4EH5A

Human p38 map kinase in complex with np-f4 and rl87
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
351
structure length
329
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
publication title Natural-product-derived fragments for fragment-based ligand discovery.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 103
structure length 329
sequence length 351
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2012-04-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4eh5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4eh5A01
5IQBA 3CIKA 3HUCA 3AC4A 5TO8A 3UG2A 4C8BA 3I81A 3S3IA 3UOJA 5H8EA 3PXFA 3UIBA 1NA7A 5EHYA 3MV5A 3R00A 4QNYA 4H1MA 4R5SA 3GCQA 4Q5EA 3FYJX 4B9DA 4MWHA 4FVPA 1GNGA 2P0CA 2BILB 4X2JA 4EQUA 2WZJA 3UYTA 1WBVA 3EQBA 1OIYA 4MWIA 4KKGA 4IX4A 2O2UA 1PYXA 2C6EA 4IQ6A 2R3QA 4QMVA 4K8AA 4OGRA 1V0PA 2X2LA 4O38A 5CTPA 1PMUA 5D10A 4EH7A 3IW8A 3KA0A 4FGBA 4TYGA 1ZMVA 2CMWA 3AC1A 3SGCA 4AXAA 3MH3A 4IXPA 2JDSA 3G33A 5CAPA 3RALA 2CCHA 5IQAA 2VTHA 3W33A 4UY9A 3SRVA 3U51A 4CEGA 4O0RA 2OJFE 5HBHA 4CFWA 1FVTA 3AGMA 4J8MA 3MBLA 4F7NA 2VZ6A 1M7QA 3LKMA 4JOAA 3W1FA 4GT4A 1WVYA 4IX5A 3R7GA 4O21A 5J8IA 3UP2A 4KSQA 1U59A 3RCJA 1OBDA 4RIOA 4XOZA 5LMBA 5L2QA 1ZY4A 3GQIA 4HVIA 4B8MA 5D12A 3UZPA 2C3IB 2YDJA 3VULA 3IPHA 4R1VA 2RFEA 3V6SA 2XNMA 2DYLA 4O96A 2RL5A 4PF4A 2WMQA 5B2LA 2QU6A 2XBAA 2RFDA 4IAIA 2PMIA 4MHAA 3KCKA 1JVPP 4ZP5A 3MN3A 3ORZA 2OW3A 2BHHA 3RK5A 3THBA 5C8NA 5BUIA 2XK6A 3A4OX 3FZRA 3R22A 4IB5A 3ZLWA 4CSVA 3NVMB 2UZWE 2XJ1A 4U45A 4XG2A 4CNHA 4X2KA 1WBSA 3OCTA 1K3AA 2HIWA 3E3BX 2WMAA 3S00A 1MRUA 3QTUA 5E91A 4CMUA 2VWYA 2J0MB 2X9FA 4B6LA 4KS8A 4Q2AA 4ERKA 5AUTA 4BDCA 4NKSA 3KXMA 1PXNA 4WO5A 5TE0A 4DT8A 2XBJA 1OIUA 3PJ8A 3HZTA 3FXXA 4O27B 5CQUA 3R28A 2VWIA 3BYUA 4QTCA 3NX8A 3AOXA 2UZOA 3QC4A 5HX8A 4DH7A 5FXRA 1G5SA 4A4OA 4BCOA 3DA6A 1P4FA 4YJOA 2GCDA 2P2HA 2XEZA 4GJ2A 4IWDA 2XK4A 3Q2MA 5AWMA 4HOKA 4GMYA 5AV2A 5IEYA 4EK8A 1XHAA 2UW3A 5C9CA 1CTPE 4ASZA 4AWIA 3W32A 5FWKK 2WEIA 4KIPA 1CDKA 5BMMA 4BF2A 5IMEA 5EQEA 5L2WA 2IN6A 5DI1A 5CASA 3V5QA 2UZDA 5A4EA 2PZYA 3FI3A 4UYAA 4A9RA 4J1RA 3BELA 5A4QA 4ITIA 4PMMA 2VTOA 4YC8A 4WSQA 4ZJIA 4I0TA 4QMNA 5D41A 1R78A 4ACCA 3TNQB 5BVOA 5DIAA 4EL9A 4W4XA 2PPQA 2JKKA 2WIHA 3EHAA 2A2AA 4S32A 5I3OA 4C2VA 3EYGA 4B7TA 1H4LA 2QOCA 4C0TA 3ANQA 3FMJA 4F70A 3F66A 2Y4IB 4GL9A 1M52A 3NUPA 2GPHA 1ZYSA 5CAVA 2BFYA 3TZ9A 4BDKA 3UPZA 3G0FA 2BRHA 4EORA 3PPZA 3D83A 2V7OA 4RGJA 5DR6A 2UVZA 2C0IA 4AGWA 4MNFA 5TR6A 3LFAA 3IECA 5DYJA 4DTAA 3RNYA 5J5SA 1LR4A 3UVPA 4RA4A 5HNBA 2GNLA 3FHIA 3F88A 4G6NA 1PY5A 1J1BA 2QD9A 2QC6A 3F3WA 4U9AA 3VQHA 2E9UA 1WFCA 4BDEA 2VWWA 5JRSA 3BLQA 1WCCA 4JIAA 3H4JA 3W2RA 1KOBA 4FEXA 4F7LA 3GOPA 2YIWA 1Q8YA 4RJ8A 2EB2A 5F9EA 2ZDTA 4TW9A 2JGZA 3ROYA 4DBNA 2NRYA 5FTQA 5I4NA 2GNHA 4M66A 2B55A 2RIOA 3MVJA 2WELA 3O8UA 1PMVA 4S34A 3OT8A 2UW8A 4YLKA 2BRNA 4WUNA 2R3LA 3P79A 4BCQA 3FI2A 4ZJVA 2XF0A 1H24A 5AEPA 2WTIA 3RJCA 4DG0E 5M4FA 4K18A 4EHEA 1MQ4A 2QHNA 1FOTA 3Q9WA 4LV8A 4CCBA 4O6EA 4RZVA 4F0IA 5KMKA 4IAAA 3LMHA 4YO4A 2VGPA 3EKKA 4IIRA 4AFEA 3V04A 4AZEA 4M0YA 4WOVA 4Y85A 4O7VA 5FD2A 2CHLA 4EH9A 3QLFA 4NJDA 3VW8A 2B9IA 3ULIA 3A7HA 5E4HA 3VS6A 3VS0A 2GSFA 4AACA 4APPA 3IW7A 1AQ1A 2OJJA 2ZMCA 1TVOA 3LM5A 4I23A 4WA9A 4WNPA 2ZV2A 3DKOA 4EH8A 3ORMA 3BHVA 1YXTA 3MH2A 4L3LA 4R1YA 3JUHA 4WRGA 2ITXA 2X39A 4H39A 4BCNA 4FSRA 5C01A 2C6TA 4GUBA 3QXOA 4QPAA 1FPUA 4FKJA 2Y8OA 1LEZA 2UW7A 4U0IA 3R8MA 3HAVA 2CGWA 2QLQA 4ANBA 3TUDA 3RAWA 3GU4A 4KIKA 2C0OA 4NH1A 3G5DA 3FL5A 4RLLA 4BDDA 2LGCA 4BCFA 4ZY5A 4EH3A 3LXKA 4FV1A 2VTIA 4D0XA 2AYPA 4BN1A 3EZVA 4APCA 3MJ2A 4LOOA 1M7NA 3ZOSA 4ZY4A 3R8UA 2XMYA 3NWWA 3N4TA 3ZXTA 3OHTA 4AZWA 3VS7A 4BIBA 2VTRA 3ZXZA 3AC8A 4PX6A 3NCZA 5EG3A 3FXWA 5CSPA 3WF8A 4RJ7A 4NKAA 3OD6X 2I0YA 4PNIA 2WMUA 4Z3VA 5AP6A 2P55A 4IWPA 2F7XE 2UW5A 5FDXA 4ZXTA 5HO8A 4WG3A 2WMRA 4QMWA 4TT7A 1O9UA 3MVMA 4UZDA 5TF9A 1IAJA 4IADA 3H9FA 3DQWA 5BVKA 4NUSA 3UOLA 3GCSA 4LV5A 5IQGA 4M69B 3LCOA 4E93A 2ZB0A 4ZMEA 1BL6A 1FVRA 3LZBA 3Q5IA 4YHTA 4DGLC 1IAHA 1T46A 2HCKA 4ZTHA 2UVYA 2WD1A 4CVAA 3JVRA 4CG9A 2RGPA 4YJPA 4D2WA 4B0GA 4NSTA 4FOCA 1FMOE 1IEPA 2OG8A 5HZNA 2I0EA 5KMLA 4O0WA 4K9YA 3KQ7A 4BIEA 1ZOGA 1ZMWA 4RVKA 3WOWA 3CJGA 2UW0A 4GVAA 1HCKA 2YM8A 4DEEA 4U6RA 4D9TA 2B7AA 5AIRA 4IVDA 4G3EA 4MX9A 5HD7A 3DXQA 2NP8A 2XNPA 3NYVA 3SOCA 4ZLOA 2XKFA 2YJSA 3SD0A 2O8YA 3ZO1A 3UDBA 2B9FA 2C5NA 2EWAA 5EK7A 3ZO2A 4XHKB 2HW7A 5HO6A 2C1AA 4D4SA 4ZSGA 2J9MA 3FKNA 3CPBA 3L9PA 2XS0A 3B2WA 5J7BA 4OUCA 3IONA 2XRWA 3KC3A 3CS9A 5E7RA 4EOPA 4ZJJA 4C38A 4D58A 2Z02A 3QFVA 2GDOA 3ZS5A 5FGKA 2HYYA 3EH9A 4BKJA 3UC4A 4YUQA 3ZBXA 5L8LA 4K33A 4MTAA 3GU7A 3QCYA 3GVUA 4E4NA 3H10A 3QA0A 4QP6A 4QTDA 5EH0A 2V22A 3ZC5A 2WNTA 3PVGA 4ONAA 1UKIA 1X8BA 3D5XA 3R01A 4BCJA 5CF4A 3I6UA 3Q3BA 5JRQA 5AP2A 4DH5A 1H1RA 4KKHA 1TKIA 1FQ1B 4LYNA 2WFYA 4AN3A 3LLTA 2XH5A 4RSSA 4AQCA 1U54B 4PMTA 1VEBA 3QTRA 3HMIA 3KRLA 4JDIA 4KB8A 2WTCA 2UZVA 3GP0A 2QI8A 2OK1A 2B52A 3IKAA 3G2FA 5FRIA 4E6DA 3UZRA 2IVTA 4DITA 2YAKA 4F7SA 5L2TA 3ORKA 3AMBA 1XKKA 2ERZE 3I6WA 2JD5A 4OLIA 4BHZA 3Q6WA 4FICA 3E7VA 1CKJA 4FTQA 5HG5A 4ZZMA 4X2GA 5K5NA 4B99A 3QZHA 1E1VA 5FP5A 2R9SA 3R8ZA 3ACJA 4MEDA 2PTKA 5HGIA 2Y4IC 4FL2A 3W2CA 1XH9A 1OIRA 3TV6A 2PSQA 3LFBA 3QX4A 4AA4A 5AR3A 5KNJA 3Q4CA 4C3FA 2ZV7A 3PFQA 3VUTA 2C6MA 4W4YA 2WMXA 2VNWA 2B4SB 3ORIA 4WKQA 4Y72A 4ZS4A 4CFXA 4O91A 5FDPA 4JNWA 2FSMX 3HVCA 3FZSA 4BYIA 3DTCA 4DFYA 4EZ7A 3DXNA 5DE2A 5I9WA 4YLLA 4I24A 4KBAA 3ZSIA 4C35A 5IEVA 3DBDA 1URCA 3EQIA 3QKKA 3QQKA 5AV0A 2V55A 5K9IA 4RC4A 4RPVA 1LUFA 4CYJA 1XO2B 4TWCA 1Q62A 4JR7A 5BVWA 2PE2A 4J99A 3TNWA 5JK3A 5LVNA 1ATPE 1KE8A 5FEEA 1YWNA 3MJ1A 1PXMA 2UZBA 5KMNA 2WU7A 3AG9A 3IDPA 4YJVA 4BI1A 4CFVA 5LWMA 2W1HA 1NT2A 4ENYA 3RZFA 4D28A 3MI9A 2WQEA 2F7ZE 3NYNA 4MXXA 4LL5A 5HIEA 2Z8CA 3LQ5A 3LCTA 3QUPA 3VS2A 4BZNA 1UVRA 3DS6A 3QD2B 1I44A 3SG8A 2YWVA 3CKWA 4RIWA 2X7GA 4FG8A 5AAFA 5BYYA 3TZ8A 3ZM4A 4DFZE 5EKNA 1BMKA 4CGAA 3AD6A 1J91A 3AC3A 2QOIA 4G9RA 1J3HA 3WF7A 4EC9A 4FV2A 2BAQA 3P7CA 4IH8A 2BMCA 4G6LA 4WRSA 2CDZA 1Z5MA 1UNLA 2GTNA 4MXCA 3TWJA 5M53A 4XLVA 4A06A 3P86A 4F7JA 3S2PA 4EOOA 2W0JA 5HTIA 1STCE 1J1CA 2E2BA 3AT3A 3CY3A 4EBVA 4MCVA 4XJ0A 4O0XA 1OL7A 5DG5A 5FTOA 1Q5KA 4UN0C 5I5ZA 3NYOA 4FV4A 4NU1A 3PY3A 4P90A 5E1EA 4D2PA 4RIYA 1DI8A 1WBTA 3FSFA 1XH6A 2X8EA 4FBXA 1OKVA 3WIGA 4D4VA 3VUHA 5B7VA 5AP0A 5IMXA 4TKSA 4XG4A 4ZOGA 4YLJA 1VJYA 4CD0A 5I9YA 4YJNA 1OL1A 3F5UA 3CY2A 3ZMMA 5J9YA 4ZK5A 2OZAB 3GQLA 5A4CA 3EQPA 2HOGA 3DY7A 4IM3A 5A54A 2IZTA 4FV0A 2ITOA 1WVWA 2CKPA 4HGLA 4Z7GA 3DKCA 4K0YA 5HLPA 3LFNA 3VF9A 4BCKA 1H1PA 3DAEA 2YM3A 3KXNA 4NFMA 3ZUTA 5BNJA 5BYLA 2XKEA 5FP6A 4IACA 1V1KA 1U4DA 4QRCA 4EYJA 4DGOA 2P33A 2VO6A 1Y57A 3Q04A 4J71A 4EOQA 5IQFA 4MD9E 2Z7QA 4CFMA 3WZKA 3OOGA 4YBJA 1U5QA 3QRKA 3SC1A 4IAKA 5CT7A 3NUUA 1Q8TA 2BRBA 4G3GA 5LMKC 3HV7A 2Z2WA 5AP4A 3TACA 3UIXA 3QTWA 2JAMA 1OL2A 4U7ZA 2OBJA 4ACDA 2XZSA 3AGLA 5CWZA 4C34A 4D2TA 3HV3A 3DBCA 4YURA 5HCYA 4V04A 4IZ5A 3UMXA 5HLWA 4O0SA 1SNXA 4P4CA 4YZDA 3SXFA 3VBQA 2A1AB 3D15A 2ZV9A 2VTJA 4L3PA 4GG5A 3LM0A 4IFCA 5I9UA 2G9XA 3LJ2A 4M67A 2ESMA 4FZ6A 3GI3A 2BALA 4QYHA 3C4CA 5DR2A 2OF4A 5L2SA 5LOHA 3DK3A 3G9LX 3ZUVA 3V5LA 1A06A 4O0YA 3OW4A 4M14A 4IVCA 5HTBA 4YNOA 2WMBA 2WQBA 2UVXA 1ZRZA 2B54A 3PY1A 4Y95A 4A9SA 4UB7A 4BCPA 4C36A 2VNYA 1XQZA 1SNUA 4FT5A 3SLSA 4JQ8A 4LUEA 3COIA 3QU0A 5J1WA 3QKMA 4FTCA 3CXWA 4QMZA 5B2KA 2XIXA 4NT4A 4Y5HA 2C5VA 1BYGA 2IZRA 4Z55A 4YTCA 2X8DA 3O51A 4FR4A 4YPDA 2ITQA 4MBLA 4IAYA 5CZIA 5BQ0A 3FDNA 3CPCA 4MQ2A 2BAKA 3V51A 4QP2A 1YWRA 3MFUA 4YMJA 4IVBA 5HCXA 3LHJA 4RQKA 5JT2A 4YSJA 2HZ0A 3S0OA 2PYWA 3BU3A 2HK5A 3UYSA 5E90A 4ZMFA 1SZMA 3CC6A 1WMKA 2NPQA 3UIUA 4ACHA 2X4FA 5EYKA 3G6GA 3FZPA 4L43A 3O17A 4IDVA 3RAKA 2QOLA 3L8XA 4JRVA 4X3FB 1XBBA 4H3BA 2YM4A 3DU8A 3LJ1A 5ANIA 3TZMA 4C62A 3BEAA 3NVKI 3DJ7A 2GQGA 2RFNA 4MVFA 2C5YA 2J5FA 1ZXEA 3JY9A 3PJ2A 4TNBA 3OWJA 5AA9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5IQB A;  3CIK A;  3HUC A;  3AC4 A;  5TO8 A;  3UG2 A;  4C8B A;  3I81 A;  3S3I A;  3UOJ A;  5H8E A;  3PXF A;  3UIB A;  1NA7 A;  5EHY A;  3MV5 A;  3R00 A;  4QNY A;  4H1M A;  4R5S A;  3GCQ A;  4Q5E A;  3FYJ X;  4B9D A;  4MWH A;  4FVP A;  1GNG A;  2P0C A;  2BIL B;  4X2J A;  4EQU A;  2WZJ A;  3UYT A;  1WBV A;  3EQB A;  1OIY A;  4MWI A;  4KKG A;  4IX4 A;  2O2U A;  1PYX A;  2C6E A;  4IQ6 A;  2R3Q A;  4QMV A;  4K8A A;  4OGR A;  1V0P A;  2X2L A;  4O38 A;  5CTP A;  1PMU A;  5D10 A;  4EH7 A;  3IW8 A;  3KA0 A;  4FGB A;  4TYG A;  1ZMV A;  2CMW A;  3AC1 A;  3SGC A;  4AXA A;  3MH3 A;  4IXP A;  2JDS A;  3G33 A;  5CAP A;  3RAL A;  2CCH A;  5IQA A;  2VTH A;  3W33 A;  4UY9 A;  3SRV A;  3U51 A;  4CEG A;  4O0R A;  2OJF E;  5HBH A;  4CFW A;  1FVT A;  3AGM A;  4J8M A;  3MBL A;  3UDS A;  4F7N A;  2AQX A;  2VZ6 A;  1M7Q A;  3LKM A;  4JOA A;  3W1F A;  4GT4 A;  1ST0 A;  1WVY A;  4IX5 A;  3R7G A;  4O21 A;  5J8I A;  3UP2 A;  4KSQ A;  1W2F A;  1U59 A;  3RCJ A;  1OBD A;  4RIO A;  4XOZ A;  5LMB A;  5L2Q A;  1ZY4 A;  3GQI A; 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