1RT7A 2P9SA 1XMOK 5AZIA 4KV8A 3KLFA 3CCEN 4BRNA 2OPQA 4KTWA 3V6DA 4BR2A 3VF2A 1N8RO 3FE1A 3K58A 1NJIO 2PYJA 1RBTA 4FLYA 3AO1A 4OLBA 4HHTA 5KRSA 3NHGA 3AA4A 4DR2K 3NH0A 2B4JA 3J7YP 2OPSA 1L3UA 1NGFA 2IAJA 1HKCA 3C65A 4DHYA 4FZYA 4CFAA 2FF6A 3CJAA 5AQGA 3M8QA 3KIOA 4MLEA 4KH5A 1BIZA 4DWIA 1Z6RA 2BANA 1RDCA 1FW6A 2V52B 2V51B 3F73A 3HTVA 1ESVA 3QLHA 1K6YA 1T8EA 2HOEA 4DSEA 3SAFA 3DLBA 3MCAB 4AH9A 1Q18A 3SAGA 1JLQA 4U7BA 3ISNC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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