4EHTA

Activator of the 2-hydroxyisocaproyl-coa dehydratase from clostridium difficile with bound adp
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MYTMGLDIGSTASKGVILKNGEDIVASETISSGTGTTGPSRVLEKLYGKTGLAREDIKKVVVTGYGRMNYSDADKQISELSCHARGVNFIIPETRTIIDIGGQDAKVLKLDNNGRLLNFLMNDKCAAGTGRFLDVMAKIIEVDVSELGSISMNSQNEVSISSTCTVFAESEVISHLSENAKIEDIVAGIHTSVAKRVSSLVKRIGVQRNVVMVGGVARNSGIVRAMAREINTEIIVPDIPQLTGALGAALYAFDEAKESQKEVKNISA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
molecule keywords Activator of 2-hydroxyisocaproyl-CoA dehydratase
publication title On the ATP-Dependent Activation of the Radical Enzyme (R)-2-Hydroxyisocaproyl-CoA Dehydratase.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium difficile
total genus 83
structure length 268
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehtA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ehtA01
5AQUA 3H3NO 5BREA 3CERA 4XH5A 3MK6A 1BOTO 2GELA 4CBWA 3QMLA 3SJHA 5F0XA 2P9IB 4BQLA 1J6ZA 5FPEA 5AZJB 5AQJA 5EVZA 1SQKA 4IO8A 5FPNA 4M63C 1NGBA 2P9UA 4CD3A 1CZAN 3LDPA 1NGJA 5AQPA 3VEYA 3A5LC 2PAVA 3CJ9A 2ZWHA 4A61A 5KQDA 3CHWA 3HI0A 1U2VA 4BC4A 1NGDA 2QXLA 4PKHA 1NGFA 3A5OC 4PL7A 4Z94A 2D4WA 4DQ8A 1NGEA 4BGAA 1JCFA 3U9ZA 4FWKA 2CH5A 3ULEB 2CH6A 4BVPA 2ITMA 3A5NC 1G99A 1YXQA 2H3GX 2P9NA 2HF4A 2QM1A 4DCHA 3WT0A 4JHDA 3UB5A 4IWVA 3SMSA 1X3NA 5FPMA 2CGKA 1KAYA 2QWNA 2YHYA 2GWJA 3VEVA 3D2EA 1NMDA 4ISFA 1GLDG 5B8HA 2DPNA 2FSNA 2P9PA 3ZX3A 1BO5O 2FLOA 2NRHA 3O6WA 3WQUA 1RGIA 4BRKA 4BR5A 4FO0A 4FOIA 2YJFA 3RSEA 4DB3A 1K8KA 4K25A 1NGCA 1RDWX 5AZIB 4KBOA 3VETA 4EHUA 4BROA 3A5MC 3GE1A 3MN9A 5AQOA 2D1KA 3J8AA 5BRDA 3O4WA 3LM9A 4JD2A 3D2FB 4B9QA 2HMPA 3FFKB 3O5BA 3B8AX 5EOYA 1SAZA 4JN4A 1EQYA 3ENHA 4YDUA 3JS6A 4QS7A 3KHYA 3BP8A 2V7ZA 4B1YB 4JHDB 2QWRA 4IXCA 3FZMA 3VEWA 4BRHA 1Z05A 2VWBA 2VYPA 3C7NA 4H0VB 4K41A 2IVNA 3IUCA 2AA4A 2CGJA 3FZKA 4M7XA 4FWSA 3I8BA 2FSKA 5KQ8A 3CIPA 4FWRA 4BRLA 4FOEA 1P8ZA 3JXUA 1IG8A 2A6AA 3EZWA 1LCUA 1X3MA 3DXKA 3LDNA 4JNEA 4CJ7A 5BRFA 1C0GA 4FWQA 4C23A 3P4IA 5AQIA 1BG3A 5E84A 1U2VB 2F9TA 3C0BA 2E8AA 2A40A 2QWOA 4BRPA 3KVGA 4AM7A 3QBWA 4CZJA 3BF1A 1GLFO 4XEIA 1YAGA 4K43A 3VF2A 2YHWA 2VCPA 1HKGA 3DWLA 3H6EA 5AQXA 1NWKA 1NGGA 3H1VX 5BRHA 3FZFA 3IFRA 3HM8A 2WUSA 4GNIA 1S22A 1MA9B 4H0OA 2P9NB 3FLCO 4JAXA 3A0IX 1Q18A 1QZ5A 5AQVA 2Q97A 4PKGA 5ADXA 3ZEUA 5JLFA 2IVOA 1BA0A 4BRCA 2E2OA 3CQXA 4H0PA 4QS8A 2NZTA 4FWOA 1QQOA 4NO7A 3QFPA 3LL3A 3ZETA 5KPZA 4YDUC 2YJEA 1H1VA 3AAQA 4I6MA 5AFUH 1E4GT 4BREA 5TKYA 3MN7A 3DAWA 5CE3A 1IJJA 2OANA 4EAHD 3QICA 3SLCA 1NGIA 4FWNA 4XH1A 3I33A 1TYQA 3O80A 3CJ1A 1K8KB 3FGUA 1QZ6A 1TUYA 5BPMA 3QFUA 3M3ZA 4MO5A 2Q2RA 3MDQA 2YCHA 2ASOA 1DGKN 2YHXA 2ASMA 5I9EB 4CI6A 1MWMA 2P9LB 3L0QA 4A62A 5KPRA 3UE5A 4JD2B 4IJAA 5AQGA 3FE1A 2V52B 5ADXH 3VEXA 3KZBA 3EKUA 2E1ZA 1ZXOA 1KXPA 3D7EO 4H0TB 2P9SB 5EY4A 3HTVA 3MN5A 4PKIA 1RFQA 1BA1A 3IDHA 2YI1A 3L6QA 4CZKA 1ATSA 3H1QA 4EIAA 2P9IA 4H5VA 3SK3A 4MLHA 2QWMA 3GG4A 1BU6O 3LDLA 5AZJA 5EXWA 4BRMA 2E2PA 1V4SA 2GUPA 4EFHA 4BC3A 2GWKA 5AQHA 1WUAA 3DXKB 2E2NA 3BUZB 3MMVA 2Q31A 4E1JA 3GOIA 2E1YA 3UKUA 1ATRA 3EO3A 2UYTA 2W41A 1KAZA 3LDOA 3WUHA 4B1UB 1D4XA 3O8MA 1X9JA 4H03B 5LJWA 3GDQA 3VOVA 3A8YA 5E26A 3ULEA 3WXLA 4CZHA 5AQFA 3SMPA 1T6DA 2ASPA 3CJAA 4BRNA 1HKBA 2V7YA 5AQQA 3GBTA 1QQNA 3R9PA 3VGLA 2KHOA 5AQKA 1YVNA 5JMVA 2PBDA 1WOQA 2GEMA 1YUWA 3VPZA 4A2AA 4H5TA 1ATNA 2P9UB 3W0LA 4WQ5A 4FL9A 3VENA 1T44A 4BVOA 4FPBA 4RCHA 2Q36A 3W3DA 3ZETB 4ISEA 3VEOA 3WQTA 5AFUA 4XH4A 4I6MB 3LDQA 4H5NA 2QWLA 2A5XA 2QWQA 4AM6A 1R59O 2QW9A 1BUPA 5KPTA 1BWFO 3UKRA 1QHAA 3DXMA 1DKGD 5AQSA 3EN9A 3WXKA 4FWPA 1GLAG 3IMXA 2A41A 4BR9A 4BRAA 1TYQB 5AZIA 3VGMA 1ESVA 4CD1A 3R6MA 4CZIA 1GLBG 4CZGA 4BQZA 3CI5A 1JCGA 2HF3A 1NM1A 4K42A 4CBUA 4RTFD 3WEEA 1HJOA 3MN6A 4BR4A 5AR0A 2D0OA 4H0YB 3ZX2A 3AY9A 3HSCA 4DHYA 2FXUA 4H0XB 4L3QA 1NBWA 1HLUA 2Q1NA 3CETA 1NGAA 3D2EB 4O5FA 3VESA 3M6GA 3VEZA 3M1FA 3U8XA 2P9PB 1ZC6A 1JCEA 1QQMA 3FZHA 3LM2A 4BRIA 1HX1A 4B1WB 4BGBA 2P9KA 1HUXA 3RSEB 4BG8A 3HBTA 5AQWA 2FSJA 3TPQA 4O8KA 5LY3A 3H45C 2F9WA 4WQ5C 4BG9A 3CJCA 3ATUA 3FR0A 4BR7A 2HOEA 3UKUB 5AQYA 1BDGA 3L4IA 3OHRA 3BEXA 1Y64A 3GL1A 3O1WA 3HZ6A 3WXJA 1XUPO 2ZGZA 3WXIA 1XC3A 3F9MA 2E20A 3S41A 4LC9B 4H5WA 2BTFA 3CJBA 2W40A 4WQ4A 2A42A 2E88A 5LJVA 2ZGYA 4B1XB 3C7NB 5BN8A 2AP1A 4Y0WA 4H5RA 2GTDA 4WYBA 4BRFA 3TU5A 2EWSA 5AQRA 4FPAA 4B1VA 1T6CA 5BPNA 3H3OB 1C0FA 3BF3A 4FWMA 3G25A 5F1XA 1GLCG 3U9DA 3CQYA 1MWKA 2A3ZA 4ISGA 2CGLA 5FPDA 4BRGA 2QWPA 3VERA 3VF4A 3UKRB 5AQNA 2FF3B 3DXMB 3FZLA 3R8EA 2D0PA 4IZ9A 3CJ7A 2FF6A 3VGKA 1NLVA 2IIRA 4FSVA 4HWIA 1S3XA 1V4TA 1ZBSA 4A2BA 4CZMA 2IVPA 1U6ZA 1DEJA 1TUUA 2NLXA 4BR0A 2P9LA 4CZFA 2Q0RA 4HTLA 4MLEA 3WEEB 1KAXA 5AQZA 3ZEUB 5F2RA 4BR2A 4CBXA 5AQTA 5AQLA 5ELZA 3VF6A 2P9SA 4GY2B 4M7YA 4B1ZA 2E2QA 1XQSC 4WQ4C 5JLHA 4BRQA 4BRDA 4PL8A 2I7PA 5EX5A 1GLJO 4BC5A 1MDUB 1SZ2A 4MO4A 3ENOA 3QB0A 5JICA 3O1BA 1LOTB 2P9KB 4CZEA 3ZX0A 1GLLO 2J4RA 3AARA 3ID8A 2Q0UA 1OKJA 3EKSA 3O08A 2I7NA 4CZLA 3U4LA 2BUPA 3DJCA 1GLEG 1HPMA 1Z6RA 4QS9A 2ZF5O 4FWLA 3ATVA 3D2FA 1E4FT 5BN9A 1NGHA 4NB4A 4F9OA 3QBXA 4J8FA 5AQMA 4IJNA 4RWTA 4BC2A 3QDKA 5BPLA 2V51B 3H46O 3MCPA 1HKCA 5BR9A 3AAPA 3EL2A 4EHTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JRPA 3THYB 4I9QA 5BREA 4M41A 5LMNK 1BOTO 3S9HA 4FJ5A 4CBWA 3QMLA 3SJHA 4DF4A 1T7PA 3CCSN 5AZJB 5AQJA 3T19A 3A2FA 2PYJA 4LSNA 4CD3A 2QK9A 1VSDA 1LW2A 3VEYA 3K0SA 1KVBA 2PAVA 3KK7A 2OPPA 2AJQA 3SPYA 1S1VA 1U2VA 4Z4EA 1TAUA 2UXDK 1NGFA 5CY4A 1YJ9N 1NJZA 2D4WA 4CHNA 4DQ8A 1JCFA 1VK0A 3U9ZA 3SQ1A 4E0DA 2F8TA 2CH5A 3A5NC 3AGRA 1YXQA 1NK9A 3PLAA 3O3GA 2HVIA 1BCOA 2HF4A 3S3OA 3RWUA 3QLHA 3WT0A 4CJFA 3OYFA 4DUZK 1A5XA 4ZTFA 1C1BA 2Z1GA 4IOXA 4IWVA 5FROA 2BANA 3AVBA 3SMSA 3HP6A 1X3NA 1VQ7N 3MX5A 4B9SA 3VQ8A 4B3SK 1NMDA 3ZLJA 5B8HA 3ZX3A 1NJXA 4LF9K 2NRHA 3O6WA 4CJLA 4AH9A 4YY3K 1TKDA 4BR5A 4FO0A 2Y1IA 4FOIA 1BGXT 2YJFA 3RRHA 4GVMA 1K8KA 1RDWX 3BZCA 3DM2A 4LH5A 1TKTA 1BQMA 4DR1K 4KHUA 4LF6K 2P51A 4NCBA 3LP3A 1ZBLA 3J8AA 3O4WA 4KTQA 4NXMK 1XHZA 3CFRA 4HHTA 3JAMO 2PFUA 2BH1A 3FFKB 3K57A 3PO5A 4UY8O 4FJJA 1SAZA 4JLHA 4JN4A 1BHLA 3OS0A 4JHDB 2VQEK 3RMAA 1SKSA 2VWBA 4K41A 3OBWA 4C1NK 5C12A 1OH8A 3IUCA 2WFBA 3HPHA 1HRHA 4X64K 3RMBA 1NOZA 3SUQA 5M1KA 4BRLA 4FOEA 3RMCA 1LCUA 4GKKK 1X3MA 2O8FB 3LDNA 2VWJA 4CEOA 4DQSA 4FJ8A 1RT5A 3VQCA 2HHTA 1XI1A 4DTMA 3OS2A 1BG3A 1U2VB 2F9TA 3C0BA 3KKSA 3O9UA 3KVGA 4AM7A 3QBWA 1O13A 4B9NA 1S1TA 1VSHA 4I9LA 2YHWA 1YITN 1HKGA 3DWLA 4E7IA 3H6EA 3DI6A 1EKEA 5HRRA 4BE0A 3IFRA 3HM8A 1S22A 3LWLA 4H0OA 4C8MA 5KI6A 3SAHA 3J81O 1T05A 4CGGA 1HNXK 1XNRK 2JLEA 5AQVA 4W5QA 3R3LA 4CF8A 5JLFA 1VSFA 2E2OA 3I0SA 1K8AO 4YDUC 3K9KA 2YJEA 1H1VA 3LPTA 4I6MA 5AFUH 3TR8A 5DM7L 1QSLA 4DFPA 4BREA 5TKYA 3CPEA 2YHBA 2PYLA 4IKFA 3QICA 3EY1A 4FWNA 1LAWA 1TYQA 3O80A 3CJ1A 1K8KB 4IDKA 3AVHA 4CEQA 2HHHK 4MO5A 2Q2RA 1HNWK 2ASOA 2YHXA 2ASMA 3VQEA 1NKBA 3CC4N 3IS9A 1YF5L 1WNSA 4F4KA 4CGFA 1D8YA 3EE9A 3FE1A 5M1NA 4FCYA 3MX2A 2HSTA 3EKUA 3G0ZA 3U3YA 2E1ZA 4IDHA 2Q3SA 3KIOA 3D7EO 4DSEA 3K5MA 3MN5A 5K14A 1RDBA 3DRPA 5MLCQ 1RFQA 3IDHA 1FKOA 1RDAA 1L3SA 4H5VA 3SK3A 3GG4A 5T7BA 4BE2A 4NYNA 2W6KA 2ZQBA 2E2PA 5KTQA 5AQHA 1WUAA 4YOYA 4DQPA 3MMVA 1VQNN 2E1YA 3UKUA 1ATRA 2UUCK 4O55A 4DKWA 3O8MA 1IKYA 1P90A 3VOVA 3NGIA 5CR4A 1N32K 4DFKA 4KHNA 4M45A 2ETJA 3CCRN 4B9TA 2ASPA 5C24A 4BRNA 3VGLA 3J7YP 3VA0A 3SJJA 1OVQA 1BISA 3L8BA 2PBDA 4YOWA 4A2AA 3ULDA 1ATNA 3OVNA 4WQ5A 5KGWA 1OH5A 3PO4A 2F8SA 3W3DA 2Q36A 3LAKA 4CIGA 1QS4A 1JLGA 4I6MB 3TARA 2QWQA 3Q7CA 5KPTA 3OYLA 2RKIA 3KKRA 3F73A 2WONA 1QHAA 4U7BA 1RDUA 4JK9A 4WE1A 4BR9A 2O8CA 3C6AA 4BRAA 1REVA 1TYQB 5AZIA 2FBYA 1ESVA 3CCMN 4CF2A 2FBVA 2ITGA 3PIPL 1QVGM 1GLBG 4BQZA 1HYVA 3CI5A 1N36K 3TI0A 4W5NA 4RTFD 5AR0A 4M3RA 4H0YB 3AVGA 2FXUA 2LSNA 2RF2A 4KRFA 2EX3A 2P9PB 2QTDA 4LFCK 1ZC6A 4L8RB 1YJNN 2DFEA 1X9MA 4JKFA 4AHCA 4FM2A 4ELVA 3QINA 3KLIA 1VSJA 4BG8A 3NGZA 1YHQN 5BR8K 1VSLA 3S3NA 1XHXA 3CJCA 3THWB 4KHPK 2O8EA 4BR7A 2ZJPL 3UKUB 3L2UA 2HHWA 1WB9A 3MEDA 1TV6A 3RVCA 4M3WA 2ZGZA 2HHUA 1XC3A 3LZJA 1VRUA 1VQ5N 3O3HA 4LC9B 4U67L 1VHXA 5DMRA 4JV5K 1RT6A 2W40A 4B9LA 4CJ4A 3CCVN 3THVA 3E9LA 3PUFA 1KVCA 5I3UA 5BN8A 4FM1A 2AP1A 2GTDA 3VQ7A 3ZT4A 3K5OA 4DFMA 4BDZA 4OX9K 2NRXA 4ID1A 4FWMA 4CK3A 5EU7A 3VN5A 4RW8A 3U9DA 1BI4B 4XIUA 4ISGA 1NKCA 4B3TK 3D6RA 2BDPA 5TKWA 1NNEA 1B9FA 3D0PA 2FF3B 4WF9L 3DLRA 5HL7L 3FZLA 4CJQA 4DTNA 4FLVA 4FSVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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